Lsi02G027360 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi02G027360
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr02: 33639143 .. 33644520 (+)
RNA-Seq ExpressionLsi02G027360
SyntenyLsi02G027360
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGAAAGAATGTCCAGAGAAGATGTACGCTTCCTCCGCATTGCTCTTCCAAGTCCCAATATTAGTCCTAACGCCATTTCCCAAGTTAATCACCTCGATCAAACAAAAGAACAGTACCAGAACGCTTTCTGAAACTTCTTCTGCTAGGTTATCTATCGGACGGGTCCGTGCGTCTTCGCGGGGTTTAAGCGGCGTCGGAGTTATCCTACGGCGGTGGAATTTAAACTCGCTGAAGGGAAGAGATGAATAGGTTACAGAATCGTTGAACCTATGGCGGCAGCGGCTAGTATCAGTGGGAATAGGACAGGAAGACAGAGAGAGAGAGAGCCAGAGCCAGAGCTAGAGGAGAAGAAAAAGAAAAACAAAGGTTATTAATTTTTTTTCTTTCTTTTTTATTTATCGGTGTGTATCCCTTTAAATCATTCTTCACCATATTGTGTGAAACATAATTTGAGTTAATTAAACTTTTAATTTTGATAAGTTAATCAATTAAAATTATTTATTATCGTTATTTTAAATTTCATCAATATATTAATTTTCAAATATGTATGACTTCTTCAAATATCAATTTAATAAAATGGACGATTAAAGCAAATACATGAACAATTGTCAAAGAATCTAAATTGATTTATTTATGAAAGTCTAGTGATTGAATTGATACAATTATGAGTTTCACAAGATTTTCTCAAACAGAATATAATAAAGGAAATTGATATATTAACAAAAGTTTAGGGGTATAAATTGATAATTTTTTGAAGTTTAGGAGTAGAAGTTTTAACTTCCAACCTCACATGTCATTTGCTGTTTGTTCGTTTTTTTTTTCCATTTCCTTTGAGGAAACAATCAACAATAAAACTAAGTACAGAATTACATCCAAAGAAATAAATGACTCAAACCAGTTAGAGTAAGGAAATAAGAGAAGAGAAGAAGCTTGCTCATCCAATGCCCTTGGCGCCAACATATGGGCCAGAACGTTGTTCAAACGACGAATATGTTTAAAGGAAACATTGCTCAACTCTTGTGCATAAGACTTAGCATCAATGATGAAAAAGGAGACTTAAATAAGATCTAAATAACTACCACTCAACATATTAGCAACCTCCAAGAGTTTGACTCTACAATGATGAGTTGTACATTGATAGAGATAGTATTAAAGAGTTCTTCACGAATAGCCCTCGCTTCAAGAACCTTAACTTCATTGCTTCTTTTGATAAACTTAAGACTAATAAGTAGAGAAGAGAGGGAAAAGGAGAGGAAGAGAGAGAGAGAGAAATGAGATTTTTTTTTCCTTTGCAATACAACAAATTGTGGTAGTGTAGATTTTAACCTTAGTCTTGGTTACATGTCACTTTGACGAGAAAAGAAATAGTTAGTTAGGTCATTCTTGTAAAAATTATTATTAATAAAGGTTGCCACAATGCAATTAACAGTTTTACACTATTAGATGTATGAGAGAAACTACAAAACTAATCTATACCGACTCCAATCGAGTGGATATTATGAGGTAGGTTTTTTAAATTACATAGAACATTTATTAAGAGACACCCACATTATAGTATTTTATTTTTAAAAAAATCATTTTTACCCACTATTAATTAATGAAAAAAGAAATATTTTCAAAATTAAGTTTAAAGATGAATTAATTCTAGTTCTGGAAATTTCAAATTTATGTTTAAAACATTTTTAAGATCCTTAAAACTTTCAAATTCATTTTTTATAGATTTTCAAACTTTAAAAGTATCTAATTGATCACTACACACTTGCAACTTTGTGTCTAATAATTTATTGGTACACTGAAGATTCTTAAACTTTAATCGATTTATTATATATAAATTTAAATTTTACAGGTAGTACATTCTTATAATATTTTTGGGTAATAGTGATGAGTAGCAATTTTAAGAGCAATAACCAATTGTATAGCAACATTTTAAAAAAATTACAAATATAGCAAAGTCTATCACGGATAAAATTTGCTAAATTTACAACTTTTAAAATATTGTCATATATATTAATACTTTGAATCTAATTGCTATATTTGTTATTCTATTAGACAAAATTAAAGTGTCAAGGCCTCTAAAACATAAAGCTGAAAGTTTAGATTATATTAAACTTTTAGTCTGATATTGAAACTATGTGAAATGAACATTCATTTATAATGAAACGAAGTTTTCAGCGCCTCTTAATTCATTGATTCAAAATAATGTCTATAGGTCAACCTCACAATATAAACTACAACAACACTCGTCAGAGTCTCCAATTAAGATAAAAGGGAAGAAATACCAAACATATTCCATCATTTTGATTCTACTGAAACTTTAATAAAAAAATATTTGGATTAACTTTTTAAGCGCTTAAAAACATCTATTTATAGGTACTTAAAAAGTCAATCCAAACAAGTTTTAAGTTAGTCGAGTGCGAAGCTACTAAGTAGCATCGCCGGTGATCTCCGTTAACTTGAAGGGATTAAAGAAGATGGAGTTGGACCATAACTTCCCACAACCTGAGAGTTAGCAGAAAAGAAACACTATTGTGGCTGAATCCAGTCAGTGAGTGTTTTTCTTTTCCGTTTTGTTTGAGCCTTTTGGCTTTGTTCCTCCTCTGAATTTCGCTTCAACTTCTCCAAATCTTCTTCACTTATCAAACCCTTCAATCTTTTGTTTAGTTCGTATGCTTCACCCATCTTTTTTCTGCATTCTTTGATAGCTATATCATGTGACACCACTGAAAAAGAAAGAAAAAGAAATATGGTAGACATGAGTAATTGATGTGGTGATCCAACGCAATCAACCAAAAAGAAACGAATCATTAATTCAGGAAGATGCAGCAAAATTCGAAGTGTGTTATAAAAATTACTCCTTTTATCTATCTCCTAATAGAAAAGGCTCGTGATAATATTTCTCACTTTCTTGAGAACCCATACCTGATCGTATTAGACTATTTACATCTCTTGACAAGACCAATTATATAAAAGATTGTTTTGAGAAGTAAGCTCTGGCAAGACGTTGTCAAAAGTTGACTTGCTTGCAGGGTTTAATAGACATGTAATGACCAATTAAATACAGGGGAATGAAGAGAGAATGTCCTTATAGTAGATGGAAACAGTTGATATGAACCATATGTAAATCAGAATAGAGGAATAGGCAAAACTAATAGAATCGATTTTGGACGATTTAAGGAGACGTTCTGACAGCTACCAGAGTCTGACCACTTACAGCTTTTTACCCTTTCAAATATTGTTTGCTGTTTATTCCTAAAAGGTATGATATATAATGCTTCCGATCAAAAGGGATAGATAATGGTTAACTGAAATAACCGTCAGAACTAACCTGGATTTGGGTAATCTTTACCAATGATGCATTTTGCTTTCTTTTGAATGCTGAGAGGAGCTGTCCATGGCTCATATATGTACTGCTTGGGCATATCTATCAATCAAAAGTTGGATTTCATAACGGTAAAATATAGCACAACATCAATCATGATGAAAGATGAGGAATTTATGATATGCTAGAGAAATTGATTTGAAATCATTATATTCTTTTTCTTCTTTTTGCAGAACTATTTTTGAAAACTACTATTTACAAGCACGATTTGCAAATTCAACTTATTTATCCTAGAAAGACAATAATGACAATACAATAAATATATCTTTTTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATTTTAAAATGAACTGTAGGAAAGTTTATGACATTAAAAAACAGAACCTTTCAATTAATAGTTTCCAAACAAACCCTTTGTTTACCTTTTAATACTGGAAGAAAATGCCTGATGAAGTCACCGTTTGGGTCATACTTCTTTCCGAATGTGACTGGAGAGTATATACGATTATACTGACAACCAAAGACAACCAGCAAGATCATTAAATGTAAAAGCGAAGTATTGCAACAAAAAGAGAAAATTATGATTCTAGCATTTAGTTAAAAAAATTGGCCCAGATGATCCAACAAGTAAAAGCAATTCACCAAATTTAAAGCCACAAGTCCGCTCAATGCTTACAACACTCTAAACCAGGATCATTTCATGTACCTCATAATGGTGAAAGAGGATCTATGTTACACACTTACACTTTTATGAGAAACAATTTTATATTGATGAAGTTCCCGACAAAAGAAGGGGGAGAAAAAACTAAGATTCTAACATCAAGACAGTTACTAAGATTCGAATCAAACCTGATAAAAAAATGATGAACACGATAACCACAACCAATTTGCATTGTTAATGACCCAATCTGAATCAATCAGAAGCCTCTCGAACACATCACGTCCTTTCTCCCAGTGAACAAACTATGCAGAGGGGAAAAAATGAAATATAATATAATGACATCAAGATAAACTAGAATTCAGTGGCCCACATTTCCCAAGCTAAGTCACATACCAGATCTCCGCGAGTTAGGAAACATGCAACACAATGTCGTGCTAGGTGGTGCATCCAACCCCATTTGCGAAGCTAAAAATAAATAAAAATTAAATTAAAAATAAATAAATAACTGTTTTGCTATCATATGACCAAGTAGACTTTTGCTCACCTACCCTATATATATAGATAGTAATGTAAAAGGATAAACCAAACTAACCTGAACCATGATAGCATCAATCCAAGGAAATCCTGTCCTTGCATCTCTCCAAGCCGCCAAGAGTTCATTATCATCATTCCAAGGTATCTACATATTCATTTAACCACTTTAGCACATACAACCTTAAGTAGACAACATAATCCTACCAGGTCCTCTTGTTGCCTTACTGTTAACGTCAAGCCTGATATTTGAATAGTCATAAATGTCTTTTCACAACTCTTCTAATTCAGTAGCAACTGGATTTAGGTTATTCTCCTCAAATGATTAATAAACTACATTTACAGGATGAGGATGGTTTCCTAATTACTCACATCCTACTTCTACTGTATCCAATGATGAAAAGTACTCGGGAATCTTCAATCGTTTGTGACATCCAAATCTTGCATATCCGTAATGCTGAAGCTAAAAT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mRNA sequence

ATGAAAGAATGTCCAGAGAAGATGTACGCTTCCTCCGCATTGCTCTTCCAAGTCCCAATATTAGTCCTAACGCCATTTCCCAAGTTAATCACCTCGATCAAACAAAAGAACAGTACCAGAACGCTTTCTGAAACTTCTTCTGCTAGGTTATCTATCGGACGGAAAAGAAACACTATTGTGGCTGAATCCAGTCATTCGTATGCTTCACCCATCTTTTTTCTGCATTCTTTGATAGCTATATCATGTGACACCACTGAAAAAGAAAGAAAAAGAAATATGGTAGACATGAAAAAGGCTCGTGATAATATTTCTCACTTTCTTGAGAACCCATACCTGATCGGTTTAATAGACATGAAATCCTGTCCTTGCATCTCTCCAAGCCGCCAAGAGTTCATTATCATCATTCCAAGGTATCTACATATTCATTTAACCACTTTAGCACATACAACCTTAAGTAGACAACATAATCCTACCAGGTCCTCTTGTTGCCTTACTGTTAACGATGAGGATGGTTTCCTAATTACTCACATCCTACTTCTACTGTATCCAATGATGAAAAGTACTCGGGAATCTTCAATCGTTTGTGACATCCAAATCTTGCATATCCGTAATGCTGAAGCTAAAATATTTCAATGCAAGTTGGGACAGATACTGTTGAAGATTAAAAAATCTTTAAAACATCGAGAAACTAGAGTTCTAGTGCAGTTGCTACAATTATATGCAACATCACAGTCACCACCAGAACTGTATCTCAAAGGAGGAAGTCAGAGATGTATAATTAAATATCTATTTCACTGGCAAAAAGATTGGGCAAGGTCCTTAATTCAGATGAAGGGAAGAGATGTGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAAGAATGTCCAGAGAAGATGTACGCTTCCTCCGCATTGCTCTTCCAAGTCCCAATATTAGTCCTAACGCCATTTCCCAAGTTAATCACCTCGATCAAACAAAAGAACAGTACCAGAACGCTTTCTGAAACTTCTTCTGCTAGGTTATCTATCGGACGGAAAAGAAACACTATTGTGGCTGAATCCAGTCATTCGTATGCTTCACCCATCTTTTTTCTGCATTCTTTGATAGCTATATCATGTGACACCACTGAAAAAGAAAGAAAAAGAAATATGGTAGACATGAAAAAGGCTCGTGATAATATTTCTCACTTTCTTGAGAACCCATACCTGATCGGTTTAATAGACATGAAATCCTGTCCTTGCATCTCTCCAAGCCGCCAAGAGTTCATTATCATCATTCCAAGGTATCTACATATTCATTTAACCACTTTAGCACATACAACCTTAAGTAGACAACATAATCCTACCAGGTCCTCTTGTTGCCTTACTGTTAACGATGAGGATGGTTTCCTAATTACTCACATCCTACTTCTACTGTATCCAATGATGAAAAGTACTCGGGAATCTTCAATCGTTTGTGACATCCAAATCTTGCATATCCGTAATGCTGAAGCTAAAATATTTCAATGCAAGTTGGGACAGATACTGTTGAAGATTAAAAAATCTTTAAAACATCGAGAAACTAGAGTTCTAGTGCAGTTGCTACAATTATATGCAACATCACAGTCACCACCAGAACTGTATCTCAAAGGAGGAAGTCAGAGATGTATAATTAAATATCTATTTCACTGGCAAAAAGATTGGGCAAGGTCCTTAATTCAGATGAAGGGAAGAGATGTGTAA

Protein sequence

MKECPEKMYASSALLFQVPILVLTPFPKLITSIKQKNSTRTLSETSSARLSIGRKRNTIVAESSHSYASPIFFLHSLIAISCDTTEKERKRNMVDMKKARDNISHFLENPYLIGLIDMKSCPCISPSRQEFIIIIPRYLHIHLTTLAHTTLSRQHNPTRSSCCLTVNDEDGFLITHILLLLYPMMKSTRESSIVCDIQILHIRNAEAKIFQCKLGQILLKIKKSLKHRETRVLVQLLQLYATSQSPPELYLKGGSQRCIIKYLFHWQKDWARSLIQMKGRDV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi02G027360.1Lsi02G027360.1mRNA