HG10006107 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTTAAGTTCTTAAAGGGAGTGGTGGGTGGATCTGGGACTGGGCTCAAAGATCTGCCCTACAACATCGGCGATCCATACCCATCTGCCTGGGGCTCATGGACTCACTTTCGGGGTACATCCAAGGTATGTTGTAACACGATAAGTAGTCGCTTGGGCATGAACATGATCTAGATTTGGCATTGCGGATTGCTGAATTGTTGTTTGTTCAACTCGAAGTGATTTGTACGGGATTTTTTTAATTGAATTGACGAGGCTTGATCCTGTAGTTGGGAAATTTTTCATCATTTTCCTAGTTGGCTTCTTACTGTTTGGGTCGGTGGTGTGCGGCAGCCTATTTATGGGGATGAATTGAATTGCTTTACATCTGACAACTTTGAGTTTGTTGTGTTTTGGCTTTCATTGCTCAACTTTTCCCAGCTTTGTTCTTTACAAACTTTTTGTACGTTGAGATGAAACCATGCCAGCATGAGGTTCATACGCGTAAAAGTAAATGAAATGTACATCCAAATGTTGAACACTCTTTTTCTAAATCTGGCTGTACGTGAGCTTGCATTATCTGATGTAGCAAAACTTTTCTTCTTCTTCCCTTTTTTCTTCCTGTTTGGGATCTGAAGCACGTTAGTTAATTATAACGTGTTCTATATGTATTTCCTATATAAGAACATTTTCTAGAAGACGATCTTTGTAAAAAAGTGACCTACTGTGGTGGTGGTAAATGGCTCCTAACAGATTTGAACATTAAAGCCTTTCTGAGTAGGAAGTGGGTAACGAGTATGACCTTGCTTGAATATGATTTGTTCTTTAGGTAATGAGTTCATATGGAGGTTCTCATATTTTTGTGACAACACGGAGGTTCCCAAACTGCCAAGCAGTAGCTTTAGGATTAAAATGTTGTATTTTATCTGGCCGTATGCTATCTTTTTTCTTGATAGAGCAACACATTTTTTTTAGAGTCGTGAAATTATAAAGGAGATGCTACTGACTAGCACCACCCAAAGAGGGGGGAAAATGTCCAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGAAGAAGAAGGTTAAATTATATATATAAAATAAATATCCTTCAACTTTGCACTCTAGTTAAAAACCACCCTTATCCTCTTGAAACTTGCAATATTACTCTTGACCTTTTATAAATATTTCAAAACTATCCTTAGTGTAGAAATCTTTTAGGATTTTGGATAGAAATTGTGACACGAAATTGTGCGGCGGTGACCTATAACAAAAGTTTTGACTCACACATCATTTTAGGTCGTCACCATCCTAAGTCCCAATTTTCGTCTGAATTCCTGAAAGATTTCTACTCCAAGTCTGGTTTTGAAATGTTTATGAAAGCTCAAGAGTAATCCAGATTGTAGAGATGGTATTTGTATCTATGTTTGACTTTTTTCTTTCTTTTGTTCAATTGAAAACTCCTGTTTGTGTTGTAGTTTTGATGTTTTCTTTGTTGAGCATTTTGCTGCTAAATATGATTCTTGCACGTAGGATTTCTGTCACTAAGTGTAGATTTCAGAAAATTTTGGGCTTCTATGTTCACCTTTTCTGTTTTATGTATATTTTATGCCTCTCTATAATCTTCTGAAATTGCCAGCCTGAATTATGCTCAGGTTAAGGCCTACCCTCTTCTTCTGAAATTTTAGTTTTAGGTGAAGTTGATGTAAGAATGGTTTCATTTTCAGGATGATGGGTCTCCAGTCTCTATATTTTCTCTTTCAGGAAGTAATGCACAGGATGGACATTTGGCTGCAGGTCGCAATGGTGTGAAACGGCTGCGAACTGTAAGCTGCCAAGGCCTACTGTTATGGATCAAATGCATTCATTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGCTTTTTTGCTTTTTTAAATTTATGAAAAGCCAGACTTTCATTGAAATCAAATGAATGAATACAAAGGAAATTGAAAAAAAAAACACCCATTCCCAAGAGGAGCCCAATCAACACAAATGAGATTATTTGTGTGTTTTCATAATTTTAATTGCTGTTGTCCCATTTCAACTCTAGTTTTGAGGATTTCGATGCATTTTTGTAACTAATAATGTATTGTATACCAAAAATGGCTTGCTATTTTAGTCTTTTGGGCTAAAAGTATTTTTTTTCTTTTAAAACCAGTAATCTACTCCCCTTTGTCTGCTCATTGACCTTATTATGCCCCAAATTTGACTTCATTTTCCTTCATTTAAACCGAGAATTGATAATTTCTCTTGGTTCTTCCATAAAATCCACTGTGCGATTTTTCTAGAATATCTGTCTGATATATTGATATTTCATTGACATTAATAATCTATATCTGCAATTTTATTCAGGTTAGGCATCCAAATATTTTATCCTTTCTTCACAGTACTGAGGCCGAAACTATTGATGGTTCTGCTTCCAAGGTTACGATTTATATTGTTACAGAGCCTGTTATGCCATTGTCTGAAAAGATCAAGGAATTGGGTCTAGAAGGTACCCAAAGGTATAAGCAAAATCCAACCAGAAGCTTTTCTCCAATTTTGGTTTTTGCATTTTTCTTGCTGCTGGTTAACTTCTTTTTTTTTTCGGGGTGCTGTTTTGTCATTCATTTTTCAGAAGTATATTGTTATATGTAACATGATAATGTAAGAGGCAATGAATTGTTTTGAGCTTCTAAAGTGGTCTGCCATTAATTTTATGCCCTGGTAATTGATGCATTATTTAGTTATAGACCTATAAGAAGTTCAAAATGTGAAGAAGATAAGGCATTTTTCATGTCATGAAATGCTTCATGGGTGGAACAGTTTTGTCTATTTGTCATCATCAAAACGAGATTTCCTAACTCTTGCTCAAGGAGCTCTTAGAAGATTTCTATTGGAGGATTGAAAGTCTTTGGGCATGTGGGAGTGATTTTAGGAATATTGATTTTAGTGAATTAAACCCAACTCCCCATAATCCGGTAATGAACACCTTCGTTCTCTCTCACCCTCAACCCCCGCCTCCTACCCATCAACGTTGGCCATGGTTCTTCTACTGCCAGTGATCTTTTTGTTCCTGCTGTCTTCCACCATGTCGACCTACCCACCCACCCACCCATGTCCATTACCATCGACCGTAATGTTCATTACCATCGGCCGTAAGATTTTCACCATTTAACCAGATGTCTGATACAGACCCTTATGAATCTAACTAATAGAAACAACAAAAGATCGTGCTTTCTTCATCTCTATACACTGGTCTACACTTGTTTGGATCATCAAAACCTTCTAGTCTTTCCTAACGGCCCCTTTGAACCAGAAAATTTTTAAGAGAGTTCTGTATTGATGAACATACCATGTGGGTAGAAAAATCCTTCAATTATCGTTGAACTTTGGTGGTTATGAATAATAATGGAGGGCTCAACAAAATCCTTGTTCCCATCCATGAAGAGAGAAGGGCTTGGAAAGGTTTTATACCTTACTACAATATTTCTCCAACAAACTACAATCTTTCTCCAACAAACAAAAAAGGTGTTGCCACAACGATGCCCCAGCCATTAATGCAGCCTCTTCCAACCCCATAAATGTGACCCCAACTACCTACAAAGAAGCTCTTAAGGCTAAAGTCCCCATCCCATACTCATCCCATGAACCTCTTTCTTTTTTTTTTTGAAACGGAAACAAGACTATTCATTAATAAAATGAAAGAGTCTAATGCTCAAAGTACATGAGAGGAAACAAAATAAAACTACAAACTTGCCAATACTGGAATCAAATTCTATCATAGAGACTAAAACTTTGAAGAAAAAGTAAAAACATTCCAATTGAACACATATCTCAAGATGAACGCCTATTTCAGATGACTTTAACTCGAACAAGCCCAAAATAAAAGAAGAAAAGTTTCCACGCAACCTCTTGCAAAGATTGAACATGAATTTATGAAGGATCAACTAAAAATGATTGACAAACTTCCAAGACCAAAGGAGAAATCATCTGCTTCCAACAAACCGGCCAATAACACCAAATCCATTTGTGGCCGCTAGCCAGGATCTCTCAGAACAACAAATACTAACACCATTGATACGCACATACGGATACTCTCTAAGGAATCGACGAATTCTGCTTGCTTTTTTTTGTTGCTTCAGACTCCCAAGCCCCTCGATACATCCAACCCAGAACAAAGGCATCAACAACAATGTAACTCAAATCCAATACCTCCATGCTGAAGAAAAACGAGGCTAAGAAGGCTTCCTTACTCAACCGAACCAATAGTATCCATAATCAGCTCCTCGCAGAAAAACTTATCAATGATTTACGGCCTATTGAGCATAACAATTCCTCTAATGATGTTAAATATCATGTGAAGACCATCGATATTTTCCAAATCTTCGTATATTCAGAAAAGGTTCATTAGCATTTTGAAAAGTTCTTGATCATTCAATAAGAGTTCGGTCAACCTCAATTGATCTGCAAATCCATTCTCAATCAGAGTCTCCTGGTTTACCAAAAGCTTCCAAAGAGATGTAACAAAATCTATTTAAAATGAATTAATGAAATGTCAAACAATACTAATTCTGGAAGTTGGTTTTGTAATAGATGTCTCTAATCTATTTTTTGGATATTTCAATGAGGCTCTTAGCATTCCAGGAGCCGGTCTTCATTTACAATACGCCTCACGAGGAGATGCTATTTCCTGTAGTTGAAAATCACACGCTGCCACTAAAGATGAAAAATGAGAGGGTATTTTGGTGGGAGATAGTTGTAAAGCACTTACAAGAGGTTGTTGATTATGTAAGAAAAGTGTATTGTAGGCTTCCCCCAATTGACCAAGTGTGAATTCCTCTTCAGCTAATGCTTCTTCTTGGTTAGAGTCTTCGCTACTCAGATTGACATTTGATTCATCATCTGATTCCTGAGTGAGATGCTTCTTATAACCCTGAGTGAAGGTTCGCCTTTCGGTGTCCACCCTTCAGCATGCCTCTCATTTAAGCAATAGTAGGCAATCTTAGAAATCAAAACTTATCAGCCAACCAGTT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ATGTTTAAGTTCTTAAAGGGAGTGGTGGGTGGATCTGGGACTGGGCTCAAAGATCTGCCCTACAACATCGGCGATCCATACCCATCTGCCTGGGGCTCATGGACTCACTTTCGGGGTACATCCAAGGATGATGGGTCTCCAGTCTCTATATTTTCTCTTTCAGGAAGTAATGCACAGGATGGACATTTGGCTGCAGGTCGCAATGGTGTGAAACGGCTGCGAACTGTTAGGCATCCAAATATTTTATCCTTTCTTCACAGTACTGAGGCCGAAACTATTGATGGTTCTGCTTCCAAGGTTACGATTTATATTGTTACAGAGCCTGTTATGCCATTGTCTGAAAAGATCAAGGAATTGGGTCTAGAAGGTACCCAAAGGGATGAATATTATGCTTGGGGTCTGCACCAGGTAGCCAAAGCTGTGAGCTTCTTAAACAATGACTGTAAACTCGTTCATGGTAATGTTTGCTTGGCCAGTGTTGTTGTCACTCCAACCTTGGATTGGAAGCTCCATGCTTTTGACGTGCTATCTGAGTTTGATGGAAGCAATGAAGCTTCAAGTGGGCAAATGCTGTCTTTACTTCCAGATTATCAACGGCTATTGAGCTCTATGCCTTCTCGCAGGTTGAATACATCCAAGCTTATAGAAAATAGTGAGTATTTTCAAAATAAGTTGGTCGACACTATACACTTCATGGAAATTCTTAGTCTAAAGGATAGTGTTGAGAAGGATACCTTTTTCCGGAAGCTCCCAATTCTAGCTGAACAGCTTCCTCGTCAAATAGTATTGAAAAAGTTGCTTCCTTTATTAGCTTCCTCCCTTGAATTTGGTTCAGCTGCTGCCCCTGCCTTGACCGCATTGTTAAAAATGGGTTCTTGGCTTTCAACTGAAGAATTCAGTGCAAAGGTTCTACCTACGATTGTGAAACTATTTGCCTCCAATGATCGAGCTATCCGAACTGGACTCCTGCAACATATTGATCAATTTGGTGAATCATTGTCATCCCAAATGGTTGATGAACAGGTCTACCCCCATATTGCCACTGGGTTCTCTGACATGTCTGCTTTTCTTCGTGAATTAACTCTAAAATCCATGCTTGTTCTAGCTCCCAAGCTTTCTCAACGCACTATTTCTGGGTCATTATTGAAGCATCTTTCAAAGTTACAGGTTGACGAAGAACCAGCAATCCGAACAAATACAACCATATTACTTGGGAACATTGCAAGTTACTTAAATGAAGGGACAAGGAAGAGAGTTTTAATTAATGCTTTCACTGTCCGTGCACTGCGTGATACATTTTCCCCAGCCCGTGGTGCAGATCTCACAATAAAAGAAGAAGCATCAGATGCTGATATTGAAGGGGACAAGAAGGAAACAGAAATGGAGAAGGTTTCAATTCAAGCTAAAAAAGATGATACAACAATCAACAAATCCATGGAGGAGTTCCCTGAGAATGTTTCTGAAGATTTCGTTGATGTCAAGATCCAATGGAAAATTGAAGAAGCTCCTCCTAAAGACATAAATGTCAACACCATTGATTCACCACTCGAAATCCCAAATGACATTGTTCGATGTGACGAAGCTTTGGTAGAAATCATTCCCACTTCCTTGAACAACAACAATGGAGTTCAATCATTACCCTCTTTTGCAGCTGACCAATTGGCATTGGCAAACCAATTCCCTAGGCCAATTATTGCAGAAACTAAATCTCCAGAAATTTCAGGAGATACAGCTGCTGGAGTTCTGAATATCCCGTCTCTGCCAGGAAATGCTAGTTTGCTTGGATGGGCAATGAGCTCCTTAACTCTAAAAGGAAAACCCTCTGAACATGCTTCTAGCGCTTCTGTAAGCTCTAATGCACCTTTAGCTGCTACAAGTTCTGATTCCATCTCAGTTGAAAATGCTCCAACTACGGCACCTGTAAGGGTTAGCTCGAGTTTTGATTTAACTGAACAACATGCAACTGAATCGCCAACATCTACTGATGGCTGGGGAGAAGTTGAAAATGGAATTAATGATGAAGATGAAACTGAAAAGGATGGGTGGGATGAGTTGGAACCTCTGGATGAGCCAAAGCCGTCTCCAGCTCTTGCAAACATTCAGGCTGCTCAAAAACGACCTGTATCTCAACCTGTCTCACAAACAAAACCACCAAGTTCAAGAAGTACAGCCCGGCCAGCTAAAGAGGACGACGATCTTTGGGGTTCCATAGCTGCCCCTGCTCCAAGAACTGTCTCAAAACCATTGAATGTAAAAGCAAGTGGAACTGTTGATGATGATGATCCTTGGGCTTCCATTGCTGCTCCTGCACCTACGACTCGAGCCAAGCCGTTGTCAGCTGGTAGGGGGAGAGGAAGCAAACCAGCTGCTCCAAAATTAGGGGCTCAGAGGATAAATCGGACATCATCAACTGGTATGTGA MFKFLKGVVGGSGTGLKDLPYNIGDPYPSAWGSWTHFRGTSKDDGSPVSIFSLSGSNAQDGHLAAGRNGVKRLRTVRHPNILSFLHSTEAETIDGSASKVTIYIVTEPVMPLSEKIKELGLEGTQRDEYYAWGLHQVAKAVSFLNNDCKLVHGNVCLASVVVTPTLDWKLHAFDVLSEFDGSNEASSGQMLSLLPDYQRLLSSMPSRRLNTSKLIENSEYFQNKLVDTIHFMEILSLKDSVEKDTFFRKLPILAEQLPRQIVLKKLLPLLASSLEFGSAAAPALTALLKMGSWLSTEEFSAKVLPTIVKLFASNDRAIRTGLLQHIDQFGESLSSQMVDEQVYPHIATGFSDMSAFLRELTLKSMLVLAPKLSQRTISGSLLKHLSKLQVDEEPAIRTNTTILLGNIASYLNEGTRKRVLINAFTVRALRDTFSPARGADLTIKEEASDADIEGDKKETEMEKVSIQAKKDDTTINKSMEEFPENVSEDFVDVKIQWKIEEAPPKDINVNTIDSPLEIPNDIVRCDEALVEIIPTSLNNNNGVQSLPSFAADQLALANQFPRPIIAETKSPEISGDTAAGVLNIPSLPGNASLLGWAMSSLTLKGKPSEHASSASVSSNAPLAATSSDSISVENAPTTAPVRVSSSFDLTEQHATESPTSTDGWGEVENGINDEDETEKDGWDELEPLDEPKPSPALANIQAAQKRPVSQPVSQTKPPSSRSTARPAKEDDDLWGSIAAPAPRTVSKPLNVKASGTVDDDDPWASIAAPAPTTRAKPLSAGRGRGSKPAAPKLGAQRINRTSSTGM Homology
BLAST of HG10006107 vs. NCBI nr
Match: XP_038889822.1 (probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1212.6 bits (3136), Expect = 0.0e+00 Identity = 676/869 (77.79%), Postives = 694/869 (79.86%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. NCBI nr
Match: XP_008460279.1 (PREDICTED: probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1196.4 bits (3094), Expect = 0.0e+00 Identity = 666/869 (76.64%), Postives = 689/869 (79.29%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. NCBI nr
Match: XP_008460276.1 (PREDICTED: probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008460277.1 PREDICTED: probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008460278.1 PREDICTED: probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1189.5 bits (3076), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/872 (76.26%), Postives = 688/872 (78.90%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. NCBI nr
Match: XP_011651704.1 (probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1189.1 bits (3075), Expect = 0.0e+00 Identity = 673/869 (77.45%), Postives = 691/869 (79.52%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. NCBI nr
Match: KAE8650877.1 (hypothetical protein Csa_000828 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1187.6 bits (3071), Expect = 0.0e+00 Identity = 672/869 (77.33%), Postives = 691/869 (79.52%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A6QLH6 (N-terminal kinase-like protein OS=Bos taurus OX=9913 GN=SCYL1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 280.0 bits (715), Expect = 8.3e-74 Identity = 171/487 (35.11%), Postives = 255/487 (52.36%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5M9F8 (N-terminal kinase-like protein OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Scyl1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 278.9 bits (712), Expect = 1.9e-73 Identity = 170/487 (34.91%), Postives = 254/487 (52.16%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96KG9 (N-terminal kinase-like protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SCYL1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 277.7 bits (709), Expect = 4.1e-73 Identity = 170/487 (34.91%), Postives = 256/487 (52.57%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9EQC5 (N-terminal kinase-like protein OS=Mus musculus OX=10090 GN=Scyl1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 272.3 bits (695), Expect = 1.7e-71 Identity = 167/487 (34.29%), Postives = 252/487 (51.75%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q55GS2 (Probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=scy1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 270.0 bits (689), Expect = 8.6e-71 Identity = 199/613 (32.46%), Postives = 307/613 (50.08%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CBP3 (probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499151 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1196.4 bits (3094), Expect = 0.0e+00 Identity = 666/869 (76.64%), Postives = 689/869 (79.29%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CCL0 (probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499151 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1189.5 bits (3076), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/872 (76.26%), Postives = 688/872 (78.90%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K7E5 (N-terminal kinase-like protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491833 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1185.2 bits (3065), Expect = 0.0e+00 Identity = 660/869 (75.95%), Postives = 688/869 (79.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EUR3 (N-terminal kinase-like protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1185.2 bits (3065), Expect = 0.0e+00 Identity = 660/869 (75.95%), Postives = 688/869 (79.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FHG6 (probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444185 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1146.7 bits (2965), Expect = 0.0e+00 Identity = 648/873 (74.23%), Postives = 684/873 (78.35%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006107 vs. TAIR 10
Match: AT2G40730.1 (Protein kinase family protein with ARM repeat domain ) HSP 1 Score: 965.7 bits (2495), Expect = 2.3e-281 Identity = 561/873 (64.26%), Postives = 624/873 (71.48%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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