Cp4.1LG20g03580 (gene) Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1

Overview
NameCp4.1LG20g03580
Typegene
OrganismCucurbita pepo (Cucurbita pepo (MU‐CU‐16) v4.1)
DescriptionUnknown protein
LocationCp4.1LG20: 2056688 .. 2060429 (+)
RNA-Seq ExpressionCp4.1LG20g03580
SyntenyCp4.1LG20g03580
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGCTAAGTGTTGTGCTTGTTGTAAGCTTTGTGTTGGCGAAGGGGAATGTATGAATGTATGGATGGATGTTGTATGTATATATGTATGTATGGATGGATGGTGGAGAGATGGTGTATGGTGTATGATGATGCATTGACCATATTGATGCTGGTTATTCAGGATCCATGGCAATGTGCTTGAATTATCTTCTTGTAGTAATAAAAGCTGCTCAATTGTTAATTGTTCATCTTGATTTAACCAAGAACTCGGTCAATATATGAGTGGAGTGGAGGGGTTTTACAAAAACAAAACAAAGTGGTTACTTGGTCAATAGACGACCCCACGTTGAAGGACAAACAATTCAATGTGGTCTAGGTTTGGTAATACTTCTTACTCAAAGACCACCCTGCTCCGATCGTCAATCATATGGTTTGGTACTGCTCTTGTTCTTCTATGATACATAGTACCTCTACATCTCATTCATCCTATCTTCTTTTTGGAGATTGCTATGTTGTTTTTTACCAGCCTTTTTTGGACTATTCTTGTTATATGTGACTCTTCTTCCTGCCGTTGTAGCAAATACATTCAGATCTCTTGTACATAAGAACTCTTGTTGTCGTTCTTCTAAGCTTTTCAAGGTTGTGCAGATCCTTGGTAACTTCTTTCCTTTGTCACCATTTTTGTATCCACACTTGGTAGACATCTTATTGTTGTTTTGTAGAGTGTTTCTTCTTCATCATCATTTAATGTGGAGTCTTCCAGCCACTTCTTTGTTGGCTAACAAATTTTCTATCTCTACCAGTAATGGTTGAGTGGGTCATCCTTGTATATAGCAGTAATGGAACTTCTATATTCTGGTCGCAATCCATGGATAATGATCCTTTTCATTTGAGCTCCTCCAATGACAAACGTTGGATCTAATTCAGTAATCTCTCGACAGGTTGACTTGACCATATGAAAGTATTGAACAATCGTCATATCACATTGTGAGATTGACAACAGCTCGTCCTCCAGAAGTTGTAGCCTTGTATTGTTCTCTTTAAGAATAACATCAAGAACATGTCCCATGCTTCTTTTGGTATCTTGTCATTTCGAATGTGTTCTAACATCTCTTTTTCGATCGTGGTCTTCAAGGTAAACATTGTTTAGAAGAATAACATCAAGAACGTGTCCCATGCTTCTTTTGGTATCTTGTCATTTCGAATGTGTTCTAACATCTCTTTTTCGATTGTGGTCTTCAAGGTAAACATTGTTTGTCTACTTTAATTTTCCATTTGCGCAAGGCACCATTAAAATCCTCCTCTAACGGCGTAGTTTCACTCCCGTCAACGACCTCCCAAAAGTCATGTCCTTGTAAATAGGACATCATGCATGTTGCCCAAATGTTGTAATTCTTGTTATTAAGTTTATGAATTCCTCAAACGATTTGGAAATCACTTATCGTGTTAGTAATACCTTATTAATACCAAAGAAGCATGTTCGACACAAAACTTGCAAAGTCACGGACTACTCACAACACAAAGAAAATAATTCACTAATAATCTCAATAAATCGTTTCTGATATACAAGATCATACACAGCTACAACCACAGAAAGTACTAAGCATCTTAAGATATTAAACAACCTATATCAACCTCGCTCTGATACCAAATTATTGAACACAATCGACAACTTTTTGTTGGAACCAGTTTCAATAATTAAAATAATATCACGTAATTAATAACAAAATCATTTATCATGACGTGGCCTTGAGTTGAAGTTTAGAACATATTCAAGCAGGTAATTGGGCCGGCCCACTAATGACCCAAAACAACGCATACGATCTTTACCGAATTAGGTCAACACAGAAACCTAATTGGGGGCGATTCTGCCGCCTCGCTATCTGTATAAAAGCCGATGGCCACTTTGCTAATTTCATTATCCATCCTCTTCCGTCTCGGTTAGGGTTTCCTCGCTTCCTCGGAAACGAAGGTTCAGTTGGACATGGCGTCAATTATTTTTTAATTGATAAGTTCTTTAGGTGAATTAGCTGCTTCTTCTTCATTGTTTATGATCTTTAGCGTTCGATGCTTCATCATCTGGCGAATGTGGATTCAATCTGTTCCCATTTGACTCGTTCCCTTGAAGCAAGATTGAGTGTGTTACATCCTGGTTTCTTAAATTCTCTTGCGGTGTTTACCATTACTACATGAGAACGCGGGAGTAACTATATATTTTTTTTATTATTATTCTCTTGTTCATGAGTTTATTTTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTCTCTTGATCCTTGTTGGAACTTATTTTCTCTCGATAAATGATGATTCGGAGTGCTGTTCTAACGGTGATGAGTCTATCAGACCTGTTATGATTTGCGAATATGATCGCAATCCATAATGAACATCTAAGGGACTGAGTTACTTCGTTGTTCTCCGATTTGTTTTTTATAATGCTACGAAAATGACCACTAGTCTCTACTTTTCTATCACCATAGTTTCTTTCTAGATTAACGTAGTACGTACTAAATGAAATATCTTTGGCCTCACTTTTTTAAAACTGGAAATCTATCTAGCTTCCAATTCGATGAAGCAGGATCCATTTGTGAGGCCTAAAGCTATGTTCTCCTCGCTATCCAGAGTTTCACTTTACATGATTCATTTGGACGTCGGAGAACTACATTTATTTTTTCGTTTCAATATTTTTTATATGTTCTCATTAATTTAATCTTGTTACATTAACCTTTGAAATTCTCAGCTGTCAGTTCCTTCAGGTACTACGAGGCTCTGAGCTCTTCTTCCCTCATAGACGAAGTTGGCCATTTGTATAACTGGTTGCTTGGATTTCATTCACAGGATGGTAATTTGAGATCGTGTAATATTTTCTTCTTCCGATTATTTGGGTTTCAACAACTTTTCAACGCGGACATCGTTTCTCATCAAGGCCCATACCGTTTTTCTACGAATGTTGTAATCTGTTTCTGTAAATATTTGATCCATTTAATGACAACATTCTCGGTGTTGTGCAACGTTATTTATGTTTTTCTCTTCTCTTGTTTTTCTTAATTTACCATCATCGTACTAGTTCAGACCAACAAAGCATCTATATCGATACCGTTTATTCAAACGAAATAGACTTCTTTTTTTACGTGATAAATCTACCGTTCTTTTTCTGTATCATAGGCTTTCGAAACTTTTGTACGATATGATTCTACAGTCAGATTTTGTTGTTGTCGTTTAGTTGTAAGTTTCTTTTTGAAGATGTTATACTTGAATTCATCCTTAGATGTTAACTTAGAAGCACGATTTGAACTCGCTAAGAACATTAGACTCGGTTTATACTATCCTTGTACCATATCGAGATTAACAGAACTCGGTTTCGGTGGTACTCCATCGACACCGTCCTCAGAATCTTTCTCCGATCGGGCACGTTCGTTCACATGGAATATTTCTCGGCGACAATTCTCCCCTGTCGTCCTTCCAGTATCTTGTAAATCAATCGCCACTTCGCCGACGCCGTTCATCACGCGACGTCGATCTCCGTCGAGTTCTGATGACTGCATTGTTCCCGTAAATTTCATAGTTGCCATTGGCTGAATTGTCAAAAATCGATCACACATCTTCGCGGAACTCTGATGAGTCGCACTATATGTGCCTTGAGAGTGTCTATCGCTATGTCTCCCGAGGAACCGTTCGTTCCTCTTTACCCCAACTTCCGTCCTTTCGTTATCCGCCGGCCAAATTTCCGAATATTTCATCAACAAAACTTCAATAA

mRNA sequence

ATGCTAAGTAATTGGGCCGGCCCACTAATGACCCAAAACAACGCATACGATCTTTACCGAATTAGGTCAACACAGAAACCTAATTGGGGGCGATTCTGCCGCCTCGCTATCTGTATAAAAGCCGATGGCCACTTTGCTAATTTCATTATCCATCCTCTTCCGTCTCGGTTAGGGTTTCCTCGCTTCCTCGGAAACGAAGGTTCAGTTGGACATGGCCGTTCGATGCTTCATCATCTGGCGAATGTGGATTCAATCTGTTCCCATTTGACTCGTTCCCTTGAAGCAAGATTGAGTGTGTTACATCCTGGTTTCTTAAATTCTCTTGCGATGTTATACTTGAATTCATCCTTAGATGTTAACTTAGAAGCACGATTTGAACTCGCTAAGAACATTAGACTCGGTTTATACTATCCTTGTACCATATCGAGATTAACAGAACTCGGTTTCGGTGGTACTCCATCGACACCGTCCTCAGAATCTTTCTCCGATCGGGCACGTTCGTTCACATGGAATATTTCTCGGCGACAATTCTCCCCTGTCGTCCTTCCAGTATCTTGTAAATCAATCGCCACTTCGCCGACGCCGTTCATCACGCGACGTCGATCTCCGTCGAGTTCTGATGACTGCATTGTTCCCTTGCCATTGGCTGAATTGTCAAAAATCGATCACACATCTTCGCGGAACTCTGATGAGTCGCACTATATGTGCCTTGAGAGTGTCTATCGCTATGTCTCCCGAGGAACCGTTCGTTCCTCTTTACCCCAACTTCCGTCCTTTCGTTATCCGCCGGCCAAATTTCCGAATATTTCATCAACAAAACTTCAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGCTAAGTAATTGGGCCGGCCCACTAATGACCCAAAACAACGCATACGATCTTTACCGAATTAGGTCAACACAGAAACCTAATTGGGGGCGATTCTGCCGCCTCGCTATCTGTATAAAAGCCGATGGCCACTTTGCTAATTTCATTATCCATCCTCTTCCGTCTCGGTTAGGGTTTCCTCGCTTCCTCGGAAACGAAGGTTCAGTTGGACATGGCCGTTCGATGCTTCATCATCTGGCGAATGTGGATTCAATCTGTTCCCATTTGACTCGTTCCCTTGAAGCAAGATTGAGTGTGTTACATCCTGGTTTCTTAAATTCTCTTGCGATGTTATACTTGAATTCATCCTTAGATGTTAACTTAGAAGCACGATTTGAACTCGCTAAGAACATTAGACTCGGTTTATACTATCCTTGTACCATATCGAGATTAACAGAACTCGGTTTCGGTGGTACTCCATCGACACCGTCCTCAGAATCTTTCTCCGATCGGGCACGTTCGTTCACATGGAATATTTCTCGGCGACAATTCTCCCCTGTCGTCCTTCCAGTATCTTGTAAATCAATCGCCACTTCGCCGACGCCGTTCATCACGCGACGTCGATCTCCGTCGAGTTCTGATGACTGCATTGTTCCCTTGCCATTGGCTGAATTGTCAAAAATCGATCACACATCTTCGCGGAACTCTGATGAGTCGCACTATATGTGCCTTGAGAGTGTCTATCGCTATGTCTCCCGAGGAACCGTTCGTTCCTCTTTACCCCAACTTCCGTCCTTTCGTTATCCGCCGGCCAAATTTCCGAATATTTCATCAACAAAACTTCAATAA

Protein sequence

MLSNWAGPLMTQNNAYDLYRIRSTQKPNWGRFCRLAICIKADGHFANFIIHPLPSRLGFPRFLGNEGSVGHGRSMLHHLANVDSICSHLTRSLEARLSVLHPGFLNSLAMLYLNSSLDVNLEARFELAKNIRLGLYYPCTISRLTELGFGGTPSTPSSESFSDRARSFTWNISRRQFSPVVLPVSCKSIATSPTPFITRRRSPSSSDDCIVPLPLAELSKIDHTSSRNSDESHYMCLESVYRYVSRGTVRSSLPQLPSFRYPPAKFPNISSTKLQ
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Cp4.1LG20g03580.1Cp4.1LG20g03580.1mRNA