Clc07G05790 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAAAAAAAAAAGAGGAAAAGTAAAGGGCTCCTCCATTCGATCTTCCTCTCCGCAGAAGAATTCTTCTTGTTCTTCGTTGGATCACATAGAGAGAATCACGGAATCAGAGAATTCAGCCCTGCGAAACACGTAACACTGTTGATTTTCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGATCTAGCGAGAGGGTTAGAAGAATATGGCTACGCTTCAGACATGGAGGAAAGCCTATGGCGCTCTCAAGGATTCTACCAAAGTCGGCCTTGCCCATGTCAACAGCGATTACGCGGTATTCTTGGATTCATTCCTTTTCTTCTTTATTATTATTGTTATTATTATTGATTTTGTTTATCGGTGTTTGATCCGATTTGTGCGTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGTATTATCTTATTCTTCGGGATTTTTGTCTGAGTTTAGGATTTGGATGTCGCAATAGTCAAAGCTACTAACCACGTCGAGTGCCCGCCCAAGGAGAGACACCTCAGGAGTGAGTGATTGCTGTTTGCCAGATCCATTTTGTTGTTATCAATCAAAATCGGCATTTCTGGTTTGATTTTCTGTTGTTGTTTCAGAAATTCTGATTGCTACATCTGCAATTAGACCTCGTGCTGATGTTGCTTATTGCATTCATGCCCTTGCTCGTCGCTTGTCCAAGACTCGGAATTGGACGGTACGATTTTTATTTTTTTTCCCTGTAAAATTTGCTATTTTTTTGGGCGTTAGACTCCTTTATCTGGATGATATCTTTTGTCTAAGAAATTTTGTGGGTTCCTTTAGCTATCCCCAGTTTTACATTGGTTATGTCCTGTTGTTACTTGTATGTGGTTTTTCTTTAATGCCGATATTTATCAGCATTGGATTTTGTTACGTTCGTTATCTGCAATGATATTTCAAGTGTGATAATCCACAAGTGATACTGCAATATGCAAATTTCTTCTCCTGATTCCTAATTTACCATTTGAAAGGATATTTCCATTTCTGCGAAATTGGCAGTGCTTTTGGTAAATTTAATTTTCATTTGTAATGGTAAAATACAAAACCTTTAGGTTCTATCCTAATATTAGTTGAGTTTTTTCTTTGAAGTTTTTCTTTCGTACCTTTTTTCTTTAATAGGATTTCATATATACACTGATAATGAAGCATGTCTTCAAAACATAATGTCTGTATCTCATGGTTATTTTGGCAAGTATGACATCAAATTATCCATGAATTTTTAGTGGAATGAATGTGAGAATACAGTGTTTACCAGCTGCTTATTTTATAATTTACCCATTATATTCTTTTTTCTTCGTTTATTGATTATTTTGGCTTGATTTCTTTTTGCATTCTGATTCACCGTATAAGTTTCTTCATGTTTTACAGGTAGCTTTGAAAACATTAATAGTCATACATAGGACCTTGAGGGAGGGCGATCCAACATTCAGGGAGGAACTTTTGAATTTTACACAAAGAGCTCGAATTCTTCAACTGTCTAATTTTAAGGATGATTCAAGCCCAATTGGTAAAATTTTTGAGATTTTCTTCTATTCTTTTCATTCAAATGATACTCTAAAAGTGTAGTCAATTAGATGACTGATATATAAATTTTTATAATAGCTTGGGATTGCTCTGCATGGGTACGTACATATGCATTGTTTTTAGAGGAGCGTCTCGAATGTTTCAGGATACTTAAGTATGACATTGAATCTGAACGCCTGCCAAGACCTGCCCAAGGTCAGGATAAGGTATTGTACTGAAGATTTTTGTTAATTCACCTGGCCTCCTTGCATGGTACATGTATGAGTGAGTTATAACATTTATTTAGGTATGTAGTCTGAAAGATGCATATACTTTTTTGCTGTCGGTAAAAATAATGTGATTATAAATTTCTTATTTTACATCCTAATTTTGGAATAACCTCTTATAAATAATTAAAAAAAGGAATAACCCTTAATCTTCCTCCTCCTTGGCTCCACCACTAAAAATGTCTTGCCATGAGGTTTTCTTCTACCTCTTGAAGTGGTGAACTCATAAACCTTGCTCCATTAGATTTTAAAATGGCGAGGGAGCTAGTGATTGAAAAGATCTATAAGCTATCCCATAGTTTTGGAAGTGTAGGCATATAATGTAGGAAAAGATAAGTGGGGTTGGCGCTTTATTCATGAACCAAACTCCTTTTGGTGGTTATGAGTATTCATGAAAAATCTCCTTTTGAAGGGCATATGGTAGGATGACATGTATCAAGCTATTTCCAAGATTTGGAAAAAGGTTGATCCTCTCCCGACTTTTAAACTTGGGAGAGGTGACTACATATGCTTTTGGCCGGATAGATGGGTTGTTGTCTTGGTGATAATTCTTTGATGCATTGTTTTCTCCAAGTATTTGGTCTGTTCATCTTCAAAGGTTTCTTTATGGATTTTTGGGACTCAAATATTATATGTTGGTTTTAGTCTTTTGTAGATTATTGAAAAATGATGAGATATTTGCTTTACAATCTTTGTTGGGTATTTTGGATACCTATGAAGCACAGACAGGGGTACGGATACGGGATACGAATACGATGATAGGATACGACGAGTTGTCAATTTCTAAAATACTAAGATATGGATACGTCGAGGATATGTCAATTTGGTTATATATTTTTTATTTATATATGTAAATTGAACATAAAGATATTGAATGTAATCCACCAAAGGATAGAATACCAAATTAATAACATAAAGATAATTTAATCCACCAAATACACATTATATTCATCTAACAAAACATTTGTAATTCAACAAATCAAAACAAAGTTTTTAGTACAAAGTAGACTGAAGCATTCAAATCTAAGATCTCCATAGTCATCTTCAACAAGGGAGGAGGTTGAGTTTATGGAAGGATCTGATGATTGACCTTGGCTTGAGGATGAAGATGCCATATTACCTAACTACCTACCTAATAATTTAAGTTAAAATTAAAGGAGTTTTGTGAAAAAAAAAAAGGAAGGAAGAAAGGAAAAAAACAGAGAGCTTTGAAATTGACCATAGGCAGCAAGCCAAGGCAAAGGCCTAATGAGGATGGTTGGGGGCGAGGCTGAGGCGTGGTTTGCAACGAGGCTGAGGTTAGGCGCGACAGCGAATGGCGTACGTCTTGCATTGCTCAGTCGAAGAAATTGGAAGAAGATGAGGGGGGTCGTGACTTGTTTGTTGGAGATGAAGAGAATACTGAAGAGATTTGAATGAGAGGGAAATTTGATTTAGGGTTTGATTGTTCTAATTTTCTGATTTTTCTTTTTGTTATTTCCTTTTTAGGCTGCTGATAATTATAATATTTTTATAAATTTAAGTGGGCCATGGGCTTAAAATTCAGCCCAAGTGTACAATTTCTTTTTATTGTCGCGCCCCCTTCATGTATCTGGAAGGGGACACACGTGTCCAAAATTAAAAAAATAAAATTAGATACTTCATTTCATGTATGATGTATCTGACACGTATTTGGACGTATCGGTATCAAATATATATCTAATACTAAATTTCTACCCACTTTGAAGTCTCTTTTTATTTCTTTAATGAAAAGTTTTGTTCCTTGTAAAGAATATGGGAAATGACAGTTTTTTTTTTTTTTATTTTATTTTATTTTTTTTATATCCGTGGGTGTCTAGCCAGCTTATGCGCACCTCGACTAATCTCACGGGACAACCCACCTGGCCCTACAATATTTGGTTGTCAAGGAAACCCGTAGAATATTAAATCCTAGGTAGGTGGCCATCATGGATTGAACCCATGACCTCTTAGCCATATATTAAGACTATGTCTTCTCTTTTACCACTTGGCCAACCCATGATGGTTAATATGGGAAAAGATAGTTCATCATTGCTAATACAATACCAATTTGGATTAAGTTAGGAACCAAGGTTTCTCTTTTGGATTCTAAAAAAAGGAAAAAAGAATCTAGTATCTACATATCTTGGAGTATGACAGTGCACTCCTGTCTAAATGGCTCGTGCATTTCCATCTAAGAATAATTTCATTTGGTTGCTCGTGCAAGCAAATATGGATCACACCCTTTTGAATGGATTTGAGGAAGAGCTATAGGCACTTCCAAAACCCCTTGCCCCTTGGAGAGGTATAGTCAGGGGCCTCTCCAACCTTTTCTCATGTTTTGCAAGGTTCGGTGGGTCATGGGAGGGATGTTATGAACCCCTATGTGCTTGTTACCCTCTTCTGTATCATTCGTCCTTGATGAGGAACCACTGGTTTCGACATTGTTTGTTTGATAGGAAATGTTAGATGTTATTGCGCATCTCTCATTTGATTAGGGAGTTCTGTAGTAGTTTTTGGAGAAGGGATGTTCATTTTTGGAGCTTGCCCTTCAAATGGTTTCTCTTGAAAATCTTTCTTTCACCGTTTGGCCAATCCCTCTCCCTCTCCCTTGAGTGGTGTCTTTGCCTCATTGTGGAAGGTAAAAATCCCAAAGTAGGTTAAGTTTTTTGTGTGGTAGGTTCCTCATGGATTGGTGGTTAACGAGTTTTGGGGATGATGTGCAATTTGTTTGGGCTATTGTGTTGCATTCTTTGTAGGTAGGCGGATGAGGACCTTGAGCATGTACGTTGAAGCTGTGACTTTGCACATGCTGTTTGGAGTTGCTTCTTCGAGGAGTTCGACTTGAATCTAACTAGACAGAGGGGCTATAGAGAGATGATTGATGAGTTCCTTCTTTTTCCTTCTTTTGTGAGAAAGGAAGGTTTTCATGGCAGCTGAGTTTGCTGTTTTGTGGGATATTTGGAGAGAGGAATACTAGAGTCTTATAGAGGGCTTGAGAGACTTTGAAGTGATGTTTTAGTATTTACTTCTAAATATTGAACATAAATAGTGCTATAGGATAAAAATAATACAATTTGAGAGTGATACATTAACACTTGTTTTTTCAAAGCATATAAACACGTTAACTATTTCCTTAATTTTCCTTTGTAAAAACATAATATATACACAAATGTAAATATGGATAATTGTGTCT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MATLQTWRKAYGALKDSTKVGLAHVNSDYADLDVAIVKATNHVECPPKERHLRKILIATSAIRPRADVAYCIHALARRLSKTRNWTVALKTLIVIHRTLREGDPTFREELLNFTQRARILQLSNFKDDSSPIAWDCSAWVRTYALFLEERLECFRILKYDIESERLPRPAQGQDKAASQGKGLMRMVGGEAEAWFATRLRSPVAALIEEQNSGQIPLVSDGTKPPESDDPSEKKNKETWSNVNTREGDEKAESLWKEKIEGCSVNAGEKNEESLVLRKENLVGCSLYELNSLVESAGIPCEEKEELIDGCSPSNKLNSINSCLHQGSISPKQFNVKPSEEVADKQSMKELNSEVPSVSIKHFDFLSTNLNINQEVLRSWLQKKDSQPTLPTSSLHRFIIHRKGSNPTPPMTTQLKFSLPPKSQKSGKSRDTAEPGNWTVKNCWNICLLCNSCCIVLLAAGQKEQLLGIMLYSTPWHCRPFGTGKVFQQEVVDTLLDNGIRGQPMRDGHNKVYKSFSDKKEEATRVRDHWSIDLFTSVYVWYAVAGSLSDFYDICKGLELARNFQFPVLREVMMPPQSFLNTMEEYIREAPRMVTVPNEPLLQLTYKPEESLSEDQNLPTDQPEASPSDDLSITPVETAPPPPPAPAPAPESHAETGDLLGLSLATTEVSEIEERNALALAIVPSGDTATPTFHSNGAHTNDFDPTGWELALVTTPSSNLSSTNERQLAGGLDTLTLDSLYDEGAYRASLQPVYGKPAPNPFEVQDPFAYSNAIAPPPSVQMAPLPQQQANPFGPFQPTFPQQQQPFSMDPTNPFGDAGFGAFPAPNHHTVPPPASNPFGSTGLL Homology
BLAST of Clc07G05790 vs. NCBI nr
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BLAST of Clc07G05790 vs. NCBI nr
Match: XP_004142277.1 (putative clathrin assembly protein At2g01600 [Cucumis sativus] >KGN49630.1 hypothetical protein Csa_018458 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 802.7 bits (2072), Expect = 2.9e-228 Identity = 486/845 (57.51%), Postives = 512/845 (60.59%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. NCBI nr
Match: XP_008464707.2 (PREDICTED: putative clathrin assembly protein At2g01600 [Cucumis melo] >KAA0041003.1 putative clathrin assembly protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 796.6 bits (2056), Expect = 2.1e-226 Identity = 483/845 (57.16%), Postives = 511/845 (60.47%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. NCBI nr
Match: KAG7031470.1 (putative clathrin assembly protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 776.9 bits (2005), Expect = 1.7e-220 Identity = 475/846 (56.15%), Postives = 505/846 (59.69%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. NCBI nr
Match: XP_022942730.1 (putative clathrin assembly protein At2g01600 [Cucurbita moschata] >KAG6600834.1 putative clathrin assembly protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 775.4 bits (2001), Expect = 5.0e-220 Identity = 474/846 (56.03%), Postives = 504/846 (59.57%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LBH2 (Putative clathrin assembly protein At2g01600 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g01600 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 488.0 bits (1255), Expect = 2.1e-136 Identity = 358/867 (41.29%), Postives = 417/867 (48.10%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P94017 (Putative clathrin assembly protein At1g14910 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g14910 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 450.3 bits (1157), Expect = 4.9e-125 Identity = 325/858 (37.88%), Postives = 409/858 (47.67%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LVD8 (Putative clathrin assembly protein At5g57200 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g57200 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 329.7 bits (844), Expect = 9.6e-89 Identity = 294/865 (33.99%), Postives = 374/865 (43.24%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VYT2 (Putative clathrin assembly protein At4g25940 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g25940 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 326.6 bits (836), Expect = 8.1e-88 Identity = 294/875 (33.60%), Postives = 373/875 (42.63%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LHS0 (Putative clathrin assembly protein At5g35200 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g35200 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 249.6 bits (636), Expect = 1.3e-64 Identity = 249/824 (30.22%), Postives = 329/824 (39.93%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KIT4 (ENTH domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G033480 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 802.7 bits (2072), Expect = 1.4e-228 Identity = 486/845 (57.51%), Postives = 512/845 (60.59%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TCZ2 (Putative clathrin assembly protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold125G002210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 796.6 bits (2056), Expect = 1.0e-226 Identity = 483/845 (57.16%), Postives = 511/845 (60.47%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CM82 (putative clathrin assembly protein At2g01600 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502525 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 796.6 bits (2056), Expect = 1.0e-226 Identity = 483/845 (57.16%), Postives = 511/845 (60.47%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FWU2 (putative clathrin assembly protein At2g01600 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 775.4 bits (2001), Expect = 2.4e-220 Identity = 474/846 (56.03%), Postives = 504/846 (59.57%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JBM7 (putative clathrin assembly protein At2g01600 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484291 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 3.0e-218 Identity = 470/844 (55.69%), Postives = 503/844 (59.60%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. TAIR 10
Match: AT2G01600.1 (ENTH/ANTH/VHS superfamily protein ) HSP 1 Score: 488.0 bits (1255), Expect = 1.5e-137 Identity = 358/867 (41.29%), Postives = 417/867 (48.10%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. TAIR 10
Match: AT1G14910.1 (ENTH/ANTH/VHS superfamily protein ) HSP 1 Score: 450.3 bits (1157), Expect = 3.5e-126 Identity = 325/858 (37.88%), Postives = 409/858 (47.67%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. TAIR 10
Match: AT5G57200.1 (ENTH/ANTH/VHS superfamily protein ) HSP 1 Score: 329.7 bits (844), Expect = 6.8e-90 Identity = 294/865 (33.99%), Postives = 374/865 (43.24%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. TAIR 10
Match: AT4G25940.1 (ENTH/ANTH/VHS superfamily protein ) HSP 1 Score: 326.6 bits (836), Expect = 5.8e-89 Identity = 294/875 (33.60%), Postives = 373/875 (42.63%), Query Frame = 0
BLAST of Clc07G05790 vs. TAIR 10
Match: AT5G35200.1 (ENTH/ANTH/VHS superfamily protein ) HSP 1 Score: 249.6 bits (636), Expect = 8.9e-66 Identity = 249/824 (30.22%), Postives = 329/824 (39.93%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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