MC07g0202 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTCATAGTCGAGAGTCTGTGCTCTAAACAAGTTGAGAAAGAGGTCGAGATTAGAGGACCTCCTGTTTCAAAAGCTTTTGATGACCAAGGAAATCCTACAAAGGTGAACGTTTTCTCATTATTATGATATTTTTTTAGTCAAAGAATTTTCATTTTCTTTCATGATGGTGCTTAATTACTTGAGTAGCATCGTGGAATAAGGTATGGATTGTATTTCAAATACGTTAAGAATTAATGTTAAACACAATACATGCTTGCTGAGTGTGCAGATTAATAGTAGTGTGGAAGATAAAATGTAAAGACATCATCTAAAATCAAAACTGCTTCGCCTCTTTAGCCCTCAAAGATGTGTGATCTGCAATAATGATGAGGAAATTATGAACCACTGTTTGTTCATTGCCCTTTAGCAAAAGCTGTTTGGGATAATCTTTTGAACGTTCTTTAATTTCTGTTAGGTTTCCCCATGCAGTGGAGGATATGTGATTATTTACCATTTATTTGTTCATAGTAGATGGTTTCAAACAATCTAATTAAAGAACTTTTAGATGATAACAATACCTATAATCCTTCAATGATACACATATATATGAGGAAATTAGGTGCTAATTTAGTACTAGTCTTTGTGTTATTGTGTATTTTCATTTACCAAATTTACCCCATGGTTGTAACTCTTGAATGAATTTGATAAGATGGATAAAATTTGTCTATATCCATTTCATATATCTGTCGTACGACAATTATTGTTCCTGTTCATATTCTATTAATGAAAAGTATGTTTCTTGTTCAAAAAACGAATAAAATTTGTCTATATACATTGTTTTATTTTCCTTTTATTTGGGCATCAGAGTTCTTAATTTCAAGTGTTGCATTTTTTTATAAATATTATTATTTTTCTTATTATTATTTTTAACAAGATACGACCTTCTCATTGAAATAATGAAAATGAGCAATAATGTGCAAGGATACAAACTCTCGAAAGAGTGAAAATGAAGAAGAAATATCAAACTGATATTTTTAACTTATTAAATGCCACATCAGACTGATAGTCATTTGTCTCTTATTGAAATATCCTATCGTCGCCAACATAGCTTATGAGACTAAGTATTTTGTGTTAGGCTGCTGAGGGCTTTTGTCGCAGATACTCTATACCGTGTGAATCATTGTACAAGAAGATCGATGGTAAGTCACTAGAGTTTCCTATTTAAAAGCACAAATCTTCATTTGATGTTCAATTTTCTTTTAAAACACAAAAATTTCTTTAACCTTTAAGGAAAAAATGCAAAAAATTCTTTGTATTTAGATGGCTTGTTTTTTAGATTCCCTATATCTTAAAACCACCGCATCAGTCCTAGCTTAACATGTATTAGACTGAAAAGGTGCACTTTTTCTTTCTGTTTTCACAAGCAAATGAGATTTTGGTTTTTCAGAGCTGATGGTGTGAAGATAAAATGTCGTCCATATAGAGTGAGTTAAACCTCAAGATTACAAAACAAAACCTATAAATAGAGAAATTTAAATTCTCTGAATCTATGTAACATCATTCCATAAATTATCAAAGAAAAATTTTCATATAAAATTGTAAAAAACCAGTTGCTAGAAAAAGTATAGTACACTTTTATCTCATCCAATTATCGAACCCTGATTTCCAGACTTGTGTTTAAAATAAATAATCTTCTTATTGAGTAACAAATATTATATTAGAAGGGAATTTTATTAGTAACTCTTATTCCACACTAGTTGTAAAAAAATGCAACGCTTGAATATTATCTGAAAATTTCCTTCTAATATAATATGACCTCAGTTGACATTTCCACTGAGGTCATAAGTCCTGTTCGACTTGTACTGGGGCATTCCAACCATCTTTTCACACTGGTACTAGTATTTGATCGTTTACAATTGTTTTTCTTACCAATAGTCTGGACGGCTATTGGTGTAAGAGGCTTTTACCAATAATGGGAATCCCAACAGTGTTCCACACTAGTTGTACTGTTTTGTGCACTGACCTTTTTTACTTATTTATTTATTTATTTTTATCTTTTTAATAAATAATTTTTAATGCATTAAGAAAATAAATATTGAAGAAAAAATAATGCAATTTAAGTGTGAATAATTGGCCATGTTTTTTTGAACTATTTGATTTTGAAGTTTCTTTCTTTACAAAACATTTAATAGTGTAGGATTTATTTGGTATTTTATTTTATTAGAAAATAAAATGTTGAAAGAGCAACAAGGAGGGTGTGGTTTTTAAGATTGATTTCGGAAAGGCCTATGATCATGTGGACTGAGATTTTTTAGACAAGGTCTGGGAAAGAAAGGTTTTTGGTTCAAATGGAAAGCTTAGATGTGGGGTTGTATTAGATCCGTTAATTACTCTATCCTCGTGAATGGGAGACCTAGGGAAAAAATTGTTGCCTGAAGAGGCCTTCGGCAAGGTGATCATCTTTCTCCTTTCCTCTTTATGTTGGTCGTGGACATTCTTAGCTGATTAATTTCTGTTGGCGTGGAGAAAGAGGCTCTGGAAGCCTTCGAGTGGGAAAGGAGAACGTGTGCCTCTCACATCTTCAGTTTGCAGACGACACCATTTTTTTTTGCTCTGGTAAGGATAGTGCTTTTAAGAATTTGAATAGCCTTCTAGGTTTTTTCGAAGCTTTATCGAGCCTTAAGATCAACAGGGGCAAGAGTTCGTTGTTGGGGGTTACTTGTGACGATGATAAGCTTAGAGAGTGGGCGACTCTGATTAGGTGTGAAGTCGGTGAGTTTCCTTCTTCTTATCTTGGTCTTCCATTAGGTTACCCAAGAAGTGTGATGTTTTGGTCACCGGTGCGTGAGAAGTTTCAGAAGCGCCTTCTTCGTGGAAGAAGGCCTTCTCTTCTCTAAAGGAAGGAGACTCACTTTAATCCAATCTGTCTTGAGGGGTATTCCGACTTACTATCTCTCCCTTTTCAAGATCCCGGTGCAGTTAGTGAGGCTTTAGAAATGATTATAAGGGACTTCCTTTGGGAAGGTGTGGAAGAGGGGGGTGGCGCTCATCTAGTCAGATGGAATGAGATTACTAAGACTCAAGAATTGGGGGGTCAGGGCATTGGGAGCTTAAGGCTGAGGAATGAGGCTTTCTTGGCTAAATGGTTGTGGCATTTCATCCATGACTCCAGTGCCTTGTGGCGAAGGATTATAGTGAGCAAGTATGGGCTGTATCCCTTTGATTGAGTTGACAGGTGGGTCTAAGGTGAACAATTATAACCCTTGGAACGTTATTGCTTTGGGTTTCCCTGCGTTCTCTCAATCTTTATGTTCTGTGGTGGGGGAGGGTCGTAACATTTATTTCTGGAAGGATACTTGGGTAGGAGATAAACCTCTTTGCATTGCATTACCTCGACTCTACTTTTTCTCTGAAAAGAGGCTTAATTCGGTGTCTGAGGTTTTGAATCCTCGGGGGATGTCCTATCCATTTCCTTGGGCTTTACTCGAGCTCTAACGGATCGGGAAACCTTAGAGGTGTCCACTCTTCTTGTTTTGGTGTCCGAGGTCCCTAGACTCTAGGGGGGAGGATGTGAGGGTATGGACCCCTAACCCTTCGAAAGGTTTTTCTTGTAGCTCTTATTACCATATCTTGAGCTCCTTTGTCTTCTTCTCACTCTTCGACCCCTTTGTTCACCTCTCTTTGGAAGATTAAAATCCCGAAGAAGATCAAGTTCTTTGAGTGGCAAGTTTTACTTGGGAAAGTCAATACCTTGGATCGTATCTAGAGGATTTTCTCCTTATGTTTGGGTCTGCAGTGGTGCGTTCTCTGTAAGAGTGCCTCGGAAGACCTCGATCACTTGTTGTAGACTTGCCAGTTTGCGCAGGATTTATGGCACCGTTTCTTTATATGTTTTGGATTGTCTTGGGTCCGTGCTAGGGATTGTAGGGCTATCATGGAAGAATTTAATTTGGCTTGGGTTTTTGGCAATAATGTGGCGGATAACTTGGTTCAAATCCTTTTGAGGCCTATCTTAAATACAAAAGCTTCCTTATTATGGATTAATGCGGTGAAGGCAGTGGTGTATGAAGTATGGTAGGAAAGAAACCTTAGGATTCTTGAAGAAAAGAGGCAGCCCCCTCCAGATCGTTTCGACCTTGCTAGATTCAAAGCCTCGCAATGGAGCTCCTTATCTCCGTTATTTAAATCTTATTTTCCTAGTGTAATTTACTCTAATTGGGAAGTTTTTACGGTAGTGTTTTAAGTTTTACATTTATTTTAGCTTTATTTATTGTTTCAAGTTTTGCTTTCACTCTTTCGAGAGTTTGTATCTTTGAAAAATTTTGTCCCTTTTCATTATTTCAATGAGAAGTTCGTTTCTTGTTCAAAAAACGACAAATCAAAAAAACAAAAAAAGAAATGAGAAAGAGTTAATAAATACAATTATTGTAGAAATTCAAGTTGAAGATTCGGTTTTTCAAATTTGGAACTACTTTAAAATTATTTATTTTTATACCATATAATTTATCTTTTTCTTGTAGATCTAGATTGATTCCTTATTTCCAGAGCTTTGGTTGGAGGTTCTCTTGTATATGTATCTCATCCTATTATATTAAGGTCAATAAGAAAAATCTCTTCTCATAAAGCTTCATGCTATCAGAGCATGGGAAATAAACCATAATTCTAAAAAACCTTAGTGATCATCAGATATCTTACGTTTGACAATCTCTTCACGACAACTAGTTGTCGCTGTCGACCCTCTCAGTTGTCTATCCGCACAGATCTACATCTGTCTTCGCAGATTTGTCGTCTATGAAGCACGGACACGGATACGGGATACAGACACGATAGGACACGGCGATACGTCAATTCCTAAAAACTTAGGCACGGACACGTTGGGGATACGTTTATTTTTTTTAATATTTTTTAGGATATATGTAAATTTAACACAAAAAATGCTAAATACAATAAATGCATAAATATGAAGTCAATTACATCCAATGTTCAACAAAAGTTACAAAAACAAAGTCCCAAAT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GTCATAGTCGAGAGTCTGTGCTCTAAACAAGTTGAGAAAGAGGTCGAGATTAGAGGACCTCCTGTTTCAAAAGCTTTTGATGACCAAGGAAATCCTACAAAGGCTGCTGAGGGCTTTTGTCGCAGATACTCTATACCGTGTGAATCATTGTACAAGAAGATCGATGGAAAGACAGAATATCTATATGCTCGTATAATGGAGTCTTCTCGGCTTGCTTTGGAGATTTTTTCTGAAAATTTACCTGGCATTGTAGCTAAAATATCATTCCCAAAGTCAATGCGATGGAATTCTCAGGTCATGTTTAGCAGGCCTATTCGCTGGATTTTGGCCCTTCATGGAGATATAGTTGTTCCATTTTCATATGCTGGTGTTTTAAGTGGGAACATATCCTATGGTCTTCGTAACACTTCTACATCTGTTGTTAAGGTCAATAGTGCAGAATCTTATGTGGGGGCAATGAAGAATGCTAAAATCAATATTGAAGTTGAGGAACGTAAAAGAAAAATTTTGGATCAGTCTTCCATATTGGCAGAAAGCGTCAAAGGGAAAACTGTTATTCAGGAGGTCTTACTTGATGAGGTTTCCAATCTCATCGAGACACCTGTTTCAATACTTGGAAAGTTCAATAATTCCTTCTTGGAGCTTCCAGAAGATCTTCTAACAATGGTTATGCAGAAGCACCAGAAATATTTTTCGATTAGAAATGCTAATGGGAAGCTGTTGCCGTACTTCATTGCTGTATCAAATGGAGAAATTGATGAGAAAGTTGTAAGAACAGGAAATGAAGCAGTACTTCGAGCTCGCTATGAAGATGCCAAGTTTTTCTATGAGATGGATACAAGTAAAAGGTTTTCTCAGTTTCGAAGTCAACTTAATGGTATTCTGTTTCATGAAAAACTGGGATCAATGCTTGACAAGATGACACGTGTGGAAACTATGGTTGTGAAACTAAGCCTGGCAATGGGAATTAATCAAGATTTGCTTCAAACTATACAGGAAGCTGCATCCCTTGCCATGTCAGATCTTGCTACTGCTGTTGTCACAGAATTTACTTCACTTGCAGGAATAATGGCACGACATTATGCTTTGCGGGAGGGCTTTTCAGAGCAGGTTCTTGAAGCCTTGTATGAGATCACACTTCCTAGATTTTCTGGAGATATTCTTCCAAAGAGTGATGCTGGGATAGTTCTGGCTATTGCTGACAGATTAGATAGTCTTGTTGGCTTATTTGCTGTTGGCTGTCAGCCTAGTTCTACAAGTGATCCATTTGGCCTTCGGAGAATTTCTTATGGCCTTGTCCAAATATTGGTGGAGAAGGATAAAAATCTTGATCTAGCGCAAGCACTGAGACTTGCAGCTGATGTCCAACCCATTAAAGTTGATACCGACATTATTGATAATGTAAATATATTTGTTACTCGAAGGCTTGAACAATTTTTGGTGGATAAGGATTTAAGTTCAGAAATAGTTCGTTCAGTTCTCACAGAGCGTTCAAATTTTCCATGTCTTGCAGCAAAGACTGCTCATAAAATGAATGCTATGTCAAAAGGCGATCTGTTCCCAAAGATTGTAGAAGCATATGCACGTCCGACAAGAATCATTTATGGGAAGGATGTTGACCATACTATCGAGGTTGATGAAGCTGCATTTGAGTCGAATGAAGAGAGAGCTTTATGGAATACTTTTTTGTCAATTAAAAACCAAGTTCACCCTGGCATTGAGGTTGATGAGTTTTTTGAAATATCTTCAAAGCTCATAGAACCACTTGAAGATTTCTTCGAGCATGTTTTTGTAATGGTGGATGATGAAAAAATCCGTAATAATAGGCTCGCTCTTCTCAAAAGAATTGCAGATCTTCCAAGAGGCATAGCGGATCTTTCGGTTTTGTCGGGATTT VIVESLCSKQVEKEVEIRGPPVSKAFDDQGNPTKAAEGFCRRYSIPCESLYKKIDGKTEYLYARIMESSRLALEIFSENLPGIVAKISFPKSMRWNSQVMFSRPIRWILALHGDIVVPFSYAGVLSGNISYGLRNTSTSVVKVNSAESYVGAMKNAKINIEVEERKRKILDQSSILAESVKGKTVIQEVLLDEVSNLIETPVSILGKFNNSFLELPEDLLTMVMQKHQKYFSIRNANGKLLPYFIAVSNGEIDEKVVRTGNEAVLRARYEDAKFFYEMDTSKRFSQFRSQLNGILFHEKLGSMLDKMTRVETMVVKLSLAMGINQDLLQTIQEAASLAMSDLATAVVTEFTSLAGIMARHYALREGFSEQVLEALYEITLPRFSGDILPKSDAGIVLAIADRLDSLVGLFAVGCQPSSTSDPFGLRRISYGLVQILVEKDKNLDLAQALRLAADVQPIKVDTDIIDNVNIFVTRRLEQFLVDKDLSSEIVRSVLTERSNFPCLAAKTAHKMNAMSKGDLFPKIVEAYARPTRIIYGKDVDHTIEVDEAAFESNEERALWNTFLSIKNQVHPGIEVDEFFEISSKLIEPLEDFFEHVFVMVDDEKIRNNRLALLKRIADLPRGIADLSVLSGF Homology
BLAST of MC07g0202 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L785 (Glycine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EDD1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 885.2 bits (2286), Expect = 4.4e-256 Identity = 433/632 (68.51%), Postives = 545/632 (86.23%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A4J7C9 (Glycine--tRNA ligase beta subunit OS=Desulfotomaculum reducens (strain MI-1) OX=349161 GN=glyS PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 393.3 bits (1009), Expect = 5.3e-108 Identity = 236/635 (37.17%), Postives = 356/635 (56.06%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8CXH5 (Glycine--tRNA ligase beta subunit OS=Halothermothrix orenii (strain H 168 / OCM 544 / DSM 9562) OX=373903 GN=glyS PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 391.0 bits (1003), Expect = 2.6e-107 Identity = 225/637 (35.32%), Postives = 375/637 (58.87%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q182B8 (Glycine--tRNA ligase beta subunit OS=Clostridioides difficile (strain 630) OX=272563 GN=glyS PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 366.7 bits (940), Expect = 5.3e-100 Identity = 224/640 (35.00%), Postives = 366/640 (57.19%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B1I1T4 (Glycine--tRNA ligase beta subunit OS=Desulforudis audaxviator (strain MP104C) OX=477974 GN=glyS PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 363.6 bits (932), Expect = 4.5e-99 Identity = 232/633 (36.65%), Postives = 341/633 (53.87%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. NCBI nr
Match: XP_022156973.1 (glycine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1211 bits (3134), Expect = 0.0 Identity = 630/632 (99.68%), Postives = 631/632 (99.84%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. NCBI nr
Match: XP_022156971.1 (glycine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1211 bits (3134), Expect = 0.0 Identity = 630/632 (99.68%), Postives = 631/632 (99.84%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. NCBI nr
Match: XP_022156974.1 (glycine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 isoform X3 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1211 bits (3134), Expect = 0.0 Identity = 630/632 (99.68%), Postives = 631/632 (99.84%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. NCBI nr
Match: XP_022973889.1 (glycine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1097 bits (2838), Expect = 0.0 Identity = 557/632 (88.13%), Postives = 604/632 (95.57%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. NCBI nr
Match: XP_022973888.1 (glycine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1097 bits (2838), Expect = 0.0 Identity = 557/632 (88.13%), Postives = 604/632 (95.57%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DS69 (Glycine--tRNA ligase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023800 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1211 bits (3134), Expect = 0.0 Identity = 630/632 (99.68%), Postives = 631/632 (99.84%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DWK5 (Glycine--tRNA ligase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023800 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1211 bits (3134), Expect = 0.0 Identity = 630/632 (99.68%), Postives = 631/632 (99.84%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DV61 (Glycine--tRNA ligase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023800 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1211 bits (3134), Expect = 0.0 Identity = 630/632 (99.68%), Postives = 631/632 (99.84%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IFY6 (Glycine--tRNA ligase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472479 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1097 bits (2838), Expect = 0.0 Identity = 557/632 (88.13%), Postives = 604/632 (95.57%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IEH3 (Glycine--tRNA ligase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472479 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1097 bits (2838), Expect = 0.0 Identity = 557/632 (88.13%), Postives = 604/632 (95.57%), Query Frame = 0
BLAST of MC07g0202 vs. TAIR 10
Match: AT3G48110.1 (glycine-tRNA ligases ) HSP 1 Score: 885.2 bits (2286), Expect = 3.1e-257 Identity = 433/632 (68.51%), Postives = 545/632 (86.23%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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