CmoCh02G008440 (gene) Cucurbita moschata (Rifu) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCGGGTTTACTTAATGTACTGTCCGCAATCTACATTTTTCTTTAAGATTGCATTGGAACATGTGTATTGGGTTGAGTTACATATTATTTCTTGAAGTTTATTACAGATACTGTCATGCGTTACAGATTCTGTGCAGTGGCATTGACCTTTCAGAAACTAAGAAATCCTAACCCTAGTTGTTGTTGTTTTTAAGTTCATAGTCTAGTTAGGATTTCAGTTTTAATTGGCTCAACATTTTTTTGTTAGGTAAGAACGTATCTCTTTCAATTATAGAAATTCCATTCAATTGTTTCCATTGTTCTCATTTGGTTTTTGGTTGTTCTAGGTTAATTGAATCTTATTTTTATAACAATCTGCTAAATGAGCACGTGCCTTTATTGTGTTAACTTATTTTGACATAGTCATGTGCATTTTTGTTGATGTTGGTGCTGTTTCACGTGCCTTCATTCTTTATGATAAATAATTTATCTTCTTCTTCCTTTTATGTTGATACATTGAAATTCTACTGTTAACTTTTGTGATTCAAGTTCAAATTTGCACAATGATACATGATTTTTAAATTTTCAAAGCTCTTGTTATTCGCAGTCATCTGTTAATGGATCAGCTTCAAATCTTCCAGATGGTACTGGGCGATCTTTTGCTAACTCATTTTCTGGTCAGTCTGGTGCAGCTTCCCCTGTTTTTCATCACTCCGGTAGGTGCATGTGTCTTAGAGTTGTGTAGTTTTCACTCAAATTTATGAAATTGAGAGGTCTCAATTTCAGGAACTATCCAAGGGTTGCACAACATTCACGGAAACTTCAATCTTCAGAACATGTCAGGTGCACTAACTTCAAGAAATTCAACAATAAATAATGTTCCATCTGGTGGGGTGCAGCAACCTACTGGAACAATTTCCAGTGGGCGTTTTGCATCAAACAACCTTCCTGTTGCTCTTTCTCAGGTATCTTTCAAAGTCAGGCTATTTATTCGTAATTACCATCAGTTTCACCTGTAGTTTCTTTGAGTTGCATTTATTGTGCTCACAAAAGATTAGCGGCTGCATGATAACATATTTTAGACATTTTATCACTCTGGTAAGCAAAGACGAGCATGCTTATTTATGATTAATTCTGAAGTACTGTTGTAATTATCACTATAGAAGAGATTTACCATCTAGTAACTGTGTTGAGGAAGAAATGATGGAGAGCTGCTTTACAAATCAGACATCAGATCATGATTTTTATAATTAGCATGGTATAGGGTTTTCTGGGCATGAAATGACATCTTTAATAGATCTAGAAGCAATGAAAGTGAAACCCTAATCTTATCCTCTCAAAACCCCTCATAATTGTTTATGTGCTTTCACTACATTTTGACTGTTGCGTTCTCTTCTGTAGTTATCTCATGGCAGCTCTCACGGACATTCAGGAGTCACAAATAGAGGAGGTATAAGTGTTGTAGGAAATCCTGGATTTAGTAGTAGCACAAATGCAGTTGGCGGTTCTATTCCTGGGATTCTGTCTACTTCTGCTGCTATTGGTAATCGAAATGCTGTTCCAGGATTGGGTGTATCCCCAATTTTGGGAAATGCAGGTCCTCGGATCACAAGTTCAATGGGAAATATGGTAAGTGGAGGCAACATAGGAAGGAGTATAACTACTGGCGGGGGTTTGTCATTACCTGGTCTTGCTTCTCGTCTAAACCTTGGTGCGAATAGTGGATCTGGAAGCTTAACTGTGCAGGGACAAAACCGTTTAATGAGTGGTGTGCTTCCACAAGGTACAATCCCAATTCCTTGAATTTGTGCGCAAAATACCTATTTTATGAGGCTATATTGAATGGAAATGCATTCATTACTATGTTTTAGTTAAAAATGTTCTATGCTACTTTTTCGTATATGACATTTTCTTGCTTCAGGATCTCAACAGGTTATTTCTATGTTAAGTAATTCTTATCCAAGTGCTGGAGGTCCACTTTCCCAAAACCACATACAGAATGTGAATAGTCTGAATTCTCTAGGGATGTTGAATGATGTGAACTCCAGTGACAATTCCCCTTTTGACATTAATGATTTTCCTCAGTTGACAAGTCGTCCAAGTTCTGCAGGAGGGCCTCAAGGACAATTGAGTTAGTAACTAGACATTGTTGGTTTTGTTTGTTTTTTTTTTCTTTTTCTCTCTTCGCCAATTTTGATTGTTAGAAATGTCATGTAATTGTTTCAGGTTCCCTGAGAAAGCAGGGCCTTAGTCCTATTGTTCAACAAAACCAAGAGTTTAGCATTCAGAGTGAAGACTTCCCAGCATTATCTAGATTTAAAGGTGCAAATCCCTTCTTTGCTTCTACTAGGTTTCATTCATGTAAATCATAAGCCAAAACTTTGTTTACTGCTCTCTACCCTATTCTTTTTAAGATTAAATACAACAATTTTGGATAACTGTTGTTGGGAATTATCTCAGTTGACCATGAGCAATAGCTTAATAGATTTAGTAGAATTTCAGATTTCGTTTTTCAAGTTTTCCCTTGCAATTATTAAGCTCAAGATCATCTTCATGGAGAGTTCTATTTTTCTGTCATCTGTTTGGATTTTAAATTCATAGCACATAGTAATGTCTTGCATACTTTGAATATGAAACAGAACACTTTCCATCATTGATTATAGTTCTAGATCTTGTGCAGGTGGCAATGTTGATTATGGCATGGACATTCATCAGAAAGATCAACATGAAAATTCTGTACCTATCATGCAGTCTCAGCAGTTCTCTGTGGGAACTCCTACTCTCTCATCTTCTGACTATCCTCATTTGGTGATGTGCTGCTTAACAACTTTTCCCTTGTTTTGATCTTCAGATTGGGAGATCTGCTGGATTTAACCTAGGGAGCACATACTCACATCGACCCCAGCAGCAGCAGCAACATTCTCCTGCAGTCAGCAACAGCACGGTGTCCTTTCCGCCTGCTAATAATCAGGATCTCCTCCATTTACATGGTTCAGATATATTTCCATCTTCACATGCTGCATCCTATCACCAGCAGGTGTGCAATTCTATTAATGCAATTCTAAAGGAAGTAAATATTTTTACCTTGCAGGCATAATCAAACTGTTCCTTTACTTAGATATTTCCATTCTTGGTGTTTTATCAACTGAAATACAGTCTCAACCTTTTATTCTCAAGTATTAAAAAATACATACTCAATGGGTTTAAATGTTTCGTAGATCAATCAGTTGCCTGTATGTCTTAATGTCTTCCCCATTGAATTTTTTCAATATCAACATTTCATTTTCATATTCAGTCTAGTGGGCCTCCTGGTATTGGTTTAAGACCTCTGAGCTCTCCTAACTCAGTGTCTGGAATGGGTTATGACCAACTTATTCAGCAATATCAGCAGCATCACAGTCAACCGCAGTTCCGGTTGCAACATATGTCTGGTGTTAGCCAATCATTTAGAGATCAAGGGATGAAGTCTATGCAGGCAGCTCAATCTTCTCCTGACCCATTCGGTTTACTTGGTTTGTTAAGTGTAATAAGGTTGAGTGATCCTGATCTTGCATCCCTTGCGCTCGGGATTGATTTGACCACGTTAGGATTAAATTTGAATTCAGCAGATAACCTTCACAAGACTTTTGGTTCCCCGTGGTCTGATGAGCCTGCTAAGGGTGATCCAGATTTCAATGTACCTCAGTGTTATCTTATTAAACCACCACCTTCTCTACATGTGAGTCTCTTCTCCTTTCCTCTCCCAGTCAACCTTCCTGCAGTTTTTATTTTTTTTTCTGAACTGATCATTGTTTTGGTTGACTACAGCAAGGATACTTCTCAAAATTCACTTTGGAAACGCTGTTTTATATATTTTTCAGGTGTGGTATATTTAAATAATTTGAACGTATTAATTTTGTAATCTTAATACATATTATTCTGATCTGTCTCGTTCTTCAGCATGCCCAAAGATGAAGCTCAGTTGTATGCTGCAAATGAACTGTAAGCTCTTATTATATATACCTACTGTGCAGTTTGTTATTTTCACCAAAGTTATATAAAGATAGTTGTGGGTAGAATTTCCCCTAAGGGCGATGTTGCCAACATTTTTTTGTTTGGTAGTTATAATAGAGGCTGGTTTTATCACAAAGAACATCGATTCTGGTTCATTCGGGTCTCTAATATGGAACCGCTTGTGAAAACTAGCTCGTACGAGAGAGGATCTTATCTCTGTTTTGACCCTCACACATTTGAAACTGTCCGCAAGGTTTGGAGTTTAATCTATATTTTTTCATTGAAATGAGTTGATGATAGACCCAACCATTGCCGCTGATGTTACGTTGAATTGTGTTCAGGATAATTTTGTGCTTCACTACGAGATGGTGGAAAAGAGACCAGCTCTACCGCAACATTAGCCATTTTCTTTTTCCTTTTTATTAAATGTAAAAAGGTAATTTGTGGATTTTTGTGTTATTAGCCATAGCTGTGTTTGTAGAAGTAATATTTTGTTAAATTTGATAATTTTATATCCATTCTGATGTGGGCCCCCTTGTTATTGTAATGAGCCGTTTTTGCTTCCCGGAAAAAGACAACTGTAGCGAGGCATATGTTTGATCACCCGTCGTTCTACATGATTATATATTTGGTTATTAGCTTAGTTTAGTTTGTTCAACTTTATCATATTAATAATAGTAATACCCAATTGATTAAATACCTTACTGTGGTGATTATGTGGTTATGGGTTTGGATTCACTTCAATATGTTTACTCTCACCAGTACTCCACAAATCCCATTATGGTTTGTGCATTAAATTAATTTTATTCCTAGTTATTTTCTTAATTTTACTTTCGTTTTTTTTTCTTTTCTCTATTACTTTTCTTTATTGTTTCTTAAGAAAGGTTAGAGTCATAGTGATATAATTTTTTTATGAGATATATTTGATAGAAAAATAATAATTATTAGTTGAAGAAAGATTAAAAGAAAAAGTGATTTTTCTTATATAAATGAAAACCAAATTTTAAAACTGGTATATCA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TAGGGAGCACATATTCACATCGACCCCAGCAGCAGCAACAGCATTCTCCTGCAGTTAGTAACAGCACGGTCTCCTTTTCGCCTGCAAACAATCAGGATCTTCTTCATTTACATGGTTCTGATATGTTCCCATCTTCACATGCTGCATCCTATCACCAGCAGGTGTGCTTTTTTATCACTGTAAATGAAGATTCCCCCCCTTGCATTGAAGTTTTCACTTTGCAGGCATAAGGAATTGACCAATATATTTTTATTCTTGGTGTCTTTATTAACTTGAAAGCCAATCATTCCCATGTATTATATGAATTGAACGGGTGTAAATGTTTTGTAGATCAATTATAGCCTATGTCTTAAATCTCTTTTCCAATGAAGTTTTTCAACATCAACATGCCTTTGTTTTTCTTCAGTCTATTGGGCCTCCTGGTATTGGTTTAAGACCTCTGAGCTCTCCTAGTTCGGGTTCTGGAATGGGTTATGACCAACTTATCCAGCAATATCAGCAGCATCACGGTCAATCTCAGTTCCGATTGCAACCTTTGTCTGGTGTTAGCCAGTCATTTAGAGATCAGGGCTTGAAATATATGCAGTCAGCTCAATCTTCTCCTGATCCATTCGGTTTACTTGGTTTGTTAAGTGTAATAAGGTTGAGTGATCCTGATCTTGCATCCCTTGCTCTCGGAATTGATTTGACCACGTTAGGATTAAATTTGAATTCATCAGATAACCTTCACAAGACTTTTGGCTCCCCTTGGTCTGATGAGCCTGCTAAGGGTGATCCAGATTTCAATGTACCTCAGTGTTATCTTATTAAACCACCACCTACGCTCCATGTAAGGTTCTTTACCTTTTACATCCTCCTCCTAGTCTATGTGAAACTTTCAACAGGTTCTTCTCAACTAATATTTTTTTTGTTAACTGCAGCAAGGATACTTCTCAAAATTTACTCTTGAGACACTTTTTTATATATTTTTTAGGTACGGTATATAAATACTTCAACGCTCTTTTTCTCCTTTTTTTAAACTTTTGTTATATAATTCTGCTCTGTCTTGTCCTGCAGCATGCCAAAAGATGAAGCTCAGTTGTATGCGTCAAATGAACTGTAAGTCTTATTATTGACTCTGTGCGGTTTGTTATTTTGACCATAAGTAATTTATGGGCGTGACTTAAGCTTGGACCAACCTTTTTTTGTATAGTTATAATAGAGGCTGGTTTTATCACAAAGAACAACGTTTCTGGTTCATTCGGGTCTCTAACATGGAACCACTTGTGAAGACGAACACTTACGAGAGAGGATCGTACCTCTGTTTAGACCCCCAAACATTTGAAACCGTCCGCAAGGTTTGTACTTTGTCAATACTTTTCATTGAAATGACCTATACCACTGCTGCCCCGTATTCCCATTGTGCTCATGTTGCGTCCATTGGCTTCAGGATAATTTTGTTCTTCACTACGAGATGGTAGAAAAGAGACCAGCTCTACCACAACATTAATTTTTGTTTTTAATAAAAAATGTAAAGGTAATTCGTGGATTCTTCACATGTAAGCCTTAGTTCTATTTGTAGAATTAATAGTTTGTAATTTGGTAAGCGTAATTGATCATGTAGGCCCTTGTAATTGTAATAAGCCGATTTATTGGGTTTCTTCTCTGCTGTTTTACAAGATACACTAGCTTAGCTTGAACATCGTTTATCTTATGAAGAGCTGTCACATAATTTCTATATTGATTTTAAAAATGAGTTCAGCATAGCATTTCTAGAACTGATGCTCCTTAATTCCAATGAAGTAGGACCCTGCTGTTGCTCGTTTGAACAACATCCTGCCAATCAATGTAAGTCCATTCTTCTACCTTGTTTTGAAACTGTTTTTTATTTTTATTCTTTTTGTTTTTAGAACTGTTTTTAAAATCTATATGTTTGATGACTTGTAAATGTAGATTTTTATGTTTCTATGTGAATAGAATAACTTTTTTTGATCTGAAAAATAGTGTTTTTTTTTTTTTTTAATTTCTACAGGAACACACTAAATTTGAAAGTTTAAATATTTTTACAGGAAAATAGTGTTTATAGATTTGTAACAAATTTAAATATTTTGAAAGTTTTCAATTTTACATCTAATAGATTTATGAGTTGTTATTGTGCAAGTTGAGGATCAATCAGACAAAAACGGGAGTCGTCGGAGACATGGATGTGGACGGAGAAGACTTTTCCTTTCTCCATCCTGCCTCGTGAACGTCCCTTTTAAATGTGTCTCAAGATGTGGTTTTATCACTGGTAGCTTGAATGTGTTTGAGACAATGTTACATTTTCGACATATAGTCAAACATCGTTGACCGGTTTTAGGGTTCTCACTACACATACAGCAGATGATCGAGCTTTGAGCCTCGTTTAAGTTAATAACACAGGAAATGAAAGAAAGTGGATAGTGAAAACCAAAGCACCCTACTACAGAACACTGTAAATAAGGGTCAGCCCACAAAACAGAGAATTCAAAGTCATTCATATCAACTACAGTACAGATTTACAGGTGAGATTATAAAGGCAGAGCAGGAAGCAGGAAGCAGGAAGCAGGAGCAGCCATGGCCTATGGATCACTGA 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ATGTCGGGTTTACTTAATTCATCTGTTAATGGATCAGCTTCAAATCTTCCAGATGGTACTGGGCGATCTTTTGCTAACTCATTTTCTGGTCAGTCTGGTGCAGCTTCCCCTGTTTTTCATCACTCCGGAACTATCCAAGGGTTGCACAACATTCACGGAAACTTCAATCTTCAGAACATGTCAGGTGCACTAACTTCAAGAAATTCAACAATAAATAATGTTCCATCTGGTGGGGTGCAGCAACCTACTGGAACAATTTCCAGTGGGCGTTTTGCATCAAACAACCTTCCTGTTGCTCTTTCTCAGTTATCTCATGGCAGCTCTCACGGACATTCAGGAGTCACAAATAGAGGAGGATTGGGTGTATCCCCAATTTTGGGAAATGCAGGTCCTCGGATCACAAGTTCAATGGGAAATATGGTAAGTGGAGGCAACATAGGAAGAAGTATAACTACTGGCGGGGGATTGTCATTACCTGGTCTTGCTTCTCGTCTTAACCTTGGTGCAAATAATGGATCTGGAAGTTTATCTGTACAAGGACAAAACCGTTTGATGAGTGGTGCCCTTCCACAAGGATCTCAACAGGTCATTTCTATGTTGGGTAATTCTTATCCTAGTGCTGGAGGTCCCCTTTCCCAAAGCCACATGCAGAGTGTGAATAGTCTGAGCTCTCTGGGGATGTTGAATGATGTGATCTCTAATGACAATTCTCCTTTTGATATCAACGATTTCCCTCAGTTGAGTAGTCGTCCAAGTTCTGCAGGAGGTGCTCAAGGACAATTAAGTTCGCTGAGAAAACAAGGTCTTAGTCCTATTGCCCAACAAAACCATGAGTTCAGCATTCAGAATGAAGACTTTCCAGCGTTACCTAGATTTAAAGGTGCAAATCCTTTTGTTTCCAGTCGGATGCATTCATGTGGCAATGCTGATTATGGGATGGATATTCATCAGACAGACCAACATGAAAATTCTATGCCTATGATGCAGTCTCAGCAGTTCTCTATTGGAAGGTCTGCTGGATTTAACTTAGGGAGCACATATTCACATCGACCCCAGCAGCAGCAACAGCATTCTCCTGCAGTTAGTAACAGCACGGTCTCCTTTTCGCCTGCAAACAATCAGGATCTTCTTCATTTACATGGTTCTGATATGTTCCCATCTTCACATGCTGCATCCTATCACCAGCAGTCTATTGGGCCTCCTGGTATTGGTTTAAGACCTCTGAGCTCTCCTAGTTCGGGTTCTGGAATGGGTTATGACCAACTTATCCAGCAATATCAGCAGCATCACGGTCAATCTCAGTTCCGATTGCAACCTTTGTCTGGTGTTAGCCAGTCATTTAGAGATCAGGGCTTGAAATATATGCAGTCAGCTCAATCTTCTCCTGATCCATTCGGTTTACTTGGTTTGTTAAGTGTAATAAGGTTGAGTGATCCTGATCTTGCATCCCTTGCTCTCGGAATTGATTTGACCACGTTAGGATTAAATTTGAATTCATCAGATAACCTTCACAAGACTTTTGGCTCCCCTTGGTCTGATGAGCCTGCTAAGGGTGATCCAGATTTCAATGTACCTCAGTGTTATCTTATTAAACCACCACCTACGCTCCATCAAGGATACTTCTCAAAATTTACTCTTGAGACACTTTTTTATATATTTTTTAGCATGCCAAAAGATGAAGCTCAGTTGTATGCGTCAAATGAACTTTATAATAGAGGCTGGTTTTATCACAAAGAACAACGTTTCTGGTTCATTCGGGTCTCTAACATGGAACCACTTGTGAAGACGAACACTTACGAGAGAGGATCGTACCTCTGTTTAGACCCCCAAACATTTGAAACCGTCCGCAAGGACCCTGCTGTTGCTCGTTTGAACAACATCCTGCCAATCAATTACAGATTTACAGGTGAGATTATAAAGGCAGAGCAGGAAGCAGGAAGCAGGAAGCAGGAGCAGCCATGGCCTATGGATCACTGA MSGLLNSSVNGSASNLPDGTGRSFANSFSGQSGAASPVFHHSGTIQGLHNIHGNFNLQNMSGALTSRNSTINNVPSGGVQQPTGTISSGRFASNNLPVALSQLSHGSSHGHSGVTNRGGLGVSPILGNAGPRITSSMGNMVSGGNIGRSITTGGGLSLPGLASRLNLGANNGSGSLSVQGQNRLMSGALPQGSQQVISMLGNSYPSAGGPLSQSHMQSVNSLSSLGMLNDVISNDNSPFDINDFPQLSSRPSSAGGAQGQLSSLRKQGLSPIAQQNHEFSIQNEDFPALPRFKGANPFVSSRMHSCGNADYGMDIHQTDQHENSMPMMQSQQFSIGRSAGFNLGSTYSHRPQQQQQHSPAVSNSTVSFSPANNQDLLHLHGSDMFPSSHAASYHQQSIGPPGIGLRPLSSPSSGSGMGYDQLIQQYQQHHGQSQFRLQPLSGVSQSFRDQGLKYMQSAQSSPDPFGLLGLLSVIRLSDPDLASLALGIDLTTLGLNLNSSDNLHKTFGSPWSDEPAKGDPDFNVPQCYLIKPPPTLHQGYFSKFTLETLFYIFFSMPKDEAQLYASNELYNRGWFYHKEQRFWFIRVSNMEPLVKTNTYERGSYLCLDPQTFETVRKDPAVARLNNILPINYRFTGEIIKAEQEAGSRKQEQPWPMDH Homology
BLAST of CmoCh02G008440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q52JK6 (Probable NOT transcription complex subunit VIP2 (Fragment) OS=Nicotiana benthamiana OX=4100 GN=VIP2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 773.9 bits (1997), Expect = 1.5e-222 Identity = 412/600 (68.67%), Postives = 471/600 (78.50%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FPW4 (Probable NOT transcription complex subunit VIP2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VIP2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 677.6 bits (1747), Expect = 1.5e-193 Identity = 386/660 (58.48%), Postives = 466/660 (70.61%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9NZN8 (CCR4-NOT transcription complex subunit 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CNOT2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 137.5 bits (345), Expect = 5.4e-31 Identity = 75/161 (46.58%), Postives = 98/161 (60.87%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8C5L3 (CCR4-NOT transcription complex subunit 2 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Cnot2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 119.8 bits (299), Expect = 1.2e-25 Identity = 144/546 (26.37%), Postives = 218/546 (39.93%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P87240 (General negative regulator of transcription subunit 2 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=not2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 116.7 bits (291), Expect = 9.9e-25 Identity = 66/168 (39.29%), Postives = 97/168 (57.74%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G5Z5 (probable NOT transcription complex subunit VIP2 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451093 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1138.6 bits (2944), Expect = 0.0e+00 Identity = 594/656 (90.55%), Postives = 599/656 (91.31%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L4Y9 (probable NOT transcription complex subunit VIP2 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499942 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1116.7 bits (2887), Expect = 0.0e+00 Identity = 582/656 (88.72%), Postives = 596/656 (90.85%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G5W2 (probable NOT transcription complex subunit VIP2 isoform X4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451091 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1104.7 bits (2856), Expect = 0.0e+00 Identity = 566/618 (91.59%), Postives = 587/618 (94.98%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KYQ8 (probable NOT transcription complex subunit VIP2 isoform X4 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499941 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1096.6 bits (2835), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/618 (90.78%), Postives = 585/618 (94.66%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G5I6 (probable NOT transcription complex subunit VIP2 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451091 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1085.9 bits (2807), Expect = 0.0e+00 Identity = 566/656 (86.28%), Postives = 587/656 (89.48%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. NCBI nr
Match: XP_022947130.1 (probable NOT transcription complex subunit VIP2 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1138.6 bits (2944), Expect = 0.0e+00 Identity = 594/656 (90.55%), Postives = 599/656 (91.31%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. NCBI nr
Match: XP_023532183.1 (probable NOT transcription complex subunit VIP2 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1127.9 bits (2916), Expect = 0.0e+00 Identity = 587/656 (89.48%), Postives = 597/656 (91.01%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. NCBI nr
Match: XP_023532184.1 (probable NOT transcription complex subunit VIP2 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1120.9 bits (2898), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/656 (89.33%), Postives = 596/656 (90.85%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. NCBI nr
Match: XP_023007444.1 (probable NOT transcription complex subunit VIP2 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1116.7 bits (2887), Expect = 0.0e+00 Identity = 582/656 (88.72%), Postives = 596/656 (90.85%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. NCBI nr
Match: XP_022947129.1 (probable NOT transcription complex subunit VIP2 isoform X4 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1104.7 bits (2856), Expect = 0.0e+00 Identity = 566/618 (91.59%), Postives = 587/618 (94.98%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. TAIR 10
Match: AT1G07705.2 (NOT2 / NOT3 / NOT5 family ) HSP 1 Score: 808.5 bits (2087), Expect = 3.9e-234 Identity = 434/624 (69.55%), Postives = 509/624 (81.57%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. TAIR 10
Match: AT1G07705.1 (NOT2 / NOT3 / NOT5 family ) HSP 1 Score: 731.5 bits (1887), Expect = 6.0e-211 Identity = 399/575 (69.39%), Postives = 470/575 (81.74%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. TAIR 10
Match: AT5G59710.1 (VIRE2 interacting protein 2 ) HSP 1 Score: 677.6 bits (1747), Expect = 1.0e-194 Identity = 386/660 (58.48%), Postives = 466/660 (70.61%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. TAIR 10
Match: AT5G18230.1 (transcription regulator NOT2/NOT3/NOT5 family protein ) HSP 1 Score: 52.0 bits (123), Expect = 2.1e-06 Identity = 30/97 (30.93%), Postives = 46/97 (47.42%), Query Frame = 0
BLAST of CmoCh02G008440 vs. TAIR 10
Match: AT5G18230.2 (transcription regulator NOT2/NOT3/NOT5 family protein ) HSP 1 Score: 52.0 bits (123), Expect = 2.1e-06 Identity = 30/97 (30.93%), Postives = 46/97 (47.42%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata (Rifu) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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