Lcy03g003440 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy03g003440
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr03: 14256584 .. 14261054 (+)
RNA-Seq ExpressionLcy03g003440
SyntenyLcy03g003440
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptide
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TTCTCTCCCTCCCTTCAGCCCTCTCACACGTAAGAACCCCATCCCCTGCGATTTTTCTTCAGCCGCCAGCCTCCCCCTTCAGCTTCTTCGTGCGCCGCCAGCCCTCCTCGTGGGTTCTCGTTCGCCAGCCTCTGTCACGTCGTTGCCGCACGTTCAACCTTCGTCTCCCTCTCCTTTCTTCATCCACGCGCGCGTAATAGGTAATTTTGACTATAGCAGCAACTTCCGCGTGCCATCTCCGACTCGTGTTGCAGTCTCTCTCTCTCTCTCGATTTTCTCCCTCTCTTTCATGCGCCACCATCCCTTTCGCGTTCTGTTTTGTCCGAGCAGCAAGACCCACACCTGAAGTCGCGAGTCCCTCTCTCCCTCTCGTCTCCAACAACCTTATACTCGCGGCCATCAACGATTGTTCGTGGTTGGCGTGATTTTCAGCTCTCCTTCAGCGTCGATAGGTGTTCTTGGTAAGTTCGCCTCAACCCACTCGTTTTTCTTCAAGTTTTAGTGTTTACCCACTTGAATTCGAACTCTGGATTATATCTAAATCATGACCCGCTCGTTAATAGTCTTATATTGCAGAATAAAGCTTGGTTTGAATGTTGTCCAGTGGCGTCTTGGGTTAAAATTGGTGTTCGGCCAATACCCATAGCCTGAAAGGTCACAATAAAAGTTACCCATAGCCTAAGAAGTTTGGGTTTGTGAATTCGAATCGTTTGGAGCATATTTCAGCAAGGATCCAGACCCTTTTCGGTAAGGTTCAACAACTCTTAGCATACTTAGCTCACTCTTGTTTCGTTTAGAGTGTTTTAAAGTATGTTAGATCAGTCTCTAATCCTTAGAAACTCTCTGTTTATAGATTCGAACTTCGTCGGATACTTTTCAGTAAGGACCCAAGTTTCCTTTGGTAAGTTCAAGGAGTTTAGGTGATTTTCGGTAAGTTTCCTCGCCCTTGGACCTTTGTAATTCAATGATGTTGCCTTTCGAATAGCCTATGACCCATGGGCTTGCTCTTAAGTTGAAGTTAAAACCTTACCCACTATCTGTAGGTGTTGGTTTTGTGTTTACCCATTCGTTATCGTCTTCATAGTGCAAGATTTAAGTATGTTGGGTTGCTGTTCAGCGAGCATCTGATCTCAAAGATCGTGTTCAGTGAATACCCACATCTCGAAAGGCCTTGATTTTGGTTACCCATAACCCGGTGACTTGGGATCTTGGTTGTTGGGTCGTTTCGAACACAAGTCAGCTTGTTCTCAAGGCTGTTTGAGGGCTGAACGATAAATTCTAGCACTCTCTATTTCCTTTATGAGTCGTTTAGGTGTTGTTAATTGGTTCCTAACCTTGGAGGGTCTTTACTTGTAGTTCGGGCTCCTTAGGCTCTTCCGGTTCGTCCTGTTGGTTTTTAGGTTCGCTTAGGAGCGCTTATTTGTAAGTAGTTCTTATCTGATGAAGTCTGTTTGACTGCGTGATGCATGTTGATTAATTACTCGCTTTATAACTGTTCTCATGTTTCTTGTTTCTTTGAATATATATGTTTATATATGAAATCTTTGAAAAGCATGAACTGTTGTTGCGTGATGGTTGGTTGTAAAGCATGTTGGTTCTGCTATGCATTCATGAGTGAGTCGAGAGCATGTGGTTTTATGTATATGCTTGGTGGGCATAGTACATGAGTCTAGAAGCATGTTGTAGGGCATATGCATTCTAGATAGATGTGAGATAGACGTCAGGGACCTAAAGTGTGAAAGAAAGGAATGTTGGGTGGATGTCAGTGCACCTCGGGTACAAATGGTCGAGGGGTGGCATGTCACCATTGGTTTAAGAGGAGCATCGAGGCCTTGGGTACAGATGGTCAAGGGTCGGTGTGATGAGTCTAGAAAGCAAGTGTTGGGCGCCTGGGGAAGGGCCAATAATTTGCTAAGTCATCGGTGCGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGGCGATGCACAGTTCGGGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGTCGAGCTCCGTAGAGAGCATTGTGGCCCTGGGTACAAATGGTCAGGGGACAGTGCGACTCGAAGGATCAGTCTTGGAGAGCCATGTGAGAGCTAAATATGAGCGTTGAGTGAGCTCGTGGAGCTTGAGTGGTTAGCGAGTTGCATAGAGAGATGCATGAGTTATGGCTTAGGAGAGTCATTCACTTTACTAGGTTGTGAGCATGTCGTTGTGTTTACCGCTTAAAAAAGCATGTTGTTTGCGCATGAAAAGCATGTTGTTTGCTTCGTTGTTGTTTGATGGCTTCTCAGGTAGGGGCTGCTTACCAGTACCTTAGTGTACTGACCCCCTCCCCTCTCTATCCCCCCAACTACCAGATTTTGCAGGTTATGAGGACTGCATGGACCATGGTGATGCAGAGGAGGCATATGAGGAAGGACCTTAGCTAGTTTGCGATGTTTTCCATTTTATTTTCATGTTGGATAGCTTGTTGTTTAACTTGGTTGGACAGCTGTTGTCCTGTTAGGTTTAGTTCTGATCATTCTTGTTAAACTCTAGGTCTAGTTGTCCTTGTTTTTAAAGAACCCTATCTATTCATTTAGTTGTTAATCATTAAGTTTGTTTCGAATGAATTGATGTTATAAGCTCTGTTAAAGTTGTGTTTCTGGTTAGTTAGTAGTTGATAATGCGAGGCCTGTCTGGCTATTGGTTCCGTGGAGTTCTGTTGTGCTGTAGTATGGTGGAGTCGTTGAATAATGTTATTTAGAAGTGTTTTGTGCTTAGCAGGTTAAAGAAAAATTTTGGGTTAGTCCTATGTGTGTCGTTATGCTGCCGAAATTTTCGGTGCACTCGGTTACTTTTGGTTTAAGAGTTAGTAATGTCATTAGGATAGTTATTAAAATCCTGGGGCGTTACACTTTTGGCTGAGTTTTCTGGGTTTTTATATTCTGTTCTTGCTGTCTTTTATGAGTTTTACATGTAATCTCGTTTAAACCAATGCATGAGATTGATTTCTTAGAATTGACGACCCTAGGAGATTACTTTTTGTGCATTCAATCAGTGATTTTTAGATAGCCACTAGGCCAAGACAAGTCCATCACTATAGAGTGTAGATTCTTGATAAGCCTAAGATGAATGTTAAAGGTTGTGTTAATTAGATCTAAATTTTATTTATATTTAGTTAACTCAATTTCGGACCCACGAGTTTAAAGCGGCTAATTTAAGTAAGCAATTGCGAGGTTTCGGATTGTTTATTTTAGATTAGTTAGACATAGCTTAGTAGTCATTGCGAGGTTTCGGATGGTTCATTATGTTATGCATGAGGGGTGGCGGTCGATCAAGCTAATTTAATTAATTATGTTAACTGTAGGGTTCTGGGTTAATTGGTTAATTAAACACAGGTTAGTGTAGGGGGGTCCTCCGAGTAACCAAGAAGTTAACCGAATTCATAAAAACTGCATTGAATTATTAATAGAGGAAACTAGGAAGCCAAGTAGCATAACATTCAAGCATAAGCAATCCGAATACAGTTATCCCTTTTTAATATTGAATTCTATGTCATTTCTTTTTATCGTATGTTTTCCTGCTTTGCCTTATTTACATTCAGTATTTTACTTCCTGTTGCACCTATCCATTCCAACCCCTCTGTTGTCTGAACACAAAATTCTGCATCTTCTAGATCCCCTTCCCTGTGTTCGACCCCGACCACTATTTCTACAAAATAGTTGTAGTGTCATGGATTATAAATTTATTTGACTCGGATCTTCGACAAGTCCCGTCAACTAGCACTAGAAATAGATGTCCAGTTGGCTTAGTCTTCTAAAGGCACCTACAGCGGAGCTGAATAGAAGTAGCACTTAACTCAAAATCTAGTTGTCAGGGCATTTGCGGGCGCAACTGGAGGATTCTATCTGCACCATGTCTATGTGGGCAACATAGATATTCTTCACCCGTTTGCAGTGCCTGAGTAAGTTGCGAGTGCAAAGGTGGGTGCAATCTGATTCTGTTGGGTGATACTATTTCAATTTTCCCGCTTATCTCATAAGTTTTTACCGTTTTCTTTTACTTGCTTATTTCTATTTTTATCCTCAAACAAAACCCCATTTAAAATATTTCTTTGGTTACCTCCCTCGGTTGTAAATTTAGAGGAGGTTCTTGTTTTTTAGAATCTTGTGTTTTTCAACTAGTCACAATCTCCCTTGGGTACGATATCCGGAATACTTTCCACTTTATTACTTGATAGTGTATACTTGCACTCGAGCAGTGTCATAGTGCACGCGACTCCCCAAATCAAGCACACGCCTTGCAGCATGTCACCATTTCCGATCCCACCCCACAACCGATGCAACGCTCGAGGCCCAAGAATGCCCACTACCGATTCAAGTGCAGCTCCCTTGGACCTCCAGCGCATGCCTCGGGGCGGAAGCCCAAGGCGACAGGCAACATTGCAACATCCCACACCCAACGAGGATTATGTCGTGCACTATGGCACCTGA

mRNA sequence

TTCTCTCCCTCCCTTCAGCCCTCTCACACGTAAGAACCCCATCCCCTGCGATTTTTCTTCAGCCGCCAGCCTCCCCCTTCAGCTTCTTCGTGCGCCGCCAGCCCTCCTCGTGGGTTCTCGTTCGCCAGCCTCTGTCACGTCGTTGCCGCACGTTCAACCTTCGTCTCCCTCTCCTTTCTTCATCCACGCGCGCGTAATAGGTAATTTTGACTATAGCAGCAACTTCCGCGTGCCATCTCCGACTCGTGTTGCAGTCTCTCTCTCTCTCTCGATTTTCTCCCTCTCTTTCATGCGCCACCATCCCTTTCGCGTTCTGTTTTGTCCGAGCAGCAAGACCCACACCTGAAGTCGCGAGTCCCTCTCTCCCTCTCGTCTCCAACAACCTTATACTCGCGGCCATCAACGATTGTTCGTGGTTGGCGTGATTTTCAGCTCTCCTTCAGCGTCGATAGGTGTTCTTGAATAAAGCTTGGTTTGAATGTTGTCCAGTGGCGTCTTGGGTTAAAATTGGTGTTCGGCCAATACCCATAGCCTGAAAGGTCACAATAAAAGTTACCCATAGCCTAAGAAGTTTGGGTTTGTGAATTCGAATCGTTTGGAGCATATTTCAGCAAGGATCCAGACCCTTTTCGATTCGAACTTCGTCGGATACTTTTCAGTAAGGACCCAAGTTTCCTTTGGTAAGTTCAAGGAGTTTAGGTGATTTTCGGTAAGTTTCCTCGCCCTTGGACCTTTGTAATTCAATGATGTTGCCTTTCGAATAGCCTATGACCCATGGGCTTGCTCTTAAGTTGAAGTTAAAACCTTACCCACTATCTGTAGGTGTTGGTTTTGTGTTTACCCATTCGTTATCGTCTTCATAGTGCAAGATTTAAGTATGTTGGGTTGCTGTTCAGCGAGCATCTGATCTCAAAGATCGTGTTCAGTGAATACCCACATCTCGAAAGGCCTTGATTTTGGTTACCCATAACCCGGTGACTTGGGATCTTGGTTGTTGGGTCGTTTCGAACACAAGTCAGCTTGTTCTCAAGGCTGTTTGAGGGCTGAACGATAAATTCTAGCACTCTCTATTTCCTTTATGAGTCGTTTAGGTGTTGTTAATTGGTTCCTAACCTTGGAGGGTCTTTACTTGTAGTTCGGGCTCCTTAGGCTCTTCCGGTTCGTCCTGTTGGTTTTTAGGTTCGCTTAGGAGCGCTTATTTGTAAGTAGTTCTTATCTGATGAAGTCTGTTTGACTGCGTGATGCATGTTGATTAATTACTCGCTTTATAACTGTTCTCATGTTTCTTGTTTCTTTGAATATATATGTTTATATATGAAATCTTTGAAAAGCATGAACTGTTGTTGCGTGATGGTTGGTTGTAAAGCATGTTGGTTCTGCTATGCATTCATGAGTGAGTCGAGAGCATGTGGTTTTATGTATATGCTTGGTGGGCATAGTACATGAGTCTAGAAGCATGTTGTAGGGCATATGCATTCTAGATAGATGTGAGATAGACGTCAGGGACCTAAAGTGTGAAAGAAAGGAATGTTGGGTGGATGTCAGTGCACCTCGGGTACAAATGGTCGAGGGGTGGCATGTCACCATTGGTTTAAGAGGAGCATCGAGGCCTTGGGTACAGATGGTCAAGGGTCGGTGTGATGAGTCTAGAAAGCAAGTGTTGGGCGCCTGGGGAAGGGCCAATAATTTGCTAAGTCATCGGTGCGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGGCGATGCACAGTTCGGGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGTCGAGCTCCGTAGAGAGCATTGTGGCCCTGGGTACAAATGGTCAGGGGACAGTGCGACTCGAAGGATCAGTCTTGGAGAGCCATCACACGCCTTGCAGCATGTCACCATTTCCGATCCCACCCCACAACCGATGCAACGCTCGAGGCCCAAGAATGCCCACTACCGATTCAAGTGCAGCTCCCTTGGACCTCCAGCGCATGCCTCGGGGCGGAAGCCCAAGGCGACAGGCAACATTGCAACATCCCACACCCAACGAGGATTATGTCGTGCACTATGGCACCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGTCGAGGGGTGGCATGTCACCATTGGTTTAAGAGGAGCATCGAGGCCTTGGGTACAGATGGTCAAGGGTCGGTGTGATGAGTCTAGAAAGCAAGTGTTGGGCGCCTGGGGAAGGGCCAATAATTTGCTAAGTCATCGGTGCGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGGCGATGCACAGTTCGGGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGTCGAGCTCCGTAGAGAGCATTGTGGCCCTGGGTACAAATGGTCAGGGGACAGTGCGACTCGAAGGATCAGTCTTGGAGAGCCATCACACGCCTTGCAGCATGTCACCATTTCCGATCCCACCCCACAACCGATGCAACGCTCGAGGCCCAAGAATGCCCACTACCGATTCAAGTGCAGCTCCCTTGGACCTCCAGCGCATGCCTCGGGGCGGAAGCCCAAGGCGACAGGCAACATTGCAACATCCCACACCCAACGAGGATTATGTCGTGCACTATGGCACCTGA

Protein sequence

MVEGWHVTIGLRGASRPWVQMVKGRCDESRKQVLGAWGRANNLLSHRCALGTNGQGAMHSSGPWVQMVKGRTSSSVESIVALGTNGQGTVRLEGSVLESHHTPCSMSPFPIPPHNRCNARGPRMPTTDSSAAPLDLQRMPRGGSPRRQATLQHPTPNEDYVVHYGT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 104..158

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy03g003440.1Lcy03g003440.1mRNA