Lcy03g011450 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy03g011450
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr03: 45396105 .. 45403837 (-)
RNA-Seq ExpressionLcy03g011450
SyntenyLcy03g011450
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGTGAAGATCAGACAACTACCAGATAGAGACGTAAGAAGGAGCCAAAGGCTTCTTGGAAGCTCAACAAGGCAACCGAAAAATAAATCGAAAGAGAACGAAATTGTTGCAATTTCTGAGGTATGATTGCCACTGTTTATTATATATATGTATGAATTTTAAATGCAATAATTATGCATTTTTCCAGAGTGAAAGTTCGGATAGCGTTGATTATCCGATGAACGTTGATAATAAAGAAACCCCTTCGAGATCCAACATTTTCAACCGAATGATTGAAAATGTTGGCAGGATGTTAAGTGCAATAACCCCAACCAAGAGACAACTTTTTGGGGATGAGGAAATGGTTGACGTTGAAGGAAAAAAGGTACATCCATTTGTTTTAAAAAAATTCTTTCAGCCCCAACATGAAATTTCCTTCTAACAATACAACAAATGCAGGATGATTTGGACATAGACGATGTGGATCCAATAGGGACTCAATTACAGACACAAATAGTGCCGTATGAACCAAATATACAGGTATTATTTGAAACATCCTGTATATAGAGTGTTAACTAAGAGAAATATTTGACTTATTTTTTTATTCAAAAATAGGAGGAATATGCCAAGGGTGAAGATGAGATGTCGAACACCTCAAACAAGACCGAGATTTTAGATGATAAAGATGAACATATGGAAGATGTTTGTGAAGGAAGACAAGAGGAAGATGAACACACCGAAGTAAGAGGCGGTGAAACAGACGAAGAGGATATTTCATACCCCTCTTTATATAATATTGCGGCCCTATACATGAAAAAATTTCAGGGTGATCAAAATTACCTACTATTCCTAATCGGGACATTATAGCCTCAACCAACAATTGAAACGTCAATCCTTGAGGCAACATTATCTCCGAAACTTGGAATTCAACGTAATTGTCACTATCATCCCATTTACCCCCATGAAGCATGCGGACGGGAATTAAGTTTGAACCTAATAAATGGTTAGAACAACTAATATGTTATCGAATGAAAAATATAATATTGTGGACAATATTGTGGTAATGAAAATAATGAGAAATAGAAGTTGATATTGAAAAGAAATTGAAACATAACAAGGATTAAAAACATGCGTTTTAAGATAGTAGGAGACATGAGTAAATCCGACAAAATGAAATCAAAGGAAAATAAATGAAGAATAACATACACATACTAGATGATGCAGCCATGAGAAAAAATTCAGAGTGCAAACGAAATCTGGAAAAAAAAACAGAAATATAGGGCAGATCGTGGTCTTCAAATACAGAGGAAAAGATGAAATTTGAATGAAAAATTGGTTGAAAATGGTGGCATACTGTGATAGCAAAATGGAGCCAAAATAAAAATTAGAAATTTCAAATATTTGGATGACAAATGGAATCAGCCGGTCAATTAATGGAAAATTGGAAATAAATTCCATTTTGGTACACATATAATTTTAAAAAATAAAAAATATTATAAGAATATTACAGAATATATATATTTGTGTGATTTCTTTAAAAATAAACCCTAAATCTTATTTTAGATATTACCAAAAGAGATGCATGCGTATTTTTTTTTAAAAAAAAAGAAAATCAACGGCAAATCTACCAAAATGGAATGATCATGGCTGCCGGCTACGCAATTAATTGATAATATATATATAATTATATATTTTTTTTAAAACAAAAACATTCCATCATTAAATAAGGGCTGCCGGATGCAAATGGAAAAAAAAAAATAATATGTAATATAATTATATAATTAAATAAGGGCAATTAGGGAAGAAAAAAATTGAAATAAATGCATGAAATCCTACAAATGAAAAAATCAAAAGATGAGGACAAAGATGTAATTAATAGGTTAATTGAACCCATCCGCTATAATTTCTGTTTTATATTTAATTGAAATTAATAATGGAATTCAAGAGGACCAAGGTTGGAATTTTAAAAGTTTCTAATTTACGCATTTGGTGTATATAAATGTAGCTCTCCTGCACCTCTTCTCACAACAATTTAACCCTTTTAAGAGAATGAGTTGCCCATGTACTAGCCTGGAGAATAGTGGAAAAGAAATCATTTGAAATATAATTGGAAGATTGATACCATACCAATTGATGATCAAGATCAAGCTTAGCTTAAGCTTCAAATTGCAAGTGACATTAAATTTGAGTATAGAAATATTTTCTTTAAAATGAAATGACATATCTTTTAGTATAGAAATATTTTATTTTCAAAATAAACAAAAAAAACTAATTTAAAAAATTATAGCATTTTTTTTTTAAAAAATTATAGCAATTATAGAAATATTTTCTTTAAAATGAAATGACATATCTTTTAGTATAGAAATATTTTATTTTCAAAATAAACAAAAAAAAACTAATTTAAAAAATTATAGCATTTTTTTTTAAAAAAAAAATTATAGCAATTAATTGACAATATATTTATTTGTTCAAATAATTATTTTGAATAATATTTCAACTAAAATATTCAATATTTTAAATATTTTAAAATTTATAAATACACGTGTTTGCACGTGGTAACACACTAGTGTAATAAAGAAAGCCTATTTATGAGTAATGAATATATTTTGCTATGAAAAATATACGGTTAAAATACCATTTTGGCTTATGTATTTTGGATTTAATTACATTCTAAAAAACTTAAAATTGGTCCCTACGTTAGTTTGAAGTTAATTTTTTGAAAATTAGTTAGATAATCATAATAATTTTCATGGAAGTAAAGACACAATGTGAACATATATTTTCAAAATTTATAGAGGGAAAACTAATAGAAACTTTTTCTTAATAGAAAAGTTAACGACAAATCAACGTCAAGGACCAATTTAAAGATTTGTGCAAAATACAAAGACTAAAATTGAACATTTGAAAGTACATGGACTAAAATGAAATGAAATCCAAAATACAAGTATCAAAATGGTAGATTTTGACCAAAATATAAAAAATTTCATTGTATTTATGTAACATAATGTTGTTTAAGAAGCTCATGTTGAGCTAACTAGTCATAGGATGAAAACCATGATTCATGGGTGTTAATATCAAACTAAGGGGCCAAAACGAGCTTAGCTCAGCGGTAATTGGCATGTACCCTCGACCATGAGGTCAGAGTTTCAAATCCCCCCACCCCCAAATGTTGATGTACTAAAAAAAAAATAATAATAATAATATCAAACTAAGGGTCCGTTTGGAATACATTTTGATTTAAAAAATTTTCAAGAATGCATTTTTTTTAAAAAATTGTTTAGAATTTAAACCCACATATGTTTGGTTGCATTTCTTCATAAGTGTTTTTATACACAAGTTATTGTATACTAAGGCTCTTTTTTAAAAAGTTGGTTTCAAGTGTTTCTCTCAAAATGGTTTATTTATCAATTTCATTTTCTAATAAGTCATTTTTAGTGGTTGCCAAACACTAGAAATTTTTTCAAAATGACTTTTTTTTTTCCAAAATTAAACACTTGAAAAGTTAAACCAAACACACCCTAATTCATGTCAATTGACATTATGCGAGAAAACCTTGCTACCGATAGAAAATACAATCACGCTAAAGTGAGCATAGCTCAACGGTAATTGGTATGTATCATCGACCAATAGGTCAAAGGTTCGAATCCCCCACCCCAAATGTTGTTGTACTCAAAAAGAAAAAAAAAAAAGATAGAAAATACATTCACTATATGCTTAGAAATAGTTTAAAGTTAATAACTGGATAAGTTAAGACGTCAAACTCTTTCAATGTCAAAATTGACTTGAATAACTTAAGTTGCTTTTGTAAAATTCACCTACTTAAGTAGATAGAAAAATAACAAAAGTGTCACAAGAGAGAGTAATCTGGAAAAGCTAAACTCCTGGAAAATACGTTTGTTTCACTCAAGTAAAATGTTCCACAAGAATACTACCTCTATTATGATTCTTCACATAAAAACATTCAAATAATTAGAGTAGCTTAACATCAGTCATTAGCTTTTTATCACCTGCCCCTCAATACGTCGCCAAGCTCAAACATTCTAGTTCCTCATAAAAATGTCAACTTTTGAATTGTGATATATAAAACATGCGTTTAAACTAATGACTCAATTTAACTCAATCTTATAATCAAATGTAAAGATCGATTGTATTTAAATATTGCCTAATTATATTTACTTTAGCTTCTAATTTCGTTTAGTCATTGTGTTATATGCTTATATTTTTTTTTTTTTTTTGAGGAGAATTATATGCTTATATTTGCAACTATGGAATTGAGTTGAAAATATTTATTTAACATATTATTAAAAAAAAAAAAATCAATTTGGGGTTGAAAAAGTGATGAAAATTGACCTGATCTTTACCTCAAAGAATATTGGACTAAAGAATGTTTCTTTGTAATGAAAAGAGAGAAAAAAGAAAAGAAAAAAAAAAAAAGGGGAAAATGTATGACTAAATTAATTATTAGTAACCATATCTTCTTCTCAATTCTCTTACCCCCGAGTATCAAGGCGCCAACCAATTATTAGCAGGCATAAGATTGGATTGACGTCAAATATTCCTTTCCTATTCCTTTCACTTTAAATTATAGGGAAAAAAAATCATTTTTAACCCTAAACTTTAGGGGTTGTATCGATTTTAACCCTGAACTTTTCATTTTATCAAATTGAACCTTAAACTTAGCAAGTCATATCAATTTTAACCATAAACTTTTAATTTCATTGAATTGAACCCCAAGCTTATCAGATTGTATCGATTTGAATCCCAAACTTGCATAAGTGTTTCAATGTTGACCTTTGATTAACTTTCCGTTTGAACCACCGTAATTGACTATTTCTTCCTTTTTTTTTTCTTAATTCACATCTCACTTGAATTGGTTTTTTATAAATAAAATATTGGAGAAATTTTATTTTAGATGACCTTTTCTTCTCGTTGAGAACTTTGTGAAGACTTTTTTGTTGCTGTCTAAGATTTCGAAAGCAAAACAACTTTGGAGGTTTTTTATCTTCAAATATTTGTTGGTT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mRNA sequence

ATGGTGAAGATCAGACAACTACCAGATAGAGACGTAAGAAGGAGCCAAAGGCTTCTTGGAAGCTCAACAAGGCAACCGAAAAATAAATCGAAAGAGAACGAAATTGTTGCAATTTCTGAGAGTGAAAGTTCGGATAGCGTTGATTATCCGATGAACGTTGATAATAAAGAAACCCCTTCGAGATCCAACATTTTCAACCGAATGATTGAAAATGTTGGCAGGATGTTAAGTGCAATAACCCCAACCAAGAGACAACTTTTTGGGGATGAGGAAATGGTTGACGTTGAAGGAAAAAAGGATGATTTGGACATAGACGATGTGGATCCAATAGGGACTCAATTACAGACACAAATAGTGCCGTATGAACCAAATATACAGGAGGAATATGCCAAGGGTGAAGATGAGATGTCGAACACCTCAAACAAGACCGAGATTTTAGATGATAAAGATGAACATATGGAAGATGTTTGTGAAGGAAGACAAGAGGAAGATGAACACACCGAAGTAAGAGGCGCAACTTCAATCCGATCTAACTCTCCGGGTCCGGTTCCGTTTCTCTCGGATGAGTTAGCGGCTGAGGAAGATCTTTTGAGGGGTTTCTATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGTGAAGATCAGACAACTACCAGATAGAGACGTAAGAAGGAGCCAAAGGCTTCTTGGAAGCTCAACAAGGCAACCGAAAAATAAATCGAAAGAGAACGAAATTGTTGCAATTTCTGAGAGTGAAAGTTCGGATAGCGTTGATTATCCGATGAACGTTGATAATAAAGAAACCCCTTCGAGATCCAACATTTTCAACCGAATGATTGAAAATGTTGGCAGGATGTTAAGTGCAATAACCCCAACCAAGAGACAACTTTTTGGGGATGAGGAAATGGTTGACGTTGAAGGAAAAAAGGATGATTTGGACATAGACGATGTGGATCCAATAGGGACTCAATTACAGACACAAATAGTGCCGTATGAACCAAATATACAGGAGGAATATGCCAAGGGTGAAGATGAGATGTCGAACACCTCAAACAAGACCGAGATTTTAGATGATAAAGATGAACATATGGAAGATGTTTGTGAAGGAAGACAAGAGGAAGATGAACACACCGAAGTAAGAGGCGCAACTTCAATCCGATCTAACTCTCCGGGTCCGGTTCCGTTTCTCTCGGATGAGTTAGCGGCTGAGGAAGATCTTTTGAGGGGTTTCTATTGA

Protein sequence

MVKIRQLPDRDVRRSQRLLGSSTRQPKNKSKENEIVAISESESSDSVDYPMNVDNKETPSRSNIFNRMIENVGRMLSAITPTKRQLFGDEEMVDVEGKKDDLDIDDVDPIGTQLQTQIVPYEPNIQEEYAKGEDEMSNTSNKTEILDDKDEHMEDVCEGRQEEDEHTEVRGATSIRSNSPGPVPFLSDELAAEEDLLRGFY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..59
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 131..186
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 39..59
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 131..171
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..17

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy03g011450.1Lcy03g011450.1mRNA