CsaV3_3G020350 (gene) Cucumber (Chinese Long) v3
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Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTTGTTGTTCAGGCTACCAAGCTCAGCCTTCCCAACCCTTCTCTCTCTTCCCCACAAATTTCTTCCCTTCTCTTTGAACCTCATTCTCTTTCTCTTGCTCTAATGCACTCAGATTCTTCTTTCTCCCTCTACCCTTCTTTTTCCCCTCTCTCACTTTCCTCTCTTCCTTCCCCTCAAGTGGTTGTGCCTTCTCCGTGTTCTTCTGCGGCTTTTGTTGCCCTTCAGAATTCTAATTCCAACTCCGATACTAAGGTTCTGTTTGTGGTCTCTGGCCCCCACAAGGGTGGCTCTCAGATTCTCCTTCGGTTTTATGTTTTGGAGGGTTCTAAATTGTTCAGGAGAGCTCCAGTTGTTTGCACGCAGAAGGATCTTCGATCTGATGATAAATTGGGTGTTTGGGTCAATTTTAGACATGGGATTTCGGTTCGTTTAGCTGGGTCAGTCAATTTCTTCGCCATGTACTCTGTTTCGAGCATGAAGATTTGGGTTTTTGCGGTGAAGATGGTGGGAGACGGCGATGATGGGATAGGTTTGAAATTGATGAGATGTGCTGTGATTGATTGCTGCAAACCCATTTGGTCGCTTAACATTTCGTTTGGGTTTTTGCTTTTGGGGGAAGATAATGGGATTAGGGTTGTTAATTTGAGACCCTTTGTGAGAGGGCGTGGTCGAAAAGTTAGGAATCTGAATGCAAATACCTCTTCTAATGCCAAGCGTGAAGTTCAGAAGTCATTTTTGCCTCATGTAGATGTTTGTGGAACTTCTGGTGGCAATGACTTGAACGGTGGTTCTTTAGTTGTTAGCAGCAATGGATTCAATTTACAAGCCAGTAGAAGTGAAGATGCTGGAAGTTTATCTTGCAATGGATGCTTGGACGGGAAGTTGGACAAAATTTCTAGTTCTGGTAAGTTAAGAGAGTTTTATTACTTTAGTTTATTTGATTTATCTTTTTAGTTTTCACAGTAAGAGGGATACATTTAAATGTATATTATGCGTACATTTTATTTATATTGGTTGTGTCTCCTGTAATTTGGAACTTTTGATCATAATTTTAATCCTGGGGGCCTTCTTTTAATTGCCCAAGATAGGTGTGAGCATAATTATAATACCATGCGTTTGCTGAAGTTTGAGGCGGCATGTTAAAAATTTCAAGAGTTTGGAGCAATCTTTATTCAAAGTGTATGTGATGTAGCATTATAGCTATGTAGTTTTTGGTCAATGTTGGGGTCTGTTATGAATTTGTTAACTTGTCTTCTTTAATTCTGTTTTATAGAGCATTTTATTTAGAGCTGGCTGGTTAGTTAGTCATTACCCTTGACTGCTTTGGTTAGGATTTTAGGGAATTAGTTATTCCCCGTCAGAACCTTTAAATAGCTGCCATTAGGTTGCTAAAAAGGATCATTCAATAAAGAAGATGTTGGAGTACTCAATTGTCATTTGTATGCAACTGTATGCAACTGTATGCTATCAAGAATTATAATTTATAGGAGTGTTCAAGAAAGTTTGTTTTACTATAGATGGAGATGAGAGAAATCTATGCTGTTGTTTTTTAAGGAACTGGACGGACTCAAGAAGATTCTTTCTCAGACCAAAGCAGATTCTACATTTGTGGCCAGGCAAATTCTTGATGGATTGCTCATTGCTAATGAGCTCGAAGGATAAAGAAGGATGTGATTGTAAACTTGACATCAAGAAAGCATTTGACAAAGTTGTCTGAGACTTTTTTTTGTGAAATTCTTGCAGCAAAAAGTTTTGGGCTTAGATGGAGAACATGTATCTGCATTTGCATTTCTCTCCAAATTTCTCGATCCACCGAAGAGGAAAGATTTTGACTTTTAGAGGCCTTCACCATGGGGGACCCCCTCTCACCTTTTCTTTTCATCTTGATTGTGGATTGCCTTAGTATATTGTCCCATGGTTCTAGTATGCATGTTTATTCATGTTTTTGATTTGGGAAATGGTTTCTTGACTATTCATTACCTACGGTTTGCCAACGATATCTATTATGGAAAAACAAAACAGTTTGCTAATGATACTATCCTTTTATTCACGGTTGACAATCATGCTATTAATAACGTTTTCAATTTGGTGAGACTTTTTGAAGAAGCATCTGGACTCAACATTAACCAACCATCACAAAATAAGAATTTTTAGGGCTTCACATGGACTACTTGGATATTGAATTTTGGATTGGAAAACTTGGTTGCAAAGTTGGATGGTGGCCTAGTTATTGTTGTGCCTTTCCTCCCAAGGGTAAGCCTAGGAAGCCAAACTCTTGTAAGAAATAGTTCACTTGGATCTTGCAAACTGATCCCTAGAGAATGTAATCCAGGTCTTCTTTCGCCTTCCAATCGAGAATACAACAAAAAAAAGCCCCATGATCGAAGAGTTCCTCCTTAAAAGTCTATCGGCAATGTTCACATGACCAAACAAAACTTGCTAGGCAAAGAACTTAACCTTCTTGGATATCTTGATCCTCCAAAGACCATAAAAAGTTGACTCTACCGAGAGAGGGATTCAACAACTGAAAAAATGATTTACAAGAAAAACCCTCGAGAAGATTAGGACTCCAATGGAAAACCCTTGAGAAGATTAGGACTCCAACCGAGAACATCCTTTCTTCCCAACCTAAATTGAACTCATCAAGCAAGATCAATATAGAGGCAACCTCTGTCATTTCCCTATTGAATAAAGGACGACAAAAACCAAAGGAGAAGGATCTAGGAAGAAGATTCAATCCCTAACCCACTTCCCTATTTGTCAAAGGTTTTTGAAACCCTAAGGGTGTGTTTGGCCCAAGGAGTTGTGAAGTAGGAATTGTGAACTTGATTCCTTGTTTGGTCCAAGGAGTTGGTGGGTCCCACTAGTAAAAAACATCAATTTTTTATCTCATCAAGGATAATCCTTGCACCATGGGCTCCAAGAGTTCACAACTCCCTAGTTTTCATATCTCCTTACTCTTCACTATTCCATTTCTTACCTCAAACACCACTCAAGAGATCAAGGAAGAAGGATACAAGAAGGTAATACTGGTTTATAGAAAAGTTTGGGACCTTGCTTTATAGATTCCTTTAAATGTTCCAACAATAGATCAACCAAGTTCACATCATGGGTGTCCACCAAATATAAGAAATAGTCCTTGTCTCCTCTAGCCTGTACCTTGGTGGCTTAATCATCTAGAGTTGCTTTTATACCTTTCTTTCAATATTATTGTTTATGAGGAAACAAAGCTTTTATGGAGAGAAATAAAAGTGTTGGAAATAAGAGGCTAGTTGTGTGTTTATATCCTCAAGGGTATTTTTTAATTTATTGTACCCTAGTTTTATTTCCTTGTTTGCTGGGGCTTATTGTAGCCTATTTATATTCTTCCCCCTTGTATTTATTTGATTATTAGAAAATCATAAGAGCGCTTCTATCGTAGTTTTTTCTCCCTGTACTAAAGTTTTCCACGTATACCTTGTGTTGCTTTCTTGTTCTTTTTCAATATACAAGAATATATAAAAAAATAACTGCAAAATAGAAGGAGCCTGACAAACTAGTGAACGGGCCTCCAATCCAAAAGAATGAAACTCAGTTGATAACAACCAAAATCCTTGGTCACAAAAGTTCAAACTGGGACATTAAGGATTCGCTTGGTAATGTTTCCTGTTTCTTGTTCCTTGTTCTTTGTTCCTTCTTTTTTAGAAGAAGAAACATGAATGTGTTTGATAACTGTTTCTTCTTCTTGTTTCTTGAAAAACAAAGAAAAAGAAATAGAAAATGTGTTTGATATCTGTTTCTTGTAGTTTCCTTATTTTCTTCGAGATTTTTTTTTTATTTTATTCCTGTTATTTTATTCACATTTAATTCAATTAAACATTGCACTACTCACTTTATCAAACATAGATTGGAAGGTCTTCTAGTATGGAGATCAAGATGAAGATTGAGATCTGAAGGACAGAGCCAGCGAGAGGAAGACGAAAACCCACGATAAAGAGGAGGATTGAAATCCACGTCGAAGAGCTACAAAGACCCACGACGAAAACACAGATCTGGAGAAAACCCACAGCACAAACCCAGATCAGCACGAAAAGGAAGAGGAAAATCCAAATCCGACGAAGAGGAAGACGATGAGAGGCGAGGAGGAAGATCGTGAAGACAGTGAGAGGAAGAGGAAAACAATGGTTATTTGGGGAAGACGATGGAGATAAATAAGAAGAAGAAAAAGAAAACCACGTGGAGAGTGGTTATTTGGGGACGAAGATGGAAATAAGAGAAAGAAAAAGGAAATCACGTACGAAAATGGAAAAGGAAAAGGAAATAGAAAAATAATTAAGAAAAAAGGAAAATGAAACCAATAAAAATAATTGAGAAAAAGGAAAAGGAAACTAATAAAAATAATTGAGAAAAAGGAAAAGGAAACCGATAAAAATAATTGAGAAAAAATGAAAGTAAACCAATAGAAATAATTGAGAAAAAGGAAAAGAAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAATCAATAAAAAAATTGAGAAACGGAACAGGAGAAACTACTTGTTTTTTGTTTCCAATAACTCCTTATAAAATGGGAAACGTTTCTATTTTTTTTTAGAACGAGAAACAGGGAACATTACCAAACATCTCTGTTTCTTAAAAAATGAAAACAGAAACAGGAAACAGGGAACAAGAATGTTACCACACGGGCCCTAAACCTCATTAACTCCAACAACTCCTCAGACCTGTCAACTTCACTAAAAACTTTACCATTCCTCTCTGCCAAATCTCCCATACAATAATAATAATAAAAAAAGAGCCTCCTAAAGGTTTTTTTCCTTCTCCATGGGAAGATTCAACAAAACCTCCTCCACTCAAACACACTCCTACAGTCCTTGTTCCGTGCCAATGGGACACTGGAGCAAAAACATCCAAGAATCTGCACCAAGTTAATTGAGTGAAGTGGCTTTCCCTAAGATGTGGCCTATGCCCTCATGTGCTTCTATGCAGAGAGAACACCAATGAA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ATGGTTGTTGTTCAGGCTACCAAGCTCAGCCTTCCCAACCCTTCTCTCTCTTCCCCACAAATTTCTTCCCTTCTCTTTGAACCTCATTCTCTTTCTCTTGCTCTAATGCACTCAGATTCTTCTTTCTCCCTCTACCCTTCTTTTTCCCCTCTCTCACTTTCCTCTCTTCCTTCCCCTCAAGTGGTTGTGCCTTCTCCGTGTTCTTCTGCGGCTTTTGTTGCCCTTCAGAATTCTAATTCCAACTCCGATACTAAGGTTCTGTTTGTGGTCTCTGGCCCCCACAAGGGTGGCTCTCAGATTCTCCTTCGGTTTTATGTTTTGGAGGGTTCTAAATTGTTCAGGAGAGCTCCAGTTGTTTGCACGCAGAAGGATCTTCGATCTGATGATAAATTGGGTGTTTGGGTCAATTTTAGACATGGGATTTCGGTTCGTTTAGCTGGGTCAGTCAATTTCTTCGCCATGTACTCTGTTTCGAGCATGAAGATTTGGGTTTTTGCGGTGAAGATGGTGGGAGACGGCGATGATGGGATAGGTTTGAAATTGATGAGATGTGCTGTGATTGATTGCTGCAAACCCATTTGGTCGCTTAACATTTCGTTTGGGTTTTTGCTTTTGGGGGAAGATAATGGGATTAGGGTTGTTAATTTGAGACCCTTTGTGAGAGGGCGTGGTCGAAAAGTTAGGAATCTGAATGCAAATACCTCTTCTAATGCCAAGCGTGAAGTTCAGAAGTCATTTTTGCCTCATGTAGATGTTTGTGGAACTTCTGGTGGCAATGACTTGAACGGTGGTTCTTTAGTTGTTAGCAGCAATGGATTCAATTTACAAGCCAGTAGAAGTGAAGATGCTGGAAGTTTATCTTGCAATGGATGCTTGGACGGGAAGTTGGACAAAATTTCTAGTTCTGTTAGACCAAGATGCATAAAACTGAGGCAAGATTCGAGCGAAGGACTATATTTTGTGGCACTGAAGGGCAGAGGAAATGAAGGCCTGAAATCTGCAAAAATGATGTCATTAAAGGCAATATCAATTCAAGCACTGTCTCCCAAGAAAATATTGATCCTGGACTCTGTTGGTGATTTACATCTGTTGCACATTGCTAACACTGCTAATGGATTTGATTTTTCTTGCAACATTCGGCCATTACCTCATCTAATGAAAGCTCAAATGCTGACCAGTTTTCCTGATACAATCATAAGGAACCAAACTGTCTGGCTATCGGATGGGAATCATTCTGTGCATATAATGGTGATACCTGATGTTGATTCCGTTGTCCCTGAAAATATGGGAAATGAGAGCGAGGAAGTCCTGATGAAAAGAATATCAGTTATGCAAGCTATATTTGCCGGTGAAAAGATTCAAGACATAACATCCTTGGCTGCAAATGCTGTTTTAATTCTTGGACAAGGAAGCTTATATGCGTATACAATTTCCTGA MVVVQATKLSLPNPSLSSPQISSLLFEPHSLSLALMHSDSSFSLYPSFSPLSLSSLPSPQVVVPSPCSSAAFVALQNSNSNSDTKVLFVVSGPHKGGSQILLRFYVLEGSKLFRRAPVVCTQKDLRSDDKLGVWVNFRHGISVRLAGSVNFFAMYSVSSMKIWVFAVKMVGDGDDGIGLKLMRCAVIDCCKPIWSLNISFGFLLLGEDNGIRVVNLRPFVRGRGRKVRNLNANTSSNAKREVQKSFLPHVDVCGTSGGNDLNGGSLVVSSNGFNLQASRSEDAGSLSCNGCLDGKLDKISSSVRPRCIKLRQDSSEGLYFVALKGRGNEGLKSAKMMSLKAISIQALSPKKILILDSVGDLHLLHIANTANGFDFSCNIRPLPHLMKAQMLTSFPDTIIRNQTVWLSDGNHSVHIMVIPDVDSVVPENMGNESEEVLMKRISVMQAIFAGEKIQDITSLAANAVLILGQGSLYAYTIS* Homology
BLAST of CsaV3_3G020350 vs. NCBI nr
Match: XP_011651361.1 (uncharacterized protein LOC101211683 isoform X2 [Cucumis sativus] >KAE8650568.1 hypothetical protein Csa_011041 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 928.3 bits (2398), Expect = 2.6e-266 Identity = 478/478 (100.00%), Postives = 478/478 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020350 vs. NCBI nr
Match: XP_031739256.1 (uncharacterized protein LOC101211683 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031739257.1 uncharacterized protein LOC101211683 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 911.0 bits (2353), Expect = 4.4e-261 Identity = 469/469 (100.00%), Postives = 469/469 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020350 vs. NCBI nr
Match: XP_008461569.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103500140 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 870.5 bits (2248), Expect = 6.5e-249 Identity = 450/470 (95.74%), Postives = 455/470 (96.81%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020350 vs. NCBI nr
Match: XP_038891880.1 (uncharacterized protein LOC120081240 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038891885.1 uncharacterized protein LOC120081240 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038891892.1 uncharacterized protein LOC120081240 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 857.4 bits (2214), Expect = 5.7e-245 Identity = 443/478 (92.68%), Postives = 458/478 (95.82%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020350 vs. NCBI nr
Match: XP_022143305.1 (uncharacterized protein LOC111013209 isoform X1 [Momordica charantia] >XP_022143306.1 uncharacterized protein LOC111013209 isoform X1 [Momordica charantia] >XP_022143307.1 uncharacterized protein LOC111013209 isoform X1 [Momordica charantia] >XP_022143308.1 uncharacterized protein LOC111013209 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 792.7 bits (2046), Expect = 1.7e-225 Identity = 419/482 (86.93%), Postives = 443/482 (91.91%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CGA6 (uncharacterized protein LOC103500140 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 870.5 bits (2248), Expect = 3.2e-249 Identity = 450/470 (95.74%), Postives = 455/470 (96.81%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CQE0 (uncharacterized protein LOC111013209 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013209 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 792.7 bits (2046), Expect = 8.4e-226 Identity = 419/482 (86.93%), Postives = 443/482 (91.91%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CES6 (uncharacterized protein LOC103500140 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 763.8 bits (1971), Expect = 4.2e-217 Identity = 406/470 (86.38%), Postives = 412/470 (87.66%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CF16 (uncharacterized protein LOC103500140 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 738.8 bits (1906), Expect = 1.4e-209 Identity = 381/400 (95.25%), Postives = 385/400 (96.25%), Query Frame = 0
BLAST of CsaV3_3G020350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GAY1 (uncharacterized protein LOC111452530 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452530 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 729.6 bits (1882), Expect = 8.7e-207 Identity = 391/482 (81.12%), Postives = 422/482 (87.55%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Chinese Long) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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