HG10006204 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATTCCGTCTTCGTTAGAGCCTACCGAAGTCATGTTACTCTTGCATCAGGTACGCCGTTTTTTTTTTCTTCTTCCGATCCAAGTGACTTGAGACTGTTTCAGTCAGTTCAATCTTAGATTTCTCCACCGAAACTTCTGCATCTTGTTTGAGTTTATTCTTTTCCCCCTCGTTGATTGCTGCATTTTTGTTATAGAGTCTGTTATTTTCTATTTTGATGCTTAGTTTTCATTTGCGCTTGATGAGTAACTCGATGATGTTCTCGCGATTCTCATCCTATTACTTGATTGAAGCTGATTTCAGTTCGTTTTGTGTAATTTTCTGTTTCTGTTCAGTAGGTGGGATTGGAAACGGCTGGGCGAATCGTGACGTCAACAATGTTTGGCTTCCAAGTAAGACCAATTCGTCTTTGAATCTTTATTTTCTTAGCATTTATCGTTTTCGCTTTTCGTCTTATCTGGTATCCTTTAATTCGTCAATGGCACACGCAACATTCTTGTCATTTTTGCTTGTTTCTTCGAATTTCATGTTTGATAGTGCAATTTTTAAAAGAATTTGTTGTTGATTGTGCAAGTTGGATGAATTGAACTAGCGGAAGGGATTATCCCGGCGGCGGATTCCCATATAAGCTTGAAGGGGCTATTTGAGAGTTGGGAACAATGATTTCTTTTTTCTTCTTCTTTTTTTCTTTCACTGAAATAAAAATTAAACTAATTTTTTATAAAATAATTAGTGTGTAAACTTACCTGCCAATAGCCTGAAAGCGGCATCAGCGCCAGTGGCAATTAATATTCTGGAAGTTCGTTTTACTCCCAGCAATTTCAATTTAAAACTGAACAAAAAAATTACAGTTTCTCAAAATTACTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAATCAATATTTTTTTTATAATAATGTTTTTGCCCTTTTCTTTTGGGCTAAATTGCGAAAATTTTGATGCGGAAGATGATAAACGAATAATTTAATATTAATCGAGTAGCGATTTATTATAATATCAGTGGTAGCATAGTTAAAGTTTATTTTTAGTTAGTGCAATAATTATGTATGTTCAAAATAAATTTTTGTGACTGGTTAAGGTTCACTTCACTTCATTATCACTTTTGTTTGATATTTCGAATTCAAGTTTGGCAGTCCAATTGTCGAAAGACTTCGTCGCTGATTTTAAGAAAGTAAAAATGTATTTCTATAGCTGCCAGTATTTTTTGATATCATAAGAAACCAAAGAAAACTTGTGATGATATAAATGTAAGAACCTTTATTAATTATTAAATGTTATCCCGTAGCTCGTGTAGTCTCGATTATCTTTCAGTAGTTATAAAATAAATTATAATTTATTTACTTATTCTTTTCTTTTATTTAGTTTTGTTTTGTGGTTAAGTACTGGAGGATGTTCTATAACTTCTTTGTCTTTTGTAGGAGTTATCTTACCTCCTAACCTGAGGCTGTAAATTGAAAGAAACTTTAGAATCTTTCGTGATAAAAAAATTAATAGTGAATTTTCTTTTGGAGTTTGTTCACTCTTTTTGCTTCAACTTGATCTTCTACTTTTACATTCTTTTATAATTATAGTCTAACACAAATTTTTATTAGTTGGGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAGTTATTATGTGAGGATATCTCATCTCTCCTCTTTTTGTATCGTTCTCTTTGACAACGAAAGTTATGTTTGTTATAAAAAGAATTCTTACCTCTAAACATTTTTCTTAAATCTATTAGTTTATTAGTATTTGTATTTCTTTTCCATGAAAAAGACATATCCCACAAATGTGTTGGCAGCAGCATGAATAACGAAATTTTAAAGCATAGATGAACTAGATTTTCAACCTTTTGTTAGAAGAAAAGACTTCAACCTCATTTAAATGGTAGCTCTGAAGAAAAAAATGTGAATTATTGTAGATTATGAATGTCCTTGAATAATAAATTTTTATCTTTAACCCTCCAAAGTTGGGAGAACAATGCATTGGACCTAAGCTACCAAATGTCATTAACTGGCGTGGTTGACGCAAGTAAGACACGTTTAATAGTGTATGTCCGCATGTGGGCTATTAACAAAAGTGCCTGCCTGCGAGATGTTGGCCTTCTGTCACTGACTAGTGGCACATGGCATGTCGTAATTTTGTTCCAAGTCCAAACGGAGAAAGTCGGAGACAAAAATAGGAAAGATAATAGGAAAAAGATTATTATATGCACATATGTAATCTGCCTGTATTTCAATTACATTTGCGACTTGCATGTGTACGTGTCATAAGAGTGGGAAGGTGCGGTGCGGATCAATATTAAGGAAGTACATGTTTATAAAGTAGATCTTAGGACGACCTTACTTGACCTTCCTTGAACCGGATCTACTCAATTAGTTGTACTTGTTCTGTAAGTTGTACAACTGTGCCTGTTCTACAGAGTAGATTTTAGAAATCTCAAGACCAGTGTTCAGAGGAGAATTGTAACGCCTTGAGTATAGGAGGGGACAAGAATGAATCCTAGGCCTGGAGTGTTATAGGAATACTATTACTTATTGGATGTCAACCAAACTTGGACTCGACTAAAAAGAGGGATTTTTGATAGAGAGCTCGACATTTGGATTATGCTTATTGAGAAGATTGACTCGATCAGTTTGGGAGAAGGCCAAGACAAATTGTGCTGGTCTATTGATCCTATTGGCTTGTTCTCTTGAAAATTGGTCTTTCTTCATCTTAGATTGAGATCTTCGAAAATGATTTGGAAGTTCAAGGCCCCAAAGGAATCAAAATCTCCATTGGACGCTTGCTATAAAAGCCACAATATGGATAAGCTTCAGAAGAAGTTCCCAAAGTGGGTGTACAGTTTGTAGTCTTTGTTATAAGTGTGATGAATCCTTAGATCACCTTTTTCAACATTGCTCTTTTGCTTTCAATTGTTGGCTTCTCTTGCTATACACATTTGATGTATCGGTATGCCTACCCAATTGAATGGATGATCCAACCTTTAAATAATCTGGATTGGAATTTAACAGTTATAGAAGAAATGAATGCTCTCAAAGAGAATGATACATGGATATAGTAGACCTACAAAAAAAATAAAAAACATGGGATGCAAATGAACGTTCACTACAAAATGTAGTGTCGATGGAAGCATTAAAAGATACAAAGTAAGGTTAGTTGCTAAGGGCTTTAATTTCATTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTATTTTTATTTATAATCTTTTGTTGTTTTCATTAAAAAAAAAAAAAGGTGGTTCTTCGTTCTCCTCATGCACCAATGCCTTCTAAATTTGTTTCTCTTATTGAAGCTTGTGGCCTGAAGATGCGTAAAACTCCTTTCATGTGTGATTGACAGATTTTAATGTAGTTTCCTTCAACTTCTTGCGAGGAGGCCCATCCACACCCGGTCTTAGGCTGTTTCTTACCATTTCATTTTATGTTAATAGATTCATTCTCTGGTGTAAAGTGATTAAGACTAAATATTCCTCCTTATCCATGTAACCTACTTGGTTGGCCCCCTCTCACGAAATTATCTCTAGTTTGGAGCTGCTCTTTTCTCAACACTTGGACATCAGGTCAGGGACGAACCTATTCTTGTGAGGAGATTGGGGAGGTGGGATTCTCAGATTCGTATTTATTTGAAGGGGTCTCTCCTCTGTGCTAGTTTTCTGCAAGGTCTTGTGGAAAGCGTCGATCTCAAAAACATGCCAAGTTTGTATGGTCTGTGGTCAAAGTTTGAGTGACATTGACGGATACAGTAAAATTTAGAGAAGGAATATCTACAAGATCAATTTTAAGGTCCTACATCGTATCTTACTCTCAAGTCTCATGTTCGTTTGCAGCGGTTTTGCTGGAAGAACTTACTTGGGTTGTTCAAACCTGAAATATTGCTGCCTATAGTCTGAAAGAGGATTTGTTTCTAAGTTACGGTGGCCATAACTTTGAGTACAATCAAATCTGGCCACATGTTGTCTTCTGTTTGGTTTTGTGAGAATTGTAGAAGAGAGAAAATAAAAGGATGTTTGATAATCCTAAAGAAGTCTGGGAGCTGAGGGATGTTATTGTTAGTTTTTTTTCCTCCGGGAGTCAACTCTTTTTTTTAAACATATTTTTAAAGAACTGGTGACCTTTATTATGTCTTCTTTTTGTAAGTTTTGTATAACAACACTGTTTCCACCTTTAAAAACATTGGGGATGTACTTCATAAAGAGGTTTAGAAAAGACTAAAAGAGAAAGGGTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTAAATTTATTATTATTATTATTTTTTAAATATGGTTATTATTATTTTTCCTCCCTTTCTTTTGATATGTGCAGTTATAGGTCTTCTGTTGTTTTTTATTTGAAAACGTAGAATAATTAAGGAAAGAGGTAGAGAATGCTTGCTCATCTGTTCACATGTCACAATTGAAGGTCCAAGGCCTGGAGCATTGAAGATTTCTAAAAGGCACTGTTGTGTGGAATCTGAATATGAATCACATAATTTTGAATGTGTTTTTAAAAGACACCGGGAAAGATACACCTTCTACCAGAGAAAAGACAACAGAATCCAAGTTAGAAAAGCAGCCTCTAATCAGCCTTTTGAAACCGAATCCGGAGCCTTAAGTTCCAAAAATTATGGTGACTCTGTAAGGAGTTTTTTGGATGCTTTCTACAGGTTTTCACGGCCGCACACAGTTATTGGTACAGTTACGTTTTTTAAAACTCATGTCCTTTTAGGTCAATAACGTATTCTTTCATTTCTTTCTTTATGAGGGAAAATTCTTCGATGTAGCTGGCAGCTGCAACATCATGGCGACTACCCTCTAAATGATTGGACGCATGGTGAAAATTACTTTCTGAAATATGTGTCCTCAGCTTACGCTTTTCTTTCATGCTTGTAGGCATTGAGCATTGTATCAGTTTCTCTACTAGCAGTTGAGAAACTATCCGACTTGTCACCATTATTTTTAA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BLAST of HG10006204 vs. NCBI nr
Match: XP_038889438.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 711.4 bits (1835), Expect = 4.1e-201 Identity = 370/408 (90.69%), Postives = 381/408 (93.38%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. NCBI nr
Match: XP_038889435.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 706.8 bits (1823), Expect = 1.0e-199 Identity = 370/409 (90.46%), Postives = 381/409 (93.15%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. NCBI nr
Match: XP_008451585.1 (PREDICTED: homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 696.4 bits (1796), Expect = 1.4e-196 Identity = 364/409 (89.00%), Postives = 379/409 (92.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. NCBI nr
Match: XP_004148327.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN61152.1 hypothetical protein Csa_021364 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 695.3 bits (1793), Expect = 3.0e-196 Identity = 366/409 (89.49%), Postives = 378/409 (92.42%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. NCBI nr
Match: XP_022997420.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 668.7 bits (1724), Expect = 3.0e-188 Identity = 354/408 (86.76%), Postives = 367/408 (89.95%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VWJ1 (Homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HPT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 431.8 bits (1109), Expect = 8.2e-120 Identity = 217/282 (76.95%), Postives = 254/282 (90.07%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B7FA90 (Probable homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=HPT1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 423.7 bits (1088), Expect = 2.2e-117 Identity = 223/282 (79.08%), Postives = 253/282 (89.72%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XB13 (Homogentisate geranylgeranyltransferase OS=Triticum aestivum OX=4565 GN=HGGT PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 315.1 bits (806), Expect = 1.1e-84 Identity = 170/280 (60.71%), Postives = 215/280 (76.79%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XB14 (Homogentisate geranylgeranyltransferase OS=Hordeum vulgare OX=4513 GN=HGGT PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 313.9 bits (803), Expect = 2.5e-84 Identity = 170/280 (60.71%), Postives = 213/280 (76.07%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DAK7 (Homogentisate geranylgeranyltransferase, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=HGGT PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 312.4 bits (799), Expect = 7.3e-84 Identity = 170/280 (60.71%), Postives = 209/280 (74.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BRS9 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492819 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 696.4 bits (1796), Expect = 6.6e-197 Identity = 364/409 (89.00%), Postives = 379/409 (92.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LKA3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G059830 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 695.3 bits (1793), Expect = 1.5e-196 Identity = 366/409 (89.49%), Postives = 378/409 (92.42%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K9K8 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492342 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 668.7 bits (1724), Expect = 1.5e-188 Identity = 354/408 (86.76%), Postives = 367/408 (89.95%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K7F2 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492342 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 668.3 bits (1723), Expect = 1.9e-188 Identity = 354/408 (86.76%), Postives = 367/408 (89.95%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EPF4 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436184 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 659.1 bits (1699), Expect = 1.2e-185 Identity = 348/408 (85.29%), Postives = 364/408 (89.22%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. TAIR 10
Match: AT2G18950.1 (homogentisate phytyltransferase 1 ) HSP 1 Score: 431.8 bits (1109), Expect = 5.8e-121 Identity = 217/282 (76.95%), Postives = 254/282 (90.07%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. TAIR 10
Match: AT3G11945.1 (homogentisate prenyltransferase ) HSP 1 Score: 133.3 bits (334), Expect = 4.3e-31 Identity = 95/259 (36.68%), Postives = 143/259 (55.21%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. TAIR 10
Match: AT3G11945.2 (homogentisate prenyltransferase ) HSP 1 Score: 133.3 bits (334), Expect = 4.3e-31 Identity = 95/259 (36.68%), Postives = 143/259 (55.21%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006204 vs. TAIR 10
Match: AT3G51820.1 (UbiA prenyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 45.4 bits (106), Expect = 1.2e-04 Identity = 45/196 (22.96%), Postives = 82/196 (41.84%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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