Lcy02g008420 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview
NameLcy02g008420
Typegene
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr02: 12862807 .. 12868355 (+)
RNA-Seq ExpressionLcy02g008420
SyntenyLcy02g008420
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGTCGCGTAACTCTCCCCTATTGGCATTTGTGGGCCTCGACCTCGACCTCCTAAGGGTCGGCCTCAGCCCCTTGCATGCTGGTTCTGTCATTGTCACTGAGACCTTCAACATCATCATTCTTGAGCGTTTTTCGACTCAGCTAAGGTCATTCCATAAGTCGAGTGCCTTGGAGAGTATAGGTTGTTCCACTCTTCCAAAGACATTTTATCAGTCGAGTGCCTTGAGGTAGTTGAGAGTATGGGTGTCTCAACTCCGCCAAGAACACTTTGTTGGCTCAGCTACTTGGGCTTTCTACATGTCATGTCTCCTTGTAAAATAACGTTAGTGGATGTAATCATATGTAGATGAGAAAACATGGAAAAAAGACTAACCAATGATTGAAAATGTAAGTCTGTTGTGAGTAGCTTGCAAATTATGAATAGTTTGCATAAAATAAATAAAAAGAAACACATAAGGTAAAAAAATGTATCAGAATTCGTAATTACGAATTGAGTAATAACATATTGACATTTAACAAATAGGAGTAGGTAGAGAACATACCCGGAATGTTAAGCTTATAAAGCGATAAAGACTTTCATGATCTATCTTCAACCAATTTGAATTTCTCACCCCATATTGTTGAACTCAAAATTAGAAATAAATAAATAAAAACTTTGTAACATTAATAGTCGGACATTTACGAAGATGTCATAGAACATTTTTTGTGCAAGTAAGTAACTAACTTGCTTTATATAGTCAACTTAATTTCCACTTTTGATTTAGTCCAAGTAATTTCATAATTTTCAATTTGAAGTATAGATTAAATCTATATATATATAATAACAACAAATCTCTAATAATATAATATAAAAATAATGAGTCTGAAGTGTCAAACCAAATATATGAATACTCAATCTTTTTTAACATACCCACACTCAAACTAACAATTTTGATTTGGACGATTAGTTAACTAATTTTTCTTGAAAATCTAGAATCAAATTAGAATCAAATCTCATGTGATCAAATCTTTTCACTATTATTTTACAATAATTCTATGAAGAAATCTCAGTACATCTATTTTAAATGTTAGCACCTCAGTACCAATTTACTCAACCAGAAAGCATTTTGAAAATTTAGAAACTTACATCCTTTCTCCTTGTTGTAGCATCCAAGTGGCCATTAATCCATATAACAAATTTTCAGTTAAATATCTTAAGCCTCAAATTCCCATAATGAAATTAATCGCAAATGCATGTTCCTCCTATCTCTGAATAACCATAAAAACAAAATAAAACAAAAAGAAACTTCTAGTACCTGTTCGTCAACCTTCATGTGCTTTGAAAACAGTTTGACGGCATGACATTCTTGAGTTAGTGATCGTAAACATTTTTGTGCATAAAGAGTCTTAAGAATGCATAAAAAATAACTCCCTTTTTTTTTGTAGATGCTGAACACAATGTCGATGGTGTCTGAAACAAGGTTGTCGTTGCCTTTGCTCTTTCGGCGGCACTCAAGTGGCGAAATAAGAAACTTGACATCAATTTCTAGCAGCCTTTTGTCGGCGTTCGTTATAGCTCCATATGACAGAAGATATCGATGGCGACAAACTTTCCTGGTGGTGTTAGTGGTGTACTCAACATGGGTATCTTCCTTTGAATTTGCCTTCAAGAAAGTGGCAGCTGGCTCTCTTTTACCCGTTGACTTGCTGGTGGATACATTCTTTGTCCTTGATATTGTGTTGACCTTCTTCGTGGCTCACCTGGATAAAATCACCTATCTCCTTGTTGATGATTACAAGAAGATAGTTGTACGTTACCTTACAAGCCTATTGATTCCCACACACGGTGCCAACTATTGATGTCAAAATTTGGGCAGGGAAACTCACCCGACATTCACGTGACAACAATGGTGAATTTATTTGAAGGGAAAATACGTGACCTGCAAAACAAGAGAAAACTGTACGCACCACACCGACTTCGATGCTTAAGTCAGTTGGGAGTTCATGAGTGAAGCAAGTAAATTAACAATGATCGGGGAAGACTAAAAATAAGAATACACACCTAGTTGAGTCCCCCTACCTTAGGGTTAGCTTCTACTCTTTATAATTGAATTAGGGTTTTCCCCTTCCTTTTAGGAGAGGGAAAATCCTAGAGATTGATTTGGTCCCGATGGGTCTCCTTGAGCTTGTTTCTACTTTGAACTTTTATCATTATGACATTCTTAGAATTAGGTCAAAATTCACCCATAACATATATAAAACTTAATTGGATTCTAACTACAAACTTACCCAACTAAAATTAGTACAATAAATAATATTTAATCTTATACTTAGTCATATAAAATAGTATTTCATGTAAAAATTGGTAATATTCAAGATAAATAAAATATTCATGATATTCAATTGAAACTTGTTTATAAAAATAAAATAGGGGCAGTTGCATAGATGACAAATTGGACCAAATTAACAGCAAATATAGCACAGTTGCAAACTAATTGCAAATATAGCAAAATTAATTGTACAAGACCAAAAAGCTGTTGTCGGATTCTATCCGTGTCTATCACTGATAGACTCTGATTATTCAAAGTATATCAGTGTCTATCGTTGATAGACTTCGATTAATCAAAGTCTATCAATGATAGTCACTGATAGACATTGATAGATTTTGATTAACCAGAGTTTTCAGTGATAGACACTGATAGACTCTGAATAATCGGAGTCTATCAGTAGATTGATAGATTCTGATTAATCAGAGTCTATCGCTGATAAACTCTGATAATCGAAGTCTATCAGATAGACTCCGATAGATTTTTCTATATTTGCAATTTTTTTTACATAGTACTATATTTGCTATTAATTTGGTCCAATTTGTCACCCACTGCAATTTTCCAATAAAAGATGTACATGATCGTTTTAAAAAGCCTACCCAATATATTTTGTTTTTAAGTTAACAGTTTTTTAAACAATTAAGTTAAACCATTTGAAATACAAAATATAAATAACAATTTCAATTGTGAATTTGACAAAATGAGCATAACTCAACGGTAATTAACATGTATTACTTCCTAGTAGGAACTCTAGCTTAACCATAAGGTTTAGTATTCTCAATTTTAAGATTTCAAGCCAATGAAACAAACAAGTCCTAATATGTCACTATTTTTTTTCTTTTTAAAATTAAGAACTTCATTAAAGGCTAACCACCAAAAGAACCGTTTTCAACAAGCTAAGGCTACAAAAAATTATCCATTTTCCCAATCTCCCGAAGAGAAACAAAATCCAAACTACACGTATGCCTTGCAACGCAGTGAGCTACTGAATTGGAGGGTCTACAACAATGCAATAATCAACTACGTACTGCTAATCGAGAGACATGACCGACGATAATTAACTGTTGCTAAACCCTAAACCCTAAAATGTCACTATTATGGCAAGTAATAAATGAAATTCCATACTAAAAATCCTTCCCGCCAGGAACGTTAGCTAGAGTTGGTTTGTGTTTTAATAAATTGGATGAGTGGCATATTAATGGATTAATTGCTTGCATGTGTTCGGGATTTACCACAATAAATGAACAAAAATGATGCAACTAATGCAATTGATAACAACATTATCCATCCAATACAACTCAGAAGCGAAGTGAGAGCGATCGATTTTATGACTGAAAACTTTGGTATTTTCCAAAAATGAATCTTCACTCTCTAAGCTTTTCTGCAGAGATATGACGAAAAAGGAGATTAATAAATAATAATGATAATTTTCCCTTTTCAGAAGAAAAAAAAAATAATGATAATTTTGGAGCGGAGGCCTCTCGCCGGCCGGGTCCCATCTCCTTTTACTACATCATCGATCATCAATCATCATGATAATTTTTCTTTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAAACGTTTGAATTTGAATTCCGTGGCCTCCCTCTCTAAATTTTATCGATTTGAACCATGAACTTAAATATATGTTGCAATTTTTTACCATTATATCCTAATTTTAACCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCACTAATTTAATGAAAATTAAGTTTTTGCACCAAATTAGTTTTGATATGACACAAATTCACTATTGAATAACTCCAATAAAATTTTTAAATTTCAATAAAAATATAACTCTTATATCATTTTTGTCCAGATTCTATTAGGGGGTGTTTGGGGGAAGGGTTTAGGTTTTGGAAGTGGGGGTTTAGGAAATAGGGTGATTTGTGAAATCTGTGGGTTTTGAAAGTCTGTGTTTGGAGTGCTGATTTCTGAGGTCTGATTTAGGAAGTCTGTGTTTGGGGTGCTGATTTCTGAAGTCTGAGTTTATAATTATTTTTTTTATTGTTTTTTTTTTAATTTTATACAATTTTTTTCAAATTTAATGAATCAAAATGTTCTTTCCATTAATTGTAAAATTGAGGTTTTTTTGTCACAATTTTGATTAAAAATCCAAAAAAAAAAAAAATCATAACATTTGACCCCATAAGTAGTCTTCAAGATTGAAATTCTTGTTGTATTTAAAGAAAAAAAAATATTGTTATATTAGAACAAAAATCGAAATTAACCTAAAATTGGTTACATTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAAGCCAAACTTTGAAAAAATGATTTTTTTTTTTCCAAATGAACCATCTCTTTGAAAATTAATAACACTCATTTTAGTTTTTAATTATCTTTGACCTAGAAAACTAGATTTCTTCCAAATTGATTAAATTTATTTTTTTTCTTTTAATTAATTATTATATAAAATATTGTTTTTTTAAATATTAAATTTTAATTTAAATAATAAAGGGAAAAATACACTTTTAGTCCCTAGGGTTTGAGTTAGGTTTCATTTTGGTCCCTGAGTTTTCAAACTCAACAATTTAGTCCCCAAGGTTTGATTTTAGTTGCATTTCAATCCCTCCATCCATTTTTCCGTTAAAAACTAACGGGTGGATGACCTGACAATATTTTTTTATTTTAAAAAAT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mRNA sequence

ATGTCGCGTAACTCTCCCCTATTGGCATTTGTGGGCCTCGACCTCGACCTCCTAAGGGTCGGCCTCAGCCCCTTGCATGCTGGTTCTGTCATTGTCACTGAGACCTTCAACATCATCATTCTTGAGCGTTTTTCGACTCAGCTAAGGTCATTCCATAAGTCGAGTGCCTTGGAGAGTATAGGTTGTTCCACTCTTCCAAAGACATTTTATCAGTCGAGTGCCTTGAGATCCCGACGGCGACTCGTTTCAGACCCCGATTCAGATCTGGAGCTTCTTGCTCGTGCGAGGACGAGCGACGACCACTCGTTTCAGACTGATTTTTCCTTCGAATCCACAAGCGGCGTGAACAAACGCGAGGACGGGCGGAGGCGTGAAGAAAAGTGTGTAGATCCGGGCAGGCGTGCGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTCGCGTAACTCTCCCCTATTGGCATTTGTGGGCCTCGACCTCGACCTCCTAAGGGTCGGCCTCAGCCCCTTGCATGCTGGTTCTGTCATTGTCACTGAGACCTTCAACATCATCATTCTTGAGCGTTTTTCGACTCAGCTAAGGTCATTCCATAAGTCGAGTGCCTTGGAGAGTATAGGTTGTTCCACTCTTCCAAAGACATTTTATCAGTCGAGTGCCTTGAGATCCCGACGGCGACTCGTTTCAGACCCCGATTCAGATCTGGAGCTTCTTGCTCGTGCGAGGACGAGCGACGACCACTCGTTTCAGACTGATTTTTCCTTCGAATCCACAAGCGGCGTGAACAAACGCGAGGACGGGCGGAGGCGTGAAGAAAAGTGTGTAGATCCGGGCAGGCGTGCGTGA

Protein sequence

MSRNSPLLAFVGLDLDLLRVGLSPLHAGSVIVTETFNIIILERFSTQLRSFHKSSALESIGCSTLPKTFYQSSALRSRRRLVSDPDSDLELLARARTSDDHSFQTDFSFESTSGVNKREDGRRREEKCVDPGRRA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 113..135
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 99..135

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lcy02g008420.1Lcy02g008420.1mRNA