Cmc02g0046081 (gene) Melon (Charmono) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTTGAAAAAAAATAAAATGCCACTTCTCCGAAAAAAAAAAAAATTATTTGTTTCCCTCCGCACTTTTGCTCGCTCCTTCTTCGCTGCTGCCGCATAACACCGGCAGTTCAAAATTTGTGTGTGTTTTTTTTTCCGACTCTCCAATTGTGAAGATTTTTTTTTCGTCTAAGTTTCTGAAGTTAAATATGTGAGTTCAGAAATTGGCTTTCCTGTTTCTCTGCCCACCTCATGATTTTTAGATGGTTTTCTATCTCTCTCTTTTCTCCTGTGAACTGGGTGTTGTACTTTTTGTCCATATGGATTCAGTATTGACATAATGGGTCAATGGAATGTAAAATATGGACCAGGTGTTCGTATTTGCATTTCAATTAAATTTTTTTATGATAGTGCTGCTCATATTTATATTTAAATTCTCGCTTTTGGAACTTGATATGATACCCTTGGATGAAATGCTAATATGCGAATGCTATGCTTCCTCAATTGGTTTTTCTTTTAAGCTTTTATATTCTGTTTTCTGCTGTGTGTGATTAGAGGAGGCTTTAAGTACATATAGCTTAGCTGTTTCTTGTAAACAAAGATTAAGTTTTGCAACGCAACAGTTTTGCAATTTCTTCTTTCATTTGCTTGTGGCTTTCTACAGTTTTTCGATTATGTTCACCTGTATAGTAATAGATTTATTTTATGATTTTACTATATATCTATCTGGCGGCCTGCATTACAAGATGAACTTTAGTTTTGTTATTTTATTAAAAGGTTGCTAGCTTACATTCTAAGTTTTTTTTCAAATTGTTTGTATAAGCCAACTGGAAATTCTGCAAATTAATTTGTATTTGTAATGTTCTATTTAAGGTATTGGGAGATTAATGATTATGCTTACCAGATTTTTATTTTGTTAGATTTTCAGATGAGCTTGGGCTATTCATCTGTTCTCGTTGATTCTAGTTATCAATTGTGAAGGAAAGTTCCATAAGAAATTTCTGGACTGCCGTATTTGAGTGACAATCTTAGCAAGTTCACTTATGTCTTCACTTGTTAAGACTTCTCCCTTCTTTTTATATTTCACTAAAATTCCGTGGGTATTTCCCTGCCAGAACACCCTTCGAGCTAGCCTCCAAACATATAGCTGCCGGTCTATTGTGTTTTCAAAAAATATACTGAAATACAGTTGCAACAGTTACTTCCCGATACACACAGTTCGATATTTATGTAATGTTGCTTCGGCTGCCACTTCATCTGTTCATGCATCCTCAACACCTTCTTCCAATAAAGGCTCCTACAAATTAAGGAAGAAATTAATGAAGAAAGACTCCAGGGATGCACCAGAGAATGTGCTTAGATATAAATTAGATATGTGCTCAAAATATGGACAAGTTGTCAAAGCACTTGAGCTTTATGATGAGGCACGAAGTGATGGCGTCCAGCTTATCCTACATCACTATAATGTATTGCTCTATTTGTGCTCTTCCCCTAGTTTGCTTGAAACAAGTGGGGCTAACAACTTATTAAGTGTGGTCCTCAGCAGGGGTCTTGAGATATATCAGCAAATGATTACTGATAAAGTATCCCCAAACGAGGCTACATTTACTAGTCTTGCAAGAATTGCAGGTGCAATGGATGATCCAGAAATGGCATTTTCTTTGGTGAAGCAGATGGAGGATTATCATATTGCACCAAGATTGAGGTCATATGGACCAGCGCTGTTTGGTTTCTGTAGGAAGCTAATGCCCGAAGGAGCTTATGAAGTTGATTCTCACATGCTTGCATCTGCGGTAGAACCTGAAGAACCTGAGCTTTCTGCTCTTCTAAAACTCAGTTCTGATGTGAAGAGGGCTGATAAAGTCTATGAGTTGTTGCATCGGTTAAGAAGAACAGTGAGGCAGGTTTCTGAACCTACTGCCAAAGTTATTGAAGATTGGTTCAATTCTGAAAGTGCATCAGAAGTTGGAAAGAAACATTGGGATGTGGACAAGGTTAGGGAAGGTATCGTTAGACGTGGTGGAGGGTGGCATGGAGAAGGTTGGCTGGGTAGTGGTAAGTGGAGGCTGGTGAGAACTGGAATTGATGATAATGGTGTTTGTCATTCATGTGCTCAAAAACTTGTTTGCATTGATATTGATCCAAAAGAAACTGAAGACTTTGCTTCCTCATTGACCAAGTTGGCTAACCAAAGAGTTAAAGATAATTTTGGTAAATTCCGGGTATGATATTTCTTTTGCCATCCCCAAAATCTATGATGTGAAGTTCATGGAGTGAATATTTTGCAATAGTTACCTGTTTGGGAACTTTTATGTAGCGCAATTAAGTATATATCTGAAATATTTGAGTGGGTAGATCAATTTTTTAAAATATTTTTAAATTTAACATTTTATTTTCGTGGAAAAAATTGATTTACCAATTTCTTGGAGCTACAAGGTATCTAACAGTGAGCTACAAGGTCTCAATTTTCGTTTCTTCTTCAACGGTTTTGTTGTCCACCATCAAGAGTCTCAACTCCTTGCTTTTGCACTTGTGTCCCACAATGAACTTCTCATCACATTTGAGATACAATGCATGTGCTCTTTCCTTAATTGGAGTTTAACGTGTGTCAACTCTTTGTAGGGATATTCTTTTAGAAAATTTTGATAATGACCTGCTAGTGTGATGGTTAGGATGAGATTGACTTCTACGGCCTTGGGCTGGTCCTTAACTAAACTATTAAGCCAAAATGTCAGCTGGCTGTTTTTTGGTGGCTTGATTGGGCCAGGGCTTGACTTTGATGCCACAGTCAGATTTATGCCTTCCACTTTTTGGTTTGCTTTCATAATCTGGCTGAAGCCCACCCGTTCAAGGCATACTCATTACTTTTGCTATCACATCTACGTCAAGGCCATTTAGAAACGTGCTCTCTAAGACTTCTTCTAACAAATGTGGAAGAGGTGCTGCCAGAGCCTTAAATCTGTCCATGAATTCTACTAATATCTGCTTTTGCAGCAGATGGAATCAGGTTCACATTTTCTCTTTCAAGTCAAACCATCCTTGAATGGGTAAAGGTGATCACTGCCATGGTCACTTTTTTGGTCTTCGAGAATTGATGGATACCAAAATAAATTTATGCCCTACGCAACCACGCGTCCAATTGCTCCCCTCAGTTGTTCTATGTTAAATTTCTAATGTTGCCTTTCTCTCCCTTCTCTTTCTTTATTATCCAACAAAGCTAGTTGCTCGTCTTGAGTCTTCCTTCTGTGTCCATTGCCTTGGTTATCTTTTAAGTGAATACGAACATTGCGAGCCATTTGGTTCTCTTCCATTATCTGTTGCGGATTTTCCATTTTTTCAAATATGCGTTCAATATGCTTTGCCATTTGCGCTATTGAGTTTTATAACTCTGTTATCTTTTACACGCCTTCTTTAACTTCTGCTAGATGCCTTTATGGAACTTCCGCCTTTCTTTGCATCTTTTTGGACATTTTCCTTGACTTTCCCATAACAATGGCTTTGGTATGAGTGTGGTATTTCATTCACAATATAATAAATTAACAAAGATACAAAGATATAGATACATAATACATCATTCCCATTAAGCTTTGGCTTCTGTTTTGCTTTGAAGGAATTAAACGCTTGTTACCGGTGGCATAGAGGTAATCACATGGTACTCTAGGATCTGAGGTCCTTGGGAATGACAAGTATAAACTTGGAACAAGGGCTATTGGGTCATCAGGGGGTATTCTAATTATGTGGAGCACGAGATTGTGTGTGGCCATGGAGGTGGTTAGGGGAAGTCACTATATTACTATCTCTTTTTTGTATAGTTAGAGTGAAGAATTTTGGGCCACAGGGGTGTATGGCCCCCCTAAGGATTAGGGGTAGGGATGCCTTTTGGGAAGAGTTGGGGGACCTCTGTGGTTATTGTGGTCCAAGATGGTGCGTGGTTGGGGATTTTAATGTTCGATCTTAGAAGAGATGGTGCGAGGTGGTAGAATCGCTAGGTCCATGAGAACGTTTAACAAATTCATTGATGGCAGTGATTTGTTTGAATCTCTTTAGTTGTTGGCAAATTCACTTAGGCCAACTGCAGGGTGGCTTTTAGAATCAATAAATTCTTACAGATCGAGGCTTGGATTGATCAATTTGGAAGTTCGAGGTAGGTGAGATCCTAGAGTTACTTCAGATCACTGCCCCATTTTTCTGACTTTAGGCTTATTGAACTGGGGTCCGAATCCTTTCCATTTGGGGAATATGTGGCTTGAACATCCCTCTTCTAAAGCTAATATTTCGTTCGGGTGGAATAGAGTGGTCCAAGGAAGGTGGGAAGGTTATCAGTTAATGGAAAAGTTGAGAGCTTTAAAAGGCAACATCAAAGTTTTGAATGGAGAAGTTTTTGGAGATATTCGCATAAAAAAGAAGGAAATCATTGCTAGGATTGACACTTTGGAGTTAGAAGTCCCTCTAGATATGGCTTTGAAAGGAGAAAGCGATAACTTAAAATGGGCTTTTGCTGATATCTAAGAAGCAAAGACACTTCATTGTTAGACACTTGGGGGACACAGATTCGTCCGGACATGTTGGGGACACGTGCCCAATATGCCAAATTCCGTGTGATTTTTTATTTTTATTTTTTTAATGCTGGACACGTCTTAGGCACGCTGAACACTAGTATTAGACACGTTGAAATTGTTGTTCAGAAAAATTTGTATTTTGATGGCCTCAAAATCTCAGCCAAAGCCCCCTTACTTTCTTATTAATAAAATATAAAAATATTAACACATTAAAAATCGAATCTTTCCTTGTCGTGCACTTCACAAAAAGCCCCTTCATCTCTCACTCACTTATTTCATCTCCATTTTGTTCAACTCTAACGGTAAAGACCCACACCCAAGTTCTCACCCACTCCTCGTCGGCCACCGTCAGATATCGGAGCCATCACCGGGATTTCATTTCTCGCTCACAGCTATTGCTTGCCTGCAATATTACACCAAATCAACTATCAAGTAGAAGTTATCCTTGCAAATTAGCA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MSSLVKTSPFFLYFTKIPWVFPCQNTLRASLQTYSCRSIVFSKNILKYSCNSYFPIHTVRYLCNVASAATSSVHASSTPSSNKGSYKLRKKLMKKDSRDAPENVLRYKLDMCSKYGQVVKALELYDEARSDGVQLILHHYNVLLYLCSSPSLLETSGANNLLSVVLSRGLEIYQQMITDKVSPNEATFTSLARIAGAMDDPEMAFSLVKQMEDYHIAPRLRSYGPALFGFCRKLMPEGAYEVDSHMLASAVEPEEPELSALLKLSSDVKRADKVYELLHRLRRTVRQVSEPTAKVIEDWFNSESASEVGKKHWDVDKVREGIVRRGGGWHGEGWLGSGKWRLVRTGIDDNGVCHSCAQKLVCIDIDPKETEDFASSLTKLANQRVKDNFGKFRVWLEKHGPFDAVIDGANVGIENDHFSFIQLKRAVYRMRELSPSKKMPLIILHTRRVTEGPARYPNNMKLIEIWKNCGALYATPYTSNDDWYWLYAAVRFKCLLLTNDEMRDHLFQLLGNTFFPQWKEKHQVRWSISRNGLKLHMPPPYSIVIQESENGSLHIPTTTGDDIETPKQWLCVTRPTNTSKSGFE Homology
BLAST of Cmc02g0046081 vs. NCBI nr
Match: XP_008443714.1 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: proteinaceous RNase P 1, chloroplastic/mitochondrial-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1189.5 bits (3076), Expect = 0.0e+00 Identity = 582/584 (99.66%), Postives = 582/584 (99.66%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. NCBI nr
Match: XP_004142562.1 (proteinaceous RNase P 1, chloroplastic/mitochondrial [Cucumis sativus] >KAE8653579.1 hypothetical protein Csa_007308 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1050.0 bits (2714), Expect = 7.3e-303 Identity = 519/585 (88.72%), Postives = 548/585 (93.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. NCBI nr
Match: XP_038878402.1 (proteinaceous RNase P 1, chloroplastic/mitochondrial-like [Benincasa hispida] >XP_038878403.1 proteinaceous RNase P 1, chloroplastic/mitochondrial-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 966.5 bits (2497), Expect = 1.1e-277 Identity = 477/580 (82.24%), Postives = 520/580 (89.66%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. NCBI nr
Match: XP_022988265.1 (proteinaceous RNase P 1, chloroplastic/mitochondrial-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 908.7 bits (2347), Expect = 2.6e-260 Identity = 449/583 (77.02%), Postives = 507/583 (86.96%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. NCBI nr
Match: XP_023516015.1 (proteinaceous RNase P 1, chloroplastic/mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 905.2 bits (2338), Expect = 2.9e-259 Identity = 449/583 (77.02%), Postives = 503/583 (86.28%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q66GI4 (Proteinaceous RNase P 1, chloroplastic/mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PRORP1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 638.3 bits (1645), Expect = 8.7e-182 Identity = 319/518 (61.58%), Postives = 393/518 (75.87%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q680B9 (Proteinaceous RNase P 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PRORP2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 430.6 bits (1106), Expect = 2.8e-119 Identity = 230/504 (45.63%), Postives = 318/504 (63.10%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JKB6 (Proteinaceous RNase P 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PRORP3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 427.2 bits (1097), Expect = 3.0e-118 Identity = 237/542 (43.73%), Postives = 323/542 (59.59%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B8R1 (Ribonuclease P OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487238 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1189.5 bits (3076), Expect = 0.0e+00 Identity = 582/584 (99.66%), Postives = 582/584 (99.66%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JJ38 (Ribonuclease P OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111485569 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 908.7 bits (2347), Expect = 1.3e-260 Identity = 449/583 (77.02%), Postives = 507/583 (86.96%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H9Y1 (Ribonuclease P OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111461472 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 900.6 bits (2326), Expect = 3.5e-258 Identity = 445/576 (77.26%), Postives = 500/576 (86.81%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DYN9 (Ribonuclease P OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025808 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 710.3 bits (1832), Expect = 6.7e-201 Identity = 357/484 (73.76%), Postives = 404/484 (83.47%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. ExPASy TrEMBL
Match: B9SJ92 (Ribonuclease P OS=Ricinus communis OX=3988 GN=RCOM_1478990 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 708.0 bits (1826), Expect = 3.3e-200 Identity = 361/583 (61.92%), Postives = 442/583 (75.81%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. TAIR 10
Match: AT2G32230.1 (proteinaceous RNase P 1 ) HSP 1 Score: 638.3 bits (1645), Expect = 6.2e-183 Identity = 319/518 (61.58%), Postives = 393/518 (75.87%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. TAIR 10
Match: AT2G16650.1 (proteinaceous RNase P 2 ) HSP 1 Score: 430.6 bits (1106), Expect = 2.0e-120 Identity = 230/504 (45.63%), Postives = 318/504 (63.10%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. TAIR 10
Match: AT4G21900.1 (proteinaceous RNase P 3 ) HSP 1 Score: 427.2 bits (1097), Expect = 2.2e-119 Identity = 237/542 (43.73%), Postives = 323/542 (59.59%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. TAIR 10
Match: AT5G60430.1 (drug transmembrane transporters;antiporters ) HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 2.9e-23 Identity = 46/109 (42.20%), Postives = 70/109 (64.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cmc02g0046081 vs. TAIR 10
Match: AT5G60430.2 (drug transmembrane transporters;antiporters ) HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 2.9e-23 Identity = 46/109 (42.20%), Postives = 70/109 (64.22%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Charmono) v1.1
Date Performed: 2022-10-13
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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