Lcy08g009880 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCCTCGAATCTTTGTGTGTTACGGTTGTGTATGGAAGGAGAATGAAAGAAATTATGAAGGTGGCTATTTAGTAGGATTGGATGTGAATATTGACATAAGGTATGAAGAGTTTTTAAGAGAGCTGTATAACGTGAGTGGCATTAACCCCATTCAGTTTGACCTTATAATAAGATGTCTATACAATTTTGGATCAAGAGTTCCTACTTATTTGATTAGAAATGATAGAAAATTAAGATTCTTTCTAAGTGGAGAGGATGCATCTCAATTGCCGTTATACTTATCAATGATTCCGAAAGTAAATGTACATTTGACCGAACATTAATAAAAGTGATGTATTATTCATGTTTGTATTGTATCTTGTCTTATTAACCCTAATCCAATAAACTAAACATCCAAGGCTAATAGAATGAGACTTGAACTAGTATGTAGGGACATATGGGTATCGATGTTCAAGTTTTAGCCTAAAGGGTCTGTAGTATAGGGATAAGGCTGGGTACCTTATCCTAGTGACACTATGGATACGACCCGCTTTGTATATTGATACAAACGTACTGATCCAACGCGTTCATGTAGTTGACATGCGAGTGGGGGTATCCTGTGCAATGAGTTTGCACAAAGACCGGACCGTGAAATAGTTAACCACTAACTGTAACACCGTTAGTTAGCTCGGTTTCTATTTCACTAGGATGACCTAGGCAACTTGGCCTTAATCCTGAGTGGATTATGGACTCCTGTCCATGAGGGATGGTCCTTTGATTTGTACGGGTGAGAGTGGCCTGTTCGCCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGACAAGACCGAGTGGGGAGCTGGGAACATAGTCTCACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCGACTTTAGGGTAAGTAGAAGTGTGTTCCCTTAAGTGGTGTCTCCGAGTCTTGAACAATGGGCCCTGCCCTCTCTATGGCACGAGAGGGACTTATGTTTGTTGGTTGGACCTCAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGTACTTAAAGACCAAGAGGTAGCCCAGGGGTAAAACGGTAATTTGACCTAGCTGGGTTACGAACACACGTGAAGGGCTAACTTGCTGTTGATGGTCGATATCCGTGGACACAGAAATATATCTGTAGTGAGAAGAGTGCAGTTGGGGTTCTATAGTGGAGTGAACCACAGTTAACGAATATTGATTAACTTGGTTAATGAGTTTAGCCAATTAATCTCATATCGTTGGAGCTTCTGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCCACCGGTAGCTCACTAGGGGCGTTGAGGTGAAATTCTAAGGGAGAATCGAATATTCGAAGGTGTTCGAATATTAAATTTAAATATGAATTTGATTCATATTAAAACTATAGGTTATATTTAATGCACATTAGATGTACATTAATACTATAGTTTAATTGAGAGAGATATATTTAAATATATGATATTTAATTACAATATTAATTAATTGTTGAATTGATTAATATTTTGTTTAATTTAATTTAATTAAATTTGATTTAATTAAATTACTTTAAAACCATAGGTTATGTGGGAATGTTTATGTAAAATATGATTTACATAAATAATAATTAGTTTAAGTATTAAATTAATTATTATTATTAATATTAATTTATTATTTATTAATATTAATATTCATCAATCAGTTAAAGTAACTGATTGAATTTTTCTTCCCCACTAACCTGTACACGTTGGGAGTGGGTTATTTTAGGGAGTTGGGTCAGTTTTTACGCTTCATCCCCGAATCCTCTCTAACCTCTCAACCCTAATTGTTCTCTCTCTCTCTCAATTGATTGAGATCAATCGTTCTTTTTGCTCTCAAGCGATACAGAGACTTTCCTCCGAAGAAATTCCTAGAGTTTTACCTTGCTCCCACAAGCAATCAACGTTTTTCCCCGTGAGGATACGGGTGCTACTGCGTGGTAGTGTTCGTGGTAAATTTGCAGCATTAAAGGAAGATTTTGCTGCTGGAATTTTCTGTCTTCGCAAGGGTTTATTGTCGAATCGGTCAAGAACGTCTTCCAAAGTAAGTATTCTTGATCTTGGATCGATAGGGTCCTTCTTAGATTAGATCTAGGAGTTTATCCTTGGATCATAAGCATGCTTTATTATTGTTGTACAACATGTTAAAATTTAGTTTACTGCTGTTATTTTTATTCCAACGTATCGGTATTTTGATCCTAAATTAAATCAGAGTTAAGGTTCTGAAAAGTTTTCCGTTGTGTTGGGGCTTTATCCCTACAATTGGTATCAGAGCCATCTCTGTATTTTTTCTTATTGATTAAAATTTGCAATTTGCTGTATGGTGGGATTAATTGCATTATGAATGTTAATTTTGCGATAAACTGTTTTGGTTTAATTTGGCCTTAGATTTACAGTTTTTTGTTGATTTGATCATGTAAAGCCCCTGCGTTTTTGGGCAAAAATTCTGTAAATTGAGTCTGTACAGTCCGGGTCTAGAATAGGTTGAAGATCGGTGAATAACACGGTATAAATCGAGGCCAATTTGAAGAGTTCAGCCGTTGTTTTTTGCCCAGAATCGAGCTCCAGACGCAACAGCGTCAGGACGCTTGGCCTATCGCGTCCCAATGCTGTCGCGATTTCACCCAGCAAACGGTTGAAATCGCGCCAGCGTCGGGACGCTGTGCTTAAAGCGTCTCGACTCTGTCGCGATTTCGTGCGGCAGTTCAGATTTCGTCAGGACGTGCGCTGAAATCCTAATGGGCGGACCAGTTCGTGCGGTCAGGGTTGAGCTGGGACCGGTTTGGTCCGGTTCAACCCGATTTATGGGCGGTTCGAGATTTTCAAGGCCGATTCGAAGCGGTTCGGGTCAGTTTGTGGATTCTGGACCAATTTTAGAGCTGTATATTATGTAATAGGATAGATTTAAAGCTTTATTAGTGTAATTTTGCTTTAAAATTATCCTAGGGGCCAATTAAACCGGTTTATTCGCTATTTAAATGCTTTGTGGATGTCATTTAAATAATAATCCCACCTTAGGTTATAAAGCATGCTCATGCATTATGTATGTTATAATATGATTATAATATTTGGATGATAATGCATGGTTTTTCATGATTGATTAATATATAGATGAGTTATATTAATATCATGAAAATGAGATAGCATGATGTATGCAATTACATAGTTTTAATATAAGAGTTATATTTAAAATGAATTGTTTGCAGCATGCTACTGTGATTTACCATTTTTGGCTATAATTAAGTGTTAATTTATTAAAAATGGAAATCAAGTTGCATTGAGCATGAAACATCCATAGATTAATGTAAAAGTTATATTAATTTTCATGCAATGCAAATTAGTATAGTTTAAATTTGATTAATTTGAATATGATTGTTAATTGATTTAAACTATAGTATGCAAGATTATAGGGCTAATCATTAAAGTTTTGAAATAGTTTAAAATTTATGATTAGAAACCGTCAATCTATAATCAAGATATGCATGCTCACATAGGATCTTAGGTTAAAATGAATTAATTTTAATGAGTTAAAATTAATTAGACCTGAGATCACTTTCTAATAGGATTAGAAATTCTTACTTAGTTTTAAAATAGTTTTAATGTACTAAGTAGGACAAACATTTCTGAGATTATAAGGGAACTCTACCAGTGAAGTTCTGTCTAAGGATTGGAGGTATTTAAGTTGATGGTATACGGAACACCTCCTACCTCGGAACTAATCTGGAACACCGGAGTTGAATTAATCACAGGTTAATGTTAGAATAATGTCGCTAGGTAAATTAAATTGGTTTAATGCACCTAGACATTAGGTCTTATTATAATAGTTATAATAGGACTAGACTTAGATAAATGACTTAGCCGGATTTATCTAGGTCTAATCAAACCCTAAAATACCCGATAGGTTACTTTAGTGGGAGGAAAATTACAAAACTTAATTTAAATTGAGTTTTGCTCCTACGTCCCTGTATGTTTACATCGTGAGATCCATGCTCGGCTTCGTGTCGTTTTAGCGCGGCCTCCCTTCGGAAAGTGTTTGCATGGGTCAATACCAAGGTGAATGGGGAAAGTGACTATAGTAAGTGGGAGCGGGACGCGTGTCAACGTATCCCTCGGTCTCCACCCCTAGGTCACAACGTGAGATTCCTATGATCCGCCTGCGTGTTGCCCTGGAGCAACCATCCATTCTGAGGGCCTGATCATAGGATTCGGAACACCGTGAACTCCTGATTAGGATAAGATCGCTTAGGCTAATTACCAACAGTTTTCTTTCCTAACGGTAGCCTGTTGGTCTGTGCCTCTGAGATCTGAAAGTGGGAGGGTTACACTAACGGGGAGGAGTTAATTGGTTAACAAATCCTTGACCGAACAACGGTGGTTAATGTCTAATGGAATATGAGTTATTTTGGTATTAGAAATTAACTGAGAAGAGTCTCATTTTAGAGGAGGAACAACTGATCACCCTTCGGTGGCTGTTCTTCTAAACCTCTAAAGCATCGTTGCAAGACACAATCAATAGTTTTATTAGGGTTCTTTGATTGCTTCTTTGCAAGATTGATTGGATGTATGCAATTGTTTGTATTGCTTGTGTGATGGGTTAAGGCAAAGATAACTAATACGGTCAATTGTTTGTTTTTCAGCAATGTCTTCCTCTGTTATTGCCTTGCTTAAAAATGAAAGATTAATGGGCGAGAATTTCCCCACATGGAAATCGAATCTAAACACCATACTCGTGGTAGAGGATCTTAGGTTCGTCTTGACGGAGGAATGTCCTCCTGTTCCCCCTCGCACTGCCGCTCAGGCAGTAAAGGATGCCCACGAACGCTGGACGAAGGCCAATGAAAAGGCCCGAGTCTACATATTGGCTAGCTTATCTGAAGTCTTGGCCAAGCGTTACGAAAACGTGGAAACTGCCAGGGAGATTATGAATTCCCTGCAGGAGATGTTTGGACTCCCGTCCTATCAGCTCCACCACGATGCCTTGAAGAACG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MPRIFVCYGCVWKENERNYEGGYLVGLDVNIDIRYEEFLRELYNPMIIHQLEENLYTGDDTLNYKEEEYDEEEDENWEYNEEDEELDESYEEESEADEFEEVDDYDDDVAGDGVEADGGIDGGNEVEEDVAPLASRMEVRAIKPKGYDVFKISKYYNVHTCSHELLNHHHRQAKSQVVGHLIKSKFEDVRQIYKTKDIIQDMRKDYGVTISYKKAWRTREEALAFVRGSPEESFGHLHAYGEALKIMNPGTIYDIKLEDGKYFKYVFMALGQCIRGFIEYIRPVIIVDGAHLKGKFGDDAWQWFFERVKRSIGDPTGLVIVSDRKSSIEKAIRTVYPSAFHCFCIHHLSMNLMKNFKCEGAIPFFFLAVKACRESEFENMFAKLRPFSGVAKYLDELGFPRWARAFQCGRRYNQMTTNVAESMNATLVHARTLSVTKMLDNIREYAENLLMEAEKKSRRHNVDPIDCYEYQVDEGQLDFHVDLHMRPCTCREFEYYEISCSHAIAAARDRNVNVATLCSPAYHTKSVILSYAEPIYPVCPMSEWKRSAEFQEMELLPPKRVARVGRRQTVRIPSAGERPQPETVMLMWPLFVPRHITQNL Homology
BLAST of Lcy08g009880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DJT1 (uncharacterized protein LOC111020715 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020715 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 460.7 bits (1184), Expect = 9.4e-126 Identity = 245/490 (50.00%), Postives = 312/490 (63.67%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g009880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DU12 (protein FAR-RED ELONGATED HYPOCOTYL 3-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023994 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 439.9 bits (1130), Expect = 1.7e-119 Identity = 227/488 (46.52%), Postives = 305/488 (62.50%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g009880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DL12 (uncharacterized protein LOC111022077 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022077 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 439.1 bits (1128), Expect = 2.9e-119 Identity = 228/491 (46.44%), Postives = 306/491 (62.32%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g009880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CVL4 (uncharacterized protein LOC111015181 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015181 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 433.7 bits (1114), Expect = 1.2e-117 Identity = 241/490 (49.18%), Postives = 297/490 (60.61%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g009880 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DRN0 (uncharacterized protein LOC111022579 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022579 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 425.2 bits (1092), Expect = 4.4e-115 Identity = 270/725 (37.24%), Postives = 388/725 (53.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g009880 vs. NCBI nr
Match: XP_022153146.1 (uncharacterized protein LOC111020715 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 460.7 bits (1184), Expect = 1.9e-125 Identity = 245/490 (50.00%), Postives = 312/490 (63.67%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g009880 vs. NCBI nr
Match: XP_022157237.1 (protein FAR-RED ELONGATED HYPOCOTYL 3-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 439.9 bits (1130), Expect = 3.6e-119 Identity = 227/488 (46.52%), Postives = 305/488 (62.50%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g009880 vs. NCBI nr
Match: XP_022154930.1 (uncharacterized protein LOC111022077 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 438.3 bits (1126), Expect = 1.0e-118 Identity = 227/491 (46.23%), Postives = 306/491 (62.32%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g009880 vs. NCBI nr
Match: XP_022145820.1 (uncharacterized protein LOC111015181 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 433.7 bits (1114), Expect = 2.6e-117 Identity = 241/490 (49.18%), Postives = 297/490 (60.61%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g009880 vs. NCBI nr
Match: XP_022155431.1 (uncharacterized protein LOC111022579 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 425.2 bits (1092), Expect = 9.1e-115 Identity = 270/725 (37.24%), Postives = 388/725 (53.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g009880 vs. TAIR 10
Match: AT1G64260.1 (MuDR family transposase ) HSP 1 Score: 103.6 bits (257), Expect = 5.6e-22 Identity = 104/492 (21.14%), Postives = 194/492 (39.43%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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