Lag0015532 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTAAAGTCCTACGAGGCATATATTTGAAAACAGGGCATTTCCTTAAAGCCTCCTTGGGTCACAATCCTTCATATACATGGAGAAGTATTCTATGGGACGAGAGCTCTTTAAAAAGGGATACCGATGGAAGATTGGAAATGGCATGCAAGTGGATGTCTGAAGGATTGAAATTCCCAATTCCGTTACAGCGTAAGCAATTGGACCGAATCGTATTTTAATTTGGTTAAACAAAATACCCATACATTGGCAAAATTCATAAATCTAGGCTAAGCAATAAGAAGCATACCTCCATTGACGACTCATAATTCTTCAACGGACACCACCACGAGGCTACCCTGCTATTTTCTGAGATCGAGAGTGGAGTGGTGGGACTCCCAATTCTTTATCTTGAGAGGGAATAGTCACAAAGAAACTGAGAAGGAAAAAATTTCTTCTCCGTTCCTTTCTTGAGAGAGAAAGAACGTGAAAGAGAGTTTGTTAGAGAGATTTTTTTTTAAAGTCTGCATCCATGAGAGTAAAAACTCCAAGACCCCAGTATTGTGAGAGATATTATTGGTTAACAAATAACCAATAAAATAAAATAAAATTAATTAATTAAAATTAATCCAATTAATTAATTAAATGCTAATCAATTAATCATATTAATAAATCAAGCATATGTACATTTAAATCATATTTAAATGCATTTCCCTCACATAATACATAGTTTTAATTAATCTTAATTAAATTAATTAAACCAATCAATTAATTAATTCACAATTAATTAATTATTTGATCAATTAGATATTACATATTTAATTAATTGAACATTTGAATCATATTCAAATGTGCATCTCTCTTATAACCTATAGTTTTAATATGAATCACATTCATATTAAAATTAATCTATAGATTTAATTTAATTAAATCACATTTAACTAAATTAAACTTAACAATTAATTAATCAAAAATAAATTAATTTTATAACTAATTAAATATCATCCATATTTAATTAATTACATATTAGAATCATATTCTAATATATCTCTGATATATTATAGTTTAATTAAATCACATTTAATTTAAACTAAATTGAATAATTAATTAATTCACAATTAATTAATTAATTAATTAATTCACAATTAATTAATTAATTAATTAATTAAGTATCATATACTTTTTTTTAAAACTAAATATCATATACTTAATTAGCCACATATTTGAGCTCCTGCAAATATATTATTCTCTCAATAAAATAAAGTCTAATCTCATATTAAACTTAATATTATAATGCATCACCATACATTATATTAATTGTATCTCATACAATCACTTGATTCCCCAAATTAAAATTGAATTTGAACTGTTCAAATTCTTTCAAGATAAATTGTTCCCAATTACTCTTTACGAGCTAGTAGGGGGACCTAATGGACCTACAGATCAGAAGCTCCAATGATATGAGGCTAATTGACTAAACTCATTAATCGAGTTAACCAATATTTATTAACTGTGGGTCACTCCACTAAAGACTCACAGCTGCACTCTTCTCACTGTAGAATGTTTCTGTGTCCATGGATATTGACCAATAACAATAAGTCAATCCTTCACGAGTGTTTGTAACTACAGCTGGGTCAAATTACCGTTTTACCCCTAAGTTACCTTTGGCTCCTTAAGTACCAGTGCTCCTCTAATGAACAACCTGTTTATGGTCCAAACAGTAAACAGAAAGTCCCTCTCGGGCCAATGAGAGGTCGGGATCCCTTTGTTCAAGCCCCAGAGTCACCACTTAAGGGAACACTCATCTACTTCTCCTAGAAGTGGGAAGGAGAGAATTTCATCTTGTGTTGTCATGTCCCTAGCCCCCCACTCGGTCTTGTCCCCAAGAAGGTAGGCTTATTGAGTCGGCGTGCAGGCCATTCTCACCCGTACTAATCAAAGGACAATCCCTCATGAGAAGGAGTTCATGACACACTCAGGAATAAAACTGAGTTACCTAGGTCATCCTATTGAAACAGTAACCTAACTAGTTAACGGTATTACATCTAGTGGTTTACTATTTGTGGTCTGGTTTTATGCAAACTCATTGCATAGGATACCCCCGCTCGCATGTCTCCTACATGGACGCCTTGGATCAATACTTCTGTACCGAATACAAAGCGGGTCGTATCACATAGTGTTACCAGGATAAGGTACCCAACCTCATCCTTGTACTATAGACCTTTTAGGTTGTTACTTGAACACTGATCCCTGTATGTCCCCACATACTAGTTCAAGTTACATGTACACAACCTTGGATCTTATTTTATTGGATTTGGGTTATATTGTGCAATTTTAGACTTAATATGACAGTAACACTTTATTGCATAAACCTCAATAACACTTTATTGATACAAGTGTATAATTCGTTAACATTCACTATCTACGAGTTTTAGGACATAAAACCCAACAAATCAATGATCAGTGGATTCCAAAGGAAGGGTCTTGTAATCCTATCATAACTCATCCTGATATGCAGAATTGTTCGGTGGCCCATCTTCTACTTCCTTCGGGATTGTGGAATGAAAATCTAGTGAGAGCCTCGTTTCTAGAGGAAGACGCAATGGCTATATTAAACATCCCAGTTGGATCAAGACCAAGCGAAGATGAGGTAATCTGGAACCTTGATTCTAAGGGACTCTTCTCGGTGAAGAGTGCCTATAGATTGGGTATCCAAATTCAATCTTCTCTTGAAGCCTTGGCATTGAATTTTCAGAATCAAGAAGAACTGTGGAAGAGTTTCTGGAAAATTAATCTGCCTCCTAAAATCAAAATATGTGGCTGGAAAATCTATAATGATATTCTTCATACACTGACAAATTTAATTAATAAGGGGATGAAGATTAATTCTAGTTGTTTATTTTGCAGGAGCAAACCAGAGACAACAAGCCATATATTCTGGGAATGCAGATTTACAAAAGGACTTTGGGATAATTGTTGCCCGTGGACTAATACAGGGTGTTTGGATGACAGGAGATGCTGGAAACCAGCGGACTGTTGCGATTGCAAGTGGAAAAAAAAGGGGGAAGCAGTGTATGACGAGGAAATAATATCTAAAAGCTTCCTGGTGTATTGGCAGATATGGACTCATAGGAATGAGGTTCTACATTGCAAGATTCAACCGAATAGAAAAAATGAGACTGCAAATCCAAAAGTATACTACAGAATTTTCAAACTTTCAAGGCACATACATTCAGTCGAGGACTCAATCTCATCGTCGAGAAGCTCCAGCTCCAAATAGATGGATTCTGGTTCCAACAGTAAGGTGGAAGCTAAATTGTGATGCGACCTGGTGCAAAGAATTGGAGATGGGTGGCATTGGGTGGATTCTTCGGTCTTGGGACGGGGTTCCTCAAATGGCCAGTTGTCAAGTTGTTAAGCATGCCTGCAAAATTAGCTAGCTTGAGACTCTTGCCGTTTGTGAAGGTCTAAAGGCCATTCCGATCGACACTCCATTGGCGAGGATAGAGTTGGACGCAATGCACATTGTTCAGCTTCTAAATGGGGAGGTTGAAGATATAACAGAGCTTTCCCATTTTGTGTTGGATGCTCAAGCCCTAATTGCTGCTACGAACATTGATGAAGTGATTCATATTCCAAGGACGTACAATGTCATGGTCCATTTGTTGGCCCGCAGAGCTGTTAGAGTTAATTTATCTGAGTGTTGGAGTAATGTTTTTCCATATTGGTTGTTAAGTTTTAATGCTACTGATATAGGAAGTGATTTTCACACTAGTGGGGGATCCTGTCTCACAAGTGGTATCCGAACAAGACTTGTCGAAGGTCCGAGCCAAATAAATTTATAATTCCACGACACTACAACTATTTTTGTAGAAATAGTGGTCAGGGTCGAACGCAGGGAGGAACCAAATTAATTAAATTAACCTAAGATTTTTCAATTAGTAACGGAAATTGGGGGGTTGGCATGGAAGAAGATTTGAGGATGAAAAATTAAAATACAAGAAATTAAATTACCAAAATTAAAATAACAAGAAAATAAAAGGATGGACTGACTAATCTTGCCTCGGGATCGTGCAATTGGTTATCCGAATTAAGTTTGGCAATTCCAAATCATAGACTCTTTTTATTAACGAATTACTAGCTAATTGTCTAACCTCCCATTGGAAAAGCCAGCGAGATTAATGATCCCAATTATTTTCTAACCCGACAAAAGCATCGAGGCCAGAACCTAATTAAAAATCTAACCAATGACGTCTCACTAATTAGAATTTAATCACATTAAGAATGATGGAACGTTAAATAGAATGCATAAACTAGGAAAAGCCTAAATTCATACGATTCTAAGCCTTAACTTCTAAATCTATCATGCAATTTTGATCAATTAGGATAAAGCGCCTTTTAATTAAGATTAAAAATAGATTGATTTGCTACAAATTCTAGCAAAGCAATTGGTTCAAACAAAATAGGTTGTCAATCTATAGGTTCAAGGCAATTGTGATACAAACTGGAATTAAGAACACAATTAGACAACAATTCTATGAAATCTGAAATATACAAGGTCTCAAAGGAATGCCAAACTTACATTCGGAGTCCCAATTACGACGATCTACACTTAGCCAGACATTGCAATGCTCCAACTAAGCGTCGAGGCTCGATTAGCCATTCCTATATCTAAAAAATAATGTAATCTAATGAAAATACACTGAAAACTAGAAAAATATAGAGAAAAGGACTGTTGCGGCGAGAATCGGAGTAAAAACGGACATTAGAATGACGTAAAATTAAAAAGCCCATATTTATAAACCGCGACAGTGTCTCGACGCTGATGCTAAATTGGCCCACATCTTGCATCAATAGCGTCGAGACGCTGAGAGGTAGCGTCGAGACGCCGAGAGGTAGCGTCTCTCGGGAAAATTGGTGAATTCTTTGCTCCGATTGACTTTCTTGATCCCGAGAACACCAAATCAACCTATGCATAATAAGACTCAAAATTAGTCAATTATCACGAATAATA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ATGGCTAAAGTCCTACGAGGCATATATTTGAAAACAGGGCATTTCCTTAAAGCCTCCTTGGGTCACAATCCTTCATATACATGGAGAAGTATTCTATGGGACGAGAGCTCTTTAAAAAGGGATACCGATGGAAGATTGGAAATGGCATGCAAGTGGATGTCTGAAGGATTGAAATTCCCAATTCCGTTACAGCGACATAAAACCCAACAAATCAATGATCAGTGGATTCCAAAGGAAGGGTCTTGTAATCCTATCATAACTCATCCTGATATGCAGAATTGTTCGGTGGCCCATCTTCTACTTCCTTCGGGATTGTGGAATGAAAATCTAGTGAGAGCCTCGTTTCTAGAGGAAGACGCAATGGCTATATTAAACATCCCAGTTGGATCAAGACCAAGCGAAGATGAGGTAATCTGGAACCTTGATTCTAAGGGACTCTTCTCGGTGAAGAGTGCCTATAGATTGGGAGCAAACCAGAGACAACAAGCCATATATTCTGGGAATGCAGATTTACAAAAGGACTTTGGGATAATTGTTGCCCGTGGACTAATACAGGGTGTTTGGATGACAGGAGATGCTGGAAACCAGCGGACTGTTGCGATTGCAAGTGGAAAAAAAAGGGGGAAGCAGTGCACATACATTCAGTCGAGGACTCAATCTCATCGTCGAGAAGCTCCAGCTCCAAATAGATGGATTCTGGTTCCAACAGTAAGGTGGAAGCTAAATTGTGATGCGACCTGGTGCAAAGAATTGGAGATGGGTGGCATTGGGTGGATTCTTCGGTCTTGGGACGGGGTTCCTCAAATGGCCAGTCTAAAGGCCATTCCGATCGACACTCCATTGGCGAGGATAGAGTTGGACGCAATGCACATTGTTCAGCTTCTAAATGGGGAGGTTGAAGATATAACAGAGCTTTCCCATTTTGTGTTGGATGCTCAAGCCCTAATTGCTGCTACGAACATTGATGAAGTGATTCATATTCCAAGGACGTACAATGTCATGGTCCATTTGTTGGCCCGCAGAGCTGTTAGAGTTAATTTATCTGAGTGTTGGAGTAATGTTTTTCCATATTGGTTGTTAAGTTTTAATGCTACTGATATAGGAAGTGATTTTCACACTAGTGGGGGATCCTGTCTCACAAGTGGTATCCGAACAAGACTTGTCGAAGCCGCTTACCCCCTTGCATTTTGGTTTCTTCTTCGAGCAGCAGACCGTGGTGTTCCTCTTCAGCAGCCAACCCCTCCTCCTTCAGCTTCTTCTTGCGCCGCCAACCACTCGAAGACCCATCTCCGTCGATCTCTCCCTCCCTCTCGCGAGTCTTCTCCTCCACGCAAGCAGTCGGCCTCGCGCGTCTCTCCCTCCGCGCGTCTCTCTCTCTCGCGACTCCCTCTCCCCCTCACGTGTTTGTTCGACTCGAGCAGCAAGACCCACGCGGACCTCCATCTCCTCAGTCAATCTCTCTCTCTCTCCCGTGTTCTGACGCCAACAACAACAGATCCGTGGCCTTGTATTCACAAGCGTGGGCCAACAAGTTTCGCAACTTCGGGTTTTCACGTTCAAACTTGCGTGGGCGATGCACAGTTCGAGGACTTGGGTAAAAATGGTCAAGGGTCGAATGTCGAGCTCCATAGAGAGCATTGTGGTCCTGGGTACAAATGGTCAGGGGACAGTGCGACTCGAAGGATCAGTCTTGGAGAGCTTTATGAAGGCTATGTGAAATTGAAGTCATCGGGTGCCTTGGGTAATATGGCCAAGGGGCGATGCACAGTTCGAGGCCTTGGATTTTTTACAGGTTATGAGACCATATCTGGACTTGGTGATGAGGAGGAGGCTTGGAAGAGGAGACCCTTAGATAGTAGCTAG ATGGCTAAAGTCCTACGAGGCATATATTTGAAAACAGGGCATTTCCTTAAAGCCTCCTTGGGTCACAATCCTTCATATACATGGAGAAGTATTCTATGGGACGAGAGCTCTTTAAAAAGGGATACCGATGGAAGATTGGAAATGGCATGCAAGTGGATGTCTGAAGGATTGAAATTCCCAATTCCGTTACAGCGACATAAAACCCAACAAATCAATGATCAGTGGATTCCAAAGGAAGGGTCTTGTAATCCTATCATAACTCATCCTGATATGCAGAATTGTTCGGTGGCCCATCTTCTACTTCCTTCGGGATTGTGGAATGAAAATCTAGTGAGAGCCTCGTTTCTAGAGGAAGACGCAATGGCTATATTAAACATCCCAGTTGGATCAAGACCAAGCGAAGATGAGGTAATCTGGAACCTTGATTCTAAGGGACTCTTCTCGGTGAAGAGTGCCTATAGATTGGGAGCAAACCAGAGACAACAAGCCATATATTCTGGGAATGCAGATTTACAAAAGGACTTTGGGATAATTGTTGCCCGTGGACTAATACAGGGTGTTTGGATGACAGGAGATGCTGGAAACCAGCGGACTGTTGCGATTGCAAGTGGAAAAAAAAGGGGGAAGCAGTGCACATACATTCAGTCGAGGACTCAATCTCATCGTCGAGAAGCTCCAGCTCCAAATAGATGGATTCTGGTTCCAACAGTAAGGTGGAAGCTAAATTGTGATGCGACCTGGTGCAAAGAATTGGAGATGGGTGGCATTGGGTGGATTCTTCGGTCTTGGGACGGGGTTCCTCAAATGGCCAGTCTAAAGGCCATTCCGATCGACACTCCATTGGCGAGGATAGAGTTGGACGCAATGCACATTGTTCAGCTTCTAAATGGGGAGGTTGAAGATATAACAGAGCTTTCCCATTTTGTGTTGGATGCTCAAGCCCTAATTGCTGCTACGAACATTGATGAAGTGATTCATATTCCAAGGACGTACAATGTCATGGTCCATTTGTTGGCCCGCAGAGCTGTTAGAGTTAATTTATCTGAGTGTTGGAGTAATGTTTTTCCATATTGGTTGTTAAGTTTTAATGCTACTGATATAGGAAGTGATTTTCACACTAGTGGGGGATCCTGTCTCACAAGTGGTATCCGAACAAGACTTGTCGAAGCCGCTTACCCCCTTGCATTTTGGTTTCTTCTTCGAGCAGCAGACCGTGGTGTTCCTCTTCAGCAGCCAACCCCTCCTCCTTCAGCTTCTTCTTGCGCCGCCAACCACTCGAAGACCCATCTCCGTCGATCTCTCCCTCCCTCTCGCGAGTCTTCTCCTCCACGCAAGCAGTCGGCCTCGCGCGTCTCTCCCTCCGCGCGTCTCTCTCTCTCGCGACTCCCTCTCCCCCTCACGTGTTTGTTCGACTCGAGCAGCAAGACCCACGCGGACCTCCATCTCCTCAGTCAATCTCTCTCTCTCTCCCGTGTTCTGACGCCAACAACAACAGATCCGTGGCCTTGTATTCACAAGCGTGGGCCAACAAGTTTCGCAACTTCGGGTTTTCACGTTCAAACTTGCGTGGGCGATGCACAGTTCGAGGACTTGGGTAAAAATGGTCAAGGGTCGAATGTCGAGCTCCATAGAGAGCATTGTGGTCCTGGGTACAAATGGTCAGGGGACAGTGCGACTCGAAGGATCAGTCTTGGAGAGCTTTATGAAGGCTATGTGAAATTGAAGTCATCGGGTGCCTTGGGTAATATGGCCAAGGGGCGATGCACAGTTCGAGGCCTTGGATTTTTTACAGGTTATGAGACCATATCTGGACTTGGTGATGAGGAGGAGGCTTGGAAGAGGAGACCCTTAGATAGTAGCTAG MAKVLRGIYLKTGHFLKASLGHNPSYTWRSILWDESSLKRDTDGRLEMACKWMSEGLKFPIPLQRHKTQQINDQWIPKEGSCNPIITHPDMQNCSVAHLLLPSGLWNENLVRASFLEEDAMAILNIPVGSRPSEDEVIWNLDSKGLFSVKSAYRLGANQRQQAIYSGNADLQKDFGIIVARGLIQGVWMTGDAGNQRTVAIASGKKRGKQCTYIQSRTQSHRREAPAPNRWILVPTVRWKLNCDATWCKELEMGGIGWILRSWDGVPQMASLKAIPIDTPLARIELDAMHIVQLLNGEVEDITELSHFVLDAQALIAATNIDEVIHIPRTYNVMVHLLARRAVRVNLSECWSNVFPYWLLSFNATDIGSDFHTSGGSCLTSGIRTRLVEAAYPLAFWFLLRAADRGVPLQQPTPPPSASSCAANHSKTHLRRSLPPSRESSPPRKQSASRVSPSARLSLSRLPLPLTCLFDSSSKTHADLHLLSQSLSLSRVLTPTTTDPWPCIHKRGPTSFATSGFHVQTCVGDAQFEDLGKNGQGSNVELHREHCGPGYKWSGDSATRRISLGELYEGYVKLKSSGALGNMAKGRCTVRGLGFFTGYETISGLGDEEEAWKRRPLDSS Homology
BLAST of Lag0015532 vs. NCBI nr
Match: XP_022155286.1 (uncharacterized protein LOC111022423 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 129.8 bits (325), Expect = 8.1e-26 Identity = 67/156 (42.95%), Postives = 91/156 (58.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015532 vs. NCBI nr
Match: XP_015388020.1 (uncharacterized protein LOC107177951 [Citrus sinensis]) HSP 1 Score: 112.5 bits (280), Expect = 1.3e-20 Identity = 90/382 (23.56%), Postives = 158/382 (41.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015532 vs. NCBI nr
Match: KAG8652478.1 (hypothetical protein MANES_06G094851v8 [Manihot esculenta]) HSP 1 Score: 110.5 bits (275), Expect = 5.1e-20 Identity = 103/394 (26.14%), Postives = 162/394 (41.12%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015532 vs. NCBI nr
Match: XP_024038356.1 (uncharacterized protein LOC112097383 [Citrus clementina]) HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 1.6e-18 Identity = 56/162 (34.57%), Postives = 84/162 (51.85%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015532 vs. NCBI nr
Match: XP_024035599.1 (uncharacterized protein LOC112096407 [Citrus clementina]) HSP 1 Score: 104.0 bits (258), Expect = 4.8e-18 Identity = 56/155 (36.13%), Postives = 80/155 (51.61%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015532 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DRA0 (uncharacterized protein LOC111022423 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022423 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 129.8 bits (325), Expect = 3.9e-26 Identity = 67/156 (42.95%), Postives = 91/156 (58.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015532 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A803PC16 (Uncharacterized protein OS=Cannabis sativa OX=3483 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 1.6e-19 Identity = 99/408 (24.26%), Postives = 168/408 (41.18%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015532 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A803NU77 (Uncharacterized protein OS=Cannabis sativa OX=3483 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 8.0e-19 Identity = 99/407 (24.32%), Postives = 164/407 (40.29%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015532 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A803PAK3 (Uncharacterized protein OS=Cannabis sativa OX=3483 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 102.4 bits (254), Expect = 6.7e-18 Identity = 105/452 (23.23%), Postives = 181/452 (40.04%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015532 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D5K1 (uncharacterized protein LOC111017816 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017816 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 99.8 bits (247), Expect = 4.4e-17 Identity = 59/155 (38.06%), Postives = 84/155 (54.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015532 vs. TAIR 10
Match: AT4G29090.1 (Ribonuclease H-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 3.1e-07 Identity = 43/170 (25.29%), Postives = 72/170 (42.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lag0015532 vs. TAIR 10
Match: AT2G34320.1 (Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 44.3 bits (103), Expect = 4.2e-04 Identity = 39/120 (32.50%), Postives = 52/120 (43.33%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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