CmoCh19G001350 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAGAGACGGAAGAGGGAAATATGGGAGGCACTGTGTTGAGAAATAACGGCGGGTAGATTGTCCAAAAGAGTTTTTTTTTTTTTTTCCTCCCTTGAAATCCGTATTTTTAAGATTAAATTTATAAGAATGTCTAAAAATAAAATACTTTATATAATATCTTTAAATTTTTAAAAATAAAACATAATTTTTTTAATTTAAGAATTTTAATAATATTCTTAAATTTATAAATAAATAAATAAATAAATATATTTATTTATTTATAATTAATTTTGGATTTAGTATTTAAATACATTTAAACTTTAACAGTATTTTAAAATTATGGGAGACTTTTCCAAAGTTTATTAACACCCTTAAATTAAAAAAAATTGAAAAAAAATAATTTTTAACTTTCACACCCTTTAAACATTTTTTTAAAATAAGGTATTTAAATAAAATCGTTATTAATCATTTTCAAAAATAAAAAATAAAAAATTCTTACTATTGGAAATAATTTCTCACTTCTCATCTATTTTCCTCTTTATGTCATAATATTATTTATTAATTTTTAAAATTTATCAATAAATCTATAAATTAAAAGAGCATTTGAATAAATATATATATATATATATATATATAATTTTTTTTTTTTTTGTCTAACGAGTCCCTGTAATTTAAAAAAAAATTACGTAATAATTTAATTTAATTTCTAAGAGATTAATTAATTTTAAAATAATGTTACATCTCTAAAAATTTGAAAATTTATGATATTTTAAAAATGATTAAAAATTGAAATTCGAGCACCAAATATAACCAAACATTTAATTAATATATTTGGCCTGAAGATTTCGGAACCGATGCTATCGTTGTCCTCGTCATTTATCCACTCCGCCATTGTTGCGTGCAGCTAGTTCCTGAGAAGGCGTTGGTTCCTCCGTCGGATTATCCAAGCATCCATTTCACTTTCTGGACTCACTTTCGGAAGTTCGAGCAGAGAAATGTAGGTCACGAACAACTCCAGTGCAGCCTTTTCGATTCTTCCATGCTTCTTCTTGACTGGAGTACGGGGATTTCGGCCATTAATTGTTGTATTTGTTCTTCTGTGGTTGATTTTTTGATTCGACAGGGATAATGAATTGAAGCCGATGGACGCCGAGCAACTCAGAGAGCATGCTCATAAAATGGTGGATTTCATTGCTGATTATTACAAAACCATCGAGGATTTCCCCGTGCTCAGCCAAGTGAAGGTCGCATTTCCTTTTCGTTCATCCTTTTGCTGTTCTTAGGATCCATTGCACCTAGTTTTACTTGTTAATTACTAAATGAAAATTATGTATGACGCCTGTGTGAATTAGACGTTTCTCGAAGTGGTAGAAGAAAATTTCATCTGTTACGTTGTTCCATTGTTGTTCAAATCTATTTGAAATTTATTCATGACCTAGTTTCATCATTGTTCAATGTTATTCACAAATATCTTTCACTTATTAGTATTAATATATATATATTTGGTTTTGTATTATGATTCTGTAACCATTCTTGATTTACAAGTTGAAGTTGATAGTATTTTGTTTTCATTCAATCTTCTTTTGCTTACGGTTTTTGAAGAAAATGTGTTTATCATTTTTTTCCACTCATTTCTCAAATTTCTTTCTTAAAATTGAGAACAAAATGAAGAAAATTAATTTTATTTTATTACTAATTAATTTTATTTATGCATATTTTGAAAGTGTTCTCAAAACTAATACAAAATTTGAAGTTTCATTTTATTATTTAAATTTGGCTATAATTTCTAACGTGAGTTTAAAAAGTACTAAAGCATATTGAAAATAAAGCGTCACTAAAATGGGTGATAATTTAATGGTCTAATAATCTTTTGTTTTAATTTCCATCGATGTAGATTTTACTTTTATTTAAAAATAACAAAAAAAATGATGGTAGTTCAACTATTATTGACATGTATTCATCTTTTCGAGGTTGGAGATTCAAATTTTTATCCCTGTGCTAAAAAGAAATAAGAGAAAAGGAGTCACCATTTAATTTTTCTTTTTCTTTCTTTTGGTGATGAACAGCCCGGTTATCTTCGAAATCTTCTACCAGAATCTGCACCTCTTAATCCAGAATCTCTTCAAAGTGTTCTTGATGGTAAAGTTTCTAAATCTTGCTGTGCAAGTATAACTAATACCCCAAAACGTTTGGACTTTTTTTTTTTCTGCTTCAAGTGTAACATAATTTGAAATTCTTGGCTAATATTTTAAAGCATGACTTTTCTATTAATGTTTGGGTTGTAGATAGTTCAATGGGCCTTGTAATCATAGTGTCAATGAATTATTTTCGTGATTCAGATGTTCAGAAAAAGATTTTTCCGGGTGTAACACATTGGCAGAGCCCCAGCTACTTCGCTTATTATCCTTCCAACAGCAGCATTGCTGGATTCCTTGGGGAAATGCTGAGTGCAGCTTTTAACGTTATCGGTTTTAGTTGGATAACTTCTCCAGCTGCTACAGAACTTGAGATGATAGTTCTTGATTGGCTTGCCAAATTACTTCAGCTGCCTGATGACTTTCTCTCATCAGGTAATCCAATCGATTATGATGTTGGTTTTGATTGTTTTGTGGTGAACAATGAAGCTTTCTGCCGCTTTTTTTGTACTTTTGAATCAATTTAAAGTGTCTGTTTCATATTCTAAGTGTCCTGCTGCAGGAAAAGGTGGGGGAGTAATACAGGGTACTGCCAGTGAAGCTGTTTTAGTTGTGCTACTGGCGGCCCGTGATCGAGCTCTGAGAAGATTTGGAAAAGATTCCCTTAAAAAACTAGTGGTTTATGCTTCTGATCAAACGCATTCTGCTTTACAAAAAGCATGCCAGGTAAGGTAGTTTGAAGGTGTAATATTCATGTTCTTTAAAAAAATGTCCTTCAATGAGGTAATTTATCACATCATTTACGTATTTAAATTATAAATGATGCAATGATCTGTTGAGAATTGTTGGGAGAGGAGTCCCACGTCAACTAATTAAAGGGTTGATCATGGGTTTATAAGTAAGGAATATATCTTCATTGGTATGAGACCTTTTGGGAAAACCAAAAGCAAAGCCATGAGAACTAATGCTCACAGTGGACAATATCATACCATTGTGGGGAGTCGTGGTTTCTAATATGGTATCAGAGTCATGTTCTTAACTTAGCAATGTCAATAGAGTCCTCAAATATCGAACAAAAAAGTTGTGAGTGTTGAAGGTGTAGTCAAAAGTGACTCTGGGCTCTAGAAAAAGAGTCGAGCCTCGATTAAGGGAAGACTGTTTGAGGGCTCTATAGGGGCCTCAAGGGAGGCTCTATGGTGTACTTTGTTCGAGGAAAGGATTGTTGAGAGAGGAGTCCCATATCGATTAATCAAGGGGTTGATCATGAGTTTATTTGTAAAATGATGATGACTGAAACGAAAGTAATTTGGTAAGAAGTATGTGTATTTTTATTTTGCATTTTTTTTTTAATTTTTTTTTTTGTAGATTGGAGGCATTCATCCTGAGAATTGCAGATTGTTGAAAGCAGATTTTTCTACCAATTATGCCCTTTCTCCAGATGTTCTTTCTGAAGAACTTTCACACGACACAGCCAGTGGATTAATTCCATTTTTCTTATGTGCTACAGTAAGAATGAAGAATAAGCTTACTCATGAGCTCATTTCATTGAATACAAGTTGCTGCAGTATCTATGGTTCCACACCCCATCTCCCCTCTTTATCGGGTTTCGGTAAAACTCGTGCAGTCTCTACTATTTGACATAGTAGAAATTAACAGTGGCCTTTAGAAGGTCATCAGTGAATTGCCCCCTCCTTCCTTCTTCGCTTCACTCCTTCGTTTCAGTAATTACAGATTTGGTGCTTTTGCATGCAGGTTGGCACTACATCATCAACAGCCGTAGACCCTCTCCCTGAACTAGGAAATATTGCTAAGGTCAGCACATTTTTTCTTCCTGAATCGAATGCTGTAGTTTCTGAATTTTTAGAATTGTTCTACTTTGATAATTAAACTTTCCAATTGCACATTTTGGTCCCAAACATTCAAGTTTATTTCACTTCGGTCCCTGAAATTTCAAAATGTCAATTTTAGTCCTTGAAAATAACTGTTTTGGTCCACATGTTCAATGCTTGAAATCATGTTTATATTAACATATTAATACATACTCGAAGCTATTCCATTAATTTATTAAAAGCAAAATGAAGGTAAGAACTAAAATTATTAATTTTTTAAAGTTGAATAAGTAAAGTAGACATTTCAAAAGTCCATGGAGCGAAATGAGATTTAAACCTCTTAAAAATGTTTTGTGGAAAAGCAAAGGGGAATATTTTGACAAGCCTCACTATATTTGTAACACTGCTACTAGCTATTGTTTCCACGCCCTTAAAAGAAATACTTTGTTTCCCTCCCTAACCAACGTGAGATCTCACAATCCACCCCTTTTGGGGGCTCAGCGTCCTTGCTGGCACACCACTTAGTGTCTGGCTCTAATATCATTTGCAATAGCCCAAACTTACCACCAGTAGATATTGTCCTCTTTGAGTTTTCTTTTCCATGCTTCCCTTCAAGATTTTTGAAAGGCATCTACTTGGGAGAGGTTTCCACACCCTTATAAGGAATGCTTCGTTCCTCTCTCCAACCAATGTGGGATCTCATGATATTAACCATCGGAAATGGAAAGTTATATTCATAAGATATTGTTTGACATAACTGAAGTGGAATCACATGACCTTACATTTTAGCATGTTGTGGAACTTGAAAGGCAACCAATGAGATGAATTCAGACACTTATCCCTCATCTCTCACAGAATAAAAATCTTACTTTAGGCATACTAATGTTAAGGTTTAAGGATGATGACTTTGATCATTAAGCAGATAGAAGATGTAATATGAGTGAAACATGGGGATTATGTAATTGGAAAGGCTACAGCTACAGCTAAATTGAGTTGCCATTTGCTCTGCTAGCATAATATACAAAGTACATATTTGTAAAAAAACTA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ATGGAAGAGACGGAAGAGGGAAATATGGGAGGCACTGTGTTGAGAAATAACGGCGGGCGTTGGTTCCTCCGTCGGATTATCCAAGCATCCATTTCACTTTCTGGACTCACTTTCGGAAGTTCGAGCAGAGAAATGGATAATGAATTGAAGCCGATGGACGCCGAGCAACTCAGAGAGCATGCTCATAAAATGGTGGATTTCATTGCTGATTATTACAAAACCATCGAGGATTTCCCCGTGCTCAGCCAAGTGAAGCCCGGTTATCTTCGAAATCTTCTACCAGAATCTGCACCTCTTAATCCAGAATCTCTTCAAAGTGTTCTTGATGATGTTCAGAAAAAGATTTTTCCGGGTGTAACACATTGGCAGAGCCCCAGCTACTTCGCTTATTATCCTTCCAACAGCAGCATTGCTGGATTCCTTGGGGAAATGCTGAGTGCAGCTTTTAACGTTATCGGTTTTAGTTGGATAACTTCTCCAGCTGCTACAGAACTTGAGATGATAGTTCTTGATTGGCTTGCCAAATTACTTCAGCTGCCTGATGACTTTCTCTCATCAGGAAAAGGTGGGGGAGTAATACAGGGTACTGCCAGTGAAGCTGTTTTAGTTGTGCTACTGGCGGCCCGTGATCGAGCTCTGAGAAGATTTGGAAAAGATTCCCTTAAAAAACTAGTGGTTTATGCTTCTGATCAAACGCATTCTGCTTTACAAAAAGCATGCCAGATTGGAGGCATTCATCCTGAGAATTGCAGATTGTTGAAAGCAGATTTTTCTACCAATTATGCCCTTTCTCCAGATGTTCTTTCTGAAGAACTTTCACACGACACAGCCAGTGGATTAATTCCATTTTTCTTATGTGCTACAGTTGGCACTACATCATCAACAGCCGTAGACCCTCTCCCTGAACTAGGAAATATTGCTAAGAGGTATGAAATGTGGTTTCACATCGATGCTGCTTATGCTGGAAGTGCATGTATATGTCCCGAATATCGACAGTACATTAACGGTGTTGAAGAAGCTAACTCATTCAATATGAATCTTCATAAATGGTTCTTGACGAACTTTGATTGTTCAACGCTGTGGGTCAAGGACAGACATGCCTTGATCCAGTCACTTTCTACCAATCCTGAGTTCTTGAAGAACAAAGCCTCTCAAACAGAAATGGTTGTGGATTACAAAGATTGGCAAATTCCACTTGGGCGCCGTTTTAGATCATTGAAGGTCTGGATGGTGTTACGACTGTATGGTATAGAAAACCTTCAAAAATACATAAGAAACCATATCAAGTTGGCTGAACATTTTGAAGCGCTTGTATGTGAAGATCCAAGGTTTGAGATTGTTACACCAAGGATATTCGCTCTAGTATGTTTTCGCCTTCTTCCTCACAAAAATGAAGATGGTGGCAACAAACTAAACCAAAGCCTATTAGATGCTGTAAATGCTAGTGGAAATATGTTCATTTCTCACACGGTTTTATCAGGAAAATACATCCTTCGATTTGCAGTAGGGGCGCCATTGACAGAGGAAAACCATATAAATGCTGCTTGGAAGTTACTGCAAGCCGAGGCTTCCGCTTTGCTTGCAAATTGA 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BLAST of CmoCh19G001350 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A2H5AIY2 (Tyrosine decarboxylase 2 OS=Narcissus pseudonarcissus OX=39639 GN=TYDC2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 776.5 bits (2004), Expect = 1.9e-223 Identity = 371/485 (76.49%), Postives = 428/485 (88.25%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh19G001350 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XHL3 (Tryptophan decarboxylase 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=TDC2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 758.1 bits (1956), Expect = 6.8e-218 Identity = 361/480 (75.21%), Postives = 420/480 (87.50%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh19G001350 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RY79 (Phenylacetaldehyde synthase OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ELI5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 751.5 bits (1939), Expect = 6.4e-216 Identity = 361/480 (75.21%), Postives = 411/480 (85.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh19G001350 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M0G4 (Tyrosine decarboxylase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TYRDC PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 687.6 bits (1773), Expect = 1.1e-196 Identity = 326/487 (66.94%), Postives = 396/487 (81.31%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh19G001350 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q06086 (4-hydroxyphenylacetaldehyde synthase OS=Petroselinum crispum OX=4043 GN=AAS PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 634.0 bits (1634), Expect = 1.5e-180 Identity = 297/501 (59.28%), Postives = 384/501 (76.65%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh19G001350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HFB9 (tyrosine decarboxylase 1 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463789 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 985.7 bits (2547), Expect = 7.4e-284 Identity = 485/485 (100.00%), Postives = 485/485 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh19G001350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HHV8 (tyrosine decarboxylase 1 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463789 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 984.2 bits (2543), Expect = 2.2e-283 Identity = 484/485 (99.79%), Postives = 485/485 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh19G001350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HW83 (tyrosine decarboxylase 1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466833 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 973.8 bits (2516), Expect = 2.9e-280 Identity = 479/485 (98.76%), Postives = 482/485 (99.38%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh19G001350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BGQ0 (tyrosine decarboxylase 1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489832 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 906.7 bits (2342), Expect = 4.4e-260 Identity = 445/485 (91.75%), Postives = 466/485 (96.08%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh19G001350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DPR0 (tyrosine decarboxylase 1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022679 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 886.7 bits (2290), Expect = 4.7e-254 Identity = 431/486 (88.68%), Postives = 460/486 (94.65%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh19G001350 vs. TAIR 10
Match: AT2G20340.1 (Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 751.5 bits (1939), Expect = 4.5e-217 Identity = 361/480 (75.21%), Postives = 411/480 (85.62%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh19G001350 vs. TAIR 10
Match: AT4G28680.1 (L-tyrosine decarboxylase ) HSP 1 Score: 687.6 bits (1773), Expect = 8.1e-198 Identity = 326/487 (66.94%), Postives = 396/487 (81.31%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh19G001350 vs. TAIR 10
Match: AT4G28680.3 (L-tyrosine decarboxylase ) HSP 1 Score: 684.5 bits (1765), Expect = 6.8e-197 Identity = 327/489 (66.87%), Postives = 397/489 (81.19%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh19G001350 vs. TAIR 10
Match: AT4G28680.4 (L-tyrosine decarboxylase ) HSP 1 Score: 684.5 bits (1765), Expect = 6.8e-197 Identity = 327/489 (66.87%), Postives = 397/489 (81.19%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh19G001350 vs. TAIR 10
Match: AT4G28680.2 (L-tyrosine decarboxylase ) HSP 1 Score: 684.1 bits (1764), Expect = 8.9e-197 Identity = 327/489 (66.87%), Postives = 396/489 (80.98%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata (Rifu) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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