IVF0021418 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAATAGATATTACAGTTAAAATTTGGAATGGAATCTGCTTCCCGGTAAAGCGGAATCAATTGGAGCACCTCAGGCAAGCCTGGCCTCGCAGCCAGACCCGAGCGAGATCTACACTCGCCGTACTCGTTTTATGTTACTCGCATCAAACAGGGCAACTGTTGTCTTTCGCTAATGGCAACCATTGACGGGGCGGTGCAGAATCAGCCTCAGCAGCAACAGCCTCTTCCGGCGCAGCAGGTGGTTTTCGCGGAAAGGCTAAACCAGGCAGTTCAGCAACAGTTGAACCTAGAGGCTCTGAAGAATCGAGCTACTACTCTCTTTAAAGCCATTTCTCGGATCCTTGAAGATTTTGATGTCTATGGTCGCACCAATACCACACCTAAATGGTCTACTTTCATCTTTCGCCTAGTTTTCTCTTGTGATATTTCCAAATGTGCTTGAATTTTTACGTTCGTTATCGGCTTTCGATTGATAGCACGTTAGTGTTAGAAAGTAGTTTTTTATTTCTCTATCTCGTGGATTTACATGTACTGATTATCTTTCTAGACATCAAAGCTTCTTAATATCTTTCTATTTATGTTTCGATATTCTCCTCTACTGGCTGACTGTATAGTTGATTTTTACACCAGGCAAGACATACTGGGGCAGTATTCTATGGTGAATCTCGAGCTTTTCAACATTGTTGACGAAATTAAGAAAGTTTCGAAGGCTTTCGTTGTACATCCAAAGAATGTTAATGCAGAGAACTCTACAAGTATGTCCCTGCACCCCTTCCAAGTATTTGATGAAATAAAAGGAACAAATGCTTAGTTTTTGTTTTTTATGCTTGAACAATCATTCATTTATTTGTAAATTTTGATTTCCTCTGATTTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTGTGAGCCCAGTACTACCAGTTATGTTGTCCTCCAAACTACTGCCTGAGATGGAGGTAGATGACAATTCGAAACGAGAGCAGTTGCTTCTTGGGATGCACAACATGCCAGTATCTACACAGATTGAGAAATTAAAGGTACTAGAAGTTTGTTAAATAATTATAGATCGTAGAACTCCTCGTTCTAAAGAAATTCGTTAAATCACATAATTTCTTATTTATCTGGCATTTAGGTTTACTTTTCTTACAGACTAGAATTGAAATGATTGGAGCAGCCTGTGAAAGTGCTGAAAAAATATTAGCTGAAACTCGAAAAGCATATTGCTTCGGAATGCGTCAAGGGCCAGCAATAACTCCAACCTTAGATAAGGCTCAAGCAGCAAAAATTCAGGAGCAAGAAAATTTACTCCGAGCTGCTGTTAACTTCGGGGAAGGTGATATTTTATTACTTGTATAGTCCTTGGTTAGTATCTTAGTTTTAATTAGTTGTAGTTCATATATTGTTTAGTACTGTATCATTGCCTTGTAAGTCACTCACGATTGACATTTACCAAAAAAAGCAATATTATATTTAGATTTCTTGCCAACTTGTCACATATCTATGAAGATTACGGATCTGTATATTTATTTCTTTATTCATGATGTACTTTATCAATTTTTTTGTGCATAATTGAATATGAACATTCTGACTTGTGTAACAGCCATTTTCCTCTCTTTTCATTGTTGTATGAATCAGACACCATAACTTGCTTGTTGGGAGAGTTGATTTAAATGACTAAATTGTTTGAAATTTTGTGAAAGAGTTGCTGAGGGAGAAAGGAGAAGTGGAATGTTGTAGAATGGGAGTGATGCGACTTTGTAAAATAACCATATGAATTATGGAGGATGCATATATGGCGAGAAATGCTCTGTTCCTTAGGTCAGGCTGTAGGGATCCTAGCTCAGTTGGATCCCCTGAATCAATTGATCTTTCATTCTTCTTCATCCTTCCCAAACACTTGAAGGCCCCAACTAAGTAGCAAGCCCACACTACCAGTGTTTTCAAAGGCTCAAGGCGCACTAAGGCGCAATGGTCCTCTGGGGCCTAGGCGCAAGACGCACAAAAAGGCGCGGGCTTTTTTTCATGAGGCGCACTATATAAAAAAAATATACATATAAAATATAAGTAAATAACCAATGTGGAAATGAGAATTAACTCTAATGTATAAAATATTAGAATATTAGTTTTCTACCCAAAAACAAAACATAATAGAAAACTAGTCAGAATTCAACAACAATCAAATAAAAGTTTATTCCTAAAGATCAAACTCATCATCACTAAATTGATCCTCATCTTCATTCGCTCCTTCGTTGGACTTATAGCCATCGGTATCTTCTTCGTTGGACTTATAGCCATATGTAAAACACGTAATAGGTATAATAGTTTTTTTTTTAATTACAGCCTAGCCCAAATAATAAAGCCTGTGCCTTTGGGGCTTTTGCGCCTGGAGGAAGGCGCGCGCCTCAGCCGCGCCTCTTCATCTGCGCCTCGCCTCTCCACAAATAAGCTTTTAAAACACTGCACACTACCAGGCTTGGCAAACTGATTTAATTCTTGCAAACCATGTGGGTATAAGGTGTTAAAAGTAATATCTGAAAAAGAGGGAATTATGGATTGACCAAAGGGGAGGTGACTTTGATAAAGGGATGAGAGGTCACAGGTTCAATTCATGACAATCACCTACCTAGAATTTAATATTCTATGAGTTTTCTCGTCATCCAAATGTTGTAGGATTAAATCAGTTGTCTTGTGAGATTAGTCGAGGTACGCATAAGCTGACCTGAACAAAATTTAGAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAGGGTGGTCAACTAGTAATCTTTTCTATTTGAAGAGGCTTGTTTAGCCTTTTCTATTAAATTCCAATAGCTAATATTCTCCTTCAAATATCTCTCTTACAAAAATTCTCAACACACAATAGAATGCAAGATCTTCAATCTTTTCCTCTCTACATTTTCATATTTCTCTTTTGTGCTTTTTAAAGCAAATGGCCAAAAGGAAGGTGTTTTTTGTTGTGGAGCTTTGAGCCTAATGTTATAGTGCAAAGTAGTTTGAGCTACAAACATTTCAGTTGTGTGATTGTATCTTGGAGGAGACATGTTAGACAATATCTGGTGCATTGGTGGTTAATATAAAGGAATACATAGTTAGGGGCCGTTTGGCTCAAGGATTATCACTATTGGGTTGGGTTATGGTAACCCAACCCTTGTTTGGGGGAAGGGTTATCATAACCCTTGTTTTAGGATTATCATAACCCCTCTTCCCTCTCTCTCCTTCTTCTAAAACCTTTTCAACTCCCCATAACCCTATCTCTTCAACTCCCTCATAAAACTATCTTTTTAAACCCTTCCCCCAAACACATCTTATCATAAAACTAAGTTTATTATAACACTAGTTTTATCATAACACTAACCCTCCATAACCTAACCCTTCCCCCAAATGGCCCCTTAGTCTCTTAAAAGACAGTGAGATACATGCACCTCAACGTAATTGTTTACATGTTTGTTTCTCAATATTTACTACCAATTTCTAGGTTATTTGTAAACTATTATTTTGTATGTTAAGCTGTTGGGCTTGAGCAAGACAAAAGGCTTATCAGATCCTTTGTTAGATTCCATATTTCTCTTTCAGTTTTAGTTACAAAAGTCTTTTGTATTGACACGAGCATTCTTTTACACAATTTAAGGCCCTTCCTTTAGTGGCCTCCCTTTATGTAGGATTATTCTTTTTGGATCCTAGTAAATGCTTTCATTTTTTTTTCCCAAATGTTGTTTTCTCATTATAAAAAAAATAAAAAAAATAAAAGAGAAGTCCTTGATGCTTGATGCATATGATTTTGGTGTAATACCAAAGACTATTTTTTAATCGAATGAAAATCTTCTCCCTCGATATGAGAGTTGTTTATTTATAGATGAAAATGTATATAGATAGTTATTAACTAACTAGCTAAACAATCACCCCCAAAATGTCCCAAGTTTACAACACTCCACCCCAGGAATGTCCTCAGTTTACATCACCCCACCCCAGGAATGCCCCGAGTGTGTATTACATCTTCCACTCGGGAATGACCTGAGTATTACATCATTCCACCCCCAAGCATCAAACTCGTTCCCGAGTTAGGTTTGTCGTGAAAGTTGGAATCCAACAGGTGCATTTTATCTTTTAAGGTCTGCAATGTTGAAAGATTGGACTGATGTTGAACCCTTCAAGCAGCTCAATCTTGTAGGCATTTGGCTCTATTTAGCAATTATTCTACATGGGTCAATCGGTTTATCTTTTAGGTTTCCATAAGTTCCAGCTGGGAACCTTTTCTTCTTCAAGTAGGCCATTACAAGGTCTCCAATTTGATAGTGGACTTCCCTTCCCTTCTTTTCTTGTCTTTCTCTTCTTTGTAAGACTCGGTAGTCTTAGTGATATGGTCATGGACTTCAGTGTGAAGCTTTTGAATTCTCTCGGTTAGTTCTTCAGCTTCTTCTTGGATTTCTACTTCTTTTGGAAGGCTAGTTAGATCCAATGTAAGTCTTGGAGCTTTAGTGTACACGATCTCAAAGGGGCATTTGACTGTAGTTCTATTCTTCATGTTGTTAAAAGCAAATTCAGCTTGGCAAGAATCATATCCCATTGCTTAGGATGATTGCCACTTAGGCAGCAAATCAAGTTTCCCAAAGACAGATTAGTTACCTCTGTTTGTCAATCAGTTTGTGGATGAGCAATGATACTAAATTTCAAAGTGGTGTCAAACTTCTTCCAAAAGGTCTTCCAGAAGGTCTTCCAGAAATGGCTAAGGAATTTGGTATCTTGGTTGGAAACTATGGTCTTAGGGATGCCATGTAGCCTCGCTATCTCTCTAAAGAAGAGAGTGGCTATATATACTGCATCTATATTCTTTTTGCAAGCCAAAAGTGTGACATCTTGCTGAATCTATCCACAACAACCATAACTGAGTCAAATCCTCTTTGAGTTTTGGGTAGACCTACCACAAAATCAATTGATAAGTCTTCCCGTATATTCTCTGCTTAGGGCATCAGCAACACTGTTTT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BLAST of IVF0021418 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4V3C1 (Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MED8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 446.0 bits (1146), Expect = 4.7e-124 Identity = 272/453 (60.04%), Postives = 334/453 (73.73%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0021418 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VLA2 (Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold238G001760 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 810.1 bits (2091), Expect = 4.6e-231 Identity = 436/436 (100.00%), Postives = 436/436 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0021418 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CPL4 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 810.1 bits (2091), Expect = 4.6e-231 Identity = 436/436 (100.00%), Postives = 436/436 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0021418 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CN44 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502790 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 803.9 bits (2075), Expect = 3.3e-229 Identity = 435/436 (99.77%), Postives = 435/436 (99.77%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0021418 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GV67 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457835 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 723.8 bits (1867), Expect = 4.3e-205 Identity = 395/443 (89.16%), Postives = 412/443 (93.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0021418 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IZN9 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479910 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 721.8 bits (1862), Expect = 1.7e-204 Identity = 392/445 (88.09%), Postives = 411/445 (92.36%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0021418 vs. NCBI nr
Match: KAA0068194.1 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 810 bits (2093), Expect = 4.43e-294 Identity = 436/436 (100.00%), Postives = 436/436 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0021418 vs. NCBI nr
Match: XP_008465097.1 (PREDICTED: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 810 bits (2093), Expect = 2.75e-293 Identity = 436/436 (100.00%), Postives = 436/436 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0021418 vs. NCBI nr
Match: XP_008465098.1 (PREDICTED: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 804 bits (2076), Expect = 1.03e-290 Identity = 435/436 (99.77%), Postives = 435/436 (99.77%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0021418 vs. NCBI nr
Match: XP_011651696.1 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8650872.1 hypothetical protein Csa_001556 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 802 bits (2072), Expect = 5.21e-290 Identity = 431/436 (98.85%), Postives = 432/436 (99.08%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0021418 vs. NCBI nr
Match: XP_004144418.1 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 796 bits (2055), Expect = 1.95e-287 Identity = 430/436 (98.62%), Postives = 431/436 (98.85%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0021418 vs. TAIR 10
Match: AT2G03070.1 (mediator subunit 8 ) HSP 1 Score: 446.0 bits (1146), Expect = 3.4e-125 Identity = 272/453 (60.04%), Postives = 334/453 (73.73%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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