IVF0015171 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAGAAACCCTAGAAAATAGAAAAATGAAGATTGGTATAAGAATGAGAAAGGGCCTACGTTCAATTTCCCATAGCCATAGCCACGTGATATTCATATGCCTGTCCTCGGCGCCAGGCCGTCGTCTCATCTGCTTGCTTAAATTTTCTCACAACCACACCGCTCCGGCTGTGTTCTCCCCTGTTCTTTCCCTTCCCGGAAATAAAATTCCCCGTTCCTTCAAAGCCCTAACCACTTCCTCAATTCTCACCCTCCTCACCATTCCTTGTTTCACTACCACTTCCTTCCTTTAGGTCTACTATGGCAGGAGTTCTCAGAGAAAGAGCACTCTCTCTCCTCGCCGCCGCTAACAACCACGGCGATTTAACGGTGAAGATTTCATCTTTGAATCAGGTTAAGGATATTATACTGGCCATCGAGCCTTCTTTCGCAGCAGAGCTCTACTCCTACTTGGTTGAGCTTCAGTCCTCCCCCGAGAGCTTACTACGTAAATTGTTAATTGAGTGAGTTCCAAACCCTAATTTCCCCCTCGTTGTGTGTATTTTGGATCGTTTCCGGTTGTTATGGCATTTCCCACGTTTCTACATGAAAGTGAGATCATAGTATGAGTTCCACGTTGGTGTACAGCGGAGGCAATACGATGTGTTTGGTGATAACTATTTCCCACTTTGCACTTTTGTATCGTATACACTGCATTTTCTGCATGAACATTGGTTTCCTTGATTTTTATTTTTGTTTCTTACAAGTAGTGCTCGTTCGAATTACTTGGTAGGTAGTGTATTTGTTTACGGCATCAATTTTGGATCAATGATATTAAGCTATGGTCACTAGACTTAAAAGCTTAAGCTTGTTTGGGACAAATTTATCACTGTCAAGTTACTCTCAACATTCCTCATTTTGCATGTTTTTGAATATTAGCATTTGTTCCAACCTGTGTATGTTTATTTAAATTGGGGAGAAAATAATATTGGAGGTGTTTAAAATTAGGATCTCATATCGTAGTAAAAGTTGCTTTTTGTTGCCGGAACAATTTGAACTTAAATTCTGTGCTCCAAAGGGGACTTCGTCCTTGTTCTGGTTTATTAATAGAGCTCCTCCCAAGAGACCAAGAAAAGTTTTATCTATTTAAGAAATTTAGCTGGAGAGAAATGTTTGTCTTTTCGAGGCAAGGGCCGATATGTCTGTGAACCCTGGGAGAACCTTAAAATTCTTCCCATCTCACACGTATTGACAGTTTTTGGCTGGTACTCTGTCGGTTATTGTTGATTGGGAGACTTATTGTCCTTCCCTCAGTTATCTATTTGACGATGTGTGCTGTTTTTTTTTTTTCCATACTAGAAATAGAATGGGATAGTTGGTTAGTTTCTTCTGGATTCATTTTTGCTTCTTCTTGATGTGCAATCAGTGTACCTCATATGGGTTGTGGACTTTTAGCACGTGTAAATTTGTTATTAGAGCTGTATCTTACTTCATTTCTGTTTGAAATTGATGTTGGTATAAGTCTCTTGTCTCTTTGGCTGGGGAGGAACACTAGAATTTTGGAGATTTGGAGTGTTCTTAGGAAGAAATTTGGTTGAGTGCTAGGTCTAATGCTTCTCTTTAGGCGTTGGTTTCTAAGTCCTATCATGTTGGATTGAAACTTTTTTAACAGCTAGCTTTGTGGTTTATTTTTTTGGTTGTTCTTTTGAGGACCCTTCTGCTTATTTTTGTACGCTTTCTTTTTTCTTGATGGGAGCTCACTTTTTAGATATATACATATACATATCTACACTCACAAACTCACACACATACACACATACAAACATACACGTTTATGTCTGCATATATCTTTGACCAGTTAATGTACCTGGTGAAATAACTTCCATTTTACTCATACAATTATGCATGCATTTTAGAGCATTAGAACAACCGCATATATTGTCCACTGGGCTGCTTTTTATACCTCAAGTTCTTCCACTTTTCTTCTTAAGTATGCTAGCTGCTGGATAAAACTTTCTTTAGTTTATTTATACCTTATTTGCTTCTACTTTACACAATCCACAGGGTGATTGAAGACATTGGATTAAGAGCCATGGAACATTCTCCTCTGTTAATGTCGGTTTTATTGGCATCTTTAAAGGATGGAGAATCAATCGTTGCGGGACAATCAATTATTAGTGGCCAAAAATTATTTTGTGGTACTTTAAGAGAGATGGCATTACAGGTTTCTCCTTTTGCTTTCATTGTGTAAAGTGGAAGAAAATATTGAAATATTGGGCTTATTGAACACCTTTTTCCATCTGATTTATGTTTATTTTTATCTTCACATTGCTTGCCTGACGGCTGACGTGGTTTGAGAAGGTCAATCAACTGTTATATTATATATTTATGTATTGTTATTCTTGTCTATGATGAATATCATCAGTATAAAGATGTTTTAAATATATCCACTTGAAACTTAATTTGTATCATTATGAATTAGATGCTAACTCTAGAATTTCACAGTGGCATCGGCGAGGTAAAGTTGAAAGATGGCTGGAAGAACTGTGGATGAGAATGTTGAAATTTAAAGATGAGGTTTTAGCAATTGCTTTAGAGGTATTTAAATGCGTAACCCTGGTCCTTGAAACTGTCTGCGATTGTTTTTATTTTTAAATGTGGACCTCTCTTTCGTTTTTCTCTTCTCTTGAACTAATTGTCTATTTATTTATTTTACTGGAAAAAGGATAACATGGTTGCCTTTTTTAAATTATTAAATTATCATTACTATTCTTTTTATATTTTTTCTTCGCTTTCTTCTTCTCTCTTTGTCTCCATGTATGTTTGTGTTGTGTATGGTCAAAATCTTAATGTATGTTTTAATAAGAATTTTTTGTACAAAATTTTATCATACGTTTGTTAATTTATTGCTTTGCTTATTTCTGATATTAAAAAAGCTTTTGGTCAATGTTGTGTGCTTTTGACTCGGTTCCCTTTATATGTCATATTGTAGCCTGGATCTGTTGGGAAGAGGTTGCTGGCTCTGAAATTTTTGGAAACGTATGTTCTACTTTTTACATCTGACACAAATGATCCACAAAAAGCTATTTCAGAAGGTATTACATTTAGACAGCACAAACGCATGCCTGCTTTCAAGTTATATGTGCTTCACATTATAAGAAATTTTTAGTTTCTACCTTTTACATTCAATACAAAGGATCCACAAAAAGCTATCTCAGAAGGTATTACATTCAGACAGCACAAACATATGTCTGCTTTTAAGTTGTTTGTGCTTCACATTGTAATGTTCCTCCTTTTTTTAGTTGTTTAGGTTAAAGGTTAATATATGTTTGCATCTTTTTTCTGGAAGTTTGTTTATTTGAAATTTAACATGATCCTGCATGTAAACAGGAAATAGGGATGTTTTTAACATTTCATGGCTAGCTGGTGGGTTTCCTATTTTGGATCCAGTTGGGCTAATGTCGGAAGCTAATAGGATGCTTGGCATTCTGTTGAATTTGTTGCAGACCAGTTCTGTTCCTGGTACATATACAGTAACAGTTGTCAGTAGGTGATTATCTTCCTCTCTGTTTCTCACATATTTGGTCATTTTATTAGTTGATGGCAGTTTTCCGTTTCTAATATAAGTATTTCCTCTTAATTTTTTATAATCTGTATATTGCAAGTTGCTGTGTTTCCTGTCATTTTGTTGTTAATGTACTGCCGTTGATAGTTATGTGAAAGAAGGCAATGATAAGAAAAAAGATCACAATACGACGCTGACGTCTGTGTTGGAGTCTTCCCCATTTCAATTTTGTTTTGTAGCGTCAATTTGTGACATTGTCAAGTACAGTATGCTCTGTTTGAGCGTTCTCTAATCTTCATTTATTTTTGTGTTTATCAAATATTAAACATGTTTATGTATTTTCTGTGTGCATTATTTAATGAAATTTCTAAATTAGTGTATTGTTTGAGTCATTTTCATGTGCTATCTGAAATGTTCTGCTCTTGCTGATATGTACCCCTACATTCTTATTTTTAATTATTTGATGTTAGTGGTATAGACTTGTTATTTCTAGTTTATCACATTTTTGTTGGATCTTTGTATCCTTCTTTCCGGCACTGTCATGATGTTGATATGATACTGATACATAACAGTATATAGAGTATTAAGAAAGTTGCATATATTGCTTTTATTATTTTGTTTGCTTTCTGTATGTTGCTTATTATCTGTACTGTCAACAATATTATTCAACTTGTTTTCTTCTTGTTGGGCTATATTTTTTTTGTATATCTTAGAGAGATAATATTGGGACGTATAAGTTGGATTTTGAAACAAAGGACAATTTTTTTATAACAATGTTTTTCAATAAAAAATGAAAACATGTAAAATTATTGATTTGTTAATAAAAAATTATTATTAAACAAGATACACAAATTATAATGGATGAAATGAAAAGAGACTGATACTCAAAAGTTACAAACTCCTCAGTTGAGTGAGTAAATTTTTTTTTTTTTTTTATAAGAAACAAACATTTCATTGATAAAATGAAATAAGGGGAAACCCCAAGTACCTAAAGGATTACAAAATGAGCGCCAATTGGAATCTAAGACCAATAAGCTAAAGTTCTTAAAAGGGTGCTCAATTTGGCACCAATAAAAAGCCGTGGACAATACCATGTCAAAAAAGAATTAAAAGATGAAAAAGAGTCTTGAAAAAGATACGCTTGCCCCATAAAGTCCAAAAGAAAGCCTGAAAAATAGCCAGCCAAATAACCTTCTTGCAACTAATAAACGGGCAGACTCGAGGATGTCTGACATTTCATTGGACAAAGCAATAGGCCAACCAAAAGCCTCCAAAATGAGATCCCAAAACTGTGGAGCAAAAGGACAATGAATAAAAAGATGGGCAGGGGATTCAACACTGGCACAAAACATAATACACCAAGAAGGAGAAAGAGACATGTAAGGCATACGACGCTAGAGATGATCGACAGTGTTTAGAGCTTTATGACTAAGCTACCAAAGAAAAACTTTAA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MAGVLRERALSLLAAANNHGDLTVKISSLNQVKDIILAIEPSFAAELYSYLVELQSSPESLLRKLLIEVIEDIGLRAMEHSPLLMSVLLASLKDGESIVAGQSIISGQKLFCGTLREMALQWHRRGKVERWLEELWMRMLKFKDEVLAIALEPGSVGKRLLALKFLETYVLLFTSDTNDPQKAISEGNRDVFNISWLAGGFPILDPVGLMSEANRMLGILLNLLQTSSVPGTYTVTVVSSLATIARKRPIHYGNILSALLDFVPSFEMTKGRHAASIQYSIRSALLGFLRCMHPAFVESRDRLLKALRGINAGDAADQVIRQVDKMVKAADRAARDAWLGKDDQSSNQLNASADLTRKRSRVLDDEELSNGREVSKQFRFGPDVHPISTAQKDGSLQNAVSNGTSHDVSKLDAELTPAEQMIAMIGALLAEGERGAESLGILISNIHPDLLADIVITNMRNLPKASPPLTWPGDLPVTRQGSSHVQVLAPSAPLSSVQTSVAPAQIPSSLAMSAGSTFAEATVNSLPVDSKRDPRRVNVASYRCVLTCVSALLGHHFASKYIGLFYSLLQDPRRLDPRRGGVSSASSVEEASSNTSDVDGSISLGKSASVPVSVTIENSSVSLVSKTKVEEKIIESPLVFGTEQSTPKSRSPDRAEKIDTILEIHAPLDPTPTAVGKADDGLVAVSLFDDLATKGDDASSCVEYNQFSPSVTSAAASEDTCEELPSLPPYVDLTSEQQITVRNLAAEKIFDSCKNFNGADCHQIRLAIIARLVAQVDADDDIVRMLEKQVAIDYQQQKGHELALHVLYHLHSLNILDSAESSSFAVYEKFLLVVAKSLLDAFPASDKSFSRLLGEVPVLPDSTLELLHKLCSCDITDNGGKDTPDIERVTQGLGTVWNLIVKRPYSRQACLDIALKCAMHSEVKVRATAIRLVANKLYRLSYISDRIEQHATNMFLSAVDDVDQTDVEPSPCVSIEQRTGGEGESLETSVCGSQVSDPGISENDSLRSSQPTVHGSSTLSLSEAERHISLLFALCVKNPCLLRFVFDAYGRAPRAVKEAVHEHIPNLITALGSSDSELLRIISDPPPGSEHLLALVLQVLTQETAPSSDLIDTVKHLYETKLKDVTILIPMLSSLSKNEVLPVFPRLVDLPLEKFQRALAYILQGSAHTRPALTPVEVLIAIHNIIPEKDGLPLKKITDACSACFEQRTVFTQQVLAKALSQMVEQTPLPLLFMRTVIQAIDAFPTLVDFVMEILSKLVNRQVWRMPKLWFGFLKCAFQTQPHSFRVLLQLPPPQLEML Homology
BLAST of IVF0015171 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7ZYV9 (Symplekin OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=sympk PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 226.5 bits (576), Expect = 1.8e-57 Identity = 171/570 (30.00%), Postives = 277/570 (48.60%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q92797 (Symplekin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYMPK PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 221.1 bits (562), Expect = 7.4e-56 Identity = 175/570 (30.70%), Postives = 280/570 (49.12%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q80X82 (Symplekin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Sympk PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 221.1 bits (562), Expect = 7.4e-56 Identity = 173/570 (30.35%), Postives = 280/570 (49.12%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8MSU4 (Symplekin OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Sym PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 168.3 bits (425), Expect = 5.7e-40 Identity = 94/234 (40.17%), Postives = 142/234 (60.68%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CQF9 (uncharacterized protein LOC103503628 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503628 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2390.9 bits (6195), Expect = 0.0e+00 Identity = 1263/1297 (97.38%), Postives = 1263/1297 (97.38%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CQH3 (uncharacterized protein LOC103503628 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503628 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2385.1 bits (6180), Expect = 0.0e+00 Identity = 1263/1301 (97.08%), Postives = 1263/1301 (97.08%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CQG3 (uncharacterized protein LOC103503628 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503628 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2166.7 bits (5613), Expect = 0.0e+00 Identity = 1142/1180 (96.78%), Postives = 1142/1180 (96.78%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FGK2 (symplekin-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443713 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2114.7 bits (5478), Expect = 0.0e+00 Identity = 1128/1301 (86.70%), Postives = 1174/1301 (90.24%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FII2 (symplekin isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446048 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2110.5 bits (5467), Expect = 0.0e+00 Identity = 1127/1297 (86.89%), Postives = 1179/1297 (90.90%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. NCBI nr
Match: XP_008466106.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503628 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2395 bits (6206), Expect = 0.0 Identity = 1263/1297 (97.38%), Postives = 1263/1297 (97.38%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. NCBI nr
Match: XP_008466105.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503628 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2389 bits (6191), Expect = 0.0 Identity = 1263/1301 (97.08%), Postives = 1263/1301 (97.08%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. NCBI nr
Match: XP_011652606.1 (uncharacterized protein LOC101202828 isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN60445.2 hypothetical protein Csa_002340 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2331 bits (6042), Expect = 0.0 Identity = 1227/1297 (94.60%), Postives = 1243/1297 (95.84%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. NCBI nr
Match: XP_011652605.1 (uncharacterized protein LOC101202828 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2326 bits (6027), Expect = 0.0 Identity = 1227/1301 (94.31%), Postives = 1243/1301 (95.54%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. NCBI nr
Match: XP_038898452.1 (uncharacterized protein LOC120086087 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2231 bits (5782), Expect = 0.0 Identity = 1180/1298 (90.91%), Postives = 1210/1298 (93.22%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. TAIR 10
Match: AT1G27595.1 (CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Symplekin tight junction protein C-terminal (InterPro:IPR022075); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HEAT repeat-containing protein (TAIR:AT5G01400.1); Has 593 Blast hits to 297 proteins in 111 species: Archae - 0; Bacteria - 3; Metazoa - 139; Fungi - 49; Plants - 57; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 345 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 783.9 bits (2023), Expect = 2.0e-226 Identity = 481/957 (50.26%), Postives = 612/957 (63.95%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. TAIR 10
Match: AT5G01400.1 (HEAT repeat-containing protein ) HSP 1 Score: 627.1 bits (1616), Expect = 3.2e-179 Identity = 466/1324 (35.20%), Postives = 707/1324 (53.40%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. TAIR 10
Match: AT1G27590.1 (CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF3453 (InterPro:IPR021850); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein (TAIR:AT1G27570.1); Has 109 Blast hits to 109 proteins in 38 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 65; Fungi - 4; Plants - 38; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 277.3 bits (708), Expect = 6.2e-74 Identity = 141/239 (59.00%), Postives = 185/239 (77.41%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. TAIR 10
Match: AT1G27570.1 (phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein ) HSP 1 Score: 256.5 bits (654), Expect = 1.1e-67 Identity = 151/340 (44.41%), Postives = 213/340 (62.65%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0015171 vs. TAIR 10
Match: AT1G27570.2 (phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein ) HSP 1 Score: 171.0 bits (432), Expect = 6.2e-42 Identity = 124/351 (35.33%), Postives = 184/351 (52.42%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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