IVF0000582 (gene) Melon (IVF77) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGACGGGCCACAATGGCTACAAATTGCGGTGCGAGCTCACTGGCCACGAGGACGACGTAGGAGATGAATTACTCATTTATCTCTAACCTGTTAATTGCTTTCTTAGTTTGCAACAATTTTGAACTCCAGCATTTGTTTGCACAATCTTCTCTTAACATTTTCAATTTGACTTGAATTGGGCGTTTGTTGGATGTAGAGTCTGGCCTTAATCTTACTGAACTTGTATCATTAGGTTCGGGGAATTTGCGTCTGCGGAAATGAGGGAATTGCCACTTCGTCCAGGGACAAAACTGTGCGGTTTTGGAATTCGGATGGACGGAAGTATGTAGAATCGAAAATCTTGCTGGGGCATACGAGTTTTGTGGGTCCTTTGGCTTGGATTTCGCCAGATGAGGAGTTTCCGGAGGGGGGAATTGTGTCCGGTGGAATGGATACACTCGTCATTGTTTGGGACATGAGGACGGGTGAGAAGGTGCAGACTCTTAAGGGCCATCAACAGCAAGTTACTGGCATTACGTTGGATAATGGTGACATTGTGTCATCCTCCGTTGACTGGTAATTTAGTTCCCTAGTTGTGATCTTCATCTGGGTATAGGAGTAGAATTTACAAGGTGTTGCAAAATGTATGCATTATAAGATTTATATCAACATACTCAGTCTGGAATGTCGATGTTCTTGTACGATAGGGTGTTGTATAGTAAGTACCCATTTTGTATAGTAAGGAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAATATTGCATTGCAACTTTGATTTTTGTTTTGCAAGCTCTTGCTCAGGCCATTTACTTTTTATAGCTGGGCTGTTTCTCTTGTGTTTTCATTCATACTTAATAGAAGTTACTTTTATTTCTGTGCATGACCTCACAGATTCTGTAGTTACAGCAGTACCATGCTTTGTACCCTTCTACCCATTGGACGGCATTTTTGTATCTTACTTCATTTGGGATTGATGGCACTGTCTTCTATCAATGAATTTTTTGTTTCCTTTTCTTTTTCTTTCAAAAGAAATTTGGGCATGAAGAAGGTTCTAATTTTAATTTTGACCAAAACTGAAGCTGATTTTCCGTTAGTGCACATATTTTTTGGTGGACTGGGTTTTCTGCTTAGTGCTTCTGGCCTTCTACTTACTTTATACAAGAATAAACGTGCGATATTTGCTTCTTTACTCCAGTACTTTAAGGCGATGGAGAAATGGCCAAGTGTTGGAGTTTTGGGGTGCTCATAATGCTGCAATTCAATCAGTTATAAAGCTTCCATCAGGCGTGCTGGTCACAGGTACTACTTCAAATGGGGGAACTGGAGTTTGTCTGCGTTATAATTTAGATAACCTTTGCTCTATTCTCCCTTTGTATATCCTGGTTTCAAATTTGTGAGTGCTTTCATTATGATTGAGCGTTGATTGAGCAACGTTTATGTTATGTTTCAGAACAAATTATATTGGTGGGGTGCAATCTACAATTTGATATTATTGGACTACCGTTTTGGCATTTTCTTCACTTTTCATCGCAGTTATTATTTAACAATTTGGTCTGTGTTAATCATTTTGATATTTTAATTTGTCACAAAGATTCATGAGGAAAACAATTTTTATGGCCTTTAAAGAGAGAACGTCTGATTATGGAATTATTGGAATGAGTTAGTGTTCTCCATCCAAGAGAGGAGCCAGGAGGTGACCATTCTCACCTTTCCTATCTGATTAGTTTGTGTTAGATCATTTTGTTTTTGGGATCATCCAAGATAAGAATAGAGACAAATACTTCCTCTTAAATTAAGGATATTGGTAGATGGGTGTTTGAACTCTGAGATCGGCAGAGAAAATCTTCATGTATTCTTTTGTTTATAAGAGGATATTGTAGTGAATCAAAGGTTAGAAAGATAAGTTTTTTCCAACCAAAAAGAGAAGTGAAGAGGAGACTCCCCATTGCCTCAACTATGTTCTTCATTTGTTCTGTTATTGACGTTTTTTTAATGCGAGAGGGCTCTTTTGTGTGTTTACCTCTCTTTCGTGTGTTTACTTAAATTAGAACTGTTGGGAAATGGAAGTTCTTCATTTGTCCACATGAAAAGTCTTTTAGTATAAGTTATTTACTTTGTTATTCTTATGCATGGCTTTAAAGTATTTGACTACATCATAGGCTCAGACATATGATATTGGGTCTGTTCGTGTGTAGGTTCAAGTGATGCAAGTTTGAAGCTTTGGAGAGGGAAATCATGTTTGAAGACACTTTTAGGACATACAGGTCTACTTCCTCCATCCCCCTCATGAGTGCATGTGTATGTATTTGACTTTTAAGTTGCAAGTGGTGGATTTTTCTTTTATCTTATATCATTGGGAGCTATTTACCTTCAGTTTTGTCTTTCTGCATATGCTGCCTTATTTTTTTGCTGTTCTTATCTCGAATAAATTGATGAAATTTGATTTTTTCCATATAAATTGTGATGAATGCTTTGACATCAGACTTTTGGATTTTAAGGTTAGAGGTTTAGCTGCAGGAATAATGTTATAAGGATTGCCATGGCCCATGGGGTATTTGATCTGATATTTATTTAATGGGGAATAGAAGAATCTGAGGTTTTTTATGACCAAAGCTTGCTCTAAACGTGTCTATTTTTTTAACACCATTTTTTTAGAAGCCGACTCCAGCACTCTTTCAGTTATAACTTTAATAAATTATACTCATGTCATTCGTCCCTCCACCTATAATTGACATAAACTTTCTTCTTATTTCATGTTTTAAGTCACTGCTTTTGTATTAGGACATGAAACTCAACTTGAAAGATCAATTGTAGAAGTGTATATTTCAACCTACATTAAGTTATATACTAAATTATGATCTCTGAAGTTTTCAAAATATTTAAGAGTTTTAAAGGATAGTAGACAAAACTATCGAGTATATTTTGTTTTTCTGTTTGGCCCATGATTTATTTGCATCAATTGATATATTTATACCAATCTTATTTATACTTCTTTTATCTAGAAAACTTGATCATGCAAACAACATTACCTTATGTGTTTTGTTTACATTTTATAGATACTGTTCGAAGTTTATCAGTGATGTCCGATCTGGGAGTGCTATCTGCATCTCATGATGGGTAAACCTATACCTATTTATCAGTGTATATTCTTATTCTTCTTTGTATTTCTATTCTTCTTTGGATTTTTATTCTTTTTCTTTGAAGGTTATAATTCTTTTTAAATGAAGAATTATACCATTCTTATTCAAAAACCATCAAATTATGCTCAAATAAACCTGCTAAATAACTGCATGTTTCAAATATACAATATCTCTTATTTTTCTTTTGTCAAAACAATATTTTCATTCACATGAGTTACGATTGAATTTAAGTTAAGTTTCCATTTTGGTTTGTCATTTGGACTTATTTCATTTTAGTTCCCATAACTTTCAGGAAGTCTTAAATTGGTGGTCATCTCATGTTTGGAGCATTTTTATTTGACAGTGACAAGAATACTATGAACTACTATCCTCTCCCCCTTCCCCTTCCCCCTCTTCAGACATCTCCCATCTATCAGTTTTTCAGCAAGAAGATGTTAGGATACCAACTGGTTCCTAAACTTCTATTAAGCTTTCAACAAAATTACAACCGAAAGGACCACAACGATCTTAAAATAACAACTCAAAATAACAACTCAACGTTCAACAGTAAATAACCAACAAAGTTCAGAACCAAAATAAGAACAAAGTGCGACAATCTTGAAAATAAAAACACAAGAACAAGCAACGAACTAAGGCCAGAACAAGGGAACCTGGACTCTGCTCTCCCCGCGAGGAAGAAATCAGTCTCTCTCTTCTCCACCCAAAATTTCCGTACCTCCCTCTACTCTCCCCTGCTCCTTTTAATTTCCCACTACTAACTAACTAGTGGTCCCCACCTGATGGTCCCCGATCTCCTTGCTTTCCTCCCCACTACCATGTGCAGCTTCCCTATTGGTTTCATGGTGATTCTCCCCAATCCCACGTGCTTCCTCCTCATTGGCTTCATGTATTTTCTTATTTCTCCTATTATACGTGAACAGTATTGGGGGCCTAGCAGAAGACCACCGTTTTTGGTTCTCTAGAAAGTTTGTTTTCAGGCTCTTTCCTTTTTGGATGCTTCAATCATATTCAGAGATGGAAGTGGAAAGTCTACAATTGATAAATTGTGTTTTTGCATTTGGTACGAGGATGGATCATTTCAAGTGGAAGATGCAGAAGCCACCATAATACTGTCATTATCAATATCAATCCCCCAGCTTATATGGTTTCATGAAGCCATTTCAGAATTGAGCCAAAAACCAGAAGATAGATTCTTCTTCAAAAAAGAAAAAGTTGAAATTAGATTCTTCTTCAAAAAAGAAAAAGTTGAAAATGGAATGGTTAAAATTTCTAAATTCAGAGCTAAGTTCGGTTGGGTAATGAGATAGGTTGTTTGGCCTCGTACAGCTAGTAGATCGGACATTCTTATTCCTTCAAGACAAGATAAGCAGGGTTGGGTTTTGTTCAGCAAAATTCTAGGAGACTTCAAGTCAAAACATGAATATATGACTTGGTACTCATCACAAATAAGGACATCAAACAGCAGCAAGAAGATTTAGGCGCAAAATTTTAAGGTGTTCAAGGATAGTTATGTAGAGAAGGTGAAGCCAATGAGTTACATTCATTCCTCTATTCTTGCACCCGAAAAATCGAGTATGAGTCGTTATTGGATAATCAAGAATCCTGAAGTTTGCAAAATCGATTTCAACAATCTTTGGACTGTTGCAAGATTGTTTAAGTTTGATGAATGGACAGAAATAGCTAACACACTAAAATTATACTTTGAATCTGAGGTCATTATCAATCCTTTGTCTGCGGAAAGTGCTGGAAAGTGCTTTAATCCATTTGGCTCAAGGTGAGTTGGACAATTTAGTTAAATAGCCAAGGAAATGGCAAGATTGTCGCAAGTTCCATTTAAAATTTGACAAGTGGAACAAT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METGHNGYKLRCELTGHEDDVRGICVCGNEGIATSSRDKTVRFWNSDGRKYVESKILLGHTSFVGPLAWISPDEEFPEGGIVSGGMDTLVIVWDMRTGEKVQTLKGHQQQVTGITLDNGDIVSSSVDCTLRRWRNGQVLEFWGAHNAAIQSVIKLPSGVLVTGSSDASLKLWRGKSCLKTLLGHTDTVRSLSVMSDLGVLSASHDGSIRLWALSGEPLMEMVGHTSIVYSVDSHASGLIVSGSEDCSAKIWKDGICVQSIEHPGCVWDAKFLENGDIVTACSDGVARVWTADQERIADPQELESFASRLSQYKLKRKRVGGLKLEELPGMDALQIPGTSNGQTKVIREGDNGVAYSWNLNDYKWDKIGEVVDGPDDGGRKPVLDGVEYDYVFDVDIGDGEPIRKLPYNLADDPYTAADKWLLKEDLPLVYRQQVVDFILQNSEKKNFVLDPSFRDPYTGSSAYVPGGPSNVSAESRKPIFKHIPKKGVLVFDVAQFDGILKKIVEFNNALLADPEKKNYALPELQVLRLSAIVKILKDTSHYHSTKLADADVMLLLNLLRSWPRESLFPVIDMLRMIVLHPDGAILLLKFIDSDGILLELIQKVTMAPVIAANILTSIRLIANLFKNSGYYNWLQKHRSEILDAFSSCYSSANKAVQLSFSTLILNFSVLLIDEKDLDGQGQVLSAALEIAEEENLEADSKFRALVAIGSLMVEGGDDIKRTALDFDVESIAQKAKTSKDAKIAEVGADIELLIKER Homology
BLAST of IVF0000582 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P27612 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Mus musculus OX=10090 GN=Plaa PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 401.4 bits (1030), Expect = 2.3e-110 Identity = 266/804 (33.08%), Postives = 416/804 (51.74%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P54319 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Plaa PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 396.7 bits (1018), Expect = 5.7e-109 Identity = 264/799 (33.04%), Postives = 410/799 (51.31%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6GM65 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=plaa PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 385.6 bits (989), Expect = 1.3e-105 Identity = 257/795 (32.33%), Postives = 411/795 (51.70%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y263 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLAA PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 383.6 bits (984), Expect = 5.0e-105 Identity = 255/799 (31.91%), Postives = 408/799 (51.06%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O94289 (Ubiquitin homeostasis protein lub1 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=lub1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 345.1 bits (884), Expect = 2.0e-93 Identity = 225/715 (31.47%), Postives = 368/715 (51.47%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SPK0 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold139G00010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1511.1 bits (3911), Expect = 0.0e+00 Identity = 757/757 (100.00%), Postives = 757/757 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C0S7 (phospholipase A-2-activating protein OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495187 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1511.1 bits (3911), Expect = 0.0e+00 Identity = 757/757 (100.00%), Postives = 757/757 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C5T3 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold13G00010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1476.5 bits (3821), Expect = 0.0e+00 Identity = 744/757 (98.28%), Postives = 744/757 (98.28%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C3A1 (phospholipase A-2-activating protein OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111007968 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1367.8 bits (3539), Expect = 0.0e+00 Identity = 678/755 (89.80%), Postives = 709/755 (93.91%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EZ65 (phospholipase A-2-activating protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437774 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1352.8 bits (3500), Expect = 0.0e+00 Identity = 666/757 (87.98%), Postives = 707/757 (93.39%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. NCBI nr
Match: XP_008454875.1 (PREDICTED: phospholipase A-2-activating protein [Cucumis melo] >KAA0031249.1 phospholipase A-2-activating protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1507 bits (3902), Expect = 0.0 Identity = 757/757 (100.00%), Postives = 757/757 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. NCBI nr
Match: XP_031744253.1 (phospholipase A-2-activating protein isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8645890.1 hypothetical protein Csa_017692 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1473 bits (3813), Expect = 0.0 Identity = 739/757 (97.62%), Postives = 747/757 (98.68%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. NCBI nr
Match: TYK06700.1 (phospholipase A-2-activating protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1473 bits (3813), Expect = 0.0 Identity = 744/757 (98.28%), Postives = 744/757 (98.28%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. NCBI nr
Match: XP_038887808.1 (phospholipase A-2-activating protein [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1426 bits (3691), Expect = 0.0 Identity = 714/757 (94.32%), Postives = 731/757 (96.57%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. NCBI nr
Match: XP_022136219.1 (phospholipase A-2-activating protein [Momordica charantia] >XP_022136220.1 phospholipase A-2-activating protein [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1364 bits (3530), Expect = 0.0 Identity = 678/755 (89.80%), Postives = 709/755 (93.91%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. TAIR 10
Match: AT3G18860.1 (transducin family protein / WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 1058.9 bits (2737), Expect = 1.9e-309 Identity = 507/760 (66.71%), Postives = 632/760 (83.16%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. TAIR 10
Match: AT3G18860.2 (transducin family protein / WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 1057.0 bits (2732), Expect = 7.2e-309 Identity = 506/760 (66.58%), Postives = 631/760 (83.03%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. TAIR 10
Match: AT3G49660.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 108.6 bits (270), Expect = 2.2e-23 Identity = 79/254 (31.10%), Postives = 125/254 (49.21%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. TAIR 10
Match: AT3G18130.1 (receptor for activated C kinase 1C ) HSP 1 Score: 90.1 bits (222), Expect = 8.1e-18 Identity = 82/308 (26.62%), Postives = 143/308 (46.43%), Query Frame = 0
BLAST of IVF0000582 vs. TAIR 10
Match: AT1G48630.1 (receptor for activated C kinase 1B ) HSP 1 Score: 89.7 bits (221), Expect = 1.1e-17 Identity = 75/263 (28.52%), Postives = 127/263 (48.29%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (IVF77) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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