Lsi04G005940 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi04G005940
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr04: 5457079 .. 5462397 (-)
RNA-Seq ExpressionLsi04G005940
SyntenyLsi04G005940
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGAAAGTTAGTGTACCATAAATAATAGTTAAATATGGATAATGGAGCAACATATATATAGTGAGCTACAAATTATAATGGTTAAAGAGCCTAACATACCTACGTTAATAGATGATTGAGCATGTCATGATGTTGTTAAGATTTCATATATCCTTTATGACACTGGAATGTAAATGACTATCATGCCATTTTTTTGACAAAGCATAGAGTGTTATGGTTTCATCAACTAATGAGGCACTCAATATCTATTATCCTACCACTTCACATTACAAAATGTCTCTTGAAAGGTCAACAAAGAGTTCCTCCTATATATCAACTACAAGCCCTCTCATTTTCTCTCTCAAAATTATTGAAATTTTCATTTCATTTTCTGTTATGAGTATTTTTTTTTAATTTCATTAACTATGTATTATAAAAAGTGTTACGAAATTGACAAATAAAATATACAGAAAAAGAATGTAAAATAGAGGAGAATCAACATGGATTTACGTGGTTCACTAACAGTCCACAGGGCAGAACAATTTTATTAGAATGAATGTCACAAATTACAGAATCAATCAGCACTTCTAGGGTTAGGGAGTTTATATAGTGTACTTCTCTAAACTCTAGGGTCATAATCGTAAATAACCATAAATAATTAAATCGACGCCTCTAATTAAGGTTAGAGAGTTCATATAGTGAGATTTTCGTACTTGGTTGTTCGAAGCACCAGATAACAGATTAAAGGCATTCCAACAAAAAATATATTTGAAATGAAGTATTCTTTATTAAATTAAAGATTATTTTTAATTATTTTTTTATGAAAATATTGTTGAAAATCTTATATTGAAAAATTAAGGGACCTCACACTCATTATAAGATAGATGAGCTTTCGTTGTCCATTGATTTTGAGATGAAATTCCATGTTATCTAATATGGTATGAGAGCCCATAAAGCCCAAATAGGTATTTGGTCCAATAAAAAGAAACTAACAAAAATATTTCTTAGCCCTTATAGGGCCAGCAGAAATCATGTTTAATTTCTTCGGAAGAAATTCATCACTGAGCGATAGAAGTCTATTACAGTCTATCGCCTAGTGATAGAAATCTATCGCGGTCTAACATTGATAAACAATGAAATTCTTTTATATTTATTAAATATTTTAGCTTATTTTTCTATATTTGAAAACAACAAAAAAATGTTTATAATTATTGTAAATTTGAAACAAGCTGAAACAAAAATTACATTTTGTTGATACTAATTTTGGGTCGAGTAATTTGTACCGACCCTGGGGTGGAATCAATGGTAAATGTGTATTTTGGAGGAAGCGTCAACCTGCAAATTAAAAAACAAAATTGCACACCGGTGTGGTGTAGGCCACACACACTCCGATGCCTAAGTTAGAGGGAGGTTCAAAGCTGATTCAATACTTAGTTGGAAGTTTTTACTTATCTCGTTTGTTCTCTCCCTCCTCTTATTTATAAGGCTCGGGCCTTCTCCGCTCTGTTCTCGAATTTCCTTATCAGGGTTTCTTTCTCCACCTCTAAGTTCAGTCGCTATGGGCTTGATCTTGCTTGAGGTCGAGGCTTAGTTGGGCTAATTGGTTTTAGGCTCAATTGGAAAAGTCAACTGGGCTCAAGCGTACCTTGATTGACCTTGGACACCTGGCTTGAGTGGTTTGGCCTCATGGCCGAGGTCGACCAGACCGATAGGCCTGATTTTGCCTGAGGCTGACGCTCAACTGAGCTGCTTGGTTTTGGGCTCAGTTGGAAAAGACACCCAAGTCCAAGTGTACCTCGATTGACCCTGGACACCTGGCCTTAGTGGTTCGGCCTCATGCTCGAGGCCGACTAGACTGATGTTGTCTCGGGCTACTTCCTTATTCCTTCCGCCTTATGTTGTTCTGTCGCTTTTGTCCTTGATTCAAGATTACCCCTAACACATTTCCCAATTAAAAGCTAAGATTATTGAGTTGACTGAAAAACCAACCTAATTGATTAATCACGTTTGTGGCAGACCTGGAAAACATTGTAATTCGAGGGGAAGCAACCAATACGAATCTGTTTTGCTTATTGAAGGCTATGTTGGGCCACTGAGAAGCCCATATTAAAAATGAATGGGCTGTTTGGTTTGAATAGAGGGAAAGAGAGGCCTATGGAGGGCTGTTTAGTCATTTTGTTAATTGTATATAAGGGCAGCCCTATTAAGCGTTTAATTGATGTTTAGTTGCTTTCCCGCGCGAGACCCTTGGTTCATTCGCTTGGGCATTTCGATCTTTCTCTGTCCTCGCGGAAAAGTTGATTTCTCTTCGGCTATTTGACAGGTATTTCAGATTGTTGTTGCGATACTTTGTTTTCTCTTGCTGATTTCTCTCGCTTTATGAATTGTGTATGTATGTGAGTTTTTACAGCCGATTGTTGATTGGATTAGTAATTTTCGGGATTTGATACTCGTAGTGGTTTGATTTTGCATTTTGTACTGAAGATTGATGTTTTTGTAAGTTTGAGAGTTTACTCGAAAGCAAGGAATTGCACGATCTTGTATAATTTTTCGCTATATGAATGATTTTGATCTTTCTTGCATTTGTGTGATCGAGCAATTACTGCGATTTTGCTATGAGTTTTGGCGTTTGCAATTTCTTGTTTCCTTCACCGATCATAGTTTTCAATTGTTGACAATCTGTTCCAATCTATGATTTGCTTTGTGATTTTAGCTTCGGCTTGAATTTTGATTTGTGATTTGCAAGAAATTTCAGGTTGCACGATTTTGATCTCTGCGGCATTTTTGTGATTGAGACACATTTCTTGTGGTTTTGCTTCGAGGTTGCCATCTTCAGTTTATATTTTGCTTTACTGAGAATTAGCTTGCAATTGGTCATGGTGACAATCTTTTGTCACTTGACATTTGCTATGAGATTTGAGCATTTGCAGCATTTTGATTTTTTATTTTCAAGAAATTTTAGTTCTGCTTGATTTTGATATTGGTTGCCTTAATGTGATTGAGCAGTTCTTTCGGTTTTGCTATATGGTTTCCTGTCCACCGAGCATTGGCTTGCAGTTTGTGACATGACAATCTGTGACTACTTGTGAGCTTCGGCATGCATTTTGATTTTTGATTTGCAAGAAATTTGTATTTGCATGATTTTCATCTCCATTCCATTAATGTAATTAAGCAATTGCTTTGTTTTTACTCTGAGGTTTTCCATCTACAATTTTTAATTTCTTTCACCGAGCGTTGGCTTGCAAGTGTCATCTGTGGCGACTTGATTTTCTCCGAGAACTTTTGGCTTACTACTTCTTTAGATTTGGTTTGAAACTTTGTACAAAATTGCAAGTTCTTTCCATCTCTTGCGTTGATGAAAATGTTTTTGGTGAGTTGTCTGATCTTGAGATTCCTGTGGCATCCTCTCATGTGGCAGGCGATTATCTACTAGCTACTTTTAATAGTTATCTTGATTCCTTAGTTTATTGAGTCGTATATTCGAGAGATACAACTCATATAAGTAGGTTTCACGCTCCATTTTTTCTCTACGATCTGGTCTCTACAACTTTTAATTCTCAAACTTTTCTATATTCTGTTTTGCAATTGAATAAACCCTAACCCTACCTTTCTGTAAGTTTCATACAAAGGGATATATCATATGTCAATATTTTTATTTGATCGAACCATATAATCAACTGTTAAATTAATCGTATCATTTTTGTCATTAATTTGTATTTAGTTTTTATTTAAGAACAAAAATGGATGGATTACAATATTTTTTATTTATAGTTTTTCAAGGATGAAAAGCTAGAATTACAAGTTCCGAAATCATATTTTAATCTATCGTTTATTGTCCCTGTCCGTCCGTGCGCAGATCCTCTCCTATCTCGAGAGGTTATTCCTTGCCGGTGGAAGGCTTAGATTCTGCTCACGGAGGGTAGAGGTACGTTGGGTTAATACTATAGTTTACTTTCAATTAACTTCTGCTTACAGAAAACATAAATTATGTTTTAGAAAGAATTAGAATTTCAAGCACGAAAACCATATTTTAATGTAACGTTTCTTGTCCGTCAGAGCACTCACAAGAGAAAATTTCCTCTCATCTCTATGGCTGGGATCCTACACTCTCTTGGGACAAAGGTACGTAGGCTTAAATAGGACGACTTTGAAACTTCACAAGAATTTTATTTTAACTAATTTATTATTATTTCTTAAGAATCACAGACAACAAATCGTTTAGTCTCTTTAACAGTAGAGTTTACTTTCTGTTTTCATCGGTTCTCTTCTCAATCTGTTTTTGTTTTAAAATTAAGCCAGTGGCTTGTTTTGCATAATGTTTCTGAAATAGTTTTTTGTTTGTGATTCCCCTAGGTTATTTTAAAAGCTATAATTCTATAGCTTATTAAAATTAGTTATTGTACGTGTCACAATTTCTATATGCAAATATATTATTTTGATTAAAAGAAGGAAGTTATCCATACTGAAATGTAAGTCCAAAATACAATAAATGAAACAAAAAATGAAAAGTGGATGTTCAGCGCTTTTCTCCTTTTTAATTGAATTTTTGTTTAAAAAGAGTTTTGACGACAATTTCTAAACAAAGTATAAGCTTTCAAAATGCTTGTAATTGAAAAAAATAATAACAATACATAAACAATCTTCACTAGAACAAGTTCACTCTGTAGGAACAAAAACAAAAACGTAATTGTTTTAGTTTAGAAAGTGTACATGAACGTGCTCTTTTTAAACTGTTCTATTTCATTTTTTAACACATTTCTGCGTTGAGTGTATCAATGTATGGTTGATGATTCCAGATTGAGTATTTAGAAATAGAAGCCAAGCTTAAACCATCATGACCTAGGGGTAAAAAAGGAGACAAAGTTTTAAATAGCTAAGAGGTCATGGGTTCAATCCATGGTGACCACCTATGTAGGAATTAATTTCCTACAATGTTGTAGCGTAGGCGGGTTGTCTCGTGAGATTAGTCGAGTTGTACGTAAGTTGACCCGAACATTCACAGATATTAAAAAAAAAAAAAG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mRNA sequence

ATGAAATTTTTCAAGGATGAAAAGCTAGAATTACAAGTTCCGAAATCATATTTTAATCTATCGTTTATTGTCCCTGTCCGTCCGTGCGCAGATCCTCTCCTATCTCGAGAGAAAGAATTAGAATTTCAAGCACGAAAACCATATTTTAATGTAACGTTTCTTGTCCGTCAGAGCACTCACAAGAGAAAATTTCCTCTCATCTCTATGGCTGGGATCCTACACTCTCTTGGGACAAAGAAACCCAGGTTGATGAGAAGCCCATACAATCCTCCACTCACAACTGTTGATACAACCATGGGTCCTTGGAATTTTCGTTTCTTCCTCCTAAATAGTTTGTACAACCCCAGAAGTTACATTAGTCAACATGGAGGATCCCCAAGTAAACCATCCACTCTGATTTTCAGGCATGTTTGCCTCATGCATGGTCTTCTGTTTTTCCGCTACTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAATTTTTCAAGGATGAAAAGCTAGAATTACAAGTTCCGAAATCATATTTTAATCTATCGTTTATTGTCCCTGTCCGTCCGTGCGCAGATCCTCTCCTATCTCGAGAGAAAGAATTAGAATTTCAAGCACGAAAACCATATTTTAATGTAACGTTTCTTGTCCGTCAGAGCACTCACAAGAGAAAATTTCCTCTCATCTCTATGGCTGGGATCCTACACTCTCTTGGGACAAAGAAACCCAGGTTGATGAGAAGCCCATACAATCCTCCACTCACAACTGTTGATACAACCATGGGTCCTTGGAATTTTCGTTTCTTCCTCCTAAATAGTTTGTACAACCCCAGAAGTTACATTAGTCAACATGGAGGATCCCCAAGTAAACCATCCACTCTGATTTTCAGGCATGTTTGCCTCATGCATGGTCTTCTGTTTTTCCGCTACTAA

Protein sequence

MKFFKDEKLELQVPKSYFNLSFIVPVRPCADPLLSREKELEFQARKPYFNVTFLVRQSTHKRKFPLISMAGILHSLGTKKPRLMRSPYNPPLTTVDTTMGPWNFRFFLLNSLYNPRSYISQHGGSPSKPSTLIFRHVCLMHGLLFFRY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi04G005940.1Lsi04G005940.1mRNA