Clc06G07590 (gene) Watermelon (cordophanus) v2

Overview
NameClc06G07590
Typegene
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus cv. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
LocationClcChr06: 8253134 .. 8262908 (-)
RNA-Seq ExpressionClc06G07590
SyntenyClc06G07590
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CGCGGCGGGTGAGATGGGGAGGGAGAGATGGTTCCACGACTATGAGTGACTATAGAGTAAAATTGCGGAGAAAAAGAAGAAAAAGAAAAAAAAAAAACCTTCATTTTAGGTTTTTCTTCCTCCTCCTCCATCGCCATCGCGCATCGCCATTCTCATCTTCTCTCTCCAGCTTGCCTCCGACACTGCAACGCCGCTCTGCCTCATCGCCGTCGCCGGGCTTCGCATTCCAACTCTCTTTTCTGCCTTTTATCCAAGGTTACTCAGCCACATCTTCTCCCTCATCGCTGTTCTTGATTCTTCTGTTGCTGCTGTAGTTTCATCCTTCTGAGCCCTCATTGACTCTCTAATTATTGAGAATAAACTTACATGGGAGATTATTCATTGTTAGTGCTTTGTACGTAATTCTTTTTTGCACCTTTTTAATTTCTTTAGGCTAATTAGAGGTTTAATAAGTGATTAGGAAGTGGGAAAATAAGAGGCACGATGTAAACCGTTCTCTTGAAGTAAATTTAGTCTGCATTTTAGCTTGCATGGTTAAGTTTTGATTTATTTGATGTTTGGTTTTGTAATTGAATGGAATCTTTAGTTTTCTTCTTAATATGCGTATTTATTCTTTTGTAGGATTATTGAATGTGCAAGTGACTGCGTAAGCACTGAGGATTTCCACCTTGACCAGTTATTGGTCTTCTAACATGGTCAATGCGGTCTTTGTTTGAGCATTAATTGTCACATTATATCGTCCGTTTAAGTAGGGGCCGATGAACACGCATAGTTGCTCAAAACAATACAGTAGAAGGAGTAAAAAGCAGACCCAGAGCAACTCTAATGATGAAAGTGCAGCTCGAACTAGGCCACTCAGCTTTGAAGACATTATGCTTAGAAGGAAGAATAAAGGGTCAGCTGCTACTGTTGAGGTGGGTGCCACTGGTAGCCATTCAAGAAGGGAAAGCATAGATAAGCACAGTACTGATAATCGTGCATCTGAAAGGAATCTTCGTCACAGTAAAGGTTCTTCTCTTGATGTGCAAAACCTCTCAATTGAGGAATCAGCCAAAGATAGTTCAAGAAGGAAAAAAGAGGAGACATTGTTGAAGGACAATATGGTGGTTAGGAGTGATAGAAATAATTATGAATCTGGATTGTCACTGATGAGTAAGCTTAAATACGACAGGAATGGAAAGGATAAAATAGAGAAATATGGCCAGGAAAATCTTGGTTGGGGAAAAAATGACCAGAGTTCTAGAATTGATATTGAAACTGAAACTGGAAAGAGGCATTCAAGAGATACAGCTGGCAAGGATAGACGTGAAGATCATGGTAGGGGGAAATTTGAAAGAGAAAATAAGAGAAAATCTCAAAATGGTGATGATGACAGGAATAGAGACAAGTACATTGCAAAGAGACATGATCATGGCAAACATCATGACCTAGAAAATAGAGAAAGAAAGGAAGCTAAAGTATCATTGACTTCACATTATGAAGATTCTAGATTGAAAAGAAGACGGAAAAGAAGCCGAGATCGTGAAAGTAAACATAGAAGATCTGTTTCACTTTCTCCAAGACCTCACAAGCACTCAACTAAGTTAGCTAGGCAGAAGGAGTTGCCATTAGATTCTCATGTAAAGAAGTCTGGAAGATGGCGTTCTGATAGTGATAGAACAGGGGATTTTACCAACACTTCCAATAGCCAATACCGGCGACATTCTGGGTCCACAAGTGGGCTTGGTGGCTATTCACCTAGAAAGAGAAGAACTGAATCTGCTGTCAAGACTCCTTCACCTGCTCGATCACCAGAGAAGAAAAATGAAGTGTTGGATGTTCCTCCAACAGAAAAGGTTAAATTATTTTCTGGCTCAGTTACTTCCAACTTCCAGCCGCCAAATCCTACTGTTTCCTTGGGCATTAGTAATGATCAATCTGGTGGTGCACTCTTTTCTTCTGCTATGGGGAAATCTTTATCAGGGGTTTCTTCAAACAATATAGCAATGAAGACAAAGGTTTCTCTTGATTTGATTCAGCTGACCCAAGCTACTCGGCCGATGAGGAGGCTTTATATTGAAAACTTACCACATTCTGCATCTGAGAAAGCAATCATTGATTGCCTGAATGGTTTTCTTACGTCTTCAGGTGTTAATCACATTGAAGGAACCCAGCCGTGTATTAGTTGTATTGTAAGTGCTTTATTCTATGTTCTAAATGTGTGTCGCTATTTTGTTATGATATTGTCTGATGGGAGTTTTGGTGCATACACCACTCGTGCAGATACACAAAGATAGGGCGCAAGCTCTTGTCGAATTTCTTACACCTGAGGATGCTTCAGCAGCTCTTTCGTTTGATGGAAGTGACTTCTCTGGCTCTATTCTAAAGATTCGGCGACCAAAAGATTATATCGAAATTGTAGTAAGAATAAATATCCAGAATTCTTGGCCATCTCCATTCTCTTGATACCCTCAATCTATAATACATTTTGCATTGTTTGAATTAATTGTTCCATTGATTGGATGAGTAGTATAGTTTTAACTTGTAAGGCAAACCTAAAATTGTTGAGCCATAGTTTCCCAGGTATCAGCACCCTGCATGACTCTCTTCTGATTGTTGGGGACCTCTTTTTGTCTTTGATTCTTTTGTTTTGAAAGTACATTGTGCCAGTAGCTCAGGATTTAGATGAAATTGTCTTACGTCTTCTTTTTCTAGGATAGGGGAGGTAATTTGTGGTAGTTTTTTCCTCCTGGCTCTCGAGAATGTTTGGTTAGAAAAATATAGGGAGAATCTCCATTTAAGTAAGTTCTCCATTATGTGGATACATATTTTAGCTTAGTATGTGCAAAGCATGGATGCTAGGATGACTTGTTGCGTTGAAAATGGCCTGTGTTATATTTAGGTATGTATTTTGGATTGAAGGACACCACAATGGTGGAATCTACCACTAGTGCAGAGGAATTTCCCTGAATCTCGGCAATGAGAATGTAGGAATTGTTCTTTTGTAGTGGTATTACTATTAAAATAACTCATCAAGTGCATGGATCAATTTTGGATATTCCTTCGAGAAAGGTTATGCTTGAGCATGCAGTCAACATAATTGGAGGACCTATTAGTTGAGGAGGGTCTTAAGTGATTATGAGCGATGTAGTGAATGCTCTCACGATTTTATAAGAAAAACCCTTGACATTATTGAATGCAAACAAGTGCACAAGCTTATATAAATGAGTAAGGTTAAAACTTAAAAGTGGTGGATAGTCTGGCTCCTCTAGCTCTGGCTAATAGGAACTTAATTAGGACAGATAAACTGGAAGAATAGCTCTTGCCGTTGATACCATATTAAACCAGAAACATATAGCTCAAGGGCTGATCGTGAGAGTGGTAAATGATATCATGATATGTAGCCATTTGACAAAAATGCACAACTATGGAGCAATTAATTCAAATTTAATTTGATTCAATTTCTTTATTTGATAATGGGATGTACGTATCCAAATTCTTGTCTTGCATGGCTACATTTTAAGTTAAGGGATTCAATAACTGGGTTTGAGTTGGGGTTATCACTCCGCATGTTTTTGTTTGCCCCTCGTCAAACCTTTTTCTTTTTCCTTTTCCTTTTCCTTTTCTCCCAACAAATTATTAGCTCGGGTTCTAAACTTTGCCTATATTTTCTATAGCACATATAGAATCTGTTTCTTCATCCTTGTCATTTCAGTTTCTGAGGTCTATTGTGGTTACTATCATGTAGCAGGTTTTCAGACAGTTGCTATTTTCATGCAGACTGGTGACCTGGACAAGTCGGTGCCGGTAGTAAATGAAATCAGTGATGTTGTCGAGGACTCACCAAACAAGGTATGTATTTGAATTTTTTGACACTGAGGAGCTGAATGTTAGTTTCTGCTTATGATGGGGACTGAGAGTGAAGTCTCTAGTAGTTATTATTATTATTGTCATTGTTATTATTATTTTGTTGTTGTGGTGGGGTGGAGGTTGAAAAGAGAACAAAGAGGTAATGAGTCAAGAAATATCTCTGTCTTCCCTTCCCCCTCTTATGCAACTCTTTATTACCTTTCACCTTTTTTGGGACAAAAATTACCTTTCACCCTTTTTGGGACCATAAAACTATGGCTCTCTTTATAACATAATCGTGTAAAAGTTGAACAAGAAAATCACTGAAGATTGCTGGCTGAACAAGGAAAATGCCGAAGTCATCCTTCGAGACCAAGATTCCAAGCAAATGGGCCACAAATAAACAAATGGTTTAAACCTTCATTCTTCTTTATAAACGTTTAAGACTAACTCGGATTGAGATGAGCTGAGCCAAATGAGTTCTTTGTTGGATGCTGTCTGCTGTGTTGTTCTTGTTCATAACTCCCATGCGATGCTAACCACAAAAAGTTATGGCCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGCAAACTTTCTTCCAATACCACTATTACGCTGTTAGTTGATAATTAGTCAATTGTTTACTGCTTTTTAATAAGTGTCAATTAGCTTCCTTTTTTGTAGTAATCGTGGAAGATTCTAATCCCTAGCTGCACTAAACATACAACCCAACTAAGGAGGTTGCTTACCACCATGGTCCTTTGGACCTACAAGGAAAATAGAGTGATCAATTATCATTAATTACATCAGTACTTGAGCACATTTTTCATTTTTCTTTAAACCATCTTCCAAATCTCTTCGCTGTTAATTCCAAGTATTACAAATACCTATAACTCCTTAAAGAAGCCTTTTCCCAAAGTGCCTGCCCATTCCTAGTTCCTAATACTTAAGTTCTCCCTATTAGAGACCGTGTACAATTTTATTTTGAACTCTTTCCAAAATCAGATCCTAGTTGCTGAGGCTTCTAGGATTTCTCTTAGAGGTAGAGTATAAAATATTTGATAGTAATATTTTCAATAGCATATTCCCAGTAGGCAGCTCACATTAGAAACTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCAGGTTGAGTATAGCTATTAGGATTCTTATGTTATAGCATCATTTA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mRNA sequence

CGCGGCGGGTGAGATGGGGAGGGAGAGATGGTTCCACGACTATGAGTGACTATAGAGTAAAATTGCGGAGAAAAAGAAGAAAAAGAAAAAAAAAAAACCTTCATTTTAGGTTTTTCTTCCTCCTCCTCCATCGCCATCGCGCATCGCCATTCTCATCTTCTCTCTCCAGCTTGCCTCCGACACTGCAACGCCGCTCTGCCTCATCGCCGTCGCCGGGCTTCGCATTCCAACTCTCTTTTCTGCCTTTTATCCAAGGATTATTGAATGTGCAAGTGACTGCGTAAGCACTGAGGATTTCCACCTTGACCAGTTATTGGTCTTCTAACATGGTCAATGCGGTCTTTGTTTGAGCATTAATTGTCACATTATATCGTCCGTTTAAGTAGGGGCCGATGAACACGCATAGTTGCTCAAAACAATACAGTAGAAGGAGTAAAAAGCAGACCCAGAGCAACTCTAATGATGAAAGTGCAGCTCGAACTAGGCCACTCAGCTTTGAAGACATTATGCTTAGAAGGAAGAATAAAGGGTCAGCTGCTACTGTTGAGGTGGGTGCCACTGGTAGCCATTCAAGAAGGGAAAGCATAGATAAGCACAGTACTGATAATCGTGCATCTGAAAGGAATCTTCGTCACAGTAAAGGTTCTTCTCTTGATGTGCAAAACCTCTCAATTGAGGAATCAGCCAAAGATAGTTCAAGAAGGAAAAAAGAGGAGACATTGTTGAAGGACAATATGGTGGTTAGGAGTGATAGAAATAATTATGAATCTGGATTGTCACTGATGAGTAAGCTTAAATACGACAGGAATGGAAAGGATAAAATAGAGAAATATGGCCAGGAAAATCTTGGTTGGGGAAAAAATGACCAGAGTTCTAGAATTGATATTGAAACTGAAACTGGAAAGAGGCATTCAAGAGATACAGCTGGCAAGGATAGACGTGAAGATCATGGTAGGGGGAAATTTGAAAGAGAAAATAAGAGAAAATCTCAAAATGGTGATGATGACAGGAATAGAGACAAGTACATTGCAAAGAGACATGATCATGGCAAACATCATGACCTAGAAAATAGAGAAAGAAAGGAAGCTAAAGTATCATTGACTTCACATTATGAAGATTCTAGATTGAAAAGAAGACGGAAAAGAAGCCGAGATCGTGAAAGTAAACATAGAAGATCTGTTTCACTTTCTCCAAGACCTCACAAGCACTCAACTAAGTTAGCTAGGCAGAAGGAGTTGCCATTAGATTCTCATGTAAAGAAGTCTGGAAGATGGCGTTCTGATAGTGATAGAACAGGGGATTTTACCAACACTTCCAATAGCCAATACCGGCGACATTCTGGGTCCACAAGTGGGCTTGGTGGCTATTCACCTAGAAAGAGAAGAACTGAATCTGCTGTCAAGACTCCTTCACCTGCTCGATCACCAGAGAAGAAAAATGAAGTGTTGGATGTTCCTCCAACAGAAAAGGTTAAATTATTTTCTGGCTCAGTTACTTCCAACTTCCAGCCGCCAAATCCTACTGTTTCCTTGGGCATTAGTAATGATCAATCTGGTGGTGCACTCTTTTCTTCTGCTATGGGGAAATCTTTATCAGGGGTTTCTTCAAACAATATAGCAATGAAGACAAAGGTTTCTCTTGATTTGATTCAGCTGACCCAAGCTACTCGGCCGATGAGGAGGCTTTATATTGAAAACTTACCACATTCTGCATCTGAGAAAGCAATCATTGATTGCCTGAATGGTTTTCTTACGTCTTCAGGTGTTAATCACATTGAAGGAACCCAGCCGTGTATTAGTTGTATTATACACAAAGATAGGGCGCAAGCTCTTGTCGAATTTCTTACACCTGAGGATGCTTCAGCAGCTCTTTCGTTTGATGGAAGTGACTTCTCTGGCTCTATTCTAAAGATTCGGCGACCAAAAGATTATATCGAAATTGTAACTGGTGACCTGGACAAGTCGGTGCCGGTAGTAAATGAAATCAGTGATGTTGTCGAGGACTCACCAAACAAGATTATTGTTGCTGGGATCTCAAATAGAATATCATCTGAAATGCTTAGGGATATTGTTACTGCATTTGGATGTTTGAAGGCCTATCACTTTGAGATGAATGATGATATTAATGAACCTTGTGCCTTTTTAGAGTACGTTGACCAATCAGTTGTGTCCAAAGCCTGTGCTGGTCTGAATGGTATGAAGATTGGAGGGGAAGTACTGAAAGTGTTTCCAGCTGTTCCTTTTGCATCAACGGAACGTAATGGATGTCAACCATGTTATGGGATCCCAGAGCATGTTAAACCTCTTCTTCAACAGCCATCAGTAGTGTTAAAAGTTAATAATGTGTTTAATGCAGATGTCCTCCCAGTACTCTCTGAGTCAGATATTGACGAAGTTCTTGAAGATATTCGGTTTGAATGTGCTAGGTTTGGAACTGTTAAATCCATGAATTTTGTAAAGCCATGCAATGGCTGTGTCAGTGCGGAAGAAGAATACAAGAAAATTAGCGATGATGTCACTGATGTGGAGATCAAACATGAGATTCAGGAAAACAGTACAATGGTGATTTCAAGAAACAATAATGATCTTGAAGATAACTACGCTAACCTTGATAATTGCCCCAATGATACCAATCAGAAGCAGGTTAATTCCCCTAGCAATGGTAGACGTCAGGATGAAGGTATGGAGGACAAATTCTGTCAAATTGGTAACGATGATGCTACATGTTTTGAATTTGTAGCTCGTGAGAATGCTTCAGAAAGAATCCCTCAAGGACTCTCTGACCAGCGAAGCAGCCCAGAAAATGAACTTCAGAATGCAAAAGTAGCTGAAATAATTGAAACTGATGAAACTGGCTCGGACAAGAAATCGGTTTGTCTAGATTCACCTATGGTGGTGGATGATAATGAGAAGAAAGCTCTAAATGGATTGGATCCCATGGTGAGAACAGGTTCTGATGCATCTGATAAAAGCGAAAAGAAGGATCCTAATAATAATCTGGAGAGTTTATTTGTGTTGGGGAGTGTCTTTGTCGAGTTTGGCAGAATGGAAGCCTCGTGTATGGCTGCACATTCTTTACATGGTAGGATTTATGATGGACAAGAGATTAGCATCGAGTACATTCCCTACGATGTCTATCGGAAGAGGTTTCCTAAATGACTACAGTTGAATTCTGAATGTGATGATAACTGGTTGCTGAGTTTGGCATGAAAGCTCCACTTATTAGCAAGTTTCATTACTGAAGAAGGCATTTGTTAATGGCTCATTTTAGGCCAGCCTCAATATTTTTTTGATCATTTGGTTCGAAATCCGAAGCATGCTGTATGGTGAAACGAGTCATTTCTCAAGCACCATATGGATGATATGCTGAAATGAAAGCCTGGGAGAGTATAAGTCTCCCACAGTTTAAAAGCCTTTTAACCTGCCCGACCCCGTGCGATTCTGATAGATTTTCTTTTATATGCTTAACAGGTACAAGGATCTAGGTTATGGACATGAAAGATTTACGGCCAGATTACAAGTTTGGTGCAAGGTTATTATTATATCTTTGGAGCTCCCTCTTTTCTTCATTAGACTTCATGTAGATTTATCTATCAAGTTGGGATGCAACTTTGTTAAGAAGCTGATCATAGGGAATAATGTTCTTTATTTGCAGCTTGTTACCTCAACAAATCAAATGTAAGAGTTAAGGTACTAGTAAACCTTTTCTGTAGGTTGCAATTTCAAATCTTTAGGCTATACTGC

Coding sequence (CDS)

ATGCTTAACAGGTACAAGGATCTAGGTTATGGACATGAAAGATTTACGGCCAGATTACAAGTTTGGTGCAAGGTTATTATTATATCTTTGGAGCTCCCTCTTTTCTTCATTAGACTTCATGTAGATTTATCTATCAAGTTGGGATGCAACTTTGTTAAGAAGCTGATCATAGGGAATAATGTTCTTTATTTGCAGCTTGTTACCTCAACAAATCAAATGTAA

Protein sequence

MLNRYKDLGYGHERFTARLQVWCKVIIISLELPLFFIRLHVDLSIKLGCNFVKKLIIGNNVLYLQLVTSTNQM
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Clc06G07590.2Clc06G07590.2mRNA