HG10019267 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATGCATTGGTGGTGTTTCTCTTCGCCGTCTGGTTTCCGCTTATTGGCGGAGTGACGGCGGCTTCTACGGCGGCGGTGAAGGTCGGGAATGTTTCGAAAGTTGAAGATGCGTTTAATTTCAGGATTTATTATGGACAGTCGTTTAAAGTTATTAAGAACGCCGTTGATGGCAAGAGCTACCTTCTCATTCAGGTTCTTTTTCTATCTGTTATTATTTTTTTCTTGAAGATTAAATTATTGAAAATATCTAAAACTTAAAAGTTTTAATATTATCTCTAAATTTTCATCAATGTTCCGAAACTATTTTTTAATAGAAATGTTTTAAATTTTTTATACAAAAATTGACACATGAACTTTGTAGAGTGACCTATAATGAAAAGCTAGATCATCAGTCATGTTATTCCAAATCATGATTTAGGTGTAAAATTTTAAAGGATTTCTATTTGTTACTTTTGAAATATTTATGAAAATTTAATGGTAATATTACAATTTTTTTTAAGTATAAGACACTTTTGAAATTAAAAATATACTTTATGGGTATTTTGTATAATTTAACAAAATGTATGCCTAACCCTGATTATTGGACCGATTGAGGATCCTAATATAAAAGTGTTCAACCTTTTTACCACTTTCTATACATTTATTTATTTTTTTATTACAATACTATTTTCCTCGTCATAGGTTAGATTTTATTTTATTTTAGTTAATGTATTTTCAATTGTTTATAATAAATCTTTAAATAATTGTAATAGGTAATACTTTTTAGGATAATAATTAAATCTATGACTCTATCATGATAGACTCTTGTTAGTGATTTGATATATTGATAAATTGTTAGAGTTAAATCTAAATTTTACTATATTTATAAATTATTTTGCATTATACTATGTCTGCAAATTCTTTGGATCTGATTGCTATTATTTGCAACTATTTCTAAATTTTGAAATTAGTTTATGGACTTTCAATAAATTTTAAATTTAGTCACAATCTATAGGGATGCTACTAAATTTGATGGGAAACATCAATTAAAAAACTAAGAACTAATTTTATGGTTTTTGGAAACTAGATAGACTAAAATTTGACCATATTAGAAGTACATTGATCAAATTGGTTTCTTTAATCTCAAAATTTAGCTAAAGTATATATGTATGTTGGAATATATTTTATTGGTGAAATAAAAAAAAAAAATTGATGTTTGTATATATAGAAAGAAATTTATGTGGTTAGAGATTTGATGTGAAAAAGATTGGGAAAAACTGCAGAATAATTCAAAGATGGCAGGAAGAACAAAGTATTGCACTTCAAGAATCAAATCTTACGTCATCCCTTTGGCTAATTATTCCGTTGATACCGACCTCTTTCCAGGTATCGAAAAAACTTTATAAGGTAGTACTTATTATTTTCATTCTATCATCCACACGCGCGCCATTCAATTATTTATTTATTTTATAGACTATACATTATTTTTAAATGCTATTTCTGTGACATGCAATGAATTGCGATAGTATAGAAAAATACTAGAAATTTGCATGAATTGGTAAATTTGGTACTTAATTTTTCCAGGTACCCTTTCTTTTCTATATCCATTCTTATTTTAGACAATTACTTTTTCACTTGGGAGTTTTTAAATTTTTAATATCTACATTTTTAGTGCTAGAATTTTGAAAAATATGTTTAAAAGCTTTTGAAGTAATTCTTTATAATTATTTTAAATTATATATATATTTTTCACAAATTTAAAGGAAGTGGTTTTTTCTCCCTTAAAATGCATATAATTATTTAAAACAATTTTTTCTTAAAATATCATTAACTTTAAATTTTGTTCAATTTTACTCCCTATACTTTCAATAAATCTTAAAGTTAATTTTTACAAAAGTTGATTAAATAATAATAATAATTTTTATGCAAGAAAATAGAGTATATGAATATATTTTTAAAATTCATAATAAAAATATAATAAATAACAATTTTTGTAAAAAAAAAAAAAAAAATCACCAAAAACTAGTAGTGAGAACAATTGAAAGTACAGTGACTAAAATTAGATAATTGAAAGTATAGGAACTAAAATTGAACAAATTTCAAAATATAGGGACCAAAATAGTATTTTTAATCTGGAAAATAATTTAGAGATATTTTAAACTTATTATAAAAATTTTGATGACTAAAAATATACGTTTTGAAATGCACTTATTCTTAAAAATTAAAAAACTAAAAATACATATATTGTTAAAACTCGAACACTGCAAAGCTAACATTTTCCAAATTTTGATTACTCTTTTCTTTCTTGTATGTATGTGTATATATAAAATCCTTTACAACAATAATTATGAAAATGAAGAAATGAATGGTGTAATTTGATATTAATATTCAAATGTGTTGTTATTATTAATGTGATTACTTTTTGATACACAAATCACATGAGTCCCAATATGCATAGTTAATTTTCGCAATCAATATCTAACTTTTCTTCTTTTTCTTCTTTCCTTTTTGTCTTCTTCTTTCCCTCATGGAATCCTTCCAGTTTCCTTTTTCGAGGTATGTATTATGCTTCATCTTTCCTATTATTTTTCTTTATAAAGCGACTTCCATATTCCATTTCTCAAGCATCAATTATTGAAGTAATGTGAATAATTCAATATTTTATGTTATTTTGGTCTTTCTTTTTCTATAACTCTTATTTTGATTACTATTTGGTTCTTATAATTTGAGATATTAATTAATTTTGTAGACAAATTTATCTAAATTATCTTTCACTAAATTTATTGTACAGCTTACTCAAAATATTAGGTCAGTCTTAGACCTACTTTTTAAAATAAAGATTTTATAATATTTCCAACAATTTTATCATTTAATTTTTAAAAAAACTAATTAAATATTATTTTTGCCTTATTTTTTAGAGAATTCGTATTTCTTAAATCGCTAATTAATTTAAAAGTTTAAGTTAATGGATAGAAATAAATTTAATTATATATCATCTAAATAGAATTTTATATGGGTAAAAATTACTTCAATCTTGACGTTTGTTATGAAAAGTATATCATTAATTAAAGTGCAATAATTTGAAAACAAGTTTATTCTTATAGTTTGTTATGAATATTATTGCATTTTACTTGTGAAATTTAATTTGTATTGAAAGATTATATTGTATGGGACAGCTTCTAGGGTTATTAGGAAGCTTGAAGGGCATAACGTCGGAGAAGGTGACGTCAGAATGCGTATTAAAGCAATACGAAAAAGGAGAAATTCAGATTATAAATAAAACGGAAATCCAACAGCTGGCACAGTTTGCGGCTCACTTCGTTGCTGACGTGGACCAACCACAGTCCTGCAATTTTGCCACGTTTCTTCCTTCCTCCGAGGATACGCCTTTGCAAGTAAAACCATCCTTCATTCTTTTTCGGCAAATTACAGAAATCACTCGTTAAAGTTAAAAGTAGGGGTGGTAGTTGCAGTTACATATTTAAATTTTTAATTATAAAAATTGAGTTCTTAAATTTATGCAAATCTTAAAATTTGCCTCTTAAATTTACAATAATTGTATAAATTGGACCTCTAAATGATAAAAACATATTTGAGAAGTCAATTTTTATCACTTGGAGATCAAATTACTCTAACTATTATGAGTTTGAGGTATAAATTTGAGGCTCAATCTATACAATTAAAGTTTGAGGGTGTAGTTCCATCATATTTTAGGGGTGATTTTTGCAATTTACTCTTTTTTTAAAAAAATAAAAAACCCTTATGGTTCTGTTTTGATTTGATTTCTAAATTTTAAAACTCTACAATTTTATTCTTAAAATATTTTATCAGGAGTTGCCCTCACCGGCATGGAACTAGGTTTCATAATTTTTGCTACATAGGTTAAAAAGAACAATAATGTTTGAGAGTGACTTTTAAACAGGGAGAAATGTTTAAAATTTATTTTTAAATATATCTTTGTGAGAAATTTTTATAGCTAGAAAAACTGTTAAATTGTTTATCGAAAATAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATTAAAAGACTTCTATCATTTCTATCACTGATAGACCTTGATAGACTTCTATCGGCGTCTATTTAAAAATTTTGCTTTAAAAATTTTCCAATCTTTAATCACTTTCAATTAATAATTAATTTTGGTTTATTAAAAAGCATGAAATTTTAACAATTTTAAAATCATTATTAAATTAGGCTTAAACTTATAAGAAGGAAATTGTTTATCTTTATTTGTCTTTTAACCCTTTGCTAATAGCTGGAAATTTTAGAGAGCAGAGTGGATAAAGTTATTGGGAGCTTTTGCAAACCTGGAGGCAAGAGCCACTCAAATTTACACTGCGGTAAGTAATTTGTACATCTTATTATATGGGTTAAAATGTCATATTTATTTGTACTTTAAACTATTCAAGTTTAGGTCATATAATTTCAGAAAAAAAAAAAAAGGTTAAAATTGGTCTTACTATTACTATAAGCTTTTTGTTAACTTTAAAACAAAATATTTCTATATCGACCTATTAAAAGCATATATTTACCTTGTATCTTTTTTTGAATAAAAAATCTTTAATTATTATTGTACCAATTTTGAAAAAAAAAATCAACTTCAAGACTTGTTGAAAGTACACATTTCGAAGTATAACTTAATAAGTATAAAAATGGAATGAGATTTTGAAGTATATTAGTATTTTAACTCTTTTATATTTAGGAAAAAGAATTTTTTTACCCCAAAACTTGTCACATTGTATCCATTTTGAGCATAAATGTTCAATTTCATTAAATTTATCATATATTTAATTTCTGCAAATTCTTTTTTTTTTCTTTAAAAAAAATTTACCATTCATTAAAAAAAATATTATAAAATTTTTATAAGATGTTGTCAAGTCTGGTGCAAATTGAAGTGGCTATGAATAACTCTGCGAAAATGTACAACTTCTAATAAAAATTAGCTCTGATGTCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATCTTATCAATTTTGTAACATACATATATCTTTTTTAATCTTTAAAAATGTAAGATAATACTTGTCTTTAATAAATTTTCAAACATAAACTAATTCCTAGGGTAGAATTTATTAGGAGTGTTTGTGGGTTGAATTGGGTTGGGTCGGAGCACTTTTTAGACCAAATTTAATTGTTCAGTTTGTAAATTTATTCAACCCAAATAGGCTTTATTAAATAATGAACTCAACCCAACCCAACCATGAAATAGTTGAGTTCGGTTGGTTCAAGTTACTCGAGTTATTTATATAAATTTTTGTTGTAAAAATAAGTAAAATGTTAATTTGTAAAAAATTTATTTAATTCTTTTCATATATTGAATTAAGATTAATAACTGAATTTCAATTTATATTTTAAAAATTTTCTTTCTAAAGTGCTAAAAAATTATTTTTAGGAGTTGTTGAAGAATAAATAATCTAAAAAAAAATCATGAAATTAAATAAAATTAAAATAAATATATGTATAATTGTATCATAAGTAAAAAAAAACATACTTTTATAATTAACAATAAGTTCAGGTTGGTTTAAGTTGGCTTGGTTATTTTAGATGAACTCATGAACCAATCCAACTTGTAAAATTTCATTTATTTAAATTCAACTCAATTTAAATGGGTTAATAACCCAACCCAAACCTTACTGGTAGGGTTGGATTTGGTTGATCATATTTTTTGGATCCTCAAGTTTATTCTTAACACTCCTAGAATTGTAGCACATGCAAATTTATGAAATTGAAATTTTGAGGCAAGAAAAGATGCAGCTTAATTAGGTTCTTTATAGGTAAAACCTGATTATTTTACCTTATATTTATTTTTCTATATTTTTTTGAGTTAAAATACTTTTTTATCTCTATACATTGAAATTTGTTCAATTTTAGCTGTTATTATTTTAATTGTCAAATTTTAGTCCATGTACTTTCAATAAATCTTTAATTTAGTCTCCATTGCTAGTTTATTATTGTTGGTTTTTATTTTTATTTTTATTTATTTATTTATTAGCATTTTTACTATAAATCTTGGAACATATTCACATATTGTGTTTCCTTACATGAAAATTATTATTATTATTTAACAAATTTTGGTAAAATTTAACTTTGAGTGACTAAAATTAAGATCATTTATTGAAAGTACGTGGATTAAAATTGAACAAACTTCAAAATATAGGAATCAAAATGATATTTCAACCTTTTTTTTCTCGAAAAAACATTATTTTGAAATATATAGTTGTGTAAATATAAATGTGTATGTGTTTTGTTGCAGATCAAAGAAAATTACATGTGCCTGAAGAACATAGCAACCACGAGAAAGACTTTCAAACCCATTGTTGCCTGGATGGGTTACTATGATGTTAGAATCATACCATTTTTTATTTTTTATTTTTATTTTTTTAAAATTAAATTACATTCGTTTTGAAAATTAATTTTTTAATTTTTTAAAATATTTTCTCTAATTTCTTTTAATTGATTGAACAGGGCATATGGTCTTTCACAAAGGACGCCTACAAGCTTAAGGTAAGCTAA ATGAATGCATTGGTGGTGTTTCTCTTCGCCGTCTGGTTTCCGCTTATTGGCGGAGTGACGGCGGCTTCTACGGCGGCGGTGAAGGTCGGGAATGTTTCGAAAGTTGAAGATGCGTTTAATTTCAGGATTTATTATGGACAGTCGTTTAAAGTTATTAAGAACGCCGTTGATGGCAAGAGCTACCTTCTCATTCAGCTTCTAGGGTTATTAGGAAGCTTGAAGGGCATAACGTCGGAGAAGGTGACGTCAGAATGCGTATTAAAGCAATACGAAAAAGGAGAAATTCAGATTATAAATAAAACGGAAATCCAACAGCTGGCACAGTTTGCGGCTCACTTCGTTGCTGACGTGGACCAACCACAGTCCTGCAATTTTGCCACGTTTCTTCCTTCCTCCGAGGATACGCCTTTGCAAAGAGCAGAGTGGATAAAGTTATTGGGAGCTTTTGCAAACCTGGAGGCAAGAGCCACTCAAATTTACACTGCGGGCATATGGTCTTTCACAAAGGACGCCTACAAGCTTAAGGTAAGCTAA ATGAATGCATTGGTGGTGTTTCTCTTCGCCGTCTGGTTTCCGCTTATTGGCGGAGTGACGGCGGCTTCTACGGCGGCGGTGAAGGTCGGGAATGTTTCGAAAGTTGAAGATGCGTTTAATTTCAGGATTTATTATGGACAGTCGTTTAAAGTTATTAAGAACGCCGTTGATGGCAAGAGCTACCTTCTCATTCAGCTTCTAGGGTTATTAGGAAGCTTGAAGGGCATAACGTCGGAGAAGGTGACGTCAGAATGCGTATTAAAGCAATACGAAAAAGGAGAAATTCAGATTATAAATAAAACGGAAATCCAACAGCTGGCACAGTTTGCGGCTCACTTCGTTGCTGACGTGGACCAACCACAGTCCTGCAATTTTGCCACGTTTCTTCCTTCCTCCGAGGATACGCCTTTGCAAAGAGCAGAGTGGATAAAGTTATTGGGAGCTTTTGCAAACCTGGAGGCAAGAGCCACTCAAATTTACACTGCGGGCATATGGTCTTTCACAAAGGACGCCTACAAGCTTAAGGTAAGCTAA MNALVVFLFAVWFPLIGGVTAASTAAVKVGNVSKVEDAFNFRIYYGQSFKVIKNAVDGKSYLLIQLLGLLGSLKGITSEKVTSECVLKQYEKGEIQIINKTEIQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATFLPSSEDTPLQRAEWIKLLGAFANLEARATQIYTAGIWSFTKDAYKLKVS Homology
BLAST of HG10019267 vs. NCBI nr
Match: XP_038903360.1 (uncharacterized protein LOC120089977 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 287.0 bits (733), Expect = 1.1e-73 Identity = 165/244 (67.62%), Postives = 170/244 (69.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019267 vs. NCBI nr
Match: XP_008454366.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103494786 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 276.2 bits (705), Expect = 2.0e-70 Identity = 157/241 (65.15%), Postives = 163/241 (67.63%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019267 vs. NCBI nr
Match: XP_004152259.1 (uncharacterized protein LOC101208429 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN52794.1 hypothetical protein Csa_015282 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 273.5 bits (698), Expect = 1.3e-69 Identity = 155/240 (64.58%), Postives = 162/240 (67.50%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019267 vs. NCBI nr
Match: TYK29493.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold655G00920 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 268.5 bits (685), Expect = 4.2e-68 Identity = 151/230 (65.65%), Postives = 158/230 (68.70%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019267 vs. NCBI nr
Match: KAA0044364.1 (F12P19.7, putative isoform 2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 267.3 bits (682), Expect = 9.3e-68 Identity = 153/246 (62.20%), Postives = 161/246 (65.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019267 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BXY4 (uncharacterized protein LOC103494786 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494786 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 276.2 bits (705), Expect = 9.7e-71 Identity = 157/241 (65.15%), Postives = 163/241 (67.63%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019267 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KV51 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G001610 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 273.5 bits (698), Expect = 6.3e-70 Identity = 155/240 (64.58%), Postives = 162/240 (67.50%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019267 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E0B2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold655G00920 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 268.5 bits (685), Expect = 2.0e-68 Identity = 151/230 (65.65%), Postives = 158/230 (68.70%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019267 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TMJ6 (F12P19.7, putative isoform 2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold46G00910 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 267.3 bits (682), Expect = 4.5e-68 Identity = 153/246 (62.20%), Postives = 161/246 (65.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019267 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F572 (uncharacterized protein LOC111442235 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442235 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 261.2 bits (666), Expect = 3.2e-66 Identity = 151/243 (62.14%), Postives = 159/243 (65.43%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019267 vs. TAIR 10
Match: AT1G65900.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; Has 306 Blast hits to 306 proteins in 119 species: Archae - 19; Bacteria - 238; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 34; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 15 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 179.5 bits (454), Expect = 2.4e-45 Identity = 108/246 (43.90%), Postives = 136/246 (55.28%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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