Sequences
The following sequences are available for this feature:
Gene sequence (with intron)
Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGTCAGGGTTCTCGTTCGGATCTTCTTCTTCGCCATTTTCATCGGCCACTGGTTTCGCATTCGGATCCACCTCCGCCTTCTCCTTCGGATCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTAGCTCCTCCTCTGCATTTTCAAATCAAAGCTCCAATCCCGCCCCTTCCTCTTCCCCTTCGTTCGGCTTCCCCTCCTCCACTTCCTCTCCTCTCTCTTTCTCTTCTGGAAGTTCAGGTTCTTCCCTCTTTGGTGCTACTTCATCCTCAGGAGGATTGACTTCTTTCGCGTTTGGGATTTCATCTTCATCGGGAACCTCATCTGCGCCATTGCTTGGGGCTCCTGCGTCCTCTGGGAGCTCACCTGCGCCCTTGTTTGGGGCAGCTCCGTTCTCTGGGAGCTCATCTGGGTCCTTGTTTGCTGCTGCTCCATCTGTAGGGACCTCGGCTTCGTCCGTTTTCGGAGGGCTGTCTTCTACAACTTCTTCTAGTGCGCCATCGTTTGGCACGCCTGCATCCACTGCAAGTCAGGGACTGACGTTGCTTGCCGCATCTGCAGCGGCTTCAGGTTCTAATTCGCCCCTGTTTGGGACATCTTCATCTTCAGGAAGTGCAGGTTCAGCTTTTTTTGGGTCTAATCCATTTGCTGCATCTTCTTCGGGCACGTCGTCTTCGATTTCTACTTCGACCTTGTTTACGTCATCTTCATCATCAGCTTCGGTTTCTCCATTCCAAAATTCTCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGAGTTCCTCTTCACCATTCGCGGCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTCCATTTTCAACCACTTCTTTATCCAAAGCTACTAGTATTACCAACGTGTCTTCCTCTTCTTCTTCTCTTACATCAGCTTCAACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTTGGAACGCCTGCTTCCTCGGCATCTCAATCTTCTTTTGGGTTTAGTATCAGCAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTGCTGCTCCAGGCACTGCAGTTACAAAGCAGCCTACTTCTCTACCGTTTTCAACTTCCGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTAACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCTAATAGCACAACCCAGCCATCTTTCTCCGTTCCAGCTTTTAGTTTGAGTTCTTCAGCCGCTACTACCTTATCGATAGCAGCATCCTCCGCCCCCTCAACTGCTTCCTCAGGTGCTGCGAGTTCGTTTACAGGTTTTGGTGTCACAAGCACGGCTTCTTCATCAAGTGCAACTGTTTCCTTATCGTTGCCAACCAAAACATTGACTGCTGCTTCATCATCGCAAGCCCCAGCCTCTTTCGGTAAGTTCTTCACTTTCTTCTTTTTACTTTGTGATGCAGAATTTATCTTATTGGTTGATCTGAATGAGTTTTGTGTCATGTTGTTCAATATTTTTTTTTTCGTCTTTTTTGGAGTTGTATCTGTATAAATGTAGTGAAGACACATTCAAATTTTCTTTTGGTTGATATAAATGATCTTTTGCACTATATTCTATGGTCAATGTTATGACAATTATCATTTTAGGATTATACTTTTTTTTTTCCTTTTGAAAAGATTAGGATTACACTTCAGTATGCTGTCGAATAGAATTTTAATGGTGAACTACGTTGGTAGTGATTAATAAGTAGAAGAAGCCTGGGTTATGTGGGAACAATTGGTGCATTTTGGGGGATTTTAATGTCACCCGTTCCCCTTTGGAGAAGGCTTCGGGAGGGAGGGTGTCTAAATCGATGAAGTTGTTCAACGAGTGGATTGAAGATTGCAGTCTGTATGATCCCCTTATTTAATGGGAAGTTTACCTGGGCTAACAATAGAGCGTGCAGTAGAATTGACAGAATCTTGTGTGCTCAGGGCTGGATGGATACCTTCAAGTGTGTCAAGCAATCCTTAGGTCCTAGAGTCACCTCTGATCACTGGCCTTTAATTTTTGTTTCGGGTCCTCAGAAGTGGGGACCTTGCCCCTTTCGCTTTGAGAACATGTGGTTGGATCACCCTTCCTTCAAATCTTCCTTCCAGTCCTGGTGGATGTTGAGGTTTCAGGGAAGTGGGAAGGCTACAGATTTATGA
mRNA sequence
ATGTCAGGGTTCTCGTTCGGATCTTCTTCTTCGCCATTTTCATCGGCCACTGGTTTCGCATTCGGATCCACCTCCGCCTTCTCCTTCGGATCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTAGCTCCTCCTCTGCATTTTCAAATCAAAGCTCCAATCCCGCCCCTTCCTCTTCCCCTTCGTTCGGCTTCCCCTCCTCCACTTCCTCTCCTCTCTCTTTCTCTTCTGGAAGTTCAGGTTCTTCCCTCTTTGGTGCTACTTCATCCTCAGGAGGATTGACTTCTTTCGCGTTTGGGATTTCATCTTCATCGGGAACCTCATCTGCGCCATTGCTTGGGGCTCCTGCGTCCTCTGGGAGCTCACCTGCGCCCTTGTTTGGGGCAGCTCCGTTCTCTGGGAGCTCATCTGGGTCCTTGTTTGCTGCTGCTCCATCTGTAGGGACCTCGGCTTCGTCCGTTTTCGGAGGGCTGTCTTCTACAACTTCTTCTAGTGCGCCATCGTTTGGCACGCCTGCATCCACTGCAAGTCAGGGACTGACGTTGCTTGCCGCATCTGCAGCGGCTTCAGGTTCTAATTCGCCCCTGTTTGGGACATCTTCATCTTCAGGAAGTGCAGGTTCAGCTTTTTTTGGGTCTAATCCATTTGCTGCATCTTCTTCGGGCACGTCGTCTTCGATTTCTACTTCGACCTTGTTTACGTCATCTTCATCATCAGCTTCGGTTTCTCCATTCCAAAATTCTCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGAGTTCCTCTTCACCATTCGCGGCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTCCATTTTCAACCACTTCTTTATCCAAAGCTACTAGTATTACCAACGTGTCTTCCTCTTCTTCTTCTCTTACATCAGCTTCAACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTTGGAACGCCTGCTTCCTCGGCATCTCAATCTTCTTTTGGGTTTAGTATCAGCAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTGCTGCTCCAGGCACTGCAGTTACAAAGCAGCCTACTTCTCTACCGTTTTCAACTTCCGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTAACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCTAATAGCACAACCCAGCCATCTTTCTCCGTTCCAGCTTTTAGTTTGAGTTCTTCAGCCGCTACTACCTTATCGATAGCAGCATCCTCCGCCCCCTCAACTGCTTCCTCAGGTGCTGCGAGTTCGTTTACAGGTTTTGGTGTCACAAGCACGGCTTCTTCATCAAGTGCAACTGTTTCCTTATCGTTGCCAACCAAAACATTGACTGCTGCTTCATCATCGCAAGCCCCAGCCTCTTTCGTCTGTATGATCCCCTTATTTAATGGGAAGTTTACCTGGGCTAACAATAGAGCGTGCAGTAGAATTGACAGAATCTTGTGTGCTCAGGGCTGGATGGATACCTTCAAGTGTGTCAAGCAATCCTTAGGTCCTAGAGTCACCTCTGATCACTGGCCTTTAATTTTTGTTTCGGGTCCTCAGAAGTGGGGACCTTGCCCCTTTCGCTTTGAGAACATGTGGTTGGATCACCCTTCCTTCAAATCTTCCTTCCAGTCCTGGTGGATGTTGAGGTTTCAGGGAAGTGGGAAGGCTACAGATTTATGA
Coding sequence (CDS)
ATGTCAGGGTTCTCGTTCGGATCTTCTTCTTCGCCATTTTCATCGGCCACTGGTTTCGCATTCGGATCCACCTCCGCCTTCTCCTTCGGATCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTAGCTCCTCCTCTGCATTTTCAAATCAAAGCTCCAATCCCGCCCCTTCCTCTTCCCCTTCGTTCGGCTTCCCCTCCTCCACTTCCTCTCCTCTCTCTTTCTCTTCTGGAAGTTCAGGTTCTTCCCTCTTTGGTGCTACTTCATCCTCAGGAGGATTGACTTCTTTCGCGTTTGGGATTTCATCTTCATCGGGAACCTCATCTGCGCCATTGCTTGGGGCTCCTGCGTCCTCTGGGAGCTCACCTGCGCCCTTGTTTGGGGCAGCTCCGTTCTCTGGGAGCTCATCTGGGTCCTTGTTTGCTGCTGCTCCATCTGTAGGGACCTCGGCTTCGTCCGTTTTCGGAGGGCTGTCTTCTACAACTTCTTCTAGTGCGCCATCGTTTGGCACGCCTGCATCCACTGCAAGTCAGGGACTGACGTTGCTTGCCGCATCTGCAGCGGCTTCAGGTTCTAATTCGCCCCTGTTTGGGACATCTTCATCTTCAGGAAGTGCAGGTTCAGCTTTTTTTGGGTCTAATCCATTTGCTGCATCTTCTTCGGGCACGTCGTCTTCGATTTCTACTTCGACCTTGTTTACGTCATCTTCATCATCAGCTTCGGTTTCTCCATTCCAAAATTCTCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGAGTTCCTCTTCACCATTCGCGGCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTCCATTTTCAACCACTTCTTTATCCAAAGCTACTAGTATTACCAACGTGTCTTCCTCTTCTTCTTCTCTTACATCAGCTTCAACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTTGGAACGCCTGCTTCCTCGGCATCTCAATCTTCTTTTGGGTTTAGTATCAGCAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTGCTGCTCCAGGCACTGCAGTTACAAAGCAGCCTACTTCTCTACCGTTTTCAACTTCCGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTAACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCTAATAGCACAACCCAGCCATCTTTCTCCGTTCCAGCTTTTAGTTTGAGTTCTTCAGCCGCTACTACCTTATCGATAGCAGCATCCTCCGCCCCCTCAACTGCTTCCTCAGGTGCTGCGAGTTCGTTTACAGGTTTTGGTGTCACAAGCACGGCTTCTTCATCAAGTGCAACTGTTTCCTTATCGTTGCCAACCAAAACATTGACTGCTGCTTCATCATCGCAAGCCCCAGCCTCTTTCGTCTGTATGATCCCCTTATTTAATGGGAAGTTTACCTGGGCTAACAATAGAGCGTGCAGTAGAATTGACAGAATCTTGTGTGCTCAGGGCTGGATGGATACCTTCAAGTGTGTCAAGCAATCCTTAGGTCCTAGAGTCACCTCTGATCACTGGCCTTTAATTTTTGTTTCGGGTCCTCAGAAGTGGGGACCTTGCCCCTTTCGCTTTGAGAACATGTGGTTGGATCACCCTTCCTTCAAATCTTCCTTCCAGTCCTGGTGGATGTTGAGGTTTCAGGGAAGTGGGAAGGCTACAGATTTATGA
Protein sequence
MSGFSFGSSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSPAPLFGAAPFSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSATVSLSLPTKTLTAASSSQAPASFVCMIPLFNGKFTWANNRACSRIDRILCAQGWMDTFKCVKQSLGPRVTSDHWPLIFVSGPQKWGPCPFRFENMWLDHPSFKSSFQSWWMLRFQGSGKATDL
Homology
BLAST of Lag0012105 vs. NCBI nr
Match:
XP_023006514.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita maxima])
HSP 1 Score: 393.7 bits (1010), Expect = 2.6e-105
Identity = 353/541 (65.25%), Postives = 378/541 (69.87%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSN 60
MSGFSFG SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG SSSSSSNP SSSSAFSN
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSN 60
Query: 61 QSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSF 120
Q+SNP PSS+P S FPSS SSP SF SSG SGS+LF A+SSSGGL+SF
Sbjct: 61 QTSNP-PSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGISGSALFAASSSSGGLSSF 120
Query: 121 AFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP---------------------------------- 180
FG+SSSSG SSAP GA +SGSSP
Sbjct: 121 GFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGA 180
Query: 181 --------APLFGAAP----------------------------FSGSSSGSLFAAAPSV 240
APLFG+AP SGSSS F AAPSV
Sbjct: 181 APASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGASPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSV 240
Query: 241 GTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSA 300
GTSA S+FGG+SS T+SSAP FGT A TAS G ++ ASAAASGS+S L
Sbjct: 241 GTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSSL---------- 300
Query: 301 GSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAAS 360
FGSN FA+SSSGT SS+STS LF SSSSSAS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA
Sbjct: 301 ----FGSNSFASSSSGTLSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA- 360
Query: 361 SSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAA 420
SSSGF FSTTSLSK TSIT V+SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGF+ISNAA
Sbjct: 361 SSSGFSFSTTSLSKTTSIT-VASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFNISNAA 420
Query: 421 STGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSS 444
S GS+APGT K PTSL FSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSS
Sbjct: 421 SLEGSSAPGTTAAK-PTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSS 480
BLAST of Lag0012105 vs. NCBI nr
Match:
XP_038874708.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida])
HSP 1 Score: 393.7 bits (1010), Expect = 2.6e-105
Identity = 332/458 (72.49%), Postives = 357/458 (77.95%), Query Frame = 0
Query: 2 SGFSFGSSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG--------SSSSSSNP-SSSSAFSNQSSNPA 61
S + SSSSPFSS+TGF+FGSTSAFSFG SSSSSSNP SSSS FSNQ+ NPA
Sbjct: 9 SSSQWSSSSSPFSSSTGFSFGSTSAFSFGSSSTPLSLSSSSSSNPTSSSSPFSNQTPNPA 68
Query: 62 PSSSPSFG---FPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLL 121
SSS FG FPSS SSP SFS LFG+ SSG ++ FG +SSSG+S AP
Sbjct: 69 SSSSSGFGSSSFPSSASSPFSFS-----LPLFGSAPSSGTSSAPLFGSASSSGSSPAPSF 128
Query: 122 GAPASSGSSPAPLFGAAPFSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFG-TP 181
G +SSGSS P FGA P SGSSS LF A PS G SA S+FGG+SS T+SSAP FG T
Sbjct: 129 GPASSSGSSLVPSFGALPSSGSSSAPLFGATPSAGASAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTTS 188
Query: 182 ASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTL 241
ASTAS G L AS AASGS+S LFGTS++SGS+GSA FGS+PF G SSS+STS L
Sbjct: 189 ASTASPGSALFGASVAASGSSSSLFGTSTTSGSSGSALFGSSPF-----GASSSLSTSNL 248
Query: 242 FTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAA---SSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSS 301
F SSSSS S SPFQNS SSSSSQNL+SSS FAA SSSSGF FST SLSK TSIT +S
Sbjct: 249 FASSSSSTSTSPFQNSFSSSSSQNLNSSSLFAASSSSSSSGFSFSTVSLSKTTSIT-TAS 308
Query: 302 SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFST 361
SSSSLT+ASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+AP T TK PTSL S+
Sbjct: 309 SSSSLTTASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPSTTATK-PTSLSLSS 368
Query: 362 SVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASS 421
SVAPLFSTVTTTS STPAANSTTQPSFSVPAFS SSSAATTLSIAASS PS +SSGA SS
Sbjct: 369 SVAPLFSTVTTTSGSTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSVPSASSSGAVSS 428
Query: 422 FTGFGVTSTASSSSATVSLSLPTKTLTAASSSQAPASF 444
FTGFGVTS ASSSSA SLSLPTKT TAASSSQAPASF
Sbjct: 429 FTGFGVTSMASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASF 454
BLAST of Lag0012105 vs. NCBI nr
Match:
XP_022959229.1 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2 [Cucurbita moschata])
HSP 1 Score: 391.7 bits (1005), Expect = 1.0e-104
Identity = 344/508 (67.72%), Postives = 374/508 (73.62%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSN 60
MSGFSFG SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG SSSSSSNP SSSSAFSN
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSN 60
Query: 61 QSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSF 120
Q+SNP PSS+P S FPSS SSP SF SSGSSGSSLF A+SSSGGL+SF
Sbjct: 61 QTSNP-PSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGSSGSSLFAASSSSGGLSSF 120
Query: 121 AFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP--------------APLFGAAPFSGSSSGSLFAA 180
FG+SSSSG SSAP GA +SGSSP APLFG+AP SGSS F A
Sbjct: 121 GFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGA 180
Query: 181 APSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAA---------------SAA 240
AP G+S + +FG S+ SS PSFG S S A S+A
Sbjct: 181 APGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSA 240
Query: 241 ASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSS---------GTSSSISTSTLFTSSSSS 300
A+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++ A+ SS +SSS+STS LF SSSSS
Sbjct: 241 ATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLFGSNPFASSSSVSTSNLFGSSSSS 300
Query: 301 ASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSAST 360
AS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT +SSSSSLTSAST
Sbjct: 301 ASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA-SSSGFSFSTTSLSKTTSIT-AASSSSSLTSAST 360
Query: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVT 420
SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGT K PTSL FSTSVAPLFSTVT
Sbjct: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAK-PTSLSFSTSVAPLFSTVT 420
Query: 421 TTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTA 444
TTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA
Sbjct: 421 TTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTA 480
BLAST of Lag0012105 vs. NCBI nr
Match:
XP_022959228.1 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata])
HSP 1 Score: 391.7 bits (1005), Expect = 1.0e-104
Identity = 344/508 (67.72%), Postives = 374/508 (73.62%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSN 60
MSGFSFG SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG SSSSSSNP SSSSAFSN
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSN 60
Query: 61 QSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSF 120
Q+SNP PSS+P S FPSS SSP SF SSGSSGSSLF A+SSSGGL+SF
Sbjct: 61 QTSNP-PSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGSSGSSLFAASSSSGGLSSF 120
Query: 121 AFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP--------------APLFGAAPFSGSSSGSLFAA 180
FG+SSSSG SSAP GA +SGSSP APLFG+AP SGSS F A
Sbjct: 121 GFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGA 180
Query: 181 APSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAA---------------SAA 240
AP G+S + +FG S+ SS PSFG S S A S+A
Sbjct: 181 APGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSA 240
Query: 241 ASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSS---------GTSSSISTSTLFTSSSSS 300
A+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++ A+ SS +SSS+STS LF SSSSS
Sbjct: 241 ATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLFGSNPFASSSSVSTSNLFGSSSSS 300
Query: 301 ASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSAST 360
AS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT +SSSSSLTSAST
Sbjct: 301 ASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA-SSSGFSFSTTSLSKTTSIT-AASSSSSLTSAST 360
Query: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVT 420
SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGT K PTSL FSTSVAPLFSTVT
Sbjct: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAK-PTSLSFSTSVAPLFSTVT 420
Query: 421 TTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTA 444
TTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA
Sbjct: 421 TTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTA 480
BLAST of Lag0012105 vs. NCBI nr
Match:
XP_023548092.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo])
HSP 1 Score: 389.8 bits (1000), Expect = 3.8e-104
Identity = 347/522 (66.48%), Postives = 375/522 (71.84%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSN 60
MSGFSFG SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG SSSSSSNP SSSSAFSN
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSN 60
Query: 61 QSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSF 120
Q+SNP PSS+P S FPSS SSP SF SSGSSGSSLF A+SSSGGL+SF
Sbjct: 61 QTSNP-PSSTPFGFASSPFPSSASSPFSFSLPAASTGVSSGSSGSSLFAASSSSGGLSSF 120
Query: 121 AFGISSS----------------------------SGTSSAPLLGAPASSGSSPAPLFGA 180
FG+SSS SGTS APL G+ SSGSSP P FGA
Sbjct: 121 GFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGA 180
Query: 181 APFSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAA---- 240
AP SGSS LF +APS G+S FG S SS PSFG +S+ S A
Sbjct: 181 APASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSA 240
Query: 241 -----------SAAASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSS---------GTSS 300
S+AA+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++ A+ SS +SS
Sbjct: 241 GASAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSSLFGSSPFASSS 300
Query: 301 SISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSIT 360
S+STS LF SSSSSAS SPFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT
Sbjct: 301 SVSTSNLFGSSSSSASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA-SSSGFSFSTTSLSKTTSIT 360
Query: 361 NVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSL 420
+SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGT K PTSL
Sbjct: 361 -AASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAK-PTSL 420
Query: 421 PFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSG 444
FSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASSAPST SSG
Sbjct: 421 SFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSG 480
BLAST of Lag0012105 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
Q8L7F7 (Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1 SV=1)
HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 9.1e-16
Identity = 203/507 (40.04%), Postives = 283/507 (55.82%), Query Frame = 0
Query: 2 SGFSFGS--SSSPFSSAT---GFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSS 61
+GF FGS SS+P SS T GF ST +F FGSS+SSS P S F + +S S++
Sbjct: 48 TGFGFGSSVSSTPASSTTPSFGFGASSTPSFGFGSSASSSTP--SFGFGSSASVTPASTT 107
Query: 62 PSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTS--SAPLLGAPAS 121
PSFGF ++ SS S GSS A+S++ G + F F SS+S T+ S+ L GAPAS
Sbjct: 108 PSFGFGTAASSSAPAPS-LFGSSTTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFGAPAS 167
Query: 122 SGSSPAPL-FGAAPFSGS-----SSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTP 181
S ++P+ FGAAP SGS SS SLF+A S S SS+FG SS +S++P FG P
Sbjct: 168 SAATPSSSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASNSSLFGASSSAATSTSPLFGAP 227
Query: 182 ASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFG----------TSSSSGSAGSAF--FGSNPFAASS 241
S+A+ + +++A GS+S +FG SS+SGS+ S F GS+PF SS
Sbjct: 228 -SSATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASSASGSSPSIFGATGSSPFFGSS 287
Query: 242 SGTSSSISTSTLFTSSSSSA---SVSPF-QNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTT 301
SS+ ST +LF SSSS A S SPF ++ +SSS+ N S++S S+S+GF F +
Sbjct: 288 ---SSAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNASASPFSASTGFSFLKS 347
Query: 302 SLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGT 361
+ S TS S++ S+ ++SSSSFSFGT A+S GF++ STG SAAP +
Sbjct: 348 TASSTTS----STTPSAPPQTASSSSSFSFGTSANS------GFNL----STGSSAAPAS 407
Query: 362 AVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS-----FSVPAFSLSSSAATTL 421
+ + S+ +T TTTS+STPAA S S + P+F ++SSA T
Sbjct: 408 STSGAVFSI----------ATTTTTSSSTPAATSAPASSAPASTMAFPSFGVTSSATNTT 467
Query: 422 SIAASS---------APSTASSGAASSFTGFGV--TSTASSS------SATVSLSLPTKT 456
++++ A ST ++G+ +SFTGF V TST +SS S S SLP+ T
Sbjct: 468 PASSAATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTPASSSQPQTTSPAFSFSLPSST 523
BLAST of Lag0012105 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
Q75JC9 (Uncharacterized protein DDB_G0271670 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=DDB_G0271670 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 4.1e-08
Identity = 130/308 (42.21%), Postives = 199/308 (64.61%), Query Frame = 0
Query: 8 SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSS 67
+SSS SS++ + S+S+ S SSSSSS+ SSSS+ S+ SS+ + SSS S SS+SS
Sbjct: 65 TSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 124
Query: 68 PLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSPAPLFGAAP 127
S SS SS SS ++SSS +S + SSSS +SS+ + +SS SS + ++
Sbjct: 125 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 184
Query: 128 FSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASG 187
S SSS S +++ S +S+SS SS++SSS+ S + +S++S + ++S+++S
Sbjct: 185 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 244
Query: 188 SNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSS 247
S+S +SSSS S+ S+ S+ ++SSS +SSS S+S+ +SSSSS+S S +S SS
Sbjct: 245 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 304
Query: 248 SSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPAS 307
SSS + SSSS ++SSSS S++S S ++S ++ SSSSSS +S+S+SSSS S + +S
Sbjct: 305 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 364
Query: 308 SASQSSFG 316
S+S SS G
Sbjct: 365 SSSSSSSG 372
BLAST of Lag0012105 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1L2D4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 393.7 bits (1010), Expect = 1.3e-105
Identity = 353/541 (65.25%), Postives = 378/541 (69.87%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSN 60
MSGFSFG SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG SSSSSSNP SSSSAFSN
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSN 60
Query: 61 QSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSF 120
Q+SNP PSS+P S FPSS SSP SF SSG SGS+LF A+SSSGGL+SF
Sbjct: 61 QTSNP-PSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGISGSALFAASSSSGGLSSF 120
Query: 121 AFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP---------------------------------- 180
FG+SSSSG SSAP GA +SGSSP
Sbjct: 121 GFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGA 180
Query: 181 --------APLFGAAP----------------------------FSGSSSGSLFAAAPSV 240
APLFG+AP SGSSS F AAPSV
Sbjct: 181 APASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGASPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSV 240
Query: 241 GTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSA 300
GTSA S+FGG+SS T+SSAP FGT A TAS G ++ ASAAASGS+S L
Sbjct: 241 GTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSSL---------- 300
Query: 301 GSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAAS 360
FGSN FA+SSSGT SS+STS LF SSSSSAS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA
Sbjct: 301 ----FGSNSFASSSSGTLSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA- 360
Query: 361 SSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAA 420
SSSGF FSTTSLSK TSIT V+SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGF+ISNAA
Sbjct: 361 SSSGFSFSTTSLSKTTSIT-VASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFNISNAA 420
Query: 421 STGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSS 444
S GS+APGT K PTSL FSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSS
Sbjct: 421 SLEGSSAPGTTAAK-PTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSS 480
BLAST of Lag0012105 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1H7F5 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460276 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 391.7 bits (1005), Expect = 4.9e-105
Identity = 344/508 (67.72%), Postives = 374/508 (73.62%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSN 60
MSGFSFG SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG SSSSSSNP SSSSAFSN
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSN 60
Query: 61 QSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSF 120
Q+SNP PSS+P S FPSS SSP SF SSGSSGSSLF A+SSSGGL+SF
Sbjct: 61 QTSNP-PSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGSSGSSLFAASSSSGGLSSF 120
Query: 121 AFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP--------------APLFGAAPFSGSSSGSLFAA 180
FG+SSSSG SSAP GA +SGSSP APLFG+AP SGSS F A
Sbjct: 121 GFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGA 180
Query: 181 APSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAA---------------SAA 240
AP G+S + +FG S+ SS PSFG S S A S+A
Sbjct: 181 APGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSA 240
Query: 241 ASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSS---------GTSSSISTSTLFTSSSSS 300
A+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++ A+ SS +SSS+STS LF SSSSS
Sbjct: 241 ATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLFGSNPFASSSSVSTSNLFGSSSSS 300
Query: 301 ASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSAST 360
AS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT +SSSSSLTSAST
Sbjct: 301 ASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA-SSSGFSFSTTSLSKTTSIT-AASSSSSLTSAST 360
Query: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVT 420
SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGT K PTSL FSTSVAPLFSTVT
Sbjct: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAK-PTSLSFSTSVAPLFSTVT 420
Query: 421 TTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTA 444
TTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA
Sbjct: 421 TTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTA 480
BLAST of Lag0012105 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1H5C8 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460276 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 391.7 bits (1005), Expect = 4.9e-105
Identity = 344/508 (67.72%), Postives = 374/508 (73.62%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSN 60
MSGFSFG SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG SSSSSSNP SSSSAFSN
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSN 60
Query: 61 QSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSF 120
Q+SNP PSS+P S FPSS SSP SF SSGSSGSSLF A+SSSGGL+SF
Sbjct: 61 QTSNP-PSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGSSGSSLFAASSSSGGLSSF 120
Query: 121 AFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP--------------APLFGAAPFSGSSSGSLFAA 180
FG+SSSSG SSAP GA +SGSSP APLFG+AP SGSS F A
Sbjct: 121 GFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGA 180
Query: 181 APSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAA---------------SAA 240
AP G+S + +FG S+ SS PSFG S S A S+A
Sbjct: 181 APGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSA 240
Query: 241 ASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSS---------GTSSSISTSTLFTSSSSS 300
A+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++ A+ SS +SSS+STS LF SSSSS
Sbjct: 241 ATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLFGSNPFASSSSVSTSNLFGSSSSS 300
Query: 301 ASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSAST 360
AS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT +SSSSSLTSAST
Sbjct: 301 ASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA-SSSGFSFSTTSLSKTTSIT-AASSSSSLTSAST 360
Query: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVT 420
SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGT K PTSL FSTSVAPLFSTVT
Sbjct: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAK-PTSLSFSTSVAPLFSTVT 420
Query: 421 TTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTA 444
TTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA
Sbjct: 421 TTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTA 480
BLAST of Lag0012105 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A1S3CAD4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 383.6 bits (984), Expect = 1.3e-102
Identity = 349/509 (68.57%), Postives = 370/509 (72.69%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFSFG------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG---------SSSSSSNP-SSSSAF 60
MSGF FG SSSSPFSS TGF+FGST+ FSFG SSSSSSNP SSSS F
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPF 60
Query: 61 SNQSSNPAPSSSPSFG-----FPSSTSSPLSF----------------SSGSSGSSLFGA 120
N +SNP PSSS SFG F SSTSSP SF SS S SSLFG
Sbjct: 61 PNPTSNP-PSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGV 120
Query: 121 TSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLLGAPASS----------GSSPAPLFGAAPFSGS-- 180
+SSS G SF FG SSSS SSAPL GA +SS GSSPAP FGAAP SGS
Sbjct: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSV 180
Query: 181 -------------SSGSLFAAAPSVG-TSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLT 240
SS LF AAPS G +SA S+FGG SS T+SSAP FGT AS AS G
Sbjct: 181 APSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSA 240
Query: 241 LLAASAAASGSNSPLFGTSS-SSGSAGSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSA 300
L ASA ASGS + LFGTS+ SSGS GS FGS+PF ASSSGTSSS+STS LF SS SS
Sbjct: 241 LFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSS- 300
Query: 301 SVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNV--SSSSSSLTSAS 360
SPFQ+SLSSSSSQNL+SSSPFAA S SGF F T++LSK TSITNV SSSSSSLT AS
Sbjct: 301 --SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAA-SPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLAS 360
Query: 361 TSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTV 420
TSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGGS+AP T TK PTSL S SVAPLFSTV
Sbjct: 361 TSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATK-PTSLSLSNSVAPLFSTV 420
Query: 421 TTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTST 444
TTTSASTPAA+STTQPSFSVPAFS SSSAATTLSIAASSAPS ASSG SSFTGFGVTS+
Sbjct: 421 TTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSS 480
BLAST of Lag0012105 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1CMQ9 (nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012564 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 340.1 bits (871), Expect = 1.7e-89
Identity = 304/467 (65.10%), Postives = 326/467 (69.81%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFSFGSSS---------SPFSSATGFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNP 60
MSGF FGSSS SPFSS++GFAFGSTS FSFGSS P++S SSNP
Sbjct: 1 MSGFQFGSSSSQSSSSSSASPFSSSSGFAFGSTSTFSFGSSPF---PATS------SSNP 60
Query: 61 APSSSPSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLLGA 120
SP FG PSS SSGGL SF FG + S+G+SS L GA
Sbjct: 61 ----SPLFGAPSS-------------------AGSSGGLASFTFGTAPSAGSSSGSLFGA 120
Query: 121 PASSGSSPAPLFGAAP------FSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSF 180
++GSS +FGAAP +GSSS SLF AAPS G SA S+FGG SS
Sbjct: 121 APAAGSSSGSMFGAAPSGSSASSAGSSSFSLFGAAPSAGASAPSLFGGASS--------- 180
Query: 181 GTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFF---------GSNPFAASS 240
A T + G L ASAAASGS SPLFGT+SSSGS+GSA F GSNPF SS
Sbjct: 181 ---APTTTPGSALPGASAAASGSISPLFGTASSSGSSGSALFGASLSTNSLGSNPFGTSS 240
Query: 241 SGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSK 300
SG LF SS+S AS SPFQNS SSSSSQNLSSSSPFAASSSSGF F TTS SK
Sbjct: 241 SG---------LFASSTSLASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSFSK 300
Query: 301 ATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTK 360
AT+ SSSSS LTSASTSS SFSFGTPASSASQSSFGFS SNAAST SAAPGT TK
Sbjct: 301 ATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSNSNAASTAASAAPGTTATK 360
Query: 361 QPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPS 420
PTSL FSTSVAPLFSTVTTTSASTP A+STTQ SFSVPAFSLSSSAATT+S AASS PS
Sbjct: 361 -PTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQSSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPS 413
Query: 421 TASSGAASSFTGFGVTSTASSSSATVSLSLPTKTLTAASSSQAPASF 444
ASSGAASS+TGFGVT+TASSSSA VSLSLPTKTLTA+SSSQAPASF
Sbjct: 421 AASSGAASSYTGFGVTNTASSSSAIVSLSLPTKTLTASSSSQAPASF 413
BLAST of Lag0012105 vs. TAIR 10
Match:
AT2G45000.1 (structural constituent of nuclear pore )
HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 6.5e-17
Identity = 203/507 (40.04%), Postives = 283/507 (55.82%), Query Frame = 0
Query: 2 SGFSFGS--SSSPFSSAT---GFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSS 61
+GF FGS SS+P SS T GF ST +F FGSS+SSS P S F + +S S++
Sbjct: 48 TGFGFGSSVSSTPASSTTPSFGFGASSTPSFGFGSSASSSTP--SFGFGSSASVTPASTT 107
Query: 62 PSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTS--SAPLLGAPAS 121
PSFGF ++ SS S GSS A+S++ G + F F SS+S T+ S+ L GAPAS
Sbjct: 108 PSFGFGTAASSSAPAPS-LFGSSTTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFGAPAS 167
Query: 122 SGSSPAPL-FGAAPFSGS-----SSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTP 181
S ++P+ FGAAP SGS SS SLF+A S S SS+FG SS +S++P FG P
Sbjct: 168 SAATPSSSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASNSSLFGASSSAATSTSPLFGAP 227
Query: 182 ASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFG----------TSSSSGSAGSAF--FGSNPFAASS 241
S+A+ + +++A GS+S +FG SS+SGS+ S F GS+PF SS
Sbjct: 228 -SSATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASSASGSSPSIFGATGSSPFFGSS 287
Query: 242 SGTSSSISTSTLFTSSSSSA---SVSPF-QNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTT 301
SS+ ST +LF SSSS A S SPF ++ +SSS+ N S++S S+S+GF F +
Sbjct: 288 ---SSAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNASASPFSASTGFSFLKS 347
Query: 302 SLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGT 361
+ S TS S++ S+ ++SSSSFSFGT A+S GF++ STG SAAP +
Sbjct: 348 TASSTTS----STTPSAPPQTASSSSSFSFGTSANS------GFNL----STGSSAAPAS 407
Query: 362 AVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS-----FSVPAFSLSSSAATTL 421
+ + S+ +T TTTS+STPAA S S + P+F ++SSA T
Sbjct: 408 STSGAVFSI----------ATTTTTSSSTPAATSAPASSAPASTMAFPSFGVTSSATNTT 467
Query: 422 SIAASS---------APSTASSGAASSFTGFGV--TSTASSS------SATVSLSLPTKT 456
++++ A ST ++G+ +SFTGF V TST +SS S S SLP+ T
Sbjct: 468 PASSAATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTPASSSQPQTTSPAFSFSLPSST 523
The following BLAST results are available for this feature:
Match Name | E-value | Identity | Description | |
XP_023006514.1 | 2.6e-105 | 65.25 | nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita maxima] | [more] |
XP_038874708.1 | 2.6e-105 | 72.49 | nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida] | [more] |
XP_022959229.1 | 1.0e-104 | 67.72 | nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2 [Cucurbita moschata] | [more] |
XP_022959228.1 | 1.0e-104 | 67.72 | nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata] | [more] |
XP_023548092.1 | 3.8e-104 | 66.48 | nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
Q8L7F7 | 9.1e-16 | 40.04 | Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1... | [more] |
Q75JC9 | 4.1e-08 | 42.21 | Uncharacterized protein DDB_G0271670 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=DDB... | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
A0A6J1L2D4 | 1.3e-105 | 65.25 | nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 P... | [more] |
A0A6J1H7F5 | 4.9e-105 | 67.72 | nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=L... | [more] |
A0A6J1H5C8 | 4.9e-105 | 67.72 | nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=L... | [more] |
A0A1S3CAD4 | 1.3e-102 | 68.57 | nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 ... | [more] |
A0A6J1CMQ9 | 1.7e-89 | 65.10 | nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=367... | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
AT2G45000.1 | 6.5e-17 | 40.04 | structural constituent of nuclear pore | [more] |