CsGy2G006640 (gene) Cucumber (Gy14) v2.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGAGAAGAATCTGGTTTGCCAGCTCCAAGCGTTTCTCTTCCTCTGTCTGTCAAATCTCTTCCGTTTTGCTATCGGAATTTCAATAATTCTCATCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTATACAACACTTGCAATTTCAGTTTTCTTTGCACTATCTTCGAAACAAAGAACCATATTTGTCTCATCAAGATCTCCCTTGTTCTTCCTCTATCGAACCAACTCTCGATCAGATTGATAATTGTTCTTCAATTGCCATTTGCCCCACTCTCCAGGCCAGGCACAGGCACCTCACTGTTGTGAACAACAACTTCGAGTCAAATCATACTATAACCTTCGTTTCTAAGATGAGTTGGGTTTAGGATTCAGAATGATTACTGGGTTTCTTAATTCGGGGCTCCTCTGATTGTTCAGCCATGTGGTTTTCCTTTTGGAGATCCAGGGATCGATTCTCGTTAGAAGAACTCAGGTTTGGAACTGAATTTCAGATATTTTTGTTTGCTCTTACTATTTGTGGTATACTGGGGCACCATCAGTATGACTGTTAGCAACTCCGCATTGCAACAATTGCCCAATCGGAACATTTTCGTACAAATTGCTATTTCTTCAACCTTGCTGGGGTGAAAAGTGTGAAAAGTCTGTAATTTTGTTTCATTTTTGCTCTGTTGCCGCGGTACTTGCTTCAAGTTTCTAAGTGGCAAAAATTGGTTTCCATGTTGCATAATTTCGACGATCTTTATCTCTTATGATGTACTTGTGCATTCAAATTAAATCTAAGGAACTTGATTATATCTCGGCCTTTTGTTGTAAATTATTCTTATGCTTTATTCATGGAACGAATTGAGCTGTATATGACTCGGACTTTGCAGCTGCTTAGAGCGTTTGTTCTACTGTAAGACTGCAATGCCGATCATATGGATTAAATACGGAATATTTCTCTTTTCTTCGAAATTTCTTGGTGTATTCTTTGGACTCCCTTGCGTGAGTTTATCTTTTCTGCTAGTTTGAGAATTAAGATTCCAAGGAAAGTTAAGTTCTTTACTCTTGGTAAGTTCTACATGGAAGAGCTAACAATATAAAATGGATTGTGAAGAAAATGCCCGTGTTATTTTGTTCGTTTTATTGCATTCTCTGTTGAAAGAATACAATAGAAAGGCCCAAGACAATGTCTTCCTTACAACTTACAAGTCCATCCAAGGCACTAAAGCAACCATGAAGAACCTGCCAAGATAATGAGGGATTTTAGGACGGAGTTGAGGTGAGGAAAGGATAGCATTTGGTGTGTTAGGAAGGCATTGGACTTGGGTGTTTAGGTATTAGAAATGTGGGGGGTTGAGAAATAAGATCTCATGTCATCTTTGGTCTAGGTTTGGATATGATGAAAGTGCTAAGGAGGTGTCAACCTAGTTGAGATGTTCGGGTGCACTCGCTAATCCATAGGGCTTAGGTCTTGTCTCTTCATTGTAAATTTATCTTTGTATTGTCTATTCATTTTCTTAATGGCTTGTTTCCTTATCTATTTCTCAATAAGAAATAAGACCTTGTTGGCGAAATGGCTCTAGTGATTCTATCATGAAGCCAGCACCTTATGGCAAAAGGTTATTGGTAGTTAGTAAGTATGGGCCTCGCCTTGGGAATGGACTGATGGTCAGTCCTAGGCACCTCCTAGAATTCATGAAAAGATATCTTGTTTGAATTTCATTTGTTTTCATAGTTTGTTCATTTGGTGGTGGGAGATGGGAGATATACTTATTTTTTTGGAAGATAAGTTGTTGAGTGATAGACCCCTTTGATATCTGTTTCCCCATTGATTTTAGTTTTCCTCTCTTAGGCATTATTCTGTTGCGTCTATCCTTTCTCTGCTGACTCCCTTTTTGGGTTTCCATCGTCCATTAACCAATACTCATCTTTGGCGTACTTCTTCGAATCTTCAATGAAAGGCTTTTCTTGTAGCTTTTTCTTCCATTACTTGTCTTGTCCTTCTGGGAGAGCGAAGAAGTACAGTATGGATATATGACATGGAGATGGTGCACCCTGTTTTAAAAATCTAGGACATAGACACGACAAAGACATGTTTATTAAAATATACATTTTAAAATTTTTATATCATTTTTATACTAGAAGAAAATTCAAGGTAAATGGTTTAATTCAGATGCTTGAAAAATTAGTTTGATGAATTGCACACCCAAAATTCATTATTATTGTAGTCTTTTTAGTTTGTGTAACGAGTGTCTTGTGCATGTCTAACACATTTTTTGCACTAATAAGTGTCCTATACTCGTCTAACAAATGTTAGAGTGTTCTAAATGTTCTACACGTATTGGACATGCATCTTAAATCACCAATCTGCTTAGAATCTTAAGCTTGTGGGTGAAGGTAAATTTAATTATATATCACTATCACTAACACGCCTCCTCACATGTGGGCTCAAAATATAACAAAGGCCCAACAAGTGGAAATGAACATTAATTGGAGAGGAAACAACAATGCAGAGGTTTGAGAACAAGACCTCCTTTGATACCATCTTAAACCACCAATCTACCCCAATGCTTAAGCTTGTGGGGAAGGTAAATTTAATTATATATCACTAACAATGCACAAGCTAGCCAAATTAAACTGCCTGTGCTTCTTAGCTGGCAAGTAATTATGTTTTTTCTTCTGAGTAGAGGGTGAAAATTTTCAAAACGGTTAAGTTCGTTTATGTGGTAGATATTGGTCGGAATGTTTATGTCTTATATAGGCTATCAGCCAGAGAGTCTTTTTTGGTTGGGCTGCATTGTTGTATTCTTTGCAGGAGGCAACTGAGAACCTCAACCCTAACTTTTTGGGTTCTGAGTTTGTCCAGTAGTTTGGTATGGTCTCCTTAAGGATTTTGGCTTTATATATATATGTCTTCTATATTTTTATTGGCCTTGCTTAAGGATTTTGACTTTAGCTTCACCTGTCCTCAGGGCTAGAGGGAAATAATTGAGGAGTTCCTTCTCCATCCACCCTTCAAAGAACAAAAGAAAGGGGCTATTCTTTGGCAACAGGGGTGTGTGCTTTATAGTGGGGTTTGTAGTGCGAGAGAAATAATAGAATCTTCAAGAGGAAAGTAGGTTGTTTGGGACTTTGTTAAATTCTCAGTTTTTCTTTGGGCCTCAAGGAACGAGATTATTCTTTGATACTGCTATGGAAATGAAATAGATAGAGGGGATAGAGTGTTGTGATGCTGACCTGGGTATAGTTTGAGATTTTCACAATTAAGTTTTCCACTCATGAACTTAAACGAAAGTTCCTAGATTGAATAAATGAAATTCAAACATGAATTAGAGTTTTCTCAATGTAAGGCAAATGTATCCAAGATCTTAGTTACAAGCTTCTAAGAAGTCTAAAATACAATTCCAGACTACTAACTTTACCTTTTGGACTTCCCAGATTGCCAACTTATACAGTTAGAAAGATGGAAAAAATGAAAAGAAAAAAGAAACTTGAGGTTCTGGTGAACTTTCAGATATATCGTAATGTTTAGATTCATAATTTTTACTTCAGTAGGGACAAAATATTCCAAAGCTCCTATTTATACATGTCCGAATCATTTAAAATTCTTCACATGTACGGTAAAACATAACGATGATAATTCCTTTCACATGGAATGATGTTAAAAATATTTTACGTTAAACATTGCTTATTTAGGACGCGATAGACTTGCATCCTTATTTCTTGATTCTGTGTCTTAATTTTGTTAAATTTACTGGGATACAGGTATTTAACAGATCAGCTGCAAAAGATTCACATAGTCAATGAGGTTAACAAGGTGAAAGATGCTTCATGATTTTTTCCTTCCAGTGCTATTGTGTTAAATTACAATTTTCATGGATATGTAATGGAACTAATTAATTATAACCTTGGATGAAGGATTTTGTTATTGAGGCGCTGCGATCAATATCGGAGTTGATAACTTACGGTGACCAGCATGATGCTTCCTTCTTCGAGTGAGGCTTCTTCTTCTTCCTTCTCTTTTTTCCTTGGTAAATTTATGATGTTCCAGAAGTTTTGTGTACTTCTGGCTGTGTTTAGGTTTTTCATGGAGAAGCAAATCATGGGAGAATTTGTACGTATTTTGAAGATTAGCAGGACTGCAACTGTTTCACTTCAGTTGTTGCAGACAATGAGCATTATTATTCAGAACCTTAAAAGTGAACATGCTATATGTAATTTCCTGAATATAACTTCATAAGTGAATTCAATCTTGCTACTGCTGTATATTGAATTGACCATTTTGGGTCTGTTGCAGATTACCTATTCAGTACTGAACATATGAACAAGCTAATAACATATGCATTTGATTTCCGGAATGATGAGTTGTTGTCTTACTATATATCTTTCTTAAGGTTTGTTTTGCTTTTACTTTCAACAAAGTAATTTCTTTTCATACATTTTTTGCGGTATTATCTGCTATGATATTTCTATCATCTGACAACTATGAATATGTTCTCATGGTCTTTATAAGAGCAATTAGTGGAAAGCTGAACAAGAACACAATCTCTCTTCTTGTGAAAACTCAAAATGTAAGTCCTACTTGTTATAAATTTATGTGTTCAATCTTTTCTTAAAAGTATTATTCTTTTCACTTTCAATATATATCTGATGATCCAAATCTTAGGAAAAAAATGGTTTGCAAATTGCAATTGCATATGATCTCAGGGAGATGTTAAAAGTGCTGTAAATCTAGTTATGGATGTATTTGTACATTGACCAATGTGCATGGGTCCTCAGAAGGAGTATATCAATGGATATTCTAGGAACAATCGTGACAATGCTGAAAAATTGGATTAATAAAACTTCATCAAACAACTACCAAACTCCTGGGGAATAATCTTGGAAAAGATTGATCTATATCTATAGGCTAAGATGAAAAATTGGATTAATAAAACTTTATCAAACAACTACCAAACTCCTGGGGAATAATCTTGGAAAAGATTGATCTATATCTATAGGCTAAGAAGGTGGTTATATGGA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ATGTGGTTTTCCTTTTGGAGATCCAGGGATCGATTCTCGTTAGAAGAACTCAGGTATTTAACAGATCAGCTGCAAAAGATTCACATAGTCAATGAGGTTAACAAGGATTTTGTTATTGAGGCGCTGCGATCAATATCGGAGTTGATAACTTACGGTGACCAGCATGATGCTTCCTTCTTCGAGTTTTTCATGGAGAAGCAAATCATGGGAGAATTTGTACGTATTTTGAAGATTAGCAGGACTGCAACTGTTTCACTTCAGTTGTTGCAGACAATGAGCATTATTATTCAGAACCTTAAAAGTGAACATGCTATATATTACCTATTCAGTACTGAACATATGAACAAGCTAATAACATATGCATTTGATTTCCGGAATGATGAGTTGTTGTCTTACTATATATCTTTCTTAAGAGCAATTAGTGGAAAGCTGAACAAGAACACAATCTCTCTTCTTGTGAAAACTCAAAATGATAAAGTAGTATCCTTTCCAATGTATGTAGAGGCTATACAATTTGCTTTTCATGAAGAAAATATGATCCGCACAGCAGTTCGTGCTTTGACACTTAATGTATACCATGTTGGAGATGATTATGTCAATAGATTCATCACCAGCCCTCCTCATGCAGAATATTTCTCAAATTTAGTGACCTTTTTCAGAAAGCAATGCATTGACTTGAATGAGTTGGTCAATGAGACAATGAGAAGCACCGAGCCTTCAACCTCTACAATTCTTGCTGCTGTAGATGAAATTGAAGACAACCTATACTATATTAGTGATGTTATTTCTGCTGGGATTCCTGACGTGGGAAGGTTAATAACTGACAACATTTTGCGGCACTTGATCTTTCCTTTGCTTCTTCCATCTTTGAGGATAGAGGTTGTTAATGGATTTCAAATTGGAGCTGCCACTTCTCTGTATTTACTTTGTTGCATTTTGCGCATAGTTAAAATAAAAGATCTCGCAAACACCATCTCTGCTGCCTTTTTCTGTCCATTGGACGCTTTCTCCCCACAGCCTGAAGAAAGAGTTAATGGAAATATGACTCGGTTAAATTGTGAAAGTAGAAGCCAGTCATCAGGAAGTGATGGCATAGTAAGGCAGCCGCTGGATGCTGAATCTTTAAGACAAGAAGTATCGGATCCATCTACTCCTAAAACTGAGTTAGAAGATGCGACTGTGAAGAATGGTTTTCCAGGCTCCCGATTGGAATTGAGGGGAGCTTTGCTGTCTCATATTACAACTGGGGACGATATACAAGTCTTAGGTGCTTTAAGTGTTCTGGCTACACTTTTGCAAACTAAAGGTCAGATCAGTGGATCTATTCAACTTCCTTCAGTCCATTTTTCTCTTCTTATCACGCCTCCCAACTTTTCTGTAGAACTGGATGAGTCAATGCTGGATGCGCTTGGAATTCTTCCACAAAGAAAACAACATAAAAAGTTGTTATTGGAAGCCTTAGTTGGTGAAGATTCTGGCGAAGAGCAACTCTTTTCTTCAGATAGTACCTCAGTGAAGGGGGGCATTGATATTGAACTTGATGGTTACCTGCAGAAGCTTAAGGATTATGGGATTTCATATTTTCTTAAAGCAGGTGCAAGCCCTCGTGCCCATAGGTTTGAGGTACTAGATGCATTGGTCAGTCTCTTTTGTCGTTCAAATATATCTGCAGAGATTTTGTGGGATGGTGGGTGGCTTCTGCGGCAGTTGTTACCTTATAGTGAGGCAGAGTTCAACAGTCATCATCTAAAATTGCTGAAAGATTCATATAAGTACTGGGCTACTGAGCTCTTACAGGAGGCTAGAGGGATTTGGTCTGATTTCCTCATAATACTTCTTTCCGATGAGTGGAAAAAGTGCAAAAGAGCAATTGAAGCCCCATCACCAAGGAAAGAACCGAAGTCCATGCTCTTGCACTCTGCAAAGGCTTCTGTCGTTGATGCTGTTCCACCTGAATCATCATTCGCTGCTGGTCAAAAAATGTCTGAGTTGGTAAAGGTATTTGTTCTTCTACACCAACTTCAGTCATTTTCCCTTGGCAAGGCTCTGTCAGAACAACCCTGTATCGACCCTCCGTCAGAAATTTCCGATTGCTCTCGTGCAAAGGTTGCTGGACTAGATGCTTCAGGACCTAAGCCGGGTGCTGAGTTGAGACTTGATGGTGCTGTGCCTTGTAGAATTGCCTTTGAGAGGGGCAAAGAACGCCACTTTTACTTCCTTGGAACTGCTATTGGAACTTGCGGATGGATAATTCTTGCTGAAGAGCAGCCATCAAAACTGAATTGTGGAATTATTCGAGTTGCTGCACCACTTGCTGGATCTAATCCTAGAATTGATGAAAAACATTCAAGATGGCTGCACTTGAGGATTCGTCCATCAACTTTACCTTTTTTAGATCCTACCAAACATGGTACCCCATTAAAGTTAAAGGCAAAGCCTTTTGTGGATGGGAGATGGATCCTAGCATTCCAGGACGACGACACTTGCAAATCCGCATTTTCTATGGTTCTAGAGGAGATTAATCTGCAAAGCAAGGAGGTCGAGAGAAGACTTAAACCACTGGTCGGTCTCGAAAGAGCTGTAGATTCTTCAGATGCATTTTTATGTTCTACCAAGTCATTAACTTCCAATACAGCTCCTAATCTAATGTGA 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BLAST of CsGy2G006640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W4P9 (Protein TRANSPARENT TESTA 9 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TT9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 998.0 bits (2579), Expect = 6.6e-290 Identity = 537/865 (62.08%), Postives = 638/865 (73.76%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54GS1 (Protein CLEC16A homolog OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=DDB_G0289943 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 238.4 bits (607), Expect = 3.0e-61 Identity = 122/327 (37.31%), Postives = 211/327 (64.53%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9VEV4 (Protein CLEC16A homolog OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=ema PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 203.4 bits (516), Expect = 1.1e-50 Identity = 111/286 (38.81%), Postives = 181/286 (63.29%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2KHT3 (Protein CLEC16A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLEC16A PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 195.3 bits (495), Expect = 3.0e-48 Identity = 117/323 (36.22%), Postives = 188/323 (58.20%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q80U30 (Protein CLEC16A OS=Mus musculus OX=10090 GN=Clec16a PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 193.4 bits (490), Expect = 1.1e-47 Identity = 117/323 (36.22%), Postives = 186/323 (57.59%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. NCBI nr
Match: XP_008451037.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492441 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1672 bits (4331), Expect = 0.0 Identity = 850/883 (96.26%), Postives = 864/883 (97.85%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. NCBI nr
Match: XP_004149506.1 (protein TRANSPARENT TESTA 9 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1672 bits (4330), Expect = 0.0 Identity = 858/883 (97.17%), Postives = 858/883 (97.17%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. NCBI nr
Match: XP_008451046.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492441 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1666 bits (4314), Expect = 0.0 Identity = 849/883 (96.15%), Postives = 863/883 (97.73%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. NCBI nr
Match: XP_008451054.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492441 isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1662 bits (4304), Expect = 0.0 Identity = 847/883 (95.92%), Postives = 861/883 (97.51%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. NCBI nr
Match: KAE8651683.1 (hypothetical protein Csa_021300 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1662 bits (4303), Expect = 0.0 Identity = 855/883 (96.83%), Postives = 855/883 (96.83%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BRC0 (uncharacterized protein LOC103492441 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492441 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1672 bits (4331), Expect = 0.0 Identity = 850/883 (96.26%), Postives = 864/883 (97.85%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LKC6 (FPL domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G061590 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1672 bits (4330), Expect = 0.0 Identity = 858/883 (97.17%), Postives = 858/883 (97.17%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BQN8 (uncharacterized protein LOC103492441 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492441 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1666 bits (4314), Expect = 0.0 Identity = 849/883 (96.15%), Postives = 863/883 (97.73%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BRQ5 (uncharacterized protein LOC103492441 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492441 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1662 bits (4304), Expect = 0.0 Identity = 847/883 (95.92%), Postives = 861/883 (97.51%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BQN1 (uncharacterized protein LOC103492441 isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492441 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1618 bits (4189), Expect = 0.0 Identity = 829/883 (93.88%), Postives = 841/883 (95.24%), Query Frame = 0
BLAST of CsGy2G006640 vs. TAIR 10
Match: AT3G28430.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 17 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function FPL (InterPro:IPR019155); Has 243 Blast hits to 233 proteins in 101 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 110; Fungi - 0; Plants - 53; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 80 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 998.0 bits (2579), Expect = 4.7e-291 Identity = 537/865 (62.08%), Postives = 638/865 (73.76%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (Gy14) v2.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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