Cmc08g0225141 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TCGAAACTGAGATTGTAAAGGGCAAAAACGATGAAGAGTTGAGTTATTATTACAAATTGAACTCAAAATGTTCACGATTCAAATATGAACTTTTTATTACATTACATAACAAACTCAACACATTACACGTTACCAAACATTCCTTATATAAATAAGAAGTAAAAACCAAACTGAAATATTTTTTATGGGTAAAATAGGAAGAAAAAAAATAGATACAAAATTGTAATTGAAATAAAGAGAACAAAATTTCAAAAATCCTTTTTAATTTTCATCCTCCATCACACTCGTTTTCTGCTTAAAATTCTTAAGCAATTTGGGCCTAGGGTTCATGGGCTTCAAAAACCCAGCTTGTAACCTAACCATTTCCCTCAAGACCCCAATCAATTTCTCCTCAACCGCCGCCCCATCCAACTCCATCACTCTCAAACACCTCGCCACAGCCTCCATCGTACTAACACATCCGCCGTGCGGTTCCTTCCTCAGAATCAACTCCGAATCAAATATGCTTCCGCCTTCAACACTCTCATCGATGTCCAAACAAACTCTCCTCGCAAACCTTGACAGAAACTCCTCGCTCGATCGCACCATCTCCTTCGCGTGCTTCCACGTTCCGTCGAACGCTATCAGGACCAGATCTTCAGTTATGTTGAGATCCGAGATGTTGATCGGCGGCGAGGAGTGAGGTGTAGGCGGGAAAAGGAAGACTGCGGGAGGGGATTGGTCGAGGAGTTTGGAGAGACCGGGCTTGAGGCGGCGATTGACGATGGTTGTTGCGTTGAGGAGGCATTTCGTGAGGATTGGTGTAGTGGAGAGCTTGTGTTGTGATTCGTGAGGATGTTGTAGTATGATGATTTTTGTTTTTGTTGCGATTGGTGAAGATGGAAGGAATTTGCAGAGGCAGACTGGTTGGGGACGGTTGCAATTAGGGCAAATTGGCCGCCGAGGCGGCCGGGACGACGAGGAATATCCGGCGGCGAAGTTGTGGTTGTTTGTTGACTCCATGCCTCTGGAGAAAACGATACCGTTTTGATGTGTTGCTTCCTCGACTTTCGTTTTAGGGTAAGGCATGATAGCATCTTACCTTAGGGTGTTCGACGGTTGGGTTCATTTTTTTTAAACCGAAATTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAGAAAATATAGTTAATATTTGAGGTGTTTTCAAAAGTATAACACAGAAAACAAAAAAATTCCACCTTGCAATAAAAAATACCTCTACGTCTAGCATTGGCTAGATTTGGTATTCTTATTATATTATCCTTAGATTTTTTAGATTTGTTTATTTATATTTAAATAACAATTATTTTTAGATTATTTTTTATATTTGATATTTGATTTAATATAAATCAAAATTTATGGTTGATTGAAAATAAATATCATAATTTTTAGAAAATATATAAAAGATTACAGAAGAGGAAAGAGAAATTGCAGAAAAAGAGAAGAAAGAAGATATAAAATGTGGTCAAAGTTAGAATATTTTTAAAATTATAATTGGCTTCATGTATTTTAACTACAGTAAATATTTTTGTGTTTTATATTATTATATTTATGAAAATTAACATGTGAAGATTTCTATTTTTTTTTTAATTTTCTTTAAATTTATGTAATTTTCTATTAAATGAAGGTGTGTCTAGGAGTTCTCTTCCCGAATTCATTTTGGGACACATGTTTCATAATATGGATATTTAATTTATAGGATTTGCGAAATCACTTGAATGTTGGATGTTGTTTCATGGGTATAATTCAATAATTTGTAAAAAATAAAATTAATTAATTACTTAACTAAAGAACGGAGATCAATTAAATCTAATGGGGTTTTCATAAAATATTTAACAATTTTGAAAACGAAAAAAGTCATACGTTCATGATTAGAAATACAAAAAATGCTCCAATTAACTATGCACAATCGTTCACAATGCTTGTGTAATATTCTTCTAAATGAGTGATCTAATATCATTTAGGTCATGATACTAGATTGTGTAGTTTTTTTTAACAATTGAAAAAAAATGCTTTAAATTCAAACGATTATGCACGATTGTGTATTTCTTTTAGCAATGAGAAAAAATATTTCAAATTTAAGCGATTGTATTGTCCATGTCAAACGATTGTGTTGACTATAACAAATGATCAACACAATCATGTTGATTATGAAAAACAATCGTGTTGATCATAGTAAGCAATCATATAATTCAATGTAAATAATCATTAAAAACTTCAAATAAGATGATCGTGTTTACCATGCTAAATAATCGTGTTAACTATGGTAAGTGATCGTTAAGACGATGGGGAAATAATTTCAAATTTAAAAGATTGTGTTGATCATGGTAAATGATCATATTAACAATGTTAAACGATCGTTTAGATCATGTCAAATGATATTTAAACGATTTTAATATTCTCGAATATGAGAAAGATGAGTAACTTCATAGATTTTTGTCGAAAATGGTGAAGATGTAATAAAAGATTTAAACTGAAGAATAAATCGTTTAAAAATAGAAAAGAGAAAATCTGAAAGAGAAGATGAAGAAATCTAGAAGAGAATATAGAGTAAATGTCACACCCCCTCCCGGACCACCTGCTACCTTAGACCGAAAGATGGCGTGAAGCCGACGAACAACGCTTTTCTGTACTTGTATCTGTCGACTCTGCTTAAAACTTTCATGTGATGAACTTGCCAATCTAGTATATAAACTATTGTACATGCCACAAAACACAGCGGATCCTAGGCTAGTCAAACACAGCTAGTCAAACACATACATGAAATGTACCTCAAAATTTACCGATTTCACGAGCAAACCTAAAGACACCCTAATTAAAATATAACCAACAAAATTTACACAACTACAGCTCCTAAAGCTTATACAAACTGTGGAGTATCTATAACATACAAGGGTGTGAATACATCACAACACAACAGACTTTATGCCCAACTCAAAACACGTACTGGCAATCGATAATGAAGCTTCCGCAGACTAAGGCAGTCTATCAGGCACCGGGAAGTCGATCTCTACCTGGAAAATGGGTAAAACATTTTGGAAAGGGTGAGCTATGAAGCTCAGTGAGTGACTCAGTTTAAAACTATGAATTTAAAGATAAGAGCACGTGAAAACTTTACACATATAAATCTATTTATACAAGTCGTAAATGTAAATGTGTAATAGTAAGAATAGCTTCCTTAAATACTCAGCAAGTTCATCATTGAAATCTAGCAAGGCATATCAAGTATATCGAAGCATTTTAACTAACATGACGAATCTACGTTGTGTAGGGTACACCTTGTACAACAACGTTTACAAGCACTACGATGTAGTGGGGTCCGCCCAGCACTCCCATCGTCTTTGTCGTAGTGGGGCCCGCCCAGCACTCACGACAGCATTGTTGTTACGGAGTACACTCAACGTCAACAACGAAATCTAACTAGTGTGCACACGGTAATCTCTAGCCTCAGGCTCAAGATCTCAGTCATGTAGTTAATGAAAATTTCATAAATCATCATAAAATATTAAAACATGCCTGCTTATAAATTTTACACAAAGCTCGAACTTTACTCAGCTCTTTCGTGGAAAATTGTAGTTCTTAAAACAAAACTTCATACTAATTCATACTTTGCTTAAAATATTGTGGTTTAAATACTTTCCAAACATTTAATATCTACGTGCTAGCGTAAATTTCTTTAAGAAATCTAGTCTCCAAATGTATACTTGAAAATAGTCATGAAATTCAAATACCTTTCATGGCTTCGTAAATAAACATTTATCGCATTCAATCATAATAACAGTTATGGAAAATATTTCAAAGTTGGTTTTGTCACTCACAGTCTTGGGCTAGATCCTTGGTCTATAAGCTCGGTTTAATTCTTCTCGGCCTGCCAACAACCCAACCGAGTATTAAAACCCTAAACATTCTGTTTTCCTAAAGATATACATAACATGTCGCACCAAAGATGACGCTCACGAAAACAAAGCTTAAGAAATAAAATCCTATTTCAACAATTCTCTAAAATTTCCAGATTTCTAACATAAACTTCAGAGAACTATAACTTTCTCAATACTTAACCAAAATGAGTGTTCTTTATATCAAACTCTTCGTTTTGAGATCCTCTAAAACTTACCTGAAGACATATAAATCTGATTCCCCGTGCATAAACACATATAACCCTCAAAACAGAACCACTTCCAGAATCGCGCGCACACGACCTCTTTAACTTGTTCCTACGATTTAACCAATTTTTAGTCGTTTTTGTTTACAATTTCTTCATGAAAGTTGTAGTAAATTGAATAAGCTTTCCAACCATACCAAATAGAAATTCTGTAACGACCCAACTTTTCCGGACTAAGCTGAGGTCACTACCAAATACCAAAACTCGACCACTCAACTTAAAAGTTTAAAACGGACCAGATACGATTCATTAAAACGTTATAAACCTTACAAAAGACAGTTTTGGGCCCTATTTTAAATAATTCAAAAAAAAAATATCACAAAATAAAATATCAAGTCACCAGTCCAAAATCACAGTCAAAATATTCTGACAAAATACATAGCGGAAGCGAAAAGAAAACCAGACGCGTCCATATGGCCTTCACGCACCCTTCCTGCCTCTCGTCGGTCTGCCCCTCGCTGTACCCCTACCTGAAAAGTTAAAGAAAAGAAAGGGTGAGTATAAACATACCCAGTAAGGGACCCACTACTGGGCCCGTTAGGGAACAACAGTTAACTTCCTATTCGGGGGTACCCTACATAACAGTCTAGTGGTTCCGTAGAACGCACATATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACATATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACATATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACATATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACATATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACATATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACGTATCCGTAAGGTACACTACCCCATAGATGAAG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ATGCCACCAAGGAGAGGTGCACGTAGGGGTGGCCGAGGAGGCCGAGGAAGGGGAGCGGGACGCGTTCAGCCTGAGGTGCAGCCTGTAGCCCAAGCCCCTGACCCGGCTGCGCCAGTTACTCATGCGGACCTAGCCGCCATCGAGCAGAGGTTTAGAGATATGATTATGCAGATGCGGGAGCAGCAGAAGCCTGCCTCGCCAACTCCGGCGCCAGCTCCAGTACCAGTTCCTGCTCCAGCTCCGGCTCCGGTACCAGTTGCACCCCAGTTTGTGCCGGATCAGTTGTCAGCAGAGGCTAAACATCTGAGGGATTTCAGGAAGTATAATCCCACGACGTTCGATGGGTCTTTGGAGGACCCCACCAGGGCTCAGATGTGGTTATCATCCTTGGAAACCATATTCCGTTACATGAAATGCCCTGAGGATCAGAAGGTTCAGTGTGCTGTTTTTATGTTGACTGACAGAGGTACTGCATGGTGGGAGACTACAGAGAGGATGTTAGGTGGTGATGTGAGTCAGATCACGTGGCAGCAGTTCAAGGAGAGTTTCTATGCGAAATTCTTCTCTGCCAGTTTGAGAGATGCCAAGCGGCAGGAGTTTCTGAACCTAGAGCAGGGTGACATGACAGTGGAGCAGTATGATGCGGAATTTGACATGTTATCCCGCTTCGCTCCCGAGATGATAGCGACCGAGGCGGCCAGAGCTGATAAGTTTGTTAGAGGCCTCAGACTGGACATTCAGGGTTTGGTCCGAGCTTTCAGACCCGCTACTCATGCCGATGCACTGCGCCTGGCAGTGGATCTCAGTTTACAGGAGAGGGCCAACTCGTCTAAAACCGCTGGTAGAGGTTCGACGTCGGGACAGAAGAGGAAGGCTGAGCAGCAGCCTGTTCCAGTGCCACAGCGGAATTTCAGACCAGGTGATGAGTTTCGCAGCTTCCAGCAGAAACCTTTTGAGGCAGGGGAGGCTGCCAGAGGAAAGCCGTTGTGTACCAGTTGTGGGAAGCACCATTTGGGCCGTTGCTTATTCGGGACCAGGACCTGCTTTAAGTGCAGGCAAGAGGGTCATACAGCTGATAGATGCCCGTTGAGAGTCACGGGGATCGCGCAGAATCAGGGAGCAGGTGCTCCACATCAGGGTAGAGTCTTTGCTACCAACAGGACTGAGGCTGAGAAGGCAGGCACAGTAGTGACAGGGGTACTGCGAGGGGCAGACCGACGAGAGGCAGGAAGGATGCGTGAAGGCCATATGGACGCGTCTGATTTTCTTTCGCTTCCGCTATGTATTTTGTCAGAATATTTTGATTGTGATTTTTGGACTGGTGACTTGACATTTTATCTTGTGACTTTTGAATTATTTAAAATAGGGCCCGAAACTGTCTTTTGTAAGGTTTATATTGTTTTAATGAATCGTATCTGGTCCGTTTTAAATTTTACGTTGAATGGTCGAGTTTTGGTATTTGGTAGTGATCTCAGCTTAGTCCGAAAAAGTTGGGTCGTTACACATAGGCTATCCCCATCGCATGGGATCTTATTACGTAAAGGTAGATCGTAA MPPRRGARRGGRGGRGRGAGRVQPEVQPVAQAPDPAAPVTHADLAAIEQRFRDMIMQMREQQKPASPTPAPAPVPVPAPAPAPVPVAPQFVPDQLSAEAKHLRDFRKYNPTTFDGSLEDPTRAQMWLSSLETIFRYMKCPEDQKVQCAVFMLTDRGTAWWETTERMLGGDVSQITWQQFKESFYAKFFSASLRDAKRQEFLNLEQGDMTVEQYDAEFDMLSRFAPEMIATEAARADKFVRGLRLDIQGLVRAFRPATHADALRLAVDLSLQERANSSKTAGRGSTSGQKRKAEQQPVPVPQRNFRPGDEFRSFQQKPFEAGEAARGKPLCTSCGKHHLGRCLFGTRTCFKCRQEGHTADRCPLRVTGIAQNQGAGAPHQGRVFATNRTEAEKAGTVVTGVLRGADRREAGRMREGHMDASDFLSLPLCILSEYFDCDFWTGDLTFYLVTFELFKIGPETVFCKVYIVLMNRIWSVLNFTLNGRVLVFGSDLSLVRKSWVVTHRLSPSHGILLRKGRS Homology
BLAST of Cmc08g0225141 vs. NCBI nr
Match: ADN33767.1 (gag protease polyprotein, partial [Cucumis melo subsp. melo]) HSP 1 Score: 778.5 bits (2009), Expect = 3.6e-221 Identity = 394/401 (98.25%), Postives = 396/401 (98.75%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc08g0225141 vs. NCBI nr
Match: TYK01613.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 778.1 bits (2008), Expect = 4.8e-221 Identity = 395/405 (97.53%), Postives = 398/405 (98.27%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc08g0225141 vs. NCBI nr
Match: KAA0054678.1 (gag protease polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 772.7 bits (1994), Expect = 2.0e-219 Identity = 394/405 (97.28%), Postives = 397/405 (98.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc08g0225141 vs. NCBI nr
Match: KAA0053290.1 (gag protease polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 769.2 bits (1985), Expect = 2.2e-218 Identity = 391/405 (96.54%), Postives = 393/405 (97.04%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc08g0225141 vs. NCBI nr
Match: KAA0036197.1 (gag protease polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 3.8e-218 Identity = 392/409 (95.84%), Postives = 395/409 (96.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc08g0225141 vs. ExPASy TrEMBL
Match: E5GBB7 (Gag protease polyprotein (Fragment) OS=Cucumis melo subsp. melo OX=412675 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 778.5 bits (2009), Expect = 1.8e-221 Identity = 394/401 (98.25%), Postives = 396/401 (98.75%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc08g0225141 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BPI1 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold451G002120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 778.1 bits (2008), Expect = 2.3e-221 Identity = 395/405 (97.53%), Postives = 398/405 (98.27%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc08g0225141 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UI54 (Gag protease polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold24G004990 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 772.7 bits (1994), Expect = 9.7e-220 Identity = 394/405 (97.28%), Postives = 397/405 (98.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc08g0225141 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UDK9 (Gag protease polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold102G001010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 769.2 bits (1985), Expect = 1.1e-218 Identity = 391/405 (96.54%), Postives = 393/405 (97.04%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc08g0225141 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T3M7 (Gag protease polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold69G00720 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 1.8e-218 Identity = 392/409 (95.84%), Postives = 395/409 (96.58%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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