Csor.00g076270 (gene) Silver-seed gourd (wild; sororia) v1

Overview
NameCsor.00g076270
Typegene
OrganismCucurbita argyrosperma subsp. sororia (Silver-seed gourd (wild; sororia) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCsor_Chr01: 11172502 .. 11176421 (+)
RNA-Seq ExpressionCsor.00g076270
SyntenyCsor.00g076270
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSinitialstart_codonpolypeptideintroninternalterminalstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAGACAGTGTGGGACTCCTCCGAACAATCCTCAATAGGTAGGCTCTTATCTCTTTCGAGTGCTCTCGTTAAGAACGATCTAAGGTAAGCACGAAAGTTCGTTCGGAAATCTAAAACCATAGATCAAAGGTATAAAAATAATTAAAATGATAAAAATTAAAATTAAAAAAAAAAAGTGAAAAAAATCCATATGTTGAGGTTTGGGTAGAAGCCCAACTTTTCCAACGGCCCAAAATGAATCCATTGTTGAAGCCCATAAATGCTGGCCCAGTCATGGAGCTACGGGCCTCCGGCCCAAAAGAATTAATTTAATAGCGGTTGATAAATTTACTAATAACGAAAATAAATTATTTGATATTATAGAGGTCGGTCCAATCTATTATTCTTTCATTTGATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTCTTTTGTACACGGTATACCCATAAATTGACACGTTCTTATTTGGATGAATGCAAATTATTAATCGTTGTAGTTTCAATTCCCCGGCTAATAGAGTTTACTCGTTGGGGTCAATTAGGTAATTTTTTGACTTTTATTGTTCTCAACGGTACTATTAGACCAATGGGTTTGAACTCGTGCTCGATCTATTATCAAAAGATGGAAACCATGATGGAAAGAGCAAATGTTAGAGAAGAAGAAGAAGATACCATGTCTAGATTCCTTGGCGGTTTGAATCAAGAAATTGCTCATCTTGTTGACAGAAATCCACCACCATATCTAGAAGACATGTATCATTATGCTCTCAAAATTGAAGAAAAAGAGCATTAAAAAAAGGTACACATCACGAACTAACACTTTTTCAAATTCTAAAACTTGGAACAATGATAGTTTTGTGAAAAGAAATGAATCAATGTCACCAAAACAAAAGTTTGTGGCTGCTAAAAGAGCGAAGGAATTGTGACTTTATAATACAATTGTATTTTTTTGACCAATTTTTTTTTCTATATTATGGTCGGGTTAGTTTTTGATATTATAATATTATAATATTATAAACGAAGAGATCGAGATACAAACCTATTATTTGTGTCAAATGAAAGATATATATATATATTTTAATGACAAGTTTTTGGGGCATCAAATCTTTTAAAAGATTTAATATTTATTTTTTTAAAAAAATGTACACTTTTTTTATTTGATTTTGAGAAATAAAAAAGATGAGACATTTATGAAGCTAAGATAGACTTTGACTAACCCTAAATATTGAATTCCAAAAAGGGTAGTGGGACTTTTGAAATTTGGAAAAGTGATTTTACTTTATTGCCCCTTCACATTCAAAGGGATCTTCAAAACTTGTCTTCATATGGGGAAGCATCCTTCTATCCTTTTGAAGCTTTCGTGTCTCGGGTGAGGGAGATAAAGGAGATTTAACATTAACGTACTCAATGTAGTTCGACCGTTAATTCGATATATATTGTAGCTTAACGGTTAACATTAACATACCAAATATAGAACTATGAACTATAAAGAAGTGAACTCGAGCTAGGGTTTGGTTGTCTTTTGTTCTCCCTTTCAGAACCATGTTCCACGTGGAGCTGAAAACTTCGTGGGTCGATCAAGTGGAAGGCACTGCTTTGAGTTCACGTAAATGTTCTAATTTGATACCCACAATCTCCATAGATTATATCTTAGTGTAGTAACCATTCTACGAGTGATTACTACATTTAGCTGAACTAGAATCACTCGTAACCGGGGCACGATAAACACGTGCCCCATATGAGGCTGAGTAGGAAACTTTTTGTTACTATTTTGACTTTATTTGTTCTTATAGAATTAAAAAATTAAAAAATGTTAATTTAAGTAAATATTATGAAAGAAATAGGAGAGAATTAATTGTTAAAGGAAGAAAAAATAAATAAAAATAATAATAATAAAAGACAGATAAGAAGAGAAACAAAAACATCTGAGGTGTGAGTTGGGATGGAGTTTGACAAATCGTGGGCCATGCATCGGATGCCATATCACGTGTTCAGGGAATCAGATGCCACGTGGAAACATGCTACGCTAGGGACCACCGTAATTAAATGTTCTTGTCTGCACGCCGTCTCCACCCTCCGATGTATTCCAAAGCCGTTTTGAGAAAAACAAGGTAAAATATAAATGTGCAATTTATTTTTTTTTTTTTTTTTAACAAATATAAGTGAAATAAAAATTAAATGTAATCTTTTAATTAAATATATATATTTTAATTAGTTGAATTATCTTTTTAATAAAGTAATGAAATTATGAGACAAACTTAATTTTAAAAAATATATAAAATTACATTTATTTTAGAATAAAAGTAGTATTTATAAACATATTTTTTAAAAAAATTATAAATTAAATGGAAATTAAAGATACATTATAAATATATATTTTTAGAAGAAAATTATTAATATTTATAAAGGACAATAATGGAAGTGGATGAACAAAAGTCGGCGAATAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAATTTTATTATTTATTATTTGGAATAGATCTGCCCCGTCCCTACTTCAAGTCCAGGCGTGACTCGTGAACTGTCGGACCACGGGTTCAGTGTGCCCATATCCACACCACACCACATTTCACAGACGTGGGCCCCACTTCCACGTAGTTTATAATAAACAACATTTATAAAAATATGAAAAAAGTTATAACATTATCCCTTCCGAATTTAAATTAATAAAAATACATTTTTTAATTTTTTTAAAAGAAAAGTTGAAAGACTAGATTTAGATGAACCAACCTATCCAAATTTCAAGAGTATTTTTAAAATAAAATCTAACCATTTTCGTTAAAAATTTTTTTAAGATATTATTAAAAATTTAAATGTAATTTTAAAATAAAAGTAGCAAATTTAAGGGTATTTTTATTAAGTTAGTCTTTAGTTAATTGATATAATATATTTTAACCTAAAGATTTGAGGTCTAAATCTTCTTTCACATAGTTTTTTTTTGTTAATTTTTTTTTTTTAGTCACTAAACTAATATATATATATATATATATAACAATTTAGTCCTATATTTATATATATATATAATTCTTAAACAGTCCATAAATTTAGTTGTGTAGACTCTATACTCTAATATTTGTAATAATTTAATCCTGTCATAAAATTTTATACAAGTGGATCGATAAGTCAATTAAAACCCTATATATTTATAAGCCACCAGCTTTAAGTCCATCGAATTTCAATGAAATTTTTTACGATATAGATTAAATTCTTACAAGTTCAAAACTATATAATTAAAAAACTAAATTGTGATATCTAACAAAGTTTAAAGTAAAAAAAAGTGTGTAACCTCGAACACATAAAATATGATATATTAATATAAGGAAATAAAACAAATTAAAAAGCTAAAAGGAGGTTAAAAGTGTTATTAAATGAGAAAAAATATTATTTGAAAATTAACTCCGAATGCCAATGAAATCATTACAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAAAAAGGAAAAAAAAAAGGTAATATAATAATGAAGAAAAAATTAAAAAAGAAAAAAGGAAAAAGGAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGGCAATATAATAATGACAAAAATAAATCGGTTACCAGTGGCGGGTTCCACGAGCCTGAGGTTGCTCTGTTTCTGCTCTGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCATCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCATTCAATTCAATTTATCTGAAACACAGACAAGCAAACAGGCGAGTAGACCGAGAAAGAAGAAGACCCAATGGACAAATTTTGCTCGGATCTCCACCTTCACGCATTCCAATGTCTGCCTTGTGTATATATATATATATATATTATTCAAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATCTCTGCAATTTGTGAATTTGGGTTCTTGTTTTTATGTTCAGAATTTGGGATTCTGTAATTAA

mRNA sequence

ATGGAGACAGTGTGGGACTCCTCCGAACAATCCTCAATAGGTAGGCTCTTATCTCTTTCGAGTGCTCTCGTTAAGAACGATCTAAGGGATCTTCAAAACTTGTCTTCATATGGGGAAGCATCCTTCTATCCTTTTGAAGCTTTCGTGTCTCGGACAAGCAAACAGGCGAGTAGACCGAGAAAGAAGAAGACCCAATGGACAAATTTTGCTCGGATCTCCACCTTCACGCATTCCAATAATTTGGGATTCTGTAATTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGACAGTGTGGGACTCCTCCGAACAATCCTCAATAGGTAGGCTCTTATCTCTTTCGAGTGCTCTCGTTAAGAACGATCTAAGGGATCTTCAAAACTTGTCTTCATATGGGGAAGCATCCTTCTATCCTTTTGAAGCTTTCGTGTCTCGGACAAGCAAACAGGCGAGTAGACCGAGAAAGAAGAAGACCCAATGGACAAATTTTGCTCGGATCTCCACCTTCACGCATTCCAATAATTTGGGATTCTGTAATTAA

Protein sequence

METVWDSSEQSSIGRLLSLSSALVKNDLRDLQNLSSYGEASFYPFEAFVSRTSKQASRPRKKKTQWTNFARISTFTHSNNLGFCN
Homology
[Close]
BLAST of Csor.00g076270 vs. NCBI nr
Match: KAG6608046.1 (hypothetical protein SDJN03_01388, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 170 bits (430), Expect = 3.87e-53
Identity = 85/85 (100.00%), Postives = 85/85 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  METVWDSSEQSSIGRLLSLSSALVKNDLRDLQNLSSYGEASFYPFEAFVSRTSKQASRPR 60
          METVWDSSEQSSIGRLLSLSSALVKNDLRDLQNLSSYGEASFYPFEAFVSRTSKQASRPR
Sbjct: 1  METVWDSSEQSSIGRLLSLSSALVKNDLRDLQNLSSYGEASFYPFEAFVSRTSKQASRPR 60

Query: 61 KKKTQWTNFARISTFTHSNNLGFCN 85
          KKKTQWTNFARISTFTHSNNLGFCN
Sbjct: 61 KKKTQWTNFARISTFTHSNNLGFCN 85

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Csor.00g076270 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g076270 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6608046.13.87e-53100.00hypothetical protein SDJN03_01388, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
BLAST of Csor.00g076270 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Csor.00g076270 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Csor.00g076270.m01Csor.00g076270.m01mRNA