CmaCh12G008780 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAATTACCTGGAAAATGTTGCAGAAGAGTGGGTATGGCGGAAAGAAAGGCATTGGGAAGACGTACGGTTTCCTCCATGGATGGGGAGAATCAGCGCAGTGGAAGCCATCGCCAAAGACCAGCGTTTCTTGACATCAACCCTTATCTATTGGTGAGATAAAGCATTTTTATATGGAATTAGTAACCGATTTCAGTTGCCCACATCCACACTTATCTTGCAGAGAGGGACGGTTTTGTAGTGGCTCTCATCGCTGATGCAGAGCTTGTTTTGATCCATTCGTATCTATCTGATTGGGATTTTGACTTGTCTCAACGCTCTAATATGGAAAGGAAAAAAAAGTTTTAAATGCTGAATTAATAAAATACACTTATATTTTATAATTTATTTAAAAATATATATACTTAATTTTTTAAATATACCAGTAATAAAAAAATATTTTAAAATTTTTAAAATAATTTAAGAATATTTTTAGAGTAATTTATTTTCCGAGATAAATGTAAAAAAAAAACAAAATTAAATATTTAGAAGGTAGATAAATGATTTATGTTTATATTACTAACCATAAAAAAAAATTTAACAATTTTTATATTAATTTTGTTTCAGAAAGTTTGTGGGTATTTTTATAATATGGTAGCAAAAAAAAAAATTGTAATGAAAATTTTGAAGATAAAAATATATTTTTTTTATATATTTTTGAAACAAAAATATTTATTAAACCAAAAAGGCGTCCACATTCTTACAACGAGGGGACAACAATTTTGTGGTAGTTATTCTAATCTAACGAACAAGTTAGCCGTAAAAAATTCAGACTTAGCGAACAACGTCAACATATGTTCTGGTCACGTTTGAGAGAGATGTTTTAGAAAACGTGAGCGAGGAAATACGTTGAAAACAATCTTAAAGAAAGCAACGTTATAAGCTAAAAGCGAGTTGACAATAACACCGATTTTGATAGTATATAACACGGTAAGAAGAATTGACAACTAATCCCTTCGACTGATCAAAAAGCATTTTCCACTGTTTTTTTTAGTATAAAATATCTTCTAGGGGTGAACCTATTGCCAAGAAAATTCAAAAAAATATGTGAACAACAAAATCTTAACCTACACACAAAAAGCTCAATGGATTTGAAACCTAAAAAATTATTTTTAATTTTATAAATGGTCAATTTGACTTATAAATCCGGTCCACAAACATTTTATGTCGTGAGACTATAAATACTCACTTATGTAAAATGCAAATTCGTGGATCAATGTAATTCAAATCTCAAATTAAGACGTTTCCCTTGAAAATATGAGCATCATATTTGCTATTTCTAAGTTTCAAGCTTTGTGGTAGAATTGCACCCTAGCCATTCAATCAAGCCTTGATCAAGTTAGATTGTGGACTGACTTTCAGATCTTCGATCGTAAGAGGTAATCTAATTCTAGCCTTATCTCTTGGTTGATTCAAATTTCGTATAAGGAGGTGTTAATTATTTGATTTAAGGATTCTTGCTAAAACAAAAGCTGGGATCGTTGGGCTGAGGATTAAGGTTGCCTTATCAGTTATTATGAACTATTAATGTAACAACCCGACCTCCTAGACGGAGAAAAAAACATTACTTGAAAAACATGAAAGAAGTGCTTACAACGTCTGAGTAATCGAGTCAAGATAGGAGACAAATTTCACCAAGAAGGAATAGTGGGCGTCAACGAGTAAGTAGCATATCGAAGTTTAGAAACAAGTTTTAACTTGCTATGTATGCGTACAAAGCATGTTGAGCTCACGATAATAGGATGTGAGCATATTGGAAATTCATGATTAGTATGTATGATGAGGTTTATGCTTATGAGCTTATTATGATATGTGATGTATATGATATAGTCTACTAAACCACGCAAAAGCTACATTGTGTGTTAAGTTAGACACAATGAGTATTCTTGACCACGGGCTATGTGTTACTTCCAACTGCCAAAGAGTTTAGTAGATGAGTCATATTTGACCGATAGCGAGTCTTACATATGAGACCGAAATCTAAGAGAATAGTTGCAAGACATGTGCCCCAATTAGTCTACCAAGCCCCGTGAAGCCTGACGTGTTGTGTGCTAAGTTAATGATAATGAGTATTCCTGACCATCAGACTGTGTGCTATTTTAGGCCACAAAGTGTTTTATAGACGGGTTGTATTTGATCGAAAATGAGTCTTACTTACGGTTCAAAATTTAATGTAAGCATAAACAAGTAAACATGTGTGGTCTCTGTAATGAGGTGAGTCAAAATTCTATTTTACTCGTATAATTACATTTTATACATTGAGTACTATTGATCTAATAATAAACAATTTGTTTATGGTTCAATCATAAAGTCTATTTTGGGCGTGAGAGGTTGAGGTCAATTGTTCTTGTCATGACATGAATTTTGAGGTTTTGAAACTCATATAGAGACTAAAAAGATGAAAGCGAAGACAAATAATAATAAAATAAAATAAATCAAATTGAATGACAAATAACACCAAAATTAAATAAAAATAAAATTCAAATATAAAAAGTTGCGGTTCAAATTTCCTCCAAAAAGGGAAATGAGTTTGAGATGATCTCATCTATGACTGCCCAGCTCTCGAACGCTTCTCCACCTCGACTAGTAGCCTGCGAACACTTGAAAAGAAAGGGAAAATGGTGAGTATATAAATATACCCAGTAAGCAACCTACTTGTAGGCTCTCATCGCATCATTACCTAAGCATCTGGAGTGCCTCAAAGTTTCGAGCAATACTTAAGTTGCTCATGGACTCACTCCGGATTCAAACCCTAATTTTTTAAAAGGGAGAAAAAGAAATCAACGACTGAAGCTCATGCTTGTATTGAATCACTCCGGATTCTCTTGGTAAGTTGAGCTCATGCTTGTATTGACGGAAGCTAAAAAGCTTTAGTGATTCAATAGGGATACCAAGAGAAGAAATCAACGAGCATAAGAGTTATCAGCACAACAATTAAATGAGTTAATAATTCACATAAACTCTCTGAAGAATCAACAATATAATTACTATTGTAGGTCTGTTTTTGGGAGAGAGTCTCATATTGGCTAATTTAGGAAATGATAATAGATTTATAGGTAAGGAATACATCTCTATCTACATGAGATCTTTTGGAGAAATCCAAGGCTAGGAGAGCTTACACTCAAAATGTACAATATTATATCATTAGAAGAGTCGTAATTCCTAACATATATTTGAATTTTATATATTCTCTCACATAATTTTTTCTCATCTATATTTATTTATTTATTTATGTTTTGAATTGTTACTGGACTTGAAAATGAAGAGAAAAGGAGAAAAATGCGCCGAGCTTTAAATAAACCCGTTCTACAAATTCTGCCGCTCAATTCCTACTTCCTCGCTCACTTGCTACATCAACTTCTGTGTTGCAATGGAGATTGACAATCTGGTAAACAAACTTTATCATTGATATTCGCGTTCTTTGATTGGCCTTTTCATTTCTGTTGGATTGTGAAGGAGTTGGTGTTTCTGAACTTATTGCTTGAATTCTTGTTCCCTGCAGTTCTTATTTGTTTGGATTCTTGTGCGATTTCTCCTGTTACTGTTTTTCTTTGTTTTGTTGAGCTTTGCTAGTATAATTTAGTGCCGGAATGTTGGTTTTCGGGTCTTGGAATTTTAGGAAATGTGTATTTTCTTTGGTTTGATGGATTATCTTGTTTTCCTAGTATGATTCTTATTTCAGTTCGTCATATTAGTTTTGTTCTTCACTGTTTCTTCTTTTCTGATTTCGTTTCTTACTTTGTCCCCGAAAAGGAACAAGGTTTATTTTCATCTTCTTGTTCTCTTTGTTAATCGCGGCATTTTTTAGTTGTTTCTTTAATGTTTACCATTGAATCAGAGGGGAAAAACCTTGGTTTAAATTTCTATACCATGGATCCTGTGAAAGTATTGTCAACTGAAAGATTTGAAAATTGTAAAAATTAAAAGAAAAAATAAAGAAGAAAATCTATTCAATATGATAAACACCGCATTGAGAGAAACTGTTTGAGATTTGATTGCTCCCTACTGTTCCATATTGGTATATTCTTTAAAAGTCATGTAACTCTATTCTAATATGTCTATAATTTGATAAGATGTTTAGTTCAATATGAGCTTAGCGTAGCAACTAAAGTATCTCTACTTTCTCTCAAAGATTTGTATCCTCCCGCCCCTCATGCGGTGTAGTATATTAAAGGAAGTAGACAATTGGTTCTGAACTGTTTGTCGCATTTAATTGTGTGTTGCAGCCTTCCGCATCTGATGAAGTAAGAGATGTCAACGATTGCTCAATATGTCTTGCATTGAACCAAAATGACCATCTTTTCAGCAAAAAGAAGGTGAAATATGGATACCCACATTTTGCTTCTACGCTGCTCTCTTTATCAGGAAAGTGTAGAAAGTGAGAGTCTCTATTAAATTTTCAGCAAAATTTGAATAGCAAGGATCGCATAATTTGGAATTTACTACCTTTATTGATAGATAATTTTAGCTTATCCTTTTTCTCCATTAATCGGCATTCTAACTTTTTGAGTGATGGCTAGTACTGATACGAATGCTACATTCAAGTGAATAATGAAGTTGATTATGATTTATGCTCACAGATTAAGCTATAATAAAGAACCAGCAGTTACATAAAACAGGCGATTTTGACCAAAGTCCCTTGCTAGCTGCAATACAATTATTTATTTATCAAGAAACAAGGACTTCCATAAGTATGAAGTGTAGGAAAAAAGTTGGACAAGGAATCCAACCCCAATGGATAAACCCGTACATTAAACCATATTAAGAATAAAGGGAAAATGAATAGGAGTTCATATTTGTTGCCTATCCTTCCCAGTTTTAATTATCAAAATTGGCATGCTCCCAAACTGTACTAACTAAGCCCCATGCTAACAGTCAAGTGGACTCCATGATGAATCATTTTCATTATCTTTGTCTTTTAATCATTTACATGTAATCCTTTTGATCTACATTTC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BLAST of CmaCh12G008780 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P94026 (Ribulose-1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit N-methyltransferase, chloroplastic OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=RBCMT PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 6.5e-07 Identity = 63/272 (23.16%), Postives = 120/272 (44.12%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G008780 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P58467 (SET domain-containing protein 4 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Setd4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 1.5e-06 Identity = 59/264 (22.35%), Postives = 108/264 (40.91%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G008780 vs. TAIR 10
Match: AT2G18850.1 (SET domain-containing protein ) HSP 1 Score: 523.9 bits (1348), Expect = 1.7e-148 Identity = 273/531 (51.41%), Postives = 370/531 (69.68%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G008780 vs. TAIR 10
Match: AT2G18850.2 (SET domain-containing protein ) HSP 1 Score: 519.6 bits (1337), Expect = 3.3e-147 Identity = 273/531 (51.41%), Postives = 368/531 (69.30%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh12G008780 vs. TAIR 10
Match: AT3G55080.2 (SET domain-containing protein ) HSP 1 Score: 43.9 bits (102), Expect = 5.3e-04 Identity = 45/174 (25.86%), Postives = 77/174 (44.25%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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