Lcy08g000570 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAAACAAAACAAAACAAAGAAGGAAGAAGAAGAAGAAAGAGATCACACTAAGCTTAAGAAGCACTTCTTCTCTAGTAATGTTCTAAGCTCTCTCTCTCTTTTTTCTTTGCAAAAACCATTTTTTTTCATCGAATCTATGGTGGGTTTTTGTTTTTTTGATCGAATTTCTCTTCATCCATTTCTCTCTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGAAACCCACTTTTTTTTTTTTAAGATATTTTCTTTCTTTCATTTGCATTTTTCTGAAAAAAGCTTGGGATTTTGTTCCTCTTTCGATTCGTACTGAATTCAAGATCCAATATATGTGAGAAAAACCTTATTATTTTTTCAAAGATCAATTCTTTTTTCAATTTTTTTGCCCCCAATTGATTGATTAGTTATTATTTATTTTTTATTTTTTCAGAAGAAATGACGAGGAAGAAAATTCAGATCAAGAAGATCGACAACATAGCTGCAAGGCAAGTGGCATTTTCAAAGAGAAGAAAAGGGCTTTTCAAGAAAGCTAAAGAGCTTGCAATTCTCTGTGATGCTGAGATTGGCCTTCTGGTTTTTTCTGCTTCTGGAAAGCTCTTTGACTATGCAAGTTCAAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTCTCTCTCAAAACTTCCAAATCTTCATTCTATTCTTGTTTTTGCTTCAACCCTTTTTTCTAGAGAGAGAGAGAGGAGAGGAGAGAGAAAAAAAATAATTGCACTTTAAAAGAAATTAAAGAGAAGGCAAGTACACAAATTCCAGTCAAAAGAAAGCCATTGAAAATGGAGATGAAGTGCCAATCTAAAATCTAGGCTAGTTGGGATTTGAAAGCTTTCTGTGCTGATTCTCTTTGGAGGATAATGCTTCTTTTTTGATTTCATAAAATATAGGGCATTATTTAGTTTGTTATATGATATATGTTGGTGGCTTAAAGATATGTGAAAATTTGAGAGTTTTGCATAAGACTGGGGGGTTTTTGCAAGTTTTGAGAGATGGGTTTGGTTCTAAATTTGAATTTGGATTTGGGTTTTCTTGGAATTTAGAAAATTTGTGCTTATATGTTCATATTATGCATTCATTTTGTGTTCAATTTCTCATATACATTGTATTAATACCATTCAATATGATCTTGATATTTTTGTTTTTATAAGAGAATAGTCATCCAATAAGATTAGGAATGAGAGTAAAAAATTTTAAAAAGTACAGAAAAATACAAAAACATAGGGTGAATGAAAGCAAAGGAGTTTATCAAAGGACAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAGAGGTTTGATAGTACATTACAAAGAAGCTTTTGTTGAAGATTTGGAACATATAGGTTTTGTTCAAGGTAGATTTTCAAGTATAAGATTCTGAAAACACTAAAAAGATTTAGTTCGCTCTTTCTGTTAGAACCAATTAGTACATATAAGCTTCAAAAGTGACATTTTGAGTGATGGGTTTTCTTATCGTCCCTTAACTTTGGATTAGGTAGAAGGGCGAAGCTTAAATCCTCAATGTTCATACCAAATGAAACATAAAATATACTTAAAATCTCCCTAAGAAAAACTAGACAAAGTACATAAAAAGACTTCAATAAATAGACATAGTGAGAGAGGTTGAGGTTGTACCCTTAGAATATGCACTCTTCTTAGCTTTCACTATTCATCCACAAGATTTCTCTCTCTCTCTAAACTCTCTAATAACTTTTTCTCTCACTACAATGTACTTAAAATTGCTACATTTTCTTAGGTTTATTCTAATATCCACCTCGTAATGATAATGATGATAATGTACTTTCTATGCCATCTATGACTCTTGAATCTTTTCATATATGTTTCATAATGTGTTTCAAATTTTTTAAAAATTATAATCGACAGATAAACATAAGTTTCATTCAAGGTAGATTTTCGAGTAGAAGCTCTAAAACGTTAAAAATTAGTTTTTTAAGCGGGTGGATAGAAGAAGCTAGGGATATATGATGTTGAATCATTGGAAGAATTCAATTTTTTTCTTGCATTTTGTTTTTCAACATATCTCCTTTTTGTTTTTTGTCTCTTGATTTTCAAAAAATGGTCTTATCATCCACATGCTTTGTTCTATACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAAGATGAGGAGGAAATTATAATATTCTAAAATGTATTTTCTTCATGATATTTTTTTTTTTCTTCAAGTTTATAGTTTGCCTTGTTTATATTGTTTTTACTTCTAGTTTTTCACTATGCATGAAGATAATCTTTCTGTTCTATATATTTATTTATCATTGCAATCTCTTTAAGTTTATTGTATATGATTTATATATCATTATGCTCTTTATTCATTTTTAAATATCTTTGCAAATACTTTCATTTTTATATGTGCTTTTTATTTCTGTTACTCACTGCCTTAATATTCTGTTATTTGCTTCTAAGAAACCTTTGTAGAGAGCAAAAGCAAAATTAGTATAGAAGTATATAGGGAGTAGAAATAATAGGAACAAATATTACAAGAAACTAAACCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAAATAATCTTCTTAAACAAACAAAATACAAAGAAAAGGGAACACTTAAATGTCAAGAAGATTACTAAAACTAAATAAAAGAGAGTAATTACAGTAAAAACTAGATATAAAAATATGAATGTTGAGATAAAACTAGTTATTAGGGTTTTGTTTGACAGTAATTTTGTTTTTGTAAGAATTAAGCTATTGAAAAGAAAAATCTCTTTGTTTGATTGTTCAACTGTAATTTGATAGTCCTTTTAAAACCCTGAAATCTTGGGGAAGTAGATCTAAAAGAAGAAAAAATGTTGGTAACTTAGGACATTTCAGTTTCATTTGTCATAAAAATTGAAACATTGGATAGCTGAAGCTGTTAATAATAATAATAATATGCAAAATTCTTCTGTTCAATGCAGTTTGAAAACTTTATTCTCTAATGGATTACATATTTTAAAAGCTTAAAAATACTATTTTCCTTTCAAGAATTTATTCTGTAACCACTGACAAAGTGTATAGGCTCTTGATTCTTTGATGATTTTGTAATGACCTTCCCCTTCCTCTCCTACGACCTTCCTATTCTCGAGCGTAATTGAGGTAGTTCTTTTATTAGGATCCTTCTCCCTAAATCCTTCTCTCCATGAACATTTCGACAAATCCTTTTAAGACGTGTGCTAGATTGATAGAACTCGGGCATACCTCATTTTCTATCCATTAACTAGAGCTTGCCAGCTTGAATAGGACGTAGTCATAAATTTTCACGATGGACAAAATTTTATATTCTAACTTTTTATAGGTATAATCTTTCCATTATGAGAATTTCGGACGAGGGACAAATTAGATAAACAAACTATAAAATCTTAACCTTTCTATATATATTTTTTCTTTTCATCTAAGAAAGATCTATGGGGACGACTTGCTCGATCCCCGCTTCTTTCTTCTTCGCTTTGTCTTTGTTAGCTTGATCATATGACACCTTTCTCAAACCCTAGCCAATTTATCACTCACAATAATCAAGTTCTTAATTCTTAATGTCACATAGGTTTAGAAGCTATGCAACAGAAGATGTTTCTTACCTTGCAAAGCAAAATGGTGAAACAAACTGCATTATGGGCCACTTTGGAGATCAAAGGAAGGCTATTGATCCTCTTTTTCACTCATTGATCACAAGTTTTCTCCACTCAAGGTCACAAAGTTGCTTTGGCAGGAAACCCTCAAGTCCCTTCTCATATAAATCGATTGATGTAAACCATCATGGGTTGACCTAATAGAGGGTCTAAGAATAATAAAGGATTTAGAGGGGATTAGTGAGTTCAGTATCCACCAGTGGCTACCTACTTAGGATATTAACAAACAAATGTAGTAGGGTCAGGTGATTGTCCTGTAAGATTAGTCGTCGAGGTGCGCCCAACCTGGTCCAGACACCACAGACCTCTCGGTCATTAGTACAAGTTTTATGTCAATTGAGTTATGCTCATGTTGGCAGTTGCCACCCACACTGCCTTCTCTAAAAGCTATATATAAATCCTTGTATCTGTTGGGAATTGGGAGTGCAACCAAAGTCCCACATTGGCTAGACAAGGGGATGATCATGGGTTTATAAGGGAGGACAAGTATCTCCATTGGTATGAGGCCTTTTGGGTGGAACCAAAAGCAAAGCCATGAGGGCTCATGCCCAAAGTGGACAATATCATACCATTGTGGAGATCTGTGTCGTGTCCTCGTCCCTTAACAAGTGGTATCAGAGCCTCGGTTTCGTGTTTTTCCGCAACAGTTTTTCAAGCGTACAAGGATGTCAGCTATGAACGTGAAGATCGACAAATTCACCGGGAGGAACAGTTTTGGTCTGTGGCAGATCAAGATGCGATCTCTGCTAAAGCAGCAGGGATTATGGGCGCCGCTGTCTGGTACGAAGAAGGCGGACGCTGATGAAGAAGAATGGAAAACCTTGGAGGAGAAGGCCCATTCCACGATTATGTTATGTCTGGCCGATGACGTCATCATCGAGGTCGCGAATGTGGATACTGCCGCCGGGCTCTGGTCTAAGCTCGAGAGCCTCTACATGACGAAGTCTTTGACTAAGAAGTTGCTCTTGAAGCAACGTCTGTTCAGTTTGCGAATGCAGGAAGGTACGCCCCTTAGAGATCACATAGACCAGTTGAACTCTATTCTGTTAGATCTACGTAATCTTGAGGTTAAGGTAGATGATGAGGATGCTGCTTTGATTCTGTTAGTATCTTTGCCGTTGTCGTATGAGAATTTTGTAGATTCTTTTATTAGTGGTAAAGATAAATTGTCTCTAGAAGAAGTAAAAACTGCCCTTCTGACTAGAGAAGTCCGTCATAAAGTAGCAAGTTCGGTTACAGAAAATCAGGCATCTGGGTTGGTTGCTTCGAGTAGTAAGGGACATAGGAAATCTGGTAGA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Match: Q9FVC1 (MADS-box protein SVP OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SVP PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 166.8 bits (421), Expect = 2.9e-40 Identity = 87/157 (55.41%), Postives = 130/157 (82.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O82794 (MADS-box protein AGL24 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL24 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 148.7 bits (374), Expect = 8.2e-35 Identity = 79/141 (56.03%), Postives = 116/141 (82.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XJ66 (MADS-box transcription factor 22 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MADS22 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 147.5 bits (371), Expect = 1.8e-34 Identity = 79/161 (49.07%), Postives = 123/161 (76.40%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5K4R0 (MADS-box transcription factor 47 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MADS47 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 141.4 bits (355), Expect = 1.3e-32 Identity = 80/155 (51.61%), Postives = 118/155 (76.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CLA0 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012209 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 277.7 bits (709), Expect = 4.3e-71 Identity = 146/158 (92.41%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CKS2 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012209 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 277.7 bits (709), Expect = 4.3e-71 Identity = 146/158 (92.41%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IA12 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470617 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 270.4 bits (690), Expect = 6.9e-69 Identity = 145/158 (91.77%), Postives = 151/158 (95.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I4L2 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470617 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 270.4 bits (690), Expect = 6.9e-69 Identity = 145/158 (91.77%), Postives = 151/158 (95.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I8F3 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470617 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 270.4 bits (690), Expect = 6.9e-69 Identity = 145/158 (91.77%), Postives = 151/158 (95.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. NCBI nr
Match: XP_022141962.1 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 277.7 bits (709), Expect = 8.9e-71 Identity = 146/158 (92.41%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. NCBI nr
Match: XP_022141961.1 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 277.7 bits (709), Expect = 8.9e-71 Identity = 146/158 (92.41%), Postives = 156/158 (98.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. NCBI nr
Match: XP_031744925.1 (MADS-box protein SVP isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 270.8 bits (691), Expect = 1.1e-68 Identity = 143/158 (90.51%), Postives = 154/158 (97.47%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. NCBI nr
Match: XP_004136891.2 (MADS-box protein SVP isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_011658821.1 MADS-box protein SVP isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8645819.1 hypothetical protein Csa_017269 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 270.8 bits (691), Expect = 1.1e-68 Identity = 143/158 (90.51%), Postives = 154/158 (97.47%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. NCBI nr
Match: XP_022971944.1 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 270.4 bits (690), Expect = 1.4e-68 Identity = 145/158 (91.77%), Postives = 151/158 (95.57%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. TAIR 10
Match: AT2G22540.1 (K-box region and MADS-box transcription factor family protein ) HSP 1 Score: 166.8 bits (421), Expect = 2.1e-41 Identity = 87/157 (55.41%), Postives = 130/157 (82.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. TAIR 10
Match: AT2G22540.2 (K-box region and MADS-box transcription factor family protein ) HSP 1 Score: 156.8 bits (395), Expect = 2.1e-38 Identity = 85/157 (54.14%), Postives = 126/157 (80.25%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. TAIR 10
Match: AT4G24540.1 (AGAMOUS-like 24 ) HSP 1 Score: 148.7 bits (374), Expect = 5.8e-36 Identity = 79/141 (56.03%), Postives = 116/141 (82.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. TAIR 10
Match: AT3G57230.1 (AGAMOUS-like 16 ) HSP 1 Score: 119.4 bits (298), Expect = 3.8e-27 Identity = 72/156 (46.15%), Postives = 100/156 (64.10%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy08g000570 vs. TAIR 10
Match: AT4G37940.1 (AGAMOUS-like 21 ) HSP 1 Score: 113.6 bits (283), Expect = 2.1e-25 Identity = 65/132 (49.24%), Postives = 91/132 (68.94%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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