Lag0038010 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTATAGTCAAAACCCCTCATTTTTATCTCCCTTAGGAGCAGAAGCTGCGGCGGTACTCGAAGGTCTTCGACTTGCTAAAAATATGAGTTTTGATCAAGTAATGTTGCTTTCAGACTGCCTTGGGTTAATCTCCATGATTAATGGAGAAACGGAGACTGATATGGAAATCCAATCTTCCATTTGGGATATTAAAGAACTTTGCTCTCGGTTTTGTAGGGTGGAGTTCGTATATATTCTCATAGAGATCATAATAGGATTGCTCATAGATTAGCCCGTCAGAGCCTTTTGTCTTCCCCAATGTTATGGTTGGATGTTTTCTCGATTTGGATTCAAAATTTGACTCTCATTGAGAAGTCATTGTTTGTATCCCTTGTGGGACCCTCTATTGATTTAATGATATCTTTCCCTTTTATGTCAAAAATAAAATAAAATAAAATAAGTTTCGAAACTTTGGCTGGTTTTTTTTTTAGTTGAACAATATTTGAAGGTGGGGAATTCGAACTTTTGACCTCTTGGTCAATGATACATGTCAATTATCATCGAACTATCTTGCTTTTGGCTTCATGTCTAAACTAATTGAGTTATGTTATTTCTTTTAAATTACTTTCAATACATTGATTTATTGTCTTTTTATAATTCCAGAAAAATGAAAATATGATATTAAATTATGGGCTAAATTATAAAAATATCATTGAATTATGAAATTTGTTTAAAAAATACTCTTGAACTTTAAAAAGTTTCAAAAGTACTCCTAAACATTAAAAGAAATGTTCAAAAATACCTTTACCGTTTAAGTTTTGGATTGAAAAGTATCGGTTTTATTAATACTCTTAATTTTCAAAAAATAAAAAATAAAAAATACCCTTGTTGGAAAATGTTTTTTTTTTTTTCATTCTCTCTCTAGAGATTGCTCCTCCATGAAAATTATGCCAAGGATTGTTTAGAAACGTTATGTGTAACACAACACCAAATATGGTTTGATATTGATTTTTTTTAAAGTAAATAAGATAAGTAAGAGAAAAAAACATATATATTTTTTTTCTTTTTACTTTTTGTTTGTGTATGTTAGTGATAAGTAGAAATGTCAGAAGCTAAAGTGAGCTTAGCTCAGCGATAATTGGCATATACCCTCGACCATGTGGTCAGAGGTTCGAATCCCCCTACCTCCAAATGTTGATGTACTAAAAAAAATAGAAATGTTAGAAGATTTAACATTTTCCATCTAAAATTTAACGGTATTTTTTAAACAAACACCGTAGTTCAAGAGTATTCTTTATAATTTAGCCTAAATCATGTGATTTCGAAATTATGAGATGAGGATATAAAGGGGTGCTTGCACATATGTTAAAAAAATATAATCAATTGCAAATATAGTAATAACACATGGATTTGTTTTTTTGATATCCGTGAGTGTCCAGGTCATCCTACACGCACCTCGACTAATCTCACGGTATAACACCCTACTACATTTGGTTGCCAAAGAAACTCGTAGGATATGAATTTGTAAATTTAGAAGGACAAAAACTAATTATGGACAATAGTTTTGAAACTAGCCAATTTTCTTCTTCATCACACTATTTCAACCTCACATGTTTAGTATAGATTCACATCTATAGATCTACCAGTGATAGATGTATCTTATTAATAGACGGTCTTTTATTCTATCAGTTGTATATATAAATAAATAGAGAATTACGTTAACCTATCTAAATAGGTGTGCGATTTAGAAAGAAAAAAAAAAACAATTTTATAAAACCATAATTTTGTTATATTGTGAATAGAAATCTATTGATTTTCTTCTATTTTAGATTTTTTATCATGTTTGGAACGATTTTTTTTAATGATTGTAGTTAAATTTCTTTGTTTTGATGTTTGCAGTAAAAGGAAAAACACTGAGACATCTACCCCAAATAACATAAAATAAATATTTTGAATCCAACGAGTCATTGAAATTTAAAAATGTCTACTCGAGCTTTTTTAAAATCCACACACGTATATTGTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTGTGCATACGTACTTATATGCTTTTGACTTCTCAATTTTGTGTTTAGCTAAAAGATTAAATGTTCAAATCACCCCACTCTCAATTGTTGTTAGAACTAAAAAAAGGTCCATGAATTTTATGAAAAATGTCTAACCTTTTAAACAAAAAAATTAGAAGTTCAAAGATTTATCATAATAAAACTGAAAGTTCGTGGATCTATATTATAACAAAATCGATAGTTTAGAGATGTATTAGACATTTTTTTAGAGTTTAACAATTTATCCAAAACAGTTTTGAAAGTTTAGGAACTAATTAAACTTGTAATTTCCTTCAAATAAAATAAAATAAATAAATAAACTTGTAATTTAACCAATATATTATCAGTTTGTCCCATCGCGATTTCTAAATCCACCATTGACAACAACATTAAGCAATTGAAAATATATATTTAAAAAAAATTGCACTCCTATTTATATAGTTTTAAATAACTTCGTGATAGGCCTACATCTTCCGATATATCAATGGTAAACATCTATCATTAATAGATTAAATCTATCACTCATTTGTTATGAAGTCTATAATCATTTTGATTAAAAAAAAACCATAATCAATTTACTATGTTAATGGATTAAACATGAAAAATGTACGACATTTAACTTTGATTTTATATCAATAATGGTTTGCATACTCATTTTCTATTATATCTATCATCATATCAATATAATAAAAATGGAAATATAAGTTATATTTAGATTTATTTTCTATCCATAATTGTTATGCATGTTCATTTTTCTATTACACCTATTACACCTATCATATATATCATTGTCATACTATATCAATACAATAAAAAAAGGTATGTAAGTTTTTTTTTTTTTAAAAAAGAAAAAAGTATGTAAGTTGTATTTGGTTTTTTTTAATCAATAATTGCTTGCTTGCTTATTTAGGCATTTTACACCTATAAATTTATCAAAAGATAAGCATAAATCACTAATAGACTTAAAAAAAATATAGAAGTGATAGACATACAAATATATTGTTAACACCATTATTGATAGATGTTTATTAATGATGTTGATGCCAAAATCCGGACAGGGAACTCACCTGGCCTTCACGTGACATCGACAGTGAATTTGTAGAAGCTGGGGAAGACGTGACCTGCAAGACCAGCAAGAATCGCTGGACACCGGTGTGGTGTAGGCCACACCGCCTCCGATGCCTAAGTCAGGAAACTAAGCAGCTAGAGAGTAGAGAAAGAAGTCAAGAATAGAGTTTTCCGGCCCCCTTCTTCGATGGCGAAGAGAGGTATAAATACCTGCTCGGACTCCTAGGGTTTGGAGGCGTTCTGGGACGAAGCAGGCTGGACCGAGGCAGCTGGAAGCGGTAGGGGCCGAGCGGAGGCAAACGGACTCGGCCTTGGGCCGAGGCCGACCGTACGGGTCGGGCCACGTTGGCCCAGCCCGTCGGTATGGTCTCCCTCTGGGTCCTTTTCCTGGTCCTATCTCCTCCCGGTTATCTCGTCAGCTCCTCGTACGCTGTGGTGGTCCAAAATTACCTATTACAAATGACATACAATTAAATTGATACATAAATGATATATTGTTGACGTACTATAGAAATGAATTATCATTCATATACTATGAAAATGATACGTGAATGATATATACAGATAAAAAGAAAATTATGGATAGGTGTTCAAAATTTTTCGAAAATTGTTATATTTGCGGAATCATTATCCAATTGCCATATTTGCAAATAAATATGATTAGGACGGAAGTTTCATTTTCTTTATTATTATGGAAAATTGCAGTTGGTGACAAATTGGATCAAATTAATAGCAAATATAGCACCATATAAAAAAATTGCAAATATAACAAAATATATCAGAGTCTATCGGATAGACTTCGATTATCAGAGTTTATCAGGGATAGACTCTGATTAATCAGATCTACTAGTCTACTGATAGACTCCGATTATTCAGAGTCTATCTGTGTCTATCGCTGATAAACTTTGGTTAATCAAAAATCTATCAATGATAGTCACTGGTAGATTTTGATTAATCTAAGTCTATCAGTGATAGACACTGCTATACTTTGAATAATCAGAGTCTATCAGTGATAGACACAGATAGGATTTGACAACAACTTTTTGGTATTGTATAATTAATTTTACTATATTTGCTATTAATTGGTCCAATTTGTCATCTATACAACTGTCCCTGTTATTATTATTGAGTTCAACAGCACTTGAGGGCGGAGAGATTCAAATCTCTGACATCTTGATTAATGTACATGCCAATTAACAATGAGCTATACTCGCTTTGTTTTCATTTTATTTATTCAACAAATTGAATATCTAGACTTTTAATCAAAGAAATAATATCTTACTGAGTCAAGCACAACAAAATATATAGATAAGCCAAAGCGAGCCTAGCTCAGCAATGATTGACATATATCTTCGATCAAGAGGTTAGACGTTCGAATCCCAAAAGTTCAGGTTCATGTATAAAAAAAAAAAAACCAAAATATATGGATAAATGGTCGTGATATATATATAAAATTTGAAAAGTGATAAATATATCATATTTTTGTCATATGATGAATTGAACAACACTTTTATAATTCCCACATTTTTCATTATGGTGCACTCGGGCCGAGCCAGCTGATGCTGTAGAGAAACGCCTTCGTCAGAGACGGGACACTTCTCTTTACCAAAAGGACGCAAATTCCTGGACCTTCACCTTCTCGCTCCATCTCTCTCTTTCTTCATCTTTCTTCAAGAGTGAGCCTGTGGAGTAGATTTTCATTTTTGCAGCCATGATTTCCTCCACCAAGCTCAAATCTGTAGATTTCTACAGGTCAGATAGATCTCTCTCTTTCTCTCTGCCTTCCCCATTTCTTCCTTCCCACTTTGCATTTCGTAATTCCAGGGGACTCTCTGTTTTTCGAACACCCAGTTGCGCGATATGTCGTGCAGTGCC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Homology
BLAST of Lag0038010 vs. NCBI nr
Match: XP_031744753.1 (uncharacterized protein LOC101212255 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 736.1 bits (1899), Expect = 4.2e-208 Identity = 402/690 (58.26%), Postives = 450/690 (65.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. NCBI nr
Match: XP_031744754.1 (uncharacterized protein LOC101212255 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 729.9 bits (1883), Expect = 3.0e-206 Identity = 365/510 (71.57%), Postives = 408/510 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. NCBI nr
Match: XP_031744758.1 (uncharacterized protein LOC101212255 isoform X5 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 729.9 bits (1883), Expect = 3.0e-206 Identity = 365/510 (71.57%), Postives = 408/510 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. NCBI nr
Match: XP_031744755.1 (uncharacterized protein LOC101212255 isoform X3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 729.9 bits (1883), Expect = 3.0e-206 Identity = 365/510 (71.57%), Postives = 408/510 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. NCBI nr
Match: XP_031744756.1 (uncharacterized protein LOC101212255 isoform X4 [Cucumis sativus] >XP_031744757.1 uncharacterized protein LOC101212255 isoform X4 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 729.9 bits (1883), Expect = 3.0e-206 Identity = 365/510 (71.57%), Postives = 408/510 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q69SA9 (Protein disulfide isomerase-like 5-4 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=PDIL5-4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 348.2 bits (892), Expect = 3.2e-94 Identity = 165/209 (78.95%), Postives = 194/209 (92.82%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T042 (Protein disulfide-isomerase 5-4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDIL5-4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 344.4 bits (882), Expect = 4.7e-93 Identity = 164/209 (78.47%), Postives = 189/209 (90.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LJU2 (Protein disulfide-isomerase 5-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDIL5-3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 319.3 bits (817), Expect = 1.6e-85 Identity = 156/212 (73.58%), Postives = 183/212 (86.32%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P10978 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 OS=Nicotiana tabacum OX=4097 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 257.7 bits (657), Expect = 5.7e-67 Identity = 167/491 (34.01%), Postives = 242/491 (49.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZT94 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RE2 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 257.3 bits (656), Expect = 7.5e-67 Identity = 197/608 (32.40%), Postives = 276/608 (45.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A438GWA1 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=POLX_3295 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 673.7 bits (1737), Expect = 1.2e-189 Identity = 362/708 (51.13%), Postives = 442/708 (62.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A438CP53 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=POLX_1882 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 669.5 bits (1726), Expect = 2.3e-188 Identity = 364/722 (50.42%), Postives = 447/722 (61.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: B0FBS2 (Uncharacterized protein OS=Vitis hybrid cultivar OX=241073 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 666.8 bits (1719), Expect = 1.5e-187 Identity = 364/750 (48.53%), Postives = 450/750 (60.00%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A438GAA6 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=POLX_2601 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 661.4 bits (1705), Expect = 6.4e-186 Identity = 362/750 (48.27%), Postives = 448/750 (59.73%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A438IRR9 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=POLX_1320 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 660.2 bits (1702), Expect = 1.4e-185 Identity = 362/750 (48.27%), Postives = 449/750 (59.87%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. TAIR 10
Match: AT4G27080.1 (PDI-like 5-4 ) HSP 1 Score: 344.4 bits (882), Expect = 3.3e-94 Identity = 164/209 (78.47%), Postives = 189/209 (90.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. TAIR 10
Match: AT4G27080.2 (PDI-like 5-4 ) HSP 1 Score: 322.4 bits (825), Expect = 1.3e-87 Identity = 154/196 (78.57%), Postives = 176/196 (89.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. TAIR 10
Match: AT3G20560.1 (PDI-like 5-3 ) HSP 1 Score: 319.3 bits (817), Expect = 1.1e-86 Identity = 156/212 (73.58%), Postives = 183/212 (86.32%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. TAIR 10
Match: AT1G50950.1 (Thioredoxin protein with domain of unknown function (DUF1692) ) HSP 1 Score: 287.3 bits (734), Expect = 4.8e-77 Identity = 143/213 (67.14%), Postives = 173/213 (81.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0038010 vs. TAIR 10
Match: AT4G23160.1 (cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 ) HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 1.4e-28 Identity = 61/132 (46.21%), Postives = 85/132 (64.39%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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