HG10002764 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview


Name	HG10002764
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Unknown protein
Location	Chr11: 11822049 .. 11829594 (+)
RNA-Seq Expression	HG10002764
Synteny	HG10002764

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide

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ATGAGCCTCACTGGGAAAAGGTCGGGGTTAAGCAAGTTAGGGAAGACGAGTGGTCTAGGTCTTAGCTCGATCGTATCTTCATCGGGTACTGACCAGGTCAATAAGGACAGGGCATTTAGGGGGTATGGATTTGGTTGTGCCCCGGTTTGTACTCGGATGGGTCCGAACCGAGATTAAACCTTAGGGGTACCCGGTCTAGACTCGGGTCTGGGCTTAAGTTGTGGGCTAGACCTGGTCCTGGGGGGGAGGGGCGACCCGGTATGAACTCAGGTGGGGCTAGGTCAGGTATAGGAAGCTTGAAAACATACTTTTTGTCTTTTAGCCTGGTTCCACCCTGGCCGGGTAAGGACCGGGTTACTACTTGGGGTTAGACCTGGCTGTGTAGGATGGGTACTGTTTTTTGGCCCGATATGCCCTTGGCTGGGCTTGGACCCGGGTCAACGATACTTATATGATACTATTTTTGGCTCGATCCCGATCCTGGCCGAGTGAGGACTGGGTTACTACTTGGGTTAGACCTATCGTGCTCTAGGATGATGGGTTATGTTTTTGGCCCGGTTCACCCTGGCTGGCTTGGACTGGGGTCGACAATACTTATATGATATTATTTTTTGGCCTGGTCCCGATCCTGGCCGAGTGAGGACCAGGTCAAATGTGTTATATGTTTAGGCCTGGTACTGGGAGGTGACCTGGGTTGTACTCGAGTGGGTTTAGACCAAGTTTAATGCTTTTAGGATGATCAATGATGGGTTCTATTTTTGGGCTCGGTTCACCCCTGGTCAGGCTTGGACCAGGGTTCAAGATATTTCTATGGTACTATTTTTTGGCTCAGTTCCGAACCTGGTCGGGTATGAACTGGGTCAAACCAATTATATGCTACTATTTTTTTACTCGGTGCAGGCCCGGACCGAGTATTGGACTGAGTAATTACATTTTTATTTATTATTTCTTTTTCTATTGTTTATCTACTACTTATATGTATATATTATGCAGGTTTGATGGATTTTGTAATGAAAATAAACTCTGACAACCATTTCTCTGCTGCCCTTATATGTTGTGCACATTTAGGAAAAGCTCAATTGAGCATTAAAAAGAAATTGACCCCAACCCAATTAGCTATGTTTAGGGCATGCATGTTTTGGGCCTTATTGGATTCAAATATAATGTTTAATGGCCCCCTTATCCATTATATCGTATTGGGGGAGGTGAGGGAGAATATGAGGGATATTATTAGTTTTAACCTACTGGACATCCGAGTATCATTTGGGCGTAGGGAGTTTGATCTGGTGACAGAATTGAAACACCAGATCGTACAGAGGGATAGGGATACTTCACACGTTCGACTTAGAGATAAATATCTTAATAATATGGAGGGGTTAAAAGGGTATGAACTAGACGCCCAGTATCCATCGCTCCTGTTCGAGAACGATGATGATGCCATTAAGATGTCTCTTTTTTATTTCATCGAGTTTGGACTGATGGGAAGGGAGAGAAAGGCTAGCATGAACTATGACTTCCTAGGGTACATTGATGATTGGGAGAAGTTCTGCAACCTAGATTGGGGTAAATACATCTTCGACATGACAATGAAACGACTTAAGAAAGGGTTGCAGGACAAAGTGGATAAGTGGAAGGAGAGTACAGACGGGAAACAGTAGACGTATAGCCTATATGGACTCCTTCATGCTTTTCAGGTTAGTTTCTATAGCTAGTTTTAGCATTTTATACCTTCTTTGCATTGTTATTTGGCTAACAATATATATTTTATAATATTTTATACAGGTATGGGCGTACGAGACTGTTTCATCCTTGACTGGACGTGATGCGAACCGATTGAACGAGAATGCTATTCCACGCATTCGTCACTAGCTGGTCCTGCTCGCACTCTCCCTCTTATGCTTTGATTAGGGATGAGGTGTTTGGTGCTAAAGCGATACATTATTTTCTATTATTTTTATAATGATTGCGGCTTAATGTAACTTACAATCTTTCATTATAGGCAATTATCACCCTAGAACTAGTGGCAACCGACGAGGAGATCGTGTTCCTCGAACGCGTTGTGTTGCCACTTGAAGCACCACTATTACCACCGACACTTTTATTACCACTTGCACCAATTGTCCCCCTTACTGATGCTGAGAACTGGACCTTCCACGACTTATGCTCCAGACTTTAAGCATGCAAATCCATGAAAATCCATGCAATATCCCTGTAAGCATGCAAATTCATGCAAATTATACAAATCCATGCATTATCACCCTAAGCATGCAAATCCATGCAATATCACCTTAAGCATGCAAATCTATGCAATATCATCCTAAACATGCAAATCCATACAAATCCATGAAAGTTCATGCAATACCTGCAAGTTGACCCCAATAGAAATTGAAAGTTAACTCAGAAAATGACCTAGTTGCTTTATCGAAAATCTGTAAGACATCCTTGTTCTTGAAATTTTTTATTAAGTTTTCACCCAATGATGGTTACAGATACAATGAAACGCTTCTGGGTATGCCGTTGTAATTGATTTTTTTATGCTAGGGTGTCTATTTAACACAATAACCAAATCACGAACTACCCCAAATGCACTTCTTATTTGTTGAAAAAACCACAGCCAAGATTCATTAGTTTCTCTACCGGATATACCAAACACAGCTGGGTATATTTGATTGTTTCCATCAACCCCTGTCGCAAGCAAAAGTTTACCACTATACTTACCCCTTAAATGTGTTCCATCCACATTAAAACGAGGCGAATGCAATTTAAAAACCCCTAATAGAAGCACCCAAAGCCATGAAGACATGCTTGAAGTACTTATCTTCAGTCAATTCTTATGCAAAGGCAGAACTAAGATTTTCAATTTGTAGGGCTTCACCAAATTTGGGTAACATTTTGTAAGATTCCTCTGGTGACCCCCTAACTAATACTAATGCTTCTTCCCTTGCCCTCCATGCCTTGTCGTAACTTAAATTAACCTCAAACTTCTGTTTTATGTCTTTCACAATATCTTTAGGTCTGTATGAACGACTGATGTCTTCAAACTTCGACTTTACTAAATGCCCGATAATCCAGCTAGAGGCTTGTCTATGATCCTTAGTCAAGATTTCATTCTTACATGTATGTACATTATCTTACTTAGAAATCTTAAATATTTCACAACTTTTCATTCTAACGGCTCTAAGTCTCCATTCGCACTCTTCTACAATGCATCTAACTTTATATAGTTGCGTATTTGACTTCTTCACCCTAAACTAAAAATTACCTCTAATTGCTAACATAGATAACCGCAATTTTAAATCATTCTTAGATAAGAAAATGTCACCAACTTCTACATCCTCAAAAGAATAACACCGACCTGGCATGACCACTGTGCTACTAGATCGGTGTGATAAGTTACAAGAACATGTTGCATCTTGAGTAGGTTCTTCTTCAGCATATTGAGTAGGTTCTGCCTCGGCATAAGTGTTATTTCCATCAACAACTGCATCAACCTCGTCTCCACCATCACTTGTCTCCTTCCAATCCCAATCATTGAGATATTGAGTTTGGTCTACATCATCCCCCAACAAAATAATTGATGAGTTTAGACCAAAATATGTGGGGAACACGAGATTATCATGTTTGGTCTTGCAAGAGACTAGCCTAGACGTTGATGGAATTTCTTCAATTCGTCTGATAGATGAATTATGCAGATGAAATCCTTCGTTAGTTGAACATTTTGGAATTGTTGATACATAGATAGGTATTATTGAGACCTCTTCCCATGTCAGGAATGTGTAAAGATCTTCGTCATTACGAATGACAAATGTAGGAGCTTTAGACTTCAATTGGAGTATACATCTTATCACAAGATTGTACTCAACTGAATTTATACTGTTTATCCTGTAAACCTTAGCCAAGAATTCATTGTATACCGTTCTAATCTCTATGTCAAATCTCCTCATCTCTCCTCCATCGTAATCCTTTTCTTTTTCAGACCAAACACCACCAAACCAAACGCGAGGCATTTTCCTACACTATAAGAGAAAAAAATTAGTTTATGTAATATAGTATTAAAACAATAAAGAGAAAAGAAAATGTAAAAATTAAAAATTAAAAAAATAAAAAAACCCGATTAGCTCGGTCAGCCCGAGCCAACCGGGCCATAAAACAAAACGCCATGAACATCGTCGACACGGGTTTAGCCCGGCCAAAGCACACCGGGCGACTCCCCAGACATGTCTACCTGATCCCCGATTTGTACTCAACCCGATTTCCACCCCGGTATCTACTCGGTTCAAGGAGTACTGGGCCTTCCACCCTAATCTACCTACCCTGGCCAGGACACACCGGGCCACTCCCAAGACATGCTTACTTGATCCCAGTTTGTACTCGACCCAGTTTCCACCCCCGTATTTACTTTGTTTGAGGAGTACCAGGCCTTCCACCCTAACCTACCTTGTCGGGTCCCATCGAACCACTCCTTAAACCTACCTACCTACCTGAACCCCGGTTTTCACTCAGCCGGGCAAAGTCATACGTGGCTCAATAATATTCATGAATTAGGACAACCCGGGGTGGCCCGGTCCTATTTTATGAAACCTGGCCGGGCCTCCACAAAAAAGCTTCCCTCCCTTCACCGTTTCTTTTAAAACTACTCCTTGTGGAAATGGTATAATAGTATAACTAATCTTTATGGGTATTATAATATGCATCTATCTCACCAAAAAAGTTATACCAGAAACATCGAAATGAAAGCCAGTCAATAGTGAGTGAGGATTTGAAGTAGTAACATTGGTTTCTAAAGAGAAAACGAATTGACGAATTCTAATATTAAAAGAGAATTATCAATAAAAAAATATGTTAAATGAATGAAATACATACCTTCACGAATGAATTACATAGATGTTTGATAGTAGGTAAAAAGTCTGTTGAATGTTATTAGTTGGGATTGATAGATAATTAAGTGTTGGTTAGTTCGATGTACTAAGTAGGAAAATGTATAAAAGTAAATAACTATT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mRNA sequence

ATGAGCCTCACTGGGAAAAGGTCGGGGTTAAGCAAGTTAGGGAAGACGAGTGGTCTAGGTCTTAGCTCGATCGTATCTTCATCGGGTACTGACCAGGTCAATAAGGACAGGGCATTTAGGGGGTATGGATTTGGTTGTGCCCCGCGACCATTTCCGACGACCAACTTCGGCGACCACCTCCGACGGCCAACTCCAGTGACCACCTCCGTGGGTAATTCTGATAACTACCTCCAACGACTAACTTCAGCAACCACCTCTGACAGCCAACTCCGACAACATCCAACTACTGTTGTTGACGACCAACTCTGGCGACCTTCGACGGTGGTCATTCTACCAACTCATACAATCATTATTTTAAATTATGACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAGCCTCACTGGGAAAAGGTCGGGGTTAAGCAAGTTAGGGAAGACGAGTGGTCTAGGTCTTAGCTCGATCGTATCTTCATCGGGTACTGACCAGGTCAATAAGGACAGGGCATTTAGGGGGTATGGATTTGGTTGTGCCCCGCGACCATTTCCGACGACCAACTTCGGCGACCACCTCCGACGGCCAACTCCAGTGACCACCTCCGTGGGTAATTCTGATAACTACCTCCAACGACTAACTTCAGCAACCACCTCTGACAGCCAACTCCGACAACATCCAACTACTGTTGTTGACGACCAACTCTGGCGACCTTCGACGGTGGTCATTCTACCAACTCATACAATCATTATTTTAAATTATGACTAG

Protein sequence

MSLTGKRSGLSKLGKTSGLGLSSIVSSSGTDQVNKDRAFRGYGFGCAPRPFPTTNFGDHLRRPTPVTTSVGNSDNYLQRLTSATTSDSQLRQHPTTVVDDQLWRPSTVVILPTHTIIILNYD

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of HG10002764 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10002764 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10002764 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10002764 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 53..74
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 60..74

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
HG10002764.1	HG10002764.1	mRNA