CsGy7G003850 (gene) Cucumber (Gy14) v2.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGGCTGTTAATTCCATTTCATTCTCTACACTAAACCAATGTTCCGATAGGAGATTGCTGCTTCCCTCCTCTCGTTCGCACTCCTCCAATTTCCACGGCTTTCCTTTTCGTACTAGCGTTTTCACTCATTATTCCCGAGTACGAGCATCCACCTTCAGTTCTCGCATGGTCATTCATTGCATGTCCGCCGGAACAGGTAGCTTCTACCTCTGGTTATTTATTTTCCTTACTTGCTTAATTTGACTATTCCGATTAAGTTAGTGAATCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATTGAATGTTATAATGAGTATTAGAAGTTTTAAGTAACTATTAAGCTTCCAATAGTTCAGTTGGATCAGTTCTGTACTTGTGTAGTTTGTTGAGAGATTTCTCTAGTTCGTTTTCTTACTACTATAGGTTAGAAACTGATGCGCTATTTTGACGGCTCAGATGTGACCACTGTGGCCGAGACAAAATTGAACTTCCTTAAGGCCTATAAACGGCCTATCCCTAGTATTTACAACACGGTTCTGCAAGAATTGATTGTTCAGCAGCATTTGATGAGGTATAAGAGGACATACCGTTATGATCCTGTTTTCGCTCTTGGATTTGTTACTGTATATGATCAGCTTATGGAAGGGTACCCTAGCGATGAGGATCGTGAAGCCATCTTCCAAGCGTATATTAAGGCTTTGAATGAGGATCCAGAGCAATATAGGTTTGGCCATGTATTCCCCTTTGCTTTTACCATCTCTAATCTCTATCAATTGTTGTCACTTGTCAGCTAGAAACTTCAGTTGCCTTATTGTTAAGTTTAAAAATCACCAACACGATTCCCTTTGGCTGTCTAAATGACTAAATTGGATTTGTATTGAATGTTAGTGCATGCTCGAAAAGTAGTATTAGAGACTTTTATTTGTACCTAGTAAACAAATTTACGAATGTTCATTTTTTATATTTCAAAAAGGGTTTTCTTTATTTTAAGTAATAACTTTTGTTATATCATCCAGAATTGATGCTAAAAAATTTGAAGAGTGGGCTCGATCTCAGACTGCAGCTTCATTGGTTGAGTTTGCATCAAGAGAAGGAGAAGTTGAGAGTATTTTGAAGGACATTGCAGAAAGAGCAGGGAGCAAGGGGAATTTCAGTTACAGCCGATTTTTTGCTATTGGACTATTTCGTCTCCTTGAATTGGCAAATGCTACTGAGCCCAGTATCTTGGAAAAGGTTTCTTTAATATTCCTTTCTGTGATATAGCTTTTAAGTAGTTGAGATTTTGATGACATTCTTATCGAGTTGATTATAGCTAAATTAAATGACAGCCAGCCTCTCTTGTAGGACTTTTATCAATAGATGTTATCTCTGAGTGCTGCCATTAATAAAGTATAATAGTGTTTCTGGTTCATTAGTTTTCTTTTTACTCGTTAGAGAAATTGGATCTTGATGGAATATTGCCTAACATACTGTTCGAGACGAGAGAATTAGGTTCAAAGGCTTCTTTTGTGCATAAGGCTGCATTTTATTTTCTGGCTAACTAGTCTTTTGGAACATTTGTCTTTCCCCTTTCCTCCCTTGCCGCTGACCCATCACACACACACATACTATTGTCGGATTTCCTTTCACCCTTGTGAAGGCCGATTCTATTTACTGTGTCTATCACTGAAGATAAGATACTTTTGATCTCTTAAAACAGCTCAAGCTATGTAGTCGAACAGTTTATAAAACAGCAGAAGTCATATGATAGAGAATTAACCGGGTATTGAGATCTAATTTCTTGGTACTTCTGAACAGCTCTGTGCCGCTTTAAATATCGACAAAAAAGGTGTAGACCGAGACCTTGATGTATACCGTAACCTGCTTTCAAAGTTGGTTCAGGCGAAAGAGCTCCTAAAGGAATATGTCGACAGGTAAGAGACTGTTAAGTTCATGGTTCTAGGCATGGTAGATTAATATGCTCTTTAAAGCCCTCATATTTTCAGACTTTATGAAAATCTACAATCGAATTGAAAACTGTCTCAATCTTGTATTTGTGAAATCTCCTGCAAGTCACTATCATAGCATTTATATTCATTGGATCTTATCTGAGGTCTATATGAGGTAGACAATTGGGTGGATGATGGTGGTTGTAGGAGTAAGATTTAAAGGATAGAAGTTATATGATTAACCAGCGGGTTTTGAATTGTGTAGAGAGAAGAAGAAAAGAGATGAGAGGGCTGGATCACAGACAGCTAATGAGGCCATAACTAAATGCTTGGGAGAATACAGCATGCAGACTGGTTTATAAAAGGTAATTGGAGTCGCTACATAATTTGAGATAGACTTGAGAGAGTTTATAGCAACATTATTCTAAATACTTGTTAGATATGCATCTATAATGTATTATGTTGGGTCTCATGCATTTGGTAAATTTTGTATTCAGCCACGGCTCTACCTTTATTTCTCATTTGATATAACCACCACTCAAGCTATTTTTTAATCATTTGTATTACATACTTTGAGTGCAACTGTCAATACAAAATGCTTTCGCACTCTGTGCAGTAATCACTCCTCCAGGGATATTTGACCATCTGCCTTTTGTATTGTTATCCTTTCTGTATTATTCTGATATTTGGCTATTTGCTTTTGTATGATCTAAATTGTTTCAATTATAAACGTTTTACGATTTTAATTGATATAGTTAATAGTTTGGAGTTTTAACCCTAATTTAGAACCATCCTTTTGAAAATATGACCTTACTGGAACAGATCTGTTTTACAGGTGTGCTATTTCAATTGTGTAGACTTGTGAAGCTCAATACTAAAATTTATACTCTCCCGAAAAATTTTATGTTCTAATTCAGTTACCTAGTATACGTTAAAAAAAAAAAAGGATTAATATTCTCTCAAGAGTGCTCTAGGACTCCATATTTGAGAGGAATGCCCACTATGATAAGGCTGTGACTGAGGCCCAATAGAATGAGGCTATTGGTGAAGATCCAATGAGCCTATTGTGATAGACTTATGGATAGCGGTTATTGGGCCTGTTCTGGCAAGACCGGGGTCTATCCTATGGCTGTGACAATTTTCCCCAAAGTTAAATAGGTAAATTGCATTAATATATTACTTATTACTTTTAGGTATAATTATTATCTAACAACGTTTTGAAAACTTTTGTGAATGCAACAAAATCTATCTACTTTACCACTAATTGATTCGTTTGAGTGATAATCTATTGCATATTCTACCAACGACATAATGTATCACTTGTGTACTTCAATATTTGAATCAAAAAGCTTAATCTAAAATTTATTATATTAGCAAAATTTTTGTATTGAACAGATTATTGTAATGATATGAGTTTAAGAAGGGAATATGAATGACTGAGGTTGTATTGAATTGGAATCTTAAACTTGGGGTGTTATAGTTACTATATTTGTAACAACCCCAAATCTAATCAAATTTTGTATAAAAAAAATTTATACTTGGTTTTGCTTTTAGAATTGCACGTAAATTAAAAGTATAATCATTACCACTACCAAAAATTACAATTTTTTACAATAGTAACGATGAAATAAACAGCGTCTAAGTCTACAAGTATATGTTGTAGACGAATTATAAGTATATGTTGTATCTTTCATTTGAACATGAGAGTTTTTTCAAAATTAGACTTGAATTGATGGTTTAATAAAAAAAAATGGATGAAAATCATACCAACAACTCTCTTGATTAGAACACATGAAATCTAAATTAAAAACCATAAGGGTATTAATATGCCACATTTGGAAAGTTGAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTACATAGTTAGCCACAATATTTGAATAGAAGACACGTAATGATGTTGTATTGATACGTGTGAGTTCCCTAATGCATGAAAATATGAAAAGCCTCTCTTAGAAGACCACCAACCTCAACCCTAATTCCACTCCCACTTACGCAACCCATTCTCTACTCTGCTCTTCCTTTTTCACTCCCCTATTTTATTATAATTATTAACGATCTAATATATATTACAAGCCATTCAGAGATGTATTTTCCTTAATTATAAATACGTATGTTCAATACGAAAATTGTTTATATGACCAAGTAACCAATATTAGACATTCCAACTATATACATCATATAACTAATTAATCATATATGTTATAAACACAAATAAACATACACGAGGCTTCTAATTTAAACTGTATAATTCAAGTTATAACCTTTATGCTTAATACCATTTAGTTGTTGTTGATCTATGGATCACAGAACCATCTCGAAGTAATTATAAGATGATGATTACATTATAAAATGCAAAAAATCATATGAAGTTTCTAGATTTTGATAGAAAAAAAATGTTAGATAGTTTGTTGGGGGATTATGTTTATACATAATAACTAATATATAATTGAGAGTTTGTTAAAGGGGTTTGTATATACGTATCATTTTGTTTGAATAGACGTATATATTATTGTATTGTATTTGGTAGAAATGATAGCCATGTGGACAAACCCGAGACCAAACTGCATGGCTTTTATTTTAATATATTGAATAAAATGAATCTTTCCTTCACCAAAATTTTATTAAATAACAACCACTGTATCTATTTCTTTATATAAAATAACCTACCAAACTTGGAGACATCATATGTTAGAAAGATGACATATGCCCTACTTTGCATGTTAATATACATTCACTATTTAGTTCTTTAACTTTTATATGTTTTCCAACTGATCATTATTTAGTTCTTTAACTTTTATATGTTTTCCAACTCATTATTTTCAGTTAAGACACATTTTAGGTGGAAGAAGATGATATAATATCAAACTTATTTTTTATCCTCAATTTTGGGTGATTTAACATCTTATCATAGTAGAGGAGTCTAGGAGGTTCTATGTTTAAATTTACGTAATGTTATTTTTTTTGTATAATTAATACATCAACTTAAACTTTTGGGTTAGTTAGTGATTTAATATAGTTTTAAATTGCAATAATTTA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ATGGCGGCTGTTAATTCCATTTCATTCTCTACACTAAACCAATGTTCCGATAGGAGATTGCTGCTTCCCTCCTCTCGTTCGCACTCCTCCAATTTCCACGGCTTTCCTTTTCGTACTAGCGTTTTCACTCATTATTCCCGAGTACGAGCATCCACCTTCAGTTCTCGCATGGTCATTCATTGCATGTCCGCCGGAACAGATGTGACCACTGTGGCCGAGACAAAATTGAACTTCCTTAAGGCCTATAAACGGCCTATCCCTAGTATTTACAACACGGTTCTGCAAGAATTGATTGTTCAGCAGCATTTGATGAGGTATAAGAGGACATACCGTTATGATCCTGTTTTCGCTCTTGGATTTGTTACTGTATATGATCAGCTTATGGAAGGGTACCCTAGCGATGAGGATCGTGAAGCCATCTTCCAAGCGTATATTAAGGCTTTGAATGAGGATCCAGAGCAATATAGAATTGATGCTAAAAAATTTGAAGAGTGGGCTCGATCTCAGACTGCAGCTTCATTGGTTGAGTTTGCATCAAGAGAAGGAGAAGTTGAGAGTATTTTGAAGGACATTGCAGAAAGAGCAGGGAGCAAGGGGAATTTCAGTTACAGCCGATTTTTTGCTATTGGACTATTTCGTCTCCTTGAATTGGCAAATGCTACTGAGCCCAGTATCTTGGAAAAGCTCTGTGCCGCTTTAAATATCGACAAAAAAGGTGTAGACCGAGACCTTGATGTATACCGTAACCTGCTTTCAAAGTTGGTTCAGGCGAAAGAGCTCCTAAAGGAATATGTCGACAGAGAGAAGAAGAAAAGAGATGAGAGGGCTGGATCACAGACAGCTAATGAGGCCATAACTAAATGCTTGGGAGAATACAGCATGCAGACTGGAAGTGAGGTTACGTCCACGTTCCTAATGTTTATACAGAATGTAATAAGTCATAAAAAACAAATGGGGAGAGCTCCATGCTGTGACAAAAATGGGCTTAAAAAAGGTCCATGGACTCCTGAGGAAGATCAGAAGCTTGTTAATTATATTCAAATTCATGGCCCTGGGAATTGGCGTAATCTTCCTAAGAATGCTGGGCTTCAAAGATGTGGAAAAAGTTGTAGGCTTCGATGGACCAATTATTTGAGACCTGATATTAAGAGAGGCAGATTTTCTTTTGAAGAAGAAGAGACTATTATTCAATTGCACAGTGTTTTGGGAAACAAGTGGTCAGCAATAGCTGCTCGCTTACCTGGAAGAACAGATAACGAGATCAAGAATTATTGGAACACCCACATACGAAAAAGGCTCCTTCGAATGGGAATCGATCCGGTGACCCACGCACCTCGGATTGATCTTCTTGACCTATCGTCGATTCTCTCTGCCGCCATTCGAAGCCACTCACTCCTCAGCCTATCAACCTTATTGAACAACCACCAAACTACCGCAACCCTAAATCCTGAATCTCTTAGGCTAATTCCCACCCTTTTAGGCCTTAAACAACAAGATCCAAATGCCCATAATTTACTTCTCCAAGCTCAGGCTCAGGCTCAAATTCAAGCTCAAATGGATTCATTATCACAACTCTTACAACCCAACGATAATGTTAATAATACAAATTCTTCTTCAATAATGCCCATATCTTCTACCTTTGTTGACTGCCCAAATACTTCGCAAGAAAATCTTAATTTCTTACCTACACTTTTGAATTGTGGTGAGGATGTTTTGATGAACCAACCCAATTACATATACGGCGGCAATGGGTCGAATCCAACGGCTTCGGAAATTCTCGACATTTCAAATAACAATGCTCAAAATTTAGGGTTTGATTCTGTAAAATCAAGCCCTACGCCATTGAATTCTTCATCTACTTATTTAAACAACAGCAGCAGCAATGAGGATGAGAAAGATAGTTTTTGTAGTAACTTTTTGCAGTTTGAAATTCCTGAAGGTTTGGACTTTGCTGATTTTGTGTAA MAAVNSISFSTLNQCSDRRLLLPSSRSHSSNFHGFPFRTSVFTHYSRVRASTFSSRMVIHCMSAGTDVTTVAETKLNFLKAYKRPIPSIYNTVLQELIVQQHLMRYKRTYRYDPVFALGFVTVYDQLMEGYPSDEDREAIFQAYIKALNEDPEQYRIDAKKFEEWARSQTAASLVEFASREGEVESILKDIAERAGSKGNFSYSRFFAIGLFRLLELANATEPSILEKLCAALNIDKKGVDRDLDVYRNLLSKLVQAKELLKEYVDREKKKRDERAGSQTANEAITKCLGEYSMQTGSEVTSTFLMFIQNVISHKKQMGRAPCCDKNGLKKGPWTPEEDQKLVNYIQIHGPGNWRNLPKNAGLQRCGKSCRLRWTNYLRPDIKRGRFSFEEEETIIQLHSVLGNKWSAIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIRKRLLRMGIDPVTHAPRIDLLDLSSILSAAIRSHSLLSLSTLLNNHQTTATLNPESLRLIPTLLGLKQQDPNAHNLLLQAQAQAQIQAQMDSLSQLLQPNDNVNNTNSSSIMPISSTFVDCPNTSQENLNFLPTLLNCGEDVLMNQPNYIYGGNGSNPTASEILDISNNNAQNLGFDSVKSSPTPLNSSSTYLNNSSSNEDEKDSFCSNFLQFEIPEGLDFADFV* Homology
BLAST of CsGy7G003850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XAB8 (Protein THYLAKOID FORMATION1, chloroplastic OS=Solanum tuberosum OX=4113 GN=THF1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 386.7 bits (992), Expect = 5.1e-106 Identity = 201/293 (68.60%), Postives = 243/293 (82.94%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SKT0 (Protein THYLAKOID FORMATION 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=THF1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 386.3 bits (991), Expect = 6.7e-106 Identity = 207/291 (71.13%), Postives = 247/291 (84.88%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84PB7 (Protein THYLAKOID FORMATION1, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=THF1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 361.3 bits (926), Expect = 2.3e-98 Identity = 195/288 (67.71%), Postives = 236/288 (81.94%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LDR8 (Transcription factor MYB102 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MYB102 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 313.2 bits (801), Expect = 7.2e-84 Identity = 183/354 (51.69%), Postives = 238/354 (67.23%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M0Y5 (Transcription factor MYB74 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MYB74 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 297.4 bits (760), Expect = 4.1e-79 Identity = 184/356 (51.69%), Postives = 229/356 (64.33%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. NCBI nr
Match: KAE8645760.1 (hypothetical protein Csa_020345 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1286 bits (3327), Expect = 0.0 Identity = 653/654 (99.85%), Postives = 654/654 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. NCBI nr
Match: XP_004137011.1 (transcription factor MYB41 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 677 bits (1746), Expect = 3.56e-240 Identity = 337/337 (100.00%), Postives = 337/337 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. NCBI nr
Match: XP_008455362.1 (PREDICTED: transcription factor MYB39 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 642 bits (1657), Expect = 1.18e-226 Identity = 320/337 (94.96%), Postives = 327/337 (97.03%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. NCBI nr
Match: XP_038888637.1 (transcription factor MYB41-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 587 bits (1513), Expect = 7.60e-205 Identity = 297/337 (88.13%), Postives = 314/337 (93.18%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. NCBI nr
Match: XP_004136805.1 (protein THYLAKOID FORMATION1, chloroplastic [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 576 bits (1484), Expect = 5.03e-201 Identity = 297/297 (100.00%), Postives = 297/297 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K293 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G046120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 677 bits (1746), Expect = 1.72e-240 Identity = 337/337 (100.00%), Postives = 337/337 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C0Q7 (transcription factor MYB39 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495548 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 642 bits (1657), Expect = 5.72e-227 Identity = 320/337 (94.96%), Postives = 327/337 (97.03%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K3P0 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G046130 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 576 bits (1484), Expect = 2.44e-201 Identity = 297/297 (100.00%), Postives = 297/297 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C7D3 (Protein THYLAKOID FORMATION1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold13G003760 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 552 bits (1422), Expect = 6.16e-192 Identity = 286/297 (96.30%), Postives = 290/297 (97.64%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C0V5 (protein THYLAKOID FORMATION1, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495547 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 552 bits (1422), Expect = 6.16e-192 Identity = 286/297 (96.30%), Postives = 290/297 (97.64%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. TAIR 10
Match: AT2G20890.1 (photosystem II reaction center PSB29 protein ) HSP 1 Score: 386.3 bits (991), Expect = 4.8e-107 Identity = 207/291 (71.13%), Postives = 247/291 (84.88%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. TAIR 10
Match: AT4G21440.1 (MYB-like 102 ) HSP 1 Score: 313.2 bits (801), Expect = 5.1e-85 Identity = 183/354 (51.69%), Postives = 238/354 (67.23%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. TAIR 10
Match: AT4G05100.1 (myb domain protein 74 ) HSP 1 Score: 297.4 bits (760), Expect = 2.9e-80 Identity = 184/356 (51.69%), Postives = 229/356 (64.33%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. TAIR 10
Match: AT4G28110.1 (myb domain protein 41 ) HSP 1 Score: 288.1 bits (736), Expect = 1.8e-77 Identity = 147/244 (60.25%), Postives = 176/244 (72.13%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy7G003850 vs. TAIR 10
Match: AT5G54230.1 (myb domain protein 49 ) HSP 1 Score: 258.5 bits (659), Expect = 1.5e-68 Identity = 154/327 (47.09%), Postives = 199/327 (60.86%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Gy14) v2.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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