Lag0012105 (gene) Sponge gourd (AG‐4) v1

Overview
NameLag0012105
Typegene
OrganismLuffa acutangula (Sponge gourd (AG‐4) v1)
Descriptionnuclear pore complex protein NUP62
Locationchr1: 37371599 .. 37373694 (+)
RNA-Seq ExpressionLag0012105
SyntenyLag0012105
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGTCAGGGTTCTCGTTCGGATCTTCTTCTTCGCCATTTTCATCGGCCACTGGTTTCGCATTCGGATCCACCTCCGCCTTCTCCTTCGGATCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTAGCTCCTCCTCTGCATTTTCAAATCAAAGCTCCAATCCCGCCCCTTCCTCTTCCCCTTCGTTCGGCTTCCCCTCCTCCACTTCCTCTCCTCTCTCTTTCTCTTCTGGAAGTTCAGGTTCTTCCCTCTTTGGTGCTACTTCATCCTCAGGAGGATTGACTTCTTTCGCGTTTGGGATTTCATCTTCATCGGGAACCTCATCTGCGCCATTGCTTGGGGCTCCTGCGTCCTCTGGGAGCTCACCTGCGCCCTTGTTTGGGGCAGCTCCGTTCTCTGGGAGCTCATCTGGGTCCTTGTTTGCTGCTGCTCCATCTGTAGGGACCTCGGCTTCGTCCGTTTTCGGAGGGCTGTCTTCTACAACTTCTTCTAGTGCGCCATCGTTTGGCACGCCTGCATCCACTGCAAGTCAGGGACTGACGTTGCTTGCCGCATCTGCAGCGGCTTCAGGTTCTAATTCGCCCCTGTTTGGGACATCTTCATCTTCAGGAAGTGCAGGTTCAGCTTTTTTTGGGTCTAATCCATTTGCTGCATCTTCTTCGGGCACGTCGTCTTCGATTTCTACTTCGACCTTGTTTACGTCATCTTCATCATCAGCTTCGGTTTCTCCATTCCAAAATTCTCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGAGTTCCTCTTCACCATTCGCGGCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTCCATTTTCAACCACTTCTTTATCCAAAGCTACTAGTATTACCAACGTGTCTTCCTCTTCTTCTTCTCTTACATCAGCTTCAACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTTGGAACGCCTGCTTCCTCGGCATCTCAATCTTCTTTTGGGTTTAGTATCAGCAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTGCTGCTCCAGGCACTGCAGTTACAAAGCAGCCTACTTCTCTACCGTTTTCAACTTCCGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTAACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCTAATAGCACAACCCAGCCATCTTTCTCCGTTCCAGCTTTTAGTTTGAGTTCTTCAGCCGCTACTACCTTATCGATAGCAGCATCCTCCGCCCCCTCAACTGCTTCCTCAGGTGCTGCGAGTTCGTTTACAGGTTTTGGTGTCACAAGCACGGCTTCTTCATCAAGTGCAACTGTTTCCTTATCGTTGCCAACCAAAACATTGACTGCTGCTTCATCATCGCAAGCCCCAGCCTCTTTCGGTAAGTTCTTCACTTTCTTCTTTTTACTTTGTGATGCAGAATTTATCTTATTGGTTGATCTGAATGAGTTTTGTGTCATGTTGTTCAATATTTTTTTTTTCGTCTTTTTTGGAGTTGTATCTGTATAAATGTAGTGAAGACACATTCAAATTTTCTTTTGGTTGATATAAATGATCTTTTGCACTATATTCTATGGTCAATGTTATGACAATTATCATTTTAGGATTATACTTTTTTTTTTCCTTTTGAAAAGATTAGGATTACACTTCAGTATGCTGTCGAATAGAATTTTAATGGTGAACTACGTTGGTAGTGATTAATAAGTAGAAGAAGCCTGGGTTATGTGGGAACAATTGGTGCATTTTGGGGGATTTTAATGTCACCCGTTCCCCTTTGGAGAAGGCTTCGGGAGGGAGGGTGTCTAAATCGATGAAGTTGTTCAACGAGTGGATTGAAGATTGCAGTCTGTATGATCCCCTTATTTAATGGGAAGTTTACCTGGGCTAACAATAGAGCGTGCAGTAGAATTGACAGAATCTTGTGTGCTCAGGGCTGGATGGATACCTTCAAGTGTGTCAAGCAATCCTTAGGTCCTAGAGTCACCTCTGATCACTGGCCTTTAATTTTTGTTTCGGGTCCTCAGAAGTGGGGACCTTGCCCCTTTCGCTTTGAGAACATGTGGTTGGATCACCCTTCCTTCAAATCTTCCTTCCAGTCCTGGTGGATGTTGAGGTTTCAGGGAAGTGGGAAGGCTACAGATTTATGA

mRNA sequence

ATGTCAGGGTTCTCGTTCGGATCTTCTTCTTCGCCATTTTCATCGGCCACTGGTTTCGCATTCGGATCCACCTCCGCCTTCTCCTTCGGATCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTAGCTCCTCCTCTGCATTTTCAAATCAAAGCTCCAATCCCGCCCCTTCCTCTTCCCCTTCGTTCGGCTTCCCCTCCTCCACTTCCTCTCCTCTCTCTTTCTCTTCTGGAAGTTCAGGTTCTTCCCTCTTTGGTGCTACTTCATCCTCAGGAGGATTGACTTCTTTCGCGTTTGGGATTTCATCTTCATCGGGAACCTCATCTGCGCCATTGCTTGGGGCTCCTGCGTCCTCTGGGAGCTCACCTGCGCCCTTGTTTGGGGCAGCTCCGTTCTCTGGGAGCTCATCTGGGTCCTTGTTTGCTGCTGCTCCATCTGTAGGGACCTCGGCTTCGTCCGTTTTCGGAGGGCTGTCTTCTACAACTTCTTCTAGTGCGCCATCGTTTGGCACGCCTGCATCCACTGCAAGTCAGGGACTGACGTTGCTTGCCGCATCTGCAGCGGCTTCAGGTTCTAATTCGCCCCTGTTTGGGACATCTTCATCTTCAGGAAGTGCAGGTTCAGCTTTTTTTGGGTCTAATCCATTTGCTGCATCTTCTTCGGGCACGTCGTCTTCGATTTCTACTTCGACCTTGTTTACGTCATCTTCATCATCAGCTTCGGTTTCTCCATTCCAAAATTCTCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGAGTTCCTCTTCACCATTCGCGGCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTCCATTTTCAACCACTTCTTTATCCAAAGCTACTAGTATTACCAACGTGTCTTCCTCTTCTTCTTCTCTTACATCAGCTTCAACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTTGGAACGCCTGCTTCCTCGGCATCTCAATCTTCTTTTGGGTTTAGTATCAGCAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTGCTGCTCCAGGCACTGCAGTTACAAAGCAGCCTACTTCTCTACCGTTTTCAACTTCCGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTAACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCTAATAGCACAACCCAGCCATCTTTCTCCGTTCCAGCTTTTAGTTTGAGTTCTTCAGCCGCTACTACCTTATCGATAGCAGCATCCTCCGCCCCCTCAACTGCTTCCTCAGGTGCTGCGAGTTCGTTTACAGGTTTTGGTGTCACAAGCACGGCTTCTTCATCAAGTGCAACTGTTTCCTTATCGTTGCCAACCAAAACATTGACTGCTGCTTCATCATCGCAAGCCCCAGCCTCTTTCGTCTGTATGATCCCCTTATTTAATGGGAAGTTTACCTGGGCTAACAATAGAGCGTGCAGTAGAATTGACAGAATCTTGTGTGCTCAGGGCTGGATGGATACCTTCAAGTGTGTCAAGCAATCCTTAGGTCCTAGAGTCACCTCTGATCACTGGCCTTTAATTTTTGTTTCGGGTCCTCAGAAGTGGGGACCTTGCCCCTTTCGCTTTGAGAACATGTGGTTGGATCACCCTTCCTTCAAATCTTCCTTCCAGTCCTGGTGGATGTTGAGGTTTCAGGGAAGTGGGAAGGCTACAGATTTATGA

Coding sequence (CDS)

ATGTCAGGGTTCTCGTTCGGATCTTCTTCTTCGCCATTTTCATCGGCCACTGGTTTCGCATTCGGATCCACCTCCGCCTTCTCCTTCGGATCCTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTAGCTCCTCCTCTGCATTTTCAAATCAAAGCTCCAATCCCGCCCCTTCCTCTTCCCCTTCGTTCGGCTTCCCCTCCTCCACTTCCTCTCCTCTCTCTTTCTCTTCTGGAAGTTCAGGTTCTTCCCTCTTTGGTGCTACTTCATCCTCAGGAGGATTGACTTCTTTCGCGTTTGGGATTTCATCTTCATCGGGAACCTCATCTGCGCCATTGCTTGGGGCTCCTGCGTCCTCTGGGAGCTCACCTGCGCCCTTGTTTGGGGCAGCTCCGTTCTCTGGGAGCTCATCTGGGTCCTTGTTTGCTGCTGCTCCATCTGTAGGGACCTCGGCTTCGTCCGTTTTCGGAGGGCTGTCTTCTACAACTTCTTCTAGTGCGCCATCGTTTGGCACGCCTGCATCCACTGCAAGTCAGGGACTGACGTTGCTTGCCGCATCTGCAGCGGCTTCAGGTTCTAATTCGCCCCTGTTTGGGACATCTTCATCTTCAGGAAGTGCAGGTTCAGCTTTTTTTGGGTCTAATCCATTTGCTGCATCTTCTTCGGGCACGTCGTCTTCGATTTCTACTTCGACCTTGTTTACGTCATCTTCATCATCAGCTTCGGTTTCTCCATTCCAAAATTCTCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGAGTTCCTCTTCACCATTCGCGGCTTCTTCTTCTTCTGGGTTTCCATTTTCAACCACTTCTTTATCCAAAGCTACTAGTATTACCAACGTGTCTTCCTCTTCTTCTTCTCTTACATCAGCTTCAACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTTGGAACGCCTGCTTCCTCGGCATCTCAATCTTCTTTTGGGTTTAGTATCAGCAATGCAGCATCGACGGGAGGGTCTGCTGCTCCAGGCACTGCAGTTACAAAGCAGCCTACTTCTCTACCGTTTTCAACTTCCGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTAACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCTAATAGCACAACCCAGCCATCTTTCTCCGTTCCAGCTTTTAGTTTGAGTTCTTCAGCCGCTACTACCTTATCGATAGCAGCATCCTCCGCCCCCTCAACTGCTTCCTCAGGTGCTGCGAGTTCGTTTACAGGTTTTGGTGTCACAAGCACGGCTTCTTCATCAAGTGCAACTGTTTCCTTATCGTTGCCAACCAAAACATTGACTGCTGCTTCATCATCGCAAGCCCCAGCCTCTTTCGTCTGTATGATCCCCTTATTTAATGGGAAGTTTACCTGGGCTAACAATAGAGCGTGCAGTAGAATTGACAGAATCTTGTGTGCTCAGGGCTGGATGGATACCTTCAAGTGTGTCAAGCAATCCTTAGGTCCTAGAGTCACCTCTGATCACTGGCCTTTAATTTTTGTTTCGGGTCCTCAGAAGTGGGGACCTTGCCCCTTTCGCTTTGAGAACATGTGGTTGGATCACCCTTCCTTCAAATCTTCCTTCCAGTCCTGGTGGATGTTGAGGTTTCAGGGAAGTGGGAAGGCTACAGATTTATGA

Protein sequence

MSGFSFGSSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSPAPLFGAAPFSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTASSSSATVSLSLPTKTLTAASSSQAPASFVCMIPLFNGKFTWANNRACSRIDRILCAQGWMDTFKCVKQSLGPRVTSDHWPLIFVSGPQKWGPCPFRFENMWLDHPSFKSSFQSWWMLRFQGSGKATDL
Homology
BLAST of Lag0012105 vs. NCBI nr
Match: XP_023006514.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 393.7 bits (1010), Expect = 2.6e-105
Identity = 353/541 (65.25%), Postives = 378/541 (69.87%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSN 60
           MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG      SSSSSSNP SSSSAFSN
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSN 60

Query: 61  QSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSF 120
           Q+SNP PSS+P    S  FPSS SSP SF         SSG SGS+LF A+SSSGGL+SF
Sbjct: 61  QTSNP-PSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGISGSALFAASSSSGGLSSF 120

Query: 121 AFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP---------------------------------- 180
            FG+SSSSG SSAP  GA  +SGSSP                                  
Sbjct: 121 GFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGA 180

Query: 181 --------APLFGAAP----------------------------FSGSSSGSLFAAAPSV 240
                   APLFG+AP                             SGSSS   F AAPSV
Sbjct: 181 APASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGASPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSV 240

Query: 241 GTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSA 300
           GTSA S+FGG+SS  T+SSAP FGT A TAS G ++  ASAAASGS+S L          
Sbjct: 241 GTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSSL---------- 300

Query: 301 GSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAAS 360
               FGSN FA+SSSGT SS+STS LF SSSSSAS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA 
Sbjct: 301 ----FGSNSFASSSSGTLSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA- 360

Query: 361 SSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAA 420
           SSSGF FSTTSLSK TSIT V+SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGF+ISNAA
Sbjct: 361 SSSGFSFSTTSLSKTTSIT-VASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFNISNAA 420

Query: 421 STGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSS 444
           S  GS+APGT   K PTSL FSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSS
Sbjct: 421 SLEGSSAPGTTAAK-PTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSS 480

BLAST of Lag0012105 vs. NCBI nr
Match: XP_038874708.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 393.7 bits (1010), Expect = 2.6e-105
Identity = 332/458 (72.49%), Postives = 357/458 (77.95%), Query Frame = 0

Query: 2   SGFSFGSSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG--------SSSSSSNP-SSSSAFSNQSSNPA 61
           S   + SSSSPFSS+TGF+FGSTSAFSFG        SSSSSSNP SSSS FSNQ+ NPA
Sbjct: 9   SSSQWSSSSSPFSSSTGFSFGSTSAFSFGSSSTPLSLSSSSSSNPTSSSSPFSNQTPNPA 68

Query: 62  PSSSPSFG---FPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLL 121
            SSS  FG   FPSS SSP SFS       LFG+  SSG  ++  FG +SSSG+S AP  
Sbjct: 69  SSSSSGFGSSSFPSSASSPFSFS-----LPLFGSAPSSGTSSAPLFGSASSSGSSPAPSF 128

Query: 122 GAPASSGSSPAPLFGAAPFSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFG-TP 181
           G  +SSGSS  P FGA P SGSSS  LF A PS G SA S+FGG+SS T+SSAP FG T 
Sbjct: 129 GPASSSGSSLVPSFGALPSSGSSSAPLFGATPSAGASAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTTS 188

Query: 182 ASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTL 241
           ASTAS G  L  AS AASGS+S LFGTS++SGS+GSA FGS+PF     G SSS+STS L
Sbjct: 189 ASTASPGSALFGASVAASGSSSSLFGTSTTSGSSGSALFGSSPF-----GASSSLSTSNL 248

Query: 242 FTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAA---SSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSS 301
           F SSSSS S SPFQNS SSSSSQNL+SSS FAA   SSSSGF FST SLSK TSIT  +S
Sbjct: 249 FASSSSSTSTSPFQNSFSSSSSQNLNSSSLFAASSSSSSSGFSFSTVSLSKTTSIT-TAS 308

Query: 302 SSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFST 361
           SSSSLT+ASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+AP T  TK PTSL  S+
Sbjct: 309 SSSSLTTASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPSTTATK-PTSLSLSS 368

Query: 362 SVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASS 421
           SVAPLFSTVTTTS STPAANSTTQPSFSVPAFS SSSAATTLSIAASS PS +SSGA SS
Sbjct: 369 SVAPLFSTVTTTSGSTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSVPSASSSGAVSS 428

Query: 422 FTGFGVTSTASSSSATVSLSLPTKTLTAASSSQAPASF 444
           FTGFGVTS ASSSSA  SLSLPTKT TAASSSQAPASF
Sbjct: 429 FTGFGVTSMASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASF 454

BLAST of Lag0012105 vs. NCBI nr
Match: XP_022959229.1 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 391.7 bits (1005), Expect = 1.0e-104
Identity = 344/508 (67.72%), Postives = 374/508 (73.62%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSN 60
           MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG      SSSSSSNP SSSSAFSN
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSN 60

Query: 61  QSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSF 120
           Q+SNP PSS+P    S  FPSS SSP SF         SSGSSGSSLF A+SSSGGL+SF
Sbjct: 61  QTSNP-PSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGSSGSSLFAASSSSGGLSSF 120

Query: 121 AFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP--------------APLFGAAPFSGSSSGSLFAA 180
            FG+SSSSG SSAP  GA  +SGSSP              APLFG+AP SGSS    F A
Sbjct: 121 GFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGA 180

Query: 181 APSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAA---------------SAA 240
           AP  G+S + +FG   S+ SS  PSFG   S  S       A               S+A
Sbjct: 181 APGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSA 240

Query: 241 ASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSS---------GTSSSISTSTLFTSSSSS 300
           A+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++  A+ SS          +SSS+STS LF SSSSS
Sbjct: 241 ATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLFGSNPFASSSSVSTSNLFGSSSSS 300

Query: 301 ASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSAST 360
           AS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT  +SSSSSLTSAST
Sbjct: 301 ASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA-SSSGFSFSTTSLSKTTSIT-AASSSSSLTSAST 360

Query: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVT 420
           SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGT   K PTSL FSTSVAPLFSTVT
Sbjct: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAK-PTSLSFSTSVAPLFSTVT 420

Query: 421 TTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTA 444
           TTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA
Sbjct: 421 TTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTA 480

BLAST of Lag0012105 vs. NCBI nr
Match: XP_022959228.1 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 391.7 bits (1005), Expect = 1.0e-104
Identity = 344/508 (67.72%), Postives = 374/508 (73.62%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSN 60
           MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG      SSSSSSNP SSSSAFSN
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSN 60

Query: 61  QSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSF 120
           Q+SNP PSS+P    S  FPSS SSP SF         SSGSSGSSLF A+SSSGGL+SF
Sbjct: 61  QTSNP-PSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGSSGSSLFAASSSSGGLSSF 120

Query: 121 AFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP--------------APLFGAAPFSGSSSGSLFAA 180
            FG+SSSSG SSAP  GA  +SGSSP              APLFG+AP SGSS    F A
Sbjct: 121 GFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGA 180

Query: 181 APSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAA---------------SAA 240
           AP  G+S + +FG   S+ SS  PSFG   S  S       A               S+A
Sbjct: 181 APGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSA 240

Query: 241 ASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSS---------GTSSSISTSTLFTSSSSS 300
           A+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++  A+ SS          +SSS+STS LF SSSSS
Sbjct: 241 ATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLFGSNPFASSSSVSTSNLFGSSSSS 300

Query: 301 ASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSAST 360
           AS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT  +SSSSSLTSAST
Sbjct: 301 ASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA-SSSGFSFSTTSLSKTTSIT-AASSSSSLTSAST 360

Query: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVT 420
           SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGT   K PTSL FSTSVAPLFSTVT
Sbjct: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAK-PTSLSFSTSVAPLFSTVT 420

Query: 421 TTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTA 444
           TTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA
Sbjct: 421 TTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTA 480

BLAST of Lag0012105 vs. NCBI nr
Match: XP_023548092.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 389.8 bits (1000), Expect = 3.8e-104
Identity = 347/522 (66.48%), Postives = 375/522 (71.84%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSN 60
           MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG      SSSSSSNP SSSSAFSN
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSN 60

Query: 61  QSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSF 120
           Q+SNP PSS+P    S  FPSS SSP SF         SSGSSGSSLF A+SSSGGL+SF
Sbjct: 61  QTSNP-PSSTPFGFASSPFPSSASSPFSFSLPAASTGVSSGSSGSSLFAASSSSGGLSSF 120

Query: 121 AFGISSS----------------------------SGTSSAPLLGAPASSGSSPAPLFGA 180
            FG+SSS                            SGTS APL G+  SSGSSP P FGA
Sbjct: 121 GFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGA 180

Query: 181 APFSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAA---- 240
           AP SGSS   LF +APS G+S    FG   S  SS  PSFG  +S+ S       A    
Sbjct: 181 APASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSA 240

Query: 241 -----------SAAASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSS---------GTSS 300
                      S+AA+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++  A+ SS          +SS
Sbjct: 241 GASAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSSLFGSSPFASSS 300

Query: 301 SISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSIT 360
           S+STS LF SSSSSAS SPFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT
Sbjct: 301 SVSTSNLFGSSSSSASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA-SSSGFSFSTTSLSKTTSIT 360

Query: 361 NVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSL 420
             +SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGT   K PTSL
Sbjct: 361 -AASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAK-PTSL 420

Query: 421 PFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSG 444
            FSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASSAPST SSG
Sbjct: 421 SFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSG 480

BLAST of Lag0012105 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L7F7 (Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 9.1e-16
Identity = 203/507 (40.04%), Postives = 283/507 (55.82%), Query Frame = 0

Query: 2   SGFSFGS--SSSPFSSAT---GFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSS 61
           +GF FGS  SS+P SS T   GF   ST +F FGSS+SSS P  S  F + +S    S++
Sbjct: 48  TGFGFGSSVSSTPASSTTPSFGFGASSTPSFGFGSSASSSTP--SFGFGSSASVTPASTT 107

Query: 62  PSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTS--SAPLLGAPAS 121
           PSFGF ++ SS     S   GSS   A+S++ G + F F  SS+S T+  S+ L GAPAS
Sbjct: 108 PSFGFGTAASSSAPAPS-LFGSSTTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFGAPAS 167

Query: 122 SGSSPAPL-FGAAPFSGS-----SSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTP 181
           S ++P+   FGAAP SGS     SS SLF+A  S   S SS+FG  SS  +S++P FG P
Sbjct: 168 SAATPSSSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASNSSLFGASSSAATSTSPLFGAP 227

Query: 182 ASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFG----------TSSSSGSAGSAF--FGSNPFAASS 241
            S+A+      + +++A GS+S +FG           SS+SGS+ S F   GS+PF  SS
Sbjct: 228 -SSATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASSASGSSPSIFGATGSSPFFGSS 287

Query: 242 SGTSSSISTSTLFTSSSSSA---SVSPF-QNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTT 301
              SS+ ST +LF SSSS A   S SPF  ++ +SSS+ N S++S    S+S+GF F  +
Sbjct: 288 ---SSAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNASASPFSASTGFSFLKS 347

Query: 302 SLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGT 361
           + S  TS    S++ S+    ++SSSSFSFGT A+S      GF++    STG SAAP +
Sbjct: 348 TASSTTS----STTPSAPPQTASSSSSFSFGTSANS------GFNL----STGSSAAPAS 407

Query: 362 AVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS-----FSVPAFSLSSSAATTL 421
           + +    S+          +T TTTS+STPAA S    S      + P+F ++SSA  T 
Sbjct: 408 STSGAVFSI----------ATTTTTSSSTPAATSAPASSAPASTMAFPSFGVTSSATNTT 467

Query: 422 SIAASS---------APSTASSGAASSFTGFGV--TSTASSS------SATVSLSLPTKT 456
             ++++         A ST ++G+ +SFTGF V  TST +SS      S   S SLP+ T
Sbjct: 468 PASSAATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTPASSSQPQTTSPAFSFSLPSST 523

BLAST of Lag0012105 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q75JC9 (Uncharacterized protein DDB_G0271670 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=DDB_G0271670 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 4.1e-08
Identity = 130/308 (42.21%), Postives = 199/308 (64.61%), Query Frame = 0

Query: 8   SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSSPSFGFPSSTSS 67
           +SSS  SS++  +  S+S+ S  SSSSSS+ SSSS+ S+ SS+ + SSS S    SS+SS
Sbjct: 65  TSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 124

Query: 68  PLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSPAPLFGAAP 127
             S SS SS SS   ++SSS   +S +   SSSS +SS+    + +SS SS +    ++ 
Sbjct: 125 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 184

Query: 128 FSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASG 187
            S SSS S  +++ S  +S+SS     SS++SSS+ S  + +S++S   +  ++S+++S 
Sbjct: 185 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 244

Query: 188 SNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSS 247
           S+S    +SSSS S+ S+   S+  ++SSS +SSS S+S+  +SSSSS+S S   +S SS
Sbjct: 245 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 304

Query: 248 SSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPAS 307
           SSS + SSSS  ++SSSS    S++S S ++S ++ SSSSSS +S+S+SSSS S  + +S
Sbjct: 305 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 364

Query: 308 SASQSSFG 316
           S+S SS G
Sbjct: 365 SSSSSSSG 372

BLAST of Lag0012105 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L2D4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 393.7 bits (1010), Expect = 1.3e-105
Identity = 353/541 (65.25%), Postives = 378/541 (69.87%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSN 60
           MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG      SSSSSSNP SSSSAFSN
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSN 60

Query: 61  QSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSF 120
           Q+SNP PSS+P    S  FPSS SSP SF         SSG SGS+LF A+SSSGGL+SF
Sbjct: 61  QTSNP-PSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGISGSALFAASSSSGGLSSF 120

Query: 121 AFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP---------------------------------- 180
            FG+SSSSG SSAP  GA  +SGSSP                                  
Sbjct: 121 GFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGA 180

Query: 181 --------APLFGAAP----------------------------FSGSSSGSLFAAAPSV 240
                   APLFG+AP                             SGSSS   F AAPSV
Sbjct: 181 APASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGASPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAPSV 240

Query: 241 GTSASSVFGGLSS-TTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSA 300
           GTSA S+FGG+SS  T+SSAP FGT A TAS G ++  ASAAASGS+S L          
Sbjct: 241 GTSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSSL---------- 300

Query: 301 GSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAAS 360
               FGSN FA+SSSGT SS+STS LF SSSSSAS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA 
Sbjct: 301 ----FGSNSFASSSSGTLSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA- 360

Query: 361 SSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAA 420
           SSSGF FSTTSLSK TSIT V+SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGF+ISNAA
Sbjct: 361 SSSGFSFSTTSLSKTTSIT-VASSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFNISNAA 420

Query: 421 STGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSS 444
           S  GS+APGT   K PTSL FSTSVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSS
Sbjct: 421 SLEGSSAPGTTAAK-PTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSS 480

BLAST of Lag0012105 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H7F5 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460276 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 391.7 bits (1005), Expect = 4.9e-105
Identity = 344/508 (67.72%), Postives = 374/508 (73.62%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSN 60
           MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG      SSSSSSNP SSSSAFSN
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSN 60

Query: 61  QSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSF 120
           Q+SNP PSS+P    S  FPSS SSP SF         SSGSSGSSLF A+SSSGGL+SF
Sbjct: 61  QTSNP-PSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGSSGSSLFAASSSSGGLSSF 120

Query: 121 AFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP--------------APLFGAAPFSGSSSGSLFAA 180
            FG+SSSSG SSAP  GA  +SGSSP              APLFG+AP SGSS    F A
Sbjct: 121 GFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGA 180

Query: 181 APSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAA---------------SAA 240
           AP  G+S + +FG   S+ SS  PSFG   S  S       A               S+A
Sbjct: 181 APGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSA 240

Query: 241 ASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSS---------GTSSSISTSTLFTSSSSS 300
           A+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++  A+ SS          +SSS+STS LF SSSSS
Sbjct: 241 ATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLFGSNPFASSSSVSTSNLFGSSSSS 300

Query: 301 ASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSAST 360
           AS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT  +SSSSSLTSAST
Sbjct: 301 ASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA-SSSGFSFSTTSLSKTTSIT-AASSSSSLTSAST 360

Query: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVT 420
           SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGT   K PTSL FSTSVAPLFSTVT
Sbjct: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAK-PTSLSFSTSVAPLFSTVT 420

Query: 421 TTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTA 444
           TTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA
Sbjct: 421 TTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTA 480

BLAST of Lag0012105 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H5C8 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460276 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 391.7 bits (1005), Expect = 4.9e-105
Identity = 344/508 (67.72%), Postives = 374/508 (73.62%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFSFG-------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG------SSSSSSNP-SSSSAFSN 60
           MSGFSFG       SSSSPFSS TGF+FGSTSAFSFG      SSSSSSNP SSSSAFSN
Sbjct: 1   MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGSSPLSLSSSSSSNPSSSSSAFSN 60

Query: 61  QSSNPAPSSSP----SFGFPSSTSSPLSF---------SSGSSGSSLFGATSSSGGLTSF 120
           Q+SNP PSS+P    S  FPSS SSP SF         SSGSSGSSLF A+SSSGGL+SF
Sbjct: 61  QTSNP-PSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGSSGSSLFAASSSSGGLSSF 120

Query: 121 AFGISSSSGTSSAPLLGAPASSGSSP--------------APLFGAAPFSGSSSGSLFAA 180
            FG+SSSSG SSAP  GA  +SGSSP              APLFG+AP SGSS    F A
Sbjct: 121 GFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSFGA 180

Query: 181 APSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLTLLAA---------------SAA 240
           AP  G+S + +FG   S+ SS  PSFG   S  S       A               S+A
Sbjct: 181 APGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAGTSAPSLFGGVSSA 240

Query: 241 ASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFFGSNPFAASSS---------GTSSSISTSTLFTSSSSS 300
           A+ S++PLFGTS+ + S GS+ FG++  A+ SS          +SSS+STS LF SSSSS
Sbjct: 241 ATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSSLFGSNPFASSSSVSTSNLFGSSSSS 300

Query: 301 ASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNVSSSSSSLTSAST 360
           AS +PFQNS SSSSSQNLSSSSPFAA SSSGF FSTTSLSK TSIT  +SSSSSLTSAST
Sbjct: 301 ASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA-SSSGFSFSTTSLSKTTSIT-AASSSSSLTSAST 360

Query: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVT 420
           SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGS+APGT   K PTSL FSTSVAPLFSTVT
Sbjct: 361 SSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAK-PTSLSFSTSVAPLFSTVT 420

Query: 421 TTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTSTA 444
           TTSASTPAA ST QPSFS+PAFSLSSSAATTLSIAASS PST SSGAASSFTGFGVTSTA
Sbjct: 421 TTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTA 480

BLAST of Lag0012105 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CAD4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 383.6 bits (984), Expect = 1.3e-102
Identity = 349/509 (68.57%), Postives = 370/509 (72.69%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFSFG------SSSSPFSSATGFAFGSTSAFSFG---------SSSSSSNP-SSSSAF 60
           MSGF FG      SSSSPFSS TGF+FGST+ FSFG         SSSSSSNP SSSS F
Sbjct: 1   MSGFGFGSSTSQSSSSSPFSSTTGFSFGSTT-FSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPF 60

Query: 61  SNQSSNPAPSSSPSFG-----FPSSTSSPLSF----------------SSGSSGSSLFGA 120
            N +SNP PSSS SFG     F SSTSSP SF                SS  S SSLFG 
Sbjct: 61  PNPTSNP-PSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGV 120

Query: 121 TSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLLGAPASS----------GSSPAPLFGAAPFSGS-- 180
           +SSS G  SF FG SSSS  SSAPL GA +SS          GSSPAP FGAAP SGS  
Sbjct: 121 SSSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSV 180

Query: 181 -------------SSGSLFAAAPSVG-TSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTPASTASQGLT 240
                        SS  LF AAPS G +SA S+FGG SS T+SSAP FGT AS AS G  
Sbjct: 181 APSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSA 240

Query: 241 LLAASAAASGSNSPLFGTSS-SSGSAGSAFFGSNPFAASSSGTSSSISTSTLFTSSSSSA 300
           L  ASA ASGS + LFGTS+ SSGS GS  FGS+PF ASSSGTSSS+STS LF SS SS 
Sbjct: 241 LFGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSS- 300

Query: 301 SVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSKATSITNV--SSSSSSLTSAS 360
             SPFQ+SLSSSSSQNL+SSSPFAA S SGF F T++LSK TSITNV  SSSSSSLT AS
Sbjct: 301 --SPFQSSLSSSSSQNLTSSSPFAA-SPSGFSFPTSTLSKTTSITNVPSSSSSSSLTLAS 360

Query: 361 TSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTV 420
           TSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGGS+AP T  TK PTSL  S SVAPLFSTV
Sbjct: 361 TSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATK-PTSLSLSNSVAPLFSTV 420

Query: 421 TTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTASSGAASSFTGFGVTST 444
           TTTSASTPAA+STTQPSFSVPAFS SSSAATTLSIAASSAPS ASSG  SSFTGFGVTS+
Sbjct: 421 TTTSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSS 480

BLAST of Lag0012105 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CMQ9 (nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012564 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 340.1 bits (871), Expect = 1.7e-89
Identity = 304/467 (65.10%), Postives = 326/467 (69.81%), Query Frame = 0

Query: 1   MSGFSFGSSS---------SPFSSATGFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNP 60
           MSGF FGSSS         SPFSS++GFAFGSTS FSFGSS     P++S      SSNP
Sbjct: 1   MSGFQFGSSSSQSSSSSSASPFSSSSGFAFGSTSTFSFGSSPF---PATS------SSNP 60

Query: 61  APSSSPSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTSSAPLLGA 120
               SP FG PSS                     SSGGL SF FG + S+G+SS  L GA
Sbjct: 61  ----SPLFGAPSS-------------------AGSSGGLASFTFGTAPSAGSSSGSLFGA 120

Query: 121 PASSGSSPAPLFGAAP------FSGSSSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSF 180
             ++GSS   +FGAAP       +GSSS SLF AAPS G SA S+FGG SS         
Sbjct: 121 APAAGSSSGSMFGAAPSGSSASSAGSSSFSLFGAAPSAGASAPSLFGGASS--------- 180

Query: 181 GTPASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFGTSSSSGSAGSAFF---------GSNPFAASS 240
              A T + G  L  ASAAASGS SPLFGT+SSSGS+GSA F         GSNPF  SS
Sbjct: 181 ---APTTTPGSALPGASAAASGSISPLFGTASSSGSSGSALFGASLSTNSLGSNPFGTSS 240

Query: 241 SGTSSSISTSTLFTSSSSSASVSPFQNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTTSLSK 300
           SG         LF SS+S AS SPFQNS SSSSSQNLSSSSPFAASSSSGF F TTS SK
Sbjct: 241 SG---------LFASSTSLASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSFSK 300

Query: 301 ATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGTAVTK 360
           AT+    SSSSS LTSASTSS SFSFGTPASSASQSSFGFS SNAAST  SAAPGT  TK
Sbjct: 301 ATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSNSNAASTAASAAPGTTATK 360

Query: 361 QPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTLSIAASSAPS 420
            PTSL FSTSVAPLFSTVTTTSASTP A+STTQ SFSVPAFSLSSSAATT+S AASS PS
Sbjct: 361 -PTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQSSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPS 413

Query: 421 TASSGAASSFTGFGVTSTASSSSATVSLSLPTKTLTAASSSQAPASF 444
            ASSGAASS+TGFGVT+TASSSSA VSLSLPTKTLTA+SSSQAPASF
Sbjct: 421 AASSGAASSYTGFGVTNTASSSSAIVSLSLPTKTLTASSSSQAPASF 413

BLAST of Lag0012105 vs. TAIR 10
Match: AT2G45000.1 (structural constituent of nuclear pore )

HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 6.5e-17
Identity = 203/507 (40.04%), Postives = 283/507 (55.82%), Query Frame = 0

Query: 2   SGFSFGS--SSSPFSSAT---GFAFGSTSAFSFGSSSSSSNPSSSSAFSNQSSNPAPSSS 61
           +GF FGS  SS+P SS T   GF   ST +F FGSS+SSS P  S  F + +S    S++
Sbjct: 48  TGFGFGSSVSSTPASSTTPSFGFGASSTPSFGFGSSASSSTP--SFGFGSSASVTPASTT 107

Query: 62  PSFGFPSSTSSPLSFSSGSSGSSLFGATSSSGGLTSFAFGISSSSGTS--SAPLLGAPAS 121
           PSFGF ++ SS     S   GSS   A+S++ G + F F  SS+S T+  S+ L GAPAS
Sbjct: 108 PSFGFGTAASSSAPAPS-LFGSSTTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFGAPAS 167

Query: 122 SGSSPAPL-FGAAPFSGS-----SSGSLFAAAPSVGTSASSVFGGLSSTTSSSAPSFGTP 181
           S ++P+   FGAAP SGS     SS SLF+A  S   S SS+FG  SS  +S++P FG P
Sbjct: 168 SAATPSSSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASNSSLFGASSSAATSTSPLFGAP 227

Query: 182 ASTASQGLTLLAASAAASGSNSPLFG----------TSSSSGSAGSAF--FGSNPFAASS 241
            S+A+      + +++A GS+S +FG           SS+SGS+ S F   GS+PF  SS
Sbjct: 228 -SSATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASSASGSSPSIFGATGSSPFFGSS 287

Query: 242 SGTSSSISTSTLFTSSSSSA---SVSPF-QNSLSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFPFSTT 301
              SS+ ST +LF SSSS A   S SPF  ++ +SSS+ N S++S    S+S+GF F  +
Sbjct: 288 ---SSAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNASASPFSASTGFSFLKS 347

Query: 302 SLSKATSITNVSSSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSAAPGT 361
           + S  TS    S++ S+    ++SSSSFSFGT A+S      GF++    STG SAAP +
Sbjct: 348 TASSTTS----STTPSAPPQTASSSSSFSFGTSANS------GFNL----STGSSAAPAS 407

Query: 362 AVTKQPTSLPFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS-----FSVPAFSLSSSAATTL 421
           + +    S+          +T TTTS+STPAA S    S      + P+F ++SSA  T 
Sbjct: 408 STSGAVFSI----------ATTTTTSSSTPAATSAPASSAPASTMAFPSFGVTSSATNTT 467

Query: 422 SIAASS---------APSTASSGAASSFTGFGV--TSTASSS------SATVSLSLPTKT 456
             ++++         A ST ++G+ +SFTGF V  TST +SS      S   S SLP+ T
Sbjct: 468 PASSAATFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTPASSSQPQTTSPAFSFSLPSST 523

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_023006514.12.6e-10565.25nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita maxima][more]
XP_038874708.12.6e-10572.49nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida][more]
XP_022959229.11.0e-10467.72nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2 [Cucurbita moschata][more]
XP_022959228.11.0e-10467.72nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 [Cucurbita moschata][more]
XP_023548092.13.8e-10466.48nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Q8L7F79.1e-1640.04Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1... [more]
Q75JC94.1e-0842.21Uncharacterized protein DDB_G0271670 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=DDB... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1L2D41.3e-10565.25nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 P... [more]
A0A6J1H7F54.9e-10567.72nuclear pore complex protein NUP62 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=L... [more]
A0A6J1H5C84.9e-10567.72nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=L... [more]
A0A1S3CAD41.3e-10268.57nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 ... [more]
A0A6J1CMQ91.7e-8965.10nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=367... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT2G45000.16.5e-1740.04structural constituent of nuclear pore [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (AG-4) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR036691Endonuclease/exonuclease/phosphatase superfamilyGENE3D3.60.10.10Endonuclease/exonuclease/phosphatasecoord: 438..499
e-value: 1.2E-5
score: 27.2
IPR036691Endonuclease/exonuclease/phosphatase superfamilySUPERFAMILY56219DNase I-likecoord: 442..497
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 99..118
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 27..86
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33710BNAC02G09200D PROTEINcoord: 447..524
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33710:SF32SUBFAMILY NOT NAMEDcoord: 447..524

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lag0012105.1Lag0012105.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0050789 regulation of biological process