Lsi03G009610 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCGTGCGTCAGTTTGCTCCCGTCGCCGTTCGTGAAGTCGTTGGTCGTGAGTTTGTCAAATCTCGTCACCGTTTGTTAGATCTGCTGTTCGTGAAGTCGTGGGTCTCGTCGTGGGCTTAGATCTGCCATGTGAGCTGCTGTGGGTTTTTTTTCACAAAATTGCAGGGTTGTTATGAAGGCTTATGAGGCATCCATAGGGAACAAGTTTCGGATATCACTGGGTCTTCCAATGGCTGCTACTGTCAACTATGTAGACAACACGGGAGCTAAGAATCTCTACATCATTTCAGTGAAAGGGTTCAAAGGTAGTCTCTTGACGATTTTGTTGTATGTCTCTTGTCCTCTGAATTAATGAAACTATAGATTCATTTGGAAGTTCTACTATTTTTATTAGGTAGTTTCTAATGGTAGGGCTTATTGTGTAGTTTTTATTTATTTATTTTTAATTATCTTTTATCATTATTGGTGGGATGCAATATGCAAGTTTTGATGTAGCACTAACAATAGGTTTTTTTAGTGACAAAAGTACTTAGAATAAAAAAAAATGATGCATATAACTTGGTTTTTATCTTAGATTTAACAATGTTCTTGTGATTACTTGTTATATTAATTTTTGTGTTTGTTGAAAGTTGAGTTGTATATATATAAGCTATTAAGATTTTATTTTGTGCATATATAGGTAAAAGAGAGTATTGAACAATAACTTGAATTGGAAAAGGTTATGGTGGATATCAGTTGGGGTTTTTGCTCTATTTTAGTTTATGTCGTGATGTTGCATTTAGATTGGTTAAACTTCACCTTTTTTTTTTTACTAATATATGTTTTATGTGTTTCTTGTACTGGGCCGCATATTTGAAAAGAGGGACTTTTACATGCTTGTGTATATATTAGATGAATTCATACTTATTGCATTCCGAACTTAAGTCGAACGCTTTTTCTCAATGCAGGAATATGCTTAACTTAGATGAATTCATGATTGCAGTTAAATAGTGTTATGTAGAGAAGCCTCTAATTTAGGTATATATATAACTACACTTATAATGTCTGTATGATTTTTGCAGTGTGTAATCTCTCATTCAGATACAAAGATGTTTGTCAATGGTATTGTTGTTCATTTTGTTTATGTTTGGTATCTAAGCATTGTTTAGAGTTTTGAAAATTTAAGTCATTGATTTCTTTGTTGTTTGTAGGTTTTTGCTTCAAAAATTATATGGTGAAATTGACGATGGGGCTTTACGAAGTATTTAACGCTAAAAAGGAAAATCATTAAGGGTCAACATATAATTTAAGGTTTTAAAATCTTGTATTTAAAGTTTTGTTTATCTCTGTAAATTGAATGTAGTTTGTGGAGAGACAAATAGTCATATTACTTTTGTTGGACTGAATTAGTTAATTGTTGTGTTTGTTGAAAGTTAAGTTATGGTGTATATAAATATCATATTACTTTTATCATATGCATAGAAATATTAATTTTGTTAGTCAGCCATGTATGCAACTAATAATTTTTTTAAAATTTTTTAATAAAGGAACGATTGAGGGATATTGCCTTACACAAAAAATTAATATTTAATGATGGGCAAATTCATTTAATGTCGATCGGGCGACATACATTAAAACATTAGTGTTCAATGTCGGTCATCTTTAATGTCAGTCAAAAACTGACATTAAAGACATCAATAATGTCGGTAAAAAACTGACATTAAAGGCGACCGACATTAAACACCTTTAAGAACACGTTCTTCGATGTCGGTCGCCTGACCAACACCGTACCCCTATAATGTCAATTTTTTACTGACATTATAGCCCATTTTTGTTGTAGTGACATTTTATTTAATTTCATTAACTTTTTTTTTATAAATTGATATGAACCGCCCAATGCATTAAATTATTATTTAATAATTTTGATGTAATTTAATAATTTCCAAAATTATCCTTGTTAATGACATTTTAAGTAGGGTTATTTTAGATATTTTACTATGAATTATGATAAGTTATTAGGGTTTTATTGGGAGGTTATTTAAAGTTTTGCTTTAAGTTGTTGAAAACAGTTTTGGATGTTTTTAGAACTTGTAGGGTTTCTTGAATGAGAATTATCTAGTAGATAACAGAGTTTCATCACCCGCCACTTTGCAATTCTTGAATCAGGATTGCATGCCAACAACATTCAGGTAAGTCTCATCATCTTGCTTGTGGAGTGTTCGAACTTGGAATAAGGAACTAGTTCTCCTTATCTCTTGGTCTTCGATCAAAAGGTAATCCAATTCTAATCTTTCCATCAACATCTCGATATCCTTGAAATAATCGTCCACACTTTTACTTCCTTGGCGTAGAGCTTGAAGTCTTTGTGCACAATCAAGAAAAGTACCAGTAGAATTCCACAAAAATGAAAACTAAAAATCAAGAATCTAATATTCAAGATTCGACAAACTAGACAAGAAAACAAGAAAAACAAGATACTTAGAAACAAAAATTTAAGATTCAAGATTCAAGATTCAAAGAGTTATGTAAGATGAATAAGAAAATGACAAACAACTAGACAAATCAATGATAAAAAGGAAACAAGAATTAAGAATAAAAACTAAAAGCACTAATTTTACTAAAACCCTAATTTAAATTATAAGAAGTTTCAAATTTTGATTTGAATAAGCAATGCACTTTTGAAACAAATAACTTTTTCTTATAAATTTCAGTAGCTTAAAACTCATAAAAATTAAGCTACTTGCTTGGCTTGACGTGCCTGCTTTTTCCTCTTAATTTCGAATCGTAGAACCGAATCCCAATTTTTTTTAAAAACAATTAACGTGCTTGCTTAATTTTTTTTCCACTTCCAAATTGGAGAACCGACTAAAACAAATTGACGTACTTGCTTGACGTGCTTGCTTCCAATTTTTTAATTGACATTCTTGCTTTTAATTTTTTTTCTCCTTCGATTTCATGCTCGACCGCTTGCTTGACGTGCTTGCTTCCAATTTTTTAATTGACATTTTTGCTTCTATTTTTTTTTCTCCTTCGATTTCATGCTCGACCGCTGCATATCACTTTTTTTTTCTTTTTAATTCCTTCAAGTTGCGTTCGCCACACTGATTGTTTTTTTTCTTTGATTTTTCAAAACAACAACACACAACAAGAACCCTAATCAAGAAATATACTCAACAAAAAAAATACAATTGAATAAGACGTATACCCAATCTAGAGCCTAGGCTCTAATACCAAATGATATGAAAACCATAGAAATTTGCAAATTAAGAATCCAATTTTTGAACCCTTAACAACAAATCTCAAAACCCCCATTTCAATTGACGTCAATCCAAAGGAAAATATTAGAATTGAATTACCTTTTGATCGAAGACCAAGAGATAAGGAGAACTAGTTCCTTACTCCAAGTTCGAACACTCCACAAGCAAGATGATCAGACTTACCTGAATGTTCTTGGCATGCAATCCTGATTCAAAAATTGCAATGTGGTAGGTGATTAAACTCTGCCATTTACTAGAGAATTCTCATTTAAGAAATCCCTAAAGTTCTAAAAACATCCAAAACTATTTTGAACAACTTAAAGGCAATGCTTTAAATAGCCTCCCAATAAAACCCTAATGACTTATCATAATTCATAGTAAAATATCTAAAATAACCCTACTTAAAATGTCATTAACAAGGATAAATTTGGAAATTATTAAATAATAATTTGATTCCTTGGGCGGTTCATATCATCCTCTCCTCATTTTGAAGGATTCGTCCTCGAATCCAAATCAAAGCCTTGTAAAGCAGTTTTGAAGTCGTGGGAAGAAAATGATGTCAATCGATTTCATCTTGTAGCATCAATTGAAACCAATTATAAGGCTTTTGATCAAATGTTGCTGCTTGAATCCCCTCCATTGAGTTCACCTCCGCTTGAATGTGAGAATTCAACGCTAACTGTAGCTTCTTAACTCTTGAGCATGTGATTGGCCCAAAAGGTAACACAAGGGCGTCCTGGTTCATATCATAAACATTTTGTAATAATATTTTTTTTTAATTTACAAATAAGGACATTTCTTTTAAAATAAAACAAGTTTGGATAACAAAAATAAAATGTTTTCAAACGGGTGGTGGGGTGCTAATACCTTTCCTACACTCAACGACCCCCGAACCTAACTTTGAAAATGTAGACCGTTTTTCTTTTTTCCTTTTTTTTTAAATGGGTGACGAATCACACCCCACAATGATTGGTGGCGACTCCAAATATTTCACCTAGAAAGAGACCCTATAGGGAAGGACGTCGGCCGCTTCGCTTCACGATGATGTTGCGACAGCTTGGCGACTCCGCTGGGGACTATTTTTAGAGGGTCAAAGTCATTATGTCTTATTTCTGTTATCCATGCATTCTTTTTAGTCTATATGGCTTTCATTTAATTTTATATATATATATATATATATATATTTTAATGTAAATATTCTTGTGAAATACACTTATTTATTGCTTTTATTCCATGCATTCTCATTTATTTCATACACTTTCACGAGCCTCCTTCCTAGGATATACCCTAAAGATTAGATTCGAAGGCTGAGTAGTGTGACCTTCGTGGTGTTGGGTTTTATGCCTAAAACTCGTAGATAGTAAATATTGTATTTTGACCGTCATTAATAAATTGTTATTAATTATTATTCAATAAATGTTATTGATTATTTTATCTTATTTTAATAATCCTAAAATCTAATAAACTAGCATCCTATGCTGTTTTATGAGTCTTGAACAATATGTAGAGACATATGGGAATTAATGTTCAAGTTACAGCCTAAAGGGTTTATAGTATAAGGATAGGGTTGGGTACCTTATCTTGGTAAAATCCTGAAAGTGTGGGGGCGTTTGGCAAAGGTGCAAGTTCCTTTACCAAAAAGGACCAAACTTGGACCTAAGACAATTGATTATGTCTTTATAGGCTATGCAATGCATAGTGCTGCTTATAGATTCATGGTAATTAAATCAGAAGTATCTGATATTAATAACAATACC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BLAST of Lsi03G009610 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Lsi03G009610 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3T057 (60S ribosomal protein L23 OS=Bos taurus OX=9913 GN=RPL23 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 7.8e-09 Identity = 31/44 (70.45%), Postives = 33/44 (75.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XSU3 (60S ribosomal protein L23 OS=Canis lupus familiaris OX=9615 GN=RPL23 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 7.8e-09 Identity = 31/44 (70.45%), Postives = 33/44 (75.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6PC14 (60S ribosomal protein L23 OS=Danio rerio OX=7955 GN=rpl23 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 7.8e-09 Identity = 31/44 (70.45%), Postives = 33/44 (75.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J0H3I6 (Ribosomal protein L14p/L23e family protein OS=Actinidia rufa OX=165716 GN=Acr_26g0009300 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 2.8e-09 Identity = 38/59 (64.41%), Postives = 41/59 (69.49%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2P5YSL5 (Uncharacterized protein OS=Gossypium barbadense OX=3634 GN=ES319_A07G214400v1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 3.6e-09 Identity = 35/44 (79.55%), Postives = 37/44 (84.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D2PZ50 (Uncharacterized protein OS=Gossypium tomentosum OX=34277 GN=ES332_A07G230600v1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 3.6e-09 Identity = 35/44 (79.55%), Postives = 37/44 (84.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D2G142 (Uncharacterized protein OS=Gossypium darwinii OX=34276 GN=ES288_A07G232800v1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 3.6e-09 Identity = 35/44 (79.55%), Postives = 37/44 (84.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1J7H6J2 (Uncharacterized protein OS=Lupinus angustifolius OX=3871 GN=TanjilG_14068 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 1.8e-08 Identity = 32/36 (88.89%), Postives = 34/36 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. NCBI nr
Match: GFZ17660.1 (ribosomal protein L14p/L23e family protein [Actinidia rufa]) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 5.7e-09 Identity = 38/59 (64.41%), Postives = 41/59 (69.49%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. NCBI nr
Match: KAB2075314.1 (hypothetical protein ES319_A07G214400v1 [Gossypium barbadense] >PPS18598.1 hypothetical protein GOBAR_AA01985 [Gossypium barbadense] >TYH11116.1 hypothetical protein ES288_A07G232800v1 [Gossypium darwinii] >TYI20340.1 hypothetical protein ES332_A07G230600v1 [Gossypium tomentosum]) HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 7.5e-09 Identity = 35/44 (79.55%), Postives = 37/44 (84.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. NCBI nr
Match: OIV97968.1 (hypothetical protein TanjilG_14068 [Lupinus angustifolius]) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 3.7e-08 Identity = 32/36 (88.89%), Postives = 34/36 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. NCBI nr
Match: KAF3780745.1 (60S ribosomal protein L23 [Nymphaea thermarum]) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 3.7e-08 Identity = 35/44 (79.55%), Postives = 36/44 (81.82%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. NCBI nr
Match: GAV84144.1 (Ribosomal_L14 domain-containing protein [Cephalotus follicularis]) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 3.7e-08 Identity = 34/44 (77.27%), Postives = 36/44 (81.82%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. TAIR 10
Match: AT1G04480.1 (Ribosomal protein L14p/L23e family protein ) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 1.7e-11 Identity = 33/42 (78.57%), Postives = 35/42 (83.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. TAIR 10
Match: AT2G33370.1 (Ribosomal protein L14p/L23e family protein ) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 1.7e-11 Identity = 33/42 (78.57%), Postives = 35/42 (83.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. TAIR 10
Match: AT3G04400.1 (Ribosomal protein L14p/L23e family protein ) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 1.7e-11 Identity = 33/42 (78.57%), Postives = 35/42 (83.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G009610 vs. TAIR 10
Match: AT3G04400.2 (Ribosomal protein L14p/L23e family protein ) HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 3.0e-08 Identity = 28/37 (75.68%), Postives = 30/37 (81.08%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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