Lcy02g005360 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCCTCTTGCTCCTCAAATGGAGGCAACAAGAAAAGAGCTGGAAGATAAAAATAATGATCAGATGGCTATGGCGGTTGAGGACGAAGCTCCGGTGAGGCTCCGACGAAGGCCGATTTTTCGAAGAAAATGGACAACTCTAGACAAACGTTCTGCTGGTGCTCTTTTGGTTATGCATTTGCTTTGTCTCTTGGCTCCATTTCAGTTCACCTGGCCAGCCTTCTGGCTTGCCTTTGTACTCTATATTATCACAGGCCTGTTCGGTTTGACGCTCTCGTACCACCGACACCTCACGCACAAGAGTTTCAAGCTTCCCAAATGGCTTGAATATACATTTGCTTATATCGGAGTCCATACTCTTCAGGTTTTAATTATTTTGGTGTTTACCGTTCTCATTTTTTTCTTTGTGATTTTTTTAAAGCATTTCTTTCGGTATTATAGGGTGATCCGATCGACTGGGTGAGTACACATAGATATCACCATCAGTTTGTCGATACTGAAAGAGATCCACACACTCCGACACAAGGCTTTTGGTTTGGACACATCGCTTGGATATTTGATTCTTATGGTTTGACTAAAAAGGTTTCCCCAAAACACGTTCAAGATTTCGACGAAAGAGATAAAACACGAATTCGTTTCAAAAATATTTTTGTGGGATATTTGAAGTATGGAAGACCAAACAATGTGGAAGATTTACAGAAGCAGGCTTTTTATAGGTTTCTTCGAAAAACATACATTCTTCATCACGTTGCTCTTGCAATTGTCCTCTATGCAGTCGGAGGGCTTCCCTTCCTCGTTTGGGGAATGGTAAGATATATATATTTTTTCTGGTAGAATATGTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTCTTATATGTAATTTATGAGAAATTTTTAGGTGTTTCCGGTGCAATGAGGTCCGTAGTTTTGCACCGTTGGATGTAAGAGAGAAATAGCAAAAGAATTTCGATTTTGTATCTAATGGTTATTAGGGGCAGACAAATTTGAAGATTTACATCTGACGATTTTAAGGAGACCTCATTGCACTGAAAACACCTAATAATTTTTCTGTAATTTAGGGTTAAAAGATGTTTCATACGTGGGTTTGTTAAACCTGGTTACAATTAGTTTTCTTAGGGCCGTTTAGAATACCTTTTAGTTTAAGTGTTTTTCAAGAATGCATTTTTTTAAAAACATTTTGTATCAAAATTGTTTAGAATTTAAACACACACATATGTTTAGTTACATTTTCTCATAAGTGTTTTTATACACAAGTTATTATATACTTCAAAATTCTTTTTAAAAAATTTGTTTTCAAGTGCTTCTCTCAACATGGTTTGTTTCTCAATCTCATTTTTTAATAAGTCATTTTTAGTAGTTGTGAAACACTACAATTTTTTTTCAAAATGATATTTAACACTTGAAAAGTTAAACCAAACCTACAAAATTATGATCACAAATTGCATAAACTCAAGTTTATGAAACCTCCTTTTTATATATAGTACACAGTAACTTATAGGAACCATGAATTCACAAACCAGTTATATTAGTTTTATGTGTTTTTATAATTTTTTTAAACATCCAAATACAAGTTGCACAAAATTCAAGATTTTTAATCTCATGTGTTTGTAAAATAAAATCTTAGTATAATCTCATACTAAAACATCATCCTTGGATATATATATATATATACATATCATTAGGGTAGAAACAAATCCAGTATATAGATAAAATATAGTAGCTAAAAACATTGTAGATATAGAAAAAGTTAAAAAAAAAAAAAAAGTAAATAATCGAGATTAGTCATCAATTTATATGAATTGTTGACTATAACATAAGTTTAAAACATATTCCGAACGAACATAGTTCAATTGACATACCTCTTGTACTACTGATCAAGAAGACTGTAGTGTGTATATATATAGATTGCTATTGATTAAATTCAAAATAATGGTTCATCAATGCTTCTTTAAAAACTCATCCCTCATTATCGTATATATATTTTTTTGTATATTTATTTAGTTTTTATTCCAACAACATACCTCTGACATTTTGGTCAAGAATATTAACACTTTTACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATTCATGTATAAATTGAATCTAACATAGGAATTAATTATGCTTTTTTTTTTTTTTTCCTAAAATATCAAAGAAGAATTCAAGCCTTAAATGGAAATTTTGGTTATTATCGTCACAAGAATTTTTGAAAGGACACTGAAGAAAACGAAGGCTAATGGTTTGAGTTTTGATTGAATAAATGCAGGGCGTGAGAACTGTATGCTTTCAACATGTCACTTTCGCTGTAAACTCTTTAGGCCACATGTGGGGAAACCAACAATGGAACACTGGGGATCAGTCAAGAAACAACTGGTCATACTCCATGTCTCTTTCATTTTTACATTACAAGTTTCGACTTCAATATATCCTGTTCAATTCTTGTCGACATGTCGATATTTTCATTCACACATTTTCTATCGATATTTAAAACCTCGTAACCGTTGGCTGATGAAGTGGTTCCTTTTTAGGGTATTGGCGTTGCTTATATTTGGGGAGGGGTGGCATAACAACCACCATGCGTTCGAGTATTCAGCTCGACATGGCCTCGAATGGTGGCAATTCGACGTAACTTGGTGGGTTATTTTGTTTCTTGAAGCTCTAGGGTTAGCAACGGATTTGAAATTACCCTCTCAAAATCACATGCAGAAGTTGGCCATTCAACCTAAATGCGAGTGATATCATTCATAAATGTGTTGAATCTCTCTCAAATTTTCTTTGTTTTTGTTTCTCAATTGTGATAAGAACCTTATCGTTTGTTCGATATTGAAGGCTTAGTTTCATGTTTTTTTAACGAGTGTGAAGAATATGTACTTTATATATTGTATACTGGATCCGAAATGGGATACTTGGCTTTAAATATAGTGTGTGAAATATTTATCATTGTTAGAAAAGTGTCTAATTGATTAAATAATGCTGTTTTATAGATTTTTTTTGGGTGTTTGTTTTGTTGATGAAAGGATAGGACTGGGTAGACTTTTTGTTCGGGAACTCGTCGTTCTTTCTCATATTTTTCGACGAACAATATTTGGTTGTAGGGACGATCTCCTACACACCCCATTAAAATCTTGACAACTAAGAGAGAGAAAGGTAGAGTGATAAATTAAATCTAAACTTCCTCATGTTTAACCTATGTAGCACACTAGCTAGGAGAGTTTAGCCTTGATGTATTGAAAACATAAGCCCATATCCCAAAAACAAAAGTTAATGAGGGCATTGGCCTATCTTAAGTTTGGGGGGTGCTTTATTTTAAAAAGTTGTTATTCTGTTGTAAGTTTGCTGCTGAAAGAATATGTGCTCTCAAAAGTCATTTGAAAAAAAAAAAATAAAAAACCGAGAGTTACTCCTCATTCCTAGAGTTTATTGAGTAACTAGGGGCATTCATGACACCCATGGTTTGCTACTGCATGAAAGCTAGGTTAACTTAGGGAAGTGAGTATTAATATGAGTTTGTGATATGTGCTCGTAGCTAGATATCTTCACCACAAAGTGTCAATAAGCTAGAACGAAGGTAAAGGTGACAACAGGATTCTCTTGGGGAAAAAAGAAAATGAAGTTGAATAAAAGGAACCCTAGCAGTCAAACAAGTTTGGGGGAGATAGAAAAGAAAAGGAAACACTCATTTATGCTCATTTACCTCAAGATAGTTTTCTTAACTAAAAAGGACTACACTAAGCTCTATGAATAGGAGTTAGGTAGTTTAAGCATATTGGTTAGGATGGACTAGGGAGAGTTTTGCTTTGAAAAAGAAAAATAGAAATCCTCATGCCTAGAAGACTTAGAAATTGTGATTGACACTAGAGTAGAAACCTCTCCTGAAAGGCAACTTTTTAGAAAACGATCTTGAGAAGCATGTTTACTTGATTTCATATAAATTATTTCCAAAATTCTGATTTGCAATTATATATATTTGATCTCTAACATTCTGATTTTCTATTGCTTGAGGACAAGCAATGAGTTAAGTTTGGGGGTATGATAAAGTGTAAAAAATATACCTATTTTGCCCCTTATTCGTAGCTTATTTCCTATGAAACTTGTATGTTTTTTGATCAAATTAACTATTCCCAAGCCTAAAAAGTGTAAAAGTTTGTAAGTTGAGTCTTAGAGAGTCATGTTTGTTAAATTATGCATTTTTGTGCTTAAATAAACTGATTTGATATGAATTTAACCTATTTTTGCATGTTGCAGGAGAAATAGAGAAAAACAGGGAAACAATAAAAATGCAACCACATTTCAGCCAAGGCTAAATGAAATTTGACTGCATTTCTGGGTAGAAACAGAAAAATCCGAGTCCGTCGCAGGGGTCATTTTGAACGAGCTTTTCACACACCTAACCGACTGTTTTGACTACGAAACTGACTAGGTTACCTGCAAGCACCATTTTCGTGACTCCTCAACGACTCCTCACTTTAATAAAAGGCCACAAATCGAAGGCAAATGCAAGCAGAACTCACTAGGAGAAGAGGGTGGTGACAGAACCCTAGTTCACGCCCATGAGTTATGATGCCCGCAGTCATTGCTAGAAGACCAAATTCTAACCTTAGTTAGACATCAAACCTTCGTGTTTGTAAAGATTTCACCCTATTTCCACCTTGTATAAGGAGAGTAGAGTGTCGTGAGAACTCTAGAGGGATTGGATAAAGAAAAAGATCCTAATTTTAGCTACTGCACATTAGTTTCCAACACCTTTTTCTTTTCATTATTTCTTGTATTTACCATTTATTTATTCAATGAAAATTTAATCATGCTTAGCTAAATTCCATTGAGGGATTCGGTTTAGTGAATTCTCTTGTGGATGGAGTAGCTTGAAAGTATGTTTGTTTACTTATACTTTGTTTATGCATGTCATCCTTTATTGATTGTCATTTTATCTTGTTAAGTTTAACTTGATCACTTAGACTTAGCATGTAATGTGAGTTCGGTACCGAAAG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BLAST of Lcy02g005360 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q949X0 (Palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ADS3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 391.0 bits (1003), Expect = 1.4e-107 Identity = 179/302 (59.27%), Postives = 219/302 (72.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DOW2 (Acyl-CoA C20 Delta5-desaturase OS=Anemone leveillei OX=212809 GN=AL10 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 357.5 bits (916), Expect = 1.8e-97 Identity = 164/316 (51.90%), Postives = 218/316 (68.99%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FV68 (Icosanoyl-CoA 5-desaturase (Fragment) OS=Limnanthes douglasii OX=28973 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 355.9 bits (912), Expect = 5.1e-97 Identity = 172/325 (52.92%), Postives = 216/325 (66.46%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O65797 (Delta-9 acyl-lipid desaturase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ADS1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 351.7 bits (901), Expect = 9.7e-96 Identity = 165/330 (50.00%), Postives = 222/330 (67.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DOW3 (Acyl-CoA 5-desaturase AL21 OS=Anemone leveillei OX=212809 GN=AL21 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 348.2 bits (892), Expect = 1.1e-94 Identity = 163/316 (51.58%), Postives = 216/316 (68.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DKS5 (acyl-CoA C20 Delta5-desaturase-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020979 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 657.5 bits (1695), Expect = 3.0e-185 Identity = 305/347 (87.90%), Postives = 324/347 (93.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KTM4 (Delta-9 fatty acid desaturase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G006150 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 648.3 bits (1671), Expect = 1.8e-182 Identity = 296/341 (86.80%), Postives = 318/341 (93.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TMC1 (Delta-9 acyl-lipid desaturase 1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold655G001850 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 646.7 bits (1667), Expect = 5.4e-182 Identity = 298/341 (87.39%), Postives = 315/341 (92.38%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BYV7 (delta-9 acyl-lipid desaturase 1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494690 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 646.7 bits (1667), Expect = 5.4e-182 Identity = 298/341 (87.39%), Postives = 315/341 (92.38%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KE40 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111493021 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 644.8 bits (1662), Expect = 2.0e-181 Identity = 294/341 (86.22%), Postives = 319/341 (93.55%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. NCBI nr
Match: XP_038903942.1 (acyl-CoA C20 Delta5-desaturase-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 658.3 bits (1697), Expect = 3.7e-185 Identity = 306/348 (87.93%), Postives = 322/348 (92.53%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. NCBI nr
Match: XP_022153481.1 (acyl-CoA C20 Delta5-desaturase-like isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 657.5 bits (1695), Expect = 6.3e-185 Identity = 305/347 (87.90%), Postives = 324/347 (93.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. NCBI nr
Match: XP_011652981.1 (delta-9 acyl-lipid desaturase 1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 648.3 bits (1671), Expect = 3.8e-182 Identity = 296/341 (86.80%), Postives = 318/341 (93.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. NCBI nr
Match: XP_008454215.1 (PREDICTED: delta-9 acyl-lipid desaturase 1-like [Cucumis melo] >KAA0044452.1 delta-9 acyl-lipid desaturase 1-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK29579.1 delta-9 acyl-lipid desaturase 1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 646.7 bits (1667), Expect = 1.1e-181 Identity = 298/341 (87.39%), Postives = 315/341 (92.38%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. NCBI nr
Match: XP_022998354.1 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 644.8 bits (1662), Expect = 4.2e-181 Identity = 294/341 (86.22%), Postives = 319/341 (93.55%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. TAIR 10
Match: AT3G15850.1 (fatty acid desaturase 5 ) HSP 1 Score: 391.0 bits (1003), Expect = 1.0e-108 Identity = 179/302 (59.27%), Postives = 219/302 (72.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. TAIR 10
Match: AT1G06080.1 (delta 9 desaturase 1 ) HSP 1 Score: 351.7 bits (901), Expect = 6.9e-97 Identity = 165/330 (50.00%), Postives = 222/330 (67.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. TAIR 10
Match: AT3G15870.1 (Fatty acid desaturase family protein ) HSP 1 Score: 337.8 bits (865), Expect = 1.0e-92 Identity = 158/314 (50.32%), Postives = 206/314 (65.61%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. TAIR 10
Match: AT2G31360.1 (16:0delta9 desaturase 2 ) HSP 1 Score: 334.7 bits (857), Expect = 8.7e-92 Identity = 159/330 (48.18%), Postives = 207/330 (62.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy02g005360 vs. TAIR 10
Match: AT1G06100.1 (Fatty acid desaturase family protein ) HSP 1 Score: 328.2 bits (840), Expect = 8.1e-90 Identity = 160/312 (51.28%), Postives = 203/312 (65.06%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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