Lcy03g000690 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAAATGCAGTAGCCAGTAGCCACATAACGAAACTCCCCCTCTCCCTGCCACACACAGACGAGAACACAGTTCCATGGAAAGCTCCATGGCCTTGAAGTATCTCTCCCCTTCTCCTCCTCTTACACCTTCAGCCAGATTGAGCTTCTTCTCAACTAAGCTAAGAGGAACAAGACCCACTTCAGTTCCTCACTATCCTCTCGAATGGAAGTCAAAGCATTTCGTGTTTTCGCGAAAAATGGCGGTTAAAGCTTGTGTAAAGGTGGAGGAGACCAGTGTTCAGGAGAGCTCTTATAAGAGCGAATGGGGCAAGGTTTCTGCAGTGTTGTTTGACATGGATGGAGTGCTTTGCAATAGCGAGGACCTGTCTCGAAGGGCTGCGGTCGATGTTTTCAGCGAGTTGGGTGTTGAAGTCACCCCTGAAGACTTTGTGCCATTCATGGGGACTGGTAAGTTAAGATGAACAGGGTTTTTTTTTGGTTTTCTTTCGTTGGTTAAAGCTTACTTGGTTGATGATGAATGATAATTTCCATTAATACTTGTTTCAATTGTGAGCAGAAGTATGAGAATTGCTGACGAATTCTATTGTTTAGTTGGTTTGGCGTTGGGAGTTCGACTAATTTACTACAGCTGATCCATTATGACGTTAACATTAGAGAGCATGTTTGTTATTTTTTTTAATTTTTGTATTATTGAGTGTCGGAGCCAGCTTGCACGATACATTGACTATTCTACGGGGTATCTACGTGACCTAATATTTGATTGCAAAGAAACTCATAGGATATTAAATCCTTGGTAGGTGGCCACCATAACGTGGTATTCCCTATTTTTTTATTTTTTATTTTTTATTTTATTTTATTTTTTACAAGAAACAAAACTTCTCATTGAAACAATGAAAAGTGCTCAAGGAAAACAAACTCCTTGAAAAAAGACAAAATAGTATGCTATTGAACCCTTAATAAAGGTCCTTGTAGGCCATTAGGCCAACATTGGGAAAATTTTCTAGTACTACGGTAGTAGTAGATACTCCCTTCATTAAACATGTGACTCGTCATTTAATAATATAATATTTTATTCTATTGGTCCCACACCATTTTTAAATACTTCTTACATGACAAACAATGAATGGAGGTAGTAGGAAAAACTTTCTATACTATCGTAGTACTAGAAATTTTCCCCAGGGTGATTTATGAGAGTGTGCTATTTTTTTTTTTTGAAAAGGAAACAATCTTTTCATTGAAGAAATGAAAAGAGACTAATGCTCAAAATACAATGAAACAAAAGAAATAAGCGAAAAAACAGCCAACAAAAGAACAACAATAAAAAAACAACAAGATAAGGATAAGAACAGCCAATAAAAGATCAACATCCCAAATAAGGCAAAAATTCTGAATAGAGAAGGCTGAATAAATCTTAGACAACGGACTCCATAACGAAGCTTTGAGGCGATCTTCAATGGTGGTTGTAACTTTCTCTCATGAAGAAACATCCAGAATCTTGAGCAACAAACCTAAACTCTCCAATCTGAAGAGCTAAACTATCTCCACTTGGCCTTAACGGCAGGACTTCATGAGGGCCTTTTCATGCAATGAAGCACCTTTTGGAGAGCCCAACACCTCATTAAATTGATCTCTCTCACAAGAAATCTGTTTGGAGACTCTAGATTTATCAAACATCACATCCCATTCCATGGATATCAGAAATCTTGAAGAAATTCCACAATTTTCAGATTGCTCTCATCCCACAAAATCAGAAATCCTCCTGATCTTCCCCATGATTTCACATTAACCCAACCAACATCTTTAGAGCTCCATATAGATTTTATCAAACGTTGATCAAAAGATACAATTTTAGTCTCCTGAAGTAGTACCATATCAGGGTAATGCTGCTGCAGAAATTTTTCAATGCCACTCTCTTTGATCGATCCCCTAAGCCTCTAGTATTCCAAGAAATAGTCTTCATGGAATTTTTAAAAACGTGCCTCAACAATTCATTGTTTTCATCTTCTAGCATAGATGAAAATTTACTTGGAACAGATACTAAGGGTGTTGCTGAAACATCACAATCATTCAACTGAACTTCAGAAATATCTTCATTATTCTGGAAAATCCAATTAAAAGCCAGTGCAAAAGAATCTTCCTCCAACAATTCATTGTTTTCATCATTCAAATACTGATTTTCAGCCTCCACACTACTAATACTCACCACTGAATCATTATCAGAATCAATAGGAGATGAATATGATTGATCAACTTTGTTTTCAACTTTGGATGAAGGAATAAAAACTCCCTTTGTTAAAGAAGGGTCAGATTGAATGTTTGAAAGAATATACTGATTGGATGATGTGGAATTTGATAACTCATTAAGATTAGTTTGGCAGCATCTAGACTGATTCAAAGCAGGGAGCAAAGAATGAGAACAAGATTCTTCAATAACATCAGGGTTATAATTGGAATTAATGGGAATTGAGTCCAAAATTTCTGACTTTTCATATTTCCTTCGAGAATAATGAAGAGGAAATGATTCATATTTCTTCTTTAAAGCCTTAGGAACAAACGGTTCATTTGGTTCCAAGCCCACTGCATTACAGCACTTCAAACCCGAAGGAATGTCTTGAATAGGCGAGAATAATAAAACCTGGGACTCATGCAAAGCACCATCAGTAAATGCTTTGCTAATCTCTGAATTGATGCCATTAAAAACCTTACCGTTGGCATTAAAATCATTCTCCAGCAACAAAGCACTTTTCTCCTTTGAAAACTCAACCGGCCCAATGAAATTAACACTAACTTCTTCCATTAATGCTTCCTTGGAACGTGAAATCTCAGCCTTTTCCTTTGGTAACTCAACCGACTTTTCTAAATGTAAAACCTTAGGAACAATCGATTCATCTTCTACTACATTACAGCAATTCAAACCCAAAGGAAGGTCATGAATAGGCGTGGATAATAAATCTTGGGACTCATGCACAACACCATCAGAAAATGCTCCATTAAAATCTGAACAGATGGCATTATAAACCTTACCGTTGGCATTAAAATTCTTCTCCAGCAACAAAGCACTTTTCTTCTTTGAAAATTCAACCAGCCCAATTAAATGACAATTAACTTCTCCCATTAATGCTTCATTTGAACGTGAATAGTCAGCCTTTTCCTTTGGTAACTCAACCAACTTTTCTAAATTTAAACCTCCATCATTTAATATTTCTAATGAATCATTAATCATGCCGTTGGGAGCTTTAGAAGATGGAAAGTTTTCTTGATTTACCCGAGTTTGCAAGGCTGGAAAGTTTAATCCTTGATCATTGAAGGAATTAAGATCTTCTTGTGATGAGGAAAAACCTTCATCCATCAAAACCTGAGAAACCCTTTTTAAATCAATTTCATTATCAAAATCACTCAATGATAAGTCCATAGGAATAAAACATGAAGGGTCCAAAGAAGATATATCACCAAAACGAAGAGCAAAGTTTCCGTGAATCTTGTCCGTAACCACAATTTCAGCTGGTATAAATCCACAAAAATTCCTTTTCACCTCTATACGAGCTTCTGAACAATCCAAAAGATTCAATGTTTGAGAAGAAATGCTTACCAATCCCCCAAAGTGATGTCCAATGATTTAAAAAATGTAACGATTCCAAAATGGCAAAGGTAAGTTCTTCAAAGCTATCCAACCTCCATATCCTTCAATCACCTCGGGATGAAAATGCTTGTGACACGACCAATTTTCAATTTTCAAATGAAATTTTCCAATAAGTTTCCACTTGCCATCAAACTTCTTTTCAGAAAATTTATCATTCAGTTTAACCAAAGCTTTATCTGCCATAAAAGGGTTGAGAATAACTTCAGAATGAAAATAATCTTCCAAAACTTGCTTTACTTCCTTCCAAGCATTATGTGCAAACATTCTTGAAACCACACAAAATTCATCTAGCTTTAAATCCACCACTTCTTTTTCTTTTCTAACCCAGAATGAAGACATTACTGGAAATTTCTTAGAATGAGAACCAAGAAGAGGTTCCCCAGATTTAAACTTCACTTCATCATCAAAACTTCCATCCAAATTCTTATTAGCATTAAAAACCAGCTTGGATAATTCTTCATAACTGGACTTCTTTGAAATATTCTCAACAGATTTTTTTTCCCCAAATTTCAAAAGAAAGTCTCTTATCATTTCCCAAAATATTGACCAACCAATCTTTGTGTAACCAACCGGAACTTGCACTTTTTTCTTTCCACCCGAGGGGGGCCAAATAGAGCACTCAAGGAACCAACCTTGCTGGGAATTGAACTTTGATAACTGAATTGTTCCATTTGAATCTCATAACTTCTTGCGAAAGCACAAATGAACCGGGCATTGCAATAAATCGACTAAAGCTAGCTCAAGCCAATTCAAATGAGAACTAGAAAGATAAATCTTCTGCTTATACTTAAGATCTTCAATGAAAAATAAATCATTCTCATGCCAAATACAAAAATATGAATTTCGTATGCAGCAACTTTGGACTTCCAATCGCAAAATTTGAAATCTTAATAAAAATGGAAGACAAAAAGGACCAAAACTAACCGAACTTGAAGATACTAGGAGAAATGCTGGAGAATACTACCGAAGATTAGCTGGAAGATGAAGAACTTGATGGATGGGGGCTAGAAACAGGAATCATGGGAGGAGAGAGGGGAGAGCATTTGGGGGGGGGGGGGGGGGTTTATGAGAGTGTGCTATTGCCTTTGACCTCCCCAAAAATCGTGTTTATGGAGTCACTAAGCTCCAATGTTGCATCACATGATGGGGGAAAGTAGTGAAGCAATGTTGTTTAGAAGTGTGGTGCAATTTGGGGCTAAGTAGTTGGTTGATGGCCTGAGCCCTTAATATATAAATTTCAAGATGTCAAGTTTGCGAGTACCCATAGCTATGAAGAAACGAAAGGGTGTGCCAACATGGTAGAAGAATCTGAGCCTCTTAGATTTACCATTGCATATTCAGTTTCCAATGCATAA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MESSMALKYLSPSPPLTPSARLSFFSTKLRGTRPTSVPHYPLEWKSKHFVFSRKMAVKACVKVEETSVQESSYKSEWGKVSAVLFDMDGVLCNSEDLSRRAAVDVFSELGVEVTPEDFVPFMGTGEAKFLGGVASVKGVEGFSPEAAKKRFFEIYLEKYAKPDSGIGFPGALELITECKSKGLKVAVASSADRIKVDANLAAAGLPLSMFDAIVSADAFENLKPAPDIFIAASKLLNVSSDECIVIEDALAGVQAAQAAKMRCIAVKTTLSDETLKTAGPSLIRNDIGNITIHDILSGGSDAYNEKIQGPQFLQTSSQNSPQKYASGIDAAAVQDLDAANDGSLSFERLQGTRRDIVRYGSLGIAFSCLIFTVANWKAMQYASPKAIWNLLFGVNQPSFQNNASSGGRASERIQRFMEYISDIETRGTAPVVPEFPSKLDWLNTSPLQFRKDLKGKVVLLDFWTYCCINCMHVLPDLEYLEKKYNDKAFAVVGVHSAKFDNEKDLEAIRNAVLRYGITHPVVNDGDMFLWRELGINSWPTFAIVGPNGKLLAQISGEGRRKDLDDFVEAALLFYSGKNILDGSPLPLRLEKDNDPRLVTSPLKFPGKLAIDILNNRLFISDSNHNRIVVTDLSGNFLLQIGSTGEDGLRDGTFDDATFNRPQGLAYNAKKNLLYVADTENHALREVDFVKETVRTLAGDGTKGSDYEGGREGTSQLLNSPWDVCFEPINEKVYIAMAGQHQIWVHDTLNGVTKSFSGDGFERNLNGSSSTNTSFAQPSGLSLSPDLSEIYIADSESSSIRAVNLKTGGSRLLAGGDPIFSDNLFKFGDHDGVGSEVLLQHPLGVLCSKDSQIYIADSYNHKIKMLDPVSKKVITIAGTGKAGFKDGPALAAQLSEPSGITEAAGRLFIADTNNNIIRYLDLNNREEAQLLTLELKGVLPPNPKTRSPKRLRRRSPDTQTIIVDGGSFSEGNLSLKISLPEEYHFSKEARSKFSIETEPESALSIDPPDGYLSPEGFANLHFRRSSPVASLGRISCKVYYCKEDEVCLYKSLLFEVPFRQEVSETSQAEITLAFEVKPKTSTSSLPL Homology
BLAST of Lcy03g000690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VZ10 (Protein SUPPRESSOR OF QUENCHING 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SOQ1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1484.9 bits (3843), Expect = 0.0e+00 Identity = 757/1080 (70.09%), Postives = 889/1080 (82.31%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A4IF69 (NHL repeat-containing protein 2 OS=Bos taurus OX=9913 GN=NHLRC2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 457.6 bits (1176), Expect = 3.9e-127 Identity = 277/686 (40.38%), Postives = 390/686 (56.85%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8BZW8 (NHL repeat-containing protein 2 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Nhlrc2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 453.8 bits (1166), Expect = 5.7e-126 Identity = 275/688 (39.97%), Postives = 387/688 (56.25%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZI67 (NHL repeat-containing protein 2 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=NHLRC2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 449.9 bits (1156), Expect = 8.2e-125 Identity = 274/695 (39.42%), Postives = 390/695 (56.12%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8NBF2 (NHL repeat-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NHLRC2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 446.0 bits (1146), Expect = 1.2e-123 Identity = 267/686 (38.92%), Postives = 382/686 (55.69%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DYP0 (NHL repeat-containing protein 2 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025459 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2004.9 bits (5193), Expect = 0.0e+00 Identity = 1009/1086 (92.91%), Postives = 1043/1086 (96.04%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LY80 (Thioredoxin domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G555590 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1977.6 bits (5122), Expect = 0.0e+00 Identity = 989/1082 (91.40%), Postives = 1029/1082 (95.10%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BNT8 (NHL repeat-containing protein 2 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492110 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1964.5 bits (5088), Expect = 0.0e+00 Identity = 981/1082 (90.67%), Postives = 1028/1082 (95.01%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CJ86 (NHL repeat-containing protein 2 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold16G004510 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1964.5 bits (5088), Expect = 0.0e+00 Identity = 981/1082 (90.67%), Postives = 1028/1082 (95.01%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HXU6 (protein SUPPRESSOR OF QUENCHING 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467844 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1962.6 bits (5083), Expect = 0.0e+00 Identity = 983/1086 (90.52%), Postives = 1030/1086 (94.84%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. NCBI nr
Match: XP_038878874.1 (protein SUPPRESSOR OF QUENCHING 1, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2006.1 bits (5196), Expect = 0.0e+00 Identity = 1005/1086 (92.54%), Postives = 1040/1086 (95.76%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. NCBI nr
Match: XP_022159017.1 (NHL repeat-containing protein 2 isoform X1 [Momordica charantia] >XP_022159024.1 NHL repeat-containing protein 2 isoform X1 [Momordica charantia] >XP_022159025.1 NHL repeat-containing protein 2 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2004.9 bits (5193), Expect = 0.0e+00 Identity = 1009/1086 (92.91%), Postives = 1043/1086 (96.04%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. NCBI nr
Match: XP_011659368.1 (protein SUPPRESSOR OF QUENCHING 1, chloroplastic [Cucumis sativus] >KGN65974.1 hypothetical protein Csa_007270 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1977.6 bits (5122), Expect = 0.0e+00 Identity = 989/1082 (91.40%), Postives = 1029/1082 (95.10%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. NCBI nr
Match: XP_008450538.1 (PREDICTED: NHL repeat-containing protein 2 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_016901002.1 PREDICTED: NHL repeat-containing protein 2 isoform X1 [Cucumis melo] >TYK10299.1 NHL repeat-containing protein 2 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1964.5 bits (5088), Expect = 0.0e+00 Identity = 981/1082 (90.67%), Postives = 1028/1082 (95.01%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. NCBI nr
Match: XP_022968665.1 (protein SUPPRESSOR OF QUENCHING 1, chloroplastic isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1962.6 bits (5083), Expect = 0.0e+00 Identity = 983/1086 (90.52%), Postives = 1030/1086 (94.84%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. TAIR 10
Match: AT1G56500.1 (haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein ) HSP 1 Score: 1484.9 bits (3843), Expect = 0.0e+00 Identity = 757/1080 (70.09%), Postives = 889/1080 (82.31%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. TAIR 10
Match: AT3G07060.1 (NHL domain-containing protein ) HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 2.3e-13 Identity = 36/95 (37.89%), Postives = 57/95 (60.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. TAIR 10
Match: AT4G21470.1 (riboflavin kinase/FMN hydrolase ) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 5.1e-13 Identity = 59/206 (28.64%), Postives = 95/206 (46.12%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. TAIR 10
Match: AT4G39970.1 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein ) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 5.1e-13 Identity = 70/246 (28.46%), Postives = 111/246 (45.12%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g000690 vs. TAIR 10
Match: AT2G38740.1 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein ) HSP 1 Score: 64.7 bits (156), Expect = 5.3e-10 Identity = 58/217 (26.73%), Postives = 102/217 (47.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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