Csor.00g224830 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSinitialstart_codonintroninternalterminalstop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGCAGCTGGAAGAGTCTTCTTCTCCGAATTGGCGACAAGTCCCCGGAATACGGCACCTCCTCCGATTTCAAAGACCACATTGTTCGGCACTCTCTCACACTCATTCCAGTTATACTCCACTATTCGATTACTTGTCGCTCATTTTTATCTGGGATTTGCAGGAAACTTGCTTCGCAGCGATTCGGCGGGAGCTGGATCACTATGGAGATGAAATTTTGCCTGTAATCACTTGCCTCTGCACGTTTTTTTCTCTATAATTTATCTGGGTGTTGATAAAATTTGCAGTTCTTGTGTTGGTTGAAATTATACTAGTTGAATCACTATGTTAGTAGTACGTGTGAACTGAGTCTTTTTTGGCTGGTTATCTCTTAAGTCGTATCCCTTTGTGGAAAATGTGAGTTTTGTCTAATAACTACTCTATGCTGATGGTATTTACACTGTTTTTTTTCCTCGTTTGACAGTTCCTTCTGCAATGTGTTGAACAATTGCCTCATAAGACTCCTTTGTACGGGACATTGGTAAAGTACCTTACATCCTTCAGTTCTCCAGTGAATGTATTTTCTTTTCATTTATGTATTTCGTTGATCAGCTTATGTTGTTAGGTCGTGCGATCTAGCTTTAACTTCTCAATTATTTGTTACATGTATTCTAGAGTTGTACAATTCTTATTTAACGATCTCTCTATATGTTTCCCATTAAAAGACCAAAATTGAGGTTTAAATTTATAAAATGCAATAGCCTTCCTTTTGCTGTTGTCTTTCCGTTCTTTTTAGCTTGTCGTTTGTGCCGCAATTGGAGAATGTCTTTAGAGCTACATAGGTCAGACATTTCCCTTCTTCATTTATTCATTCTTTTGATTTAACAAAATTGTATGTTCCGTATAGAAAAAGACCACCTTATAAAAATTGTAGTTTTCTTAGTTCTTGGAGCCCTTTTTCCCCTTTTCCTAGTCTGGTTTTTGTTGCCTTGGCTCCCTCTGCTCTGATTTTTTTCTCAATTAAATATTCTCTCTGTATATTCTTTCATTTCATCTATGAAAATACCCTCCGACGAGATTCTTTTCTTTCATTATTTAGCTGCCCCATGTCGGCATCAATTGTGTTTTATTTATCTTAAAAAAAGAAATAAGTTGTCTGGCTTCTTTTATGGGGCTATCTTTTTGTATGTCCCTTGTTTATTTTATATATCCTTTGTTATTCTTTCATTCTCTATGAAAATGTGGTTTTTTATCTTTTAAAAAAACGAAGGTGTTTACTCACACTTAATATTTCATGGCACAACACTTATAATTCTCAATGATGGTATTAGTTTGCGTTAGTGACGTATGTCTATCTTGTTGTGCCTACAGATCGGATTGATGAATTTGGAAAATGAAGACTTCGTGAAGAAAATTGTGGAGCAAACTCACCAAAGTTTTCAGGTTTGCAATTTTGCAGTTGGCATTGTCATTGTCTTAGTGAAGTGTAGTAAGAACTTTTTTATATTAAGACACTTTTAAATTCTCTAATCTTTACGCCCTTGTGTGTCCCTAGTCCCTTCCTAGAAGGTTTAGACTGGTATCCCATTTTAGAGAGGGAAAGGGAGCAGTTTGATGCCCCGTTTTTATTGTGGAGGTTATTCACAAGGTGGTCTGGTGAAATAAGTCCCCTAGGCATGACGATTGTACCATGGCCTTTTTTTTCAGGATTATTGGAATTGCATCAAAGAGAATACGTGGAAAGTTTTGAGTGATTTTTTTTGAGAGGTACTATTGACCCAGGCATGAGCGAGACCTATGTGTGCCTTATTTCCAAGAAAGAACACTAACAGGGTAAAAGACTTTAGGTCCATTAGCCTGGTCACTAGTTTTTATAAGATGATTGCTAAGACTCTTGAGAACAGGTTGAGGAAAGTCCTTCCTAGTACTATTTCTTATTGTTTATCCAAGTGTGGGTGTGTTGAGAAGATTGGCGTTGCTAGGCGTGGAAAAAGGGGTGGTTGAGGGGTTCCAAATGGGGAAGGAGTCAATTAGTTTGTCTTTCCTTCAGTTCACAGATGATTCAATCTTCTTATGTTTGGGGCAGAAAAATTTCTTGATGAATTTCAACGGTTTTTTTAATCCCTTTTTGAAGTGACTTTGAAACTTAAGATTAATAGGATGGAAATTTATACTTGGCCTTAGCCTTTTTCATTCTAAGCTAAGTGTTTGGGCCTCATTGGTTGGGTGTGAGGTGGGTCAACTTTCGTCCTCTTATTTTGGGCTTCCATTGGGAGGTAATCCGTGAGGGCAAATGTTTCGGGATTCAAAATTCTATATGATTCAGAAACAGTTGTCGTCTTGGAGGAAGCTCTTCTTCTCAAAATGGAGAAAACTCATTCTTATCCAATCTGTGTTAAGTAGGGTTCTCACTTGTTGCTTATCTCTCTTTAAGATTCTCGTTTCTGTGAGCATGAATATTGAAGGAGAGATGAAGAGTTTCTTTGAAGGTGTGGATAATGGGGGTGGGTCACATTTGGTTAATTGGGAGGTTGTGGTGAAGCCGGTGGAATTAGGTGATCTAGGTAATGGGAGCTTGATATTACATAATGAGGCTCTGCTAGTGAAATGGTTGTGGCGATGGTTCTTCATGAAGTTTGACTCTTTGCGGCACTAAGTTATTGTGAGTCAGTATGACCTGCATCTGCCCCTTTTCAAGTGGGTTGCAGATGGTGGTTTCATAGTGCCTAATAGAAATCTTTGGAAAGCAATTGCTTTGGGCTTCCTGTCCTTTTCCTCGTTTGTTCAATGCTTCATTGGGGAGGGCTCAAATGTTTACTTTTGGGAAGATGGGTGGATGGATGATAAACCACTTCATGAGTGTTTCCATGCCTATGCCATCTTTTGAGTAAGAAATTGCATTAAGTGGCTTCTATTTTATCGGGTTCCAACCTTTTGCTTCTTTGTTGTTAGGCTTCAAGAGATGTTGAGCAGATTTGGGAAGTCATGCTTAATAGTGGAAGAAGCTCCAATCCATTTGTCTTTCCAAAATTTGATTATTCTACCATTCCCCTTTCTAACATTCATAAGTTTTATTTTATAAAAACAACAGTATTCTTTGCTACATCAAACCAAGGCCGGGTGTTGCTTCGTGGCTCTGCCTATAGGATAAGAGGTGACCCAATCGTTTCGTTCTAGGCCCTAAATACTAGCAATTGCCTTCTTCCGTAAAAAGTGTGTAACGAGTTTTTGAACTTTAAAAAGTGTGTACCTAGTCTTTAAACTTTCGATTGTGTGTATAATAAATTCTTGAATTTTCGATTTTGTGTCTAATAGATTTTTGAACCTTCAATTTTCTGTCTAAATTTTAACCTATTCAACATTTTTTTTTAATATTTACGGAGAACACAAAATTGAAATATTAGGGTCAAGTTTCAATAGGTTCATGTCTTTAAAAAAAATTATTGAATAGATCAAGGAACTATTTAGATACAATTGAAAATTCTGGGATCTATTATACATTTTTAAAGCGTAGAGACTTAGTTGATATAACCTTGAAAGTTTAGGGGCTAAACGTGTAAGTTTACAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGTATGTAGTTTAAATTTATAAAATAAATAATAGCAATAGAATGATGCCTTAAAGATTAATATTTATCACACCTGTGTTGAAAACATACTATATCCAAGAATAACATAATCATAGTGCAATTTAGGACGAGTACTAGTTGTTGTATGATTACTCTTATGTTAGTGCTAACAATTGAAGAGCAATAAATTAAATGTTTTTGGTCTGTCTGACTTCCATTCATACTATACAAATTTAAATTATTTTATCAGAGATATTTTGTTGTTCTTACTCGGTTCTTTCTCAGGATGCCTTAAACTCTGGACATTGCCACAAGATCCGGATTTTGTTACGCTTTCTAACTGCATTGGTATGCTTGATTTTGCTATCACAGCATATTTTTTTATGACTGATTATTATCATTTTTCAAAATTAGAAAGCCGAACATCTTAGAGTTTTGATTTTGTCTTCTCGAGAGAATATTCTGATCTTCTAAGCATTTTTGTTGTCTTACGTAGATGAGCAGTAAAGTCCTGACGTCCACATCTCTAGTAGTTGTTTTTGAGACATTATTGTCTTCAGCTGCCACAATAGTGGATGATGAGAAGGGAAACCCTGCATGGCAGGCTTGTGCTGACTTTTACATAACTTGCATTCTATCTTGTTTCCCCTGGGGAGGCGCTGAACTGGTTGAGGTATTGTTATTTCATCTCTGAATAATGTCTTTACTTAATGGACCATCTTTCCCAACACTGTCCTTTTCTCTCATTCTCATTTCTTGTTATGAATTGAGTTATATCCTAGGTTAGAGATTGGGTGGTGAGCATCTTTCTCGACACTGTTCTCTCAGTCTTGTTACAAATTGGATTAATATCCTACGATAGAACATTGGGCCTTGTTTTGATATACTTTCCTATTTGATTGCTCTAAAAGAATTGTTATAGGAGCTTTACTATTTTTAGCATATTATAACACACATTGGATGAAGATTTGAACCTACGAATTATTAGAGAAGATAGAGATACCTTAACTACTGAGCTATGTCCATGTTGGCCAAAGAGCCCCTACTATTGATAATTTGCTTTTATATGCAGCAAGTTCCTGAAGAGCTTGAGAGGGTTATGGTTGGAGTAGAAGCTTACTTAAGCATTCGAAGGCATACGTTGGACACCGGCTTATCCTTTTTTGAGGATGATGGTGAAGTTGAGAAAACTCTCAACGAGAAGGTATAATTTGACTAGTTTTGATTATTCATTATTGTCATGCTAAGCTTACTACCGGTGAAAGTTTGACTAGTTATGAGTAGAAGTGCCCTTTTATATAGCTAGGTTCGACTTCTCTTTTCTGGAACTAGTTTTTTGTTTGCCCTTGTATATACTTCCATTTCTCTAAAAAAGTGCGGTTTATTACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCA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ATGAGCAGCTGGAAGAGTCTTCTTCTCCGAATTGGCGACAAGTCCCCGGAATACGGCACCTCCTCCGATTTCAAAGACCACATTGAAACTTGCTTCGCAGCGATTCGGCGGGAGCTGGATCACTATGGAGATGAAATTTTGCCTTTCCTTCTGCAATGTGTTGAACAATTGCCTCATAAGACTCCTTTGTACGGGACATTGATCGGATTGATGAATTTGGAAAATGAAGACTTCGTGAAGAAAATTGTGGAGCAAACTCACCAAAGTTTTCAGGATGCCTTAAACTCTGGACATTGCCACAAGATCCGGATTTTGTTACGCTTTCTAACTGCATTGATGAGCAGTAAAGTCCTGACGTCCACATCTCTAGTAGTTGTTTTTGAGACATTATTGTCTTCAGCTGCCACAATAGTGGATGATGAGAAGGGAAACCCTGCATGGCAGGCTTGTGCTGACTTTTACATAACTTGCATTCTATCTTGTTTCCCCTGGGGAGGCGCTGAACTGGTTGAGCAAGTTCCTGAAGAGCTTGAGAGGGTTATGGTTGGAGTAGAAGCTTACTTAAGCATTCGAAGGCATACGTTGGACACCGGCTTATCCTTTTTTGAGGATGATGGTGAAGTTGAGAAAACTCTCAACGAGAAGGATTTTTTAGAAGATTTATGGAGTCGCATACAAACATTATCTACTGATGGATGGAAAGTGGATAGTGTTCCAAGACCTCACCTTCTATTTGAAGCTCAGCTAGTTGCTGGGAAGTCTCATGAATTTGGAACCATCAGCTGTCCGGAGCAACCTGATCCACCTTTAACACTTTCTGACATTACTTATGGTAAACAGAAGTATGCTGCAGAGTTGAATTATCCTCAAAGGATACGTCGACTTAATATATTTCCATCAAGTAAATTTGAGGATGTGCAACCTATTGATCGCTTTGTCGTGGAGGAGTATCTTCTTGATGTGCTTCTTTTCTTCAATGGCTGTCGAAAGGAATGTGCATCTTTCATGGTTGGCCTTCCTGTACCTTTTAGATATGAGTATCTTATGGCAGAGACAATTTTCTCGCAGTTACTCATGTTACCACAACCACCGTTCAAGCCTATTTATTATACGCTGGTCATTATTGACCTTTGCAAGGCTCTTCCTGGGGCATTTCCTGCCGTTGTAGCTGGTGCAGTTCGTGCCTTATTTGAGAAAATAGCTGATTTAGACATGGAGTGTCGTATACGGTTGATACTTTGGTTTTCACACCATTTATCAAATTTTCAATTTATATGGCCATGGGATGAATGGGCTCACGTATTAGAACTTCCAAAATGGGCTCCCCAGCGAGTGTTTGTGAAAGAGGTTCTGGATAGGGAGGTCCGTCTGTCATATTGGGATAAAATAAAGCAGAGCATTGAGACTGCACCTGGTTTAGAAGAATTGCTACCTCCCAAGGGTGGACCAAACTTCAAATTTGCTACCGAAGACGGAGAAAAAAGTGAGCAACACGCACTTTCTTCTGAATTGTGCAATATGGTGAAGGGACGGGCTGCAGCACGTGACGTAATTTCATGGTTGGATGAAAATGTTATTCCCAAGCATGGTTCAGATATTTCTCTCGTAGTAGTTGTGCAAACTCTGCTAGATATTGGGTCGAAGAGTTTCACTCATTTGATAACAGTCTTGGAGAGATATGGACAAGTTATTTCAAGAATATGCGATGATCAGGATAAGCAGGTCTTGCTTATATCTGAAGTGGGTTCTTACTGGGAGAATAATACTCAAATGACGGCAATAACAATTGATAGAATGATGGGTTATAGGTTAATATCCAATTTATCCATCATCAAATGGATCTTTTCTCCAGAAAATGTTGAGCAATATCATACATCAGATCGTCCATGGGAGATACTGAGAAATGCGTTATGCAAGACGTATAATCGTATTTCTGATCTTAAAAAAGAAATATCCTCCTTGAAGAAAGATATTGTTGCAGCTGAAGAAGCTGTTGCTAAGACACAGGAGGAATTGAATGCTGCTGAATCAAAGCTCACACTTGTGGATGGTGAACCTGTTATGGGAGAGAATCCCGTGAGAACGAAGCGATTGAAAGCTTATGCTGGAAAAGCAAAAGAGCAGGAGACGTCGATACGAAACTCTTTAGAGGCCAAAGAAGCTCTTCTTACCCGAGCTCTTGAGGAGAACGAGACATTATTTCTATCTTTGTACAAAGGGTTTTCCAGTATATTGACAGAACGCCTTCCAGCTGCATCTAGCGCACAAACCCTGCAGGATTTGAAGTCTATTAATCCTGCTGGTGCGAATGCTATGGACCTTGAAGAACCATCAGCCATGGAGATGGAGATGGACAATGAGGATTCAAAACCTGAAAAAAGTCATTTGAATGGTAAGACAGAGCATTCCTACACTGTAGGTGAAAATGAACAGTGGTGTTTAACAACCTTGGGATATGTCAAGGCCTTCTCAAGGCAATACGCTTCCGAGATATGGCCACACATTGAGAAGTTGGATGCAGAAGTCTTGTCCGAAGATTCACACCCACTTTTCAGGAAAGCAGTCTACAGTGGCCTTCGTCGATCAATGGACTCGATCTAA MSSWKSLLLRIGDKSPEYGTSSDFKDHIETCFAAIRRELDHYGDEILPFLLQCVEQLPHKTPLYGTLIGLMNLENEDFVKKIVEQTHQSFQDALNSGHCHKIRILLRFLTALMSSKVLTSTSLVVVFETLLSSAATIVDDEKGNPAWQACADFYITCILSCFPWGGAELVEQVPEELERVMVGVEAYLSIRRHTLDTGLSFFEDDGEVEKTLNEKDFLEDLWSRIQTLSTDGWKVDSVPRPHLLFEAQLVAGKSHEFGTISCPEQPDPPLTLSDITYGKQKYAAELNYPQRIRRLNIFPSSKFEDVQPIDRFVVEEYLLDVLLFFNGCRKECASFMVGLPVPFRYEYLMAETIFSQLLMLPQPPFKPIYYTLVIIDLCKALPGAFPAVVAGAVRALFEKIADLDMECRIRLILWFSHHLSNFQFIWPWDEWAHVLELPKWAPQRVFVKEVLDREVRLSYWDKIKQSIETAPGLEELLPPKGGPNFKFATEDGEKSEQHALSSELCNMVKGRAAARDVISWLDENVIPKHGSDISLVVVVQTLLDIGSKSFTHLITVLERYGQVISRICDDQDKQVLLISEVGSYWENNTQMTAITIDRMMGYRLISNLSIIKWIFSPENVEQYHTSDRPWEILRNALCKTYNRISDLKKEISSLKKDIVAAEEAVAKTQEELNAAESKLTLVDGEPVMGENPVRTKRLKAYAGKAKEQETSIRNSLEAKEALLTRALEENETLFLSLYKGFSSILTERLPAASSAQTLQDLKSINPAGANAMDLEEPSAMEMEMDNEDSKPEKSHLNGKTEHSYTVGENEQWCLTTLGYVKAFSRQYASEIWPHIEKLDAEVLSEDSHPLFRKAVYSGLRRSMDSI Homology
BLAST of Csor.00g224830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SIU2 (Nuclear cap-binding protein subunit 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABH1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 1177.9 bits (3046), Expect = 0.0e+00 Identity = 576/862 (66.82%), Postives = 706/862 (81.90%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q10LJ0 (Nuclear cap-binding protein subunit 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ABH1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1087.4 bits (2811), Expect = 0.0e+00 Identity = 538/863 (62.34%), Postives = 674/863 (78.10%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q16UN6 (Nuclear cap-binding protein subunit 1 OS=Aedes aegypti OX=7159 GN=Cbp80 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 323.2 bits (827), Expect = 9.2e-87 Identity = 211/761 (27.73%), Postives = 377/761 (49.54%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7PX35 (Nuclear cap-binding protein subunit 1 OS=Anopheles gambiae OX=7165 GN=Cbp80 PE=3 SV=4) HSP 1 Score: 323.2 bits (827), Expect = 9.2e-87 Identity = 208/761 (27.33%), Postives = 374/761 (49.15%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B4GW22 (Nuclear cap-binding protein subunit 1 OS=Drosophila persimilis OX=7234 GN=Cbp80 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 320.5 bits (820), Expect = 6.0e-86 Identity = 207/759 (27.27%), Postives = 375/759 (49.41%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. NCBI nr
Match: KAG6590186.1 (Nuclear cap-binding protein subunit 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1731 bits (4482), Expect = 0.0 Identity = 866/866 (100.00%), Postives = 866/866 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. NCBI nr
Match: XP_022960635.1 (nuclear cap-binding protein subunit 1-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1729 bits (4478), Expect = 0.0 Identity = 865/866 (99.88%), Postives = 866/866 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. NCBI nr
Match: XP_023516128.1 (nuclear cap-binding protein subunit 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1712 bits (4433), Expect = 0.0 Identity = 853/866 (98.50%), Postives = 862/866 (99.54%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. NCBI nr
Match: XP_022988026.1 (nuclear cap-binding protein subunit 1-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1707 bits (4422), Expect = 0.0 Identity = 852/866 (98.38%), Postives = 859/866 (99.19%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. NCBI nr
Match: KAG7023839.1 (Nuclear cap-binding protein subunit 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1615 bits (4182), Expect = 0.0 Identity = 827/879 (94.08%), Postives = 829/879 (94.31%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H9M5 (nuclear cap-binding protein subunit 1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111461363 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1729 bits (4478), Expect = 0.0 Identity = 865/866 (99.88%), Postives = 866/866 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JG20 (nuclear cap-binding protein subunit 1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111485390 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1707 bits (4422), Expect = 0.0 Identity = 852/866 (98.38%), Postives = 859/866 (99.19%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BQ48 (nuclear cap-binding protein subunit 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492007 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1584 bits (4101), Expect = 0.0 Identity = 793/868 (91.36%), Postives = 830/868 (95.62%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DLR3 (nuclear cap-binding protein subunit 1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021617 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1583 bits (4100), Expect = 0.0 Identity = 786/868 (90.55%), Postives = 834/868 (96.08%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EU52 (nuclear cap-binding protein subunit 1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437775 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1581 bits (4093), Expect = 0.0 Identity = 793/868 (91.36%), Postives = 827/868 (95.28%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g224830 vs. TAIR 10
Match: AT2G13540.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 1177.9 bits (3046), Expect = 0.0e+00 Identity = 576/862 (66.82%), Postives = 706/862 (81.90%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (sororia) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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