Clc11G02770 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAACTATATTTTTCTGATTGAATTTTGTTCTGCCCCAACAATTCATATTACCCATCCCATTTTCGATTAATATAATTATTTCCAAACAGAAAACGCCGTCGTTTTTAATGGTCATCGAGAACGTATGCTTGCTTTTCCGTTCTCCACTATACTGGTCTCTTCCGCCCGCCCGCCCACCAAAGGATAAAAAAGAGCACAAAAATATGCAAAATTTGCTTGGATTTAGAGCTTCTCAGTTCTTATTCAAATCCTCTACGCTTCCTCTCTCTCGGACTCTTCCCTCACTCAGTCTCTTCCACAACAATTCCAATTCCGTCTACGGGCGAACCTTGGCGGCCATGGCCGGCGCGGATGAGTTTGTCAAGGGCAGCGTTCATCCTAATGGCCTCGCGGTTATTACTCTCGATCGCCCCAAAGCTCTCAACGCCATGAATTTAGGTCCATTTCTTTCATAATTTTATTCTATTGCTTTGCATCTTAATGCTTGTCAATTCAGTTGTTTAATTAAGGAATGTTATCAGTGGATTTTTAGTTTACTGTAGTGTTAAATTTGGGAGTTGAGCTCCATAATGTCGATTCCTTTTTGATAATTTATGTTGATTCAAGTGAAAATTGTGCTCCCAATACTTTGAGAGCCATCAGAGCTTTTTGACTTTGGTACCGCCGGATTTTTCCATATCAAATAGTTGATTCATTTGCTTATAGCTTATGGCTCTCGTCCCTGACGAGCCCGTGCAGTTCTTCGATGAGTGTTTGTGAGAACTATCTCCTTGCTCTTGCCCAGTCAAAACGATAGGGTTTTTGAGTGAATTTTTCTACCTACATTTTGCTTTCTATTTATGTAGTAATACAACGTATTACAGCAGAATAAATAATTTAGAGGAAATGATGAAACAGCAATCAGCAACTACTATTACCCGTGTTTTCCTGCAGAGAAAAATAGTCTACAATATACAATTATTGGCAATGATTTCAGATTTTCGAGCCATCACAGCTAAGCAAAATCTATTGTCATTTTGTTATAAAAACATTTGGACAGCCTGTTGAGTTGAAAGACATGTTCAGGCGTAAAACGTTAGGAGCAATGATACCGTTTAAACTTTTTAAGTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAGAAAAAAGTTTGGTGTTTTCTAAAGTTTCTAGGAAATATGGCCATTCATCAAGGCTTTTCAATCTTAATATAACTTTATGGAATGGAGTTTTTTTAGTAGTTGATAGCAGTCCAATTTCAGGACAACCGCATGATTTAAATATTGGTCTATGTTGGTTAAATATTTGTTATTTTTTTAATGCTCTTGTAATCTAATATAATAAAAGGTGGTTCTTTGGTTGGACTTTGATCTCTATGTTGGTTTGGTTTGATTATGATTTGCTTTCTGTATTAAAGTTAATTGATGATGCAGATATGGATATACAATACAAAAAGTATCTTGATGAATGGGAGGAGGATCCAAGGGTCAAATGTGTCCTTGTCGAGGGCAGCTCATCTCGTGCCTTTTGTGCAGGTAAGAGGGTGTAAAAAGGTCATCTAAATTAATGAGGCATCTTTTCCAATTTTTTTTTCCCGCATTCATTATTACTCAGATCAACCAACCAATGTTTAGAAAAGGGTAAACATTAGCCCAATACTTTTTTATTTTTATTTTATTTTTTTCTATCATTAGAGTTGAGAGGCAAAACCTTTGAGGTGGTGTGGGGCATAAGCCTTGATTTGAATAAAAACATTGATAAGAAACAAAAGAGTATGATGAGGTATTGTTAAACATGATGATTATGTAAGTACAAGAATTAATGAAAGTAACTTTTACTAAATGTTGATTTCTTAGATAAAGATTTTAAAACATTGTTTACATTTTTATCTTAATTTTTTTTTTCAAGTCTTTGGCGTTGCATGTAGTAATGGGTTACATAGCCTCCATTTCATGATGCACTAACATGGCATGCATGAACTTCCATATTTTTGAAGAGTGGTGCAGCAAATTAATGTTATTATTCTTCCAACCTTTTCATGAGGCGGAAAGACCCAAAGAGGTCCAAGCCTTAGTAATGTGTTGCATATCCTTAGTGCGTTTCATGGAGGTTCAAGCCTCTTATGAGTCAATGACCCATAGCCTTGACCCAAGGCAAAGCCTTCTAAAACATTTCTGCCGGGTTAATTTCAAATGGATATTCTACATTTTTTGGGTTTCTTTTTTAATTTCGGGGTACTTGGTAAGGTTTTGAGGGTGACCATTTATCACTAATGCAGGAATGGATATTAAAGGGGTTGTTGCTGAAATTCAAAAGGACAAAAACACTTCTCTTGTGCAGAAGGTTTACTATTATTATTTACATTATTCCTTCTATGGTTCTTGTTTTGTAAAGATTTTGTTGCTCATTTGATATGCAGTGATGTATTGTTCATCTTTGTAATTACTGAATTCGGCAATGACATTTGGTTAAACTATCTGGTCCTGGTTTCTTTGTGAGATTAGTTAGTTGAAATATTGGTTCTTAACGACTCAAAAGTATTAGTCTATTCACAGGTGGTGATGTGAAGCAGATCACGACCAAAAACCGATTACCAGATGTGATTGAGGTCTTCTTTGTGCTTCATCTCTCTGCTTTCTCAAGAACCAAAAAGAGGAGAAAATGTTTTTAGAATATGTTGTAATATTTTTTAAAAAATAAGCCACCATATTATTCTTATTGCCATGATGTTTTCACTTATCTTTTCCCCTTTTTGAATAAAACCATCATCTTGGATTAAAGAAAAAAAAAGGCATTTCTCCATAGTTATCTTTCTAAAATAAGATACTCTTTAGTAAGGCTACGAATGTGGTATTAGTTAAACTTAAATATGAAGCTGTTTGTTTTCAATGATTGCTTTCTTCAAACTCTTTGTTCTGTTTTGTGGTTTTTTTATCCCCTCTGCACCTGCATGTTTTGCATGTCTAACTTCATGTTCTTGATTTTTGTGCTGCTGAAGGTATATAATTATTTATGATTTTGCTATTAGACCTCCTGTAGTAAATGTTTATTCTAAAAGGGCAAAAAGGCACTGAGGAATTAGTTAGAAGAGGAGGCGTATATATTATTAGGAAAAACGTGCACAAGAGGTCGGTTTTTTGGTAACGGTTGAGAATGGAGAGTAGCTAGCATTCTCAAATTGGCTATAGGGTGCCAGCACCTCTTCTGCTCCCTATTAATAAATAATGGTCTGAGTACCTAACATTGCTAATTGCCAATGCCAAATGTTGAAGGATTAAGACAGTTTTACTTTGAGATTAGCTGAGATGCACATAAGCTATTTAGACATCCACATTATCCAAAAAAGAAAAAGGGACAAAAGTAAAGGGGAATTTAGGGTGCTGAGTTGGTTAGTATAGTAAGTGGTTATTATAGTATGAGAGTTATAGTAGTCTGGAAATTATAATAGTTTGTGTTTGGGCCTTGAGGTACAGACTATATTCGGGGTGTAGACTATTTTAGTTTGGGTAGAAAATAGTAAACAATGTAACAAAAAGGGAGAAAGTGGATGAATAGGAAATAGTAAACATTATAACAAAGAGGGATTTAAATAGTATTATTGTAGTTAATTGTGAGTTATAATAGTTGGAAACACTAACTATTATAATTGAAGTCCCAAACACTGAGTGGGCTATAAACCTCTCTACCCAATTGAAGTTGGGGGCATAAACGCCCCCTAAAAGTAAAAGATTGATTGCTCCAATCTCTCTGCCATATTTTGTTAGTCCTATACTTTATCAACTGCATTTACATGTTTTATCTTTTGGACTTCATCTTGCTCTGCATGATGATTCTTTGCTGAAAGTAGGATTGAGGAGGGGCAGGTTTGAACTAGAATATATGGTAGAATTATGGATCTTCTAAGTGAACCTTGTTGCCAATTTTATGCCTTCCAATTCGATAGTTTGATGTTTTTTCAAGTCAGAAACTTCTTTTGAATGCAAATGAAATGTAAATTTTTCAAACACTATGTTGCATTTGAAATTATTATGATGTTTGTCTGTCAGGTATTTACAGCAGAGTATTCTTTAATATGCAAAATTTCTAATTACAAGAAGCCTTACTTGTCCTTCATGGATGGCATAACAATGGGATTTGGGATTGGCCTATCAGGTCACGGTCGTTACAGGATCATCACAGAGGTACATAAATCTTCCCTGTTGTGCTGAACACGTCTTTTGTTTTTATATTAGTCCAAGACTGTCTTTCGTGTCCCTAACTGTACATGCTCATCTATATTTGTTTTAATTCAGAGGACCCTCCTTGCCATGCCAGAAAATGGAATTGGTTTGTTCCCAGATGTTGGGTTTTCATACATAGCAGCACAAGGTCCAGGAGAAGGATCAGTTGGTATGTGGTCTTTCTCTTAAGCTGTTTTACCAACCCCTATAATCATATCTTACAGTAATAAAACGTAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTCAAATCCTATTTTTTCCCCTTCAACTTTCAAACATTTTGTTAATAAACCTTTCATTAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAAACCCCTCAAAATTTGGCAAAATAAACTATGCCTTAATAAACCAGTTTAATTTTGCCATTATTATTTCTATTGTTAGTAATTAGTATTTATGAATTATCTAATTGAAAATTGAGGTAGGCATGGCTTTTGTTTCTTACCTTTTGAGTAGATCTAGTTGGTCCAATGTTGAATTTTGAAACAAGTTTAGATTTTTAAAAATGATCAATGGGAAGACTAATATAAATTTCTTGTGTCAATTTTAGAGGCTAAAATAGAACTGTTGTAAGTTTAGGGACCAAAGCATATTAATATAAAAGTTCAAGGACTACAACAAGATTTGGTTAACCAAATAACTTTTACCATCTAATGTATATGATCAGATGGTAGTTTCCTAATTTAGAACCTAATATGGAGAA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MVIENVCLLFRSPLYWSLPPARPPKDKKEHKNMQNLLGFRASQFLFKSSTLPLSRTLPSLSLFHNNSNSVYGRTLAAMAGADEFVKGSVHPNGLAVITLDRPKALNAMNLDMDIQYKKYLDEWEEDPRVKCVLVEGSSSRAFCAGMDIKGVVAEIQKDKNTSLVQKVFTAEYSLICKISNYKKPYLSFMDGITMGFGIGLSGHGRYRIITERTLLAMPENGIGLFPDVGFSYIAAQGPGEGSVGAYLGLTGKRISSPSDALYVGLGTHYVPSGNLGSLKEGLLTAEFSEDPHQDINTLLAKYSSDPESPPSLKSLLSQITSSFGTDKSVKETVEELKKHQLDSNSSVVEWAKESLQGIGKGAPFSLALTQKYFSKVAAARGKSNDELSTSFRYNVLPLYMGVVQLNGVMRTEYRIALRSSLRNDFAEGVRAVLVDKDQNPKWNPSALEDVDDKEVDSLFEPLVSPVAELEFPPHLLHFLIKGDDLPNFLSSRLFFLLHRSPIHQSSRRIISTIMASSFQSLFPAIRTVTISYSELQDRSVDLSMKIEEGFGPKGLGILSVTDVCYTSLDFLRCGRIFYVFHRGISWYNFGWSHGKEKLESGKPDLLKGSFYANPILDTPTTDTSLIQRYPSYCGSNIWPSRELPELELAFKALGKLILDVGLMLAYHCDQYAAKMMKVHEDDGLEKILLNSRCHKGRLLYYFPAQQSTCSEDSDNLSSWCGWHTDHGSLTGLTCAMFTRDGVEIPSPDNAAGLYIRTRAEEIVKVYYGENEIAYQIGETTEILSRGYLCATPHCVRAPNGKEAFNLERSTFALFMQPDWDQKLNFPEEVHIHKEIIPTNCALTFGEYSEKLLDKYYHLKS Homology
BLAST of Clc11G02770 vs. NCBI nr
Match: XP_038890832.1 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 3, mitochondrial isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 820.1 bits (2117), Expect = 1.8e-233 Identity = 423/470 (90.00%), Postives = 434/470 (92.34%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. NCBI nr
Match: XP_038890835.1 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 3, mitochondrial isoform X4 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 800.4 bits (2066), Expect = 1.5e-227 Identity = 417/481 (86.69%), Postives = 431/481 (89.60%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. NCBI nr
Match: KAA0061570.1 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 3 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 795.8 bits (2054), Expect = 3.7e-226 Identity = 420/473 (88.79%), Postives = 433/473 (91.54%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. NCBI nr
Match: TYK10704.1 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 3 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 795.4 bits (2053), Expect = 4.8e-226 Identity = 419/473 (88.58%), Postives = 433/473 (91.54%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. NCBI nr
Match: XP_008458107.1 (PREDICTED: 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 3, mitochondrial isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 793.9 bits (2049), Expect = 1.4e-225 Identity = 419/473 (88.58%), Postives = 432/473 (91.33%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T0K7 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 3, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g13360 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 576.2 bits (1484), Expect = 6.0e-163 Identity = 289/400 (72.25%), Postives = 336/400 (84.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LK08 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 4, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At3g24360 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 567.4 bits (1461), Expect = 2.8e-160 Identity = 288/423 (68.09%), Postives = 341/423 (80.61%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZJ60 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial OS=Gallus gallus OX=9031 GN=HIBCH PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 216.5 bits (550), Expect = 1.2e-54 Identity = 138/372 (37.10%), Postives = 204/372 (54.84%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8QZS1 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial OS=Mus musculus OX=10090 GN=Hibch PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 213.0 bits (541), Expect = 1.3e-53 Identity = 143/378 (37.83%), Postives = 215/378 (56.88%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q58EB4 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial OS=Danio rerio OX=7955 GN=hibch PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 212.2 bits (539), Expect = 2.3e-53 Identity = 146/397 (36.78%), Postives = 209/397 (52.64%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V2T2 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 3 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold41G001320 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 795.8 bits (2054), Expect = 1.8e-226 Identity = 420/473 (88.79%), Postives = 433/473 (91.54%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CHN4 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 3 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold332G00130 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 795.4 bits (2053), Expect = 2.3e-226 Identity = 419/473 (88.58%), Postives = 433/473 (91.54%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C720 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 3, mitochondrial isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497637 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 793.9 bits (2049), Expect = 6.7e-226 Identity = 419/473 (88.58%), Postives = 432/473 (91.33%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LF30 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G005320 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 771.9 bits (1992), Expect = 2.7e-219 Identity = 402/439 (91.57%), Postives = 411/439 (93.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C725 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 3, mitochondrial isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497637 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 753.8 bits (1945), Expect = 7.7e-214 Identity = 401/473 (84.78%), Postives = 422/473 (89.22%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. TAIR 10
Match: AT4G13360.1 (ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein ) HSP 1 Score: 576.2 bits (1484), Expect = 4.3e-164 Identity = 289/400 (72.25%), Postives = 336/400 (84.00%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. TAIR 10
Match: AT3G24360.1 (ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein ) HSP 1 Score: 567.4 bits (1461), Expect = 2.0e-161 Identity = 288/423 (68.09%), Postives = 341/423 (80.61%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. TAIR 10
Match: AT3G24360.2 (ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein ) HSP 1 Score: 533.1 bits (1372), Expect = 4.1e-151 Identity = 273/423 (64.54%), Postives = 332/423 (78.49%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. TAIR 10
Match: AT4G13400.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 486.1 bits (1250), Expect = 5.8e-137 Identity = 238/357 (66.67%), Postives = 283/357 (79.27%), Query Frame = 0
BLAST of Clc11G02770 vs. TAIR 10
Match: AT5G65940.1 (beta-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase 1 ) HSP 1 Score: 200.7 bits (509), Expect = 4.9e-51 Identity = 137/385 (35.58%), Postives = 204/385 (52.99%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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