Lag0021368 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0021368
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr7: 6898873 .. 6902643 (-)
RNA-Seq ExpressionLag0021368
SyntenyLag0021368
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGACGGCAGGGACCAAAGTGCTCCTTATCTCAAACCTCAGGGGTACTTTTGTTGAGTTTGAAAACTCAGGGACTAAAGTGTCACTTAATCCAAACCTCAAGGACCAAAAGTGTATTTTTCCCTAAAATATTTTTTTGAATTCAACAACATTTGAGAGTGGAGGGATTCAAACCTTATACCTCTTGGCCGAGAGTAAACACAAATCATCGACAAGGATGAAAATATTGTTATCAATATTAATACCAGAATTTGCTAAAGCGAGCTTAGCTCAGTGGTAACTGGCATGTACCCTCGATCATGAGTAAATTAATAATTAAGTTGTTTTTACTTCCTAACTGAGTTATAGATGTTATTATTAGTATATTTATATTTGTATGTGATCAAAATGTACGATGTCTTTTTATGTTTTATGCGTATTTATAAATGATATCGATTGATCCTCAATATTCATGTCGAACCCTCCAATTTATAGATATATTGACAGATATAATCTTGATCACCTTTGAGCCACACTCACTTTGGCAGGATTTACATAAAATTTTACAATTTAAAGTTACTGAATGTATAATATTATGTTAATATATACACACAATTGACCCTCCACATATCTCCACAATGGTAGATGTGTCACCACTTTGGACATAAGTCATCATTGTTTTGCTTTTGGTTTCATCCCAAAAAGTCTCATTCCAATGAAGATATTGTCCGTCACTTATATACCCATAATCTAATTCCCTTTTCTAGCCAATGTGGCACTTTAGGATAAATCAATACTCTTTACCCCTAAACTTGGTAGGTCGATTCAATGACTACAAAAAAATGTCAAGAAATACGGTTTTGACATTTTTTCAATGTCATGAAAAGTCAAATTTGTAGTCATATATGTCAATGCACCCACTAATTTTAATAAAAATAAATGTAAAAATCCAAAAAGAGGGTCATTAATTTCAATAGAAAATCAAGTAATGAATGTCCTTGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAATTATGTTTGATCCATGCACACAAATTGAATTTAACAATTGAATAACTCCGGCTAAAATTCACAAATTTCAATAAGAAAGTTGTTGATTATAAAATACAAATAGGTTTCAATTATATCTCTAAACTTTGAGAAGTCTCATTTTTATCTTTGAACTTCGAAAATTTTTCTAAAAAATGCCTTTGGACAGTTTTTGAAGATGGAATTGCCGCAACAACTAATTGTAAAAATATTGAGAAGCCATCCATGAAATCATTTACATCATTGTTTATGTAAACTGACGTGACAGTTGATGCGTAAAAATTGATTATTGTAAATTATTTTAATAATATTTTTTAAGATGAAATAAATGGTAACAACAATTTTATTTTTATTTTTTTTATATAATCGTAAATAATATAATACATGTCTTCAAATTTTCTATATTTCTACATATATATCAACTATCACATTAATTTTTATCATTTATTTTTAATGAAAAAGATATTTTTGGGATAATTTCAAAGTTTCAGGGCATTTTTTGGAATAAATTTCAAAATTTAAGGGTAAAAACGAAACTTTTCAAAGTTTAGAGATATAATTAAAATCTACCTCTACCCTAAAGTTTAGATTTTTTTTTTTTTTTAGAAAAAGTTTAGAGATATTTTATCCAAGTTTAACCAAAATTATTTTAATGTAATTTTTAAAAAAAAAAAATCCTACCAACTTTTTAATAATTGACATATATTTTATAATTCATTGACCGGATAAAATCTTTTAAAATACTATTCTTTAAAAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTCATAAGGGCCTTAACTAAAAAGCACGACTATCAAAAAGTTATAACACTTCTCAAATTCAAAGATAAAATTTCCATGTTAATGTTCAATACATCTCACTAATTTCAAGAATAAAACCTAATTTATATTTTCAAATTATAAAATCCTAAAATTAATTTGACATAACTGTTATAGGCAATTTTGGACCACCCCGATATACAAGGAGCTGACGAGGACAACCGAGGAGAAATCGGACTGGAAGATGGACCAAGGAGGCAAATCCGGCAAGTGGGACGGGCCAAGACCGAAGGGGTCGGGTTTTTGGCCCGACCCCCTGCTCGGCCCGCTCGCGCGGGCCGAGCCCGTTCGGTCTCGTCTGGTCTCCACCGCCTCTGGCTGCCTCGGTTTCGCCTGGTTTGACCTAAAACGCCTCCGAATACCTAAAAACCCTATGAGGATGAGCATGTATTTATATCCCTCTTCGCCACTGAAGAGGGGATCCCGAATTCTATCCCTACACTCTACTCTCTATTCTCTGCTTTCTCCTATTGCTCTTACTTTTCCACGCCCTACCGTTCTGTTTACTGACTTAAGCATCGGAGCCGGTGTGGCGAGCACCACACCGGTGTGCAGGTTACTGTCTTGCAGGCCACGTCTTCCCCCCTCAACTACAAATTTACCGTTGGTGGCACGTGAAGGTCAGGTGAGATCCTCTGGCCAAAATCGACCATCAACAATAACTTTTCTATTAAATTACAAATTTCAGTTCTTAAATTTTTAACGTTCAATGTGTTCCTAAAATTTAAAATTAAAGCTTCCATAGATGTTTGAACTTTTAAAATATTGTATCTAATAAGTCTTTAAATTTAAAAATATCAAATATGTCGTCCAAACTTTCAACTTTATATCTAATAGGTTCAAAAACATGTTTAACATTTTTAAAAACTAAAGAATCTATCAAACATTAAAATTGAACTTTGCGTCTAATAGGATATTAAACTTCAATTTTGTAGCCAAAGCGAGTTTAGCTCAGCGGTAATTGGTATGTACCCTCGACCATGAGAGCAGAGGTTTGAATACCCCACTCCCAAATGTTGATGTACTCAAAAAAAAGAAAAAAAAAACTTCAATTTTGTATCCTTGTGAACTTTAAAAATGTCAAATAGGTCACTGACTTATTAGACATGCAAAATCAAAAGCTTAAAGAATTATTAAACGACACAAACAAAATCAATAATCAGGAACTTTCTCCCTCGCGGGAAGGAGGCTGCGTTTTTTGGTTTCCTATTTTCCCAAACTGGTTTATCACCCTCCTATCTAAGGGTAGTTGTAACGATTTATTTCCCCTTTTATGAATTCATCTTTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATATCAGACATTATTTAAAGCTTAAAAATCTATTTGACACAACCCTGAAAGTTGAGAGATCGAAGTTGTAATTTAACCCGACATTTAAAATTTGGTATATGCCTAATTACATAATTAAATTGAGCACTTTTTGATCCTCCTTCTGGAATCACTGCAAAATTAAACCCACTGTTTTTTCCATTCATCATCTTCTACTTTTCTTCTTCTTCTTCTTTCTCTTTCTCAAAATATATGGAATAAAATTTTCTCATTTATGTACCAAACACCAAATCTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTTTTTTATCGAAGAATATTATTAAACACATACGTCTCTCTCTATATAAGGAGATAAGAATCATTCATGGGTGAAGCTTATGGAAAATGTTGAGATTTCAAAAAAAGTCAGTTGATATGATATGATCATACATTATCATTACATTACATTTCATTCCTCTCTCTCTCTTTGCATCTACGGCGACATTCCTATCCCACTCTCTCTCTTTCTCTCTCTTACCCATATAGTTGACATTCTCTTCAACATTATCTTTTCTCTTCTCTTCTTCTTCCTGTGTCTGATTCTTCGCATACTTTCAGGGATAG

mRNA sequence

ATGGACGGCAGGGACCAAAGTGCTCCTTATCTCAAACCTCAGGGGCAATTTTGGACCACCCCGATATACAAGGAGCTGACGAGGACAACCGAGGAGAAATCGGACTGGAAGATGGACCAAGGAGGCAAATCCGGCAAGTGGGACGGGCCAAGACCGAAGGGGTCGGGTTTTTGGCCCGACCCCCTGCTCGGCCCGCTCGCGCGGGCCGAGCCCGTTCGGTCTCGTCTGGTCTCCACCGCCTCTGGCTGCCTCGGTTTCGCCTGGTTTGACCTAAAACGCCTCCGAATACCTAAAAACCCTATGAGGATGAGCATGTATTTATATCCCTCTTCGCCACTGAAGAGGGGATCCCGAATTCTATCCCTACACTCTACTCTCTATTCTCTGCTTTCTCCTATTGCTCTTACTTTTCCACGCCCTACCGTTCTGTTTACTGACTTAAGCATCGGAGCCGGTGTGGCGAGCACCACACCGGTGTGCAGGTTACTGTCTTGCAGGCCACGTCTTCCCCCCTCAACTACAAATTTACCGTTGGTGGCACGTGAAGGTCAGGGATAG

Coding sequence (CDS)

ATGGACGGCAGGGACCAAAGTGCTCCTTATCTCAAACCTCAGGGGCAATTTTGGACCACCCCGATATACAAGGAGCTGACGAGGACAACCGAGGAGAAATCGGACTGGAAGATGGACCAAGGAGGCAAATCCGGCAAGTGGGACGGGCCAAGACCGAAGGGGTCGGGTTTTTGGCCCGACCCCCTGCTCGGCCCGCTCGCGCGGGCCGAGCCCGTTCGGTCTCGTCTGGTCTCCACCGCCTCTGGCTGCCTCGGTTTCGCCTGGTTTGACCTAAAACGCCTCCGAATACCTAAAAACCCTATGAGGATGAGCATGTATTTATATCCCTCTTCGCCACTGAAGAGGGGATCCCGAATTCTATCCCTACACTCTACTCTCTATTCTCTGCTTTCTCCTATTGCTCTTACTTTTCCACGCCCTACCGTTCTGTTTACTGACTTAAGCATCGGAGCCGGTGTGGCGAGCACCACACCGGTGTGCAGGTTACTGTCTTGCAGGCCACGTCTTCCCCCCTCAACTACAAATTTACCGTTGGTGGCACGTGAAGGTCAGGGATAG

Protein sequence

MDGRDQSAPYLKPQGQFWTTPIYKELTRTTEEKSDWKMDQGGKSGKWDGPRPKGSGFWPDPLLGPLARAEPVRSRLVSTASGCLGFAWFDLKRLRIPKNPMRMSMYLYPSSPLKRGSRILSLHSTLYSLLSPIALTFPRPTVLFTDLSIGAGVASTTPVCRLLSCRPRLPPSTTNLPLVAREGQG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 29..53
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 29..46

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0021368.1Lag0021368.1mRNA