Lcy05g005050 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTGCTATAACGATTGCTTGTTTTTGGTTTGAATTTTGGATGAAAGTGACGTTATGGTCTTGATTGCAGTGCCCTTTTGAATCTGGGCTATTTGAATTTTTGAATTGTAACACCGGATCCTCTTCTCCAGGGGATTCTATACATTTTTGGCTGATTTAAGTATCTGATGGCGTCGTATTTTAAGGGATACTCGTTCTGTTTTTAGTGATGTGGGTTTGTTGTTATTGTGTTCAGTTTACGTGAAAAATGGGGCTGTCTTTCACCAAGCTTTTCAGCCGGCTCTTTGCCAAGAAGGAGATGCGTATTCTCATGGTGGGTCTTGACGCAGCTGGTAAGACAACGATCCTTTACAAGCTCAAGCTGGGAGAGATTGTTACCACCATTCCCACCATTGGTAAGTTGTTTTTCCTTATATTCAACTATTGATTCTATTGAATAATGAATGGTGGAAATTATTTTTTCTTTGATGCTTTGTGTCTTGATCGTATCCATTGGACGTGTTTATTTAACTTGGTAGTTCCCTGTTTGTTTGCATCATCATCATCATCATCATCATCACAAAGGATCAAAGTCATTATGTTGAACTGTTGTTTTATCCTTGAGGAGATGAATTTATTGATGAAGATTGGATGATTAATCTAATTAGAAACCTAGGCCCTGTAAGGGCTCGCATATCTGATTAGTATGCCTCCATTTGTTATCAATAGAAAAAGGGGTAATATTTCTTTTATAATTTCGGATTAAATAGGGTCTATGAGTGAACCATACAATCATAACTTTCTGTTATAGTTAGCCACAACAAGATTCCACGCATGCGATTTTGGAAAAAGTGGGCTGATAGAAACAGTGATCTGTTCATAGACTAAATACTTCGACTGGACTGCATATTGTTATTCTGATTTCTGTAAAAGAAACTTTTTGTGCTTATGTTTTTAACTTCACACGATCTTAGTTAGTGATCACTGTTGATGAAAAAAGAGAAAGTGATATCAGAAGCATAACTGACTTGCATATGACTGTGCAGGTTTTAATGTTGAGACTGTGGAATACAAGAACATCAGCTTCACTGTCTGGGATGTTGGGGGTCAAGACAAGGTACATTGATTACTCGGTCAATGTTGATTGATAAAGCGTAATATGTTAAAATCTGGTTTCACATATGGCCTTTTTCATTTTCCTTGTCTTACCTGGCTTTTTAGTCATAAGCATAGATTTTACTAGCCAATCCCTTTGCAACTTTTCAACTTTCTTAGGGGTGTTGGAGTTAGAATTTTCCTGTAGCATGCTTAAATAATTTGACACTTGTGCTTCCACGGACTCATAGTTGCTAGCCAATCATCTACACATGGGTTCTCTCTTTACTGATTTGATGTTTGTTCTGTACCAAGATCCGACCATTGTGGAGGCATTATTTCCAAAACACCCAAGGACTTATTTTTGTGGTGGATAGCAATGACAGAGACCGTGTTGTTGAAGCTAGGGATGAGCTGCACAGAATGTTGAATGAGGTACTTATAATAAAAACTGTTTATCAGACTTCAATAGCTTTTGCAAAAGCTACCACAAATAATTGTTCATGTTAGTTTGTTATCTAGATAATAACATACATTGCACTTACAGGACGAGCTGAGGGATGCAGTGCTTTTGGTATTTGCCAACAAGCAAGATCTTCCCAATGCCATGAATGCTGCTGAGATCACCGACAAGCTTGGTCTTCACTCCCTCCGACAACGTCACTGGTACATTTTATGATCAGACTCTTAACACTTGCAAATTCTTGCACAGGCTTAAACTTTAAGATAATAATGTGATGTCTTGAAATCCTGTTTCAGGTACATTCAGAGCACATGTGCCACATCCGGTGAAGGGCTGTATGAAGGACTTGACTGGCTCTCAAACAATATTGCCAACAAGGTAAAATAACAATGTTCTTTGTTTAATCTAATGCACATGTTCACTGCAGTACATGGTACAAGGACCCATGTTTTCAGTCTGGGATGTCAAAACTTTAATCATTTGCATTGTCTTGGACGGTTAATTTTATTTTGTCTTAGAATAACTGAATTTGAACAGTCCAGTTCTTGATAGTATAAGTTTTGCTTTTGTTTTTAAAATGCAAACTTTTGCTGAAAAGACTTTATTCAAAAGAATAACAAGAGAGATAAAGGAAGGGTTTGTTTCAATGAAATTTATATTAGTTCGACTTCTGATAGGATTGTTTATTTTTCCTGATTTGCAGGCGTAGATGGCTTTCTTTGAGCTTGGATTGCTTCTGGAAATTGAAATTTATGTCATTTGTGCCTTGTTTTCGGGCATTTTTGTTGCATTACTACCCTGATCTATACAATGTTCCTAGTCGATGTGATTCCTAGGTTTTGTTGCCTTTGGATTCTGAATAATTAAAGAAATTTTGAAGTTTTTTTCTCATGTTATCGACTCAATAGCATTGTTTTTATGTAATGAATTAATGATGTTCTTAAATAGATGTATTTGTACGAACCATGTTTGTTATTTGTAATGGATTTGCTGAAAAGAAAATCAGTTTGGAACTTCATTGTATCAGTCTCTTCTGCTTCCATAATAACAGTGAGCTTAACCATTCAATGGACTTATATGCTCTATAGAGTTGCTTTCACTAAGTGCATTGAGCCAGGACTGGACATCCTCCCATCTCGACATTGAAGGGCGAAACGATGTTCGGTTCGGGTAATTTTGATTAGATAGATGGCAGTAGAAAATCAGGGTCATGCTGTTGTCAATAAGTAAAACAATCTAGAAATAGAAGAGGATGACAAGAAGAGGGGAAAAGAAAGGAGATGAAGAAAAGAGGCCTAATTTTTCATATTAGTAGTTTAATTTTTTAAAACTAACTAATGTTTCATGTTAGTATTTAATAACAAAACAAATGTAAGTATTAATAATAAAAACTGTGCTAAAGGGTGGGCCAAATTACAACTTGGGCTAAAGAATGGAGGAAAATTGGACAGAAAAATATCCAAATCCAAAGAGAAAAAACAAATAAATTATGGCCACATGATATCAGCATTTTTCTTTTGATTCGTCGAATTCAAATTAGATTTATATATATATATATATATATATATATATATTATCATCTTATGGTTCATATCTATCTAAATTTATTTTAAGATGAGTATAAAATTAATTAAAGTTAGAGCAAAAGGGTAAAATAAAAATTGACCGCGTATAATCCGGTTGAATTTGGAATAAATATTGAGTTTCAACAATACAAGATCAATAGCCATGATATCAAATTAGATGTTTTGATACAAAATGATAAGAGAACATTAGTAAAGTGGTTTAGAAATCCCTTTGATTTTGCAAACTCTTAGCATACAAAGACTAAAAATCACATATCTGTTTGATACATGTCAATTACTGTTAAACTATGCTCATTTTGTCAGGTGGAAATACTTCATTAAGTTTGATGATCAAACAAGTTTCAAAGCTTCTAAGACATGGAAGGCTGAAAAAAAAAATTGCACAAGATGGTTCAATGCTCACAATTGAAAAGAAAGTAAAAACTCAAATTTTTTCACCATCAAAATCTATTGCCTCACTTATAATTATCCATAACTTGACTATTTATCGTCTACAAGGGATGATTTAAACCCTAATTTCTAATATGGAAAGATATAATAACCAAATCTTAAAAGAATAAAATAAGATCCTAAATAGATAATTTTCAAAACAATTAAATCAAATACTTAACTAAACTAAAAGGCAATAAAATAAATCTTGATCAAATAATTCCCTAAAACAATTATTAAAGGAAAAATATACTCCCACCCTAAATAAGTTATCTTATAAATATTTGATCTCAAAAATCTAACACGAGATCCTAGAGACAAAAAATACATCAAAATTAGACAAGGTGTGTGGCAACTCAGAGGCATGGCTTATAGGCATAGGCAAATACTACAATAGTTGGGTGTGCATGGTTGTCACACGATGCACATCCTTGTAAGGTTAGCGCTAATGCGAGGATTGGAACCATAGGGGCACGCAAGCAAGTTTGGCACATGCATATAGGCAACATGAGCATGCAAATAAGCAAGATTTTAGCTATTTCTAGTACAAGGATATAGCAAAAATCCTCAAGCGATGCCACGTTCATGGTGACTTGGGAATTCCTCCTTTGATGGTGTGTTGGTGTTTTATCACTATCACATCACATAATTTCTCTAAATTTAATCCTTGATCAAGGACAAGACGAAGTCAGGAAATGATTTCTTAGCCTACCCTCCATAGTATAATAGTGATTTGTGTGTGCATACACATTTAAGATGCAAAAAACTTGCGAGTTGATCCTTGACACCCAATCAGGTGAGGAATCTTCAATTTGATTGGGTTTGAGGTCAAACTAGAAATATAAATTATATCCTCATCTCGAGTTTCAGTTCATCCATCCATCCATATATATCTTGCTCTCCTTACCCCACCTCAATGCATGTACAAGATTTTCTTGAGTACATATCATGAGTTACTTTCCATGTTTTGAATTCTTTACACTTAACATCAACTAGTCATAAAATCGTGCTTACCTATATCAACTTCAAAGATTAAAATTTGATTAATTAACTTAGCTAAGTATGAGGGATTACAATAATTTTTTCATCTAAAAGAGATTTTTTCTTTTCTTTTTTTAAGTCTCTACAAATAATAGATCTATATGTTAAGTTCAACCACCACAAATATTAGCTCATGGCCCACAAGTCAATCCAAGGCCAGTTTTGAACCAAGTTTATGTTACCAAATTTAACATTTGGCTTACACTCATCCACATATTACATTGGATATAGACCCTTTTCCTTCTGAATTTGGGTTGACCTATACAGGCACAAGGCAACTAGCCTAACAAATAATATTATTAACCTAACCCAAATCAAACTTGATTTGCCCTTTGCTGACCCAAAAACTTTTAGCCTATAAATCTCATTGAATACGGTTAGGTTGATAAAAAAAAACTTGGAA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MGLSFTKLFSRLFAKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRDRVVEARDELHRMLNEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRQRHWYIQSTCATSGEGLYEGLDWLSNNIANKEEMDVRKGPWTAEEDSVLFNYINSHGEGRWNAVARCTGLKRTGKSCRLRWLNYLRPSVRRGNITLQEQLLILELHFRWGNRWSKIAQFLPGRTDNEIKNYWRTRVQKQAKQLKCDVNSKKFRDTMRYVWMPRLLERIQASTDSIAAVATISDVVQPLHAHLDPTHPSPSESSWVNSHVASATSSSNSISDQVQIQVSPVSDMTENFNVVHTSEEEGMVMLMEQGCDGEATDGWTGGGELLDCGFWNEEDMWFLQQQFGDDV Homology
BLAST of Lcy05g005050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P51823 (ADP-ribosylation factor 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ARF PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 362.8 bits (930), Expect = 5.3e-99 Identity = 178/180 (98.89%), Postives = 180/180 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O48920 (ADP-ribosylation factor OS=Vigna unguiculata OX=3917 GN=ARF PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 362.1 bits (928), Expect = 9.1e-99 Identity = 178/180 (98.89%), Postives = 180/180 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P51822 (ADP-ribosylation factor 1 OS=Daucus carota OX=4039 GN=ARF1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 361.3 bits (926), Expect = 1.6e-98 Identity = 178/180 (98.89%), Postives = 179/180 (99.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LQC8 (ADP-ribosylation factor 2-A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARF2-A PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 361.3 bits (926), Expect = 1.6e-98 Identity = 178/180 (98.89%), Postives = 178/180 (98.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DH91 (ADP-ribosylation factor 2-B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARF2-B PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 361.3 bits (926), Expect = 1.6e-98 Identity = 178/180 (98.89%), Postives = 178/180 (98.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DCK9 (transcription factor MYB78 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019258 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 442.2 bits (1136), Expect = 2.6e-120 Identity = 219/269 (81.41%), Postives = 239/269 (88.85%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K5V3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G413890 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 441.8 bits (1135), Expect = 3.3e-120 Identity = 220/264 (83.33%), Postives = 234/264 (88.64%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BC50 (Transcription factor MYB108-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold670G00030 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 433.7 bits (1114), Expect = 9.1e-118 Identity = 216/264 (81.82%), Postives = 232/264 (87.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UUY5 (Transcription factor MYB108-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold339G00030 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 433.7 bits (1114), Expect = 9.1e-118 Identity = 216/264 (81.82%), Postives = 232/264 (87.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CEB9 (transcription factor MYB108-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500004 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 428.7 bits (1101), Expect = 2.9e-116 Identity = 215/264 (81.44%), Postives = 230/264 (87.12%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. NCBI nr
Match: XP_022151294.1 (transcription factor MYB78 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 442.2 bits (1136), Expect = 5.3e-120 Identity = 219/269 (81.41%), Postives = 239/269 (88.85%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. NCBI nr
Match: XP_004136147.2 (transcription factor MYB78 [Cucumis sativus] >KAE8646370.1 hypothetical protein Csa_016868 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 441.8 bits (1135), Expect = 6.9e-120 Identity = 220/264 (83.33%), Postives = 234/264 (88.64%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. NCBI nr
Match: XP_038899114.1 (transcription factor MYB78-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 439.5 bits (1129), Expect = 3.4e-119 Identity = 220/265 (83.02%), Postives = 233/265 (87.92%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. NCBI nr
Match: TYJ96893.1 (transcription factor MYB108-like protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 433.7 bits (1114), Expect = 1.9e-117 Identity = 216/264 (81.82%), Postives = 232/264 (87.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. NCBI nr
Match: KAA0058537.1 (transcription factor MYB108-like protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 433.7 bits (1114), Expect = 1.9e-117 Identity = 216/264 (81.82%), Postives = 232/264 (87.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. TAIR 10
Match: AT5G14670.1 (ADP-ribosylation factor A1B ) HSP 1 Score: 362.1 bits (928), Expect = 6.5e-100 Identity = 178/180 (98.89%), Postives = 179/180 (99.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. TAIR 10
Match: AT1G10630.1 (ADP-ribosylation factor A1F ) HSP 1 Score: 361.7 bits (927), Expect = 8.4e-100 Identity = 178/180 (98.89%), Postives = 179/180 (99.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. TAIR 10
Match: AT3G62290.1 (ADP-ribosylation factor A1E ) HSP 1 Score: 361.7 bits (927), Expect = 8.4e-100 Identity = 178/180 (98.89%), Postives = 179/180 (99.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. TAIR 10
Match: AT3G62290.2 (ADP-ribosylation factor A1E ) HSP 1 Score: 361.7 bits (927), Expect = 8.4e-100 Identity = 178/180 (98.89%), Postives = 179/180 (99.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy05g005050 vs. TAIR 10
Match: AT3G62290.3 (ADP-ribosylation factor A1E ) HSP 1 Score: 361.7 bits (927), Expect = 8.4e-100 Identity = 178/180 (98.89%), Postives = 179/180 (99.44%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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