HG10007663 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTCATGATCGTGGATCTTCTACAGTCGCTGCTGCTAAACTCTTCAGCTTATCTGGGAGATTCACGATTCCCAAGCGTTTGCACCTACTCTGTATTGTTTTGCTGGTAACATTCCTCTACAATTTGTTTCTTTTATGTTTTCAATACAATGGAAATTTTATGGTTGATTATCTCGTTTGTCATATATCTCATTGGAGATTCGCTTAGGATTTTTTTTGGGTATTTATTGCTTTCATTTGTTGTTTTAAGCTATTTTCTTCACGAAGTTGAATAAACCTGTTATTGGAGTTTAATCGCGTCTCGGAGAAAGAAATTGGTGAAGTAAATGAAAGACTGAGACTGAGATACCCGAATTTTACATTGGTGATGATATAAAAGAAAGTAGTAAAACATATCTCAATTCATGAGATTGATATGTAAAAACAACAACTGAAATGGAAATGAACAGAAAATACGTAAATGGCGTTGATAAGTTCCAAGCATTTCGAGACGCTAGGCTTTCCCCAAAATTAATCCCAGAATATATTGCCTTCAACCTCTTGTAACTACTTTTCCCAGAATCAAAATCAGTCTTTCCTGTTGGTTTCTGTTTTGGCCTTTTTGGTTAGTTGAATTTTGTTTGGTAGTTGTTGATTTTCTCTCACTGGGTGGTCGTTTCCTTGAATATTATGTATCATTTCATCTACCCATGAAAACTTGTTTCTTGTTGGAAAAAGAACCTTTCTTTTAATCGGCAATAAAAGTATTTAATCACTCCCTCTAAAAGCGTAACAAATATTGATGTTAAAGCACATCGTTTTCATCTTTTCTTATATAAATCTGGTCTGGTTGGGAATTAGTCAGAAAGTGCACAGCCTTGAACAAGTTTCCAATAGCTGCTGTTTCATCTAGAACACTGGTGGACCAGTTAGTTCTTTTAATAATAGAATGCATAGTGACCTCTGGGAAATGGTTAGCGTGTTAACTCACAAATACATTTGTATTAACTTCTTTCATGTGCTCTCATCAGCTATTAGCAGCAAGACCGTTTGCATCCTCCTCTGGAAATCGTAAAAGTGGAAAGTCCTCTGTATTTTCCTTGTTTAACCTTAAAGATAAGAGTAGATTTTGGAGTGAGACAGTCATACGTGGTGGTATGTCTAGCTTTCTTATCTTTGTTGCCTCAAAGTTTATACGTTCCTTAATCATGGTTATTGCTAATGAGTTCTTTTTTTTGTTTTACTCTTTTTGACACATTGTTTATTTATTTGTTTAGATTTTGATGATTTGGAATCATCCACCACTGAGAAATTGAGTGTTGTTAACTACACGAAGGCAGGTAATTGTATGCTCGAAACAGTGAAGAGTTTCTTTTTTGTCAATGTAATAAATATTGTGAGAGTTGGGGGCTTTTAAGCCCTTGTTATGCTTATGTTACATTAAGCATGAGAGTTGGTTGGATGTCACATAAGTGAAGAGGAGTTCGTGGAGTGAGGTAAAAAAATTTGAATTTTTACTGGAACGAAACTCTAGTTGGGAGAGTTCTAAGTTTTTCAAAATCTCGGAGTACTTAATGGCTAATGCAACAGTCTTTAGTCCTATCACAAACCAGCAACACCAATGGATTCATGCCAGATACAGAGCCATCTGAAATGTCTTTTAAGCTCCATTTGGGATCTCACCCTGCTGATTTTTGTTTACATTCTTGAAATTGTTATATTCATTTCCTTTTCATTTCCTTGCCTGTTTCTTCTTATAAATGAACATGTAGAAAGGTTTCTAAATCGTCATTACTCACTCAGTGATATATGTTTTTGGAGGGGAAATCTTTTAGCTTGGTTGTGTTGGGTTTACAGAATTTATTATTTCATCTTATGTCTTCCTTTAGAAAGTCTCCGGTACCCGTGAAAGATAATCTGAAATATATGTGTATTTTATGGCAATTATTTAAATCTGGAGTTGGTGCGGTGTAAAATATCTTTTGTATTGTCATTTTGAGCGCCAGTGACAAGGGAGTTGTATTATTTGTTTGTTACTCATTCCATATATTTATTATTTAAACTATTTATTCTTTTTGGTAATTTCCACAACGAAAAAGCAAGAGCACCATTAGAAGTCTCTTTTTCACATCCATCTTCCATTGCAGGTAATGTAGCAAATTACTTAAAGCTTCTTGAAGTTCATTCCCTGTACCTTCCAGTCCCTGTGATTTCATTGTATAGGATTTGAAGGGAAAGGTAACCATGGTATGTCATGCTCCTGATTATGAATTTGTTTAACGGTTGGACTTTTAGCTTTGGTTCCGAATTGTTATGTGGATGATCTAAGAGTTCTCTTTCTTGTTAGAATTCAAGCTGCATCCAGAAGAGCTTGAACGTTGGTTCATGAAACCTGATCATATCTTTGAACATACACGGATTCCGCAAGTTAGCGAGGTGCTAACCCCTTTTTATAATATCAGCATGGACAAAGTTTTGAGGCACCAACTACCCCTCGTCAGTCACATAAACTACAAGTAATGCTGTACTGGTACTTTGTATATTATGGGACCTGAAGTTGACATGCTTCTTTGAGAAAGTTAAATTTCTTATTTTATGTTTGTCATAAGTTTGTAAATGACGATTTAGCTCATGCCTACAAAGTTTGAAATGAGATCCTTAATCTTCTCATGAAAAATGTTGTTGAAATTTTGCAGTTTTTCTGTTCATGTAATACAAACGGGCGAGAAGGTTACTTCAATCTTTGAGCTTGCAAGAAATGTCTTATCTCGCAAAGAAGACGTATCCAATAATGGGTAATTTTGATATTATTATACTATTGTTAGTTTTATCATTTTTTATCTCATTAGATTCTCATTGTTGAAGCTATTTGAGCAATGTTGGCTTTGGCTTTTTTTTTTTTTTTTATTTTATTTTATTTATTTATGTCTAAATTTTTTAAAATTATTTATTATTATATGTATGTTTCTTTTTATAGTTTGGCTCTTCTGGCTGTTAATTGTATCTCATGGTTGCAGGGATGGGAATGATGCTTTTTGGCAAGTAGACGTGGACCTGATGGATGTACTTTTCACTAGCTTTGTGGAGTACCTTCAACTTGAAAATGCTTATAACATTTTTATTCTAAATCTCAAGCGTGACACAAAAAGGGCCAGATATGGATACCGGTGTGTAAATTTTTTAGCAAATCCTACTGCAATTTTGTTTGTTTGCTTTGTTTCTTTTCTGAACTCTAATACTAGAGATTAACCATACAGTTGAACCCTCAGTGATGTAAATTTTTTTTTCCTGGTCCATCTTGAATGGTCTTGGAATCTGTTAAATATTGCAATTGGATCTGTATCTTATAAAGAAAATCAAATCCATAGAAAGTTTATGACCATGTTCATGGAAAGCAGTTAATAGTATTGTCAGCATATCCTTCTTTGTTATTCTTGCAAAAGGAAATTACTTATTTTGAATAACCTGGAATCACACACTATTTAAATAAAGCCTAAAGGTGTGCATAGGTTTCTTTGTAGATTCTCATGTTTCTCTCCTTTTGCTTTGGTGGTGTTTGGAAATTGGCATTGTCATTTGGCTCTTGTATTAGGCTGCTTTTTCGCAGAGCTTTGCAGGCTGGGAATCCTTTTTGGTTGTTATTTTTTTTTCTTGGAAAATTGTCTAATTTAGTCTTTAGGTTGTGAAAACTTACACTTTCATCTCTAAGTTTTAGGAAATATTCCATTTTAGTCCTCTGATGGTTAGTTAACGTAGTGGAAAAGTGATGTGACATATTTTATAATAAAATAGGTAATATTGTAATTTTTTAAAGAAAAATATAAAAAGAGAAAAGCTATCTCTCCCCCTACCCACCCCACCCCCTTTCCTTTCCCCTTCCCCCTTCCCAAGTTCTACGGTCCCCCCTGTCGGGCCCACCCTTTCGACTCTCTCATCTCCATTGAGCAACATTCGACGGGGGTGTGACCTATGACCTCGGCATGGCCTCCTCTAGACAGCCTCCCCCTGCTTCCATCCCCACTCGCTCCATCCTCATTGACTAGAAGATATTCACGCTACAATGTGATATCTCTTCCAATGGTAAACAACTGCAAATCACGGAACATAGCAGAATGTCCTCTCAATCCCTTACCCTCACTGGGAAGGCACTCGATTGGTTTTCCTCCCCCTTCAATTCACCCTACCGTGATCCATGTAACTTTAAATTCTTTAGAAAGTTCATGGATGTTGGGGCCACCATTTGGCTAGAAAAACACAGTAACAAAAATGGCTACTTTGCTGAGTTAACTCACCTGTATTACTAAGGGCGTCAGATCAAACTTTTCATCCCATCTGAAGATGACAACGAGGGTGGTTTTCCTTCTTCTCATTGCTTTTAGAGTACAAGAGTGGACCAACATCGGGTGTCACTAAGCCTCACAGTTATAAGGCTGCTGTGCAATCAAAACCTTCTTTTAATTCAAATCCACTTCCCCCACTACCGATTACAAGAGCCCAAGTCTGTATGAGCTCTACTCCACTTGCCGATAACACCTGCTTACTGCAATATGCTTGGACCTCAATGGTCGTGGTGCAACGATACCAATTACATGATTCTTGGTCGGAGGTTTGCACTGCAATTTAATCCTCTTTGTCACTTGATGCACAATCAACCCGTTCCTTGAAGACAAGGCCCTACTACATGTCTATGATCCACAAATCTCTGAAAATCTCAAAAGTCATACTGATTGGGTTAACATTGGAAAGTATCGGCTAAAGTTTCTAGATACCTCTATTTTATCCTCCTTTTAACCGCAGCTAACGTCTTCCTATGGTGGCTGGATCGATGTACACAATCTTTCTCCAACTCTTTGGAATGACAAGGTATTTGAGTTTATTGGTGATAAATGTGGTGGCTACAGCCGTGCATCGAATAATTCAGAAAGGGGAATCAACTTCATGGCAACACGATTGAGAATAGCTTTGAATACAGTGGGATTTATCCCGTCCCACTTGAATTTACCGATCGATCTG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ATGGGTCATGATCGTGGATCTTCTACAGTCGCTGCTGCTAAACTCTTCAGCTTATCTGGGAGATTCACGATTCCCAAGCGTTTGCACCTACTCTGTATTGTTTTGCTGCTATTAGCAGCAAGACCGTTTGCATCCTCCTCTGGAAATCGTAAAAGTGGAAAGTCCTCTGTATTTTCCTTGTTTAACCTTAAAGATAAGAGTAGATTTTGGAGTGAGACAGTCATACGTGGTGATTTTGATGATTTGGAATCATCCACCACTGAGAAATTGAGTGTTGTTAACTACACGAAGGCAGAATTCAAGCTGCATCCAGAAGAGCTTGAACGTTGGTTCATGAAACCTGATCATATCTTTGAACATACACGGATTCCGCAAGTTAGCGAGGTGCTAACCCCTTTTTATAATATCAGCATGGACAAAGTTTTGAGGCACCAACTACCCCTCGTCAGTCACATAAACTACAATTTTTCTGTTCATGTAATACAAACGGGCGAGAAGGTTACTTCAATCTTTGAGCTTGCAAGAAATGTCTTATCTCGCAAAGAAGACGTATCCAATAATGGGGATGGGAATGATGCTTTTTGGCAAGTAGACGTGGACCTGATGGATGTACTTTTCACTAGCTTTGTGGAGTACCTTCAACTTGAAAATGCTTATAACATTTTTATTCTAAATCTCAAGCGTGACACAAAAAGGGCCAGATATGGATACCGGAAAGGTTTATCTGAATCGGAGATAAATTTTCTTAAAGAGAACGCACACTTGCAATCAAGAATTCTTCAATCAGAAAGTACACCAGAAACTATTCTTGCTCTTGAGAAGATTAAAAGGCCCTTATATGAAAAGCATCCCATGAGTAAGTTTGCATGGACAATAGCTGAAGACACTGATACTATGGAATGGTACAACATCTGCCAAGATGCCCTAAGAAAAGTTAATGAATCGTATCAAGGAAAAGAGACAGCTGATATCATTCAAAACAAAGTTTTGCAGATATTGAAGGGGAAAGATAGAGAGATGAGGCTTCGTCTTGATAAGGAACTAAAATCTTTTGATTTCAGTGGTTTCCATGCTGAATGTCTCACAGACACATGGATTGGCAATGACAGGTGGGCATTTATTGATTTAAACGCAGGCCCTTTTTCATGGGGTCCCACTGTTGGTGGTGAAGGTGTGCGAACTGAGCTAAGCCTACCAAATGTTGAAAAGACGGTTGGTGCTGTTCAAGAAATCTCAGAAGATGAAGCTGAAGATCGCCTGCAAGATGCTATTCAGGAGAAATTTGCTGTTTTTGGTGATAAAGATCATCAAGCCATTGATATTCTTTTAGCAGAGATTGACATATATGAGCTTTTTGCTTTCAAACATTGCAAGGGAAGGAAAGTCAAACTTGCTCTTTGTGAAGAACTTGATGAGAGGATGCGGGACTTAAAAAATGAGCTTCAGTCATTTGATGGTGAAGAATATGATGAAGATCATAAGAGGAAGGCCATAGATGCATTAAAACGGATGGAAAATTGGAATTTATTTAGTGATACGTACGAGGAGTTCCAAAACTACACTGTAGCACGTGATACTTTTCTGGCTCACCTAGGTGCTACTCTCTGGGGGTCAATGAGACATATTATATCACCTTCACTTTCTGACGGGTCATTCCATTATTTTGAGAAAATATCATTTCAATTGTTTTTCATCACACAGGAGAAAGTTAGACAAATTAAACAATTGCCCGTGGATCTTAAAGCTCTAATGGATGGGCTCTCCTCTTTGTTGTTACCTTCACAGAAAGCACTATTTAGTCAGACCATGTTACCACTCTCAGAGGATCCTGCTTTGGCGATGGCCTTCTCAGTGGCACGACGTGCAGCAGCTGTTCCACTGTTGCTTGTTAATGGAACATATCGGAAAACAATTCGTACCTATCTCGATTCATCTATACTCCAGTATCAATTGCAGAGATTGGATCATTCCCTTAAAGGAACAAATGCTCCTCATAGTTCTACACTGGAAGTTCCAATATTTTGGTTCATTCACACAGAACCCTTATTAGTTGACAAACATTATCAGGCAAAGGCACTCTCCGACATGGTTATTGTAGTACAGTCAGAGATTTCATCCTGGGAAAGCCATTTGCAGTGCAATGGGAAATCACTTATATGGGATATGAGGAAGCCAATCAAAGCTGCTCTTTCTGCTGCTGCAGAACATCTTTCCGGTCTGCTCCCTCTCCATCTTGCATACAGTCCATCGCATGATACAGCAGTTGAGTTTCAGTCTGATACTATTGCTCGAAGTTATATCATCACAGCCCTCGAAGAATCAATACAGCGAGTCAATTCAGCTATTCATCTTTTACTAATGGAGCGTACCACTGAAAAGTCCTTCAAGCTCTTCCTGTCACAGGAGCGTGAGCTTGTAAAAAAGCATCAGTATGTTGTTAGCCTGTGGAGAAGAATCTCAACCGTTTCTGGAGAGTTGCGGTATATTGATGCAGTAAGATTGTTGCACACCCTAAATGAGGCATCTAAAGGGTTCGCAGATCAAGTAAACACGACATTAGCTCTTCTTCATCCCATTCACTGCTCACGAGAGAGAAAAGTAGAGGTTGTGTTTGATGGAACAACCATTCCTGCCTTCATGGTTGTTTTGGGCCTTCTCTACGTTCTTCTAAGACCAAGGCGTCCGAAGCCAAAAATTAACTGA MGHDRGSSTVAAAKLFSLSGRFTIPKRLHLLCIVLLLLAARPFASSSGNRKSGKSSVFSLFNLKDKSRFWSETVIRGDFDDLESSTTEKLSVVNYTKAEFKLHPEELERWFMKPDHIFEHTRIPQVSEVLTPFYNISMDKVLRHQLPLVSHINYNFSVHVIQTGEKVTSIFELARNVLSRKEDVSNNGDGNDAFWQVDVDLMDVLFTSFVEYLQLENAYNIFILNLKRDTKRARYGYRKGLSESEINFLKENAHLQSRILQSESTPETILALEKIKRPLYEKHPMSKFAWTIAEDTDTMEWYNICQDALRKVNESYQGKETADIIQNKVLQILKGKDREMRLRLDKELKSFDFSGFHAECLTDTWIGNDRWAFIDLNAGPFSWGPTVGGEGVRTELSLPNVEKTVGAVQEISEDEAEDRLQDAIQEKFAVFGDKDHQAIDILLAEIDIYELFAFKHCKGRKVKLALCEELDERMRDLKNELQSFDGEEYDEDHKRKAIDALKRMENWNLFSDTYEEFQNYTVARDTFLAHLGATLWGSMRHIISPSLSDGSFHYFEKISFQLFFITQEKVRQIKQLPVDLKALMDGLSSLLLPSQKALFSQTMLPLSEDPALAMAFSVARRAAAVPLLLVNGTYRKTIRTYLDSSILQYQLQRLDHSLKGTNAPHSSTLEVPIFWFIHTEPLLVDKHYQAKALSDMVIVVQSEISSWESHLQCNGKSLIWDMRKPIKAALSAAAEHLSGLLPLHLAYSPSHDTAVEFQSDTIARSYIITALEESIQRVNSAIHLLLMERTTEKSFKLFLSQERELVKKHQYVVSLWRRISTVSGELRYIDAVRLLHTLNEASKGFADQVNTTLALLHPIHCSRERKVEVVFDGTTIPAFMVVLGLLYVLLRPRRPKPKIN Homology
BLAST of HG10007663 vs. NCBI nr
Match: XP_038880657.1 (uncharacterized protein LOC120072284 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1677.1 bits (4342), Expect = 0.0e+00 Identity = 869/956 (90.90%), Postives = 878/956 (91.84%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007663 vs. NCBI nr
Match: XP_004139093.1 (uncharacterized protein LOC101207480 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8653558.1 hypothetical protein Csa_007415 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1670.2 bits (4324), Expect = 0.0e+00 Identity = 862/956 (90.17%), Postives = 876/956 (91.63%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007663 vs. NCBI nr
Match: XP_038880656.1 (uncharacterized protein LOC120072284 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1669.4 bits (4322), Expect = 0.0e+00 Identity = 869/965 (90.05%), Postives = 878/965 (90.98%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007663 vs. NCBI nr
Match: XP_008443650.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487197 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1662.9 bits (4305), Expect = 0.0e+00 Identity = 858/956 (89.75%), Postives = 879/956 (91.95%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007663 vs. NCBI nr
Match: XP_022157070.1 (uncharacterized protein LOC111023880 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1605.9 bits (4157), Expect = 0.0e+00 Identity = 827/956 (86.51%), Postives = 863/956 (90.27%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007663 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B823 (uncharacterized protein LOC103487197 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487197 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1662.9 bits (4305), Expect = 0.0e+00 Identity = 858/956 (89.75%), Postives = 879/956 (91.95%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007663 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DS42 (uncharacterized protein LOC111023880 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023880 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1605.9 bits (4157), Expect = 0.0e+00 Identity = 827/956 (86.51%), Postives = 863/956 (90.27%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007663 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H937 (uncharacterized protein LOC111461618 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111461618 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1603.2 bits (4150), Expect = 0.0e+00 Identity = 830/956 (86.82%), Postives = 855/956 (89.44%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007663 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JJ89 (uncharacterized protein LOC111484942 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484942 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1587.4 bits (4109), Expect = 0.0e+00 Identity = 819/930 (88.06%), Postives = 840/930 (90.32%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007663 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5E4FEA8 (PREDICTED: ZEAMMB73_Zm00001d016452 OS=Prunus dulcis OX=3755 GN=ALMOND_2B028330 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1374.8 bits (3557), Expect = 0.0e+00 Identity = 705/939 (75.08%), Postives = 787/939 (83.81%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007663 vs. TAIR 10
Match: AT5G58100.1 (unknown protein; INVOLVED IN: pollen exine formation; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT3G28720.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 1238.0 bits (3202), Expect = 0.0e+00 Identity = 621/940 (66.06%), Postives = 750/940 (79.79%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007663 vs. TAIR 10
Match: AT3G28720.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G58100.1); Has 1610 Blast hits to 344 proteins in 85 species: Archae - 0; Bacteria - 567; Metazoa - 95; Fungi - 71; Plants - 145; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 732 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 57.8 bits (138), Expect = 5.3e-08 Identity = 56/239 (23.43%), Postives = 106/239 (44.35%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 44.7 bits (104), Expect = 4.7e-04 Identity = 44/190 (23.16%), Postives = 78/190 (41.05%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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