CmaCh00G002870 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TAAAATATCACCAAGCCGACTCCTATGTATTTTTCCGTTTCCACCATTTTTCTATCATTCCATTTCCAATTCTCATTTCATTACAAATTTCCTTAAAATCAGAGCACAGTCATTGCTTAACAAGATTTTTTTTCCTCTCAGCTTCGTTTTCTCATCAATTCCCATCCTCTAATTTCCTTGTTTCATCCATTTGATTCAAACATCTTCCGTCGTTCTTTCTCGCACTTGCGGCTATCGATGCAGGATTTCATTTTGTTCTCGTCTTCTAGCTTCTAAGCTTTGAGTAAATCTCAACTGCGAATTTCAACTGCCATTTTTGTTCAACAATCGATATCGTACGCGTGTCTGAGCTTGGTTTCGGAGTTTAGGTTACTAAATTTGTCGAAATTACACAATTTCACCGAGTTTTGAAATCTGGGTTGCAGGTAATATTGCCAGATCGTTAACCTTCCATCCGTATTCCCGGGTTGTTTATATCTGTTTGAAGGAATGAAAATTGGGATTACATTGATTGTTGTAGTTTAATACCACTACTGTTTCGTTGTTAAACTGTATTGATGATGGAATTCAGAATGCCCACGGAACTGAGTTGAACTTGAGATCCAATTGAGTTTAGACAATATATTTTCTCGTTTTCATCCTATGTGCGAAGGTTCCATGCTTTAGTGATTTCCATTCATATTCCATAACTATGTAACATGTGGTATTGGTTTGGAATTGAGTTCGTCATGAAAAGTGATTGTTTCTCTCATTTGAATTTTTGGAGCATGGATGTTTAATCTAGGAGGGCTTTGGATATTGTCTGTTGATGAACTTCACAAGCTGGGAAACATTATTCTTTCTCTTTAAATTAGAAAATCAGTCGTAGGTGGATTTCTAGCATGGAATATAAAGCATTGTTTTGAAAAGTTGTTTTTGATTTAAATGAATTAGAATGATTGGCAGTGGATTTCCAGTATGATTACTCTTTGGGTTTCAAACTATCTAAAGGATCCCTGTTCTTTTTCCCATTCATCGTTGGTCATTTTGCAAAGAATTTACCCAATGAATTAGCAACGTATTGGTTGTGTTAGCTTTTACTTTATGGTGTATATTTCTTACACTTCATCTTATCTGTCCTATTGGTTGGACTGGTGATTGAATAATTTGTATTCTGGTTTCAGGTGAAATAATCAAGCCTACAAGAGCTATACCTATGTCTATAATCACGTTTTTTTCTGCAGCCTTCTCTGTACTTAAAGAATACCTAATTTGTATAGAGAGATGCGATCATTCTGCTTTCAACTGATATGAAGACTGCACAGGTTTCCTTTTATAATTCTGTTGTTGCTTTATACAAAAAGCTCGACGTTCCTCTAACTTCACCTTTTTACTTGTTCTTTGCCTACAACGGAACTTCTCCACTTACTCCTTTACCTCAAATTTTAGAATGATTTTTCAACTTCGTGGTGCTAATGTTATACTTCCAATATTGCCTAATTGAAAGAAGAAATGGATTTGGCTTTAAAATTTAATAGAATTTGGAGACATCGTTTTTTATCCTACGTGGTCCTTATCAGCCTGACATATTTCTTCCATTACCATTAAGGAGTGTGCTGCCTCATATGATATTAGATGTCGGATCATATTACTTATGCCTGCAAATATGGAAGTTTGATGTGACTGTTGGACATCAATCCTTGTTGATATTCTGGCTCTTGGACATTTTATGTTGTATTTTCCCCTGTATCTCATTTATAGTATTTAGTTTCCGAATCGGTTACTATAAATTGGTTATTGTCACACTAAAAAATCTAATTGTCATTCTAAGATCCTTTCTTGACATGCATAGAGAGCTCAAGATGCAAAAAAAGCTCTGGATGATTCCAAAAATAACCTACCAAACAGCTACAAAACTGAGGCTCCTATAACGGATACAGGTTCGATTTCTGCCTCAAACAATGATGGCAAAAAAGTTTCTCACCAAGATATTGAATTTGTAAGCCACAGATTCTTTCTAATTACAATGACCATTAGTTTCTATATTTATTTTTTCATCTTCAATGTTCTGTTGTGATTTCTTATCTCTTCATTGTTGAATGAATTGGAATGCTGCTCTAGGTCCAGAATTTAATAGAGCGGTGCCTACAGTTATACATGAATAGAGATGAGGTGGTTAAGACCCTATTGAATCGTGCAAGGATAGATCCTGGATTTACGTCATTGGGTAAGTTTAGGAGCTTTCATTAAGTTCTATGTTCTAATATTCATGTTCAATCAAATAACAATGATTGTAAACAATTACTATCACTCCACACACACTTATTATAGATGATTATTACGTATCTATTATTGTTTATTAATGTTCTGGACTTTCCTCATTCAGTTTGGCAGAAGCTGGAAGAAGAGAATGCTGATTTTTTCAGAGCCTACTATATAAGATTAAAATTGAAAAAACAAATCCTTCTTTTCAATCATTTGCTTGAACATCAATGTCGTCTCATGAATTATTCAATACCTCCCAAAGTTCCGTTAGCTCCTATGCAGAATGGAATTCATCCTATGCCTGGTAAGCTCTCATATCCTTAACCAGATTATGTAATTATCTAGCTCAGTGGATACCATGGGTGCTGGGATTCCAAGCCTAGTTGTAGCTCTGCTCTTAGATAGCTTAATTTTATATATTGAAGTAAGAGAGTTACATGTTGCAAGATACTAGTATTTTGTTATTCATCACTACTTATTTTCAGTGCAGTTAACAACTTACCAATGGGATATCCAGTCCTTCAACAACCTCCTATGTCATTGCCAGGTCAACCCCACATGGATACCATGGGCTCTGGGATGCCAAGCTGCCATGTGGTCAATGGAGTTCCTGCACCTAGTAACTTCCATCCTATTAGAATGAACTCTGGGAACGAGTAAGAAGACTGCCCTAGTAAAGTCGTTATTAATATACATTCTAAAACATTCAATGCTGTGGTCTCGATAAAACAAAACAATAGAAAGTTATAAAATGGTCAATAAGATTGCATAAAATGGAAATATTTTTAAACTTAGACGAAAAAATGTGATACTGTAAAAGAATTTGGCATGTTTATTGAGCACACCCTTTTCAATATAGTTTCTATTACCTCTAGGGGAGTGGTAATTATGCACAAGTACTAGCATTGGGTGTCATGGCTCATGCTGCTAGTCTTGCCATGATATCATTGATCATTACTGCTTCGCTAAATTCTCCTCAAGAAAAATCAGCCATGTTCATGTGTCTGTGTGGTAGATTTTGCATGGAAGAAACTTGTGCTGGAGTTTTGAGTATCTACAAACAAAGCTAAAGGAATTACATCCAGTGATATAAAATCGTACTAATATGCATGGGACTAATGACCAATGGTTAAGATATTGCCTCTAGGATTCATGTGCCGACTGTAAGAGAGCATTTAAAAATATTCATGGAGGATAGTAATCCAGTATTTACATTCATTGGCTTCATAAATTGATCTCACTTCTCACTTTTCACTTTAACTTTTTGTTATTTTATTGCATCTAATACTTGTTCTTATTGAAGTATGTTGATGAACAGCGTGGCTGATGTGGCTTCTGTTATTCCACCAAATGGTACAATGTCCTCCATGTCAGAGATGTCTATGAGTCCTACATCGGTGGCATCCAGTGGTCATTTCTCATTCACTGCTCCAGAAATATCTGGAATTGGAGTAGATACTTCTGCACTTGATACTGCATTTACATCAGAAATCGTAAATTCAGTTGGTCTGCAACTTTCGCAAGATGATGGAGCAGGAAATTCCAGGGATTCTCTCAGATCATTGGATCTGATTCAGTGGAATTTTAGCCTGTCAGATCTTAAAACAGATTTATCAAATTTGGGAGGTAATTTCTAGATGATTTGTAGATTTCTCTAATTTTGTCTCTTATATTGATGTCTACAGAACTTTTAGCAGTATCATATCACCTTTTCAGATCACCGTAATTTCTTTGGAATATTACTTCACAAGGCTAGAATAATAAGCATTGTTCTAAATTGGACTTATTTTTTCCTCCTTCATTTAGCTAGGTTTACAATAAGAAACAGGGTAAATACTAGAAAGGGTAAACGTTGCGAAGGGTCAATCTCTCCGGCCTTTATACTAGGCAATAAGAAACATCTAAATTTTGGAAAATGCATCTCCAAACGCCCAAGCTAAGCTAGGTGATCCTGATCACAAAGATTTCAATAGAATGGAGAGAGAAACCAAGCTGGACAAGAAAGGGGGACCAGACATTATACCATTCAAGTAATAAATTATTGAAAAAGGGGAGTCAATAGTAGTCCCTGCCCCCTCGATGGTCAGCCAATACATAAAAGAATAATGAGAAATAAGCCATTGAAAACCAAACAACTTTAACCACCTAGCAGTAGTTCAACAATCCTTTTTGCAATAAATAGAGAAGGACGTAGAGAGTGAGAAAAAGCTTTCCCTATCTTGTGAACAATGGCAACAGTTCAAGGGAAATTTGCCTCTGAAGTCCAACTCAAAATATTTGAAAGCTAGAGGATGTCGGACTTGATTGACAGATATCCTAATCGGAGTCGAACAAATATACTGTGTGGATAAGTCAATGCCTTGTTCATTCAGCGATCACCCTAGATTGAAGTTGTTCATTCATCCCTGATATGAATATAGCCGTGGGCATCCTTCAGATGACCGATTGAGGAATTGTTTGGGAATGATGGCCTTTTACTTTAGTATCATGTGAATCTAATTTTTCTTTTCCTTTTCCAATAAGTTACTTCAGTCAAATTGTTACGAAGTTTTTCTTTCAATCTTTTTTAATCTTCCGTAAGGAAAAGTCTTGTGTTGGTCTATAGAAGTTGATAGCTTTTAGGAAGACCTTTAAATAAGAATGCAAAATCCTATTTCGTTGGCAGTTTTCACTCTTCTCTTGGACTAACTTTAAGCATATTGATGAAATCTCTTCAAATTGGTGCAGATTTAGGACCATTGGGTAACTACCCTGGTTCTCCATTTTTGCACTCCGACCCGGAAATTTTGCTCGATTCACCAGAGCAAGACGACCTAGGTATGGGAACTGCAAGACTCTTTTCAGCTCTAAATTGTTTGATGTAACCAAAACCACCCTTTTTATCATGACAAGCAATTTTGGCGAACGTTAATCATTTTATATTTGTTCATTACTCTTTTCTTTCTTCAAGTATGATGACTCTTGCGAATTAGAAGTTCCTAGTTGTCGATGGAAGTTGAATGACATAGATTTTAGATATCAACTATGCAAATTTAAGAAAGCCAAGAAGTCGAGTCTAAACCTTTATGTACATAACTTATCATTTGGCCACTCACTAACGTCTCAATTTTATCGCAGTGGAGGAGTTCTTTGTTGATTCTGTCCCTGAGCAGCCAGACGAAGAGAAGTCCTAGAGAAAGGCGACAAAGGTTTTTTTTCTTCCCACTTGAATAAGTAGGATAGTATAAGAGTTGATCAGAAATCAAGAGCTCATTTTCTATTCACAATAGGCATCCAGTAATTTTGTCATCAACAATTTCAATTATTTAAAAATTGTAGTCACATAGCTTGGTTGGTTGGTAGGATTGTAGATAGGGATGTAGTCATGTAGGGGAAGCTGTGCTTCTCTTGTGCCGCTCATTTTAGAGGTCTCCAGTTTCTTGGAAGTTGAAGCTGACTGTTCAGTTTTTAATCCCTTGTCTGGTCTGTATTAAGAGTCAATTACAACAATCCCATAATAATGGTATTTTTTAGATGTTTAATTATTCTATCTCTTGTTTAA TAAAATATCACCAAGCCGACTCCTATGTATTTTTCCGTTTCCACCATTTTTCTATCATTCCATTTCCAATTCTCATTTCATTACAAATTTCCTTAAAATCAGAGCACAGTCATTGCTTAACAAGATTTTTTTTCCTCTCAGCTTCGTTTTCTCATCAATTCCCATCCTCTAATTTCCTTGTTTCATCCATTTGATTCAAACATCTTCCGTCGTTCTTTCTCGCACTTGCGGCTATCGATGCAGGATTTCATTTTGTTCTCGTCTTCTAGCTTCTAAGCTTTGAGTAAATCTCAACTGCGAATTTCAACTGCCATTTTTGTTCAACAATCGATATCGTACGCGTGTCTGAGCTTGGTTTCGGAGTTTAGGTTACTAAATTTGTCGAAATTACACAATTTCACCGAGTTTTGAAATCTGGGTTGCAGGTGAAATAATCAAGCCTACAAGAGCTATACCTATGTCTATAATCACGTTTTTTTCTGCAGCCTTCTCTGTACTTAAAGAATACCTAATTTGTATAGAGAGATGCGATCATTCTGCTTTCAACTGATATGAAGACTGCACAGAGAGCTCAAGATGCAAAAAAAGCTCTGGATGATTCCAAAAATAACCTACCAAACAGCTACAAAACTGAGGCTCCTATAACGGATACAGGTTCGATTTCTGCCTCAAACAATGATGGCAAAAAAGTTTCTCACCAAGATATTGAATTTGTCCAGAATTTAATAGAGCGGTGCCTACAGTTATACATGAATAGAGATGAGGTGGTTAAGACCCTATTGAATCGTGCAAGGATAGATCCTGGATTTACGTCATTGGTTTGGCAGAAGCTGGAAGAAGAGAATGCTGATTTTTTCAGAGCCTACTATATAAGATTAAAATTGAAAAAACAAATCCTTCTTTTCAATCATTTGCTTGAACATCAATGTCGTCTCATGAATTATTCAATACCTCCCAAAGTTCCGTTAGCTCCTATGCAGAATGGAATTCATCCTATGCCTGTTAACAACTTACCAATGGGATATCCAGTCCTTCAACAACCTCCTATGTCATTGCCAGGTCAACCCCACATGGATACCATGGGCTCTGGGATGCCAAGCTGCCATGTGGTCAATGGAGTTCCTGCACCTAGTAACTTCCATCCTATTAGAATGAACTCTGGGAACGATATGTTGATGAACAGCGTGGCTGATGTGGCTTCTGTTATTCCACCAAATGGTACAATGTCCTCCATGTCAGAGATGTCTATGAGTCCTACATCGGTGGCATCCAGTGGTCATTTCTCATTCACTGCTCCAGAAATATCTGGAATTGGAGTAGATACTTCTGCACTTGATACTGCATTTACATCAGAAATCGTAAATTCAGTTGGTCTGCAACTTTCGCAAGATGATGGAGCAGGAAATTCCAGGGATTCTCTCAGATCATTGGATCTGATTCAGTGGAATTTTAGCCTGTCAGATCTTAAAACAGATTTATCAAATTTGGGAGATTTAGGACCATTGGGTAACTACCCTGGTTCTCCATTTTTGCACTCCGACCCGGAAATTTTGCTCGATTCACCAGAGCAAGACGACCTAGTGGAGGAGTTCTTTGTTGATTCTGTCCCTGAGCAGCCAGACGAAGAGAAGTCCTAGAGAAAGGCGACAAAGGTTTTTTTTCTTCCCACTTGAATAAGTAGGATAGTATAAGAGTTGATCAGAAATCAAGAGCTCATTTTCTATTCACAATAGGCATCCAGTAATTTTGTCATCAACAATTTCAATTATTTAAAAATTGTAGTCACATAGCTTGGTTGGTTGGTAGGATTGTAGATAGGGATGTAGTCATGTAGGGGAAGCTGTGCTTCTCTTGTGCCGCTCATTTTAGAGGTCTCCAGTTTCTTGGAAGTTGAAGCTGACTGTTCAGTTTTTAATCCCTTGTCTGGTCTGTATTAAGAGTCAATTACAACAATCCCATAATAATGGTATTTTTTAGATGTTTAATTATTCTATCTCTTGTTTAA ATGAAGACTGCACAGAGAGCTCAAGATGCAAAAAAAGCTCTGGATGATTCCAAAAATAACCTACCAAACAGCTACAAAACTGAGGCTCCTATAACGGATACAGGTTCGATTTCTGCCTCAAACAATGATGGCAAAAAAGTTTCTCACCAAGATATTGAATTTGTCCAGAATTTAATAGAGCGGTGCCTACAGTTATACATGAATAGAGATGAGGTGGTTAAGACCCTATTGAATCGTGCAAGGATAGATCCTGGATTTACGTCATTGGTTTGGCAGAAGCTGGAAGAAGAGAATGCTGATTTTTTCAGAGCCTACTATATAAGATTAAAATTGAAAAAACAAATCCTTCTTTTCAATCATTTGCTTGAACATCAATGTCGTCTCATGAATTATTCAATACCTCCCAAAGTTCCGTTAGCTCCTATGCAGAATGGAATTCATCCTATGCCTGTTAACAACTTACCAATGGGATATCCAGTCCTTCAACAACCTCCTATGTCATTGCCAGGTCAACCCCACATGGATACCATGGGCTCTGGGATGCCAAGCTGCCATGTGGTCAATGGAGTTCCTGCACCTAGTAACTTCCATCCTATTAGAATGAACTCTGGGAACGATATGTTGATGAACAGCGTGGCTGATGTGGCTTCTGTTATTCCACCAAATGGTACAATGTCCTCCATGTCAGAGATGTCTATGAGTCCTACATCGGTGGCATCCAGTGGTCATTTCTCATTCACTGCTCCAGAAATATCTGGAATTGGAGTAGATACTTCTGCACTTGATACTGCATTTACATCAGAAATCGTAAATTCAGTTGGTCTGCAACTTTCGCAAGATGATGGAGCAGGAAATTCCAGGGATTCTCTCAGATCATTGGATCTGATTCAGTGGAATTTTAGCCTGTCAGATCTTAAAACAGATTTATCAAATTTGGGAGATTTAGGACCATTGGGTAACTACCCTGGTTCTCCATTTTTGCACTCCGACCCGGAAATTTTGCTCGATTCACCAGAGCAAGACGACCTAGTGGAGGAGTTCTTTGTTGATTCTGTCCCTGAGCAGCCAGACGAAGAGAAGTCCTAG MKTAQRAQDAKKALDDSKNNLPNSYKTEAPITDTGSISASNNDGKKVSHQDIEFVQNLIERCLQLYMNRDEVVKTLLNRARIDPGFTSLVWQKLEEENADFFRAYYIRLKLKKQILLFNHLLEHQCRLMNYSIPPKVPLAPMQNGIHPMPVNNLPMGYPVLQQPPMSLPGQPHMDTMGSGMPSCHVVNGVPAPSNFHPIRMNSGNDMLMNSVADVASVIPPNGTMSSMSEMSMSPTSVASSGHFSFTAPEISGIGVDTSALDTAFTSEIVNSVGLQLSQDDGAGNSRDSLRSLDLIQWNFSLSDLKTDLSNLGDLGPLGNYPGSPFLHSDPEILLDSPEQDDLVEEFFVDSVPEQPDEEKS Homology
BLAST of CmaCh00G002870 vs. TAIR 10
Match: AT2G46420.1 (Plant protein 1589 of unknown function ) HSP 1 Score: 468.0 bits (1203), Expect = 6.8e-132 Identity = 248/367 (67.57%), Postives = 291/367 (79.29%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh00G002870 vs. TAIR 10
Match: AT2G46420.2 (Plant protein 1589 of unknown function ) HSP 1 Score: 456.4 bits (1173), Expect = 2.1e-128 Identity = 237/345 (68.70%), Postives = 276/345 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh00G002870 vs. TAIR 10
Match: AT3G61700.1 (Plant protein 1589 of unknown function ) HSP 1 Score: 443.7 bits (1140), Expect = 1.4e-124 Identity = 245/364 (67.31%), Postives = 283/364 (77.75%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh00G002870 vs. TAIR 10
Match: AT3G61700.2 (Plant protein 1589 of unknown function ) HSP 1 Score: 437.6 bits (1124), Expect = 9.9e-123 Identity = 245/369 (66.40%), Postives = 283/369 (76.69%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh00G002870 vs. TAIR 10
Match: AT5G04090.2 (Plant protein 1589 of unknown function ) HSP 1 Score: 145.6 bits (366), Expect = 7.8e-35 Identity = 109/296 (36.82%), Postives = 146/296 (49.32%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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