CmoCh06G009510 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TAGAAGGAGAGATGGAAGAAGAGTTTTCAAAACAAAAGCTAGAACTCGACGGTTACAATGATAACGGAGATTCTAAGTTATCTTGGTGGAAAAGGAAACTAACACTACTCAGTCTCGATTCATCAACTAGAAATGGTGAGAGATCGAGAGATGCAGAGAAGAACAATAGCGCAAACTTCAGATCTCTAAGTCAAATTGTCATTCATCCTCACGACTGGTACTACTTTATTTTTATTTTTATTTTTGTTATCATACATATTTTTATTCCATAAAAATGAAAATTTTAATTACTTTATTTTTATTTTTGTTATCATACATATTTTTATTTCATAAAAATGAAAATTTTAATTTTGTGTTTAAATCTACTACTTACACGTCCAAGTATCGCATTCATATATTCAAATCGTTGCTTTAAATTTTTTTTTATAATTGTTTTGAAAAATATTTGGAACTTTACGATAAATTTGAATATATTACTATTTGAGGGAGTAAAAATGTCTTAATCGTTAAAGTCGGTTTAGGATGTTTTTTTTAGAGGTCGTTTGTTTTCCTTAACTTTAGAACTAAAAACATTCTAAAAATATTTTTCTTTTATTTCACTTAGAACATTTATCTTTTATGTTTTTTTTTTTTAGATTTTTATTTTTATTTTTATTTTTCTCTCTCCAAAACGTCACTTTATTTCTCGTAATTACTTAAAAGAAAATAGAAATAAAAAAAACATTTATCAAAAGGTTTATTTATTTATTTAAATAGTAGAAAGAAACCGTTGGACGATTTTTGAAGACAAAATTAAGGGCTGGTGGAATCCATGCACGATGATGCACTGAAGCAATCCGTCAGAGCGACGGGATTCAGAGCAGAAACGAAATCTGAAAAGAACTGAGAAGAAAATGGGGTTTACGTTTAATGCAGGCGATACGTTCTTTGGACGCATTTCATTTTGGTATGGGCTGTGTACTCTTCCTTCTTTACGCCATTGGAATTCGGATTCTTCAGGGGTCTCCCCAAGAATCTCTTCCTCCTCGACGTTGCCGGCCAGATCGCCTTTCTCATCGATATCGCTGTTCACTTTTGTGTTGCCTATCGCGATTCCCATTCTTACCGCTTTGTCTACGACCGTAATCTCATCGCTATCAGGTCTGTCAGTCAATCTCTGTTCTCACAACACAATGTTTAATCTGTTTGTAATAGAAATACAAATTTTACAACTGCAGATATTTGAAGTCTCGATTTGTGGTTGACTTAATGGGTTGTATGCCCTGGGACGCCATCTACAAGGTATGGCTTCAATGATAAAATTTTATTGCTCCAAGTATGATGCATCTAAGCAATATTCTCAGCACTTTTCCACCTCCCAGGAGGGGTTAGTAATTTGATTGACTTCATGTATTCATCCCTCTACCTACCGGTACCGTGTGTAGGCTTCTGGTAAGAAGGAGCTTGTGAGATATTTACTATGGATTCGGCTAAGTCGAGCCTTAAGAGTTACTGAATTCTTTGAGAAATTGGAGAAGGATATACGAATAAATTACCTTGGTACAAGAATTGCGAAGCTTTTTGTTGTGGAGCTTTATTGTACTCATACAGCTGCCTGTATTTTCTACTATCTTGCTACTACTCTACCTCCGTCAAAAGAAGGGTACACCTGGATAGGAAGCCTAAAGTTGGGGGACTATAGCTATTCAAACTTTAGAGAAATTGATCTTTGGAAGCGTTACATCACATCATTATATTTTGCTGTTGTAACTATGGCAACTGTTGGTAAGAGGCTTCTCTTTCTCATTTTTATCTTTATATTTTTTGAATTAACCATCCCATTACGTGATATCCCTTGTTTGTTTGATGTATGTTAATTTCATTTACTTCTGTTGGCATGATGTATGTTAATATGGCTTTAGTTGAACAGAGGTCGGATGGGGATAGATTGGGTTAAGGGATGTTTTGGAATAATGGACAAATTAAATTGGTTTGCAGATACTTGGTTCCACCCAAAGGGGTCAATCAAACTGATCATAGGCCTCCAATTACAAAGGTGTATGCTAGGAAGAGAGGAAGAGTTGTCTAGAGGGGTTTTGAGATGTGTTGGTATACATACCTATTGATTACAAAATACCTTGCTACTTGATGCAACCAACCATTTGGATTTGTTCCTTCAAAGATTGGCACCTCCAACTTCTATAAATGTGAATCAAATACTGGAGCTAAAGTGTTGGCAAGTTGATTGGAACTATGACTTGAAATTCCCTTACGCACCTGGCCTCACCATCCACTCCTACTGGACTCTATTGATATAATTACAAATTTGCAAAAAGTTAGGATACCAAAATTTACAAAAAGGAGCTTTACAGAGTTCCACATACTAGTGGTAGAATTAATAATGTTGTTGATAATCAAGGTAATAAAAACCACCAAAACTTTTAACATAACATCATTACATAAGAAATATAATTCTAATATATTTTAATAACATTTACTAAAGAAAATTTAAAAATAATTTTAAAAAATCTTTATTTAATGGGATAATCCAATAAGTCGGCTCAAGTCCGATCCAAGCTTGACCCAAATTTTGATAGAATGTGTCCAAGTTCAAAGGTTGGGTCATAGGCTTGGCTATTAAAAGTTGGGTCAGCTTGATTTATGTCTGGACTGAGCTTGGACATACTCTTTTTGGATTGGACTGACCAAGGTTGAGGGTGACTCTAACCAACTCTTCCTCTCTTCCTAGGTTACACCTCGTAATTGGAGGCTTATCACAAATCTAATTAAATTTGGGCTGGATTCCCGTCCTCACATTACTTTTTTCTTTTTACAATAGCAATATTCTAAAAGGCTATTTACCTTATTTTGCTCATGGAATTACAAGTAGTAGCAAATGAAAAATAATATCCAAAAACTTGAAATAATTGTTTTTTAGAGATCGTCGATAGTAAAGAAAAAACTTAAATCTGGTAATTGAAATAGAAAAGCCAAATGCATAAATAAACAATGTCTTTTTACTTAAAATGAATTGGTTTAACTTGAACGATTGGGGAAAGAAAAAAGATATGGAATTACTGGGTATTGTGTTCCAAGCTTTGAAGACATTCCTTAGTGCATTGGTATTAGTCTTATGTTCATATGTTGGAACATTTCGTTAGTGCATGGTGAATCTTCTTAGAAGCTGGCCTGATTTTTTCCATGGGTAATGTCTTTATTTAGCCCTTTTCTGTTTGTTAAAATTAGTCAGTTGTATTAGCTTTGTGTTCATTTGAAACAGCAAACATCTCTTCCTTTAAATGTATTGGTTAGTCACCTCCAACTTTCATGGTAGGTTCCGAGAGCAATAGCCACATCGCTCTGGTGTTATCAAATTCTCAGATCTGCAAATGAGAGCATTACACTTCATTATTCTTCACTTTCTTATGATGGTTTTTTGTTACTTGTACTAGAGTTCAAGCTTCTTTTCCTCCTAATTTCTGCTTCATGTTCGCAGGTTATGGTGACATGCATGCCGTCAATGTCAGGGAAATGATTTTTATCATGATTTTTATCTCCTTTGATATGATTCTTGGTTCTTATTTGCTTGGTAACATGGCAGCATTGATAGTAAAAGGATCAAAAACAGAAAAGTTTAGAGATAAAATGAAGGACGTTATTAAATACGTGAATAAAAATAAGCTCAATAGGAAATTAAGTAAAGACATCAAAGATCATCTTCAATTACAGTACTGCCACTCCTCTGAGTTTGGTGTTCTTCAAGATATTCCAGCTTCAATTCGTGCCAAGGTATTATAATCCTGTGTTAGTCTAAGATATAGCTGAAAATCAATACTGGAAATTTAATCATGCTCTATGCTTTATTGCATTACTTGATTCATTTACTTCCGTGTTAATTTATTGAGGAATAAGGACAGTCTTTTATATATATATATATATATTGTGTATTTATTTGTATTTCCTTATTTGTAATTAGCTCCTAAGTGATTGGGAGATCTAGATATCTTTTTCCTTGTATGTTTTCTTTCTTTCCTATTCCGTTTTCCTGGTAATTTGTATTTAGAATAACCTTGTATCATCTTTTCAAGCAAGAAGGAATATTTTTCTTATCATTGAGATGGTATCAAAGCCTTGATGCTTTTTTTTTATTGGCCTTCATTGCCGATCAAACTTTTTTAACCAGCTTTCAGTATTGTTGATTTGAGTTTTTAATGTTTTGCTTGTTCAAAGTTATTGGAGTTTCAATCCAATGTGTGAGTTTCTCGCATATGGTTAGGTATTTCCTTTTGACTTGGGTTCATCTACTTGTGCGTGGATGTTTTATTTCTAAAGCGATACTATATGTGGTGGTATCTTTCTTGGTGCTTATGTTGTTAAGGACAGCTGAATCTCCCTGTGATATTATATTTTTCACTTTGGACATAAGCTCTCTAGCAAATTTGTCAAACCATGCTCGAGGGAACTGCAACAAACCATATAAGGATTTTTATAACTTGCACCCAATCCACTAGTAGACATTGATCTTATGCCGGGTGGAATATCCATGTATATTTCTTCTTCTAAGTCTCTGTTTAGAAATACATTATTCGCATCCAGTTGGTGCAGTGATCAATCTAAGAATAGCTGCAAATTAAAGCAGCATCCAAACTATAATTGGTACTTGAGTGCTGTCCAAATTTGATACAAATGCCCTGCAGTCTTGAAGGAGTTTTCCATAGGCAAGAAACTTTTGAATCGAGTGGTTTGTGCATTGTCTAACCCTTGTCCTGTGAGCTATGGGCTGACCATGGTTATCAGTTGTGGGAGTATGAGGTGTGATAACGTTCTTACTATTCTAATCATCATCGGCATGAGAACTAGTTTAAGTGATTTGAAAATTTGAAAGGGAATGGTGGTGTTTTATCTTCTCTCTATAGGGTTTCTTCTACTGTAAACATGAAGTTCAGATTGTTTTTAAGGTTTAGACGTAGGACTGAAAACTCGAGGCACTGAATTGGACACGGGACGAGTCAAAA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ATGGAAGAAGAGTTTTCAAAACAAAAGCTAGAACTCGACGGTTACAATGATAACGGAGATTCTAAGTTATCTTGGTGGAAAAGGAAACTAACACTACTCAGTCTCGATTCATCAACTAGAAATGGTGAGAGATCGAGAGATGCAGAGAAGAACAATAGCGCAAACTTCAGATCTCTAAGTCAAATTGTCATTCATCCTCACGACTGGCGATACGTTCTTTGGACGCATTTCATTTTGGTATGGGCTGTGTACTCTTCCTTCTTTACGCCATTGGAATTCGGATTCTTCAGGGGTCTCCCCAAGAATCTCTTCCTCCTCGACGTTGCCGGCCAGATCGCCTTTCTCATCGATATCGCTGTTCACTTTTGTGTTGCCTATCGCGATTCCCATTCTTACCGCTTTGTCTACGACCGTAATCTCATCGCTATCAGATATTTGAAGTCTCGATTTGTGGTTGACTTAATGGGTTGTATGCCCTGGGACGCCATCTACAAGGCTTCTGGTAAGAAGGAGCTTGTGAGATATTTACTATGGATTCGGCTAAGTCGAGCCTTAAGAGTTACTGAATTCTTTGAGAAATTGGAGAAGGATATACGAATAAATTACCTTGGTACAAGAATTGCGAAGCTTTTTGTTGTGGAGCTTTATTGTACTCATACAGCTGCCTGTATTTTCTACTATCTTGCTACTACTCTACCTCCGTCAAAAGAAGGGTACACCTGGATAGGAAGCCTAAAGTTGGGGGACTATAGCTATTCAAACTTTAGAGAAATTGATCTTTGGAAGCGTTACATCACATCATTATATTTTGCTGTTGTAACTATGGCAACTGTTGGTTATGGTGACATGCATGCCGTCAATGTCAGGGAAATGATTTTTATCATGATTTTTATCTCCTTTGATATGATTCTTGGTTCTTATTTGCTTGGTAACATGGCAGCATTGATAGTAAAAGGATCAAAAACAGAAAAGTTTAGAGATAAAATGAAGGACGTTATTAAATACGTGAATAAAAATAAGCTCAATAGGAAATTAAGTAAAGACATCAAAGATCATCTTCAATTACAGTACTGCCACTCCTCTGAGTTTGGTGTTCTTCAAGATATTCCAGCTTCAATTCGTGCCAAGATATCACAGAAATTGTACGAGCCATACATTAAGGAAGTCTCTCTTTTCAAAGGTTGCTCTCAGGGATTCATAAAACGAATTGCAACCAAAGTTCGTGAAGAGGCTTTTTTCCCTGGACAAATGATTATTGAACGTGAAAACTTAGTTGACCAACTCTATGTTGTATGTCATGGTGAATTGGAGGAAGTTGAAAACTGGGATACTGAAGATGAAGAGTTAATTAGGTGTCTTGGAACATATAGCTCATTTGGCGAAATTTCTTTCCTTTGCAATTCTCCTCATCCTTACCATGTTCGGGTTCGTGAGTTTTCCAAGATCTTGCAACTCGATAAACTATCATTTAAAGAAACCTTGGAATTACACTTTTTAGATGGACAGATCATCTTAGACAATGCCCTTGAGGGAAAGGATTCCAACCAACAAGATCAAATTTTGGAATCTGACATAATTCTTTACATTCAAAAGCGTGAACTTGAGTTAGCCATTAAGGTCAACTGTGCTGCTCATGATGGGGATCTAAATCAACTCAAACGGTTGATTAAAGCAGGAGCAGATCCCAATAAAACAGATTATGATGGAAGATCGCCTCTGCATTTTGCTGCATCGAAAGGATATGAAGCTATTGCTTGTTTTCTTATTGAACAAGGAGCACAAGTTAATGTTCCAGATAAGTTTGGGAACATGCCTTTACTTGAAGCCATTCAGAATGGACATGAGCAAGTAGCTTCTTTACTTGCCAAAGCTGGAGCAACCATTGTTGCTAATGATGCTGGTGGACTTCTTTGTTCTACTGTCGCAAGAAGGGATTTGGGCTTTCTGAAAGGGCTTCTGGCTAATGGCATTGATCCAAATGCTAGAAACTATGATCAACGGACTCCACTTCACATAGCTGTCTCAGAAGGTTTGTATCCTTTTGCAGAGGTCCTATTAAATGCTGGAGCCAGTGTTTTTGCAACGGACAGATGGGGAAATACTCCGCTTGATGAAGCTCGTACCAGAGGAAATAAGAATTTGATCAGGCTACTTGAAGTTGCAAAAATTTTTCAGTCATCTGGAAACAACTCTGATATATCCGAAGAGATTGAAGGTACTAGTTGA MEEEFSKQKLELDGYNDNGDSKLSWWKRKLTLLSLDSSTRNGERSRDAEKNNSANFRSLSQIVIHPHDWRYVLWTHFILVWAVYSSFFTPLEFGFFRGLPKNLFLLDVAGQIAFLIDIAVHFCVAYRDSHSYRFVYDRNLIAIRYLKSRFVVDLMGCMPWDAIYKASGKKELVRYLLWIRLSRALRVTEFFEKLEKDIRINYLGTRIAKLFVVELYCTHTAACIFYYLATTLPPSKEGYTWIGSLKLGDYSYSNFREIDLWKRYITSLYFAVVTMATVGYGDMHAVNVREMIFIMIFISFDMILGSYLLGNMAALIVKGSKTEKFRDKMKDVIKYVNKNKLNRKLSKDIKDHLQLQYCHSSEFGVLQDIPASIRAKISQKLYEPYIKEVSLFKGCSQGFIKRIATKVREEAFFPGQMIIERENLVDQLYVVCHGELEEVENWDTEDEELIRCLGTYSSFGEISFLCNSPHPYHVRVREFSKILQLDKLSFKETLELHFLDGQIILDNALEGKDSNQQDQILESDIILYIQKRELELAIKVNCAAHDGDLNQLKRLIKAGADPNKTDYDGRSPLHFAASKGYEAIACFLIEQGAQVNVPDKFGNMPLLEAIQNGHEQVASLLAKAGATIVANDAGGLLCSTVARRDLGFLKGLLANGIDPNARNYDQRTPLHIAVSEGLYPFAEVLLNAGASVFATDRWGNTPLDEARTRGNKNLIRLLEVAKIFQSSGNNSDISEEIEGTS Homology
BLAST of CmoCh06G009510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M8S6 (Potassium channel SKOR OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SKOR PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 860.9 bits (2223), Expect = 1.0e-248 Identity = 435/674 (64.54%), Postives = 524/674 (77.74%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh06G009510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q653P0 (Potassium channel KOR1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os06g0250600 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 850.5 bits (2196), Expect = 1.4e-245 Identity = 425/661 (64.30%), Postives = 519/661 (78.52%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh06G009510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94A76 (Potassium channel GORK OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GORK PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 842.0 bits (2174), Expect = 5.0e-243 Identity = 417/674 (61.87%), Postives = 515/674 (76.41%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh06G009510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XUW4 (Potassium channel KOR2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os04g0445000 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 737.3 bits (1902), Expect = 1.7e-211 Identity = 370/724 (51.10%), Postives = 508/724 (70.17%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh06G009510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38998 (Potassium channel AKT1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AKT1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 363.6 bits (932), Expect = 5.3e-99 Identity = 229/665 (34.44%), Postives = 362/665 (54.44%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh06G009510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G4L4 (potassium channel SKOR-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450722 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1479.2 bits (3828), Expect = 0.0e+00 Identity = 741/741 (100.00%), Postives = 741/741 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh06G009510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G4H8 (potassium channel SKOR-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450722 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1473.4 bits (3813), Expect = 0.0e+00 Identity = 741/745 (99.46%), Postives = 741/745 (99.46%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh06G009510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I9X7 (potassium channel SKOR-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472947 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1391.3 bits (3600), Expect = 0.0e+00 Identity = 701/741 (94.60%), Postives = 715/741 (96.49%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh06G009510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G4Z5 (potassium channel SKOR-like isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450722 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1347.0 bits (3485), Expect = 0.0e+00 Identity = 676/680 (99.41%), Postives = 676/680 (99.41%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh06G009510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ICN4 (potassium channel SKOR-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111474424 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1117.4 bits (2889), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/577 (97.23%), Postives = 566/577 (98.09%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh06G009510 vs. TAIR 10
Match: AT3G02850.1 (STELAR K+ outward rectifier ) HSP 1 Score: 860.9 bits (2223), Expect = 7.4e-250 Identity = 435/674 (64.54%), Postives = 524/674 (77.74%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh06G009510 vs. TAIR 10
Match: AT5G37500.1 (gated outwardly-rectifying K+ channel ) HSP 1 Score: 842.0 bits (2174), Expect = 3.6e-244 Identity = 417/674 (61.87%), Postives = 515/674 (76.41%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh06G009510 vs. TAIR 10
Match: AT2G26650.1 (K+ transporter 1 ) HSP 1 Score: 363.6 bits (932), Expect = 3.7e-100 Identity = 229/665 (34.44%), Postives = 362/665 (54.44%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh06G009510 vs. TAIR 10
Match: AT4G32500.1 (K+ transporter 5 ) HSP 1 Score: 319.3 bits (817), Expect = 8.1e-87 Identity = 206/673 (30.61%), Postives = 360/673 (53.49%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh06G009510 vs. TAIR 10
Match: AT4G22200.1 (potassium transport 2/3 ) HSP 1 Score: 315.5 bits (807), Expect = 1.2e-85 Identity = 209/674 (31.01%), Postives = 346/674 (51.34%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata (Rifu) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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