Lcy03g003090 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview


Name	Lcy03g003090
Type	gene
Organism	Luffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
Description	Integrase catalytic domain-containing protein
Location	Chr03: 11902253 .. 11927635 (-)
RNA-Seq Expression	Lcy03g003090
Synteny	Lcy03g003090

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

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CTCGATATGAACAAGCCGAGTGTTCAATTTGAAGGATTTGGAATTCCCTAACTTCGTTAAAGGGGAAGCGTAATTGGGACCGTTTCGTAGTTAATTTTGTTTCCACCAAAATACCAATACATTGAAAAAAATTTAGAAAACTATTCTAAATCAATTATTAAGACTAAGCATACAACCTTAGAACTAATTCTAAAGGGGAGAAGCAAACATTTCCTTGTTGTCATCTCTGAAATATCAAGAACGTCTTTCTTGATTTCATAGAAACCAAGCGTCAACAATTGGGACACCACCAATTGATCTTCCCCGCTATGACTCTGAGATTAGGAACGTAGTTGTGGGACTACGTAATCTTGAATGGGAAAAACTCTAGAGAGAAAATTCTCCTTAGAGTTCTTGGGTTGAGAGAATATGAGAGGGAGGCAAGAATGACCTTATGGTGGCCATATGTTGTAGTACTTAAACCCTAGGTTTAGAGTTCTATTTATAGGAGAAAGGCCATGAATAAAATGTTCATTTAAAATCAATTATTTCCATAACTGATTTAATCTTTTCCATAATTAATCAATTCCATAACCAATCAATTCCATAATTGATTAATCTTTTCCATAAATGATTGATCACTTCCATAAGCGATTAAATCATTTCCATAAATGATTAATTACTTCCATAAGTGATTAATCATTTCCATAAGTGATAAATTTCCAATTAATTAATTCTTTAATTAATTAATCACCAATTAAATATCATATATTTAATTTCAGACCTTCTATTAGTTAATTAATTAATTACCCAATTAAATATCATATATTTAATTTCAGGCCTTCAATTAATTAATTCTGTAATATGAATCAAATTCATATTAAAATTCGAACTCCTTCAAATTCTCTTGTATCCTATAAATTTATTATGAATCAAATTCATATTAATATTTGAACTTCTTCAAATATTTATTTCTCTCATAATAATAAAGTTTAATCTCAAATTAGACTTTACATTTTATTGTATCACTATACATTATATTAATTTGTATCTCATACAATTAACTTAATTTCCAATATGAATTTGAACTATTCAAATTCTCTCAAGATATAATTGTTCCTAATTACTCTTTACGAGCTAGCAGGAGAACCTAATGGACCTACAGATCAGAAGCTCCAATGATATGAGGTTAACTAATTAAACTCATTAATCAGGTTAACCAATATTCATTAACGGTGGGTCATTCCACTAAAGACCCGCAGCTGAACTCTTCTCACTGTAGAACATTTATGTGTCCACGGATATAGACCTAAATCGGTAAGTCAATCCTTCACGAGTGTCCGTAATCAAAACTGGGTCAAATTACCGTTTTACCCCTGTGTTACATCTGTCTCCTTAAGTACCAGTGCTCCTCTAATGAACAACCTATTTATGGTCCAACCAATAAACAGAAAGTCCCTCTCGGGCCAGTGAGAGGGCGGGATCCCTTTGTTTAAGTCCCGGAGTCACCACTTAAGGGAACACTCATCTACTTCTCCTAGAAGTGGGAAGGAGTGAATTCCTTCTTGTGTTGTCATGTCCCCAGCCTCCCACTCGGTCTTGTCCCCAAAAAGGAAGGCATATTGAGTCGGCGTATTGGCCACTCTCACCCATGCTAATCAAAGGACAATCCCTCATGAGAAGGAGTTCATGACACAATCAGGATTAAGACTGAGTTACCTAGGTCATCCTATTAAAACAATAACCTAACTAGTTAACGGTGTTATATCTAGTGGTTTACTATTTCATGGTCCGGTCTTATGCAAACTCATTGCATAGGATACCCCCGTTTGCATGACTACTACATGGACGCTTTGGATCAATACGTCTGTATCAAATAAAAAGTGGGTCGTATCTCATAGTGTTACCAGGATAAGGTATCCAACCTTATCCTTGTACTATAGACCTTTTAGGTTGTTACTTGAACATCGATCCTCGTATGTCCCCACATATTAGTTCAAGTTACATACAAACAACCTTGGATCTTAGTTTATTGGATTTGGGTCAAATTGTGCAATATTTAACAATAACACTTTATTGTAGAAACTCAATAACACTTTATTGTAGAAACTCAATAACACTTTATTGAAATAAGTATACAATTTGTTTACAATCACTATCTACGAGTTTTAGGGCATAAATCCCAACACAATTGAAATTCCAGACACTTCAGCCCATGCATTAATATGCAGTGAAGAAGAAGAAAATTTAGAGCCCTTAACATATGAACAAGCTTTAAAATCAGAATATAAAGAGCAATGGCAGAAAGCAATGTGTGAAGAAATATCTTCCCTTGATAAGAACAACACCTGGGTTCTAGTAGAGAAGCCTGAAGAACACAAAATAGTAAAATGCAAGTGGCTATATAAACTGAAATCGAGTGTTAAAGGTGAGAATAAACCTAGATTTAAAGCTACATTAGAAGCTACAGGCTACACTCAATAATATGGTATTGATTACACAAAAAATTTCTCACCGGTTGTTAGATATTCCTCCATTCGAGTCCTTTTGTCTTTAGTTGCTCAATTTGATTTAGAATATGAGAAAATGGACGTTACAACTGCTTTTCTCCATGGGGAATTAGAGGAGGAAATCTATATGGAACAACCACTTGGTTTCGAAGTAAAAGGGAAAGAGCATTTAGTTTGTAGACTGTTAAAATCATTGTATGGATTAAAAAAATCCCCACAACAATGGTACAAGAGGTTCGACGGGTTTATTCAAAGTTATGGTTTCGAGAGAAGCTTGTTTGATAGTTGTGTTTACATTAAAAGGGAAAAAGGGATAGTTGTAGTATACTTACTGCTTTTTGTGGACGACATGTTAATAGCAGCCCAAGATATCAAAAAAATTGAGAAGTTGAAAATACAGCTTAAAAACGAGTTTGAGATGAAGGATATTGGCCCTGCAACCAAAATCCTAGGAATGAATATTCTTAGAGACCGACTGAATGGTACTGTTATTATTAACCAAACAGAATATCTTGAAAAAGTTGTTAAAAGATTCAACCTTGAAAATGCTAAAACTGTGCCAATACCTTTAGCACAACACTTCAGATTTTCTAAAAACCAGTCACCATCCAGTGAGGAAAAAAGAAAAGAAATGCAATAAATCCCTTACTCTAATGCAGTAGGAAGCCTCGTGTATGGGATGACTTGTACAAGACCAGATTTAGCATTTGCAATGAGTATCATAAGTCGATTCATGAGTGACCCTGGCAAACCTCATTGGGAAGCAGTCAAATGAGTTATAAGATATATAAAAGGAACTACAAATCAGGGGTTGATTTATTCGAGAGGGAGCTTAGATGATAGTGCCTTAATAGGATATGCAGATGCTGACTTTGCAGCTGATTTGGACAAAAGAAGGTCCACATCAGGCTATGTTTTTATGTTATTTCATAATGTTGTTAGTTGGAAGTCTCATTTAAAGTCAGTAACAGCTCTCTCCACTACCGAATCTGAGTATATATCATTGGCAGAAGCAGTAAAAGAAGGTACTTGGTTGAACGGTCTGATTAATGAAATGCTTGGTATTACTAATCTGTTTTCTGTTTTCAGTGATAGCCAAAGTGCAATAGCACTAGCAAAGAATCCCCAATACCAAGACAGATCGAAACATATTGATATCAGGTATCATTACCTGAGAGAGAAGACCCTGAATGATGAAGTTAAGCTACATAAAGTTGCATCAGTAAATAATTCAGCAGACCTTCTTACAAAGCCACTAACTGCTTCAAGGATGCAACATCTTCTAGACCTACTTAAGGTAGGTGTTGGCTAAATTCAGTTGATTATGAAGAAGAGAAGGTAGCAGCATTTCTAAAGAAACTTCGAGAGGTGTAACACGGCAAAGAGGGAGATTTGTGAAAGTTTTGCCAAGTCACACCTTCATTTTGTCCACGTAAGAAGAAGACTATTCAACCCTTCAGCTCAGCAGATATTTCCCAAGCTTCGTCAACACACTCTCTGTGTATTTGTTATATGGCCCCACCCTCTAAATTTCGTTGTAACAGAATGGGAATTATAAATATGTTGCATCTTTTCATTCTTCTGTATCGAGTGACTGGGGTGAGCAGAGAGTTTGTGAGTTGGGAAAATTCATCTGGGAAGAGAGGTTGTGTGTTAAGGGAGTGAATCTCCATTTTGTACTCTGTATTTGTGAACTCTTCTTCGTGGAAATAAGATCGATCAGCAGTTGCCTTCCTACAGTGGATGTAGACCATTGCAAAATGGTTGAACCACTATAATTGCTTTGTGTTTATTCTTCTCCCTCTTTGATTTGTGTTATGTTTTGGTTTAGATTTTCATCACAGTATTCACATGTCTTGAATTAAATAATACAATTTATTTTTATTTTTTTCTTTAAAAATGTATGTACTTTTCATTAGTCAATGATACACACAAGTAAAATTAGAAAATTAAAAATAATAAATAATCTTTTTCTTTGACAATTAATGGAAAACATAAAATATCTTATTAATCTATTTAGAAGGAAATGAGAGAGAAAAGAAGGAAATAAACGAAAAGAGAAAAAAGAATGGAAAAAATGATGAGAAAGTATTAAAAAAACCATGATGGAAGAGAGAGAAATGAGAGAGAGGAAGATGAAAGATAGATGTAGAAAGGAGGGGAAAGAAATATGAGATACGTGCATGAAACATTAACAAAAAAAAAAACATAAACAAAATTTTGAGAAATTACTTTTTGTAGTTTCTCAAATTTTGTTGTTTTTCTAGAAGCGTTTCTAAGAATTTAGAAAAAAAAAATGATTGGTTATTAAACATGTGTTTCCTAAAAAATGAGAAAAAGAAACTAAAAATAGGAAATAAAAATGTTATCAAACGAGCCTATAGCAATATGAGACCAAAATTTTAAATAGAGGCAACGAGATATATGGCTAAAATAAATAGGTGGGATTTGAAAAATAGCTAAAAAGGTTTCGAAACTAACTAAATGGCTAACGTGATTTTAATTAATAACTTCTTAATTGAAGAAGACAAAATGGCCCCTAACAACATGTCTAAGAACTTTCTACCGTTTAGATCAAATATTAGGAGAGAGAAATGCAACCAAAAAGTTGGAGATTTATTAGGAAGAGAGAGAAATACATGATTGCAACACCCTAACAACCTATTTTGAATTTCCTACGGCAAACTCTACCATCTTCCTAATAATGAAGAACTGGCTTTTGGAAAAAAATAAAACCAATACCCCTGTGCAGATAAACATATTATTCACAAAAACAAAAATGAAGAATGAGTACACTCAATTACACACCCATAGACGACAAATGGAATGACGGAATACACATAATACAACACTCAGTAACATATTTACATGGAATTACACCACCTGCTGTGTAA

mRNA sequence

ATGTTGAAGCCAGCTGATGCAGATGGTTCATGTCTTTCTGGTTCGTATCTCTCTGGTTCAGATGCAGACAAGCGATTGAATCCCCCTGATTTGGATGTGCAATTGTATCATTTGCATCATTCAATTACGTCGACTGCCACACTGGTAACACAACAGCTCATTGGTGCCAGTAACTACATCTCATGGAGTAAGGCAATGCGTATGGCTCTGTCTGGGAAGAACAAACTAGGTTTTGTTAATGGAGTCATCAAGAAGCCTACCAAGGGTAATCGTCTTGTTTCTTGGCAATGTAACAACGACATTATTGCCTCATGGATCATCAATTCAATCTCAAAGGAGATCGCTGCTAGTCTTATGTATACTGGGAGTGTCAAAGACATTTGGGATGAATTGAAGGAACGTTTATCGTCAGGTAGTTTCTTTAAATTCTCCGTTCTAGTCCAAATGTTAGTATCTTACAAAATACACAAATATGCATGTGAAAATAGTCATTTAAGCATCAAAACTAACGACAAATGGAATGACGGAATACACATAATACAACACTCAGTAACATATTTACATGGAATTACACCACCTGCTGTGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTTGAAGCCAGCTGATGCAGATGGTTCATGTCTTTCTGGTTCGTATCTCTCTGGTTCAGATGCAGACAAGCGATTGAATCCCCCTGATTTGGATGTGCAATTGTATCATTTGCATCATTCAATTACGTCGACTGCCACACTGGTAACACAACAGCTCATTGGTGCCAGTAACTACATCTCATGGAGTAAGGCAATGCGTATGGCTCTGTCTGGGAAGAACAAACTAGGTTTTGTTAATGGAGTCATCAAGAAGCCTACCAAGGGTAATCGTCTTGTTTCTTGGCAATGTAACAACGACATTATTGCCTCATGGATCATCAATTCAATCTCAAAGGAGATCGCTGCTAGTCTTATGTATACTGGGAGTGTCAAAGACATTTGGGATGAATTGAAGGAACGTTTATCGTCAGGTAGTTTCTTTAAATTCTCCGTTCTAGTCCAAATGTTAGTATCTTACAAAATACACAAATATGCATGTGAAAATAGTCATTTAAGCATCAAAACTAACGACAAATGGAATGACGGAATACACATAATACAACACTCAGTAACATATTTACATGGAATTACACCACCTGCTGTGTAA

Protein sequence

MLKPADADGSCLSGSYLSGSDADKRLNPPDLDVQLYHLHHSITSTATLVTQQLIGASNYISWSKAMRMALSGKNKLGFVNGVIKKPTKGNRLVSWQCNNDIIASWIINSISKEIAASLMYTGSVKDIWDELKERLSSGSFFKFSVLVQMLVSYKIHKYACENSHLSIKTNDKWNDGIHIIQHSVTYLHGITPPAV

Homology

[Close]

BLAST of Lcy03g003090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CXR2 (uncharacterized protein LOC111015239 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015239 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 151.0 bits (380), Expect = 5.2e-33
Identity = 79/147 (53.74%), Postives = 100/147 (68.03%), Query Frame = 0


Query: 23  DKRLNPPDLDVQLYHLHHSITSTATLVTQQLIGASNYISWSKAMRMALSGKNKLGFVNGV 82
           + +LNP       Y +HHS   T  LVTQQL+GASNY SW ++M +ALSGKNK+GF++G 
Sbjct: 22  ESQLNP-------YLIHHSTAPTTMLVTQQLLGASNYNSWCRSMLIALSGKNKVGFIDGT 81

Query: 83  IKKPTKGNRLVSWQCNNDIIASWIINSISKEIAASLMYTGSVKDIWDELKERLSSGSFFK 142
           IKKP  GN L +W+CNNDII SWIINS+SKEIAAS++YTGS KDIWDELKER       +
Sbjct: 82  IKKP-NGNLLAAWKCNNDIITSWIINSVSKEIAASIIYTGSAKDIWDELKERFQQSDAPR 141

Query: 143 FSVLVQMLVSYKIHKYACENSHLSIKT 170
              L + LV+      + E  +  +KT
Sbjct: 142 IFQLRKELVTTIQGTLSIEAYYTKLKT 160

[Close]

BLAST of Lcy03g003090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CN69 (uncharacterized protein LOC111012810 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012810 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 146.4 bits (368), Expect = 1.3e-31
Identity = 72/112 (64.29%), Postives = 88/112 (78.57%), Query Frame = 0


Query: 23  DKRLNPPDLDVQLYHLHHSITSTATLVTQQLIGASNYISWSKAMRMALSGKNKLGFVNGV 82
           + +LNP       Y +HHS   T  LVTQQL+GASNY SWS++M +ALSGKNK+GFV+G 
Sbjct: 33  ESQLNP-------YLIHHSTAPTTILVTQQLLGASNYNSWSRSMIIALSGKNKVGFVDGT 92

Query: 83  IKKPTKGNRLVSWQCNNDIIASWIINSISKEIAASLMYTGSVKDIWDELKER 135
           I+KP KGN L +W+C NDII SWI+NS+SKEIAAS +YTGS K+IWDELKER
Sbjct: 93  IQKP-KGNLLAAWKCINDIITSWILNSVSKEIAASFVYTGSAKEIWDELKER 136

[Close]

BLAST of Lcy03g003090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VE66 (Cysteine-rich RLK (Receptor-like protein kinase) 8 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold76G00250 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 145.6 bits (366), Expect = 2.2e-31
Identity = 75/169 (44.38%), Postives = 104/169 (61.54%), Query Frame = 0


Query: 1   MLKPADADGSCLSGSYLSGSDADKRLNPPDLDVQLYHLHHSITSTATLVTQQLIGASNYI 60
           M   +  +GS       + S  D +LNP       Y +HHS+  TA +VTQ L GA NY 
Sbjct: 1   MENQSSTNGSRFDPLTAANSQNDAQLNP-------YFIHHSLGPTAAIVTQPLTGAINYT 60

Query: 61  SWSKAMRMALSGKNKLGFVNGVIKKPTKGNRLVSWQCNNDIIASWIINSISKEIAASLMY 120
           SWS+AM MA+SG+NK GF+ G I+KP+ G  L +W CNNDI+ASWI+NS+SKEIAAS++Y
Sbjct: 61  SWSRAMLMAISGRNKAGFITGKIQKPSDGVLLDAWICNNDILASWILNSVSKEIAASIIY 120

Query: 121 TGSVKDIWDELKERLSSGSFFKFSVLVQMLVSYKIHKYACENSHLSIKT 170
            GS+K+IWDEL++R    +      L +  V+ +      E  +  +KT
Sbjct: 121 IGSIKEIWDELRQRFKQSNGPSIYQLRKEFVTLRQGNLTIETYYTKLKT 162

[Close]

BLAST of Lcy03g003090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C350 (UBN2_3 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold98G002490 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 4.3e-27
Identity = 67/109 (61.47%), Postives = 82/109 (75.23%), Query Frame = 0


Query: 17  LSGSDADKRLNPPDLDVQLYHLHHSITSTATLVTQQLIGASNYISWSKAMRMALSGKNKL 76
           ++ SD D  LNP       + LHHSI  T  LV+   IG++NY SWS+AM +ALSGKNK+
Sbjct: 18  ITSSDIDALLNP-------FMLHHSIIPTTNLVSTPQIGSNNYSSWSRAMMLALSGKNKV 77

Query: 77  GFVNGVIKKPTKGNRLVS-WQCNNDIIASWIINSISKEIAASLMYTGSV 125
           GF+ G IKKP++GN L+S W+CNND IASWIINSISKEIAASL+Y GSV
Sbjct: 78  GFITGTIKKPSEGNYLLSAWKCNNDAIASWIINSISKEIAASLVYNGSV 119

[Close]

BLAST of Lcy03g003090 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E5P0 (No apical meristem (NAM) protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold455G001460 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 122.5 bits (306), Expect = 2.0e-24
Identity = 56/88 (63.64%), Postives = 71/88 (80.68%), Query Frame = 0


Query: 36  YHLHHSITSTATLVTQQLIGASNYISWSKAMRMALSGKNKLGFVNGVIKKPTKGNRLVSW 95
           Y +HHS+  TA +V Q L GA NYISWS+AM MA+SG+NK GF+ G I+KP+ G  L +W
Sbjct: 23  YFIHHSLGPTAAIVMQPLTGAINYISWSRAMLMAISGRNKAGFITGKIQKPSDGVLLDAW 82

Query: 96  QCNNDIIASWIINSISKEIAASLMYTGS 124
            CNNDI+ASWI+NS+SKEIAAS++YTGS
Sbjct: 83  ICNNDILASWILNSVSKEIAASIIYTGS 110

[Close]

BLAST of Lcy03g003090 vs. NCBI nr
Match: XP_022145891.1 (uncharacterized protein LOC111015239 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 151.0 bits (380), Expect = 1.1e-32
Identity = 79/147 (53.74%), Postives = 100/147 (68.03%), Query Frame = 0


Query: 23  DKRLNPPDLDVQLYHLHHSITSTATLVTQQLIGASNYISWSKAMRMALSGKNKLGFVNGV 82
           + +LNP       Y +HHS   T  LVTQQL+GASNY SW ++M +ALSGKNK+GF++G 
Sbjct: 22  ESQLNP-------YLIHHSTAPTTMLVTQQLLGASNYNSWCRSMLIALSGKNKVGFIDGT 81

Query: 83  IKKPTKGNRLVSWQCNNDIIASWIINSISKEIAASLMYTGSVKDIWDELKERLSSGSFFK 142
           IKKP  GN L +W+CNNDII SWIINS+SKEIAAS++YTGS KDIWDELKER       +
Sbjct: 82  IKKP-NGNLLAAWKCNNDIITSWIINSVSKEIAASIIYTGSAKDIWDELKERFQQSDAPR 141

Query: 143 FSVLVQMLVSYKIHKYACENSHLSIKT 170
              L + LV+      + E  +  +KT
Sbjct: 142 IFQLRKELVTTIQGTLSIEAYYTKLKT 160

[Close]

BLAST of Lcy03g003090 vs. NCBI nr
Match: XP_022142771.1 (uncharacterized protein LOC111012810 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 146.4 bits (368), Expect = 2.6e-31
Identity = 72/112 (64.29%), Postives = 88/112 (78.57%), Query Frame = 0


Query: 23  DKRLNPPDLDVQLYHLHHSITSTATLVTQQLIGASNYISWSKAMRMALSGKNKLGFVNGV 82
           + +LNP       Y +HHS   T  LVTQQL+GASNY SWS++M +ALSGKNK+GFV+G 
Sbjct: 33  ESQLNP-------YLIHHSTAPTTILVTQQLLGASNYNSWSRSMIIALSGKNKVGFVDGT 92

Query: 83  IKKPTKGNRLVSWQCNNDIIASWIINSISKEIAASLMYTGSVKDIWDELKER 135
           I+KP KGN L +W+C NDII SWI+NS+SKEIAAS +YTGS K+IWDELKER
Sbjct: 93  IQKP-KGNLLAAWKCINDIITSWILNSVSKEIAASFVYTGSAKEIWDELKER 136

[Close]

BLAST of Lcy03g003090 vs. NCBI nr
Match: KAA0065480.1 (Cysteine-rich RLK (receptor-like protein kinase) 8 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK08721.1 Cysteine-rich RLK (receptor-like protein kinase) 8 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 145.6 bits (366), Expect = 4.5e-31
Identity = 75/169 (44.38%), Postives = 104/169 (61.54%), Query Frame = 0


Query: 1   MLKPADADGSCLSGSYLSGSDADKRLNPPDLDVQLYHLHHSITSTATLVTQQLIGASNYI 60
           M   +  +GS       + S  D +LNP       Y +HHS+  TA +VTQ L GA NY 
Sbjct: 1   MENQSSTNGSRFDPLTAANSQNDAQLNP-------YFIHHSLGPTAAIVTQPLTGAINYT 60

Query: 61  SWSKAMRMALSGKNKLGFVNGVIKKPTKGNRLVSWQCNNDIIASWIINSISKEIAASLMY 120
           SWS+AM MA+SG+NK GF+ G I+KP+ G  L +W CNNDI+ASWI+NS+SKEIAAS++Y
Sbjct: 61  SWSRAMLMAISGRNKAGFITGKIQKPSDGVLLDAWICNNDILASWILNSVSKEIAASIIY 120

Query: 121 TGSVKDIWDELKERLSSGSFFKFSVLVQMLVSYKIHKYACENSHLSIKT 170
            GS+K+IWDEL++R    +      L +  V+ +      E  +  +KT
Sbjct: 121 IGSIKEIWDELRQRFKQSNGPSIYQLRKEFVTLRQGNLTIETYYTKLKT 162

[Close]

BLAST of Lcy03g003090 vs. NCBI nr
Match: TYK05760.1 (UBN2_3 domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 8.8e-27
Identity = 67/109 (61.47%), Postives = 82/109 (75.23%), Query Frame = 0


Query: 17  LSGSDADKRLNPPDLDVQLYHLHHSITSTATLVTQQLIGASNYISWSKAMRMALSGKNKL 76
           ++ SD D  LNP       + LHHSI  T  LV+   IG++NY SWS+AM +ALSGKNK+
Sbjct: 18  ITSSDIDALLNP-------FMLHHSIIPTTNLVSTPQIGSNNYSSWSRAMMLALSGKNKV 77

Query: 77  GFVNGVIKKPTKGNRLVS-WQCNNDIIASWIINSISKEIAASLMYTGSV 125
           GF+ G IKKP++GN L+S W+CNND IASWIINSISKEIAASL+Y GSV
Sbjct: 78  GFITGTIKKPSEGNYLLSAWKCNNDAIASWIINSISKEIAASLVYNGSV 119

[Close]

BLAST of Lcy03g003090 vs. NCBI nr
Match: KAA0035612.1 (No apical meristem (NAM) protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK30930.1 No apical meristem (NAM) protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 122.5 bits (306), Expect = 4.1e-24
Identity = 56/88 (63.64%), Postives = 71/88 (80.68%), Query Frame = 0


Query: 36  YHLHHSITSTATLVTQQLIGASNYISWSKAMRMALSGKNKLGFVNGVIKKPTKGNRLVSW 95
           Y +HHS+  TA +V Q L GA NYISWS+AM MA+SG+NK GF+ G I+KP+ G  L +W
Sbjct: 23  YFIHHSLGPTAAIVMQPLTGAINYISWSRAMLMAISGRNKAGFITGKIQKPSDGVLLDAW 82

Query: 96  QCNNDIIASWIINSISKEIAASLMYTGS 124
            CNNDI+ASWI+NS+SKEIAAS++YTGS
Sbjct: 83  ICNNDILASWILNSVSKEIAASIIYTGS 110

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Lcy03g003090 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Lcy03g003090 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1CXR2	5.2e-33	53.74	uncharacterized protein LOC111015239 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015...	[more]
A0A6J1CN69	1.3e-31	64.29	uncharacterized protein LOC111012810 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012...	[more]
A0A5A7VE66	2.2e-31	44.38	Cysteine-rich RLK (Receptor-like protein kinase) 8 OS=Cucumis melo var. makuwa O...	[more]
A0A5D3C350	4.3e-27	61.47	UBN2_3 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676...	[more]
A0A5D3E5P0	2.0e-24	63.64	No apical meristem (NAM) protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676...	[more]

BLAST of Lcy03g003090 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_022145891.1	1.1e-32	53.74	uncharacterized protein LOC111015239 [Momordica charantia]	[more]
XP_022142771.1	2.6e-31	64.29	uncharacterized protein LOC111012810 [Momordica charantia]	[more]
KAA0065480.1	4.5e-31	44.38	Cysteine-rich RLK (receptor-like protein kinase) 8 [Cucumis melo var. makuwa] >T...	[more]
TYK05760.1	8.8e-27	61.47	UBN2_3 domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
KAA0035612.1	4.1e-24	63.64	No apical meristem (NAM) protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK30930.1 No apica...	[more]

BLAST of Lcy03g003090 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR029472	Retrotransposon Copia-like, N-terminal	PFAM	PF14244	Retrotran_gag_3	coord: 46..86 e-value: 9.2E-16 score: 57.4
None	No IPR available	PANTHER	PTHR37610	FAMILY NOT NAMED	coord: 32..153
None	No IPR available	PANTHER	PTHR37610:SF55	SUBFAMILY NOT NAMED	coord: 32..153

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Lcy03g003090.1	Lcy03g003090.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0044237	cellular metabolic process
cellular_component	GO:0016020	membrane
molecular_function	GO:0003676	nucleic acid binding
molecular_function	GO:0016740	transferase activity
molecular_function	GO:0008270	zinc ion binding