Csor.00g201450 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSinitialstart_codonpolypeptideintroninternalterminalstop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTTTGGGTAAGATTGCAAATTCATATGGTTCTAAATTTATATTTGACATATGGTCATCCAAATGCAAAAAGCATACCGAACAAACCATTCTCCCTTACGATGAGGATGTTTTCGAGCAGGTGGAAGAGGATATTCGATTGGGTTCAGAGGAGTACTACGTCTCAGACCCACCACCATTCGATGCCCTAAAAGAGACGTTGGAAGAGGATATGTTGGAAACACCAACCAGTAGGTATACTAGAATCGAAACGTCGTCACGACTAAAGAAGAATGATGGGCGTAGTATGGACACCAATAAATATGCAAACAATTCATTTTGTTCACAAGGACAACTTCTTATCTATTGTGATGTAGAGAGGAGATACTGGTGAGTGAACAACTTCCACCATTTTTTTTTTTTCTTTTGCTTTGTTTTTGATGATATTTGCTACATATATGAATTAAATATAATTATTAGTGGAAATATTTTTCAATTGAATAAGTAAAATAAAATAAAATAAAAAATTAGAAAATAATGCCTAGAAAAATAAAATAAAATCCATGTGAATAATTTGTTGCAATGATATGAGATTGTAGATACAGTTATTTGCTTAAATTTATCTCAAAAAATAAGGAAAAAACATGCCATGAAATCGACTTTAGAATTACATGCATCTTATTAAATACAAACTTCAGAATTCAACTCGACAGTTTCACTTCTTCAATCATGTGGCGTCGTCATCTTAGCACGCTCACGATAAGCGTCATTCATATTTTTCGCCCGACTTTATAGCATCATTGGATCTTAGGCAAGGTTTGTCTTCACCAACTACATATCACTTGTGCGGAATCCAAGCTTGTTTGGCCACACATGCGCAGCATATTCAATCATCTATGACACAACTAACTTGCCTCTACACTAGACCAAGTCATTCAGCTCGACCTTGCCTATACTTGGAGGCAAAGTCTCTCAATGCAACGTCGCAACCTATCATCTCATCTTGGTTCCCAATTAACATGACCCTCATGTTTTGATGTCATCCCAAGTCACGGGGTGTCGTGGGCCATCACATCTCACTCTATCATGCCTTCTAGAATGGACCCACATGTCATAAATAATCTCAGGACATCCATCCATTCGGGTTCAATCGAGGCATTGACCCTCCGTGCCCATGTCATGGCATTTACGGATACCGTATTGATAGTGAGTGCAAAATTCAACCTCCGACACTCGGGTTAGGGCGTAATACTGGCACACCCGTACCGCCTGGTACTGTCCTTGAGAGATCTATTCAAAAGAAGTCACCCGAGACCCTCGTCTCGGAATGCTCACCCTCACTGTGACACACACATGTACCATAGGATAGTTTGCTTATACCATAAGGCTAGGGGTAGTGGAGAGAGCTGACACCATGCCTCCCTCTATAGAACATTTTGAGGTATTTTCAATGCTCCTTGTGTAGACGTGATTTTGGTGAAACGATCATACGGTGTCGTGGAGAGTCCGTTCGATGTCTGATTGACACCAAATTTGGCGAGCATTCATATTTCATATGGACGAACTTGACTCCATAACCGCATTCCTAGAATCTCCTCAGAACCATTGCTTTCGAGGTTAAGGTCTGATAAGATAAGATTCGTTTCTTTGTCGTTATTCGGATTTCTCCTTCAATACCCTTGTTTATGTGTTGAGTGTGCTGTCTATTCACTTTGAATTGCACTTAGCTCTATAACATAGCTTGTCTCACATCCAATTTGTTTTTTGGAGTGTGCTTTGTGTGTGCTCAATTGTGAGGTGAGTTTGTAAGGGAGTGACACATTGATTCGAGTGCAGAGTGCTAAACACGAGTGAACTACATTTACGAGTGAATACACGTGAGGGAGCGCTTGTGAGGTCCTTTTTTTTCTTTTACTTTCTTTTGTAGCATGGAAAATCCAGACGACAATACTAGCATTACTGATGCACGATTGAGAGAAGCACAACAACGAACCATGGAAAGACTAATTCGAGGAATACTAATCGAATAGGAAGATTGGAGATTCAAAATCAAGCTCGATAGAGGATTCCACTACCTACGCCCTCAACCGATACATATGAGGGCGACAATTCTGATCACCACGAGAATAATCCACATGCGGTTGGTCATGGCTTGATGCGAGGGAGAGACCTTGGAAGAAGGTATCATAATTTACAACCACGAGTTCCTTATGATGATAGAATTGATCATAACGTCGGGAGCATCAAATTAAAACTTTTCAAGTTTTATGGCAAAATCGATCTAGAGGAGTACCTTCAATGGGAGAAAACGGTGGAGTCGGTGTTCAACTGTCATAATTTTAGTGATGAAAAGAAGGTACTGTTATGCATTGCTCAATTCAAACAATATGCTCAAATTTGGTGGGATAAATTGATGTAAGTAGGAGAAAAAATCTTGAAGCACCAATTGATTCATGGGTCGAGTTCAAAGAGTCCATGAGGAAGCGTTTTGTTCCACCATATTTTCAATGGGACATGGTGCAAAAGCTTCAAGCATTGGAACAAGGACGCAAATCTGTGGAGGATTATTACAAGGAGATGGATACATTGATGGATCGACTTGAACTCGATGAAGACATGGAGGCTCTCATGGCGCAGTTTCTTAATGAGTTAAACACAGAGATTGCAGACAAGACTGATTTACAGCCTTATTCTAATATTGAGGAGTTGTTGCACATTGCAATTAAGATCGAGAGGCAAATCCAACGAAGGTCTCAACGGTATTCTTCTAAAACTTTTCCCAATTCTACTTCTACATGGAAAAAGGATAGTAAGAACATTGATTATAAGCATAGAAATCAAGAGATTAATGACAAGCCTCAAGCTAAATTTGAGAAAGGGGAGAGTTCTAGAACAGGGAAAGAAAAAGTAGAAAAGTCTAATGATAACTCTCTAAAAATAAGTTATATCAAGTCTTTTTGTAGTTAATATTGGACTCTTATTCACCAGTTTCTCATTTATTATCCCATTTATTCTATTTAGTGAGCATGAAATCATTTATTGCGGTCTAACATGAAAAAAAAATATGATTTGGCATAAATCGATCTTAATTCTATATTTAATTTAGTTATATGGTAAAATTTCAGACATTTATATTAAACCACGTGGGAGTAGCAAATTTGGAAACAAATGAGGGATAACATGGAAATTTTAAATCCACATCATCAATCCAAATGGGTCATTGACTACTCAGTGAGGAACATCCTATGTGGATTACTTATTCATTTGCAGCCCTAAAGAGGAACCCATGCTCAATATAAAAGGAAAAGGAAGACCACGAGGAGAGGAGCCACACTTTGTGGAGAAAAATCAAATTACACCGTAGCAGTGATATGAACCATGACCAAGGAATTTCCATACCTCAAGGTCCAATTACAAGGACGAGAGCCAAGAAGCTACAACAAATCTTATACAGTTATATTCAAGCTATGGTGAGTTCATCAAAGGAAATTCTAGAAGACGTTGGAGACCTCCCTTATATGTTATGCAAAGTTGAGCTTCAAGACAGAGATGAATTAAATGCACTTTAAGTTACATTTAATGAACTCCGCTGAATTTATCAAATAGTCCAAAGATGACTAATAAGCACATTTTATTATTTCAATTATTTAATTATAGTTTAACTATTTGTTGTCCTATTTAAGCTAGTTTTAAATATAGGAGTTAAGGTTATATTGTAACCCAGGTTACTATATTCCACCATTAACTAGCCATTTTAATATGGAGGTTATGGGTATTTCTCATTTACTAGCCCATTTAATTTGGGAGTTATGTATGACATAGGTTAAGGTTGTAAAGGCTAAAGCCTTCTTTTCTTTGATTAGACATCAGACTTTGGAATTAAGAATAGAATTTCTATTTTAGCTTTGTTGAGAGCTAAACTTTCTTTGCAAATTCTTGTGTTTAGAACTTGCATGTAGAGTCATTCAAGTGGTATTGATCAAACCTCTTGTGGAGTGATTCGAATCACGAGTTTAGAAACGAGTTTTCTTTACTCTTGATCTTGATCATCAAGGTAATCTGTTCCATACTTTCCCTTAAGTTGATTTCCATATCATTTTGGTATCAGAGATTCAGGCTCAAGATCGGATATATGTTTCATTGCGCTTATCTCTTTTAATTCTCTTATAATTTTTTTTTCTCAGTTTGTGTAGAATGTTCATGTTCTGTCACAAAAATATATAACAAAAAAAAAAAAAAATTCTTATGTTCTTTAAAGTGTTAGATCTGGATCTTATCAACACTTTATTCTTCTTTAAGATCTTCTAAATCAATTTTCTTGTTGGTAAATTGATTAGATTTTGCTAATAAGAAAAAAAAAACCATTGAAAGAAAGAAATATATTGATGTTAAATGTCTTTCTTTTTTCCTCTTGATTATTATATGCAACTCTCATATGTTACTACGTCTAAATTAGTCCTTAATCATTTTCTTTCTTTAATTCGTTTCTTTATCGTTATTTGGATTGCTCCTTCAATACCCTTGTTTATGTGTTGAGTGTGCTGTCTATTCACTTTGAATTGCACTTAGCTCTATAACATAGCTTGTCTCACATCCCAATTTGTTTTTTTGGAGTGTGATTTGTGTGTGCTCAATTGTGAGGGTGAGTTTGTAAGGGAGTGACACATTGCTTCGAGTGTTGAGTGCTAAACACGAGTGAACTACATTTACGAGTGAATACACGTGAGGGAGCGCTTGTGAGGTCCTTTTTTTTTTCTTTTTCCTTTCTTTTGTAGCATGGAAAATCCAGACGACAATACTAGCATTACTGATGCACGATTGAGAGAAGCACAACAACGAACCATGGAAAGACTAATTCGAGGAATAGAAGAGTTGACTGATCGAATAGGAAGATTGGAGATTCAAAATCAAGCTCCATAGAGGATTCCACTACCTACGCCCTCAACCGATACATATGAGGGCGACAATTCTGATCACCACGAGAATAATCCACATGCGGTTGGTCATGGCTTG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ATGGGTTTGGGTAAGATTGCAAATTCATATGGTTCTAAATTTATATTTGACATATGGTCATCCAAATGCAAAAAGCATACCGAACAAACCATTCTCCCTTACGATGAGGATGTTTTCGAGCAGGTGGAAGAGGATATTCGATTGGGTTCAGAGGAGTACTACGTCTCAGACCCACCACCATTCGATGCCCTAAAAGAGACGTTGGAAGAGGATATGTTGGAAACACCAACCAGTAGAGAGGAGATACTGCTGCCGCAGTCTCAGTCTTCCGACGCTTTTCAGAGGAATACGAAGATGGGTTTCCAGATGCCGTCTCATGGAATTCAATCAATGCTTAAAGAGGGTCACAAGCATCTCTCGGGTTTAGATGAGGCCGTTCTCAAGAACATTGACGCCTGCAAACAGCTCTCCACCATTACCCGAACCTCTCTTGGTCCCAATGGAATGAATAAGATGGTAATTAATCATCTTGACAAGCTTTTTGTCACAAATGATGCTGCCACAATTGTCAATGAACTAGAGGTACAGCATCCTGCGGCCAAAATTTTGGTTTTAGCAGGTAAAGCTCAGCAAGAAGAAATTGGTGATGGGGCTAATCTGACAATTTCGTTTGCTGGGGAACTTTTACAAAATGCTGAAGAGCTCATCAGGATGGGTCTACACCCTAGCGAAATAATCAGTGGCTACACAAAAGGAATCAATAAGACTGTCGAGGTTTTGAATGAACTAGTGGAGAAAGGTTCAGAAAACATGAATGTTCGTAACAAAGAGGAAGTCATTTCGCGCATGAAAGCTGCTGTTGCTAGCAAGCAGTTTGGACAAGAAGATTTTATTAGTTCTCTAGTGGCTGATGCTTGCATTCAAGTTTGTCCTAAGAATCCAGCAAATTTTAATGTGGACAATGTTCGAGTTGCAAAGTTATTGGGAGGTGGTTTACATAATTCTTCAGTAGTGCGTGGCATGATCTTGAAAAGTGATACTGTGGGAAGTATAAAGCGAATTGAGAAGGCCAAGGTTGCTGTATTTGCTGGTGGCGTTGATACATCTGCAACGGAAACAAAAGGAACAGTATTAATTCACACTGCTGAGGAGCTACAAAACTATGCGAAAACTGAGGAAGCTAAAGTTGAGGAGCTGATAAAAGCAGTTGCAGATTCAGGGGCCAAAGTAATTGTTAGTGGAGCAGCTGTTGGGGAAATGGCTTTACATTTCTGTGAACGCTACAAGCTTATGGTGTTAAAAATTAGCTCAAAGTTTGAGTTGCGGAGATTTTGTCGCACAACTGGTGCTGTAGCCATGTTGAAGCTCAGCCAGCCAAACCCAGATGACTTGGGTCATGTGGACTCTGTCTCAGTTGAAGAAATTGGTGGTGTTAGGGTTACAGTTGTGAAGAATGAAGAGGGGGGTAACTCCATATCAACAGTTGTGTTACGAGGAAGTACTGATAGTATTCTGGATGATCTTGAACGGGCTGTTGATGATGGAGTTAATACGTACAAAGCAATGGCGAGGGACAGCCGCATAGTGCCTGGAGCTGCTGCTACTGAAATTGAGTTGGCTAGAAGAGTAAAGGAGTTCTCTTTTAAAGAAACAGGATTGGATCAGTATGCCATTGCAAAATTTGCAGAAAGTTTTGAGATGGTACCAAAAACATTATCTGAAAATGCTGGGCTAAATGCAATGGAGATAATATCATCATTGTATGCTGAGCATGCATCCGGAAATACTAGAGTGGGTATAGACTTGGAGGAAGGGATTTGCAAGGATGTTTCCAAGATGAATATCTGGGATCTTCACATTACAAAGCTCTTTGCTCTTAAGTATGCTGCAGATGCTGCTTGTACTGTCCTTCGAGTGGACCAGATAATAATGTCAAAACCAGCTGGAGGCCCCAGGAGAGGAGCGCAGCCTGCGGGGATGGATGAGGACTAA 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BLAST of Csor.00g201450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94K05 (T-complex protein 1 subunit theta OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CCT8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 891.0 bits (2301), Expect = 8.2e-258 Identity = 453/548 (82.66%), Postives = 506/548 (92.34%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q552J0 (T-complex protein 1 subunit theta OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=cct8 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 560.8 bits (1444), Expect = 1.9e-158 Identity = 273/526 (51.90%), Postives = 390/526 (74.14%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3ZCI9 (T-complex protein 1 subunit theta OS=Bos taurus OX=9913 GN=CCT8 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 558.1 bits (1437), Expect = 1.3e-157 Identity = 280/539 (51.95%), Postives = 396/539 (73.47%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4R5J0 (T-complex protein 1 subunit theta OS=Macaca fascicularis OX=9541 GN=CCT8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 556.6 bits (1433), Expect = 3.7e-157 Identity = 279/539 (51.76%), Postives = 396/539 (73.47%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P42932 (T-complex protein 1 subunit theta OS=Mus musculus OX=10090 GN=Cct8 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 555.8 bits (1431), Expect = 6.3e-157 Identity = 279/539 (51.76%), Postives = 397/539 (73.65%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. NCBI nr
Match: KAG6581684.1 (T-complex protein 1 subunit theta, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1239 bits (3206), Expect = 0.0 Identity = 643/643 (100.00%), Postives = 643/643 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. NCBI nr
Match: KAG7019321.1 (T-complex protein 1 subunit theta [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1049 bits (2713), Expect = 0.0 Identity = 545/545 (100.00%), Postives = 545/545 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. NCBI nr
Match: XP_023528096.1 (T-complex protein 1 subunit theta-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1047 bits (2708), Expect = 0.0 Identity = 544/545 (99.82%), Postives = 545/545 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. NCBI nr
Match: XP_022932794.1 (T-complex protein 1 subunit theta-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1045 bits (2703), Expect = 0.0 Identity = 543/545 (99.63%), Postives = 545/545 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. NCBI nr
Match: XP_022974226.1 (T-complex protein 1 subunit theta-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1045 bits (2701), Expect = 0.0 Identity = 542/545 (99.45%), Postives = 545/545 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EY10 (CCT-theta OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439253 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1045 bits (2703), Expect = 0.0 Identity = 543/545 (99.63%), Postives = 545/545 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IAS1 (CCT-theta OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472847 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1045 bits (2701), Expect = 0.0 Identity = 542/545 (99.45%), Postives = 545/545 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I957 (CCT-theta OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470794 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1024 bits (2647), Expect = 0.0 Identity = 527/545 (96.70%), Postives = 536/545 (98.35%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UCK7 (CCT-theta OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold734G00090 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1023 bits (2645), Expect = 0.0 Identity = 528/545 (96.88%), Postives = 536/545 (98.35%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CP04 (CCT-theta OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502968 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1023 bits (2645), Expect = 0.0 Identity = 528/545 (96.88%), Postives = 536/545 (98.35%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. TAIR 10
Match: AT3G03960.1 (TCP-1/cpn60 chaperonin family protein ) HSP 1 Score: 891.0 bits (2301), Expect = 5.8e-259 Identity = 453/548 (82.66%), Postives = 506/548 (92.34%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. TAIR 10
Match: AT3G18190.1 (TCP-1/cpn60 chaperonin family protein ) HSP 1 Score: 235.3 bits (599), Expect = 1.3e-61 Identity = 136/505 (26.93%), Postives = 265/505 (52.48%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. TAIR 10
Match: AT3G20050.1 (T-complex protein 1 alpha subunit ) HSP 1 Score: 227.6 bits (579), Expect = 2.8e-59 Identity = 147/516 (28.49%), Postives = 273/516 (52.91%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. TAIR 10
Match: AT3G11830.1 (TCP-1/cpn60 chaperonin family protein ) HSP 1 Score: 215.7 bits (548), Expect = 1.1e-55 Identity = 141/542 (26.01%), Postives = 269/542 (49.63%), Query Frame = 0
BLAST of Csor.00g201450 vs. TAIR 10
Match: AT5G26360.1 (TCP-1/cpn60 chaperonin family protein ) HSP 1 Score: 212.2 bits (539), Expect = 1.2e-54 Identity = 143/522 (27.39%), Postives = 269/522 (51.53%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Silver-seed gourd (sororia) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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