Lsi08G006290 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi08G006290
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionNuclear pore complex protein NUP1-like
Locationchr08: 14639558 .. 14647276 (+)
RNA-Seq ExpressionLsi08G006290
SyntenyLsi08G006290
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCGACAGAGCGTGAGGAGGTTCGATACGAAGGAGGAAGAGGTGGGAAGTTCCAGAAAAGACCTGTCAGAAGGTCGCATACGACGCCGTATGATCGACCGCCGACTGCTCTGAGGAACTCTGCTGGAAAAGGATGGCTTTCTAAGCTTGTCGATCCGGCGCAGAAGCTAATCACCTCTAGTGCGCATAGGTTGTTTTCTAGTGTGTTTCGTAAACGCCTTCCCCCTCCGCCGCCGTCATTGCCACTTTCTCGAGGTTTTTGTTTTTAATTTTTGGTTTTTAATTGCAAGGTTCTCTTACCGGTTGGTAGAATGGTTTTCTGGGGTTTCATTTTCCGCATCTTTTCCGCTTGTTCGTTTGGTTTTAGAGGGTATTGGCTGAAGATATCATTATTGTTATTTCAAATTCGATTTTTTTTCCGCTAGGGTGTTCTTGGAATCGTGGGGTTTTCATTTCTGTCTTGGTAGAACATGGATTTATCATTTTGTATGGTTTTGGGTTTGTTGAAGCTCTTCTTTTTGATTTAGGGCTTCAATTTTTTAAATGTCATTACTTTACGCGGTTCTGTGCTCGAAGATGTAAAAGTGCTTCAACGTTTACTGGTTGAATTATATTGAGTAAGCTTGGAATGTTGTGTTTTGTTTTCGTTGTTTGGATGTCATTTGGGGGCAGTCTGGTTGTGATTCTTACGATTTTTTTTTCTAAAATGATCACGTACGTAAATTTAAGAATTGGGTTCAATTTTTATTTTAAAAAACGTTGTGAAAAGATATATTTGGTCTGTGTTCATATTTAAGCTCAATGCCAAGGCCAGGGGCTATGTGTATGTTGCAATGCTATTCGTGCTACCCCTTGAATCATCTGTGTGAAATAAAACATAAGAGTCCTTGAAGATATTTCTAGAGCTCCAAATAACTTCTGGGAAGAATTTTTTTTAGCGTCCACTTGGTCCTCTTGTGTTCACGGTATTTTCTCAATTATAGCCCATTTGAAGTCCTTCCACTGTTACCCTTTGGCCCTTTTCTGTATATAATTTTTAACCAATGAATGGGAGTGTTAATCTAAAAAACATAATATATTTAAAGTAAATTATATTTATAGGAAGCTATAACTATTTATCACCAATTGTTTAGAAGACAACTTACAAAAACTCATGTAAACAGCAGAATTCTTTTCCTTGTTCTGTTGGTTGTTCTGTTATTGGTCATTCAAAATTATTTTGCTGAACAAAGATTCTGTACAATCGCTTTTTATATTTAAAACTGAAAATTGTTTCTAAACATTGCTCTTGCTCTCAAACATTTTAATCTCTCTTATAAAATTTTCTTTTCCACGAGAGTAACATGTAAGATTTTGAATTATTCCGATGTTGATAACCATTTAGGAAGCATGATGCTATTATTTTATTATGTATTTTGGAGTAGATACTGTTGTGCTCTCTTTGACTTTTGACTTGGGGACAGTTGCTATGATGTGCTGATACGTGTTTAATAATCGCAAGAAAGAGTGGCAGAAGCTTTTCATTTGATATTTAGTTTTCTGCTTAATCTTTTACTCTCTCCTTTTTTTTCTTTGCATTTTATACTTCCAGAGGCTAATGATGAGGTGGAAAATAGGAACCAGGAAGAAGTTGCAGCTGTAAGTTTTATCTGTTATGGGTTTTGATTATCGATAACCTTTGCATCTGTATCTTGTATTTTTTTGAAATCCAATTCTACTATTGTTCAACAGCACAATACATCATCACTGTGTTTCCCTCCCTCCGTGTAAATACTCATTAGGCTTCAGCTTTTTTCTATTGCAGATATTGTGAGACTTTTTTGTTACCTTTTCCTCTTTCTTTTGACTAATCTGCATTTTTTCTTTTTTCTTTCAGATTAAAAGTTACAAAGTTGTTTTAAACTGTTCATTTTTTTAAAAGACATGATTCCAAACGTAGCTGGCATAGATCTATTTATTTTCATGAATGCATTAGTTTTCTTAACATTGAAGTGAAACTGCCTCAAACAATCTGATGATCTTGTGTTGCTGTAGTCTTAACTTCTATGTCAACATTTTTTGAATTTTTTATTATTCTTCAGGATCCTCCTGGAACTCAAGAAGGGACTAATGTTGATTTTGTTCCAAGCATCAATTCTAATAACACACATGGGGTGAGTGACCTTGAGAAAATTTTGAAGGAGAAGACCTTTACAAGGTAAGTATTTGAGTGTCTGTTGGTCAAATTATTTTTAGTCACCTACCTCAATTCTATTGGAAGTTTTTCCCTTTCCCCCCTTGTTAGTTCTTATTTGAGGGTAATATATGACAAATTTGCATATATTGCAATTAGTAGCATGGTAAGAAGTTATAAAATAGTGTGAAATGTATAAACCGCAATGTTGCTACAATATACCATGTCAATTTTAATTTTTGGGGCAGAAATTTGGTTTCATTTTTATATATTTATTTTAGCAAGATGTTTAATATGTCAAATGCTTACCACTTTACAGATTTGAAATTGATCGCTTGACTGAACTTCTGAAATCAAGAGTTGCTGACGTTCCAAGTGGAGTTGAATCGAGGAAATTTGAACAGTTCCCTTCAACCCCAGTTATCAGCTATGGAAAACAGGATGGATCTCCAAAATTCCCAGCTCAGAGTCAAGATGGAGTTAGTCCTCATATGGTTCCAACTCATGTTGCGAGTGCAAATGTAGGAATCTCTGTATATACTTTTTGCCGGTTTGATTTCTGATTGGTTAATGCTTAGTGCTTCTTTTCCGTTGGATGCTCAAACTGAAAACTGTGCTTCACACATTTGACCTTATTGTCACTTGTTTAATCATTTCAGGTCCTTGATGAGGATGTTGCTTCACCTGCAGAGATTGCAAAAGCGTTCATGGGCAGCAGGCCTCCAAAAGCAACTCCGTTGAGTATGGCATCCCATAGTCAAAAGTTCGGGGATAGTTTTGCTTCTGGCAATCCTTCAAAATCCTCTACTTTATCTCTTGTGCCAAGGTCTCCTGGAAATTTTGATGTTGTTGAAAATGGTTTTGTCACCCCGAGATCTCGTGGTAGATCTGCCCTATATAGTATGGCTCGAGTGCCATATTCCAGAGTCCGTGCAACACCCAGCATAAAGGTTTGTACTCCCATGAAATACATCTGCTTTATTGTTCGATTGCTTGATAGCTCATGTATTTATTAGCTTTCTTCCCTCTGGTTCATTCTTTAGAATAGTGTAGCAACAACAGATGCTTACAGGGCCACAACGTCCTCATCATCTCAGTCAGCATGGGGGCAAGGGAGACTTTTGGGGTCTGACCAAGGGGTATGATTTGTGAAAAGGCTCTTTTATAAAATGTTATATTATTGAGTAAACCTCTCAGATCATGTTATTTTATTTAATCATTCTCTATGTAGGCTTTAAAACGTCGAAGCTCAGTTTTAGATGATGAAATGGGATCTGTTGGTCCTATTCGAAGAATTCGTCAGAAATCTAATCACCTTTTCCATAAAGGTTTGAGTTTACCAAGCAGTTCCACTTCTATTCCAGTAAGTGGAATTGGTTTTGAGAGTGCTCAGCATTTGCAGTCTACAAAAGTACATCCATTTTCGTCTACCGGTGGGAAGGCACTTTATTCAAGTGAGATCAAGCGTAATTTGTCCAAAATGTCTTCAGAGTCCGAAAATGCTATGACACCTAGTTCAAGTTTTCCTCAAATTCCCCTCAGGTCAAGTGAGATGGCATCAAAAATATTAGAGCAGCTTGATAAATTGACCCCTCCGAAGGAAAAATCTTCCGAACTAAAGCTGCTTAGTGTGAGGAATAACTCACCCACGAAGTTATCACCATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAGAAGCCTGGAAGATGTTGATTCAGCTAAGTATTTGGAAAATGTTGAAGGCATTCGGTCTAACGATGCCCATGATCTTACTTCTCAAAAGAAGGATAAGTTTGAGGAAAGCAGTTCGTTAAAATTTAAAGTACCCAATGATAAATCTATTTCTACAGGTGATGGTGTAGGTTCTTCAGTGCCTACTAAGAATACCGTATCTGGTTCTGGTCTGCAAGTTTCATATGTTGGCCCTTCCTTACAAACAAAATGTGCTTTCCAGATGAGTGCACATGAGGTGTGTGGTTTCCTACCTTCCAGTTTATACAATAGGTCAATCCTGTCATGGTTCTATCTTTCAATATATCCTCGTTCCCACATTCCCCATTTAAATGAATGAAAAGATACTAATTGGGTTGGAGTATCTTTGTCTCAGCATCTAGCATTTCCATTTTTAAATAAGTAAATTACTTTTCAATCATCAAATATCTTTCCATTTCTGTTGAAGTTTTTCATCCTTTATGTTGTTCACGTGCACCTTCACCTGAATAAGAAGGTTTGAAAGTATATCACAATGGAAGTTGTACTAAAAAAAAAAGTATATCATTATGCCTATGTTCGTTATAAAACCTCTTTGGTTTAATGTTCGACTATCTATTATTCTTGCTAGGATTTTGTGGATCTTGATGTCTACTATCTATATGTCCCTTATAGACCCCCCTAGTTGCAATATTTATGGGTTGTCTGTCTCTTTTTGTTAGGATTTTGTGGATATGGATGAAGAAGGATATTCTAATGGGCCAGTAGCTGATATATCGTTGGAGAGGCGTGAAAAAGCTGACTCATTAGTGGCAGTGAGTAAGCCGAATAATACTGAAGCCCTCACAGTAGATAAACCTCAGGCTTCAATTGAGGCTAAACCACCCGCGGCATCTGCAATGAACAAAGTAAATGACCAAGGAAAATCTGATGTTCCTGTGACTACTGAAAAGAGCCCCATTTTTTCCTTTCCGACAGCTTCTCCACCTAGCATTACAGCCAACGTGATAGGTCCTGAATCAACCTTGAGACCTGAAAAAATTGCTTCTTCTGAAGTACCAAAAGCAGCTACTACCCCTATATTTGGCTTTGGAGAAAAGTTTCCATCACAGAAGGAAGCAG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mRNA sequence

ATGGCGACAGAGCGTGAGGAGGTTCGATACGAAGGAGGAAGAGGTGGGAAGTTCCAGAAAAGACCTGTCAGAAGGTCGCATACGACGCCGTATGATCGACCGCCGACTGCTCTGAGGAACTCTGCTGGAAAAGGATGGCTTTCTAAGCTTGTCGATCCGGCGCAGAAGCTAATCACCTCTAGTGCGCATAGGTTGTTTTCTAGTGTGTTTCGTAAACGCCTTCCCCCTCCGCCGCCGTCATTGCCACTTTCTCGAGAGGCTAATGATGAGGTGGAAAATAGGAACCAGGAAGAAGTTGCAGCTGATCCTCCTGGAACTCAAGAAGGGACTAATGTTGATTTTGTTCCAAGCATCAATTCTAATAACACACATGGGGTGAGTGACCTTGAGAAAATTTTGAAGGAGAAGACCTTTACAAGATTTGAAATTGATCGCTTGACTGAACTTCTGAAATCAAGAGTTGCTGACGTTCCAAGTGGAGTTGAATCGAGGAAATTTGAACAGTTCCCTTCAACCCCAGTTATCAGCTATGGAAAACAGGATGGATCTCCAAAATTCCCAGCTCAGAGTCAAGATGGAGTTAGTCCTCATATGGTTCCAACTCATGTTGCGAGTGCAAATGTCCTTGATGAGGATGTTGCTTCACCTGCAGAGATTGCAAAAGCGTTCATGGGCAGCAGGCCTCCAAAAGCAACTCCGTTGAGTATGGCATCCCATAGTCAAAAGTTCGGGGATAGTTTTGCTTCTGGCAATCCTTCAAAATCCTCTACTTTATCTCTTGTGCCAAGGTCTCCTGGAAATTTTGATGTTGTTGAAAATGGTTTTGTCACCCCGAGATCTCGTGGTAGATCTGCCCTATATAGTATGGCTCGAGTGCCATATTCCAGAGTCCGTGCAACACCCAGCATAAAGAATAGTGTAGCAACAACAGATGCTTACAGGGCCACAACGTCCTCATCATCTCAGTCAGCATGGGGGCAAGGGAGACTTTTGGGGTCTGACCAAGGGGCTTTAAAACGTCGAAGCTCAGTTTTAGATGATGAAATGGGATCTGTTGGTCCTATTCGAAGAATTCGTCAGAAATCTAATCACCTTTTCCATAAAGGTTTGAGTTTACCAAGCAGTTCCACTTCTATTCCAGTAAGTGGAATTGGTTTTGAGAGTGCTCAGCATTTGCAGTCTACAAAAGTACATCCATTTTCGTCTACCGGTGGGAAGGCACTTTATTCAAGTGAGATCAAGCGTAATTTGTCCAAAATGTCTTCAGAGTCCGAAAATGCTATGACACCTAGTTCAAGTTTTCCTCAAATTCCCCTCAGGTCAAGTGAGATGGCATCAAAAATATTAGAGCAGCTTGATAAATTGACCCCTCCGAAGGAAAAATCTTCCGAACTAAAGCTGCTTAGTGTGAGGAATAACTCACCCACGAAGTTATCACCATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAGAAGCCTGGAAGATGTTGATTCAGCTAAGTATTTGGAAAATGTTGAAGGCATTCGGTCTAACGATGCCCATGATCTTACTTCTCAAAAGAAGGATAAGTTTGAGGAAAGCAGTTCGTTAAAATTTAAAGTACCCAATGATAAATCTATTTCTACAGGTGATGGTGTAGGTTCTTCAGTGCCTACTAAGAATACCGTATCTGGTTCTGGTCTGCAAGTTTCATATGTTGGCCCTTCCTTACAAACAAAATGTGCTTTCCAGATGAGTGCACATGAGGATTTTGTGGATATGGATGAAGAAGGATATTCTAATGGGCCAGTAGCTGATATATCGTTGGAGAGGCGTGAAAAAGCTGACTCATTAGTGGCAGTGAGTAAGCCGAATAATACTGAAGCCCTCACAGTAGATAAACCTCAGGCTTCAATTGAGGCTAAACCACCCGCGGCATCTGCAATGAACAAAGTAAATGACCAAGGAAAATCTGATGTTCCTGTGACTACTGAAAAGAGCCCCATTTTTTCCTTTCCGACAGCTTCTCCACCTAGCATTACAGCCAACGTGATAGGTCCTGAATCAACCTTGAGACCTGAAAAAATTGCTTCTTCTGAAGTACCAAAAGCAGCTACTACCCCTATATTTGGCTTTGGAGAAAAGTTTCCATCACAGAAGGAAGCAGTTTCTTCTGCCCCCACCTTTGCATTTGGAAACAAGGTTACTACCTCAGCAAATGAACAAAATGCTATTCCTGTCGTAACTTCTGAAGGCAACGTTGAGCCAACTGAACAGGCTTCTGCCCCTACCACATTTAAATTTGGAGATAAAGCTACATTTCCTATTCCAGCAAATGCCGCTACAGAAAATGGAAATAAGAATGCAGGGTCTCTGTTTAAGTTTGCATCACCTTTAGTTAACGAAAAAGAAGGTGCTAAAGTAGGCGGCAGTGCTTCAGTTTTTAAAGCAGAGAGTTCTAGCAGCAGCATCCTGTCATTTGGAGTTCCAAAAGAGTCTATGTCAGAGAAATCTGGCGATAAGAGCTCGGATGCTGGTCTCGCAGTTGGTACATCTGGGAATTTGTTATTGTCATCTGTCTCAACATCAACATCAACACCAACTCCGAGTTTGTTTTCTTTTAGCTCCCCTAGCACTAATTCAAATCTCAACAACGGATCTCTTGTTTCTACTACTCCATCTACTTTTCCCACCCCAGCCACCACTTTTTCTAATAATATAACAAATCAGAATTCATCCATCAAACCATCTTTCAATGCTGCCACTAGCAATAGTGAACCCGTCACCACTACGAGTCTTCCTATGTCTTCTCCTATGCCATCCTTTTCAGCTGCACCCATTTTCAAATTTGGGAGCTCTAGTGTTCCTTCGACATCCGCTCCAGCTCTATCAGCACCAAGCGGAGTTGGATCCATTGAAACCAAGTCCAAGCAAGAGACAACATTTGGCAATTTAAGTGGAATTCCTCCAAGCGACACATCTGCTGTTAAAGTATCTAGTACTGGAAGCAGTGTTTTTCAATTTGGAGCTGCATCTACTACTTCAGATTCTAATAAACGACCAGAAAATTCAACTTTCCCTCCAAGCAACGTTCCTGCATTTGGTGCTCCGGTTTCGCCTGCTAGTAGTGGGCTTGCATCGTCTACTCAGAGTACACCTGTTTTGCAGTTCAGTTCATCATCTACATCATTTGGTTTGACTGGGAATACGGGTTTGGCCTCTGGCGGTTCCCTGTTTGGTTCTTCAGCTCCAGCATCTAATCTGTTCACTACAGGCACGACTTTTGGGCTTGCTTCCTCCAGTTCCTCTGCTAATAATTCTATCAGCTCTAGTGCTGGTACTAGTTCTAGCTTCTTTAACTGGCAGCCTTCCTCCACTCCATCATTTTCTACTGGCTTCAGCTCAACTCCAACTGCAGGATTCTCCTTTGGTCTTTCATCTTCTTCCGCTGCTTCTAATAGTGCACCTATGCTTTTTGGATCATCATCAACTGGTGCATCGACACCTTCTATGTTCTCATTTACTTCAGCTGCAACTGCGACAACGCCACAGCCAGCTTTTGGTAATTCTAATCATGGCTTCACTTTTGGTTCAACACCTCCTGCTAATAATGATCAAGCAAGTATGGAGGATAGCATGGCTGAGGATACTGTCCAGACAGTCGCTTCGCCTATGCCTAGTTTTGGGCAACAGCCCCTCACGCCACCTCCATCATCAGGGTTTGTATTTGGTTCAACAGCTCCTTCTCCGCTAGGAGCGAATCCTTTCCAATTTGGTGGTAGCCAGCAAAATGTACCTACCCCACAGAATCCCTCCCTATTCCAAGCTTCTGGTAGCTTAGACTTCAATGCCAGTGCTGGAGGGAGCTTCTCATTGGGCGCTGGTGGCGGCGACAAATCGAACCGAAAATATGTGAAAGTTAAAAGCAAATCAAGAAAGAAGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCGACAGAGCGTGAGGAGGTTCGATACGAAGGAGGAAGAGGTGGGAAGTTCCAGAAAAGACCTGTCAGAAGGTCGCATACGACGCCGTATGATCGACCGCCGACTGCTCTGAGGAACTCTGCTGGAAAAGGATGGCTTTCTAAGCTTGTCGATCCGGCGCAGAAGCTAATCACCTCTAGTGCGCATAGGTTGTTTTCTAGTGTGTTTCGTAAACGCCTTCCCCCTCCGCCGCCGTCATTGCCACTTTCTCGAGAGGCTAATGATGAGGTGGAAAATAGGAACCAGGAAGAAGTTGCAGCTGATCCTCCTGGAACTCAAGAAGGGACTAATGTTGATTTTGTTCCAAGCATCAATTCTAATAACACACATGGGGTGAGTGACCTTGAGAAAATTTTGAAGGAGAAGACCTTTACAAGATTTGAAATTGATCGCTTGACTGAACTTCTGAAATCAAGAGTTGCTGACGTTCCAAGTGGAGTTGAATCGAGGAAATTTGAACAGTTCCCTTCAACCCCAGTTATCAGCTATGGAAAACAGGATGGATCTCCAAAATTCCCAGCTCAGAGTCAAGATGGAGTTAGTCCTCATATGGTTCCAACTCATGTTGCGAGTGCAAATGTCCTTGATGAGGATGTTGCTTCACCTGCAGAGATTGCAAAAGCGTTCATGGGCAGCAGGCCTCCAAAAGCAACTCCGTTGAGTATGGCATCCCATAGTCAAAAGTTCGGGGATAGTTTTGCTTCTGGCAATCCTTCAAAATCCTCTACTTTATCTCTTGTGCCAAGGTCTCCTGGAAATTTTGATGTTGTTGAAAATGGTTTTGTCACCCCGAGATCTCGTGGTAGATCTGCCCTATATAGTATGGCTCGAGTGCCATATTCCAGAGTCCGTGCAACACCCAGCATAAAGAATAGTGTAGCAACAACAGATGCTTACAGGGCCACAACGTCCTCATCATCTCAGTCAGCATGGGGGCAAGGGAGACTTTTGGGGTCTGACCAAGGGGCTTTAAAACGTCGAAGCTCAGTTTTAGATGATGAAATGGGATCTGTTGGTCCTATTCGAAGAATTCGTCAGAAATCTAATCACCTTTTCCATAAAGGTTTGAGTTTACCAAGCAGTTCCACTTCTATTCCAGTAAGTGGAATTGGTTTTGAGAGTGCTCAGCATTTGCAGTCTACAAAAGTACATCCATTTTCGTCTACCGGTGGGAAGGCACTTTATTCAAGTGAGATCAAGCGTAATTTGTCCAAAATGTCTTCAGAGTCCGAAAATGCTATGACACCTAGTTCAAGTTTTCCTCAAATTCCCCTCAGGTCAAGTGAGATGGCATCAAAAATATTAGAGCAGCTTGATAAATTGACCCCTCCGAAGGAAAAATCTTCCGAACTAAAGCTGCTTAGTGTGAGGAATAACTCACCCACGAAGTTATCACCATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAGAAGCCTGGAAGATGTTGATTCAGCTAAGTATTTGGAAAATGTTGAAGGCATTCGGTCTAACGATGCCCATGATCTTACTTCTCAAAAGAAGGATAAGTTTGAGGAAAGCAGTTCGTTAAAATTTAAAGTACCCAATGATAAATCTATTTCTACAGGTGATGGTGTAGGTTCTTCAGTGCCTACTAAGAATACCGTATCTGGTTCTGGTCTGCAAGTTTCATATGTTGGCCCTTCCTTACAAACAAAATGTGCTTTCCAGATGAGTGCACATGAGGATTTTGTGGATATGGATGAAGAAGGATATTCTAATGGGCCAGTAGCTGATATATCGTTGGAGAGGCGTGAAAAAGCTGACTCATTAGTGGCAGTGAGTAAGCCGAATAATACTGAAGCCCTCACAGTAGATAAACCTCAGGCTTCAATTGAGGCTAAACCACCCGCGGCATCTGCAATGAACAAAGTAAATGACCAAGGAAAATCTGATGTTCCTGTGACTACTGAAAAGAGCCCCATTTTTTCCTTTCCGACAGCTTCTCCACCTAGCATTACAGCCAACGTGATAGGTCCTGAATCAACCTTGAGACCTGAAAAAATTGCTTCTTCTGAAGTACCAAAAGCAGCTACTACCCCTATATTTGGCTTTGGAGAAAAGTTTCCATCACAGAAGGAAGCAGTTTCTTCTGCCCCCACCTTTGCATTTGGAAACAAGGTTACTACCTCAGCAAATGAACAAAATGCTATTCCTGTCGTAACTTCTGAAGGCAACGTTGAGCCAACTGAACAGGCTTCTGCCCCTACCACATTTAAATTTGGAGATAAAGCTACATTTCCTATTCCAGCAAATGCCGCTACAGAAAATGGAAATAAGAATGCAGGGTCTCTGTTTAAGTTTGCATCACCTTTAGTTAACGAAAAAGAAGGTGCTAAAGTAGGCGGCAGTGCTTCAGTTTTTAAAGCAGAGAGTTCTAGCAGCAGCATCCTGTCATTTGGAGTTCCAAAAGAGTCTATGTCAGAGAAATCTGGCGATAAGAGCTCGGATGCTGGTCTCGCAGTTGGTACATCTGGGAATTTGTTATTGTCATCTGTCTCAACATCAACATCAACACCAACTCCGAGTTTGTTTTCTTTTAGCTCCCCTAGCACTAATTCAAATCTCAACAACGGATCTCTTGTTTCTACTACTCCATCTACTTTTCCCACCCCAGCCACCACTTTTTCTAATAATATAACAAATCAGAATTCATCCATCAAACCATCTTTCAATGCTGCCACTAGCAATAGTGAACCCGTCACCACTACGAGTCTTCCTATGTCTTCTCCTATGCCATCCTTTTCAGCTGCACCCATTTTCAAATTTGGGAGCTCTAGTGTTCCTTCGACATCCGCTCCAGCTCTATCAGCACCAAGCGGAGTTGGATCCATTGAAACCAAGTCCAAGCAAGAGACAACATTTGGCAATTTAAGTGGAATTCCTCCAAGCGACACATCTGCTGTTAAAGTATCTAGTACTGGAAGCAGTGTTTTTCAATTTGGAGCTGCATCTACTACTTCAGATTCTAATAAACGACCAGAAAATTCAACTTTCCCTCCAAGCAACGTTCCTGCATTTGGTGCTCCGGTTTCGCCTGCTAGTAGTGGGCTTGCATCGTCTACTCAGAGTACACCTGTTTTGCAGTTCAGTTCATCATCTACATCATTTGGTTTGACTGGGAATACGGGTTTGGCCTCTGGCGGTTCCCTGTTTGGTTCTTCAGCTCCAGCATCTAATCTGTTCACTACAGGCACGACTTTTGGGCTTGCTTCCTCCAGTTCCTCTGCTAATAATTCTATCAGCTCTAGTGCTGGTACTAGTTCTAGCTTCTTTAACTGGCAGCCTTCCTCCACTCCATCATTTTCTACTGGCTTCAGCTCAACTCCAACTGCAGGATTCTCCTTTGGTCTTTCATCTTCTTCCGCTGCTTCTAATAGTGCACCTATGCTTTTTGGATCATCATCAACTGGTGCATCGACACCTTCTATGTTCTCATTTACTTCAGCTGCAACTGCGACAACGCCACAGCCAGCTTTTGGTAATTCTAATCATGGCTTCACTTTTGGTTCAACACCTCCTGCTAATAATGATCAAGCAAGTATGGAGGATAGCATGGCTGAGGATACTGTCCAGACAGTCGCTTCGCCTATGCCTAGTTTTGGGCAACAGCCCCTCACGCCACCTCCATCATCAGGGTTTGTATTTGGTTCAACAGCTCCTTCTCCGCTAGGAGCGAATCCTTTCCAATTTGGTGGTAGCCAGCAAAATGTACCTACCCCACAGAATCCCTCCCTATTCCAAGCTTCTGGTAGCTTAGACTTCAATGCCAGTGCTGGAGGGAGCTTCTCATTGGGCGCTGGTGGCGGCGACAAATCGAACCGAAAATATGTGAAAGTTAAAAGCAAATCAAGAAAGAAGTAG

Protein sequence

MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVAADPPGTQEGTNVDFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQDGSPKFPAQSQDGVSPHMVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHSQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKMSSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSISTGDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISLERREKADSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPTFAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNAGSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSSSSILSFGVPKESMSEKSGDKSSDAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNITNQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQASMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Homology
BLAST of Lsi08G006290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CAF4 (Nuclear pore complex protein NUP1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 412.1 bits (1058), Expect = 2.3e-113
Identity = 494/1428 (34.59%), Postives = 683/1428 (47.83%), Query Frame = 0

Query: 13   GRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRL 72
            G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+        G GWLSKLVDPAQ+LIT SA RL
Sbjct: 18   GTGGKFRKPTARRSQKTPYDRPTTSVRNAGLGGGDVRGGGWLSKLVDPAQRLITYSAQRL 77

Query: 73   FSSVFRKRL---------PPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVA----ADPPGTQEGTNV 132
            F S+ RKRL         P     LP  R  N E +  ++E+V+     +     E TN 
Sbjct: 78   FGSLSRKRLGSGETPLQSPEQQKQLP-ERGVNQETKVGHKEDVSNLSMKNGLIRMEDTNA 137

Query: 133  DFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPST 192
               P        G +DLEKIL+ KTFTR E+DRLT LL+S+ AD  +  E ++ E     
Sbjct: 138  SVDPP-----KDGFTDLEKILQGKTFTRSEVDRLTTLLRSKAADSSTMNEEQRNE----- 197

Query: 193  PVISYGKQDGSPKFPAQSQDGVSPH------MVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGS 252
                 G     P  P+  +D   P       +V T   S   LDE +ASPA++AKA+MGS
Sbjct: 198  ----VGMVVRHP--PSHERDRTHPDNGSMNTLVSTPPGSLRTLDECIASPAQLAKAYMGS 257

Query: 253  RPPKATPLSMASHSQKFGDSFASGN----PSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRG 312
            RP + TP  +    Q   +     N    P KS T+SLV + P     +ENGFVTPRSRG
Sbjct: 258  RPSEVTPSMLGLRGQAGREDSVFLNRTPFPQKSPTMSLVTK-PSGQRPLENGFVTPRSRG 317

Query: 313  RSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQG---ALK 372
            RSA+YSMAR PYSR +++  I            +   +S S W +    GS QG    LK
Sbjct: 318  RSAVYSMARTPYSRPQSSVKI-----------GSLFQASPSKWEESLPSGSRQGFQSGLK 377

Query: 373  RRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHP 432
            RRSSVLD+++GSVGP+RRIRQKSN L  + L+LP S + + V   G E   H        
Sbjct: 378  RRSSVLDNDIGSVGPVRRIRQKSN-LSSRSLALPVSESPLSVRANGGEKTTH-------- 437

Query: 433  FSSTGGKALYSSEIKRNLSKMSSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPK 492
                              SK S+E      P SSF  +P +SSEMASKIL+QLD      
Sbjct: 438  -----------------TSKDSAED----IPGSSFNLVPTKSSEMASKILQQLD------ 497

Query: 493  EKSSELKLLSVRNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKK 552
                  KL+S R  SP+KLSPSML GPAL+SL++V++ K+L N+   ++N + D + QK+
Sbjct: 498  ------KLVSTREKSPSKLSPSMLRGPALKSLQNVEAPKFLGNLPEKKAN-SPDSSYQKQ 557

Query: 553  DKFEESSSLKFKVPNDKSISTGDGVGSSVPTKN-TVSGSGLQVSYVGPSLQ----TKCAF 612
            +   ES S +    ++K+    DG   +  +K+  + G G+ +     SL+     K +F
Sbjct: 558  EISRESVSREVLAQSEKTGDAVDGTSKTGSSKDQDMRGKGVYMPLTN-SLEEHPPKKRSF 617

Query: 613  QMSAHEDFVDMDEE-GYSNGPVADISLERREKADSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAK 672
            +MSAHEDF+++D++ G ++ P      E  EK ++   V K + +  +  +KP    EA 
Sbjct: 618  RMSAHEDFLELDDDLGAASTP-----CEVAEKQNAF-EVEKSHISMPIG-EKPLTPSEAM 677

Query: 673  PPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPTAS-------------------------- 732
            P  +   N    QG S+  + TE++   +FP  +                          
Sbjct: 678  PSTSYISNGDASQGTSNGSLETERNKFVAFPIEAVQQSNMASEPTSKFIQGTEKSSISSG 737

Query: 733  ----------------PPSITANV-IGPEST--LRPEKIASSEVP-KAATTPIFGFGEKF 792
                            P ++  N+   P +T  L     AS+++  +  ++  FG  E +
Sbjct: 738  KPTSEEKRIPLEEPKKPAAVFPNISFSPPATGLLNQNSGASADIKLEKTSSTAFGVSEAW 797

Query: 793  PSQKEAVSSAPTFAFGNKVTTSANE----------QNAIPVVTSEGNVE-----PTEQAS 852
                E+  +    A G + +TSA             NA+    S G++      P   ++
Sbjct: 798  AKPTESKKTFSNSASGAESSTSAAPTLNGSIFSAGANAVTPPPSNGSLTSSPSFPPSISN 857

Query: 853  APTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNAGSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSS 912
             P+    GD  +  + + AAT N +   G L     P  N+        S S   +  SS
Sbjct: 858  IPSDNSVGDMPS-TVQSFAATHNSSSIFGKL-----PTSND------SNSQSTSASPLSS 917

Query: 913  SSILSFGVP-----KESMSEKSGDKSSDAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSS 972
            +S   FG P       ++SE SG  S +  +   T GN         TST     F F  
Sbjct: 918  TSPFKFGQPAAPFSAPAVSESSGQISKETEVKNATFGN---------TST-----FKFGG 977

Query: 973  PSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNITNQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMS 1032
             ++          + +      P   F ++     S++ PS  AA++             
Sbjct: 978  MASADQSTGIVFGAKSAENKSRPGFVFGSSSVVGGSTLNPSTAAASA------------- 1037

Query: 1033 SPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAV 1092
               P  S + IF   SSS P T    +SA S        +   + FG  S    S  S++
Sbjct: 1038 ---PESSGSLIFGVTSSSTPGTETSKISASSA-----ATNTGNSVFGTSSFAFTSSGSSM 1097

Query: 1093 ---KVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTP 1152
                 +STGSSVF F A S+ S ++ + + S        A  A      SG  +STQS P
Sbjct: 1098 VGGVSASTGSSVFGFNAVSSASATSSQSQASNL----FGAGNAQTGNTGSGTTTSTQSIP 1157

Query: 1153 VLQFSS--SSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSISSS 1212
              QF S  S+ SFGL+GN+ LAS  S FG S     +FT+ +T  L+S++SSA++S + S
Sbjct: 1158 -FQFGSSPSAPSFGLSGNSSLASNSSPFGFSKSEPAVFTSVSTPQLSSTNSSASSSSTMS 1217

Query: 1213 A---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTGA 1272
            +   GTS    N  P+S P FS+ F  SSTPT  FSFG SS++  S++   +FG+S+   
Sbjct: 1218 SPLFGTSWQAPNSSPNSGPVFSSSFTTSSTPTT-FSFGGSSAATVSSTTTPIFGASTNNT 1277

Query: 1273 STPS-MFSFTSAATATTPQPA-----------FGNSNHGFTFGSTPPA----NNDQASME 1306
             +PS +F F S    T  QP            FGNS  GF FG+        NN Q SME
Sbjct: 1278 PSPSPIFGFGSTPPTTPQQPVFGNSGTPSQSLFGNSTPGFAFGAPNNGNGINNNQQVSME 1309

BLAST of Lsi08G006290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C4Z3 (nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496528 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 2011.9 bits (5211), Expect = 0.0e+00
Identity = 1123/1307 (85.92%), Postives = 1188/1307 (90.90%), Query Frame = 0

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATEREEV+YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVAADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFS+VFRKRLPPPPPS  LSREAN+E+E+RNQEEVAADP GTQEGTNV FVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQ 180
            +NT G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQ PSTPV S+G Q
Sbjct: 121  SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180

Query: 181  DGSPKFPAQSQDGVSPHMVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHS 240
            +GSPKFP QSQDGVSPHM PTHV +ANVLDEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSMA   
Sbjct: 181  EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA--- 240

Query: 241  QKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
                     GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
Sbjct: 241  ---------GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300

Query: 301  PSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQ 360
            PSIKNS+ATTDAYRATTSSSSQSAW QG LLGS QGALKRR+SVLDD+MGSVGPIRR RQ
Sbjct: 301  PSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQ 360

Query: 361  KSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKM 420
            KSNHLF  GLSLPSSSTSIP SGI  E+A+HLQSTKVHPFSS GGK LYSSE +RN SK 
Sbjct: 361  KSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKT 420

Query: 421  SSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSP 480
            S+ES+NAMTPSSSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSP KLSP
Sbjct: 421  SAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSP 480

Query: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSIST 540
            SMLHGPALRSLE+VDSAKYLENVEGI+SNDA D TSQK DKFEESS  K  VPNDKSIST
Sbjct: 481  SMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSIST 540

Query: 541  GDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL 600
             DGVGSSVPTK+  SGSG+QVS+VGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG+SNGPVAD S 
Sbjct: 541  SDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF 600

Query: 601  ERREKA-DSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSP 660
            E REK  DSLV+VSKP NTEA+TV K + SIEAKP   S MNK+NDQGKSDVP TTEKSP
Sbjct: 601  EMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSP 660

Query: 661  IFSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPT 720
            IFSFPT S PS TANV GPES+LRPEK+AS E+PKAAT PIFGFGEK PSQKE +S  PT
Sbjct: 661  IFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKETLSQPPT 720

Query: 721  FAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN 780
            FAFG+K TT+ NEQNAIPVVTSE N EPT+ AS PTTFKFGDKA+F IPANAATENGNK+
Sbjct: 721  FAFGSKATTT-NEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKS 780

Query: 781  AGSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSSSSILSFGVPKESMSEKSGDKSSDAGLA 840
            AGSLFKF SPLVNEKEGA VGGSASVFKAE+SSSSI SFGVPKESMSEK+GDKSS  GL 
Sbjct: 781  AGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLI 840

Query: 841  VGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNIT 900
             GTSGNL  SS STSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVS TPST PTPATTFSNN+T
Sbjct: 841  FGTSGNLFSSSDSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVT 900

Query: 901  NQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSG 960
            +QNSSIKPS  AATSNSEPVT+TS PMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSA ALSAPSG
Sbjct: 901  SQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSG 960

Query: 961  VGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFPP 1020
            VGS+E K+K ETTFGNLSG+PPSDT+AVKV+STGSSVFQFGAASTTSD+NK P NSTF  
Sbjct: 961  VGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQ 1020

Query: 1021 SNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNL 1080
            +N+PAFGAPVS +SSGLASSTQSTP LQF SSSTSFGLTGNTGLASG SLFGSSAPASN 
Sbjct: 1021 NNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNP 1080

Query: 1081 FTTGTTFGLASSSSSANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSS 1140
            FT+G TFGLASSSSSANNS+SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+ GFSFGLSSS
Sbjct: 1081 FTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSS 1140

Query: 1141 SAASNSAPMLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPA-NNDQA 1200
            S+ASNSAPM+FGSSSTGAS  SMFSFTSAA+ATT QPAFGNSN+ FTFGSTPPA NN+QA
Sbjct: 1141 SSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQA 1200

Query: 1201 SMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPT 1260
            SMEDSMAEDTVQT ASPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV  
Sbjct: 1201 SMEDSMAEDTVQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV-- 1260

Query: 1261 PQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1306
            PQNPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1290

BLAST of Lsi08G006290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SNY9 (Nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold304G001170 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 2011.9 bits (5211), Expect = 0.0e+00
Identity = 1123/1307 (85.92%), Postives = 1188/1307 (90.90%), Query Frame = 0

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATEREEV+YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVAADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFS+VFRKRLPPPPPS  LSREAN+E+E+RNQEEVAADP GTQEGTNV FVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQ 180
            +NT G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQ PSTPV S+G Q
Sbjct: 121  SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180

Query: 181  DGSPKFPAQSQDGVSPHMVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHS 240
            +GSPKFP QSQDGVSPHM PTHV +ANVLDEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSMA   
Sbjct: 181  EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA--- 240

Query: 241  QKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
                     GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
Sbjct: 241  ---------GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300

Query: 301  PSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQ 360
            PSIKNS+ATTDAYRATTSSSSQSAW QG LLGS QGALKRR+SVLDD+MGSVGPIRR RQ
Sbjct: 301  PSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQ 360

Query: 361  KSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKM 420
            KSNHLF  GLSLPSSSTSIP SGI  E+A+HLQSTKVHPFSS GGK LYSSE +RN SK 
Sbjct: 361  KSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKT 420

Query: 421  SSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSP 480
            S+ES+NAMTPSSSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSP KLSP
Sbjct: 421  SAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSP 480

Query: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSIST 540
            SMLHGPALRSLE+VDSAKYLENVEGI+SNDA D TSQK DKFEESS  K  VPNDKSIST
Sbjct: 481  SMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSIST 540

Query: 541  GDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL 600
             DGVGSSVPTK+  SGSG+QVS+VGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG+SNGPVAD S 
Sbjct: 541  SDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF 600

Query: 601  ERREKA-DSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSP 660
            E REK  DSLV+VSKP NTEA+TV K + SIEAKP   S MNK+NDQGKSDVP TTEKSP
Sbjct: 601  EMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSP 660

Query: 661  IFSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPT 720
            IFSFPT S PS TANV GPES+LRPEK+AS E+PKAAT PIFGFGEK PSQKE +S  PT
Sbjct: 661  IFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKETLSQPPT 720

Query: 721  FAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN 780
            FAFG+K TT+ NEQNAIPVVTSE N EPT+ AS PTTFKFGDKA+F IPANAATENGNK+
Sbjct: 721  FAFGSKATTT-NEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKS 780

Query: 781  AGSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSSSSILSFGVPKESMSEKSGDKSSDAGLA 840
            AGSLFKF SPLVNEKEGA VGGSASVFKAE+SSSSI SFGVPKESMSEK+GDKSS  GL 
Sbjct: 781  AGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLI 840

Query: 841  VGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNIT 900
             GTSGNL  SS STSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVS TPST PTPATTFSNN+T
Sbjct: 841  FGTSGNLFSSSDSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVT 900

Query: 901  NQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSG 960
            +QNSSIKPS  AATSNSEPVT+TS PMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSA ALSAPSG
Sbjct: 901  SQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSG 960

Query: 961  VGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFPP 1020
            VGS+E K+K ETTFGNLSG+PPSDT+AVKV+STGSSVFQFGAASTTSD+NK P NSTF  
Sbjct: 961  VGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQ 1020

Query: 1021 SNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNL 1080
            +N+PAFGAPVS +SSGLASSTQSTP LQF SSSTSFGLTGNTGLASG SLFGSSAPASN 
Sbjct: 1021 NNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNP 1080

Query: 1081 FTTGTTFGLASSSSSANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSS 1140
            FT+G TFGLASSSSSANNS+SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+ GFSFGLSSS
Sbjct: 1081 FTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSS 1140

Query: 1141 SAASNSAPMLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPA-NNDQA 1200
            S+ASNSAPM+FGSSSTGAS  SMFSFTSAA+ATT QPAFGNSN+ FTFGSTPPA NN+QA
Sbjct: 1141 SSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQA 1200

Query: 1201 SMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPT 1260
            SMEDSMAEDTVQT ASPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV  
Sbjct: 1201 SMEDSMAEDTVQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV-- 1260

Query: 1261 PQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1306
            PQNPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1290

BLAST of Lsi08G006290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K9E4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G046360 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1999.2 bits (5178), Expect = 0.0e+00
Identity = 1110/1307 (84.93%), Postives = 1184/1307 (90.59%), Query Frame = 0

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATERE+V+YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLS LVDPA KLI S
Sbjct: 1    MATEREDVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSNLVDPAHKLINS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVAADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            +AH LFS+VFRKRLPPPPPS PLSREANDE+E+RNQEEVAADP GTQEGTN+ FVPSINS
Sbjct: 61   TAHWLFSTVFRKRLPPPPPSFPLSREANDEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNIGFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQ 180
            NNT G+SDLEKIL EKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVP GVESRKFEQ PSTPV S+G Q
Sbjct: 121  NNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPRGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQ 180

Query: 181  DGSPKFPAQSQDGVSPHMVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHS 240
            +GSPK P QSQDGVSPHM  THV +ANVLDEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSMA   
Sbjct: 181  EGSPKLPTQSQDGVSPHMATTHVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA--- 240

Query: 241  QKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
                     GNP KSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
Sbjct: 241  ---------GNPLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300

Query: 301  PSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQ 360
            PSIKNS+AT DAYR+TT SSSQSAW QGRLLGS QGALKRR+SVLDD+MGSVGPIRR RQ
Sbjct: 301  PSIKNSIATADAYRSTTPSSSQSAWEQGRLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQ 360

Query: 361  KSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKM 420
            KSNHLF   L LPSSSTSI  SGIG E+A+HLQSTKVHPFSS GGK LYS+EI+RN SKM
Sbjct: 361  KSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNEIQRNFSKM 420

Query: 421  SSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSP 480
            ++ES+NAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSP KLSP
Sbjct: 421  TAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSP 480

Query: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSIST 540
            SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDA DLTSQK DKFEESS  KF VPNDKSIST
Sbjct: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSIST 540

Query: 541  GDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL 600
            GDGVGSSV TK+  SGSG+QVS+VGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG+SNGPVAD S 
Sbjct: 541  GDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF 600

Query: 601  ERREKA-DSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSP 660
            E + K  DSLV+VSKP NTE +TVDK +ASIEAKP   S MNK+NDQGKSDVP TTEKSP
Sbjct: 601  EMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSP 660

Query: 661  IFSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPT 720
            IFSFPTAS PSITANV G ES+LRPEK+AS E+PKAAT PIFGFGEK PSQKEA S  PT
Sbjct: 661  IFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKEAGSHPPT 720

Query: 721  FAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN 780
            FAFG+K TT+ NEQN I VVTSE NVEPT+QAS PTTFKFGDKA+FPIPANAATENGNK+
Sbjct: 721  FAFGSKATTT-NEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGNKS 780

Query: 781  AGSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSSSSILSFGVPKESMSEKSGDKSSDAGLA 840
            AGSLFKFASPLVNEKEGA VGGSASVFKAE+SSSSI SFGVPKES+SEK+GDKSS  GL 
Sbjct: 781  AGSLFKFASPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLI 840

Query: 841  VGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNIT 900
             GTSGN   SSVSTSTSTPTPSLFSFS+PSTNSNLNNGSLVSTTPST PTPATTFSNN+T
Sbjct: 841  FGTSGNFFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVT 900

Query: 901  NQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSG 960
            +QNSS+KPSF+AATSNSEPV++TS P SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPS 
Sbjct: 901  SQNSSVKPSFSAATSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSV 960

Query: 961  VGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFPP 1020
            VGS+ETK+K ETTFGNLSG P SDTSAVKV+STG+SVFQFGAASTTSD+NK P NSTF  
Sbjct: 961  VGSVETKTKPETTFGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQ 1020

Query: 1021 SNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNL 1080
            +N+PAFGAPVS +SSGLA STQSTP LQFSSSSTSFGLT NTGLASG SLFGSSAPASN 
Sbjct: 1021 NNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNP 1080

Query: 1081 FTTGTTFGLASSSSSANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSS 1140
            FT+G TFGLASSSSSA+NS+SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+ GFSFGLSSS
Sbjct: 1081 FTSGATFGLASSSSSASNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSS 1140

Query: 1141 SAASNSAPMLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPA-NNDQA 1200
            S+ASNSAPM+FGSSSTGA + SMFSFTSAA+ATT QPAFGNSN+ FTFGSTPPA NN+QA
Sbjct: 1141 SSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQA 1200

Query: 1201 SMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPT 1260
            SMEDSMAEDT+QT ASPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQF GSQQN+  
Sbjct: 1201 SMEDSMAEDTIQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGSQQNL-- 1260

Query: 1261 PQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1306
            PQNPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1291

BLAST of Lsi08G006290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FKS9 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444902 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1973.4 bits (5111), Expect = 0.0e+00
Identity = 1118/1311 (85.28%), Postives = 1178/1311 (89.86%), Query Frame = 0

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATERE V YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS GKGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREGVHYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPIALRNSNGKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVAADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLP+SREANDE+E +NQEEVAADPPGTQEGTN DFVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISREANDEMEIKNQEEVAADPPGTQEGTNNDFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQ 180
            NN HGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE   STPVISY  Q
Sbjct: 121  NNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQ 180

Query: 181  DGSPKFPAQSQDGVSPHMVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHS 240
            +GSPKFPA  Q+GV PHMVPTHV +ANV DEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSM +HS
Sbjct: 181  EGSPKFPA--QEGVRPHMVPTHVLNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHS 240

Query: 241  QKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
            QKFGD+FA GNPSKSSTLSLVPRSPGNFD VEN FVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
Sbjct: 241  QKFGDTFALGNPSKSSTLSLVPRSPGNFD-VENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRAT 300

Query: 301  PSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQ 360
            PSIKNSVATTD+YRAT +SSSQSAW QGRLL S+QGALKRRSSVLDDE+GSVGPIRRIR 
Sbjct: 301  PSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRH 360

Query: 361  KSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKM 420
            KSN LF KGLSLPSSSTSIPVSGIG E++QHLQSTKVHPFSS  GKA YSSE KRNLSKM
Sbjct: 361  KSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSPAGKAPYSSETKRNLSKM 420

Query: 421  SSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSP 480
            S+ESEN  TPSSSFPQIPLRSSEMA KILEQLDKLTPPKEKSSELKL SVRNNSP KLSP
Sbjct: 421  SAESENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSP 480

Query: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSIST 540
            SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVE IRSND  DLTS+KKDKFE+SS LK KVP+DKSIST
Sbjct: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDLTSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDKSIST 540

Query: 541  GDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL 600
            G GVGSSVP+K+TVS SGLQVS+VGPS  TKCAFQMS  EDFVDMD+E YSNGPV+  S 
Sbjct: 541  GGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVSAKSF 600

Query: 601  ERREKA-DSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSP 660
            ERREK  DSLVAV KP++TEA+TVDKPQASI+AKP   S M K+NDQ KSDVPVTTEKS 
Sbjct: 601  ERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSS 660

Query: 661  IFSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPT 720
            IFSFPTASP S TANVI PEST RPEKIASSEVPKAA  PIFGFGEK PSQK+ V S+PT
Sbjct: 661  IFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQKDPVFSSPT 720

Query: 721  FAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN 780
            F FGNKVTTS NEQNA+P VTSEGNV PT QASAPTTFKFGDKATFPIPA+ ATENGN  
Sbjct: 721  FTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSE 780

Query: 781  AGSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSSSSILSFGVPKESMSEKSGD-KSSDAGL 840
            AGS FKFAS LVNEKEGAK  GSASVFK+ESSSSS LSFGVPKESMSEK+GD KSS AGL
Sbjct: 781  AGSPFKFASSLVNEKEGAK-AGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESMSEKAGDKKSSSAGL 840

Query: 841  AVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNI 900
            +VGTSGNLLLSSVS   STPTPSLFSFSSP+TNSNL NGSL  +TPSTFP+P+ TF +NI
Sbjct: 841  SVGTSGNLLLSSVS---STPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSL-GSTPSTFPSPSNTFPSNI 900

Query: 901  TNQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPS 960
            TNQNSSIKPS NAATSNSEPVTTTSL  SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPS+     SAPS
Sbjct: 901  TNQNSSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSS-----SAPS 960

Query: 961  GVGSIETKSKQETT-FGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTF 1020
            GVGS+ETK+KQETT FGN+SGI PSDTSA KV STGSSVFQFGAASTTSDSNK+PE STF
Sbjct: 961  GVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNKQPEKSTF 1020

Query: 1021 PPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPAS 1080
             P +VP+FGAPV PASSG+ASSTQSTPV  FSSSSTSFGLTGNTGLASG SL GSSAPAS
Sbjct: 1021 APVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPAS 1080

Query: 1081 NLFTTGTTFGLASSSSSANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLS 1140
            NLFT+G TFG   SSSSANNS+SS AGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STPT GFSFGL+
Sbjct: 1081 NLFTSGATFGF-GSSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLA 1140

Query: 1141 SSSAASNSAPMLFGSSSTG-ASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPANND 1200
            SSSAAS+S+PMLFGSS+TG AST SMFSFTSAATA   QPAFG SNHGFTFGSTPPANND
Sbjct: 1141 SSSAASSSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAAPSQPAFGTSNHGFTFGSTPPANND 1200

Query: 1201 QASMEDSMAEDTVQTVAS--PMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQ 1260
             A+MEDSMAEDTVQTVAS  PMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQ
Sbjct: 1201 HANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQ 1260

Query: 1261 NVPTPQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1306
            NVPTPQNP+ FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 NVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1297

BLAST of Lsi08G006290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FF52 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444902 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1968.0 bits (5097), Expect = 0.0e+00
Identity = 1118/1315 (85.02%), Postives = 1178/1315 (89.58%), Query Frame = 0

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATERE V YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS GKGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREGVHYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPIALRNSNGKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVAADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLP+SREANDE+E +NQEEVAADPPGTQEGTN DFVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISREANDEMEIKNQEEVAADPPGTQEGTNNDFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQ 180
            NN HGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE   STPVISY  Q
Sbjct: 121  NNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQ 180

Query: 181  DGSPKFPAQSQDGVSPHMVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHS 240
            +GSPKFPA  Q+GV PHMVPTHV +ANV DEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSM +HS
Sbjct: 181  EGSPKFPA--QEGVRPHMVPTHVLNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHS 240

Query: 241  QKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
            QKFGD+FA GNPSKSSTLSLVPRSPGNFD VEN FVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
Sbjct: 241  QKFGDTFALGNPSKSSTLSLVPRSPGNFD-VENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRAT 300

Query: 301  PSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQ 360
            PSIKNSVATTD+YRAT +SSSQSAW QGRLL S+QGALKRRSSVLDDE+GSVGPIRRIR 
Sbjct: 301  PSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRH 360

Query: 361  KSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKM 420
            KSN LF KGLSLPSSSTSIPVSGIG E++QHLQSTKVHPFSS  GKA YSSE KRNLSKM
Sbjct: 361  KSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSPAGKAPYSSETKRNLSKM 420

Query: 421  SSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSP 480
            S+ESEN  TPSSSFPQIPLRSSEMA KILEQLDKLTPPKEKSSELKL SVRNNSP KLSP
Sbjct: 421  SAESENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSP 480

Query: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSIST 540
            SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVE IRSND  DLTS+KKDKFE+SS LK KVP+DKSIST
Sbjct: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDLTSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDKSIST 540

Query: 541  GDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL 600
            G GVGSSVP+K+TVS SGLQVS+VGPS  TKCAFQMS  EDFVDMD+E YSNGPV+  S 
Sbjct: 541  GGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVSAKSF 600

Query: 601  ERREKA-DSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSP 660
            ERREK  DSLVAV KP++TEA+TVDKPQASI+AKP   S M K+NDQ KSDVPVTTEKS 
Sbjct: 601  ERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSS 660

Query: 661  IFSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPT 720
            IFSFPTASP S TANVI PEST RPEKIASSEVPKAA  PIFGFGEK PSQK+ V S+PT
Sbjct: 661  IFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQKDPVFSSPT 720

Query: 721  FAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN 780
            F FGNKVTTS NEQNA+P VTSEGNV PT QASAPTTFKFGDKATFPIPA+ ATENGN  
Sbjct: 721  FTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSE 780

Query: 781  AGSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSSSSI----LSFGVPKESMSEKSGD-KSS 840
            AGS FKFAS LVNEKEGAK  GSASVFK+ESSSSS     LSFGVPKESMSEK+GD KSS
Sbjct: 781  AGSPFKFASSLVNEKEGAK-AGSASVFKSESSSSSFNCSTLSFGVPKESMSEKAGDKKSS 840

Query: 841  DAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTF 900
             AGL+VGTSGNLLLSSVS   STPTPSLFSFSSP+TNSNL NGSL  +TPSTFP+P+ TF
Sbjct: 841  SAGLSVGTSGNLLLSSVS---STPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSL-GSTPSTFPSPSNTF 900

Query: 901  SNNITNQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPAL 960
             +NITNQNSSIKPS NAATSNSEPVTTTSL  SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPS+     
Sbjct: 901  PSNITNQNSSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSS----- 960

Query: 961  SAPSGVGSIETKSKQETT-FGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPE 1020
            SAPSGVGS+ETK+KQETT FGN+SGI PSDTSA KV STGSSVFQFGAASTTSDSNK+PE
Sbjct: 961  SAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNKQPE 1020

Query: 1021 NSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSS 1080
             STF P +VP+FGAPV PASSG+ASSTQSTPV  FSSSSTSFGLTGNTGLASG SL GSS
Sbjct: 1021 KSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSS 1080

Query: 1081 APASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFS 1140
            APASNLFT+G TFG   SSSSANNS+SS AGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STPT GFS
Sbjct: 1081 APASNLFTSGATFGF-GSSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFS 1140

Query: 1141 FGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTG-ASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPP 1200
            FGL+SSSAAS+S+PMLFGSS+TG AST SMFSFTSAATA   QPAFG SNHGFTFGSTPP
Sbjct: 1141 FGLASSSAASSSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAAPSQPAFGTSNHGFTFGSTPP 1200

Query: 1201 ANNDQASMEDSMAEDTVQTVAS--PMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFG 1260
            ANND A+MEDSMAEDTVQTVAS  PMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFG
Sbjct: 1201 ANNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFG 1260

Query: 1261 GSQQNVPTPQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1306
            GSQQNVPTPQNP+ FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 GSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1301

BLAST of Lsi08G006290 vs. NCBI nr
Match: XP_038884354.1 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 2164.0 bits (5606), Expect = 0.0e+00
Identity = 1198/1306 (91.73%), Postives = 1235/1306 (94.56%), Query Frame = 0

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATEREEVRYEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVAADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDE+ENRNQEEVAADPP TQEGTNVDFVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEMENRNQEEVAADPPVTQEGTNVDFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQ 180
            NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVES K EQ PSTPVISYGKQ
Sbjct: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESGKLEQVPSTPVISYGKQ 180

Query: 181  DGSPKFPAQSQDGVSPHMVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHS 240
            +G PKFPAQSQDGVSPHMV THV SANVLDEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSMASHS
Sbjct: 181  EGCPKFPAQSQDGVSPHMVSTHVVSANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHS 240

Query: 241  QKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
            QKFGD F+ GNPSKS TLSL+PRSPGNFD VENGFVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
Sbjct: 241  QKFGDGFSLGNPSKSPTLSLMPRSPGNFD-VENGFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRAT 300

Query: 301  PSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQ 360
            PSIKNSVATTDAYRA TSSSSQSAWGQGRLLGS+QGALKRR+SVLDDEMGSVGPIRRIR 
Sbjct: 301  PSIKNSVATTDAYRA-TSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRNSVLDDEMGSVGPIRRIRH 360

Query: 361  KSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKM 420
            KSNHLF KGLSLPSSSTSIPVSGIG E++QHLQSTKVHPFSSTGGK LYSSE KRNLSKM
Sbjct: 361  KSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSTGGKGLYSSETKRNLSKM 420

Query: 421  SSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSP 480
            S+ESEN M PSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSP+KLSP
Sbjct: 421  SAESENDMIPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPSKLSP 480

Query: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSIST 540
            SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDA DLTS+K DKFEESS LKFKVPNDKSIST
Sbjct: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDACDLTSKKNDKFEESSPLKFKVPNDKSIST 540

Query: 541  GDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL 600
            G+GVGSSVP K TVSGSG QVS+VGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADIS+
Sbjct: 541  GNGVGSSVP-KETVSGSGQQVSFVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISI 600

Query: 601  ERREKADSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPI 660
            ER+EK +SLVAVSKPNNTEA+TVDKPQASIEAKPP  SAMNK+NDQGKSDVPVTTEKSPI
Sbjct: 601  ERQEKVNSLVAVSKPNNTEAITVDKPQASIEAKPPTVSAMNKINDQGKSDVPVTTEKSPI 660

Query: 661  FSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPTF 720
            FSFPT S PSITANVIGPES +RPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVS APTF
Sbjct: 661  FSFPTTSSPSITANVIGPESNMRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSFAPTF 720

Query: 721  AFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNA 780
            AF NK+TTS NEQNAIPVVTSEGNV+PT+QASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN 
Sbjct: 721  AFVNKITTSTNEQNAIPVVTSEGNVQPTQQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNE 780

Query: 781  GSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSSSSILSFGVPKESMSEKSGDKSSDAGLAV 840
            GS   FASPLVNEKEGAK GGSASVFKAESSSSSI SFGVPKESMSEK+GDKSS AG AV
Sbjct: 781  GSPL-FASPLVNEKEGAKEGGSASVFKAESSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSAGFAV 840

Query: 841  GTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNITN 900
            GTSG+L  SSVSTS STPT  LFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPS FPTPATTFSNNITN
Sbjct: 841  GTSGSLFSSSVSTSISTPTSGLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPS-FPTPATTFSNNITN 900

Query: 901  QNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGV 960
            QNSSIKPSFNAA SNSEPVTTTSLP SS MPSFSAAPI KFGSSSVPSTSAPALSAPSGV
Sbjct: 901  QNSSIKPSFNAAASNSEPVTTTSLPTSSLMPSFSAAPISKFGSSSVPSTSAPALSAPSGV 960

Query: 961  GSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFPPS 1020
            GSIE+K+KQETTFGNLSGIPPSD SAVKVSSTGSSVFQFGAAST SDSNKRP NSTF PS
Sbjct: 961  GSIESKTKQETTFGNLSGIPPSDLSAVKVSSTGSSVFQFGAASTPSDSNKRPANSTFTPS 1020

Query: 1021 NVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLF 1080
            NVP FGA  SP SSGLASSTQSTPVLQF+SSSTSFGLTGNTGLASG SLFGSSAPASNLF
Sbjct: 1021 NVPTFGASFSPVSSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNLF 1080

Query: 1081 TTGTTFGLASSSSSANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSSS 1140
             +G TFGLASSSSS NNS+SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPT GFSFGLSSSS
Sbjct: 1081 ASGPTFGLASSSSSVNNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSS 1140

Query: 1141 AASNSAPMLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQASM 1200
            AASNSAP+LFGSSSTG+ TPSMFSFTSAATATT QPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQA+M
Sbjct: 1141 AASNSAPVLFGSSSTGSLTPSMFSFTSAATATTSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQANM 1200

Query: 1201 EDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQ 1260
            EDSMAEDTVQTV SPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP PLGA+PFQFGGSQQNVPTPQ
Sbjct: 1201 EDSMAEDTVQTVTSPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP-PLGASPFQFGGSQQNVPTPQ 1260

Query: 1261 -NPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1306
             NPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 NNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1300

BLAST of Lsi08G006290 vs. NCBI nr
Match: XP_038884353.1 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 2158.3 bits (5591), Expect = 0.0e+00
Identity = 1198/1310 (91.45%), Postives = 1235/1310 (94.27%), Query Frame = 0

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATEREEVRYEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVAADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDE+ENRNQEEVAADPP TQEGTNVDFVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEMENRNQEEVAADPPVTQEGTNVDFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQ 180
            NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVES K EQ PSTPVISYGKQ
Sbjct: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESGKLEQVPSTPVISYGKQ 180

Query: 181  DGSPKFPAQSQDGVSPHMVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHS 240
            +G PKFPAQSQDGVSPHMV THV SANVLDEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSMASHS
Sbjct: 181  EGCPKFPAQSQDGVSPHMVSTHVVSANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHS 240

Query: 241  QKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
            QKFGD F+ GNPSKS TLSL+PRSPGNFD VENGFVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
Sbjct: 241  QKFGDGFSLGNPSKSPTLSLMPRSPGNFD-VENGFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRAT 300

Query: 301  PSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQ 360
            PSIKNSVATTDAYRA TSSSSQSAWGQGRLLGS+QGALKRR+SVLDDEMGSVGPIRRIR 
Sbjct: 301  PSIKNSVATTDAYRA-TSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRNSVLDDEMGSVGPIRRIRH 360

Query: 361  KSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKM 420
            KSNHLF KGLSLPSSSTSIPVSGIG E++QHLQSTKVHPFSSTGGK LYSSE KRNLSKM
Sbjct: 361  KSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSTGGKGLYSSETKRNLSKM 420

Query: 421  SSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSP 480
            S+ESEN M PSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSP+KLSP
Sbjct: 421  SAESENDMIPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPSKLSP 480

Query: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSIST 540
            SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDA DLTS+K DKFEESS LKFKVPNDKSIST
Sbjct: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDACDLTSKKNDKFEESSPLKFKVPNDKSIST 540

Query: 541  GDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL 600
            G+GVGSSVP K TVSGSG QVS+VGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADIS+
Sbjct: 541  GNGVGSSVP-KETVSGSGQQVSFVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISI 600

Query: 601  ERREKADSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPI 660
            ER+EK +SLVAVSKPNNTEA+TVDKPQASIEAKPP  SAMNK+NDQGKSDVPVTTEKSPI
Sbjct: 601  ERQEKVNSLVAVSKPNNTEAITVDKPQASIEAKPPTVSAMNKINDQGKSDVPVTTEKSPI 660

Query: 661  FSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPTF 720
            FSFPT S PSITANVIGPES +RPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVS APTF
Sbjct: 661  FSFPTTSSPSITANVIGPESNMRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSFAPTF 720

Query: 721  AFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNA 780
            AF NK+TTS NEQNAIPVVTSEGNV+PT+QASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN 
Sbjct: 721  AFVNKITTSTNEQNAIPVVTSEGNVQPTQQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNE 780

Query: 781  GSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSSS----SILSFGVPKESMSEKSGDKSSDA 840
            GS   FASPLVNEKEGAK GGSASVFKAESSSS    SI SFGVPKESMSEK+GDKSS A
Sbjct: 781  GSPL-FASPLVNEKEGAKEGGSASVFKAESSSSSFNCSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSA 840

Query: 841  GLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSN 900
            G AVGTSG+L  SSVSTS STPT  LFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPS FPTPATTFSN
Sbjct: 841  GFAVGTSGSLFSSSVSTSISTPTSGLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPS-FPTPATTFSN 900

Query: 901  NITNQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSA 960
            NITNQNSSIKPSFNAA SNSEPVTTTSLP SS MPSFSAAPI KFGSSSVPSTSAPALSA
Sbjct: 901  NITNQNSSIKPSFNAAASNSEPVTTTSLPTSSLMPSFSAAPISKFGSSSVPSTSAPALSA 960

Query: 961  PSGVGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENST 1020
            PSGVGSIE+K+KQETTFGNLSGIPPSD SAVKVSSTGSSVFQFGAAST SDSNKRP NST
Sbjct: 961  PSGVGSIESKTKQETTFGNLSGIPPSDLSAVKVSSTGSSVFQFGAASTPSDSNKRPANST 1020

Query: 1021 FPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPA 1080
            F PSNVP FGA  SP SSGLASSTQSTPVLQF+SSSTSFGLTGNTGLASG SLFGSSAPA
Sbjct: 1021 FTPSNVPTFGASFSPVSSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPA 1080

Query: 1081 SNLFTTGTTFGLASSSSSANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGL 1140
            SNLF +G TFGLASSSSS NNS+SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPT GFSFGL
Sbjct: 1081 SNLFASGPTFGLASSSSSVNNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFSFGL 1140

Query: 1141 SSSSAASNSAPMLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPANND 1200
            SSSSAASNSAP+LFGSSSTG+ TPSMFSFTSAATATT QPAFGNSNHGFTFGSTPPANND
Sbjct: 1141 SSSSAASNSAPVLFGSSSTGSLTPSMFSFTSAATATTSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANND 1200

Query: 1201 QASMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV 1260
            QA+MEDSMAEDTVQTV SPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP PLGA+PFQFGGSQQNV
Sbjct: 1201 QANMEDSMAEDTVQTVTSPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP-PLGASPFQFGGSQQNV 1260

Query: 1261 PTPQ-NPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1306
            PTPQ NPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 PTPQNNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1304

BLAST of Lsi08G006290 vs. NCBI nr
Match: XP_038884355.1 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X3 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 2147.5 bits (5563), Expect = 0.0e+00
Identity = 1195/1310 (91.22%), Postives = 1232/1310 (94.05%), Query Frame = 0

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATEREEVRYEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVAADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDE+ENRNQEEVAADPP TQEGTNVDFVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEMENRNQEEVAADPPVTQEGTNVDFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQ 180
            NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVES K EQ PSTPVISYGKQ
Sbjct: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESGKLEQVPSTPVISYGKQ 180

Query: 181  DGSPKFPAQSQDGVSPHMVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHS 240
            +G PKFPAQSQDGVSPHMV THV    VLDEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSMASHS
Sbjct: 181  EGCPKFPAQSQDGVSPHMVSTHV----VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHS 240

Query: 241  QKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
            QKFGD F+ GNPSKS TLSL+PRSPGNFD VENGFVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
Sbjct: 241  QKFGDGFSLGNPSKSPTLSLMPRSPGNFD-VENGFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRAT 300

Query: 301  PSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQ 360
            PSIKNSVATTDAYRA TSSSSQSAWGQGRLLGS+QGALKRR+SVLDDEMGSVGPIRRIR 
Sbjct: 301  PSIKNSVATTDAYRA-TSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRNSVLDDEMGSVGPIRRIRH 360

Query: 361  KSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKM 420
            KSNHLF KGLSLPSSSTSIPVSGIG E++QHLQSTKVHPFSSTGGK LYSSE KRNLSKM
Sbjct: 361  KSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSTGGKGLYSSETKRNLSKM 420

Query: 421  SSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSP 480
            S+ESEN M PSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSP+KLSP
Sbjct: 421  SAESENDMIPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPSKLSP 480

Query: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSIST 540
            SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDA DLTS+K DKFEESS LKFKVPNDKSIST
Sbjct: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDACDLTSKKNDKFEESSPLKFKVPNDKSIST 540

Query: 541  GDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL 600
            G+GVGSSVP K TVSGSG QVS+VGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADIS+
Sbjct: 541  GNGVGSSVP-KETVSGSGQQVSFVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISI 600

Query: 601  ERREKADSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPI 660
            ER+EK +SLVAVSKPNNTEA+TVDKPQASIEAKPP  SAMNK+NDQGKSDVPVTTEKSPI
Sbjct: 601  ERQEKVNSLVAVSKPNNTEAITVDKPQASIEAKPPTVSAMNKINDQGKSDVPVTTEKSPI 660

Query: 661  FSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPTF 720
            FSFPT S PSITANVIGPES +RPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVS APTF
Sbjct: 661  FSFPTTSSPSITANVIGPESNMRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSFAPTF 720

Query: 721  AFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNA 780
            AF NK+TTS NEQNAIPVVTSEGNV+PT+QASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN 
Sbjct: 721  AFVNKITTSTNEQNAIPVVTSEGNVQPTQQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNE 780

Query: 781  GSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSSS----SILSFGVPKESMSEKSGDKSSDA 840
            GS   FASPLVNEKEGAK GGSASVFKAESSSS    SI SFGVPKESMSEK+GDKSS A
Sbjct: 781  GSPL-FASPLVNEKEGAKEGGSASVFKAESSSSSFNCSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSA 840

Query: 841  GLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSN 900
            G AVGTSG+L  SSVSTS STPT  LFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPS FPTPATTFSN
Sbjct: 841  GFAVGTSGSLFSSSVSTSISTPTSGLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPS-FPTPATTFSN 900

Query: 901  NITNQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSA 960
            NITNQNSSIKPSFNAA SNSEPVTTTSLP SS MPSFSAAPI KFGSSSVPSTSAPALSA
Sbjct: 901  NITNQNSSIKPSFNAAASNSEPVTTTSLPTSSLMPSFSAAPISKFGSSSVPSTSAPALSA 960

Query: 961  PSGVGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENST 1020
            PSGVGSIE+K+KQETTFGNLSGIPPSD SAVKVSSTGSSVFQFGAAST SDSNKRP NST
Sbjct: 961  PSGVGSIESKTKQETTFGNLSGIPPSDLSAVKVSSTGSSVFQFGAASTPSDSNKRPANST 1020

Query: 1021 FPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPA 1080
            F PSNVP FGA  SP SSGLASSTQSTPVLQF+SSSTSFGLTGNTGLASG SLFGSSAPA
Sbjct: 1021 FTPSNVPTFGASFSPVSSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPA 1080

Query: 1081 SNLFTTGTTFGLASSSSSANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGL 1140
            SNLF +G TFGLASSSSS NNS+SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPT GFSFGL
Sbjct: 1081 SNLFASGPTFGLASSSSSVNNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFSFGL 1140

Query: 1141 SSSSAASNSAPMLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPANND 1200
            SSSSAASNSAP+LFGSSSTG+ TPSMFSFTSAATATT QPAFGNSNHGFTFGSTPPANND
Sbjct: 1141 SSSSAASNSAPVLFGSSSTGSLTPSMFSFTSAATATTSQPAFGNSNHGFTFGSTPPANND 1200

Query: 1201 QASMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV 1260
            QA+MEDSMAEDTVQTV SPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP PLGA+PFQFGGSQQNV
Sbjct: 1201 QANMEDSMAEDTVQTVTSPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP-PLGASPFQFGGSQQNV 1260

Query: 1261 PTPQ-NPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1306
            PTPQ NPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 PTPQNNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1300

BLAST of Lsi08G006290 vs. NCBI nr
Match: XP_008456625.1 (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo] >XP_008456626.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo] >KAA0031726.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK11787.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 2011.9 bits (5211), Expect = 0.0e+00
Identity = 1123/1307 (85.92%), Postives = 1188/1307 (90.90%), Query Frame = 0

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATEREEV+YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVAADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFS+VFRKRLPPPPPS  LSREAN+E+E+RNQEEVAADP GTQEGTNV FVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQ 180
            +NT G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQ PSTPV S+G Q
Sbjct: 121  SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180

Query: 181  DGSPKFPAQSQDGVSPHMVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHS 240
            +GSPKFP QSQDGVSPHM PTHV +ANVLDEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSMA   
Sbjct: 181  EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA--- 240

Query: 241  QKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
                     GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
Sbjct: 241  ---------GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300

Query: 301  PSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQ 360
            PSIKNS+ATTDAYRATTSSSSQSAW QG LLGS QGALKRR+SVLDD+MGSVGPIRR RQ
Sbjct: 301  PSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQ 360

Query: 361  KSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKM 420
            KSNHLF  GLSLPSSSTSIP SGI  E+A+HLQSTKVHPFSS GGK LYSSE +RN SK 
Sbjct: 361  KSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKT 420

Query: 421  SSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSP 480
            S+ES+NAMTPSSSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSP KLSP
Sbjct: 421  SAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSP 480

Query: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSIST 540
            SMLHGPALRSLE+VDSAKYLENVEGI+SNDA D TSQK DKFEESS  K  VPNDKSIST
Sbjct: 481  SMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSIST 540

Query: 541  GDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL 600
             DGVGSSVPTK+  SGSG+QVS+VGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG+SNGPVAD S 
Sbjct: 541  SDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF 600

Query: 601  ERREKA-DSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSP 660
            E REK  DSLV+VSKP NTEA+TV K + SIEAKP   S MNK+NDQGKSDVP TTEKSP
Sbjct: 601  EMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSP 660

Query: 661  IFSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPT 720
            IFSFPT S PS TANV GPES+LRPEK+AS E+PKAAT PIFGFGEK PSQKE +S  PT
Sbjct: 661  IFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKETLSQPPT 720

Query: 721  FAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN 780
            FAFG+K TT+ NEQNAIPVVTSE N EPT+ AS PTTFKFGDKA+F IPANAATENGNK+
Sbjct: 721  FAFGSKATTT-NEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKS 780

Query: 781  AGSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSSSSILSFGVPKESMSEKSGDKSSDAGLA 840
            AGSLFKF SPLVNEKEGA VGGSASVFKAE+SSSSI SFGVPKESMSEK+GDKSS  GL 
Sbjct: 781  AGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLI 840

Query: 841  VGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNIT 900
             GTSGNL  SS STSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVS TPST PTPATTFSNN+T
Sbjct: 841  FGTSGNLFSSSDSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVT 900

Query: 901  NQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSG 960
            +QNSSIKPS  AATSNSEPVT+TS PMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSA ALSAPSG
Sbjct: 901  SQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSG 960

Query: 961  VGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFPP 1020
            VGS+E K+K ETTFGNLSG+PPSDT+AVKV+STGSSVFQFGAASTTSD+NK P NSTF  
Sbjct: 961  VGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQ 1020

Query: 1021 SNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNL 1080
            +N+PAFGAPVS +SSGLASSTQSTP LQF SSSTSFGLTGNTGLASG SLFGSSAPASN 
Sbjct: 1021 NNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNP 1080

Query: 1081 FTTGTTFGLASSSSSANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSS 1140
            FT+G TFGLASSSSSANNS+SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+ GFSFGLSSS
Sbjct: 1081 FTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSS 1140

Query: 1141 SAASNSAPMLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPA-NNDQA 1200
            S+ASNSAPM+FGSSSTGAS  SMFSFTSAA+ATT QPAFGNSN+ FTFGSTPPA NN+QA
Sbjct: 1141 SSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQA 1200

Query: 1201 SMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPT 1260
            SMEDSMAEDTVQT ASPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV  
Sbjct: 1201 SMEDSMAEDTVQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV-- 1260

Query: 1261 PQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1306
            PQNPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1290

BLAST of Lsi08G006290 vs. NCBI nr
Match: XP_011656578.1 (nuclear pore complex protein NUP1 [Cucumis sativus] >XP_031742754.1 nuclear pore complex protein NUP1 [Cucumis sativus] >KGN46058.1 hypothetical protein Csa_005234 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 1999.2 bits (5178), Expect = 0.0e+00
Identity = 1110/1307 (84.93%), Postives = 1184/1307 (90.59%), Query Frame = 0

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATERE+V+YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLS LVDPA KLI S
Sbjct: 1    MATEREDVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSNLVDPAHKLINS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVAADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            +AH LFS+VFRKRLPPPPPS PLSREANDE+E+RNQEEVAADP GTQEGTN+ FVPSINS
Sbjct: 61   TAHWLFSTVFRKRLPPPPPSFPLSREANDEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNIGFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPSTPVISYGKQ 180
            NNT G+SDLEKIL EKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVP GVESRKFEQ PSTPV S+G Q
Sbjct: 121  NNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPRGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQ 180

Query: 181  DGSPKFPAQSQDGVSPHMVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHS 240
            +GSPK P QSQDGVSPHM  THV +ANVLDEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSMA   
Sbjct: 181  EGSPKLPTQSQDGVSPHMATTHVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA--- 240

Query: 241  QKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
                     GNP KSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT
Sbjct: 241  ---------GNPLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300

Query: 301  PSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQ 360
            PSIKNS+AT DAYR+TT SSSQSAW QGRLLGS QGALKRR+SVLDD+MGSVGPIRR RQ
Sbjct: 301  PSIKNSIATADAYRSTTPSSSQSAWEQGRLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQ 360

Query: 361  KSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKM 420
            KSNHLF   L LPSSSTSI  SGIG E+A+HLQSTKVHPFSS GGK LYS+EI+RN SKM
Sbjct: 361  KSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNEIQRNFSKM 420

Query: 421  SSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSP 480
            ++ES+NAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSP KLSP
Sbjct: 421  TAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSP 480

Query: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPNDKSIST 540
            SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDA DLTSQK DKFEESS  KF VPNDKSIST
Sbjct: 481  SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSIST 540

Query: 541  GDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISL 600
            GDGVGSSV TK+  SGSG+QVS+VGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG+SNGPVAD S 
Sbjct: 541  GDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF 600

Query: 601  ERREKA-DSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSP 660
            E + K  DSLV+VSKP NTE +TVDK +ASIEAKP   S MNK+NDQGKSDVP TTEKSP
Sbjct: 601  EMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSP 660

Query: 661  IFSFPTASPPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPT 720
            IFSFPTAS PSITANV G ES+LRPEK+AS E+PKAAT PIFGFGEK PSQKEA S  PT
Sbjct: 661  IFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKEAGSHPPT 720

Query: 721  FAFGNKVTTSANEQNAIPVVTSEGNVEPTEQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN 780
            FAFG+K TT+ NEQN I VVTSE NVEPT+QAS PTTFKFGDKA+FPIPANAATENGNK+
Sbjct: 721  FAFGSKATTT-NEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGNKS 780

Query: 781  AGSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSSSSILSFGVPKESMSEKSGDKSSDAGLA 840
            AGSLFKFASPLVNEKEGA VGGSASVFKAE+SSSSI SFGVPKES+SEK+GDKSS  GL 
Sbjct: 781  AGSLFKFASPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLI 840

Query: 841  VGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNIT 900
             GTSGN   SSVSTSTSTPTPSLFSFS+PSTNSNLNNGSLVSTTPST PTPATTFSNN+T
Sbjct: 841  FGTSGNFFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVT 900

Query: 901  NQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSG 960
            +QNSS+KPSF+AATSNSEPV++TS P SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPS 
Sbjct: 901  SQNSSVKPSFSAATSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSV 960

Query: 961  VGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFPP 1020
            VGS+ETK+K ETTFGNLSG P SDTSAVKV+STG+SVFQFGAASTTSD+NK P NSTF  
Sbjct: 961  VGSVETKTKPETTFGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQ 1020

Query: 1021 SNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNL 1080
            +N+PAFGAPVS +SSGLA STQSTP LQFSSSSTSFGLT NTGLASG SLFGSSAPASN 
Sbjct: 1021 NNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNP 1080

Query: 1081 FTTGTTFGLASSSSSANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSS 1140
            FT+G TFGLASSSSSA+NS+SSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+ GFSFGLSSS
Sbjct: 1081 FTSGATFGLASSSSSASNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSS 1140

Query: 1141 SAASNSAPMLFGSSSTGASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPA-NNDQA 1200
            S+ASNSAPM+FGSSSTGA + SMFSFTSAA+ATT QPAFGNSN+ FTFGSTPPA NN+QA
Sbjct: 1141 SSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQA 1200

Query: 1201 SMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPT 1260
            SMEDSMAEDT+QT ASPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQF GSQQN+  
Sbjct: 1201 SMEDSMAEDTIQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGSQQNL-- 1260

Query: 1261 PQNPSLFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1306
            PQNPS FQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1291

BLAST of Lsi08G006290 vs. TAIR 10
Match: AT3G10650.1 (BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.1); Has 61042 Blast hits to 31782 proteins in 2093 species: Archae - 202; Bacteria - 16480; Metazoa - 16017; Fungi - 12552; Plants - 1653; Viruses - 629; Other Eukaryotes - 13509 (source: NCBI BLink). )

HSP 1 Score: 412.1 bits (1058), Expect = 1.6e-114
Identity = 494/1428 (34.59%), Postives = 683/1428 (47.83%), Query Frame = 0

Query: 13   GRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRL 72
            G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+        G GWLSKLVDPAQ+LIT SA RL
Sbjct: 18   GTGGKFRKPTARRSQKTPYDRPTTSVRNAGLGGGDVRGGGWLSKLVDPAQRLITYSAQRL 77

Query: 73   FSSVFRKRL---------PPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVA----ADPPGTQEGTNV 132
            F S+ RKRL         P     LP  R  N E +  ++E+V+     +     E TN 
Sbjct: 78   FGSLSRKRLGSGETPLQSPEQQKQLP-ERGVNQETKVGHKEDVSNLSMKNGLIRMEDTNA 137

Query: 133  DFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQFPST 192
               P        G +DLEKIL+ KTFTR E+DRLT LL+S+ AD  +  E ++ E     
Sbjct: 138  SVDPP-----KDGFTDLEKILQGKTFTRSEVDRLTTLLRSKAADSSTMNEEQRNE----- 197

Query: 193  PVISYGKQDGSPKFPAQSQDGVSPH------MVPTHVASANVLDEDVASPAEIAKAFMGS 252
                 G     P  P+  +D   P       +V T   S   LDE +ASPA++AKA+MGS
Sbjct: 198  ----VGMVVRHP--PSHERDRTHPDNGSMNTLVSTPPGSLRTLDECIASPAQLAKAYMGS 257

Query: 253  RPPKATPLSMASHSQKFGDSFASGN----PSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRG 312
            RP + TP  +    Q   +     N    P KS T+SLV + P     +ENGFVTPRSRG
Sbjct: 258  RPSEVTPSMLGLRGQAGREDSVFLNRTPFPQKSPTMSLVTK-PSGQRPLENGFVTPRSRG 317

Query: 313  RSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSDQG---ALK 372
            RSA+YSMAR PYSR +++  I            +   +S S W +    GS QG    LK
Sbjct: 318  RSAVYSMARTPYSRPQSSVKI-----------GSLFQASPSKWEESLPSGSRQGFQSGLK 377

Query: 373  RRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQHLQSTKVHP 432
            RRSSVLD+++GSVGP+RRIRQKSN L  + L+LP S + + V   G E   H        
Sbjct: 378  RRSSVLDNDIGSVGPVRRIRQKSN-LSSRSLALPVSESPLSVRANGGEKTTH-------- 437

Query: 433  FSSTGGKALYSSEIKRNLSKMSSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPK 492
                              SK S+E      P SSF  +P +SSEMASKIL+QLD      
Sbjct: 438  -----------------TSKDSAED----IPGSSFNLVPTKSSEMASKILQQLD------ 497

Query: 493  EKSSELKLLSVRNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDAHDLTSQKK 552
                  KL+S R  SP+KLSPSML GPAL+SL++V++ K+L N+   ++N + D + QK+
Sbjct: 498  ------KLVSTREKSPSKLSPSMLRGPALKSLQNVEAPKFLGNLPEKKAN-SPDSSYQKQ 557

Query: 553  DKFEESSSLKFKVPNDKSISTGDGVGSSVPTKN-TVSGSGLQVSYVGPSLQ----TKCAF 612
            +   ES S +    ++K+    DG   +  +K+  + G G+ +     SL+     K +F
Sbjct: 558  EISRESVSREVLAQSEKTGDAVDGTSKTGSSKDQDMRGKGVYMPLTN-SLEEHPPKKRSF 617

Query: 613  QMSAHEDFVDMDEE-GYSNGPVADISLERREKADSLVAVSKPNNTEALTVDKPQASIEAK 672
            +MSAHEDF+++D++ G ++ P      E  EK ++   V K + +  +  +KP    EA 
Sbjct: 618  RMSAHEDFLELDDDLGAASTP-----CEVAEKQNAF-EVEKSHISMPIG-EKPLTPSEAM 677

Query: 673  PPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPTAS-------------------------- 732
            P  +   N    QG S+  + TE++   +FP  +                          
Sbjct: 678  PSTSYISNGDASQGTSNGSLETERNKFVAFPIEAVQQSNMASEPTSKFIQGTEKSSISSG 737

Query: 733  ----------------PPSITANV-IGPEST--LRPEKIASSEVP-KAATTPIFGFGEKF 792
                            P ++  N+   P +T  L     AS+++  +  ++  FG  E +
Sbjct: 738  KPTSEEKRIPLEEPKKPAAVFPNISFSPPATGLLNQNSGASADIKLEKTSSTAFGVSEAW 797

Query: 793  PSQKEAVSSAPTFAFGNKVTTSANE----------QNAIPVVTSEGNVE-----PTEQAS 852
                E+  +    A G + +TSA             NA+    S G++      P   ++
Sbjct: 798  AKPTESKKTFSNSASGAESSTSAAPTLNGSIFSAGANAVTPPPSNGSLTSSPSFPPSISN 857

Query: 853  APTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNAGSLFKFASPLVNEKEGAKVGGSASVFKAESSS 912
             P+    GD  +  + + AAT N +   G L     P  N+        S S   +  SS
Sbjct: 858  IPSDNSVGDMPS-TVQSFAATHNSSSIFGKL-----PTSND------SNSQSTSASPLSS 917

Query: 913  SSILSFGVP-----KESMSEKSGDKSSDAGLAVGTSGNLLLSSVSTSTSTPTPSLFSFSS 972
            +S   FG P       ++SE SG  S +  +   T GN         TST     F F  
Sbjct: 918  TSPFKFGQPAAPFSAPAVSESSGQISKETEVKNATFGN---------TST-----FKFGG 977

Query: 973  PSTNSNLNNGSLVSTTPSTFPTPATTFSNNITNQNSSIKPSFNAATSNSEPVTTTSLPMS 1032
             ++          + +      P   F ++     S++ PS  AA++             
Sbjct: 978  MASADQSTGIVFGAKSAENKSRPGFVFGSSSVVGGSTLNPSTAAASA------------- 1037

Query: 1033 SPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIETKSKQETTFGNLSGIPPSDTSAV 1092
               P  S + IF   SSS P T    +SA S        +   + FG  S    S  S++
Sbjct: 1038 ---PESSGSLIFGVTSSSTPGTETSKISASSA-----ATNTGNSVFGTSSFAFTSSGSSM 1097

Query: 1093 ---KVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASSGLASSTQSTP 1152
                 +STGSSVF F A S+ S ++ + + S        A  A      SG  +STQS P
Sbjct: 1098 VGGVSASTGSSVFGFNAVSSASATSSQSQASNL----FGAGNAQTGNTGSGTTTSTQSIP 1157

Query: 1153 VLQFSS--SSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSSSANNSISSS 1212
              QF S  S+ SFGL+GN+ LAS  S FG S     +FT+ +T  L+S++SSA++S + S
Sbjct: 1158 -FQFGSSPSAPSFGLSGNSSLASNSSPFGFSKSEPAVFTSVSTPQLSSTNSSASSSSTMS 1217

Query: 1213 A---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAPMLFGSSSTGA 1272
            +   GTS    N  P+S P FS+ F  SSTPT  FSFG SS++  S++   +FG+S+   
Sbjct: 1218 SPLFGTSWQAPNSSPNSGPVFSSSFTTSSTPTT-FSFGGSSAATVSSTTTPIFGASTNNT 1277

Query: 1273 STPS-MFSFTSAATATTPQPA-----------FGNSNHGFTFGSTPPA----NNDQASME 1306
             +PS +F F S    T  QP            FGNS  GF FG+        NN Q SME
Sbjct: 1278 PSPSPIFGFGSTPPTTPQQPVFGNSGTPSQSLFGNSTPGFAFGAPNNGNGINNNQQVSME 1309

BLAST of Lsi08G006290 vs. TAIR 10
Match: AT5G20200.1 (nucleoporin-related )

HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 1.6e-16
Identity = 193/791 (24.40%), Postives = 318/791 (40.20%), Query Frame = 0

Query: 12  GGRGGKFQKRPVRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFR 71
           GG GGK +++  RR   TPY RP         + W+S++VDPA ++I+  A R+    F 
Sbjct: 22  GGVGGKLKRQSARRHAATPYSRP--TQNQVQRRPWISRIVDPAYRIISGGATRILPYFFS 81

Query: 72  KRLPPPPPSLPL--SREANDEVENRNQEE----------------VAADPPGTQEGTNVD 131
                P  + P     +   E++N  Q+                     P GT      +
Sbjct: 82  NAASAPALAAPPEDQNQHQGELQNNPQDNDPSVTPISNKPEPASIEVGGPSGTANVNEGN 141

Query: 132 FVPSINS------NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE 191
           F  S         N+   +S+LE++++ KTF++ EIDRL E++ SR  D+P   + ++ E
Sbjct: 142 FSISAQRRGKAALNDDVAISELERLMEGKTFSQAEIDRLIEMISSRAIDLP---DVKRDE 201

Query: 192 QFPSTPVISYGKQDGS----PKFPAQSQDGVSP-HMVPTHVASANVLDEDV------ASP 251
           +    P+    K++ S     K P   +D  S     PT +A + +LD D        SP
Sbjct: 202 RNLEIPLREGAKKNMSLFDKAKEPIGGKDANSEIWATPTPLAKSIILDGDKIRDEVGLSP 261

Query: 252 AEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHSQK--FGDSFASGNPSKSSTLSLVPRS-PGNFDVVEN 311
           AE+AKA+MG +   ++     + ++K     S   G  S +S  S      PG     ++
Sbjct: 262 AELAKAYMGGQTSSSSSQGFVARNEKDCLDRSMLVGKSSLASPSSKPSACWPGIKSSEQS 321

Query: 312 GFVTPRSRGRS-ALYSMARVPYSRVRATPSIKNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLG 371
           GF TP+SR  S  L +  R PYSR      + NS +     +  +S    +       L 
Sbjct: 322 GFATPQSRRESYGLQNFPRTPYSRT----ILSNSKSKLMQLQNDSSKHLSN-------LQ 381

Query: 372 SDQGALKRRSSVLDD--EMGSVGPIRRIRQKSNHLFHKGLSLPSSSTSIPVSGIGFESAQ 431
           S   +++RR   L    + G  GP RR RQ +        S PS   S       FE++ 
Sbjct: 382 SPSQSVERRYGQLSKGRDGGLFGPSRRTRQSATPSMVSPYSRPSRGAS------RFENSA 441

Query: 432 HLQSTKVHPFSSTGGKALYSSEIKRNLSKMSSESENAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILE 491
            ++       SS  G++ Y S  +        E+E           +P  SS++A  IL+
Sbjct: 442 IMK-------SSEAGESSYLSRSQITTYGKHKEAEVGTL------TVPTHSSQIARTILD 501

Query: 492 QLDKL---TPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIR 551
            L++    + PK K++ELKL +   +  +  +            +D  SAK  E+++ I 
Sbjct: 502 HLERTQSQSTPKNKTAELKLATSWRHPQSSKTVEKSSSDVTNVKKD-GSAKLHEDIQNIF 561

Query: 552 SNDAHDLTSQKKDKFEESSSLKFKVPN--DKSISTGDGVGSSVPTKNTVSGSGLQVSYVG 611
           S       +Q     +  ++    + N  +K+ S  +G+       ++  G+ LQ  +  
Sbjct: 562 SQ------NQPSSVLKPPATTTGDIQNGMNKTASATNGIFRGTQAASS-GGNALQYEFGK 621

Query: 612 PSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG-----YS-NGPVADI------SLERREKADSLVAVS 671
           P    K +   S H++     ++      YS  G  A++      SL   +     ++V+
Sbjct: 622 P----KGSLSRSMHDELGTSSQDAAKAVPYSFGGETANLPKPPSHSLGNNKPVLPSISVA 681

Query: 672 KPNNTEALTVDKPQASIEAKPPAASAMNKVNDQGKSDVPVTTEKSPIFSFP-TASPPSIT 731
           KP    A+             P+ S          SD   ++E +     P T SPP   
Sbjct: 682 KPFQKWAV-------------PSGSNAGFTFPVSSSDGTTSSEPTTPSIMPFTTSPP--V 741

Query: 732 ANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEK------FPS-QKEAVSSAPTFAFGNK 737
           A+  G   T   E     E+P+ +       G+K      FPS  +E VS      FG K
Sbjct: 742 ASGGGVAITNHHEARKDYEIPQFSFDGSNRRGDKSPLVFSFPSVSEEVVSEDDDARFGIK 750

BLAST of Lsi08G006290 vs. TAIR 10
Match: AT2G45000.1 (structural constituent of nuclear pore )

HSP 1 Score: 45.4 bits (106), Expect = 4.0e-04
Identity = 104/323 (32.20%), Postives = 156/323 (48.30%), Query Frame = 0

Query: 976  LSGIPPSDTSAVKVSSTGSSVFQFGAASTTSDSNKRPENSTFPPSNVPAFGAPVSPASS- 1035
            +SG P   +++V         F FG++S T+ S+    +ST  P +  +F    +P+S+ 
Sbjct: 1    MSGFPFGQSNSV-------GGFSFGSSSATNSSS---ASSTTSPLSF-SFNQSSNPSSTG 60

Query: 1036 -GLASSTQSTPVLQFSSSSTSFGLTGNTGLASGGSLFGSSAPASNLFTTGTTFGLASSSS 1095
             G  SS  STP    SS++ SFG   ++  + G   FGSSA +S   T    FG ++S +
Sbjct: 61   FGFGSSVSSTPA---SSTTPSFGFGASSTPSFG---FGSSASSS---TPSFGFGSSASVT 120

Query: 1096 SANNSISSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTAGFSFGLSSSSAASNSAP--MLFG 1155
             A+ + S   GT++S     PS   S +T  SS       FG  +SSA+S + P   LFG
Sbjct: 121  PASTTPSFGFGTAASSSAPAPSLFGSSTTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFG 180

Query: 1156 SSSTGASTPSMFSFTSAATATTPQPAFGNSNHGFTFGSTPPANNDQA-SMEDSMAEDTVQ 1215
            + ++ A+TPS   F  AA A+   P FG+S   F+  S+  A+N        S A  T  
Sbjct: 181  APASSAATPSSSPF-GAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASNSSLFGASSSAATSTSP 240

Query: 1216 TVASPMPSFGQQP-----LTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSLF 1275
               +P  + G  P      + P SS  +FG+T  SP  +      GS        +PS+F
Sbjct: 241  LFGAPSSATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASSASGS--------SPSIF 294

Query: 1276 QASGSLDF---NASAGGSFSLGA 1286
             A+GS  F   ++SAG + SL A
Sbjct: 301  GATGSSPFFGSSSSAGSTPSLFA 294

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Q9CAF42.3e-11334.59Nuclear pore complex protein NUP1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP1 PE=1 S... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A1S3C4Z30.0e+0085.92nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496528 P... [more]
A0A5A7SNY90.0e+0085.92Nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN... [more]
A0A0A0K9E40.0e+0084.93Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G046360 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1FKS90.0e+0085.28nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 ... [more]
A0A6J1FF520.0e+0085.02nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 ... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_038884354.10.0e+0091.73nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 [Benincasa hispida][more]
XP_038884353.10.0e+0091.45nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 [Benincasa hispida][more]
XP_038884355.10.0e+0091.22nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X3 [Benincasa hispida][more]
XP_008456625.10.0e+0085.92PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo] >XP_008456626.1... [more]
XP_011656578.10.0e+0084.93nuclear pore complex protein NUP1 [Cucumis sativus] >XP_031742754.1 nuclear pore... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT3G10650.11.6e-11434.59BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.... [more]
AT5G20200.11.6e-1624.40nucleoporin-related [more]
AT2G45000.14.0e-0432.20structural constituent of nuclear pore [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..41
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 68..124
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1236..1277
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 110..124
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 817..837
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 642..665
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1002..1038
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1002..1021
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 533..553
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 857..925
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NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 634..665
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1236..1305
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 455..484
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33416:SF20NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP1coord: 1..1303
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33416FAMILY NOT NAMEDcoord: 1..1303

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi08G006290.1Lsi08G006290.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0071763 nuclear membrane organization
biological_process GO:0016973 poly(A)+ mRNA export from nucleus
cellular_component GO:0005635 nuclear envelope