CmoCh12G010760 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAATTTTGCCGCTACAAAGCTTTTCGCGCGCGACAGTGTAGAACGTTGCTTCAATTGCCGACATCGGGAGGATTTCCGATCAAATCTCTCGCTATAATCCGTCATTCTTCGTTATAATCTGTACGTTGCATCGGATTGTCCTCTGAATCAGCTACTTTTTTTCAGTATGTTCTTAAATCCTTCGATGTTCTTGCTAGTTACATTACATTTTACAAGCGTTTGCCTGCGTTCGTTATGTTTGATGATCCTGATTGTTTGTCACGAAAAGAATAAGGTTTATATGTTTTTTTTTTTCTTTCATATTGTTTCAAGATTTTGTCAATAATTCGAGTTTAAAGAAACTGTCGGAAGGCTCAAAGAATGTGAATGTTATAATGATTGAATGGTAATTGTATAGCTCTGCTAATTGCACAATTTAATTATGTCCGTACTTGGGGGCAGTGTATTGTTTAATTTCAGTTGTAGATTGCCAATGAAATTTATATTTCTGCTGCCGAGTGTTTCAGAATGAAATTTAAAATTGCCGGTGGAGTTTGAGTTTGAGTTCTACACTGAATTTGATAAAGGGAACATGCCGTAGAAATTGTGAAACATAGCCTTTCATGTTGCAACTAGATCATACCTTATCTACAGCAAAGTAGGATTGTAGGAGTGAAATCTCGGTAAAACTCACTATGCTTCAGCGAAGCGGAAAAAGAGCTCAGTCTTTGTTGGTTCCAATGCGACAGTCTAGCATTCTGGATCACTTTTCTCTAACCAATAGGGGTAAACGAAGTAAGACTGAAGCTGAACCAGTTCTTCCAATTTCCGAACCAGAAGTGTCCCATTATCCCGTGGAAGATACTCAGGAGGATCGAATATGTGACCTTCAAGCTGAATCAGATTCTTATCTGGTTGATTGGTCACAAGAACCAGATACCCTGTTGGATTGGGAGAAGAAGTTGAATAGGCTCCTGAAAAAGCATTTTGGCTATCCGTTCTTGAAAAAGTTCCAAAAGGAAGCTCTGGAAGCATGGTTAAATCACCAAGATTGTCTAGTTCTTGCTGCAACAGGATCTGGTATGACTTTGCTCGTTAGGCTCTCATTCCACTTTTACGTGCTTGACATGTTAGTATTGCACTGGATGGAAGATGATCTCTTTTGCACTTTTTCATATTCTTTCAGGGAAATCTATCTGTTTTCAGATCCCAGCTTTATTAACAGGCAAGGTGGTGGTTGTTATTTCGCCATTGATAAGCTTGATGCACGATCAATGCTTAAAACTTGCAAAGCATGGGGTTTCTGCCTGCTTTCTTGGGTCTGGGCAACCTGACAGTTCTGTGGAAAAGAAAGCAATGGGAGGGGCATATAGCATTATCTATGTTTGCCCAGAGACAGTTTTAAGGTAATTTTCACATAAAAATCAATGACCAATGTTGAGGAAATATTTTTTCTTTCGCAAATGTAATGAAAGATTAAATTTATGTTTTGCAGATTGATTCAACCACTTCAAAAGCTAGCTGAAACTCGTGGAATTGCATTGTTTGCAATTGATGAAGTACACTGTGTTTCTAAATGGGGCCATGACTTCCGGCCAGACTACAGGTCTTCTTTTTCCTGAACTAGACAACTGGTTTATTTCCATTCCTCGTGTTTTCATCCATTTTGATCCCCTGTGGATTGTGTTTATCTTGCATCCACAAATAAGTTTTAATTGCATAATGTGTTTTGGGTCCGTTTTATTTGCCAATTTTACATAAAAAGATTCCAGAATGATGCCCAAATTTAGAATAGTTTTCAATTTATGCCCCGTTGCTTTTTAACATACAACTTTCTTAGCTTTTTTAAACTTACTATCATCATCACTTTGAAATTTCAGGCGTTTGTCTATTCTGCGAGAGAATTTCAGCTCTTCAACCCTAAAATTTTTGAGATTTGACGTGCCTTTGATGGCATTGACTGCAACTGCCACAGTTCAAGTTCGAGAAGACATTTTAAAGTCATTATGTATGTCAAAGGAAACAAAGATTATTCTAACTTCATTTTTCAGGCCAAATCTTCGCTTCTCCGTGAGTATTGCACTTCATTTTAAAAAATTTAAAATTTATCACTCATACACCAGTTCATCTATAGCCCCCTTTAATTTTTCTCCCAAGTAGAGGAAACTTGGATTTCCCATTCAAATTTATCCATTTATTTTGTTTTAACGATTACTATCTTACTGCTTTTTGTTTCTGCTTTGTTTAGTTTTATATCACGGAATACAAACTATAATTCTTGTTCTCATTTCCAAATCCTATTTTTTTTATTTCCTTTCTTTTCAGGTAAAACATAGTAAAACAACTTCACCATCCTCTTATAGGAAGGACTTCAGCGATCTTATAGACATGTATGCTGGAAATAGAAGATCTGGCAACAAGAAACAAACTATAATCTCTCACAAATTAGACAGTGTATTACATTGCTCAACTGACAATAGCGTACGTGAGGCGGACAGAAAGTCTCCAGATGATGTGGAGGAAAGTGATGATTCTGACTCAGATAGAGATGATATAGATTCTGAAGAAGAATGGTTGCCAACCTCCTCAGCAGGAAGGACAATGTCTGTTGAATACTTGGAAAACGAGGTTGATGTCTTTCAGAGTGTAGATGATTGGGATGGTACAGACATTACTGTATAAACTCTTGCCATTATACTGTATCTGAACTTTAGAAGCCTGTGACAATGAGTAATTGAGTAATGTATGCGCTTCAAAACAAACAAGAAAGGGCTTAATTTCTTACGTAGTTTTTAAATTTTTTAATAATAATTATTATTTTTTAAAATTGTGCAGTTGCATGTGGTGAGTTCTGCGGACAATTGCTTTCTGAGGACAGGGATGTCGATGGGTCGTTGGAGGAGATTGATGTGCTGGATAAAGCAGAAGAAAGACTAAAAAGTTGTGGAGAGACTCTAGAACAAGGGCCAACTATTGTATATGTTCCGACTAGAAAAGAAACTTTGAGTGTCTCAAAGTTTCTTTGTCAATCTGGTGTCAAGGCGGCTGCATACAATGCATCGGTACGTTCACTATATACGGTGCCAAACTTGTGCTTATGTCTGTCAAGTTTGTTGCATACTAACTTGTGACCCCCACTGTCCATTATATTTGTGATCCCTTTGCATATAAAATTTATCAATTAAAAGTTTCTGTATTTTAGTTTTGTTTCTATTGTAGACTTTCATCCTTTTCATTTTGAGACCATGTCAGCTTTGAAAGTGTTTTAGGTGCCATTTTTCCATGAGTTAATTTTCCATGCATTGCTAGCTGTTCATTATTATGTGTGGCATCATACTCCATTGCCCTTAGTTCTTGCCTAGAATTTATTATGGAAGAATAATATTATCTTACGAGCTCCCGAAATAAAACTAAATGTGTTTTTCTATTCTTTCCAGCTTCCAAAATCCCATTTAAGGACGGTTCACAAGGATTTTCACGATAACAATGTTGAGGTCTGTTTAATATAGTAACTTTCTTCTTTTTTAACTTTTTCAAATTTCCTTCTCTACCTTTCTTTAACTCCCCAATTTTGTTTACATTTCCCCCTGTTATAGGCAAGTAAGCCGTTAGATTTCTACCTACGAATTTAAACATATGAATAGCGTTTAAGCAGAACATTTTTTCTTTCTGCTATGTGCGGGTTACAAACGTTTTTCAAAGTGATATGCAGGTTTCAGTTAGCTTCTTCTGATACGAATATAGTTGACAATATAGTGTATTAACCCTTTTGTACTTTTCTCTCAAGTATTATCAGTGGTGCATGACATGGCCAACTCTGCAAAATCTAATGCACCCAATCTTGTGGGAAGAGACAGAGAGATCAAAGATCGAGCTTCTTAGTTTTTAGCGATAAACTGATCATTTATAATGCTTCAATGTTAGCAATTACCACCAAAACTGGAGCTTATATAAATTTCTTCTTTGGATTTGACATTATTTATAATTAGTGAAGTATACACGTTTTTTAACCTTAATAATTTCAAATTTTGAATAATCTTTAGCCACAGCTTGCCATCGTCCATAACTTAAAAAGTTAATTATATTAACAACTGATTTGAGCAGCGATCTGTTTCCCGGCTTCGCTTGCACGATTTGCACTGATGATTGGTTTCATCAATTTTATTTTCTTTTTCGAACAACTTTTTATTAAAATGAAGTCAAAATCTCAAATTTAATTTCTTAGCCTCACGACATTAATCTCATGGAGTTCTTTAAACGTTTAGTACTTTATGTACCCACAAGGGTTTTTTTATTTTTATATTTTTCTAAATCTTTATTATTATTGACAGCTTCATTATTCTTCAGGTTGTAGTTGCAACAATAGCATTTGGAATGGGCATTGACAAGTCAAATGTACGGAGAATTATTCACTATGGTTGGCCTCAGGTGATAATTCAAATTACAAATTTACTAGATATAATAGATCTTAGTGCGGTCATTTTTGTGTCTAAGAAGCGAAAAACTTCTGCAATCGGTTTGTTTGTACGGATTTGTCTTAATTGTGGTCTGCTTTGCTCAATTTCTGCACGCATTCTAATGTGTCTTTTCTATGGTATATATCAATTCCAGCTGTTACCTTCCGAAATTCTTTAACCACTGCTTTGGTTTCAGAGTTTGGAAGCTTATTATCAAGAAGCTGGCCGTGCTGGAAGGGATGGGAAATTGGCAGATTGTAGTAAGTTCATTAATAGTTCTTTGAAAGGACACATAGTCTTAATATTAAAGTAACGAATAATTGGCCTCTATTTACTGACTCAGGTTTTTGGGATTGGTAGTTCTGCTATCATGGTATTAGAGTGGAAGGATTTCAAGGATCCCAAGTAAAAAAAAAAAAAAATGTATATATATATATATCCTCGTACTATCCGATATCAATATTCATATTTCATTCTCATTTATCAAGAATTTGATCCCCCATAAAAAGGGACATTGAGAACAGTATAAAGTTGCATGGAAACTGTTATGGCCTCTTA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ATGCTTCAGCGAAGCGGAAAAAGAGCTCAGTCTTTGTTGGTTCCAATGCGACAGTCTAGCATTCTGGATCACTTTTCTCTAACCAATAGGGGTAAACGAAGTAAGACTGAAGCTGAACCAGTTCTTCCAATTTCCGAACCAGAAGTGTCCCATTATCCCGTGGAAGATACTCAGGAGGATCGAATATGTGACCTTCAAGCTGAATCAGATTCTTATCTGGTTGATTGGTCACAAGAACCAGATACCCTGTTGGATTGGGAGAAGAAGTTGAATAGGCTCCTGAAAAAGCATTTTGGCTATCCGTTCTTGAAAAAGTTCCAAAAGGAAGCTCTGGAAGCATGGTTAAATCACCAAGATTGTCTAGTTCTTGCTGCAACAGGATCTGGGAAATCTATCTGTTTTCAGATCCCAGCTTTATTAACAGGCAAGGTGGTGGTTGTTATTTCGCCATTGATAAGCTTGATGCACGATCAATGCTTAAAACTTGCAAAGCATGGGGTTTCTGCCTGCTTTCTTGGGTCTGGGCAACCTGACAGTTCTGTGGAAAAGAAAGCAATGGGAGGGGCATATAGCATTATCTATGTTTGCCCAGAGACAGTTTTAAGATTGATTCAACCACTTCAAAAGCTAGCTGAAACTCGTGGAATTGCATTGTTTGCAATTGATGAAGTACACTGTGTTTCTAAATGGGGCCATGACTTCCGGCCAGACTACAGGCGTTTGTCTATTCTGCGAGAGAATTTCAGCTCTTCAACCCTAAAATTTTTGAGATTTGACGTGCCTTTGATGGCATTGACTGCAACTGCCACAGTTCAAGTTCGAGAAGACATTTTAAAGTCATTATGTATGTCAAAGGAAACAAAGATTATTCTAACTTCATTTTTCAGGCCAAATCTTCGCTTCTCCGTAAAACATAGTAAAACAACTTCACCATCCTCTTATAGGAAGGACTTCAGCGATCTTATAGACATGTATGCTGGAAATAGAAGATCTGGCAACAAGAAACAAACTATAATCTCTCACAAATTAGACAGTGTATTACATTGCTCAACTGACAATAGCGTACGTGAGGCGGACAGAAAGTCTCCAGATGATGTGGAGGAAAGTGATGATTCTGACTCAGATAGAGATGATATAGATTCTGAAGAAGAATGGTTGCCAACCTCCTCAGCAGGAAGGACAATGTCTGTTGAATACTTGGAAAACGAGGTTGATGTCTTTCAGAGTGTAGATGATTGGGATGTTGCATGTGGTGAGTTCTGCGGACAATTGCTTTCTGAGGACAGGGATGTCGATGGGTCGTTGGAGGAGATTGATGTGCTGGATAAAGCAGAAGAAAGACTAAAAAGTTGTGGAGAGACTCTAGAACAAGGGCCAACTATTGTATATGTTCCGACTAGAAAAGAAACTTTGAGTGTCTCAAAGTTTCTTTGTCAATCTGGTGTCAAGGCGGCTGCATACAATGCATCGCTTCCAAAATCCCATTTAAGGACGGTTCACAAGGATTTTCACGATAACAATGTTGAGGTTGTAGTTGCAACAATAGCATTTGGAATGGGCATTGACAAGTCAAATGTACGGAGAATTATTCACTATGGTTGGCCTCAGAGTTTGGAAGCTTATTATCAAGAAGCTGGCCGTGCTGGAAGGGATGGGAAATTGGCAGATTGTATTCTATTTGCAAACCTGACAAGAATACCATCCCTTTTGCCGAATCGAAGAAGTGAAGAACAAACTAATCAAGCATATAGAATGCTGTCTGATTGCTTCAGGTATGGGATGAACACTACAAACTGTCGGGCACAGAAATTGGTGGAATACTTTGGCGAGACTTTCGATCACAAGAAGTGTTTCATGTGTGATGTTTGTGTGAAGGGACCTCCAAATATGCAGAATTTGAAGGAGGAAGCAAATATATTAATGCAGGTCATTGCCGCTCATCATCAATATTTACTTGAAGGATTGTACGATGATTTCACATACGGTGATGTCAAACAGAGATTCAGGGAGAAGCCAAGTTTGAGGTTATTTGTCAGTAAAGTAAGAGAGCAGTCCATGAAATTCGCGGCAACTGATATGCTCTGGTGGCGAGGTCTTACAAGAATTTTGGAAGCTAAAGGTTACTTGAAAGAAGGAGATAACAGGAACCATGTTCAGATAAAATTCCCTGAGCCAACCAAGCTGGGATTGGAGTTTCTATCCAGAAATGACCAAATATTCAATGTTTGCCCTGAAGCAGACATGCTCCTCTCAATGGCCAAACCCAAATCCTACTCATCCTTCTCAGAATGGGGCAGAGGCTGGGCTGATCCTGCCATACGACGAGAACGTCTAAAACGTCGGAGACACTTCGTCGACGAGTCACGTGGGTCACGACCACGAAAGGGGAGAAAAAGAAAATCAAGAAAACATAACTCCGATACAAGAACAGTTCGAGATACGGTTAACGTTGACGAGTTGGGTCATGACTGTCTACCTAAGACAGACTTGACCATCCTCAGAAAGGTTTCGAGCTCACGCAACACGCTCGGACGGATCGCTGCAATTGCTGCTGCTGGTTCTTGTTTCTGGTACGCCGGAAGCAAATTAGATAATGGATCCTCTGTAGTGTTGTCAATTCCTGCTGCTTTGAGTGAGCCACTGTTTCTTCCATGGCAGACCGCACACGGCTTCACGATTCATCCTTCTGGTGCATTTGATCACCAGAAATTGGGTCTTTCATTTTGTTCTTCAAGAGTCAGTCCTGCTCCACCATCTGGTGTGGAGAAGGAAAAGCCTGGAGATACGCAGAAGCCTTGTCCAAGATGTTTGGATAGAGATACAATTGCAAATGCTGCAGCAGATGTCGGCCCTGCTGTTGTAAATATTTCTGTTTCACATGGTATTTACGGAATTGCTACTGCTAAAAGCATGGGATCCGGAACAATTATTGACAAGGATGGTACTATTTTAACATGTGCCCATGTCGTGACGGATTTTCATGGTCCACGAGCTGCATCCAAAGGAAAGGTAGAGGTTACTCTACAAGATGGTCGGACATTTGAAGGGACAGTAATGAATGCTGATTTTCACTCTGATATTGCCATTGTGAAAATCAATTCTAAAAGCCCTCTTCCCATGGCAAAGCTTGGTTCTTCAAGCAAGCTCCGACCAGGGGATTGGGTTGTAGCAATTGGGTGTCCACTTTCGCTTCAGAATACTGTCACAGCTGGTATAGTAAGTTGTGTTGACCGTAAGAGTAGTGATTTGGGTCTTGGTGGAATGCGAAGGGAATATCTACAAACAGATTGTGCAATTAACGTGGGAAATTCTGGGGGTCCTCTTGTTAATGTGGATGGAGAAGTTATTGGTGTAAATATTATGAAAGTGGATGATGCCGTTGGATTAAGTTTCGCTGTACCAATTGATTCAGTCTCCAAAATTACAGAGCAATTCAAGAAAAGAGGGAGAGTTATTCGGCCTTGGCTTGGATTGAAAATGATCGATCTCAACGAAATGATAATCGAACAACTTAAAGAAAGAGATGCATCTTTTCCAGACGTTACTAAAGGGGTTCTTGTAGCCATGGTAACTCCTGGATCCCCTGCTAGTCGTGCTGGGTTCCGTCCTGGTGATGTCGTCATCGAGTTCGATAAGCAACCTGTTGGCAGTATCCAAGAGATCATTGAAATTATGGGAGATAGAGTTGGGATTCCATTGAAGGCAGTTGTGAAAAGATCACTTAATGGCATCATCACTCTGACTGTTCTTCCTGAGGAGTCCAATCCAGATATGTGA MLQRSGKRAQSLLVPMRQSSILDHFSLTNRGKRSKTEAEPVLPISEPEVSHYPVEDTQEDRICDLQAESDSYLVDWSQEPDTLLDWEKKLNRLLKKHFGYPFLKKFQKEALEAWLNHQDCLVLAATGSGKSICFQIPALLTGKVVVVISPLISLMHDQCLKLAKHGVSACFLGSGQPDSSVEKKAMGGAYSIIYVCPETVLRLIQPLQKLAETRGIALFAIDEVHCVSKWGHDFRPDYRRLSILRENFSSSTLKFLRFDVPLMALTATATVQVREDILKSLCMSKETKIILTSFFRPNLRFSVKHSKTTSPSSYRKDFSDLIDMYAGNRRSGNKKQTIISHKLDSVLHCSTDNSVREADRKSPDDVEESDDSDSDRDDIDSEEEWLPTSSAGRTMSVEYLENEVDVFQSVDDWDVACGEFCGQLLSEDRDVDGSLEEIDVLDKAEERLKSCGETLEQGPTIVYVPTRKETLSVSKFLCQSGVKAAAYNASLPKSHLRTVHKDFHDNNVEVVVATIAFGMGIDKSNVRRIIHYGWPQSLEAYYQEAGRAGRDGKLADCILFANLTRIPSLLPNRRSEEQTNQAYRMLSDCFRYGMNTTNCRAQKLVEYFGETFDHKKCFMCDVCVKGPPNMQNLKEEANILMQVIAAHHQYLLEGLYDDFTYGDVKQRFREKPSLRLFVSKVREQSMKFAATDMLWWRGLTRILEAKGYLKEGDNRNHVQIKFPEPTKLGLEFLSRNDQIFNVCPEADMLLSMAKPKSYSSFSEWGRGWADPAIRRERLKRRRHFVDESRGSRPRKGRKRKSRKHNSDTRTVRDTVNVDELGHDCLPKTDLTILRKVSSSRNTLGRIAAIAAAGSCFWYAGSKLDNGSSVVLSIPAALSEPLFLPWQTAHGFTIHPSGAFDHQKLGLSFCSSRVSPAPPSGVEKEKPGDTQKPCPRCLDRDTIANAAADVGPAVVNISVSHGIYGIATAKSMGSGTIIDKDGTILTCAHVVTDFHGPRAASKGKVEVTLQDGRTFEGTVMNADFHSDIAIVKINSKSPLPMAKLGSSSKLRPGDWVVAIGCPLSLQNTVTAGIVSCVDRKSSDLGLGGMRREYLQTDCAINVGNSGGPLVNVDGEVIGVNIMKVDDAVGLSFAVPIDSVSKITEQFKKRGRVIRPWLGLKMIDLNEMIIEQLKERDASFPDVTKGVLVAMVTPGSPASRAGFRPGDVVIEFDKQPVGSIQEIIEIMGDRVGIPLKAVVKRSLNGIITLTVLPEESNPDM Homology
BLAST of CmoCh12G010760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FT69 (ATP-dependent DNA helicase Q-like SIM OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RECQSIM PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 857.8 bits (2215), Expect = 1.5e-247 Identity = 463/817 (56.67%), Postives = 587/817 (71.85%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh12G010760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3E6S8 (Putative protease Do-like 14 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DEGP14 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 505.8 bits (1301), Expect = 1.5e-141 Identity = 274/429 (63.87%), Postives = 316/429 (73.66%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh12G010760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A9JRB3 (Serine protease HTRA1B OS=Danio rerio OX=7955 GN=htra1b PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 227.6 bits (579), Expect = 7.6e-58 Identity = 130/321 (40.50%), Postives = 193/321 (60.12%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh12G010760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F1N152 (Serine protease HTRA1 OS=Bos taurus OX=9913 GN=HTRA1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 227.3 bits (578), Expect = 1.0e-57 Identity = 133/322 (41.30%), Postives = 196/322 (60.87%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh12G010760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q92743 (Serine protease HTRA1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HTRA1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 227.3 bits (578), Expect = 1.0e-57 Identity = 133/322 (41.30%), Postives = 196/322 (60.87%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh12G010760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FCP9 (ATP-dependent DNA helicase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444411 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1627.1 bits (4212), Expect = 0.0e+00 Identity = 812/812 (100.00%), Postives = 812/812 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh12G010760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HPE4 (ATP-dependent DNA helicase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465434 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1579.3 bits (4088), Expect = 0.0e+00 Identity = 792/812 (97.54%), Postives = 801/812 (98.65%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh12G010760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D9J9 (ATP-dependent DNA helicase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018875 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1388.2 bits (3592), Expect = 0.0e+00 Identity = 696/801 (86.89%), Postives = 733/801 (91.51%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh12G010760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LJR8 (ATP-dependent DNA helicase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G030620 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1381.7 bits (3575), Expect = 0.0e+00 Identity = 699/815 (85.77%), Postives = 755/815 (92.64%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh12G010760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BXQ9 (ATP-dependent DNA helicase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494714 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1373.2 bits (3553), Expect = 0.0e+00 Identity = 696/815 (85.40%), Postives = 750/815 (92.02%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh12G010760 vs. TAIR 10
Match: AT5G27680.1 (RECQ helicase SIM ) HSP 1 Score: 857.8 bits (2215), Expect = 1.1e-248 Identity = 463/817 (56.67%), Postives = 587/817 (71.85%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh12G010760 vs. TAIR 10
Match: AT5G27660.1 (Trypsin family protein with PDZ domain ) HSP 1 Score: 480.3 bits (1235), Expect = 4.6e-135 Identity = 260/401 (64.84%), Postives = 296/401 (73.82%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh12G010760 vs. TAIR 10
Match: AT4G35740.1 (DEAD/DEAH box RNA helicase family protein ) HSP 1 Score: 210.7 bits (535), Expect = 6.9e-54 Identity = 169/588 (28.74%), Postives = 265/588 (45.07%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh12G010760 vs. TAIR 10
Match: AT1G31360.1 (RECQ helicase L2 ) HSP 1 Score: 208.4 bits (529), Expect = 3.4e-53 Identity = 163/565 (28.85%), Postives = 243/565 (43.01%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh12G010760 vs. TAIR 10
Match: AT3G05740.1 (RECQ helicase l1 ) HSP 1 Score: 206.1 bits (523), Expect = 1.7e-52 Identity = 163/549 (29.69%), Postives = 229/549 (41.71%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata (Rifu) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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