CmUC08G150320 (gene) Watermelon (USVL531) v1

Overview
NameCmUC08G150320
Typegene
OrganismCitrullus mucosospermus (Watermelon (USVL531) v1)
DescriptionNuclear pore complex protein NUP1-like
LocationCmU531Chr08: 19699976 .. 19708288 (-)
RNA-Seq ExpressionCmUC08G150320
SyntenyCmUC08G150320
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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mRNA sequence

AAACCCTAATTTGCTCAATACCTTACTTTCTTTCTCCCCCTTTCAACAATTTCCTCTGTATTCCGCCATTGAAGAGAAGCCCTCAACTCTGTGTTGTTAATGGCGACAGAGCGTGAGGAGGTTCGATACGAAGGAGGAAGAGGTGGGAAGTTTCAGAAAAGGCCTATCAGAAGGTCGCATACGACGCCGTATGATCGACCGCCGACTGCTCTGAGGAACTCTGCTGGAAAAGGATGGCTTTCTAAGCTTGTCGATCCGGCACAGAAGCTAATCACCTCCAGTGCGCACCGGCTGTTTTCTAGTGTGTTTCGTAAACGCCTTCCCCCTCCGCCGCCGTCATTGCCACTTTCTCGAGAGGCTAATGATGAGGTGGAAAATAGGAATCAGGAAGAAGTTTCAGCTGATCCTCCTGGAACTCAAGAAGGGACTAATGTTGATTTTGTTCCAAGCATCAATTCTAATAACACACATGGGGTGAGTGACCTTGAGAAAATTTTGAAGGAGAAGACCTTTACAAGATTTGAGATTGATCGCTTGACTGAACTTCTGAAATCAAGAGTTGCTGATGTTCCAAGTGGAGTTGAATCGAGGAAATTTGAACAGGTCCCTTCAACCCCTGTTATGAGTTATGGAAAGCAGGAAGGATCTCCACAATTCCCAGCTCAGAGTCAAGATGGAGTTAGCCCTCATATGGTTCCAACTCATGCTGTGAGTGCAAATGTAGGAATCTCTGTCCTTGATGAGGATGTTGCTTCACCTGCAGAGATTGCAAAAGCATACATGGGCAGCAGGCCTCCAAACGCAACTCCGTTGAGTATGGCATCCCATGGTCAAAAGTTCGGGGATAGTTTTGCTTCGGGCAATCCTTCAAAATCCTCTACCTTATCTCTTGTGCCAAGGTCTCCTGGAAATTTTAATGTTGTTGAAAATGGTTTTGTCACCCCGAGATCTCGTGGTAGATCTGCCCTATATAGTATGGCTCGAGTGCCATATTCCAGAGTTCGTGCAACCCCCAGCATAACGAATAGTGTAGCAACAACAGATGCTTACAGGGCCACAACGTCCTCATCATCTCAGTCAGCATGGGGGCAAGGGAGACTTTTGGGGTCTGAACAAGGGGCTTTAAAACGCCGAAGCTCAGTTTTAGATGATGAAATGGGATCTGTTGGTCCTATTCGAAGAATTCGCCAGAAGTCCAATCACCTTTTCCCTAAAGGTTTGAGTTTACCAAGCAGTTCCACTTCTATTCCAGTAAGTGGAATTGGTTCTGAGACTGCTCAGCATTTGCAGTCTACAAAAGTACATCCATTTTCGTCTACTGGTGGGAAGGCACTTTATTCAAGTGAGACCAAGCGTAATTTGTCCAAAATGTCTACAGGGTCTGAAAATGCTATGACACCTTCAAGTTTTCCTCAAATTCCCCTCAGGTCAAGTGAGATGGCATCAAAAATATTAGAGCAGCTTGATAAATTAACCCCTCCAAAGGAAAAATCCTCAGAACTAAAGCTGCTTAGTGTGAGGAATAACTCACCCACGAAGTTGTCACCATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAGAAGCCTGGAGGATGTGGATTCAGCTAAGTATTTGGACAATGTTGAAGGTGTACGGTCTAATAATGCCCGTGATCTTACTTCTCAAAAGAAGGATAAGATTGAGGAAAACAGTCCATTAAAATTTAAGGTACCCAATGACAAATCTATTTCTACAGGTGATTGTGTAGGCTCTTCAGTGCCTACTAAGGATACCGTATCTGGATCTGGTCTGCAAGTTTCATGTGTTGGCCCTTCCTTACCAACAAAATGTGCTTTCCAGATGAGTGCACATGAGGATTTTGTGGATATTGATGAAGAGGGATATTCTAATGGGCCAGTAGCTGATAAATCATTTGAGAAGCGAGAAAAAGCTGACTCATTAGTGGCACTGAGTAAGCTGGATAATACCGAAGCCATCACAGTAGATAAACCTCAGGCTTCAATTGAGGCTAAATCATCCGCAGTATCTGCAACGAACAAAATAAATGACTCTGGAAAATCTGATGTTCCTGTGGCTACTGAAAAGAGCCCCATTTTTTCCTTTCCGACAGCTTCTTCACCTAGCATTACAGCCAACGTGATAGGTCCTGAGTCAACCTTGAGACCTGAAAAAATTGCTTCGTCTGAGGTACCAAAAGCAGCTACTACCCCTATATTTGGCTTTGGAGAAAAGTTTCCATCACAGAAGGAAGCGGTTTCTTCTGCCCCCACCTTTGCATTTGGAAACAGGGTTACAACCTCAACAAATGAACAAAATGCTACTCCTGTTGTAACTTCTGAAGGCAACGTTGAACCAACTCAACAGGCTTCTGCCGCTACCACATTTAAATTTGGAGATAAAGCTACATTTCCTATGCCAGCAAATGCCGCTACAGAAAATGGAAATAAGAACGCAGGGTCTCCGTTTAAGTTTGCATCACCTTTAGTTAATGAAAAAGAAGGTGCTAAAGTAGGCGGCAGTTCCTCAGTTTTTAAATCTGAGAGTTCTAGCAGCAGCATCCCGTCATTTGGAGTTCCAAAAGAGTCCATGTCAGAGAAAGCCGGTGATAAGAGTTCGAGTGCTGCTGGTCTCGCAGTTGGTACATCTGGGAATCTGTTTTTGTCATCTGTCTCAACATCAACATCAACACCAACTCCTAGTTTGTTTTCTTTTAGCTCCCCTAGCACTAATTCGAATCTCAACAACGGATCTCCTGTTTCTACTACGCCATCTACTTTTCCCACCCCAGCGACCACCGTTTCTAATAATATAACAAATCAGAATTCATCCATCAAACTATCTTTCAATACTGCTGGCACTAGCAATAGTGAACCTGTCACCACTACTAGTCTTCCTACGTCTTCTCCTGTGCCATCCTTTTCAGCTGCACCTATTTTCAAATTTGGAAGCTCGAGTGTTCCTTCTACTTCCGCTCCAGCTCTATCAGCACCAAGCGGAGTTGGATCCGTAGAAACCAAGACCAAGCAAGAGTCAGCATTCGGCAATTTAAGTGGCATTCCTCCAAACGATGCATCCGCTGTTAAAGCATCTAGTACTGGAAGCAGTGTTTTTCAATTTGGAGCTGCATCTACTACTTCAGATTCTATTAAACGACCAGAAAATTCAACTTTCGCTCCAAGCAACGTACCTGCATTTGGGGCTCTGGTTTCGCCTGCGAGTAGTGGGCTTGCATCGTCTACTCAGAGTACACCTGTTCTGCAGTTCAATTCATCATCTACATCATTTGGTTTGACTGGGAATACGGGTTTGGCCTCTGGCAGTTCTCTGTTTGGTTCTTCAGCTCCAGCATCTAATTTGTTCACTTCGGGCACGGGTTTCGGGCTTGCTTCGTCCAGTTCCTCTGCTAATAATTCTGTCAGCTCCAGTGCTGGTACTAGTTCTAGCTTCTTTAACTGGCAGCCTTCCTCCACACCATCATTTTCTACCGGCTTTAGCTCCACTCCAACTGGTGGATTCTCCTTTGGTCTTTCATCTTCTTCCGCTGCTTCTAATAGTGCACCTATGATCTTTGGATCATCATCGACTGATGCATCGACACCCTCTATGTTCTCATTTACTTCAGCTGCAGCCGCGACAACGTCACAGCCTGCTTTTGGTAATTCCAATCATGCCTTCACTTTTGGTTCAACACCTCCTGCTAATAATGAGCAAGCAAGTATGGAGGATAGCATGGCTGAGGATACCGTCCAGACAGTTGCGTCACCTATGCCTAGTTTCGGGCAACAGCCTCTCACGCCACCTCCATCATCAGGGTTTATGTTTGGTTCAACAGCTCCATCTCCACTAGGAGCAAATCCTTTCCAATTTGGTGGTAGCCAGCAAAATGTACCTACCCCACAGAATCCCTCCCCATTCCAGGCTTCTGGTAGCTTAGACTTCAATGCCAGTGCTGGAGGGAGCTTCTCATTGGGCGCCGGTGGCGGCGACAAATCGAACCGAAAATACGTGAAAGTTAAAAGCAAATCAAGAAAGAAGTAGTAGGGAATCAAGAGAGAAGGTATTCAGTTTTTTTTTTTTTCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTTTCTATATCCCAGCTATTTTTCATCTAGGAAAAAATTATATTACCATCTCCGTCACATCAATGACTGAAAAGAGGAGGGGTGGAGGGGTAGGGTATCATTTGTCACCTGGATTGTTTGATTTCGACATGATACGAGGAAGCGTTGAAGCCGAGAATTGTTGGTTTCTGTCTTCTCGTTTAGCGAATGCTTTGGTTGGCAAAATTTTTCGTGGTTTGGTTGAGAGAGTATAAGTTGACAAATTTTGTATTAGCTTAATTAGCAAAGTGGAAGAACATTCTCTGTGTACTGTAGTAAGTAGTCTGTCAATGTTTGAGGTAACAACCATCTTCTTCTATGTGCTATGGACTCAGTTTTCCTGTAATCTTTTATTTGTAACATAAGAAAAAGGAAATATATGCTGTTGTCCAAGGAAGCATCATTTGTTGCTCTCCTCATAATTCTTCTTC

Coding sequence (CDS)

ATGGCGACAGAGCGTGAGGAGGTTCGATACGAAGGAGGAAGAGGTGGGAAGTTTCAGAAAAGGCCTATCAGAAGGTCGCATACGACGCCGTATGATCGACCGCCGACTGCTCTGAGGAACTCTGCTGGAAAAGGATGGCTTTCTAAGCTTGTCGATCCGGCACAGAAGCTAATCACCTCCAGTGCGCACCGGCTGTTTTCTAGTGTGTTTCGTAAACGCCTTCCCCCTCCGCCGCCGTCATTGCCACTTTCTCGAGAGGCTAATGATGAGGTGGAAAATAGGAATCAGGAAGAAGTTTCAGCTGATCCTCCTGGAACTCAAGAAGGGACTAATGTTGATTTTGTTCCAAGCATCAATTCTAATAACACACATGGGGTGAGTGACCTTGAGAAAATTTTGAAGGAGAAGACCTTTACAAGATTTGAGATTGATCGCTTGACTGAACTTCTGAAATCAAGAGTTGCTGATGTTCCAAGTGGAGTTGAATCGAGGAAATTTGAACAGGTCCCTTCAACCCCTGTTATGAGTTATGGAAAGCAGGAAGGATCTCCACAATTCCCAGCTCAGAGTCAAGATGGAGTTAGCCCTCATATGGTTCCAACTCATGCTGTGAGTGCAAATGTAGGAATCTCTGTCCTTGATGAGGATGTTGCTTCACCTGCAGAGATTGCAAAAGCATACATGGGCAGCAGGCCTCCAAACGCAACTCCGTTGAGTATGGCATCCCATGGTCAAAAGTTCGGGGATAGTTTTGCTTCGGGCAATCCTTCAAAATCCTCTACCTTATCTCTTGTGCCAAGGTCTCCTGGAAATTTTAATGTTGTTGAAAATGGTTTTGTCACCCCGAGATCTCGTGGTAGATCTGCCCTATATAGTATGGCTCGAGTGCCATATTCCAGAGTTCGTGCAACCCCCAGCATAACGAATAGTGTAGCAACAACAGATGCTTACAGGGCCACAACGTCCTCATCATCTCAGTCAGCATGGGGGCAAGGGAGACTTTTGGGGTCTGAACAAGGGGCTTTAAAACGCCGAAGCTCAGTTTTAGATGATGAAATGGGATCTGTTGGTCCTATTCGAAGAATTCGCCAGAAGTCCAATCACCTTTTCCCTAAAGGTTTGAGTTTACCAAGCAGTTCCACTTCTATTCCAGTAAGTGGAATTGGTTCTGAGACTGCTCAGCATTTGCAGTCTACAAAAGTACATCCATTTTCGTCTACTGGTGGGAAGGCACTTTATTCAAGTGAGACCAAGCGTAATTTGTCCAAAATGTCTACAGGGTCTGAAAATGCTATGACACCTTCAAGTTTTCCTCAAATTCCCCTCAGGTCAAGTGAGATGGCATCAAAAATATTAGAGCAGCTTGATAAATTAACCCCTCCAAAGGAAAAATCCTCAGAACTAAAGCTGCTTAGTGTGAGGAATAACTCACCCACGAAGTTGTCACCATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAGAAGCCTGGAGGATGTGGATTCAGCTAAGTATTTGGACAATGTTGAAGGTGTACGGTCTAATAATGCCCGTGATCTTACTTCTCAAAAGAAGGATAAGATTGAGGAAAACAGTCCATTAAAATTTAAGGTACCCAATGACAAATCTATTTCTACAGGTGATTGTGTAGGCTCTTCAGTGCCTACTAAGGATACCGTATCTGGATCTGGTCTGCAAGTTTCATGTGTTGGCCCTTCCTTACCAACAAAATGTGCTTTCCAGATGAGTGCACATGAGGATTTTGTGGATATTGATGAAGAGGGATATTCTAATGGGCCAGTAGCTGATAAATCATTTGAGAAGCGAGAAAAAGCTGACTCATTAGTGGCACTGAGTAAGCTGGATAATACCGAAGCCATCACAGTAGATAAACCTCAGGCTTCAATTGAGGCTAAATCATCCGCAGTATCTGCAACGAACAAAATAAATGACTCTGGAAAATCTGATGTTCCTGTGGCTACTGAAAAGAGCCCCATTTTTTCCTTTCCGACAGCTTCTTCACCTAGCATTACAGCCAACGTGATAGGTCCTGAGTCAACCTTGAGACCTGAAAAAATTGCTTCGTCTGAGGTACCAAAAGCAGCTACTACCCCTATATTTGGCTTTGGAGAAAAGTTTCCATCACAGAAGGAAGCGGTTTCTTCTGCCCCCACCTTTGCATTTGGAAACAGGGTTACAACCTCAACAAATGAACAAAATGCTACTCCTGTTGTAACTTCTGAAGGCAACGTTGAACCAACTCAACAGGCTTCTGCCGCTACCACATTTAAATTTGGAGATAAAGCTACATTTCCTATGCCAGCAAATGCCGCTACAGAAAATGGAAATAAGAACGCAGGGTCTCCGTTTAAGTTTGCATCACCTTTAGTTAATGAAAAAGAAGGTGCTAAAGTAGGCGGCAGTTCCTCAGTTTTTAAATCTGAGAGTTCTAGCAGCAGCATCCCGTCATTTGGAGTTCCAAAAGAGTCCATGTCAGAGAAAGCCGGTGATAAGAGTTCGAGTGCTGCTGGTCTCGCAGTTGGTACATCTGGGAATCTGTTTTTGTCATCTGTCTCAACATCAACATCAACACCAACTCCTAGTTTGTTTTCTTTTAGCTCCCCTAGCACTAATTCGAATCTCAACAACGGATCTCCTGTTTCTACTACGCCATCTACTTTTCCCACCCCAGCGACCACCGTTTCTAATAATATAACAAATCAGAATTCATCCATCAAACTATCTTTCAATACTGCTGGCACTAGCAATAGTGAACCTGTCACCACTACTAGTCTTCCTACGTCTTCTCCTGTGCCATCCTTTTCAGCTGCACCTATTTTCAAATTTGGAAGCTCGAGTGTTCCTTCTACTTCCGCTCCAGCTCTATCAGCACCAAGCGGAGTTGGATCCGTAGAAACCAAGACCAAGCAAGAGTCAGCATTCGGCAATTTAAGTGGCATTCCTCCAAACGATGCATCCGCTGTTAAAGCATCTAGTACTGGAAGCAGTGTTTTTCAATTTGGAGCTGCATCTACTACTTCAGATTCTATTAAACGACCAGAAAATTCAACTTTCGCTCCAAGCAACGTACCTGCATTTGGGGCTCTGGTTTCGCCTGCGAGTAGTGGGCTTGCATCGTCTACTCAGAGTACACCTGTTCTGCAGTTCAATTCATCATCTACATCATTTGGTTTGACTGGGAATACGGGTTTGGCCTCTGGCAGTTCTCTGTTTGGTTCTTCAGCTCCAGCATCTAATTTGTTCACTTCGGGCACGGGTTTCGGGCTTGCTTCGTCCAGTTCCTCTGCTAATAATTCTGTCAGCTCCAGTGCTGGTACTAGTTCTAGCTTCTTTAACTGGCAGCCTTCCTCCACACCATCATTTTCTACCGGCTTTAGCTCCACTCCAACTGGTGGATTCTCCTTTGGTCTTTCATCTTCTTCCGCTGCTTCTAATAGTGCACCTATGATCTTTGGATCATCATCGACTGATGCATCGACACCCTCTATGTTCTCATTTACTTCAGCTGCAGCCGCGACAACGTCACAGCCTGCTTTTGGTAATTCCAATCATGCCTTCACTTTTGGTTCAACACCTCCTGCTAATAATGAGCAAGCAAGTATGGAGGATAGCATGGCTGAGGATACCGTCCAGACAGTTGCGTCACCTATGCCTAGTTTCGGGCAACAGCCTCTCACGCCACCTCCATCATCAGGGTTTATGTTTGGTTCAACAGCTCCATCTCCACTAGGAGCAAATCCTTTCCAATTTGGTGGTAGCCAGCAAAATGTACCTACCCCACAGAATCCCTCCCCATTCCAGGCTTCTGGTAGCTTAGACTTCAATGCCAGTGCTGGAGGGAGCTTCTCATTGGGCGCCGGTGGCGGCGACAAATCGAACCGAAAATACGTGAAAGTTAAAAGCAAATCAAGAAAGAAGTAG

Protein sequence

MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVSADPPGTQEGTNVDFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVMSYGKQEGSPQFPAQSQDGVSPHMVPTHAVSANVGISVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPNATPLSMASHGQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFNVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSITNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSETKRNLSKMSTGSENAMTPSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLDNVEGVRSNNARDLTSQKKDKIEENSPLKFKVPNDKSISTGDCVGSSVPTKDTVSGSGLQVSCVGPSLPTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGYSNGPVADKSFEKREKADSLVALSKLDNTEAITVDKPQASIEAKSSAVSATNKINDSGKSDVPVATEKSPIFSFPTASSPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPTFAFGNRVTTSTNEQNATPVVTSEGNVEPTQQASAATTFKFGDKATFPMPANAATENGNKNAGSPFKFASPLVNEKEGAKVGGSSSVFKSESSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSAAGLAVGTSGNLFLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSPVSTTPSTFPTPATTVSNNITNQNSSIKLSFNTAGTSNSEPVTTTSLPTSSPVPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSVETKTKQESAFGNLSGIPPNDASAVKASSTGSSVFQFGAASTTSDSIKRPENSTFAPSNVPAFGALVSPASSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNLFTSGTGFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPMIFGSSSTDASTPSMFSFTSAAAATTSQPAFGNSNHAFTFGSTPPANNEQASMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Homology
[Close]
BLAST of CmUC08G150320 vs. NCBI nr
Match: XP_038884354.1 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 2091.6 bits (5418), Expect = 0.0e+00
Identity = 1177/1312 (89.71%), Postives = 1222/1312 (93.14%), Query Frame = 0 

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVSADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDE+ENRNQEEV+ADPP TQEGTNVDFVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEMENRNQEEVAADPPVTQEGTNVDFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVMSYGKQ 180
            NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVES K EQVPSTPV+SYGKQ
Sbjct: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESGKLEQVPSTPVISYGKQ 180

Query: 181  EGSPQFPAQSQDGVSPHMVPTHAVSANVGISVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPNATPLSM 240
            EG P+FPAQSQDGVSPHMV TH VSAN    VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPP ATPLSM
Sbjct: 181  EGCPKFPAQSQDGVSPHMVSTHVVSAN----VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSM 240

Query: 241  ASHGQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFNVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300
            ASH QKFGD F+ GNPSKS TLSL+PRSPGNF+ VENGFVTPRSRGRSALYSMAR+PYSR
Sbjct: 241  ASHSQKFGDGFSLGNPSKSPTLSLMPRSPGNFD-VENGFVTPRSRGRSALYSMARMPYSR 300

Query: 301  VRATPSITNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIR 360
            VRATPSI NSVATTDAYRA TSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRR+SVLDDEMGSVGPIR
Sbjct: 301  VRATPSIKNSVATTDAYRA-TSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRNSVLDDEMGSVGPIR 360

Query: 361  RIRQKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSETKRN 420
            RIR KSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSET+QHLQSTKVHPFSSTGGK LYSSETKRN
Sbjct: 361  RIRHKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSTGGKGLYSSETKRN 420

Query: 421  LSKMSTGSENAMTP-SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPT 480
            LSKMS  SEN M P SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSP+
Sbjct: 421  LSKMSAESENDMIPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPS 480

Query: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLDNVEGVRSNNARDLTSQKKDKIEENSPLKFKVPNDK 540
            KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL+NVEG+RSN+A DLTS+K DK EE+SPLKFKVPNDK
Sbjct: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDACDLTSKKNDKFEESSPLKFKVPNDK 540

Query: 541  SISTGDCVGSSVPTKDTVSGSGLQVSCVGPSLPTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGYSNGPVA 600
            SISTG+ VGSSVP K+TVSGSG QVS VGPSL TKCAFQMSAHEDFVD+DEEGYSNGPVA
Sbjct: 541  SISTGNGVGSSVP-KETVSGSGQQVSFVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVA 600

Query: 601  DKSFEKREKADSLVALSKLDNTEAITVDKPQASIEAKSSAVSATNKINDSGKSDVPVATE 660
            D S E++EK +SLVA+SK +NTEAITVDKPQASIEAK   VSA NKIND GKSDVPV TE
Sbjct: 601  DISIERQEKVNSLVAVSKPNNTEAITVDKPQASIEAKPPTVSAMNKINDQGKSDVPVTTE 660

Query: 661  KSPIFSFPTASSPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSS 720
            KSPIFSFPT SSPSITANVIGPES +RPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVS 
Sbjct: 661  KSPIFSFPTTSSPSITANVIGPESNMRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSF 720

Query: 721  APTFAFGNRVTTSTNEQNATPVVTSEGNVEPTQQASAATTFKFGDKATFPMPANAATENG 780
            APTFAF N++TTSTNEQNA PVVTSEGNV+PTQQASA TTFKFGDKATFP+PANAATENG
Sbjct: 721  APTFAFVNKITTSTNEQNAIPVVTSEGNVQPTQQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENG 780

Query: 781  NKNAGSPFKFASPLVNEKEGAKVGGSSSVFKSESSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSA 840
            NKN GSP  FASPLVNEKEGAK GGS+SVFK+ESSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS 
Sbjct: 781  NKNEGSPL-FASPLVNEKEGAKEGGSASVFKAESSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS- 840

Query: 841  AGLAVGTSGNLFLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSPVSTTPSTFPTPATTVS 900
            AG AVGTSG+LF SSVSTS STPT  LFSFSSPSTNSNLNNGS VSTTPS FPTPATT S
Sbjct: 841  AGFAVGTSGSLFSSSVSTSISTPTSGLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPS-FPTPATTFS 900

Query: 901  NNITNQNSSIKLSFNTAGTSNSEPVTTTSLPTSSPVPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPAL 960
            NNITNQNSSIK SFN A  SNSEPVTTTSLPTSS +PSFSAAPI KFGSSSVPSTSAPAL
Sbjct: 901  NNITNQNSSIKPSFN-AAASNSEPVTTTSLPTSSLMPSFSAAPISKFGSSSVPSTSAPAL 960

Query: 961  SAPSGVGSVETKTKQESAFGNLSGIPPNDASAVKASSTGSSVFQFGAASTTSDSIKRPEN 1020
            SAPSGVGS+E+KTKQE+ FGNLSGIPP+D SAVK SSTGSSVFQFGAAST SDS KRP N
Sbjct: 961  SAPSGVGSIESKTKQETTFGNLSGIPPSDLSAVKVSSTGSSVFQFGAASTPSDSNKRPAN 1020

Query: 1021 STFAPSNVPAFGALVSPASSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSA 1080
            STF PSNVP FGA  SP SSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSA
Sbjct: 1021 STFTPSNVPTFGASFSPVSSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSA 1080

Query: 1081 PASNLFTSGTGFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFSF 1140
            PASNLF SG  FGLASSSSS NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFSF
Sbjct: 1081 PASNLFASGPTFGLASSSSSVNNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFSF 1140

Query: 1141 GLSSSSAASNSAPMIFGSSSTDASTPSMFSFTSAAAATTSQPAFGNSNHAFTFGSTPPAN 1200
            GLSSSSAASNSAP++FGSSST + TPSMFSFTSAA ATTSQPAFGNSNH FTFGSTPPAN
Sbjct: 1141 GLSSSSAASNSAPVLFGSSSTGSLTPSMFSFTSAATATTSQPAFGNSNHGFTFGSTPPAN 1200

Query: 1201 NEQASMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQ 1260
            N+QA+MEDSMAEDTVQTV SPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAP PLGA+PFQFGGSQQ
Sbjct: 1201 NDQANMEDSMAEDTVQTVTSPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP-PLGASPFQFGGSQQ 1260

Query: 1261 NVPTPQ-NPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1311
            NVPTPQ NPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 NVPTPQNNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1300

[Close]
BLAST of CmUC08G150320 vs. NCBI nr
Match: XP_038884353.1 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 2085.8 bits (5403), Expect = 0.0e+00
Identity = 1177/1316 (89.44%), Postives = 1222/1316 (92.86%), Query Frame = 0 

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVSADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDE+ENRNQEEV+ADPP TQEGTNVDFVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEMENRNQEEVAADPPVTQEGTNVDFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVMSYGKQ 180
            NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVES K EQVPSTPV+SYGKQ
Sbjct: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESGKLEQVPSTPVISYGKQ 180

Query: 181  EGSPQFPAQSQDGVSPHMVPTHAVSANVGISVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPNATPLSM 240
            EG P+FPAQSQDGVSPHMV TH VSAN    VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPP ATPLSM
Sbjct: 181  EGCPKFPAQSQDGVSPHMVSTHVVSAN----VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSM 240

Query: 241  ASHGQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFNVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300
            ASH QKFGD F+ GNPSKS TLSL+PRSPGNF+ VENGFVTPRSRGRSALYSMAR+PYSR
Sbjct: 241  ASHSQKFGDGFSLGNPSKSPTLSLMPRSPGNFD-VENGFVTPRSRGRSALYSMARMPYSR 300

Query: 301  VRATPSITNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIR 360
            VRATPSI NSVATTDAYRA TSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRR+SVLDDEMGSVGPIR
Sbjct: 301  VRATPSIKNSVATTDAYRA-TSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRNSVLDDEMGSVGPIR 360

Query: 361  RIRQKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSETKRN 420
            RIR KSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSET+QHLQSTKVHPFSSTGGK LYSSETKRN
Sbjct: 361  RIRHKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSTGGKGLYSSETKRN 420

Query: 421  LSKMSTGSENAMTP-SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPT 480
            LSKMS  SEN M P SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSP+
Sbjct: 421  LSKMSAESENDMIPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPS 480

Query: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLDNVEGVRSNNARDLTSQKKDKIEENSPLKFKVPNDK 540
            KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL+NVEG+RSN+A DLTS+K DK EE+SPLKFKVPNDK
Sbjct: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDACDLTSKKNDKFEESSPLKFKVPNDK 540

Query: 541  SISTGDCVGSSVPTKDTVSGSGLQVSCVGPSLPTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGYSNGPVA 600
            SISTG+ VGSSVP K+TVSGSG QVS VGPSL TKCAFQMSAHEDFVD+DEEGYSNGPVA
Sbjct: 541  SISTGNGVGSSVP-KETVSGSGQQVSFVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVA 600

Query: 601  DKSFEKREKADSLVALSKLDNTEAITVDKPQASIEAKSSAVSATNKINDSGKSDVPVATE 660
            D S E++EK +SLVA+SK +NTEAITVDKPQASIEAK   VSA NKIND GKSDVPV TE
Sbjct: 601  DISIERQEKVNSLVAVSKPNNTEAITVDKPQASIEAKPPTVSAMNKINDQGKSDVPVTTE 660

Query: 661  KSPIFSFPTASSPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSS 720
            KSPIFSFPT SSPSITANVIGPES +RPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVS 
Sbjct: 661  KSPIFSFPTTSSPSITANVIGPESNMRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSF 720

Query: 721  APTFAFGNRVTTSTNEQNATPVVTSEGNVEPTQQASAATTFKFGDKATFPMPANAATENG 780
            APTFAF N++TTSTNEQNA PVVTSEGNV+PTQQASA TTFKFGDKATFP+PANAATENG
Sbjct: 721  APTFAFVNKITTSTNEQNAIPVVTSEGNVQPTQQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENG 780

Query: 781  NKNAGSPFKFASPLVNEKEGAKVGGSSSVFKSESSSS----SIPSFGVPKESMSEKAGDK 840
            NKN GSP  FASPLVNEKEGAK GGS+SVFK+ESSSS    SIPSFGVPKESMSEKAGDK
Sbjct: 781  NKNEGSPL-FASPLVNEKEGAKEGGSASVFKAESSSSSFNCSIPSFGVPKESMSEKAGDK 840

Query: 841  SSSAAGLAVGTSGNLFLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSPVSTTPSTFPTPA 900
            SSS AG AVGTSG+LF SSVSTS STPT  LFSFSSPSTNSNLNNGS VSTTPS FPTPA
Sbjct: 841  SSS-AGFAVGTSGSLFSSSVSTSISTPTSGLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPS-FPTPA 900

Query: 901  TTVSNNITNQNSSIKLSFNTAGTSNSEPVTTTSLPTSSPVPSFSAAPIFKFGSSSVPSTS 960
            TT SNNITNQNSSIK SFN A  SNSEPVTTTSLPTSS +PSFSAAPI KFGSSSVPSTS
Sbjct: 901  TTFSNNITNQNSSIKPSFN-AAASNSEPVTTTSLPTSSLMPSFSAAPISKFGSSSVPSTS 960

Query: 961  APALSAPSGVGSVETKTKQESAFGNLSGIPPNDASAVKASSTGSSVFQFGAASTTSDSIK 1020
            APALSAPSGVGS+E+KTKQE+ FGNLSGIPP+D SAVK SSTGSSVFQFGAAST SDS K
Sbjct: 961  APALSAPSGVGSIESKTKQETTFGNLSGIPPSDLSAVKVSSTGSSVFQFGAASTPSDSNK 1020

Query: 1021 RPENSTFAPSNVPAFGALVSPASSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLF 1080
            RP NSTF PSNVP FGA  SP SSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLF
Sbjct: 1021 RPANSTFTPSNVPTFGASFSPVSSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLF 1080

Query: 1081 GSSAPASNLFTSGTGFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTG 1140
            GSSAPASNLF SG  FGLASSSSS NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTG
Sbjct: 1081 GSSAPASNLFASGPTFGLASSSSSVNNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTG 1140

Query: 1141 GFSFGLSSSSAASNSAPMIFGSSSTDASTPSMFSFTSAAAATTSQPAFGNSNHAFTFGST 1200
            GFSFGLSSSSAASNSAP++FGSSST + TPSMFSFTSAA ATTSQPAFGNSNH FTFGST
Sbjct: 1141 GFSFGLSSSSAASNSAPVLFGSSSTGSLTPSMFSFTSAATATTSQPAFGNSNHGFTFGST 1200

Query: 1201 PPANNEQASMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFG 1260
            PPANN+QA+MEDSMAEDTVQTV SPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAP PLGA+PFQFG
Sbjct: 1201 PPANNDQANMEDSMAEDTVQTVTSPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP-PLGASPFQFG 1260

Query: 1261 GSQQNVPTPQ-NPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1311
            GSQQNVPTPQ NPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 GSQQNVPTPQNNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1304

[Close]
BLAST of CmUC08G150320 vs. NCBI nr
Match: XP_038884355.1 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X3 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 2077.4 bits (5381), Expect = 0.0e+00
Identity = 1173/1316 (89.13%), Postives = 1218/1316 (92.55%), Query Frame = 0 

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVSADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDE+ENRNQEEV+ADPP TQEGTNVDFVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEMENRNQEEVAADPPVTQEGTNVDFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVMSYGKQ 180
            NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVES K EQVPSTPV+SYGKQ
Sbjct: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESGKLEQVPSTPVISYGKQ 180

Query: 181  EGSPQFPAQSQDGVSPHMVPTHAVSANVGISVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPNATPLSM 240
            EG P+FPAQSQDGVSPHMV TH         VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPP ATPLSM
Sbjct: 181  EGCPKFPAQSQDGVSPHMVSTHV--------VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSM 240

Query: 241  ASHGQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFNVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300
            ASH QKFGD F+ GNPSKS TLSL+PRSPGNF+ VENGFVTPRSRGRSALYSMAR+PYSR
Sbjct: 241  ASHSQKFGDGFSLGNPSKSPTLSLMPRSPGNFD-VENGFVTPRSRGRSALYSMARMPYSR 300

Query: 301  VRATPSITNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIR 360
            VRATPSI NSVATTDAYRA TSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRR+SVLDDEMGSVGPIR
Sbjct: 301  VRATPSIKNSVATTDAYRA-TSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRNSVLDDEMGSVGPIR 360

Query: 361  RIRQKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSETKRN 420
            RIR KSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSET+QHLQSTKVHPFSSTGGK LYSSETKRN
Sbjct: 361  RIRHKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSTGGKGLYSSETKRN 420

Query: 421  LSKMSTGSENAMTP-SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPT 480
            LSKMS  SEN M P SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSP+
Sbjct: 421  LSKMSAESENDMIPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPS 480

Query: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLDNVEGVRSNNARDLTSQKKDKIEENSPLKFKVPNDK 540
            KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL+NVEG+RSN+A DLTS+K DK EE+SPLKFKVPNDK
Sbjct: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDACDLTSKKNDKFEESSPLKFKVPNDK 540

Query: 541  SISTGDCVGSSVPTKDTVSGSGLQVSCVGPSLPTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGYSNGPVA 600
            SISTG+ VGSSVP K+TVSGSG QVS VGPSL TKCAFQMSAHEDFVD+DEEGYSNGPVA
Sbjct: 541  SISTGNGVGSSVP-KETVSGSGQQVSFVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVA 600

Query: 601  DKSFEKREKADSLVALSKLDNTEAITVDKPQASIEAKSSAVSATNKINDSGKSDVPVATE 660
            D S E++EK +SLVA+SK +NTEAITVDKPQASIEAK   VSA NKIND GKSDVPV TE
Sbjct: 601  DISIERQEKVNSLVAVSKPNNTEAITVDKPQASIEAKPPTVSAMNKINDQGKSDVPVTTE 660

Query: 661  KSPIFSFPTASSPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSS 720
            KSPIFSFPT SSPSITANVIGPES +RPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVS 
Sbjct: 661  KSPIFSFPTTSSPSITANVIGPESNMRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSF 720

Query: 721  APTFAFGNRVTTSTNEQNATPVVTSEGNVEPTQQASAATTFKFGDKATFPMPANAATENG 780
            APTFAF N++TTSTNEQNA PVVTSEGNV+PTQQASA TTFKFGDKATFP+PANAATENG
Sbjct: 721  APTFAFVNKITTSTNEQNAIPVVTSEGNVQPTQQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENG 780

Query: 781  NKNAGSPFKFASPLVNEKEGAKVGGSSSVFKSESSSS----SIPSFGVPKESMSEKAGDK 840
            NKN GSP  FASPLVNEKEGAK GGS+SVFK+ESSSS    SIPSFGVPKESMSEKAGDK
Sbjct: 781  NKNEGSPL-FASPLVNEKEGAKEGGSASVFKAESSSSSFNCSIPSFGVPKESMSEKAGDK 840

Query: 841  SSSAAGLAVGTSGNLFLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSPVSTTPSTFPTPA 900
            SSS AG AVGTSG+LF SSVSTS STPT  LFSFSSPSTNSNLNNGS VSTTPS FPTPA
Sbjct: 841  SSS-AGFAVGTSGSLFSSSVSTSISTPTSGLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPS-FPTPA 900

Query: 901  TTVSNNITNQNSSIKLSFNTAGTSNSEPVTTTSLPTSSPVPSFSAAPIFKFGSSSVPSTS 960
            TT SNNITNQNSSIK SFN A  SNSEPVTTTSLPTSS +PSFSAAPI KFGSSSVPSTS
Sbjct: 901  TTFSNNITNQNSSIKPSFN-AAASNSEPVTTTSLPTSSLMPSFSAAPISKFGSSSVPSTS 960

Query: 961  APALSAPSGVGSVETKTKQESAFGNLSGIPPNDASAVKASSTGSSVFQFGAASTTSDSIK 1020
            APALSAPSGVGS+E+KTKQE+ FGNLSGIPP+D SAVK SSTGSSVFQFGAAST SDS K
Sbjct: 961  APALSAPSGVGSIESKTKQETTFGNLSGIPPSDLSAVKVSSTGSSVFQFGAASTPSDSNK 1020

Query: 1021 RPENSTFAPSNVPAFGALVSPASSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLF 1080
            RP NSTF PSNVP FGA  SP SSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLF
Sbjct: 1021 RPANSTFTPSNVPTFGASFSPVSSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLF 1080

Query: 1081 GSSAPASNLFTSGTGFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTG 1140
            GSSAPASNLF SG  FGLASSSSS NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTG
Sbjct: 1081 GSSAPASNLFASGPTFGLASSSSSVNNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTG 1140

Query: 1141 GFSFGLSSSSAASNSAPMIFGSSSTDASTPSMFSFTSAAAATTSQPAFGNSNHAFTFGST 1200
            GFSFGLSSSSAASNSAP++FGSSST + TPSMFSFTSAA ATTSQPAFGNSNH FTFGST
Sbjct: 1141 GFSFGLSSSSAASNSAPVLFGSSSTGSLTPSMFSFTSAATATTSQPAFGNSNHGFTFGST 1200

Query: 1201 PPANNEQASMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFG 1260
            PPANN+QA+MEDSMAEDTVQTV SPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAP PLGA+PFQFG
Sbjct: 1201 PPANNDQANMEDSMAEDTVQTVTSPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP-PLGASPFQFG 1260

Query: 1261 GSQQNVPTPQ-NPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1311
            GSQQNVPTPQ NPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 GSQQNVPTPQNNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1300

[Close]
BLAST of CmUC08G150320 vs. NCBI nr
Match: XP_008456625.1 (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo] >XP_008456626.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo] >KAA0031726.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK11787.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 1955.3 bits (5064), Expect = 0.0e+00
Identity = 1114/1313 (84.84%), Postives = 1180/1313 (89.87%), Query Frame = 0 

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATEREEV+YEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVSADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFS+VFRKRLPPPPPS  LSREAN+E+E+RNQEEV+ADP GTQEGTNV FVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVMSYGKQ 180
            +NT G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPV S+G Q
Sbjct: 121  SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180

Query: 181  EGSPQFPAQSQDGVSPHMVPTHAVSANVGISVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPNATPLSM 240
            EGSP+FP QSQDGVSPHM PTH V+AN    VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPP ATPLSM
Sbjct: 181  EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNAN----VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSM 240

Query: 241  ASHGQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFNVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300
            A            GNPSKSSTLSLVPRSPGNF+VVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR
Sbjct: 241  A------------GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300

Query: 301  VRATPSITNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIR 360
            VRATPSI NS+ATTDAYRATTSSSSQSAW QG LLGS+QGALKRR+SVLDD+MGSVGPIR
Sbjct: 301  VRATPSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIR 360

Query: 361  RIRQKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSETKRN 420
            R RQKSNHLFP GLSLPSSSTSIP SGI SETA+HLQSTKVHPFSS GGK LYSSET+RN
Sbjct: 361  RTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRN 420

Query: 421  LSKMSTGSENAMTP-SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPT 480
             SK S  S+NAMTP SSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSP 
Sbjct: 421  FSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPM 480

Query: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLDNVEGVRSNNARDLTSQKKDKIEENSPLKFKVPNDK 540
            KLSPSMLHGPALRSLE+VDSAKYL+NVEG++SN+A D TSQK DK EE+SP K  VPNDK
Sbjct: 481  KLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDK 540

Query: 541  SISTGDCVGSSVPTKDTVSGSGLQVSCVGPSLPTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGYSNGPVA 600
            SIST D VGSSVPTKD  SGSG+QVS VGPS+ TKCAFQMSAHEDFVD+DEEG+SNGPVA
Sbjct: 541  SISTSDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVA 600

Query: 601  DKSFEKREKA-DSLVALSKLDNTEAITVDKPQASIEAKSSAVSATNKINDSGKSDVPVAT 660
            DKSFE REK  DSLV++SK  NTEAITV K + SIEAK S VS  NKIND GKSDVP  T
Sbjct: 601  DKSFEMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTT 660

Query: 661  EKSPIFSFPTASSPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVS 720
            EKSPIFSFPT SSPS TANV GPES+LRPEK+AS E+PKAAT PIFGFGEK PSQKE +S
Sbjct: 661  EKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKETLS 720

Query: 721  SAPTFAFGNRVTTSTNEQNATPVVTSEGNVEPTQQASAATTFKFGDKATFPMPANAATEN 780
              PTFAFG++ TT TNEQNA PVVTSE N EPT+ AS  TTFKFGDKA+F +PANAATEN
Sbjct: 721  QPPTFAFGSKATT-TNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATEN 780

Query: 781  GNKNAGSPFKFASPLVNEKEGAKVGGSSSVFKSESSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS 840
            GNK+AGS FKF SPLVNEKEGA VGGS+SVFK+E+SSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS
Sbjct: 781  GNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS 840

Query: 841  AAGLAVGTSGNLFLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSPVSTTPSTFPTPATTV 900
              GL  GTSGNLF SS STSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGS VS TPST PTPATT 
Sbjct: 841  -PGLIFGTSGNLFSSSDSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTF 900

Query: 901  SNNITNQNSSIKLSFNTAGTSNSEPVTTTSLPTSSPVPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPA 960
            SNN+T+QNSSIK S + A TSNSEPVT+TS P SSP+PSFSAAPIFKFGSSSVPSTSA A
Sbjct: 901  SNNVTSQNSSIKPS-SIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASA 960

Query: 961  LSAPSGVGSVETKTKQESAFGNLSGIPPNDASAVKASSTGSSVFQFGAASTTSDSIKRPE 1020
            LSAPSGVGSVE KTK E+ FGNLSG+PP+D +AVK +STGSSVFQFGAASTTSD+ K P 
Sbjct: 961  LSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPA 1020

Query: 1021 NSTFAPSNVPAFGALVSPASSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSS 1080
            NSTFA +N+PAFGA VS +SSGLASSTQSTP LQF SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSS
Sbjct: 1021 NSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSS 1080

Query: 1081 APASNLFTSGTGFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFS 1140
            APASN FTSG  FGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+GGFS
Sbjct: 1081 APASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFS 1140

Query: 1141 FGLSSSSAASNSAPMIFGSSSTDASTPSMFSFTSAAAATTSQPAFGNSNHAFTFGSTPPA 1200
            FGLSSSS+ASNSAPM+FGSSST AS  SMFSFTSAA+ATTSQPAFGNSN+AFTFGSTPPA
Sbjct: 1141 FGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPA 1200

Query: 1201 -NNEQASMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGS 1260
             NNEQASMEDSMAEDTVQT ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGS
Sbjct: 1201 NNNEQASMEDSMAEDTVQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGS 1260

Query: 1261 QQNVPTPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1311
            QQNV  PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 QQNV--PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1290

[Close]
BLAST of CmUC08G150320 vs. NCBI nr
Match: XP_011656578.1 (nuclear pore complex protein NUP1 [Cucumis sativus] >XP_031742754.1 nuclear pore complex protein NUP1 [Cucumis sativus] >KGN46058.1 hypothetical protein Csa_005234 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 1939.1 bits (5022), Expect = 0.0e+00
Identity = 1100/1313 (83.78%), Postives = 1174/1313 (89.41%), Query Frame = 0 

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATERE+V+YEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLS LVDPA KLI S
Sbjct: 1    MATEREDVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSNLVDPAHKLINS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVSADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            +AH LFS+VFRKRLPPPPPS PLSREANDE+E+RNQEEV+ADP GTQEGTN+ FVPSINS
Sbjct: 61   TAHWLFSTVFRKRLPPPPPSFPLSREANDEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNIGFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVMSYGKQ 180
            NNT G+SDLEKIL EKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVP GVESRKFEQVPSTPV S+G Q
Sbjct: 121  NNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPRGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQ 180

Query: 181  EGSPQFPAQSQDGVSPHMVPTHAVSANVGISVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPNATPLSM 240
            EGSP+ P QSQDGVSPHM  TH V+AN    VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPP ATPLSM
Sbjct: 181  EGSPKLPTQSQDGVSPHMATTHVVTAN----VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSM 240

Query: 241  ASHGQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFNVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300
            A            GNP KSSTLSLVPRSPGNF+VVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR
Sbjct: 241  A------------GNPLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300

Query: 301  VRATPSITNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIR 360
            VRATPSI NS+AT DAYR+TT SSSQSAW QGRLLGS+QGALKRR+SVLDD+MGSVGPIR
Sbjct: 301  VRATPSIKNSIATADAYRSTTPSSSQSAWEQGRLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIR 360

Query: 361  RIRQKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSETKRN 420
            R RQKSNHLF   L LPSSSTSI  SGIGSETA+HLQSTKVHPFSS GGK LYS+E +RN
Sbjct: 361  RTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNEIQRN 420

Query: 421  LSKMSTGSENAMTP-SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPT 480
             SKM+  S+NAMTP SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSP 
Sbjct: 421  FSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPM 480

Query: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLDNVEGVRSNNARDLTSQKKDKIEENSPLKFKVPNDK 540
            KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL+NVEG+RSN+ARDLTSQK DK EE+SP KF VPNDK
Sbjct: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDK 540

Query: 541  SISTGDCVGSSVPTKDTVSGSGLQVSCVGPSLPTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGYSNGPVA 600
            SISTGD VGSSV TKD  SGSG+QVS VGPS+ TKCAFQMSAHEDFVD+DEEG+SNGPVA
Sbjct: 541  SISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVA 600

Query: 601  DKSFEKREKA-DSLVALSKLDNTEAITVDKPQASIEAKSSAVSATNKINDSGKSDVPVAT 660
            DKSFE + K  DSLV++SK  NTE ITVDK +ASIEAK   VS  NKIND GKSDVP  T
Sbjct: 601  DKSFEMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTT 660

Query: 661  EKSPIFSFPTASSPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVS 720
            EKSPIFSFPTASSPSITANV G ES+LRPEK+AS E+PKAAT PIFGFGEK PSQKEA S
Sbjct: 661  EKSPIFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKEAGS 720

Query: 721  SAPTFAFGNRVTTSTNEQNATPVVTSEGNVEPTQQASAATTFKFGDKATFPMPANAATEN 780
              PTFAFG++ TT TNEQN   VVTSE NVEPTQQAS  TTFKFGDKA+FP+PANAATEN
Sbjct: 721  HPPTFAFGSKATT-TNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATEN 780

Query: 781  GNKNAGSPFKFASPLVNEKEGAKVGGSSSVFKSESSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS 840
            GNK+AGS FKFASPLVNEKEGA VGGS+SVFK+E+SSSSIPSFGVPKES+SEKAGDKSSS
Sbjct: 781  GNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESISEKAGDKSSS 840

Query: 841  AAGLAVGTSGNLFLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSPVSTTPSTFPTPATTV 900
              GL  GTSGN F SSVSTSTSTPTPSLFSFS+PSTNSNLNNGS VSTTPST PTPATT 
Sbjct: 841  -PGLIFGTSGNFFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTF 900

Query: 901  SNNITNQNSSIKLSFNTAGTSNSEPVTTTSLPTSSPVPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPA 960
            SNN+T+QNSS+K SF +A TSNSEPV++TS PTSSP+PSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPA
Sbjct: 901  SNNVTSQNSSVKPSF-SAATSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPA 960

Query: 961  LSAPSGVGSVETKTKQESAFGNLSGIPPNDASAVKASSTGSSVFQFGAASTTSDSIKRPE 1020
            LSAPS VGSVETKTK E+ FGNLSG P +D SAVK +STG+SVFQFGAASTTSD+ K P 
Sbjct: 961  LSAPSVVGSVETKTKPETTFGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGPA 1020

Query: 1021 NSTFAPSNVPAFGALVSPASSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSS 1080
            NSTFA +N+PAFGA VS +SSGLA STQSTP LQF+SSSTSFGLT NTGLASGSSLFGSS
Sbjct: 1021 NSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSS 1080

Query: 1081 APASNLFTSGTGFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFS 1140
            APASN FTSG  FGLASSSSSA+NSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+GGFS
Sbjct: 1081 APASNPFTSGATFGLASSSSSASNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFS 1140

Query: 1141 FGLSSSSAASNSAPMIFGSSSTDASTPSMFSFTSAAAATTSQPAFGNSNHAFTFGSTPPA 1200
            FGLSSSS+ASNSAPM+FGSSST A + SMFSFTSAA+ATTSQPAFGNSN+AFTFGSTPPA
Sbjct: 1141 FGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPA 1200

Query: 1201 -NNEQASMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGS 1260
             NNEQASMEDSMAEDT+QT ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQF GS
Sbjct: 1201 NNNEQASMEDSMAEDTIQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGS 1260

Query: 1261 QQNVPTPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1311
            QQN+  PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 QQNL--PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1291

[Close]
BLAST of CmUC08G150320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CAF4 (Nuclear pore complex protein NUP1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 402.5 bits (1033), Expect = 1.8e-110
Identity = 487/1405 (34.66%), Postives = 688/1405 (48.97%), Query Frame = 0 

Query: 13   GRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRL 72
            G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+        G GWLSKLVDPAQ+LIT SA RL
Sbjct: 18   GTGGKFRKPTARRSQKTPYDRPTTSVRNAGLGGGDVRGGGWLSKLVDPAQRLITYSAQRL 77

Query: 73   FSSVFRKRL---------PPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVS----ADPPGTQEGTNV 132
            F S+ RKRL         P     LP  R  N E +  ++E+VS     +     E TN 
Sbjct: 78   FGSLSRKRLGSGETPLQSPEQQKQLP-ERGVNQETKVGHKEDVSNLSMKNGLIRMEDTNA 137

Query: 133  DFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPST 192
               P        G +DLEKIL+ KTFTR E+DRLT LL+S+ AD  +  E ++ E     
Sbjct: 138  SVDPP-----KDGFTDLEKILQGKTFTRSEVDRLTTLLRSKAADSSTMNEEQRNE----- 197

Query: 193  PVMSYGKQEGSPQFPAQSQDGVSPH--MVPTHAVSANVGISVLDEDVASPAEIAKAYMGS 252
                 G     P  P+  +D   P    + T   +    +  LDE +ASPA++AKAYMGS
Sbjct: 198  ----VGMVVRHP--PSHERDRTHPDNGSMNTLVSTPPGSLRTLDECIASPAQLAKAYMGS 257

Query: 253  RPPNATPLSMASHGQKFGDSFASGN----PSKSSTLSLVPRSPGNFNVVENGFVTPRSRG 312
            RP   TP  +   GQ   +     N    P KS T+SLV + P     +ENGFVTPRSRG
Sbjct: 258  RPSEVTPSMLGLRGQAGREDSVFLNRTPFPQKSPTMSLVTK-PSGQRPLENGFVTPRSRG 317

Query: 313  RSALYSMARVPYSRVRATPSITNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSEQG---ALK 372
            RSA+YSMAR PYSR +++  I            +   +S S W +    GS QG    LK
Sbjct: 318  RSAVYSMARTPYSRPQSSVKI-----------GSLFQASPSKWEESLPSGSRQGFQSGLK 377

Query: 373  RRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETAQHLQSTKVHP 432
            RRSSVLD+++GSVGP+RRIRQKSN L  + L+LP S + + V   G E   H        
Sbjct: 378  RRSSVLDNDIGSVGPVRRIRQKSN-LSSRSLALPVSESPLSVRANGGEKTTH-------- 437

Query: 433  FSSTGGKALYSSETKRNLSKMSTGSENAMTPSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKE 492
                                 S  S   +  SSF  +P +SSEMASKIL+QLD       
Sbjct: 438  --------------------TSKDSAEDIPGSSFNLVPTKSSEMASKILQQLD------- 497

Query: 493  KSSELKLLSVRNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLDNVEGVRSNNARDLTSQKKD 552
                 KL+S R  SP+KLSPSML GPAL+SL++V++ K+L N+   ++N+  D + QK++
Sbjct: 498  -----KLVSTREKSPSKLSPSMLRGPALKSLQNVEAPKFLGNLPEKKANSP-DSSYQKQE 557

Query: 553  KIEENSPLKFKVPNDKSISTGDCVGSSVPTKD-TVSGSGLQV---SCVGPSLPTKCAFQM 612
               E+   +    ++K+    D    +  +KD  + G G+ +   + +    P K +F+M
Sbjct: 558  ISRESVSREVLAQSEKTGDAVDGTSKTGSSKDQDMRGKGVYMPLTNSLEEHPPKKRSFRM 617

Query: 613  SAHEDFVDIDEE-GYSNGP--VADK--SFEKREKADSLVALSKLDNTEAITVDKPQASIE 672
            SAHEDF+++D++ G ++ P  VA+K  +FE  EK+   + +           +KP    E
Sbjct: 618  SAHEDFLELDDDLGAASTPCEVAEKQNAFEV-EKSHISMPIG----------EKPLTPSE 677

Query: 673  AKSSAVSATNKINDSGKSDVPVATEKSPIFSFPTASSPSITANVIGPESTLRPEKIASSE 732
            A  S    +N     G S+  + TE++   +FP     ++  + +  E T   + I  +E
Sbjct: 678  AMPSTSYISNGDASQGTSNGSLETERNKFVAFPI---EAVQQSNMASEPT--SKFIQGTE 737

Query: 733  VPKAATTPIFGFGEKFPSQ--KEAVSSAPTFAFGNRVTTSTNEQNATPVVTSEGNVEPTQ 792
                ++       ++ P +  K+  +  P  +F    T   N+        S  + +   
Sbjct: 738  KSSISSGKPTSEEKRIPLEEPKKPAAVFPNISFSPPATGLLNQ-------NSGASADIKL 797

Query: 793  QASAATTFKFGDKATFPMPANAATENGNKNAGSPFKFASPLVNEKEGAKVGGSSSVFKSE 852
            + +++T F   +    P  +     N    A S    A+P +N    +    + +   S 
Sbjct: 798  EKTSSTAFGVSEAWAKPTESKKTFSNSASGAESSTS-AAPTLNGSIFSAGANAVTPPPSN 857

Query: 853  SSSSSIPSF--GVPKESMSEKAGDKSSSAAGLAVGTSGNLFLSSVSTSTSTPTPSLFSFS 912
             S +S PSF   +         GD  S+    A   + +     + TS  + + S  S S
Sbjct: 858  GSLTSSPSFPPSISNIPSDNSVGDMPSTVQSFAATHNSSSIFGKLPTSNDSNSQST-SAS 917

Query: 913  SPSTNSNLNNGSPVSTTPSTFPTPATTVSNNITNQNSSIK-------LSFNTAGTSNSEP 972
              S+ S    G P     + F  PA + S+   ++ + +K        +F   G ++++ 
Sbjct: 918  PLSSTSPFKFGQPA----APFSAPAVSESSGQISKETEVKNATFGNTSTFKFGGMASAD- 977

Query: 973  VTTTSLPTSSPVPSFSAAPIFKFGSSSV-------PSTSAPALSAPSGVGSV-------- 1032
              +T +   +      + P F FGSSSV       PST+  A SAP   GS+        
Sbjct: 978  -QSTGIVFGAKSAENKSRPGFVFGSSSVVGGSTLNPSTA--AASAPESSGSLIFGVTSSS 1037

Query: 1033 --ETKTKQESA-----------FGNLSGIPPNDASAV---KASSTGSSVFQFGAASTTSD 1092
               T+T + SA           FG  S    +  S++    ++STGSSVF F A S+ S 
Sbjct: 1038 TPGTETSKISASSAATNTGNSVFGTSSFAFTSSGSSMVGGVSASTGSSVFGFNAVSSASA 1097

Query: 1093 SIKRPENSTFAPSNVPAFGALVSPASSGLASSTQSTPVLQFNS--SSTSFGLTGNTGLAS 1152
            +  + + S        A  A      SG  +STQS P  QF S  S+ SFGL+GN+ LAS
Sbjct: 1098 TSSQSQASNL----FGAGNAQTGNTGSGTTTSTQSIP-FQFGSSPSAPSFGLSGNSSLAS 1157

Query: 1153 GSSLFGSSAPASNLFTSGTGFGLASSSSSANNSVSSSA---GTSSSFFNWQPSSTPSFST 1212
             SS FG S     +FTS +   L+S++SSA++S + S+   GTS    N  P+S P FS+
Sbjct: 1158 NSSPFGFSKSEPAVFTSVSTPQLSSTNSSASSSSTMSSPLFGTSWQAPNSSPNSGPVFSS 1217

Query: 1213 GF--SSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPMIFGSSSTDASTPS-MFSFTSAAAATTSQPAFG 1272
             F  SSTPT  FSFG SS++  S++   IFG+S+ +  +PS +F F S    T  QP FG
Sbjct: 1218 SFTTSSTPT-TFSFGGSSAATVSSTTTPIFGASTNNTPSPSPIFGFGSTPPTTPQQPVFG 1277

Query: 1273 NSN--HAFTFGSTPPA-------------NNEQASMEDSMAEDTVQTVASPM--PSFGQQ 1311
            NS       FG++ P              NN+Q SMEDSMAEDT Q   + M  P FGQ 
Sbjct: 1278 NSGTPSQSLFGNSTPGFAFGAPNNGNGINNNQQVSMEDSMAEDTDQANRASMVAPMFGQA 1309

[Close]
BLAST of CmUC08G150320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C4Z3 (nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496528 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1955.3 bits (5064), Expect = 0.0e+00
Identity = 1114/1313 (84.84%), Postives = 1180/1313 (89.87%), Query Frame = 0 

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATEREEV+YEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVSADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFS+VFRKRLPPPPPS  LSREAN+E+E+RNQEEV+ADP GTQEGTNV FVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVMSYGKQ 180
            +NT G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPV S+G Q
Sbjct: 121  SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180

Query: 181  EGSPQFPAQSQDGVSPHMVPTHAVSANVGISVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPNATPLSM 240
            EGSP+FP QSQDGVSPHM PTH V+AN    VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPP ATPLSM
Sbjct: 181  EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNAN----VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSM 240

Query: 241  ASHGQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFNVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300
            A            GNPSKSSTLSLVPRSPGNF+VVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR
Sbjct: 241  A------------GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300

Query: 301  VRATPSITNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIR 360
            VRATPSI NS+ATTDAYRATTSSSSQSAW QG LLGS+QGALKRR+SVLDD+MGSVGPIR
Sbjct: 301  VRATPSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIR 360

Query: 361  RIRQKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSETKRN 420
            R RQKSNHLFP GLSLPSSSTSIP SGI SETA+HLQSTKVHPFSS GGK LYSSET+RN
Sbjct: 361  RTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRN 420

Query: 421  LSKMSTGSENAMTP-SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPT 480
             SK S  S+NAMTP SSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSP 
Sbjct: 421  FSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPM 480

Query: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLDNVEGVRSNNARDLTSQKKDKIEENSPLKFKVPNDK 540
            KLSPSMLHGPALRSLE+VDSAKYL+NVEG++SN+A D TSQK DK EE+SP K  VPNDK
Sbjct: 481  KLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDK 540

Query: 541  SISTGDCVGSSVPTKDTVSGSGLQVSCVGPSLPTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGYSNGPVA 600
            SIST D VGSSVPTKD  SGSG+QVS VGPS+ TKCAFQMSAHEDFVD+DEEG+SNGPVA
Sbjct: 541  SISTSDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVA 600

Query: 601  DKSFEKREKA-DSLVALSKLDNTEAITVDKPQASIEAKSSAVSATNKINDSGKSDVPVAT 660
            DKSFE REK  DSLV++SK  NTEAITV K + SIEAK S VS  NKIND GKSDVP  T
Sbjct: 601  DKSFEMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTT 660

Query: 661  EKSPIFSFPTASSPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVS 720
            EKSPIFSFPT SSPS TANV GPES+LRPEK+AS E+PKAAT PIFGFGEK PSQKE +S
Sbjct: 661  EKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKETLS 720

Query: 721  SAPTFAFGNRVTTSTNEQNATPVVTSEGNVEPTQQASAATTFKFGDKATFPMPANAATEN 780
              PTFAFG++ TT TNEQNA PVVTSE N EPT+ AS  TTFKFGDKA+F +PANAATEN
Sbjct: 721  QPPTFAFGSKATT-TNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATEN 780

Query: 781  GNKNAGSPFKFASPLVNEKEGAKVGGSSSVFKSESSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS 840
            GNK+AGS FKF SPLVNEKEGA VGGS+SVFK+E+SSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS
Sbjct: 781  GNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS 840

Query: 841  AAGLAVGTSGNLFLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSPVSTTPSTFPTPATTV 900
              GL  GTSGNLF SS STSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGS VS TPST PTPATT 
Sbjct: 841  -PGLIFGTSGNLFSSSDSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTF 900

Query: 901  SNNITNQNSSIKLSFNTAGTSNSEPVTTTSLPTSSPVPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPA 960
            SNN+T+QNSSIK S + A TSNSEPVT+TS P SSP+PSFSAAPIFKFGSSSVPSTSA A
Sbjct: 901  SNNVTSQNSSIKPS-SIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASA 960

Query: 961  LSAPSGVGSVETKTKQESAFGNLSGIPPNDASAVKASSTGSSVFQFGAASTTSDSIKRPE 1020
            LSAPSGVGSVE KTK E+ FGNLSG+PP+D +AVK +STGSSVFQFGAASTTSD+ K P 
Sbjct: 961  LSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPA 1020

Query: 1021 NSTFAPSNVPAFGALVSPASSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSS 1080
            NSTFA +N+PAFGA VS +SSGLASSTQSTP LQF SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSS
Sbjct: 1021 NSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSS 1080

Query: 1081 APASNLFTSGTGFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFS 1140
            APASN FTSG  FGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+GGFS
Sbjct: 1081 APASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFS 1140

Query: 1141 FGLSSSSAASNSAPMIFGSSSTDASTPSMFSFTSAAAATTSQPAFGNSNHAFTFGSTPPA 1200
            FGLSSSS+ASNSAPM+FGSSST AS  SMFSFTSAA+ATTSQPAFGNSN+AFTFGSTPPA
Sbjct: 1141 FGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPA 1200

Query: 1201 -NNEQASMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGS 1260
             NNEQASMEDSMAEDTVQT ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGS
Sbjct: 1201 NNNEQASMEDSMAEDTVQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGS 1260

Query: 1261 QQNVPTPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1311
            QQNV  PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 QQNV--PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1290

[Close]
BLAST of CmUC08G150320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SNY9 (Nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold304G001170 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1955.3 bits (5064), Expect = 0.0e+00
Identity = 1114/1313 (84.84%), Postives = 1180/1313 (89.87%), Query Frame = 0 

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATEREEV+YEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVSADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFS+VFRKRLPPPPPS  LSREAN+E+E+RNQEEV+ADP GTQEGTNV FVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVMSYGKQ 180
            +NT G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPV S+G Q
Sbjct: 121  SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180

Query: 181  EGSPQFPAQSQDGVSPHMVPTHAVSANVGISVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPNATPLSM 240
            EGSP+FP QSQDGVSPHM PTH V+AN    VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPP ATPLSM
Sbjct: 181  EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNAN----VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSM 240

Query: 241  ASHGQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFNVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300
            A            GNPSKSSTLSLVPRSPGNF+VVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR
Sbjct: 241  A------------GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300

Query: 301  VRATPSITNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIR 360
            VRATPSI NS+ATTDAYRATTSSSSQSAW QG LLGS+QGALKRR+SVLDD+MGSVGPIR
Sbjct: 301  VRATPSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIR 360

Query: 361  RIRQKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSETKRN 420
            R RQKSNHLFP GLSLPSSSTSIP SGI SETA+HLQSTKVHPFSS GGK LYSSET+RN
Sbjct: 361  RTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRN 420

Query: 421  LSKMSTGSENAMTP-SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPT 480
             SK S  S+NAMTP SSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSP 
Sbjct: 421  FSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPM 480

Query: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLDNVEGVRSNNARDLTSQKKDKIEENSPLKFKVPNDK 540
            KLSPSMLHGPALRSLE+VDSAKYL+NVEG++SN+A D TSQK DK EE+SP K  VPNDK
Sbjct: 481  KLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDK 540

Query: 541  SISTGDCVGSSVPTKDTVSGSGLQVSCVGPSLPTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGYSNGPVA 600
            SIST D VGSSVPTKD  SGSG+QVS VGPS+ TKCAFQMSAHEDFVD+DEEG+SNGPVA
Sbjct: 541  SISTSDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVA 600

Query: 601  DKSFEKREKA-DSLVALSKLDNTEAITVDKPQASIEAKSSAVSATNKINDSGKSDVPVAT 660
            DKSFE REK  DSLV++SK  NTEAITV K + SIEAK S VS  NKIND GKSDVP  T
Sbjct: 601  DKSFEMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTT 660

Query: 661  EKSPIFSFPTASSPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVS 720
            EKSPIFSFPT SSPS TANV GPES+LRPEK+AS E+PKAAT PIFGFGEK PSQKE +S
Sbjct: 661  EKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKETLS 720

Query: 721  SAPTFAFGNRVTTSTNEQNATPVVTSEGNVEPTQQASAATTFKFGDKATFPMPANAATEN 780
              PTFAFG++ TT TNEQNA PVVTSE N EPT+ AS  TTFKFGDKA+F +PANAATEN
Sbjct: 721  QPPTFAFGSKATT-TNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATEN 780

Query: 781  GNKNAGSPFKFASPLVNEKEGAKVGGSSSVFKSESSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS 840
            GNK+AGS FKF SPLVNEKEGA VGGS+SVFK+E+SSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS
Sbjct: 781  GNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS 840

Query: 841  AAGLAVGTSGNLFLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSPVSTTPSTFPTPATTV 900
              GL  GTSGNLF SS STSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGS VS TPST PTPATT 
Sbjct: 841  -PGLIFGTSGNLFSSSDSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTF 900

Query: 901  SNNITNQNSSIKLSFNTAGTSNSEPVTTTSLPTSSPVPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPA 960
            SNN+T+QNSSIK S + A TSNSEPVT+TS P SSP+PSFSAAPIFKFGSSSVPSTSA A
Sbjct: 901  SNNVTSQNSSIKPS-SIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASA 960

Query: 961  LSAPSGVGSVETKTKQESAFGNLSGIPPNDASAVKASSTGSSVFQFGAASTTSDSIKRPE 1020
            LSAPSGVGSVE KTK E+ FGNLSG+PP+D +AVK +STGSSVFQFGAASTTSD+ K P 
Sbjct: 961  LSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPA 1020

Query: 1021 NSTFAPSNVPAFGALVSPASSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSS 1080
            NSTFA +N+PAFGA VS +SSGLASSTQSTP LQF SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSS
Sbjct: 1021 NSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSS 1080

Query: 1081 APASNLFTSGTGFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFS 1140
            APASN FTSG  FGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+GGFS
Sbjct: 1081 APASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFS 1140

Query: 1141 FGLSSSSAASNSAPMIFGSSSTDASTPSMFSFTSAAAATTSQPAFGNSNHAFTFGSTPPA 1200
            FGLSSSS+ASNSAPM+FGSSST AS  SMFSFTSAA+ATTSQPAFGNSN+AFTFGSTPPA
Sbjct: 1141 FGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPA 1200

Query: 1201 -NNEQASMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGS 1260
             NNEQASMEDSMAEDTVQT ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGS
Sbjct: 1201 NNNEQASMEDSMAEDTVQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGS 1260

Query: 1261 QQNVPTPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1311
            QQNV  PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 QQNV--PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1290

[Close]
BLAST of CmUC08G150320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K9E4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G046360 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1939.1 bits (5022), Expect = 0.0e+00
Identity = 1100/1313 (83.78%), Postives = 1174/1313 (89.41%), Query Frame = 0 

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATERE+V+YEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLS LVDPA KLI S
Sbjct: 1    MATEREDVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSNLVDPAHKLINS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVSADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            +AH LFS+VFRKRLPPPPPS PLSREANDE+E+RNQEEV+ADP GTQEGTN+ FVPSINS
Sbjct: 61   TAHWLFSTVFRKRLPPPPPSFPLSREANDEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNIGFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVMSYGKQ 180
            NNT G+SDLEKIL EKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVP GVESRKFEQVPSTPV S+G Q
Sbjct: 121  NNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPRGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQ 180

Query: 181  EGSPQFPAQSQDGVSPHMVPTHAVSANVGISVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPNATPLSM 240
            EGSP+ P QSQDGVSPHM  TH V+AN    VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPP ATPLSM
Sbjct: 181  EGSPKLPTQSQDGVSPHMATTHVVTAN----VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSM 240

Query: 241  ASHGQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFNVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300
            A            GNP KSSTLSLVPRSPGNF+VVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR
Sbjct: 241  A------------GNPLKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300

Query: 301  VRATPSITNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIR 360
            VRATPSI NS+AT DAYR+TT SSSQSAW QGRLLGS+QGALKRR+SVLDD+MGSVGPIR
Sbjct: 301  VRATPSIKNSIATADAYRSTTPSSSQSAWEQGRLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIR 360

Query: 361  RIRQKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSETKRN 420
            R RQKSNHLF   L LPSSSTSI  SGIGSETA+HLQSTKVHPFSS GGK LYS+E +RN
Sbjct: 361  RTRQKSNHLFSTSLGLPSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNEIQRN 420

Query: 421  LSKMSTGSENAMTP-SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPT 480
             SKM+  S+NAMTP SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSP 
Sbjct: 421  FSKMTAESKNAMTPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPM 480

Query: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLDNVEGVRSNNARDLTSQKKDKIEENSPLKFKVPNDK 540
            KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL+NVEG+RSN+ARDLTSQK DK EE+SP KF VPNDK
Sbjct: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDK 540

Query: 541  SISTGDCVGSSVPTKDTVSGSGLQVSCVGPSLPTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGYSNGPVA 600
            SISTGD VGSSV TKD  SGSG+QVS VGPS+ TKCAFQMSAHEDFVD+DEEG+SNGPVA
Sbjct: 541  SISTGDGVGSSVSTKDAGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVA 600

Query: 601  DKSFEKREKA-DSLVALSKLDNTEAITVDKPQASIEAKSSAVSATNKINDSGKSDVPVAT 660
            DKSFE + K  DSLV++SK  NTE ITVDK +ASIEAK   VS  NKIND GKSDVP  T
Sbjct: 601  DKSFEMQGKVDDSLVSVSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTT 660

Query: 661  EKSPIFSFPTASSPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVS 720
            EKSPIFSFPTASSPSITANV G ES+LRPEK+AS E+PKAAT PIFGFGEK PSQKEA S
Sbjct: 661  EKSPIFSFPTASSPSITANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKEAGS 720

Query: 721  SAPTFAFGNRVTTSTNEQNATPVVTSEGNVEPTQQASAATTFKFGDKATFPMPANAATEN 780
              PTFAFG++ TT TNEQN   VVTSE NVEPTQQAS  TTFKFGDKA+FP+PANAATEN
Sbjct: 721  HPPTFAFGSKATT-TNEQNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATEN 780

Query: 781  GNKNAGSPFKFASPLVNEKEGAKVGGSSSVFKSESSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS 840
            GNK+AGS FKFASPLVNEKEGA VGGS+SVFK+E+SSSSIPSFGVPKES+SEKAGDKSSS
Sbjct: 781  GNKSAGSLFKFASPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESISEKAGDKSSS 840

Query: 841  AAGLAVGTSGNLFLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSPVSTTPSTFPTPATTV 900
              GL  GTSGN F SSVSTSTSTPTPSLFSFS+PSTNSNLNNGS VSTTPST PTPATT 
Sbjct: 841  -PGLIFGTSGNFFSSSVSTSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTF 900

Query: 901  SNNITNQNSSIKLSFNTAGTSNSEPVTTTSLPTSSPVPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPA 960
            SNN+T+QNSS+K SF +A TSNSEPV++TS PTSSP+PSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPA
Sbjct: 901  SNNVTSQNSSVKPSF-SAATSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPA 960

Query: 961  LSAPSGVGSVETKTKQESAFGNLSGIPPNDASAVKASSTGSSVFQFGAASTTSDSIKRPE 1020
            LSAPS VGSVETKTK E+ FGNLSG P +D SAVK +STG+SVFQFGAASTTSD+ K P 
Sbjct: 961  LSAPSVVGSVETKTKPETTFGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGPA 1020

Query: 1021 NSTFAPSNVPAFGALVSPASSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSS 1080
            NSTFA +N+PAFGA VS +SSGLA STQSTP LQF+SSSTSFGLT NTGLASGSSLFGSS
Sbjct: 1021 NSTFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSS 1080

Query: 1081 APASNLFTSGTGFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFS 1140
            APASN FTSG  FGLASSSSSA+NSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+GGFS
Sbjct: 1081 APASNPFTSGATFGLASSSSSASNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFS 1140

Query: 1141 FGLSSSSAASNSAPMIFGSSSTDASTPSMFSFTSAAAATTSQPAFGNSNHAFTFGSTPPA 1200
            FGLSSSS+ASNSAPM+FGSSST A + SMFSFTSAA+ATTSQPAFGNSN+AFTFGSTPPA
Sbjct: 1141 FGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPA 1200

Query: 1201 -NNEQASMEDSMAEDTVQTVASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGS 1260
             NNEQASMEDSMAEDT+QT ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQF GS
Sbjct: 1201 NNNEQASMEDSMAEDTIQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGS 1260

Query: 1261 QQNVPTPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1311
            QQN+  PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 QQNL--PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1291

[Close]
BLAST of CmUC08G150320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FKS9 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444902 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1902.1 bits (4926), Expect = 0.0e+00
Identity = 1093/1316 (83.05%), Postives = 1163/1316 (88.37%), Query Frame = 0 

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATERE V YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS GKGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREGVHYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPIALRNSNGKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVSADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLP+SREANDE+E +NQEEV+ADPPGTQEGTN DFVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISREANDEMEIKNQEEVAADPPGTQEGTNNDFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVMSYGKQ 180
            NN HGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE V STPV+SY  Q
Sbjct: 121  NNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQ 180

Query: 181  EGSPQFPAQSQDGVSPHMVPTHAVSANVGISVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPNATPLSM 240
            EGSP+FPA  Q+GV PHMVPTH ++ANV     DEDVASPAEIAKA+MGSRPP ATPLSM
Sbjct: 181  EGSPKFPA--QEGVRPHMVPTHVLNANVP----DEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSM 240

Query: 241  ASHGQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFNVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300
             +H QKFGD+FA GNPSKSSTLSLVPRSPGNF+ VEN FVTPRSRGRSALYSMAR+PYSR
Sbjct: 241  VAHSQKFGDTFALGNPSKSSTLSLVPRSPGNFD-VENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSR 300

Query: 301  VRATPSITNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIR 360
            VRATPSI NSVATTD+YRAT +SSSQSAW QGRLL S QGALKRRSSVLDDE+GSVGPIR
Sbjct: 301  VRATPSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRSSVLDDEIGSVGPIR 360

Query: 361  RIRQKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSETKRN 420
            RIR KSN LFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSET+QHLQSTKVHPFSS  GKA YSSETKRN
Sbjct: 361  RIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSPAGKAPYSSETKRN 420

Query: 421  LSKMSTGSENAMTP-SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPT 480
            LSKMS  SEN  TP SSFPQIPLRSSEMA KILEQLDKLTPPKEKSSELKL SVRNNSP 
Sbjct: 421  LSKMSAESENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPM 480

Query: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLDNVEGVRSNNARDLTSQKKDKIEENSPLKFKVPNDK 540
            KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL+NVE +RSN+ RDLTS+KKDK E++S LK KVP+DK
Sbjct: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDLTSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDK 540

Query: 541  SISTGDCVGSSVPTKDTVSGSGLQVSCVGPSLPTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGYSNGPVA 600
            SISTG  VGSSVP+KDTVS SGLQVS VGPS  TKCAFQMS  EDFVD+D+E YSNGPV+
Sbjct: 541  SISTGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVS 600

Query: 601  DKSFEKREKA-DSLVALSKLDNTEAITVDKPQASIEAKSSAVSATNKINDSGKSDVPVAT 660
             KSFE+REK  DSLVA+ K  +TEAITVDKPQASI+AK S VS   KIND  KSDVPV T
Sbjct: 601  AKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTT 660

Query: 661  EKSPIFSFPTASSPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVS 720
            EKS IFSFPTAS  S TANVI PEST RPEKIASSEVPKAA  PIFGFGEK PSQK+ V 
Sbjct: 661  EKSSIFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQKDPVF 720

Query: 721  SAPTFAFGNRVTTSTNEQNATPVVTSEGNVEPTQQASAATTFKFGDKATFPMPANAATEN 780
            S+PTF FGN+VTTSTNEQNA P VTSEGNV PT QASA TTFKFGDKATFP+PA+ ATEN
Sbjct: 721  SSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATEN 780

Query: 781  GNKNAGSPFKFASPLVNEKEGAKVGGSSSVFKSESSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS 840
            GN  AGSPFKFAS LVNEKEGAK  GS+SVFKSESSSSS  SFGVPKESMSEKAGDK SS
Sbjct: 781  GNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAK-AGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESMSEKAGDKKSS 840

Query: 841  AAGLAVGTSGNLFLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSPVSTTPSTFPTPATTV 900
            +AGL+VGTSGNL LSSVS   STPTPSLFSFSSP+TNSNL NGS + +TPSTFP+P+ T 
Sbjct: 841  SAGLSVGTSGNLLLSSVS---STPTPSLFSFSSPTTNSNLINGS-LGSTPSTFPSPSNTF 900

Query: 901  SNNITNQNSSIKLSFNTAGTSNSEPVTTTSLPTSSPVPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPA 960
             +NITNQNSSIK S N A TSNSEPVTTTSL TSSP+PSFSAAPIFKFGSSSVPS+    
Sbjct: 901  PSNITNQNSSIKPSLN-AATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSS---- 960

Query: 961  LSAPSGVGSVETKTKQESA-FGNLSGIPPNDASAVKASSTGSSVFQFGAASTTSDSIKRP 1020
             SAPSGVGSVETKTKQE+  FGN+SGI P+D SA K  STGSSVFQFGAASTTSDS K+P
Sbjct: 961  -SAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNKQP 1020

Query: 1021 ENSTFAPSNVPAFGALVSPASSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGS 1080
            E STFAP +VP+FGA V PASSG+ASSTQSTPV  F+SSSTSFGLTGNTGLASG+SL GS
Sbjct: 1021 EKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNSLVGS 1080

Query: 1081 SAPASNLFTSGTGFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGF 1140
            SAPASNLFTSG  FG   SSSSANNSVSS AGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STPTGGF
Sbjct: 1081 SAPASNLFTSGATFGF-GSSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGF 1140

Query: 1141 SFGLSSSSAASNSAPMIFGSSSTD-ASTPSMFSFTSAAAATTSQPAFGNSNHAFTFGSTP 1200
            SFGL+SSSAAS+S+PM+FGSS+T  AST SMFSFTSAA A  SQPAFG SNH FTFGSTP
Sbjct: 1141 SFGLASSSAASSSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAAPSQPAFGTSNHGFTFGSTP 1200

Query: 1201 PANNEQASMEDSMAEDTVQTVAS--PMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQF 1260
            PANN+ A+MEDSMAEDTVQTVAS  PMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQF
Sbjct: 1201 PANNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQF 1260

Query: 1261 GGSQQNVPTPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1311
            GGSQQNVPTPQNP+PFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 GGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1297

[Close]
BLAST of CmUC08G150320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FF52 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444902 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1897.1 bits (4913), Expect = 0.0e+00
Identity = 1093/1320 (82.80%), Postives = 1163/1320 (88.11%), Query Frame = 0 

Query: 1    MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
            MATERE V YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS GKGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1    MATEREGVHYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPIALRNSNGKGWLSKLVDPAQKLITS 60

Query: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVSADPPGTQEGTNVDFVPSINS 120
            SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLP+SREANDE+E +NQEEV+ADPPGTQEGTN DFVPSINS
Sbjct: 61   SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISREANDEMEIKNQEEVAADPPGTQEGTNNDFVPSINS 120

Query: 121  NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVMSYGKQ 180
            NN HGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE V STPV+SY  Q
Sbjct: 121  NNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQ 180

Query: 181  EGSPQFPAQSQDGVSPHMVPTHAVSANVGISVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPNATPLSM 240
            EGSP+FPA  Q+GV PHMVPTH ++ANV     DEDVASPAEIAKA+MGSRPP ATPLSM
Sbjct: 181  EGSPKFPA--QEGVRPHMVPTHVLNANVP----DEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSM 240

Query: 241  ASHGQKFGDSFASGNPSKSSTLSLVPRSPGNFNVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSR 300
             +H QKFGD+FA GNPSKSSTLSLVPRSPGNF+ VEN FVTPRSRGRSALYSMAR+PYSR
Sbjct: 241  VAHSQKFGDTFALGNPSKSSTLSLVPRSPGNFD-VENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSR 300

Query: 301  VRATPSITNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIR 360
            VRATPSI NSVATTD+YRAT +SSSQSAW QGRLL S QGALKRRSSVLDDE+GSVGPIR
Sbjct: 301  VRATPSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRSSVLDDEIGSVGPIR 360

Query: 361  RIRQKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETAQHLQSTKVHPFSSTGGKALYSSETKRN 420
            RIR KSN LFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSET+QHLQSTKVHPFSS  GKA YSSETKRN
Sbjct: 361  RIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSPAGKAPYSSETKRN 420

Query: 421  LSKMSTGSENAMTP-SSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPT 480
            LSKMS  SEN  TP SSFPQIPLRSSEMA KILEQLDKLTPPKEKSSELKL SVRNNSP 
Sbjct: 421  LSKMSAESENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPM 480

Query: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLDNVEGVRSNNARDLTSQKKDKIEENSPLKFKVPNDK 540
            KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYL+NVE +RSN+ RDLTS+KKDK E++S LK KVP+DK
Sbjct: 481  KLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDLTSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDK 540

Query: 541  SISTGDCVGSSVPTKDTVSGSGLQVSCVGPSLPTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGYSNGPVA 600
            SISTG  VGSSVP+KDTVS SGLQVS VGPS  TKCAFQMS  EDFVD+D+E YSNGPV+
Sbjct: 541  SISTGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVS 600

Query: 601  DKSFEKREKA-DSLVALSKLDNTEAITVDKPQASIEAKSSAVSATNKINDSGKSDVPVAT 660
             KSFE+REK  DSLVA+ K  +TEAITVDKPQASI+AK S VS   KIND  KSDVPV T
Sbjct: 601  AKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTT 660

Query: 661  EKSPIFSFPTASSPSITANVIGPESTLRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVS 720
            EKS IFSFPTAS  S TANVI PEST RPEKIASSEVPKAA  PIFGFGEK PSQK+ V 
Sbjct: 661  EKSSIFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQKDPVF 720

Query: 721  SAPTFAFGNRVTTSTNEQNATPVVTSEGNVEPTQQASAATTFKFGDKATFPMPANAATEN 780
            S+PTF FGN+VTTSTNEQNA P VTSEGNV PT QASA TTFKFGDKATFP+PA+ ATEN
Sbjct: 721  SSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATEN 780

Query: 781  GNKNAGSPFKFASPLVNEKEGAKVGGSSSVFKSESSSSSIP----SFGVPKESMSEKAGD 840
            GN  AGSPFKFAS LVNEKEGAK  GS+SVFKSESSSSS      SFGVPKESMSEKAGD
Sbjct: 781  GNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAK-AGSASVFKSESSSSSFNCSTLSFGVPKESMSEKAGD 840

Query: 841  KSSSAAGLAVGTSGNLFLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSPVSTTPSTFPTP 900
            K SS+AGL+VGTSGNL LSSVS   STPTPSLFSFSSP+TNSNL NGS + +TPSTFP+P
Sbjct: 841  KKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVS---STPTPSLFSFSSPTTNSNLINGS-LGSTPSTFPSP 900

Query: 901  ATTVSNNITNQNSSIKLSFNTAGTSNSEPVTTTSLPTSSPVPSFSAAPIFKFGSSSVPST 960
            + T  +NITNQNSSIK S N A TSNSEPVTTTSL TSSP+PSFSAAPIFKFGSSSVPS+
Sbjct: 901  SNTFPSNITNQNSSIKPSLN-AATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSS 960

Query: 961  SAPALSAPSGVGSVETKTKQESA-FGNLSGIPPNDASAVKASSTGSSVFQFGAASTTSDS 1020
                 SAPSGVGSVETKTKQE+  FGN+SGI P+D SA K  STGSSVFQFGAASTTSDS
Sbjct: 961  -----SAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTSDS 1020

Query: 1021 IKRPENSTFAPSNVPAFGALVSPASSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSS 1080
             K+PE STFAP +VP+FGA V PASSG+ASSTQSTPV  F+SSSTSFGLTGNTGLASG+S
Sbjct: 1021 NKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNS 1080

Query: 1081 LFGSSAPASNLFTSGTGFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP 1140
            L GSSAPASNLFTSG  FG   SSSSANNSVSS AGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STP
Sbjct: 1081 LVGSSAPASNLFTSGATFGF-GSSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQASSAPSFSSGFGSTP 1140

Query: 1141 TGGFSFGLSSSSAASNSAPMIFGSSSTD-ASTPSMFSFTSAAAATTSQPAFGNSNHAFTF 1200
            TGGFSFGL+SSSAAS+S+PM+FGSS+T  AST SMFSFTSAA A  SQPAFG SNH FTF
Sbjct: 1141 TGGFSFGLASSSAASSSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAAPSQPAFGTSNHGFTF 1200

Query: 1201 GSTPPANNEQASMEDSMAEDTVQTVAS--PMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGAN 1260
            GSTPPANN+ A+MEDSMAEDTVQTVAS  PMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGAN
Sbjct: 1201 GSTPPANNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGAN 1260

Query: 1261 PFQFGGSQQNVPTPQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1311
            PFQFGGSQQNVPTPQNP+PFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 PFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1301

[Close]
BLAST of CmUC08G150320 vs. TAIR 10
Match: AT3G10650.1 (BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.1); Has 61042 Blast hits to 31782 proteins in 2093 species: Archae - 202; Bacteria - 16480; Metazoa - 16017; Fungi - 12552; Plants - 1653; Viruses - 629; Other Eukaryotes - 13509 (source: NCBI BLink). )

HSP 1 Score: 402.5 bits (1033), Expect = 1.3e-111
Identity = 487/1405 (34.66%), Postives = 688/1405 (48.97%), Query Frame = 0 

Query: 13   GRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRL 72
            G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+        G GWLSKLVDPAQ+LIT SA RL
Sbjct: 18   GTGGKFRKPTARRSQKTPYDRPTTSVRNAGLGGGDVRGGGWLSKLVDPAQRLITYSAQRL 77

Query: 73   FSSVFRKRL---------PPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVS----ADPPGTQEGTNV 132
            F S+ RKRL         P     LP  R  N E +  ++E+VS     +     E TN 
Sbjct: 78   FGSLSRKRLGSGETPLQSPEQQKQLP-ERGVNQETKVGHKEDVSNLSMKNGLIRMEDTNA 137

Query: 133  DFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPST 192
               P        G +DLEKIL+ KTFTR E+DRLT LL+S+ AD  +  E ++ E     
Sbjct: 138  SVDPP-----KDGFTDLEKILQGKTFTRSEVDRLTTLLRSKAADSSTMNEEQRNE----- 197

Query: 193  PVMSYGKQEGSPQFPAQSQDGVSPH--MVPTHAVSANVGISVLDEDVASPAEIAKAYMGS 252
                 G     P  P+  +D   P    + T   +    +  LDE +ASPA++AKAYMGS
Sbjct: 198  ----VGMVVRHP--PSHERDRTHPDNGSMNTLVSTPPGSLRTLDECIASPAQLAKAYMGS 257

Query: 253  RPPNATPLSMASHGQKFGDSFASGN----PSKSSTLSLVPRSPGNFNVVENGFVTPRSRG 312
            RP   TP  +   GQ   +     N    P KS T+SLV + P     +ENGFVTPRSRG
Sbjct: 258  RPSEVTPSMLGLRGQAGREDSVFLNRTPFPQKSPTMSLVTK-PSGQRPLENGFVTPRSRG 317

Query: 313  RSALYSMARVPYSRVRATPSITNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLLGSEQG---ALK 372
            RSA+YSMAR PYSR +++  I            +   +S S W +    GS QG    LK
Sbjct: 318  RSAVYSMARTPYSRPQSSVKI-----------GSLFQASPSKWEESLPSGSRQGFQSGLK 377

Query: 373  RRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETAQHLQSTKVHP 432
            RRSSVLD+++GSVGP+RRIRQKSN L  + L+LP S + + V   G E   H        
Sbjct: 378  RRSSVLDNDIGSVGPVRRIRQKSN-LSSRSLALPVSESPLSVRANGGEKTTH-------- 437

Query: 433  FSSTGGKALYSSETKRNLSKMSTGSENAMTPSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKE 492
                                 S  S   +  SSF  +P +SSEMASKIL+QLD       
Sbjct: 438  --------------------TSKDSAEDIPGSSFNLVPTKSSEMASKILQQLD------- 497

Query: 493  KSSELKLLSVRNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLDNVEGVRSNNARDLTSQKKD 552
                 KL+S R  SP+KLSPSML GPAL+SL++V++ K+L N+   ++N+  D + QK++
Sbjct: 498  -----KLVSTREKSPSKLSPSMLRGPALKSLQNVEAPKFLGNLPEKKANSP-DSSYQKQE 557

Query: 553  KIEENSPLKFKVPNDKSISTGDCVGSSVPTKD-TVSGSGLQV---SCVGPSLPTKCAFQM 612
               E+   +    ++K+    D    +  +KD  + G G+ +   + +    P K +F+M
Sbjct: 558  ISRESVSREVLAQSEKTGDAVDGTSKTGSSKDQDMRGKGVYMPLTNSLEEHPPKKRSFRM 617

Query: 613  SAHEDFVDIDEE-GYSNGP--VADK--SFEKREKADSLVALSKLDNTEAITVDKPQASIE 672
            SAHEDF+++D++ G ++ P  VA+K  +FE  EK+   + +           +KP    E
Sbjct: 618  SAHEDFLELDDDLGAASTPCEVAEKQNAFEV-EKSHISMPIG----------EKPLTPSE 677

Query: 673  AKSSAVSATNKINDSGKSDVPVATEKSPIFSFPTASSPSITANVIGPESTLRPEKIASSE 732
            A  S    +N     G S+  + TE++   +FP     ++  + +  E T   + I  +E
Sbjct: 678  AMPSTSYISNGDASQGTSNGSLETERNKFVAFPI---EAVQQSNMASEPT--SKFIQGTE 737

Query: 733  VPKAATTPIFGFGEKFPSQ--KEAVSSAPTFAFGNRVTTSTNEQNATPVVTSEGNVEPTQ 792
                ++       ++ P +  K+  +  P  +F    T   N+        S  + +   
Sbjct: 738  KSSISSGKPTSEEKRIPLEEPKKPAAVFPNISFSPPATGLLNQ-------NSGASADIKL 797

Query: 793  QASAATTFKFGDKATFPMPANAATENGNKNAGSPFKFASPLVNEKEGAKVGGSSSVFKSE 852
            + +++T F   +    P  +     N    A S    A+P +N    +    + +   S 
Sbjct: 798  EKTSSTAFGVSEAWAKPTESKKTFSNSASGAESSTS-AAPTLNGSIFSAGANAVTPPPSN 857

Query: 853  SSSSSIPSF--GVPKESMSEKAGDKSSSAAGLAVGTSGNLFLSSVSTSTSTPTPSLFSFS 912
             S +S PSF   +         GD  S+    A   + +     + TS  + + S  S S
Sbjct: 858  GSLTSSPSFPPSISNIPSDNSVGDMPSTVQSFAATHNSSSIFGKLPTSNDSNSQST-SAS 917

Query: 913  SPSTNSNLNNGSPVSTTPSTFPTPATTVSNNITNQNSSIK-------LSFNTAGTSNSEP 972
              S+ S    G P     + F  PA + S+   ++ + +K        +F   G ++++ 
Sbjct: 918  PLSSTSPFKFGQPA----APFSAPAVSESSGQISKETEVKNATFGNTSTFKFGGMASAD- 977

Query: 973  VTTTSLPTSSPVPSFSAAPIFKFGSSSV-------PSTSAPALSAPSGVGSV-------- 1032
              +T +   +      + P F FGSSSV       PST+  A SAP   GS+        
Sbjct: 978  -QSTGIVFGAKSAENKSRPGFVFGSSSVVGGSTLNPSTA--AASAPESSGSLIFGVTSSS 1037

Query: 1033 --ETKTKQESA-----------FGNLSGIPPNDASAV---KASSTGSSVFQFGAASTTSD 1092
               T+T + SA           FG  S    +  S++    ++STGSSVF F A S+ S 
Sbjct: 1038 TPGTETSKISASSAATNTGNSVFGTSSFAFTSSGSSMVGGVSASTGSSVFGFNAVSSASA 1097

Query: 1093 SIKRPENSTFAPSNVPAFGALVSPASSGLASSTQSTPVLQFNS--SSTSFGLTGNTGLAS 1152
            +  + + S        A  A      SG  +STQS P  QF S  S+ SFGL+GN+ LAS
Sbjct: 1098 TSSQSQASNL----FGAGNAQTGNTGSGTTTSTQSIP-FQFGSSPSAPSFGLSGNSSLAS 1157

Query: 1153 GSSLFGSSAPASNLFTSGTGFGLASSSSSANNSVSSSA---GTSSSFFNWQPSSTPSFST 1212
             SS FG S     +FTS +   L+S++SSA++S + S+   GTS    N  P+S P FS+
Sbjct: 1158 NSSPFGFSKSEPAVFTSVSTPQLSSTNSSASSSSTMSSPLFGTSWQAPNSSPNSGPVFSS 1217

Query: 1213 GF--SSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPMIFGSSSTDASTPS-MFSFTSAAAATTSQPAFG 1272
             F  SSTPT  FSFG SS++  S++   IFG+S+ +  +PS +F F S    T  QP FG
Sbjct: 1218 SFTTSSTPT-TFSFGGSSAATVSSTTTPIFGASTNNTPSPSPIFGFGSTPPTTPQQPVFG 1277

Query: 1273 NSN--HAFTFGSTPPA-------------NNEQASMEDSMAEDTVQTVASPM--PSFGQQ 1311
            NS       FG++ P              NN+Q SMEDSMAEDT Q   + M  P FGQ 
Sbjct: 1278 NSGTPSQSLFGNSTPGFAFGAPNNGNGINNNQQVSMEDSMAEDTDQANRASMVAPMFGQA 1309

[Close]
BLAST of CmUC08G150320 vs. TAIR 10
Match: AT5G20200.1 (nucleoporin-related )

HSP 1 Score: 94.4 bits (233), Expect = 7.5e-19
Identity = 142/587 (24.19%), Postives = 241/587 (41.06%), Query Frame = 0 

Query: 12  GGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFR 71
           GG GGK +++  RR   TPY RP         + W+S++VDPA ++I+  A R+    F 
Sbjct: 22  GGVGGKLKRQSARRHAATPYSRP--TQNQVQRRPWISRIVDPAYRIISGGATRILPYFFS 81

Query: 72  KRLPPPPPSLPLSREANDEVENRNQEEVS------------------ADPPGTQEGTNVD 131
                P  + P   +   + E +N  + +                    P GT      +
Sbjct: 82  NAASAPALAAPPEDQNQHQGELQNNPQDNDPSVTPISNKPEPASIEVGGPSGTANVNEGN 141

Query: 132 FVPSINS------NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE 191
           F  S         N+   +S+LE++++ KTF++ EIDRL E++ SR  D+P      +  
Sbjct: 142 FSISAQRRGKAALNDDVAISELERLMEGKTFSQAEIDRLIEMISSRAIDLPDVKRDERNL 201

Query: 192 QVPSTPVMSYGKQEGSPQF-----PAQSQDGVSP-HMVPTHAVSANV--GISVLDEDVAS 251
           ++P    +  G ++    F     P   +D  S     PT    + +  G  + DE   S
Sbjct: 202 EIP----LREGAKKNMSLFDKAKEPIGGKDANSEIWATPTPLAKSIILDGDKIRDEVGLS 261

Query: 252 PAEIAKAYMGSRPPNATPLSMASHGQK--FGDSFASGNPSKSSTLSLVPRS-PGNFNVVE 311
           PAE+AKAYMG +  +++     +  +K     S   G  S +S  S      PG  +  +
Sbjct: 262 PAELAKAYMGGQTSSSSSQGFVARNEKDCLDRSMLVGKSSLASPSSKPSACWPGIKSSEQ 321

Query: 312 NGFVTPRSRGRS-ALYSMARVPYSRVRATPSITNSVATTDAYRATTSSSSQSAWGQGRLL 371
           +GF TP+SR  S  L +  R PYSR      ++NS +     +  +S    +     + +
Sbjct: 322 SGFATPQSRRESYGLQNFPRTPYSRT----ILSNSKSKLMQLQNDSSKHLSNLQSPSQSV 381

Query: 372 GSEQGALKRRSSVLDDEMGSVGPIRRIRQKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETAQH 431
               G L +       + G  GP RR RQ +        S PS              A  
Sbjct: 382 ERRYGQLSK-----GRDGGLFGPSRRTRQSATPSMVSPYSRPSRG------------ASR 441

Query: 432 LQSTKVHPFSSTGGKALYSSETKRNLSKMSTGSENAMTPSSFPQIPLRSSEMASKILEQL 491
            +++ +   SS  G++ Y S      S+++T  ++         +P  SS++A  IL+ L
Sbjct: 442 FENSAIMK-SSEAGESSYLSR-----SQITTYGKHKEAEVGTLTVPTHSSQIARTILDHL 501

Query: 492 DKL---TPPKEKSSELKLLSVRNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLDNVEGVRSN 551
           ++    + PK K++EL           KL+ S  H  + +++E     K   +V  V+ +
Sbjct: 502 ERTQSQSTPKNKTAEL-----------KLATSWRHPQSSKTVE-----KSSSDVTNVKKD 557

Query: 552 NARDLTSQKKDKIEENSPLKFKVPNDKSISTGDCVGSSVPTKDTVSG 560
            +  L    ++   +N P     P   + +TGD       T    +G
Sbjct: 562 GSAKLHEDIQNIFSQNQPSSVLKP--PATTTGDIQNGMNKTASATNG 557

[Close]
BLAST of CmUC08G150320 vs. TAIR 10
Match: AT2G45000.1 (structural constituent of nuclear pore )

HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 1.5e-06
Identity = 181/628 (28.82%), Postives = 281/628 (44.75%), Query Frame = 0 

Query: 636  KSSAVSATNKINDSGKSDVPVATEKSPI-FSFPTASSPSITANVIGPESTLRPEKIASSE 695
            +S++V   +  + S  +    ++  SP+ FSF  +S+PS T    G          + S 
Sbjct: 8    QSNSVGGFSFGSSSATNSSSASSTTSPLSFSFNQSSNPSSTGFGFGS---------SVSS 67

Query: 696  VPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSSAPTFAFGNRVTTSTNEQNATPVVTSEGNVEPTQQA 755
             P ++TTP FGFG          SS P+F FG+  ++ST          S  +V P   A
Sbjct: 68   TPASSTTPSFGFG---------ASSTPSFGFGSSASSSTPSFG----FGSSASVTP---A 127

Query: 756  SAATTFKFGDKATFPMPANAATENGNKNAGSPFKFASP--LVNEKEGAKVGGSSSVFKSE 815
            S   +F FG  A+   PA +   +   NA S    +SP   V     +    SSS+F + 
Sbjct: 128  STTPSFGFGTAASSSAPAPSLFGSSTTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFGAP 187

Query: 816  SSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSAAGLAVGTSGNLFLSSVSTSTSTPTPSLFSFSSP 875
            +SS++ PS        S   G   +S +    G+S +LF  S  +S S    SLF  SS 
Sbjct: 188  ASSAATPS--------SSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLF--SAPSSASASNSSLFGASSS 247

Query: 876  STNSNLNNGSPVSTTPS--TFPTPATTVSNNITNQNSSIKLSFNTAGTSNSEPVTTTSLP 935
            +  S     SP+   PS  T  TP+ +V+++    +SSI   F   G+S S  V +++  
Sbjct: 248  AATST----SPLFGAPSSATGATPSFSVASSAPGSSSSI---FGATGSSPSFSVASSASG 307

Query: 936  TSSPVPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSVETKTKQESAFGNLSGIPPNDAS 995
            +S  +  F A     F  SS  + S P+L A S  G                        
Sbjct: 308  SSPSI--FGATGSSPFFGSSSSAGSTPSLFASSSSG------------------------ 367

Query: 996  AVKASSTGSSVFQFGAASTTSDSIKRPENSTFAP-SNVPAFGALVSPASSGLASSTQSTP 1055
                 +T SS   FG ++  S S     N++ +P S    F  L S ASS  +S+T S P
Sbjct: 368  -----ATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNASASPFSASTGFSFLKSTASSTTSSTTPSAP 427

Query: 1056 VLQFNSSST-SFGLTGNTG--LASGSSLFGSSAPASNLFTSGTGFGLASSSSSANNSVSS 1115
                +SSS+ SFG + N+G  L++GS    S+APAS+  TSG  F +A+++++++++ ++
Sbjct: 428  PQTASSSSSFSFGTSANSGFNLSTGS----SAAPASS--TSGAVFSIATTTTTSSSTPAA 487

Query: 1116 SAGTSSSFFNWQPSST---PSFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPMIFGSSSTDAS 1175
            ++  +SS     P+ST   PSF    S+T T       + +S+A+  +   FG +S+  +
Sbjct: 488  TSAPASS----APASTMAFPSFGVTSSATNT-------TPASSAATFSTTGFGLASSTPA 532

Query: 1176 TPSMFSFTSAAAATTSQPAFGNSNHAFTFGSTPPANNEQASMEDSMAEDTVQTVASPMPS 1235
            T S  SFT  A   TS PA           S+ P     A      +  +    A+   +
Sbjct: 548  TGSTNSFTGFAVPKTSTPA----------SSSQPQTTSPAFSFSLPSSTSTTAPATSSAT 532

Query: 1236 FGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANP 1252
              Q  L  P SSG    STA +P+  +P
Sbjct: 608  TTQTTLVVPSSSG---TSTAVAPVAGSP 532

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of CmUC08G150320 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_038884354.10.0e+0089.71nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 [Benincasa hispida][more]
XP_038884353.10.0e+0089.44nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 [Benincasa hispida][more]
XP_038884355.10.0e+0089.13nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X3 [Benincasa hispida][more]
XP_008456625.10.0e+0084.84PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo] >XP_008456626.1... [more]
XP_011656578.10.0e+0083.78nuclear pore complex protein NUP1 [Cucumis sativus] >XP_031742754.1 nuclear pore... [more]
BLAST of CmUC08G150320 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
Q9CAF41.8e-11034.66Nuclear pore complex protein NUP1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP1 PE=1 S... [more]
BLAST of CmUC08G150320 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A1S3C4Z30.0e+0084.84nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496528 P... [more]
A0A5A7SNY90.0e+0084.84Nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN... [more]
A0A0A0K9E40.0e+0083.78Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G046360 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1FKS90.0e+0083.05nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 ... [more]
A0A6J1FF520.0e+0082.80nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 ... [more]
BLAST of CmUC08G150320 vs. TAIR 10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT3G10650.11.3e-11134.66BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.... [more]
AT5G20200.17.5e-1924.19nucleoporin-related [more]
AT2G45000.11.5e-0628.82structural constituent of nuclear pore [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (USVL531) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 165..196
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1240..1310
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..18
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1240..1282
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 806..823
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 863..901
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 800..840
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 70..121
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..41
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 99..121
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33416:SF22SUBFAMILY NOT NAMEDcoord: 1..1310
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33416FAMILY NOT NAMEDcoord: 1..1310

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CmUC08G150320.1CmUC08G150320.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0071763 nuclear membrane organization
biological_process GO:0016973 poly(A)+ mRNA export from nucleus
cellular_component GO:0005635 nuclear envelope