Clc06G04380 (gene) Watermelon (cordophanus) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTAACTGCATACATACAAACTTCAACCAAACCGCCCTTCATAAATTTACCTCCATTTTCGTTTTCTCCAAAATTGATCCGCTCGAATTTTGAGCTCCTCTCTCTGCATTTTTCTCCCTTTAACTCCCTACGTTTCAGCGTTTCATCGTCTTCTTCGCGAGCTTTCATTCATTCATCTTTTCCGTTTTCTGTCCACTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTTAAGCCCTTCAGTTAGCTTTGATACAACCAGAAACTTCAGGACCATTCACAGATATTAATGCAATAAATTTCCATCACCCTCTTCAGTTTACTCTCCCGGCGGAATGGCTAGCAGTGTGCAGAGGAGTCCTCGGTTGGATCAGATCCATGGCGAAATTCGCGACAGTTTTCGTGCCATTTCGTATGTTCTTTAACCACGCCCTCTCTATTTAGTGATTGTTTCTGCTTATATTGCCATGTTGTTGTATATATGCATTAAACGCTTCCAATGACAATGGTTGGTGTCTCGGGTAATGATCAATTTTTATGTTCGGGGACCCTTCAAGCCTTTTGATTCTGTTTCGTCTCTTACACCTTCGTTGAAGTGTGGTTTTGTGGATTAGTAGACATTTTTTTTCCCTGTTAAAATAATGTTTACGAAAAACTATTTCATTGACCCAATGGAAGGGAGAAGAAGACCCCATTCCAACAATGGAATTTAAGAAAGACGTCTGGTTAGCGCATTCGTTTGTTAGGCTAGGTCAGTGGACCTCATTTTAAACATCTGCATTGATAAATGGCGATGTAGTGTCTTTTAGGAATTTTTTTTTTCCCTTTCTGTTTGTATTCTTTGGGAGTTAGTTATTGACTTCTTATTTAAAGACTTCCTTAGTTATTTATTTTTACCTTTTGTTAACTTTTACCTTTTGGTAATGGTTTAATTTTAAGAGATGTAACTTTTCTTCAGCTTCTATTTTATTTCTTTACCTTCGGTTAATAAGGTCAAGTTAGTTTGTATTCTCAGTTTTCAGCCTATACATAAGGCTAATTACTTTCAGTTGAAGGTAATAAGAAGTTAATCATTTCTTTGAGAATTTTGTCCTCACCAAACGAAATGACCACCAAAGGTGCATTGTAAAAATGATCTTCAATCATGAAGAAAGACTATCTTTGAAAGGGTGTGCATAGTGCATAGGTTGACTGGGGGCATCATAAACTAATTAAATGTTTTTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTAATTAAAGGCTGTTTGGAAGTGTACCCAAATCCTTTTTGAGTTTTTGAAAAAGACAGTGTATGAAGATACTCCAAGTTAATGGTGGGAGCAGATTGGTTGGGCACTTTAATAAGAGAGTTGAAGAATTTCCATCCCTTCTTTTCTTTTCCCACACGAATGATGACTTTGTTAAGGCCCCCACTGATGCAGAGCTTAATGACTTCAGCACAATGACCCTTTCAGCTGGTGGTCTTTTCAACCCAGAGATCATATTTGTCAAGATGACATTTTTGGAAGAATTGTTGGTTGAGGAGGGCGTCGATCAAAACATTGAAACAAGAAGAAATCCAAGATCAAGATTTTTTCTTCAAAGATGAATGGTTGATCTTTCCATGCCTCGGTGATGCGAAAGCCATGGTCAATCTCAATGGTGGAAGTCTTGTTGTTGAGGGTGAAGGAGGGAAGGGGGGAGGCAGAACGGCGGGACATGCCGTGGGAAGAATGGTTAGAGATGGAGAATGGTGGATGAGGGGGATGGAGAGGATTTCATTGGGGAGAGGGCGCCTTTCCTCTTTATGATTATATATACATAATATTGAAAATTTGAGTTTTATTGTTTAATAACTTGGATATGTTCAAACTATAAAATTGAACACTTGGACTATGTATGTCGACGATTAGATAATTTGATAGGTTGGTTATTTTGTTAATGTTAGCAGCTTTAACAAATTTATCTTTAAATGAAAATTCTCCATGTGAAATTTACCATTTAAATGATTTTTTAGTGAAACACGCTGTGTATAATTAAAATAACTTAAAATAAAATTTGTTAAATAATAGAATTTGAATGAGAACTATGGATATCCTTGCTTGTGGATATCTAATTGTTCATTTATATTCATGGATTTATGGATGTAGCCTCTCTATCTCTGTAATTACACCTTTTTTTGTGTGATTAAACTTGGTTTGCAAGGTCTAACATGGTCAGTGATCAAAGCATTTGAGAATTGAATTGCTTGAAATGTGAGTTTCTCATGTTTTATAGCTGGAACACAGGTATACGAATACTCCTGCTAATAAGAGAGTAGAGCTGTTTGATGAGAGAGGCATTAATGAATCTACGACTGATGATAATGTTCAGATGACACCATGTAAGACTTTATATACTGTGAAATCCATAAGCTTGTAGCTAAATATGTCCCTTTTGGAGGAGTTTCTACCCTTGGAACCTTTAGGGCCTTCTATTTTTGAATTTGGAATTTTTGTTTTAGAACTCTTTGTCTCCTAGTATTACCAATCTCAAGTCGAAATACCATTGAAGGATCTCCAACTTCGTTTCCATCTATTACTCTTTTCTTATTGGCCTGAATGTTCTATTGCTTTGCTTTACACATTTTTTAACTTAAAATAATTAATTAGTTGTTTCCCGTTTCAACCTATTGATGTGATTTGTTCACAATAACTATGCATTTTTATTTACAATAATATTTCTTCAGTTTTGATATGTTCAGCGTGATATAAATCTCATGATATAATAAACTTGAGTTGAAGGAACCATAATTTTGTTCCCTATTTTATAATAAGTAGATTAAAGGATAGGTTTGCATTGCAATCCCGGGCTTGAGGATGTGACAATTGAAATATAAGTAAAAAGAAACAGTGGCTTTGGTTCCAAATTTCAATCTTCCAGATGTGTTCAAGTAATAAATATTAAATATGGTTTATTGTGGAGGGGTGAATTTCTATATTGTCTATAGGGCAGAAGGAAGAAATAGTATGATCATACTTGTAGGAACTATGCTTTCTTTGAGTTTTTTGATGTATATGTGAGTGTTGAAAAGTGAGAGACTTTTTAAGTATCCTCTTTTCTTCTATATATTTCACATTCTAGTGGCATGTCTTTGTGCTGTAGCAATAATAAGTCAAGAACTGACCAATGTTGGGAAGAAGACAATGGATGAAAATGATCCTGCGATTGACAGCTCTAAAATGGTGACCAGTTTTTTATAATGCACATGCTTTCTCATTTTGTTTAGGTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTACTGTTATTCCTAATGCAAAATATGATCTTTAGGTAGTTGAACAGACAGTTGAAATGGGAAGGCAATCTGCTTTTACATTGGAAGGCCAAGTAAGTATATAAATTCACGATTCTCTTAAAAAGAAGTATTCAATTGGTTTAGCTCTATTCACTAGAATCTTTTTGGTGTTTTTGTTTTATGACTTGGCAATTGTTCTCACAATGCAATGCGTTACGTCTAGTGGACGTTATCAAGTTTAAGTTGGTAGATTACAATAAATTTAATTATATAAGTATACTTCAACACACCTCCTCACTTGTGGGCTTGAAGATGGTCTAGCAAGTGAAAATCAATAAGAAAAAGGACAACAAGTGCATTTGATGTAAAACTACAAATCACTAGTAAGGAAAAGAAGGATAACAAGCGCATTTGATGTAGTAAGATTAGAGTAAGGGTATCTTGGTCAAATCTTTAATTGATTAGGATAAGGATCGGTTCCTCGATTGATTAGGATTTGGATTAGTTTCTTTGGTTTATTAGGATTTGGATTACTTGGCTTTCCAGTTCTCTATAAATTGAAGAACTGTCTTCCTGTATTGATAACTTTGGATTCATAAGACTTCGATTTTTTCTGGGAGATTTCTCTCCTTTTATCTTTTAGGCTACATTGGTCGTTAGATAAATCGAGGAAAGAGTTTAGTCATTGGTTTTAATTGTGATCCATCTAAGGCTTCAAGATGGGCCATGATGGCTGCTCGTAATGTAGGAGAATTTCTCACGATTGAGTACTTTGGCCATATTGTATCAGACCAAGGAGTCTTAGCTCAGCCATTGAAAAATGAGGTAATGGTGCAATGGCGAAAGATGTAATTGTCTTTAGAGTAATATAGCGCAAGATGTCTTTGATAAACCTAAAAAAAGCAATGACTACTGTTCCAGTATTGGGCCTTCCAAATTTCTCTAAACAACCCATCAGGGAATCGAATGCTTTTGGAGTTGGTTTGTGTGTGTGTACTGTGCTAATTTAAGACCAACAACATCTAGTATTTTACTTATTATTTATTTTTTTGTTATGCTTTACCTTTTGTCCATTGACATGAGGCTATTCATTATGAGTGTGAGTTAATGGCGATTGTTATGGCAGTGCAAAAATAGAGACCACACCTCCAAAGTCAGAAGTTTGTAGGCCGTACGGATCAAAAGGCTTTGAAGTTTTTGCTTGGTGAAAGGGTAATAGCAGTTGAATACCAACATTGGATAACAAAGCTCCTAGGGCATGATTTTGACATTCAAAACAAAGTCAAATTAGACAATAAAGTCGTAGATGATCCAGGCTTCCCCCTAAGATTGCTTTAACAATTTGAATATACTGGCAGGAACTAATGTGACCGTCATTGTCAATCAGATCAAACAAGATGAGGAACTCTCCAAAGTAGTGGAGGTATAGAAGAAGGGTGATAATCCACTAGAGGGATACAACCTCAGAGGGGACTTGTTATATTTTCGAGGATGTCTGGTATTACCCCAAATTCTCTGCCAATTCCTTTACTCTTGTAGGACTATTAAATGACTTGTTGGGTTGGTCAAGACTAAACAGAGGATTGCCAAAGAAATCCATTGGAGTCTTGTATCCTTGAGCAGTAGTTTTTTTCATTTCTTGAATGGAAAGTTTTGTATATTGTTAAAAAAAGGATGGCCAAAGAAATCTACTGGCGAG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CTTAACTGCATACATACAAACTTCAACCAAACCGCCCTTCATAAATTTACCTCCATTTTCGTTTTCTCCAAAATTGATCCGCTCGAATTTTGAGCTCCTCTCTCTGCATTTTTCTCCCTTTAACTCCCTACGTTTCAGCGTTTCATCGTCTTCTTCGCGAGCTTTCATTCATTCATCTTTTCCGTTTTCTGTCCACTCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTTAAGCCCTTCAGTTAGCTTTGATACAACCAGAAACTTCAGGACCATTCACAGATATTAATGCAATAAATTTCCATCACCCTCTTCAGTTTACTCTCCCGGCGGAATGGCTAGCAGTGTGCAGAGGAGTCCTCGGTTGGATCAGATCCATGGCGAAATTCGCGACAGTTTTCGTGCCATTTCGTATACGAATACTCCTGCTAATAAGAGAGTAGAGCTGTTTGATGAGAGAGGCATTAATGAATCTACGACTGATGATAATGTTCAGATGACACCATCAATAATAAGTCAAGAACTGACCAATGTTGGGAAGAAGACAATGGATGAAAATGATCCTGCGATTGACAGCTCTAAAATGGTAGTTGAACAGACAGTTGAAATGGGAAGGCAATCTGCTTTTACATTGGAAGGCCAAGCCACAGCTACGAAGAAAATAATTGCTATATGCCAATCAGGTGGTGAGTTTGTGAAAAACAAAGATGGATCCCTGTCTTACAATGGGGGCGAGGCCTATGCTATAGATATTGATCAACAAACAAATTTGGATGATTTGAAGACAGAAGTAGCAGAAATGTTTAGTTGCAGTATAGATACAATGTCCATCAAGTATTTTCTTCCTGGTAACAAGAAAACTCTCATCTCAATATCCAAGGACAAGGATCTAAAGCGGATGGTAAACTTTTTAAAGGATTCCATCACGGTTGATGTGTTTATCTTGTCAGAGGAAGCTGCTGCTCGGAATTTATCTAATATGCCTGCTAGTAGGTCAAGTAGAACAACAGTTTCTGAGGCTGTAGTTCCTGTAGTTGAGCCCGTAGATGTTGCAGTTGAGACTATCATCGCCATTGATCAGATTGGTATGGACATATCCAATGAAGTCCCTTTAATGTGTGTTCCTGCAGGGTCCAGTGATGAAAAACATCGAAAAGCTGCACAACAATGGGAAAATGCCATTATTGGCGTAGACCAAAGATTTAACAGCTTTAGTGAATTCCGAGAAGCCTTACATAAGTACTCAATTGCACATGGTTTTGCTTACCGGTATAAGAAAAATGACAGCCATCGTGTCACTGTTAAATGCAAATACCAGGGTTGTCCATGGCGAATATATGCTTCAAGGCTGTCTACTACCCAACTGATTTGTATCAAGAAAATGAACACAAATCATTCATGTGAGGGGGCTGCTGCTAAAGCTGGGTATCGGGCTACTAGGGGATGGGTGGGAAATATCATAAAGGAAAAACTAAAAGTCTCCCCAAACTACAAGCCAAAAGATATCGCAGATGACATAAAACGGGAATATGGAATTCAACTGAACTATTCACAGGCATGGCGTGCAAAAGAGATAGCAAGAGAACAGCTTCAAGGCTCCTACAAGGAAGCATATAATCAGTTGCCACACTTTTGTGAGAAGATCAAAGAAACTAACCCTGGAAGTGTTGCTTCATTCACCACTAAAGATGACTCGAGCTTTCATCGTCTATTTGTATCATTTCATGCATCAATTTCTGGTTTCCAGCAAGGTTGTCGACCTCTCCTCTTCCTTGATAGTACTCCATTGAACTCAAAGTATCAGGGGTTTTTTTTGACTGCCACAGCTATAGATGGGGAAGATGGCATATTTCCAGCAGCTTTTGCTGTTGTAGATGCCGAGACAGAGGAAAATTGGCATTGGTTTTTACTGGAACTGAAATCTGCAGTGAAAAGGTCTGAGCAGATTACATTTGTAGCAGATTTTCAGAATGGACTGAACAAGTCTTTGGCCGAAATATTTGACAAGTCACACCATAGCTACTGTTTGCGTCATCTAGCTGAAAAGCTTAACAATGATTTAAAGGGCCAATTTTCTCATGAGGCCAGGCGATTTATGATTAATGATTTCTATGCTGCCGCTCTCGCATCTAAACTTGAGGATTTCCAGCGCTGTGCTGAAAGCATAAAAGGAATTTCACCTGATGCTTACAATTGGATCATACAAAGTGAACCACAGCATTGGGCAAATGCATTCTTTGGAGGAGCAAGGTATAACCATATCACATCAAATTTTGGACAGCAGTTCTACAGTTCCATATCTGAAGCACATGAATTGCCTATAACACAGATGATTGATGTTTTACGGGGAAAAATGATGGAAACAATATATAGACGCAGGGTTGCATCAGACCAGTGGATGACAAAATTAACACCAGCCAATGAGGAAAAGTTACAAAAAGAAATATCAATTTCGCGGTCATTTCAGGTTTCACTATCCCATGGAAGCACATTTGAGGTTCGTGGGGAATCTGTTGACATTGTTGATGTTGATAATTGGGATTGTAGCTGTAAGGGATGGCAGCTTACTGGTTTGCCTTGTTGCCATGCCATTGCTGTCATTGAATGCATTGGTCGGAGCCCATATGATTATTGCCCCAGATACTTCACAGTTGAGAGTTACCGCCTAACGTATGCTGAGTCAATACATCCTATTCCAAATGTGGACAGACTAATCCTGGGTGAATCCACTGAGGCACTAGTCACAGTAACCCCTCCACCTACTAGAAGACCACCAGGTCGTCCAAAGATGAAGCAGAATGAATCATTAGAAGTAGTTAAACGTCAGCTCCAATGTAGCAAATGTAAAGGCCTTGGCCACAATAAGAAGACATGCAAAGATTCTTAGCTTCAATTTAGGAATTCCAAATAGGTAATTACTCGTTAACTTTGTTTCCCTAATTGTTAATATTTACTTGTTGCCATCTATGATCTATCTCATGCTTCAGCTATTTGAAATTTCTTTTAGTTGATTTCACATACTTCATTTCGCTGCTTCTTCCTACTCGTGGAGGGTTTTTTTTTTCCTCTTCTTTTTTTGAAG ATGGCTAGCAGTGTGCAGAGGAGTCCTCGGTTGGATCAGATCCATGGCGAAATTCGCGACAGTTTTCGTGCCATTTCGTATACGAATACTCCTGCTAATAAGAGAGTAGAGCTGTTTGATGAGAGAGGCATTAATGAATCTACGACTGATGATAATGTTCAGATGACACCATCAATAATAAGTCAAGAACTGACCAATGTTGGGAAGAAGACAATGGATGAAAATGATCCTGCGATTGACAGCTCTAAAATGGTAGTTGAACAGACAGTTGAAATGGGAAGGCAATCTGCTTTTACATTGGAAGGCCAAGCCACAGCTACGAAGAAAATAATTGCTATATGCCAATCAGGTGGTGAGTTTGTGAAAAACAAAGATGGATCCCTGTCTTACAATGGGGGCGAGGCCTATGCTATAGATATTGATCAACAAACAAATTTGGATGATTTGAAGACAGAAGTAGCAGAAATGTTTAGTTGCAGTATAGATACAATGTCCATCAAGTATTTTCTTCCTGGTAACAAGAAAACTCTCATCTCAATATCCAAGGACAAGGATCTAAAGCGGATGGTAAACTTTTTAAAGGATTCCATCACGGTTGATGTGTTTATCTTGTCAGAGGAAGCTGCTGCTCGGAATTTATCTAATATGCCTGCTAGTAGGTCAAGTAGAACAACAGTTTCTGAGGCTGTAGTTCCTGTAGTTGAGCCCGTAGATGTTGCAGTTGAGACTATCATCGCCATTGATCAGATTGGTATGGACATATCCAATGAAGTCCCTTTAATGTGTGTTCCTGCAGGGTCCAGTGATGAAAAACATCGAAAAGCTGCACAACAATGGGAAAATGCCATTATTGGCGTAGACCAAAGATTTAACAGCTTTAGTGAATTCCGAGAAGCCTTACATAAGTACTCAATTGCACATGGTTTTGCTTACCGGTATAAGAAAAATGACAGCCATCGTGTCACTGTTAAATGCAAATACCAGGGTTGTCCATGGCGAATATATGCTTCAAGGCTGTCTACTACCCAACTGATTTGTATCAAGAAAATGAACACAAATCATTCATGTGAGGGGGCTGCTGCTAAAGCTGGGTATCGGGCTACTAGGGGATGGGTGGGAAATATCATAAAGGAAAAACTAAAAGTCTCCCCAAACTACAAGCCAAAAGATATCGCAGATGACATAAAACGGGAATATGGAATTCAACTGAACTATTCACAGGCATGGCGTGCAAAAGAGATAGCAAGAGAACAGCTTCAAGGCTCCTACAAGGAAGCATATAATCAGTTGCCACACTTTTGTGAGAAGATCAAAGAAACTAACCCTGGAAGTGTTGCTTCATTCACCACTAAAGATGACTCGAGCTTTCATCGTCTATTTGTATCATTTCATGCATCAATTTCTGGTTTCCAGCAAGGTTGTCGACCTCTCCTCTTCCTTGATAGTACTCCATTGAACTCAAAGTATCAGGGGTTTTTTTTGACTGCCACAGCTATAGATGGGGAAGATGGCATATTTCCAGCAGCTTTTGCTGTTGTAGATGCCGAGACAGAGGAAAATTGGCATTGGTTTTTACTGGAACTGAAATCTGCAGTGAAAAGGTCTGAGCAGATTACATTTGTAGCAGATTTTCAGAATGGACTGAACAAGTCTTTGGCCGAAATATTTGACAAGTCACACCATAGCTACTGTTTGCGTCATCTAGCTGAAAAGCTTAACAATGATTTAAAGGGCCAATTTTCTCATGAGGCCAGGCGATTTATGATTAATGATTTCTATGCTGCCGCTCTCGCATCTAAACTTGAGGATTTCCAGCGCTGTGCTGAAAGCATAAAAGGAATTTCACCTGATGCTTACAATTGGATCATACAAAGTGAACCACAGCATTGGGCAAATGCATTCTTTGGAGGAGCAAGGTATAACCATATCACATCAAATTTTGGACAGCAGTTCTACAGTTCCATATCTGAAGCACATGAATTGCCTATAACACAGATGATTGATGTTTTACGGGGAAAAATGATGGAAACAATATATAGACGCAGGGTTGCATCAGACCAGTGGATGACAAAATTAACACCAGCCAATGAGGAAAAGTTACAAAAAGAAATATCAATTTCGCGGTCATTTCAGGTTTCACTATCCCATGGAAGCACATTTGAGGTTCGTGGGGAATCTGTTGACATTGTTGATGTTGATAATTGGGATTGTAGCTGTAAGGGATGGCAGCTTACTGGTTTGCCTTGTTGCCATGCCATTGCTGTCATTGAATGCATTGGTCGGAGCCCATATGATTATTGCCCCAGATACTTCACAGTTGAGAGTTACCGCCTAACGTATGCTGAGTCAATACATCCTATTCCAAATGTGGACAGACTAATCCTGGGTGAATCCACTGAGGCACTAGTCACAGTAACCCCTCCACCTACTAGAAGACCACCAGGTCGTCCAAAGATGAAGCAGAATGAATCATTAGAAGTAGTTAAACGTCAGCTCCAATGTAGCAAATGTAAAGGCCTTGGCCACAATAAGAAGACATGCAAAGATTCTTAG MASSVQRSPRLDQIHGEIRDSFRAISYTNTPANKRVELFDERGINESTTDDNVQMTPSIISQELTNVGKKTMDENDPAIDSSKMVVEQTVEMGRQSAFTLEGQATATKKIIAICQSGGEFVKNKDGSLSYNGGEAYAIDIDQQTNLDDLKTEVAEMFSCSIDTMSIKYFLPGNKKTLISISKDKDLKRMVNFLKDSITVDVFILSEEAAARNLSNMPASRSSRTTVSEAVVPVVEPVDVAVETIIAIDQIGMDISNEVPLMCVPAGSSDEKHRKAAQQWENAIIGVDQRFNSFSEFREALHKYSIAHGFAYRYKKNDSHRVTVKCKYQGCPWRIYASRLSTTQLICIKKMNTNHSCEGAAAKAGYRATRGWVGNIIKEKLKVSPNYKPKDIADDIKREYGIQLNYSQAWRAKEIAREQLQGSYKEAYNQLPHFCEKIKETNPGSVASFTTKDDSSFHRLFVSFHASISGFQQGCRPLLFLDSTPLNSKYQGFFLTATAIDGEDGIFPAAFAVVDAETEENWHWFLLELKSAVKRSEQITFVADFQNGLNKSLAEIFDKSHHSYCLRHLAEKLNNDLKGQFSHEARRFMINDFYAAALASKLEDFQRCAESIKGISPDAYNWIIQSEPQHWANAFFGGARYNHITSNFGQQFYSSISEAHELPITQMIDVLRGKMMETIYRRRVASDQWMTKLTPANEEKLQKEISISRSFQVSLSHGSTFEVRGESVDIVDVDNWDCSCKGWQLTGLPCCHAIAVIECIGRSPYDYCPRYFTVESYRLTYAESIHPIPNVDRLILGESTEALVTVTPPPTRRPPGRPKMKQNESLEVVKRQLQCSKCKGLGHNKKTCKDS Homology
BLAST of Clc06G04380 vs. NCBI nr
Match: XP_038906599.1 (uncharacterized protein LOC120092551 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1649.4 bits (4270), Expect = 0.0e+00 Identity = 816/850 (96.00%), Postives = 836/850 (98.35%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. NCBI nr
Match: XP_004138593.1 (uncharacterized protein LOC101203713 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN45626.1 hypothetical protein Csa_005598 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1634.0 bits (4230), Expect = 0.0e+00 Identity = 807/850 (94.94%), Postives = 829/850 (97.53%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. NCBI nr
Match: XP_008458283.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103497748 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1633.6 bits (4229), Expect = 0.0e+00 Identity = 809/850 (95.18%), Postives = 828/850 (97.41%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. NCBI nr
Match: XP_022959325.1 (uncharacterized protein LOC111460335 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022959326.1 uncharacterized protein LOC111460335 isoform X1 [Cucurbita moschata] >KAG6575156.1 putative plant SNARE 12, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1602.0 bits (4147), Expect = 0.0e+00 Identity = 789/850 (92.82%), Postives = 823/850 (96.82%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. NCBI nr
Match: XP_023006497.1 (uncharacterized protein LOC111499213 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_023006498.1 uncharacterized protein LOC111499213 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1595.9 bits (4131), Expect = 0.0e+00 Identity = 786/850 (92.47%), Postives = 822/850 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LNH6 (Novel plant SNARE 12 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NPSN12 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 3.3e-12 Identity = 58/188 (30.85%), Postives = 79/188 (42.02%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LRP1 (Novel plant SNARE 13 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NPSN13 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 3.3e-12 Identity = 58/188 (30.85%), Postives = 82/188 (43.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q944A9 (Novel plant SNARE 11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NPSN11 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 52.0 bits (123), Expect = 3.9e-05 Identity = 26/79 (32.91%), Postives = 47/79 (59.49%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KCW9 (SWIM-type domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G001720 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1634.0 bits (4230), Expect = 0.0e+00 Identity = 807/850 (94.94%), Postives = 829/850 (97.53%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C8R6 (uncharacterized protein LOC103497748 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497748 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1633.6 bits (4229), Expect = 0.0e+00 Identity = 809/850 (95.18%), Postives = 828/850 (97.41%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H5Z5 (uncharacterized protein LOC111460335 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460335 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1602.0 bits (4147), Expect = 0.0e+00 Identity = 789/850 (92.82%), Postives = 823/850 (96.82%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KW10 (uncharacterized protein LOC111499213 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499213 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1595.9 bits (4131), Expect = 0.0e+00 Identity = 786/850 (92.47%), Postives = 822/850 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C712 (uncharacterized protein LOC103497748 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497748 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1595.5 bits (4130), Expect = 0.0e+00 Identity = 794/850 (93.41%), Postives = 813/850 (95.65%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. TAIR 10
Match: AT1G49920.1 (MuDR family transposase ) HSP 1 Score: 154.5 bits (389), Expect = 3.9e-37 Identity = 141/581 (24.27%), Postives = 247/581 (42.51%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. TAIR 10
Match: AT1G64260.1 (MuDR family transposase ) HSP 1 Score: 151.8 bits (382), Expect = 2.6e-36 Identity = 167/724 (23.07%), Postives = 297/724 (41.02%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. TAIR 10
Match: AT1G64255.1 (MuDR family transposase ) HSP 1 Score: 127.5 bits (319), Expect = 5.2e-29 Identity = 119/519 (22.93%), Postives = 216/519 (41.62%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. TAIR 10
Match: AT1G48240.1 (novel plant snare 12 ) HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 2.3e-13 Identity = 58/188 (30.85%), Postives = 79/188 (42.02%), Query Frame = 0
BLAST of Clc06G04380 vs. TAIR 10
Match: AT3G17440.1 (novel plant snare 13 ) HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 2.3e-13 Identity = 58/188 (30.85%), Postives = 82/188 (43.62%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (cordophanus) v2
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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