Lag0032449 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0032449
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr11: 32723995 .. 32727115 (+)
RNA-Seq ExpressionLag0032449
SyntenyLag0032449
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGAAATCCTTCTCACTACCGATTGTTTTGCCCCTTCCACCGCCCACTTTGTCGCCGGCTGCCTTGCCGCCGTTCCAAAGAAAAAAAAACGAACAATTTGAGAATGGGAAGATTTCGATAGGGAAGATTTGTGAAAGAAAGAAAAAACGACCCGACCCGACCCAACCCGACCCATTCGGGTCTAATCGGGTCGGTCTTTCTGTACGACCGACACGTGCCGGGTCGGGTCGGTTTGTCCGTACAACCGACCCGACCCGCCTTTTTTACACCCCTATCAAATAGATCCCTAAACTTTCAATTTTGTATCTAATAAATCTTTAAACTTTAAAAGTGTTTAATAAGTCCATGATGTATTCAAAATTTTTAAAATTTAATTGATTTCAATTTAAATTTGTGTCCAATAAGTCTACATTTTAAAAAAAAAAAAAATGTTGAATAGGTCAAGAACCTATTAGACACAAAATTGAACATTCAAGGACGTAGTTGGCACAAAATTGAAAGTATAAGGACATGTTCGGCACTTTGTAAAGTTTGAGGACCTATTTGACCCAAAATTGAAATTTGAAAGAACTACTAGAAAATTTTAAAAGTTTAAGGATCACACGAGCATAAAAGTTTAGGAACTAAACTTGTAATTTAGGTTTCGTTTGATAACCATTTGGTTTTTGGTTTTTGGTTTTTGAAAATTAGGCTTGTTTTCTTTAAATTTCCTCACCATGATTTTCATTTTTGTTAAAGACATACTTGAATTCCTAACCAAATTCTAAAAACAAAAACAAGTTTTTGAAAACTACTTTTTTTAGTTTTCAAAAATTGGCTTGGTTTTTGAAAACATGGGGAGAAGGTAGGTGAAAAACCAAAGAAACTTAGAGTTGGGAGTGGTATTTATAAGCTTAAAAACCAAAAACCAAAAACCAAAAACAAAATGGTTATCAAACGGGGCCTTAGTTTTTGGTTTTTGGTTTTCTAAAATTAAAAAAAAATATATTTATATATTTATTTACTTACTTGGTCAAATTAAAAAAAATATTTCCTAAATTATCAAGTTTTTTCTATTTGGTTCCTGAACAATAAAAATTGAATAATAGGTCCTTAAAATTTCAATTTTATGTCTAATAGGTTCTTCAATTTTAAAAATGTCTAATAAATTCTTAAACTTTTAAAATTGTGTCGAATACGTTCGACTTTTAAAGTTGTGTCGAATAAGTTCCTAACATATTCACAATTTTTTAAAATTAATTGATTTCATAGAAATAAAATCTAAATTTGTGTACAATAAGTCTACAATCTTTTTTTTTTAAAAAAAAAATATTGAATAAGTCAATGACCTATTAGATACAAAGTTGAAAAAGATATAATTAACACGAAATTTGAAAGTCTAGGAATCTGTTAGACACTTTTTAGACTTATTATTGACACAAAATTGAAAATTTCAAAGAGCTATTAGAAATTTTTAAAAGTTTAAGGTTCAAATAACAGACACAAACCTGAAAGTTTAGAGACTAAACTTGTAATTTACTTTTTCATTTTTACGTTAAAAAAATAATTGATGTATGAGGGTAAAGATGAAATGTTTACATTCTTCTTACGATCTATGTTGTCATAAAATATACAAAAATTATTTGACACAAGTGTAGTGTGATTTTTATAGCACCAAATAAGAAAGAACAAAAAGATGACAAGGGATATTATGCGTGATATGTTAGTTTAATTAAGGATATATAAGGAAAAAAAAAACACAAAACAAAACAAAATTGTTGCCCAATGGAAATTTGATTTTTATAGTCATGTTTTCTCAGAATTTTTCTAAATATTTTTAGCAATAATTACTAATTCCAAAATTTGAAAGAAATACGAACGTGACAAAAAGTAGAAACCACCCCCTTAATAATTACTATAATGTAACTCAATGAATGTATCTACATCAATCATTAATTCTATAAGAAGTATACATTATATTTTGGTTCTAAAGTTTCATATATATTTACTTCTTTTGTTCTTAAACTTTGAATTGTTTCGTTTAATCCTATTTTCGATGTATATATATTTTAATCTTTAATATTATTTTTCATTAATTATCTAACAAGAAAGTCATTACATTTGGAAATCTAAAAGTAGTTAGCTTCAAACACTTGTCTATGTAAATATATGTTTGTCTGACATATGAACAGAAATTGTGCATTTGTCAAGTTTCTATTAAAATAACGGATGATTATTGTGCAAATTAGTTCAAGGACTACCGTAGAAAGTTCGAAAAGCTTGGACATTATACTTGACAAAGCATGAAAATTTAGTGACAACAGTAGGATTTAAACTTTATAGTAATCATTGTTGATGGTCGATTTTGGCCAGAGGAACTCACCTGACCTTCACGTGCCACCAACGGTAAATTTGTAGATGAGGGGGGAAGACGTGGCCTGCAAGACAGTAACCTGCACACCGGTGTGGTGCTCGCCACATCGGCTCCGATGCTTAAGTCAGCAAGCAGAACGGTAGGGCGTGGAAAAGTAAGAGCAAGAGGAGAAAACAGAGAATAGAGAGTAAAGTTTAGGGATGGAATTCGGGATCCCCTCTTCAGTGGCGAAGAGGGATATAAATACCTGTTCATCCTCCTAGCCTTTTTAGGGTTTCGGAGGTGTTTTAGGTCAAACCAGGCGAAACCGGGGCATCCAGAGGCGGTGGGGACCAGACGAGACCGAACGGGCTCGGCCCGCACGAGCGGGCCGAGGCCGAGCAGGGGGTCGGGCCTAAAACCCGACCCCTTCGGTCTTGGCCCGTCTCACTTGTCGGTTTTGCCCCCTTGGTCCATCTTTCAGCCCGATTCCTCCCCGGTTGTCCTCGTCAGCTCCTTGTATATCGGGGTGGTCCAAAATTACCTATAACATTAAGCCCCCACTCTTGAACTGGGATTCGGGGTGACTTATTGCTATAAGTTGAGCTCCTTAAGCCCGATTTAAGAGTAATGACCCTTGCCCTGGACTGGCTTACGTGTAGCTTTGTTGTCATCAAAAGTGGTGCTGGTCGGCCTCGGCCTCGGGAAGAGGCCGAGCACAGCTATCTCCCTTTCTGCTTGCCTGGTCGGCCTCGGCCTCGGGAAGAGGCCGAGCATCATATTTTGTAA

mRNA sequence

ATGAAATCCTTCTCACTACCGATTGTTTTGCCCCTTCCACCGCCCACTTTGTCGCCGGCTGCCTTGCCGCCGTTCCAAAGAAAAAAAAACGAACAATTTGAGAATGGGAAGATTTCGATAGGGAAGATTTGTGAAAGAAAGAAAAAACGACCCGACCCGACCCAACCCGACCCATTCGGGTCTAATCGGGTCGGTCTTTCTGTACGACCGACACGTGCCGGGTCGGATGAGGGGGGAAGACGTGGCCTGCAAGACAGTAACCTGCACACCGGTGTGGTGCTCGCCACATCGGCTCCGATGCTTAAGTCAGCAAGCAGAACGGTAGGGCGTGGAAAAGTCAAACCAGGCGAAACCGGGGCATCCAGAGGCGGTGGGGACCAGACGAGACCGAACGGGCTCGGCCCGCACGAGCGGGCCGAGGCCGAGCAGGGGGTCGGGCCTAAAACCCGACCCCTTCGGTCTTGGCCCGTCTCACTTGTCGGTTTTGCCCCCTTGGTCCATCTTTCAGCCCGATTCCTCCCCGGTTGTCCTCGTCAGCTCCTTGTATATCGGGGTGTTGAGCTCCTTAAGCCCGATTTAAGAGTAATGACCCTTGCCCTGGACTGGCTTACGTGTAGCTTTGTTGTCATCAAAAGTGGTGCTGGTCGGCCTCGGCCTCGGGAAGAGGCCGAGCACAGCTATCTCCCTTTCTGCTTGCCTGGTCGGCCTCGGCCTCGGGAAGAGGCCGAGCATCATATTTTGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAATCCTTCTCACTACCGATTGTTTTGCCCCTTCCACCGCCCACTTTGTCGCCGGCTGCCTTGCCGCCGTTCCAAAGAAAAAAAAACGAACAATTTGAGAATGGGAAGATTTCGATAGGGAAGATTTGTGAAAGAAAGAAAAAACGACCCGACCCGACCCAACCCGACCCATTCGGGTCTAATCGGGTCGGTCTTTCTGTACGACCGACACGTGCCGGGTCGGATGAGGGGGGAAGACGTGGCCTGCAAGACAGTAACCTGCACACCGGTGTGGTGCTCGCCACATCGGCTCCGATGCTTAAGTCAGCAAGCAGAACGGTAGGGCGTGGAAAAGTCAAACCAGGCGAAACCGGGGCATCCAGAGGCGGTGGGGACCAGACGAGACCGAACGGGCTCGGCCCGCACGAGCGGGCCGAGGCCGAGCAGGGGGTCGGGCCTAAAACCCGACCCCTTCGGTCTTGGCCCGTCTCACTTGTCGGTTTTGCCCCCTTGGTCCATCTTTCAGCCCGATTCCTCCCCGGTTGTCCTCGTCAGCTCCTTGTATATCGGGGTGTTGAGCTCCTTAAGCCCGATTTAAGAGTAATGACCCTTGCCCTGGACTGGCTTACGTGTAGCTTTGTTGTCATCAAAAGTGGTGCTGGTCGGCCTCGGCCTCGGGAAGAGGCCGAGCACAGCTATCTCCCTTTCTGCTTGCCTGGTCGGCCTCGGCCTCGGGAAGAGGCCGAGCATCATATTTTGTAA

Protein sequence

MKSFSLPIVLPLPPPTLSPAALPPFQRKKNEQFENGKISIGKICERKKKRPDPTQPDPFGSNRVGLSVRPTRAGSDEGGRRGLQDSNLHTGVVLATSAPMLKSASRTVGRGKVKPGETGASRGGGDQTRPNGLGPHERAEAEQGVGPKTRPLRSWPVSLVGFAPLVHLSARFLPGCPRQLLVYRGVELLKPDLRVMTLALDWLTCSFVVIKSGAGRPRPREEAEHSYLPFCLPGRPRPREEAEHHIL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 30..54
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..150

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0032449.1Lag0032449.1mRNA