CmUC11G211900 (gene) Watermelon (USVL531) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GAATTCGGTTTTCCATTTCTCTTTCCTACTAACCCCTACTTTTGCTTCTCTTCTCTTATCAGTCATCAACCACTTCTTCTTTCTTCCCACTTTCCCCACTCCCCCACTCCCCCATTTCCACCTCCTTCGATCATTCGCATTTTCACTTTCCTACTTCTGAATTCCGCTGAGTCCCTGTTGGGGCCTTGGCCTTGTGCTTCCAAAGGGTCCGAGCATAAATGGAATCGGAGGACGAGCTCGACATGCACGATGCCCATGACGACGACGGCTCTGTTGACAATGAGGAGGACTTCTACAGTGGCGGCGACGACGATGGTGCCGCCATCGACAGCGACGATGCTGATGTCGGTGATTACGAGTTTGTTGATAATGATTCCGACGATTCCGACGACATGGTCTCCTATCGCCACCAGGTCATATTGTACCACTTTCCATCTTTTTGTGTTTCTCCATGGGCATTCATAATTTGTAGTTTTGTGAATGCTAGTGTTTCTCGATTGCTCTATTCTACTCTTTACCAATCTGAATTTCCAGTACCTTTTTTATTTCTTTGTTTTTCTTCCCCTATTTGCGTATTAGATTGGGATTCTTTTTGCTTCTTTCTACAAATGCATAGCTAGAGAACTTTTAATATTCTTTTCATACGAGTCTGTTTCGTTTTGATGGTTTAATTGGGTACTCAAGTGCAATTAGACTCTTGAAGTTTGTTAATTTTAGTTATATATTTATATCTTGAAATGTGATACTTTTCGGGAAGAATTAGAGTGTTCCATGACTCCTTGATGTTGAGTTAGAAGCATAATGGCTGGTTCGTTGTAGAGCGCAGTAGCTGAGCCTGCTCGCAGTGGACTTATCAACTTTTAAAAAATTGTATTAATAACAAGAGAGAACCAAGAGCATATATTTTTTTCTGCCAAGTAATGATTCCTTTGTGGTTTAAGCTTTTGGAAGCTTTCCTTCTGTACAGGACTTGTTCTAGATTAGATTGGCTGGTAATCTGGTGGTTTAGGCGATTGTAGGGCCAAGATTCAGGAACTGTTGGAGGGTTTTGTGGACTAATGCTTGTGGTGCTCTCCTCTAGAACATTGGCTAGTAGGAAAGAGAGAGAAGAAAAAGAAATGAGGGTGGGTGAGTAGACAGGAGGGAGTGGCTTTGGGAAGTTATTGTTGCCTTATTTCCTCAAAGAGATAGGGGGATTCCTTGATCTCATTCTTTGAATCAAAGGCTTACCAAGTGGAGAAGATGGATCCATGGCTACATTTCCTCATCCAATTTCTCCAATATTATAAATGGCAATTCTTGTGGGAAGATTATAGCCTTAAGGGGTCTCTCGAAAGGCGATCCTTACTTTTTTCATTCTCATTGTGGGTTGTCTTAGTAGGGTGTTGAATAAAGCGGAAAGTGATGGATTGATTAAAGGTTTTGTTGTGGTAAAGGACATTGCTCCTTAACTATTATGCATATTCAATTTGCGGGTGATACCATGTTGTTCTCATCCCCCAAAGTCATACACCTTGACAATCTATTACATCCATTAAGCTCTTTGAAAGAGCTCTGGGCCTCACTATTAATTGTCTAACGTCAAAATTTTTGGAAATCAACATGGATCCTTGATTGGTCTCCACTCTAGGCAACGAGTATGGTTGCAACAAATAGGGTATTTGGCCTGCTACCTACTTGGGCCTGCTTCTAAATGGTAAGCCTAAATCTAGAACTTGCTCTGTTTGGGCTCCAATTGTTGAAGGTGGGTTGGAGGTGGCTTGGGAATCATAGACTCATCGCATTCAACTTCAAAATAAATCCCTTTTAGCCAAAAAATTTGGAGATTTTAGGCTGAAAAACCTGCTTTATGGAGAAAGGTGATTGCTATAAAGTATGGTTCTTTACACTTTGATCTCAAACTAAAGCAATCTTCTCTTTCTACAGTAAAAGTTCCTTGGAAATACATTGACAAAATATAAAACACTATCCACAAACATGTCTCTTAAAGTTGGTAGGGGCAAGATTACTCGGTTTTGGCTAGAATGGGAGGGAATAGGACTCTTAAAGATAGTTATCCCTCATTATTTGTTCTCATTCTCAAAAAAGAAGCTAGTATCTCTGATGGTGGAATAGTGAAGCAGCAACATGGAATACTTGGCCAAGGAGAAATCTTACTGAAGTTAAAATTGATAAATGGGCTATGTTTTCCAATGCCCTTTTTGCGGTTGTGCAATTTGATCGTGAAGACTCAGGGTATGGAACCTTGATAGAGATGGTATCTTCACCTCTCAATCATTGTCTATGTGTTTGGCTTCTCGTGGCATCCAATGAAAAGATCTTTAGAGAGCCATTTGGGGTGGGAGATTCCCTAAAAAAGACAAGCTATTTATTTGGACTCTCAAAAAAGAAGTTGCCATCTCTAAATTGTGGAACAATGAAACATCAACATGGAAAATTTGGCCGAGGAGAAATGTTAATGAAGTCAAAGTTGGTGAATGGGCTATGCTTTCCAATGCCCTTTCCCCAATTGGATCGTGAAGACTCATGGTATGTAACCTCAGCATAGATAGTATCTTCACCTTTGAATCATTGTCTAGGTCTTTGGCTTCAAGTGGCATCCAAGAAAATGTTCATCTTTACCGAGCCATCTGGGGTGGGAGATTCCCTATAAAACTTATGTCTTTTTTTTCTTTTCTTTTATTTTCTTTTTAATTTTTTTTATTAAAAAAAAATTTAATTTGGAGAGGACTCTAAAAAAAGAAGCTGCTATCTCTTAATTGTGGAATAGTGAAGCAGTAACCTGGAATATTTGGTCAAGGAGAAATCTTTTTGAAAGGAAATAAAACTTTTCACTGATATAATGAATAGTGAAGCAACTACCATCAATTTCGCTAAGGAGAAATCTTAGTGAAGTAAACATTACGATGGGCTATGCTTTCAATGCAATGCCTTTTCCCAATTGTGCTATCTGTTCGTGAAGACTCATGGGTATGGAGCCTTCACAGAGATGGAATCTTCACCTAGGTCTTTGGCTTTCAATGGCATCCAATGAAGGACGATCTCTATAAACATTAAGTTTTTTATTTGGGAGTTTAGCCATTCAACCCAAGTCGAGCTTGAACAAAGGTCCCCACGGATCACCCCCCCTCTACTTTATTATGTTCAAAACTTGTGCAGTAACCCTTAACCATCTCTTTAGCTCTTACGCTTTTGCTAGATCGTTTTGGGATTCATCTATGGCTTTTTGGTGAACAAGCCGAGAGGGGCGAGAGAAATCTCGTTATTCAAAGAAAACTTCTAATTTTTATTATTCTGATCTAACCAAAAGATAAAAAAATCCAGCTTATATACTAGCTGAAAACAACTAGAATTATCTTAAAATTACAGATTTGCCCTCCTGAAAGAAGTCACCACATAGGTAACTTGATACAAACAGAAAATTACAAAAATATTGCTATTTAATAATAAAAAAAAATAGCTGCTGAATCATCAAAATTACATTAAATTCCCTCCGTGCAAGTAAAAAGAAACTCATCCTCGAGTTTAAGTGGAAAGGGAAAATTGATCCGGTGGAAAATACTCAGTCAAATCGGTGATATTGAATATAAGATTGATGTGTAAATTGTTCGGAAGTTCAATCTTGCAGGCGTTGTCACCATATCTTTTCATTATCTGAAAAGGACCAAGTTTTCAGGGCTGGAGTTTGTTATATTTCCCTACTGGAAATCTAGCCTTGCTCAGATGGATCATCATAAGGTCTCCTTCTTTGAACTCCTTGAGTCTCCTATGCTTGTTAGCATTTCCTTGTACTTAGTTGTCATTCTCTCAAGATGTTCAGTGACTTCTTTGTGCAATTCGGCAACTCGTTTAGCCATTGTCTCTGCTTCCAAGCTAAGATCCACAGAAGAAGGTAAATTAGCAAGATCTACAGTTAGCCTAGGAAGTTTAGTGTAAACAATTTCAAATGCCCTATGGACCAATTCTTCATGTGATTGTAAGCGAATTCGGCTTGAGCTAAGACAAGGTCCCATTGCTTTGGTTTGTCTCCTCCAAGACAACAAATGAGATTTCCAAGGATTTTATTCGTGATCTCCGTTTGCCCATCCGTTTGGGGATGACTTGTAGAGCTAAATTTTAAGTGTGTATTGAACTTCTTCCACAATGTTTTCCAAAAATAGCCCAAGAACTTCACATCACGATCTGAAACTATAGACTTAGGCACACCATGTAAACAAACAATTTCCTTAAAAAAGGTTAGCCACATATATAGCATCGAAAGTCTTACGACAAGGAAGAAAGTGAGATATTTTACTAAATCTATCTACTACAACAAGAACTGAGTCATACACTCTATGAGTTTTTGGAAGGCCTAAAATGAAGTCCATTGAGAGGTCCTCCCAAATGTTTTTTGGAATTGAAAGATGAGTGTACAGACCTGTATTTTGTTTGTGCCCTTTTGGAGTTTGACAAGTAAAACAATGCTTAACATATTTATTTACATCCTTTCATATTTGTGGCCAATAGTATCTATCATTGAGAAGTTGTAGAGTTTTGTCCATACCAAAACGTCCAGCTAAACCATTACTATGAAGTTCCTTTATCAAAGATTCATGTAGAGATGTTCGAGAAATGCATAATAAGTTGTTTTTGAAAAGGAAGCCATTCACTATATGGAAATCATTACAATTGATATGATTATTACACTTAGTCCAAATTTCATGGAAATCAGGGTCATTATCATACAACGTGGGAAGAGAATCAAATGCGATAATACTATCTTTAAGAATTGTTAAAATGTTAACTTTCCTACTTAGAGCATCTGCCACAATATTAGTATTTCCAACCTTATGTTTAATGACAAAATCAAACCTTTGTAGAAAAGACAACCAATGAGCATGCATTCTACTAATTGTTTTTTGGGTTTGCAAAAATTTGAGTGAAAAATGATCAGAAAAGAGAATGAATTCATGAGCTGAAAGATAGTGTTCCCAAACCTTGAGGGCTCTTACCAA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BLAST of CmUC11G211900 vs. NCBI nr
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BLAST of CmUC11G211900 vs. NCBI nr
Match: XP_004138892.1 (probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1104.0 bits (2854), Expect = 0.0e+00 Identity = 551/597 (92.29%), Postives = 554/597 (92.80%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. NCBI nr
Match: XP_031736773.1 (probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1099.0 bits (2841), Expect = 0.0e+00 Identity = 551/599 (91.99%), Postives = 554/599 (92.49%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. NCBI nr
Match: XP_022144490.1 (probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1090.5 bits (2819), Expect = 0.0e+00 Identity = 544/596 (91.28%), Postives = 551/596 (92.45%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. NCBI nr
Match: XP_022965653.1 (probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1073.2 bits (2774), Expect = 8.7e-310 Identity = 537/598 (89.80%), Postives = 546/598 (91.30%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W468 (Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI8 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 815.5 bits (2105), Expect = 3.9e-235 Identity = 407/580 (70.17%), Postives = 470/580 (81.03%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84RR0 (Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 772.3 bits (1993), Expect = 3.8e-222 Identity = 393/570 (68.95%), Postives = 457/570 (80.18%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L829 (Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 705.7 bits (1820), Expect = 4.3e-202 Identity = 360/568 (63.38%), Postives = 437/568 (76.94%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0C8K8 (Putative E3 ubiquitin-protein ligase ARI6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI6 PE=5 SV=1) HSP 1 Score: 657.1 bits (1694), Expect = 1.8e-187 Identity = 337/565 (59.65%), Postives = 422/565 (74.69%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SKC2 (Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ARI11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 527.7 bits (1358), Expect = 1.6e-148 Identity = 268/515 (52.04%), Postives = 354/515 (68.74%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4U8 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485827 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1104.7 bits (2856), Expect = 0.0e+00 Identity = 549/597 (91.96%), Postives = 554/597 (92.80%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CRR9 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014168 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1090.5 bits (2819), Expect = 0.0e+00 Identity = 544/596 (91.28%), Postives = 551/596 (92.45%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HPL6 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465486 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1073.2 bits (2774), Expect = 4.2e-310 Identity = 537/598 (89.80%), Postives = 546/598 (91.30%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FIK3 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444256 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1068.5 bits (2762), Expect = 9.3e-309 Identity = 535/597 (89.61%), Postives = 545/597 (91.29%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4Y9 (RBR-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485827 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1036.2 bits (2678), Expect = 5.2e-299 Identity = 522/597 (87.44%), Postives = 527/597 (88.27%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. TAIR 10
Match: AT1G65430.1 (IBR domain-containing protein ) HSP 1 Score: 815.5 bits (2105), Expect = 2.7e-236 Identity = 407/580 (70.17%), Postives = 470/580 (81.03%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. TAIR 10
Match: AT2G31510.1 (IBR domain-containing protein ) HSP 1 Score: 772.3 bits (1993), Expect = 2.7e-223 Identity = 393/570 (68.95%), Postives = 457/570 (80.18%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. TAIR 10
Match: AT1G05890.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 705.7 bits (1820), Expect = 3.1e-203 Identity = 360/568 (63.38%), Postives = 437/568 (76.94%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. TAIR 10
Match: AT1G05890.2 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 685.3 bits (1767), Expect = 4.3e-197 Identity = 360/610 (59.02%), Postives = 437/610 (71.64%), Query Frame = 0
BLAST of CmUC11G211900 vs. TAIR 10
Match: AT2G31760.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 522.3 bits (1344), Expect = 4.8e-148 Identity = 260/503 (51.69%), Postives = 342/503 (67.99%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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