MC08g1150 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSutr3 Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTGGTTGAATCTGCTTTCAATGAGGAAAGAGGAATGCTAGATCTACCTGATGGTCTTATCCATTTTAGAATGAATATCGTTGAGCTTCTGGTGGATATTTGTCAAATTTTAAGGTCTTCGAGATTTATGGAAAAGGTCTGTTGGTTTAAGGCTGTGTTTTATCAATGGTAAAAGTGTGAAGTATCTTTGGTTTGGGCACTGTGATCATAGATATTATATTCTATACAGTTTGGCATTTCTTAAAATTTCTTTTTAAAAATTGAATTTAAAATTTTGGTACTTGGAGTTGATAAGAAATGATAGAAGAATGATGAGTGCAAAAAAGAGATACTTGAAGCGTATGGTTGTGTTGGAGAAATTTGATTTTGAATTTTTCCCGATGTGAAATCATTCATTTGGTTTATATTTGCTTTATTTACCTTTGTTTTCTTTTTAAACAAGAAATGGACTTCTCATTGATATAACGAAAAGATACTCAAATGAAAGAACCCCAAAAAACGAGCAAAGTTGGTGAAGACTCGAATAGAGAATAATCAAATATTATTCATCAACCGAAAAGCTAATACAAAGCCCTATTTATGGAGGGCGGCTGCAAACTGTTTATGCTAATTGAGAACTAACAGCTGGTGTCTATTACTAACAGAAGACTAATGGTCTTTTTAAACATGACCGTTAGCTAGCCAAACAGCAGCTATATGAACTAATTTAAAACTATTCGAACTACTTTTCTTATACTAAAGTAGTTGGTTACATAAAAAATAAATGTAAAATAATGGAAATCAAAATTCTTTATTTTTTTGGGTTATAAGACAATGTCATTATTATTATTTTTTGGGTTATAAAACAATGCCATTTAAAGAAACAAACCCCAAAAATGAGTGTAATAAAGCGAAACAAACCGAACCTTATTTTTTTGGTTGTAAATTTATCCAATCCACACGAGTCTAGCTATATGATAGATCATACTAAATCCAACCGTAAAATATTTGAGTCGGAGGTTAAAACATTAAATTAGGATTAGTATTTCCATGTCAATTTTTATACGTTGAAAGATTATGCTCCTAAGGACCGAAAGAGTTTATTTTCCAGAAGTTGTCGGAGAGTGTAAAATATGCAAAGAATTATGTAAAATGACATTTTTAATTGATGATAAGTTTGTCTGCGGGATATCTCATCTCCCCCATTTGGTATGAGCTTTCTTGTTAATACATTTTCTCAAGTTTCCTATCAAAAAAAGAAAACAAAGAGGATTTGCTAAGAGTTTTCCGGGGAGTTTTACCATTACTTTCAGAATGTGCTCTTAATGAAGAATTGCAAATGCTCTTCAATGTAGACAAAAGAGTCACTTCTTCACAATGAAAGTAATGGTGAAAAGACATTACCTTCAGAGCAATCAAACATTCCTCCATATTTTGAAGGAGTGGGCATTTCTCTTGTACCATTTAATGGGGTAGATTGAACTCAAGGGGCTGGGAGATCTTAGTTAAAGTGTTGTCATAGAAGAAGTTCCTTCAGCAAATTTGGTCAGAATTTTTCGGTTTCTTCTAAGTCAGATTATTTTTGTATCTTTTGAAGAGGTGGATAAGGTTTTTGTAAATGAAGTGTTAGGCAGCAGGAGTAATTTTGAAATTGAAAGGTCATTCTCAATAATAAGCAGCAGGGGATGATTGATTTTCCCATGGGATCCAGCAGTTGAAGTTGTCTTTTGAAGATGGATGGTCACAGGTGCTTGAATCTTCCATTTGTCTCAATATTAGTAGGTGTCTTTCAAAGTTGAAAGGTCACAGATTTTTTAATGCTCTGCCTCGGTATTCAAGATTTGGTGATTTAAAGACAGCGGGATTTGATTTTATTTGTCTTCTCAGCTTCCTTCTTTGAACTTCAAAAGTTATTTAAAAATCAAGCTCAAAGGACACTTGGGTTCTAGGGAAAGGCCGCAGACTTTTTCAAACAATGTGGCATTTTCAAAAAGCCATAGGGGAAGGCTTTATTTCACATTGGGAAGTAGCATGGGTATGAGGATTTCATTTACACTTGGCTGTATTTTTGGTTAATGAAGAGTTCTTGCCTTCAGTTCACCTTCGAAAGCAGCATGGGCTTGAGGCTTTTATTTCCACTTGGCTAGATTTTTGGATACCAAGGATATCTCGCCTTTAATGCACTTTGGAAAGGGCATAATCCTTAATATTCAATTGGTTTAGTCTTTAATTTTCCCTTGGAAGACAGCGATTAATGTAGCTTTCCATACCCTTTTCGGTTGGTTTGGTTTTTCAAGGAGGTTTTTCTGTCTTTCCATATTTCTATTAGCTGAATTCTGGTTTTCCTAGAATCATTTAATGCTGCAGCCATCAATTTCAAATCTGAAAGGGTTTTGGTCCCCATGCAAAATTTTTGGTCCTGAAATCTTTGAGCAAGCTTTGGTTGATTCTTGTATTCTTTTTTAGCGTGATTGGAAAGTTTTAAGATTTGTGAAAAGGAGACAACTACGTGGAAATGATTCAGGTGGTTTTTGATGAACTCACTGATATGGTTGAGCTCTTTAGCTATTTTAAACGCTAAAAGTTTGATAGAATTAGATAATCTCTATTCCATTCACTAAAGATTATGTTGGATTTATCAATATTTGAGTGTAAATATTAGTTGTCTATATTTTGTCTTTATGGTATTTATTTATCTCCTTATTTGTAGTGGGTACTTCTCCTGTATAATTAGACCTAAGTTACATATATGAATATAATAGAATATCTTTCTTCACTTGAATTAAGATGGTATTAGAGCTCTAGGAAGAAAAAACCTTAATTCTCAAAAAAGAAAATAACAATAGCCATCATCAGGCATCAAAACTTCCTACCTCCGACGATCTCCTCACGACAACCTAGCTGTTGTCGTCAACCATCTTCACCGTCCTCGCGATCAATCTGCAGGTCTCATCTTTGTAGATTCAAGCCGCACCGTCTTCACAAGTCTCGCCTTTGAAAATCTGCTCTGTCTTCGCAGGTGGTCCCTGCCACCTTCTTAGATTCGCGCCATCACACTCCTGCTCGTTGTCGTCGATCATCCCCATCTTCACAAATTGTAGATTGTTCGTGTTTGCCAACCTTTTTTGTGTTCTCTCTTCATCGATTGCCATTCATCTTAGCCGTGAGGAGTAGTCTTCATTTACTGAGTCGTCGTTTCGCTTCGTCGTCTAGACTCTAGGTGTTTCATCCTCAGTGTTGTCGCCACCATCGTTGCCGCCGTCGCCCTATTACTGTTGTCACTTCTGTTTAGATTCAAATTTTTATGTTTTTTGAACCCTAGCCGATTCGGTTCATGATTTGGTTCGGTTCAGTATAGTGTTTTGTTTGGTCTGTCTGTTCGGGTTGGTTGCTTCACGGCCAATGGTTTAGTACGATTTGGTCTGCTTCTGATTTTGTTTGTCTCTGCTGGTTAACAGGTTATCTCTTTTCTAATTTCAGTTTGTGGCTTGATTTGGTTTGGTTAATTACTAGCCACTTCTGTTCTTTTGTCAGCCTTTGTTCAGGATAGTTCATTTATTTGAAATGGTCCAAATTTTGACTAACGATAAGAGGGGAATGGTCAATGACAGTAGTGGTGACTCAAGTATAGAGCAAATTCATGAAACTCTTGAAATTACTATCCAGCCATTTATCTTCCAATAATTCATGTGTATCGTTGACACAAAAGATATTTATTCTAAGGCTTTCTCTTGTAGTAACTCATCTTCGTGGATTATAGATTTTGAAGCTTTTGATCATATGACAAGTTCACCATAAAACTGACGAAGACTTTCTCTAGAGCCTGTCCTCCATATTCCAAAATTGGCCTGTAATCTTTTATTTGTCAACAAACTTTCTAAAGATTCTAAGTATTGTGTTACTTAGGGAAGAAAAAAGGTAAGTATGCTCTGTTCTCTCTCCTCTCTCCTCTCCCCCGTCCTCCTCCTTTCCAGTTCGTCTCTCCTTTGGTAAAGCCTCGACCTCAATTTCTTCTTAGTAGTTTCGTTATACTTCGGTCATTTAGAATGGAAGTAAGCAGTTGTTGTATTGACGGGTCATTTTTCTGCATTTGGTTCGAAAGTGATACATTCATGTTGGAAGATGTGAAGCGAAATTTTATTATGTCTCTACCTTCATTTCAATTTCTCTGGTTCGAAAATCACATGGCAGAGGTCACTCGACAATCGATTCTTGCCTCTCTATTCTTTCAACTAAGAGATGACCTAGGACAATGTCGAATACAAAAATTCCATTCAAAGGGTCTATGGTTTTTGAAATGGGTGTTATGGCCTTCCACAGGTGGTTGAAAGAGCATAGTCATACCTGCCGGAGATATGAGGGATGGATGGAACACATTTTGGAAAATTATGAAAGCGTTCTCAGTTTGTATAGCATAGGCTGAGGCAATGAAGATGGTTAGGAACATCTGTCCTTCTTGTGTTATGAATGCAAAAGTCGATGAAAATTCGAGTCCTCAGGGCTAGAGGAATGAACCTTCAATTCAAAAGTTACTTGCAAGAATAGAAAAATTTTATGCTGAGGTGGTGGTCGGAAAAGGAGAAGTAGCACATTCGTGGCCATCACGCGACGTTCAGAGGATCGTAGAAAACTCAAAGAGGTCTTCAGACAAAGTCTAAAGTTTTTGGGTTAAAAAAGAGACCGAGGTGCTGGAACTGGACTGGAACAGTTGATGGTGGTCTCTAAAGGTTGTGCACATGATGATTGGATTGAAATCGCGAGGTCCCTAAAAGAAAGATAGACTATGTGATTAATCGTATCATGGTCGATAAAGGTATATTGAAATTCTTAGGAGATTCGGTTCTTAAACCCAGTGAGTTGACTGGAAAATGGAGGAAGATTGGAAAGTTTCACTTAAAACTGGGAAGATGGAGTCCTCGTTGGCATAACAAGAGGGAGTTCAGTTAGGGAAACAGAGGATCGTTAACCATTCAGGACTTACCTTTTTACTATTGGACTCGTTCAACATATGAAGCC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VVESAFNEERGMLDLPDGLIHFRMNIVELLVDICQILRSSRFMEKLFFSGWTNGNVPIPWREVEGKLFALNVVAEVVLQEGQSFDFSVITQLVTILSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELPNLEILIWMGESLEKLHLPLEDEEEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNALSLRQNPAAYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEPTLDDPIFSLLIVFWPMLEKLLRCEHMENGNLSAAACRALSLAIQSSGQHFVALLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHQEKFGHLFITTFERFTYAASVIAINSSYICDQEPDLVEAYTNFASIFIRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLELASTISEGPFDSMVIRVISHSGEGLVSNILYALLGVSAMSRVHKCATILQQLAAICSISERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAASDYLDSKSCDELKNNYGHMQGKGGRVLKRLVREFADGHRNIPNVT Homology
BLAST of MC08g1150 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6P2B1 (Transportin-3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tnpo3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 84.3 bits (207), Expect = 5.1e-15 Identity = 107/491 (21.79%), Postives = 206/491 (41.96%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1150 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y5L0 (Transportin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TNPO3 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 83.6 bits (205), Expect = 8.8e-15 Identity = 106/491 (21.59%), Postives = 206/491 (41.96%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1150 vs. NCBI nr
Match: XP_022148146.1 (transportin MOS14 isoform X3 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1211 bits (3132), Expect = 0.0 Identity = 620/620 (100.00%), Postives = 620/620 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1150 vs. NCBI nr
Match: XP_022148142.1 (transportin-3 isoform X1 [Momordica charantia] >XP_022148143.1 transportin-3 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1190 bits (3079), Expect = 0.0 Identity = 620/662 (93.66%), Postives = 620/662 (93.66%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1150 vs. NCBI nr
Match: XP_022148144.1 (transportin-3 isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1182 bits (3057), Expect = 0.0 Identity = 618/662 (93.35%), Postives = 618/662 (93.35%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1150 vs. NCBI nr
Match: XP_038891351.1 (transportin-3 [Benincasa hispida] >XP_038891359.1 transportin-3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1171 bits (3029), Expect = 0.0 Identity = 596/620 (96.13%), Postives = 607/620 (97.90%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1150 vs. NCBI nr
Match: XP_008449960.1 (PREDICTED: transportin-3 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1159 bits (2997), Expect = 0.0 Identity = 590/620 (95.16%), Postives = 606/620 (97.74%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D4H9 (transportin MOS14 isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016896 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1211 bits (3132), Expect = 0.0 Identity = 620/620 (100.00%), Postives = 620/620 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D496 (transportin-3 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016896 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1190 bits (3079), Expect = 0.0 Identity = 620/662 (93.66%), Postives = 620/662 (93.66%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D347 (transportin-3 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016896 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1182 bits (3057), Expect = 0.0 Identity = 618/662 (93.35%), Postives = 618/662 (93.35%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BN70 (transportin-3 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491690 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1159 bits (2997), Expect = 0.0 Identity = 590/620 (95.16%), Postives = 606/620 (97.74%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1150 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BNV6 (transportin-3 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491690 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1159 bits (2997), Expect = 0.0 Identity = 590/620 (95.16%), Postives = 606/620 (97.74%), Query Frame = 0
BLAST of MC08g1150 vs. TAIR 10
Match: AT1G12930.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 794.3 bits (2050), Expect = 7.2e-230 Identity = 406/620 (65.48%), Postives = 499/620 (80.48%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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